CX3CL1

CX3CL1
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	1B2T, 1F2L, 3ONA, 4XT1, 4XT3
Идентификаторы
Псевдонимы	CX3CL1 , ABCD-3, C3XKine, CXC3, CXC3C, NTN, NTT, SCYD1, Fractalkine, Neurotactin, C-X3-C Мотив Хемокин Лиганд 1
Внешние идентификаторы	Омим : 601880 ; MGI : 1097153 ; Гомологен : 2251 ; GeneCards : CX3CL1 ; OMA : CX3CL1 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 16 (human)
End	57,385,044 bp
showGene location (Mouse)
Chr.	Chromosome 8 (mouse)
End	95,509,055 bp
showRNA expression pattern
	Top expressed in
	right lung; ; right coronary artery; ; prefrontal cortex; ; olfactory zone of nasal mucosa; ; frontal pole; ; ascending aorta; ; Descending thoracic aorta; ; right frontal lobe; ; popliteal artery; ; tibial arteries;
	Top expressed in
	perirhinal cortex; ; entorhinal cortex; ; CA3 field; ; visual cortex; ; primary visual cortex; ; olfactory tubercle; ; superior frontal gyrus; ; primary motor cortex; ; prefrontal cortex; ; nucleus accumbens;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showGene ontology
Molecular function	cytokine activity; chemokine activity; protein binding; CCR chemokine receptor binding; signaling receptor binding; integrin binding; CX3C chemokine receptor binding;
Cellular component	integral component of membrane; membrane; plasma membrane; extracellular region; cell surface; extracellular space;
Biological process	G protein-coupled receptor signaling pathway; defense response; positive regulation of inflammatory response; monocyte chemotaxis; cytokine-mediated signaling pathway; chemokine-mediated signaling pathway; angiogenesis involved in wound healing; cellular response to tumor necrosis factor; wound healing; leukocyte chemotaxis; neutrophil chemotaxis; positive regulation of angiogenesis; positive regulation of transforming growth factor beta1 production; positive regulation of GTPase activity; cell adhesion; immune response; cellular response to interleukin-1; leukocyte adhesive activation; positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; cellular response to interferon-gamma; cell chemotaxis; lymphocyte chemotaxis; negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand; positive regulation of calcium-independent cell-cell adhesion; chemotaxis; integrin activation; negative regulation of cell migration; leukocyte migration involved in inflammatory response; macrophage chemotaxis; regulation of signaling receptor activity;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideOrthologs
	6376
	20312
	ENSG00000006210
	ENSMUSG00000031778
	P78423
	O35188
	NM_002996 ; NM_001304392
	NM_009142
	NP_001291321 ; NP_002987
	NP_033168
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Fractalkine , также известный как лиганд 1 хемокин (C-X3-C) , является белком , который у людей кодируется CX3CL1 геном .

Функция

Fractalkine представляет собой большой цитокиновый белок из 373 аминокислот, который содержит несколько доменов и является единственным известным членом _{CX 3} C. хемокинов семейства Он также обычно известен под названиями фракталкина (у людей) и нейротактина (у мышей). ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} Полипептидная структура CX3CL1 отличается от типичной структуры других хемокинов. Например, расстояние между характерными N-концевыми цистеинами отличается; Существуют три аминокислоты, разделяющие начальную пару цистеинов в CX3CL1, с ними в хемокинах CC , и только одна промежуточная аминокислота в хемокинах CXC . CX3CL1 продуцируется как длинный белок (с 373 -аминокислотой у людей) с расширенным муциноподобным стеблем и хемокиновым доменом на вершине. Муциноподобный стебель позволяет ему связываться с поверхностью определенных клеток. Однако также наблюдалась растворимая (90 кД) версия этого хемокина. Растворимые CX3CL1 мощно хемоаттракты Т-клетки и моноциты , в то время как хемокин, связанный с клетками, способствует сильной адгезии лейкоцитов к активированным эндотелиальным клеткам, где он в основном экспрессируется. ^[6] CX3CL1 elicits its adhesive and migratory functions by interacting with the chemokine receptor CX3CR1.^[7] Его ген расположен на человеческой хромосоме 16 вместе с некоторыми хемокинами CC, известными как CCL17 и CCL22 . ^{[ 6 ]}^{[ 8 ]}

Fractalkine обычно встречается по всему мозгу, особенно в нейронных клетках, и его рецептор, как известно, присутствует на микроглиальных клетках. Также было обнаружено, что это необходимо для миграции микроглиальных клеток. ^{[ 9 ]} CX3CL1 также активируется в гиппокампе во время краткого временного окна после пространственного обучения , целью которой может быть регулирование опосредованного глутаматом тонус нейротрансмиссии. Это указывает на возможную роль хемокина в процессе защитной пластичности синаптического масштабирования . ^{[ 10 ]}

Ссылки

^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000006210 - Ensembl , май 2017 г.
^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000031778 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Pan Y, Lloyd C, Zhou H, Dolich S, Deeds J, Gonzalo JA, Vath J, Gosselin M, Ma J, Dussault B, Woolf E, Alperin G, Culpepper J, Gutierrez-Ramos JC, Gearing D (1997). «Нейротаксин, хемокин, закрепленный мембраной, активируется в воспалении мозга». Природа . 387 (6633): 611–617. Bibcode : 1997natur.387..611p . doi : 10.1038/42491 . PMID 9177350 . S2CID 4307876 .
^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в Базань Дж. Ф., Бэкон К.Б., Хардиман Г., Ван В., Су К., Росси Д., Гривз Д.Р., Злотник А., Шалл Т.Дж. (1997). «Новый класс хемокина с мембраной с мотивом CX3C». Природа . 385 (6617): 640–644. Bibcode : 1997natur.385..640b . doi : 10.1038/385640A0 . PMID 9024663 . S2CID 4322166 .
^ Имаи Т., Хизехима К., Хаскелл С., Баба М., Нагира М., Нишимура М., Какизаки М., Такаги С., Номияма Х., Шалл Т.Дж., Йоши О (1997). «Идентификация и молекулярная характеристика рецептора Fractalkine CX3CR1, который опосредует как миграцию лейкоцитов, так и адгезию» . Клетка . 91 (4): 521–530. doi : 10.1016/s0092-8674 (00) 80438-9 . PMID 9390561 . S2CID 17281691 .
^ Nomiyama H, Imai T, Kusuda J, Miura R, Callen Df, Yoshie O (1998). «Человеческие хемокины Fractalkine (SCYD1), MDC (SCYA22) и TARC (SCYA17) кластеризованы на хромосоме 16Q13». Цитогенет. Клеточная генера . 81 (1): 10–11. doi : 10.1159/000015000 (неактивный 2024-07-29). PMID 9691168 . S2CID 46851784 . {{cite journal}}: CS1 Maint: doi неактивен по состоянию на июль 2024 г. ( ссылка )
^ Maciejewski-Lenoir D, Chen S, Feng L, Maki R, Bacon KB (1999-08-01). «Характеристика Fractalkine в клетках мозга крысы: миграционные и активационные сигналы для микроглии, экспрессирующей CX3CR-1» . Журнал иммунологии . 163 (3): 1628–1635. doi : 10.4049/jimmunol.163.3.1628 . ISSN 0022-1767 . PMID 10415068 .
^ Шеридан Г.К., Wdowicz A, Pickering M, Watters O, Halley P, O'Sullivan NC, Mooney C, O'Connell DJ, O'Connor JJ, Murphy KJ (2014). «CX3CL1 активируется в гиппокампе крысы во время синаптической пластичности, связанной с памятью» . Передние клеточные нейроски . 8 : 233. DOI : 10.3389/fncel.2014.00233 . PMC 4130185 . PMID 25161610 .

Внешние ссылки

Местоположение генома CX3CL1 CX3CL1 и CX3CL1 страница гена в браузере генома UCSC .

Дальнейшее чтение

Базань Дж. Ф., Бэкон К.Б., Хардиман Г., Ван В., Су К., Росси Д., Гривз Д.Р., Злотник А., Шалл Т.Дж. (1997). «Новый класс хемокина с мембраной с мотивом CX3C». Природа . 385 (6617): 640–4. Bibcode : 1997natur.385..640b . doi : 10.1038/385640A0 . PMID 9024663 . S2CID 4322166 .
Combadiere C, Salzwedel K, Smith ED, Tiffany HL, Berger EA, Murphy PM (1998). «Идентификация CX3CR1. Хемотаксический рецептор для человеческого хемокина CX3C Fractalkine и корецептора слияния для ВИЧ-1» . Дж. Биол. Химический 273 (37): 23799–804. doi : 10.1074/jbc.273.37.23799 . PMID 9726990 .
Meucci O, Fatatis A, Simen AA, Bushell TJ, Grey PW, Miller RJ (1998). «Хемокины регулируют передачу сигналов нейронов гиппокампа и нейротоксичность GP120» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 95 (24): 14500–5. Bibcode : 1998pnas ... 9514500M . doi : 10.1073/pnas.95.24.14500 . PMC 24402 . PMID 9826729 .
Mizoue LS, Bazan JF, Johnson EC, Handel TM (1999). «Структура решения и динамика хемокинового домена CX3C Fractalkine и его взаимодействие с N-концевым фрагментом CX3CR1». Биохимия . 38 (5): 1402–14. doi : 10.1021/bi9820614 . PMID 9931005 .
Papadopoulos EJ, Sassetti C, Saeki H, Yamada N, Kawamura T, Fitzhugh DJ, Saraf MA, Schall T, Blauvelt A, Rosen SD, Hwang St (1999). «Fractalkine, хемокин CX3C, экспрессируется дендритными клетками и повышается при созревании дендритных клеток» . Евро. J. Immunol . 29 (8): 2551–9. doi : 10.1002/(SICI) 1521-4141 (199908) 29:08 <2551 :: AID-IMMU2551> 3.0.CO; 2-T . PMID 10458770 .
Лофтус Б.Дж., Ким У.Дж ПК, Вентер Дж.С., Адамс М.Д. (1999). «Дубликации генома и другие особенности в 12 МБ последовательности ДНК из хромосомы человека 16p и 16q». Геномика . 60 (3): 295–308. doi : 10.1006/geno.1999.5927 . PMID 10493829 .
Тонг Н., Перри С.В., Чжан К., Джеймс Х.Дж., Го Х., Брукс А., Бал Х, Киннер С.А., Файн С., Эпштейн Л.Г., Дайраги Д., Шалл Т.Дж., Гендельман Х. Х. , Дьюрст С., Шарер Л.Р., Гелбард Ха (2000) Полем «Экспрессия нейронов фракталка при ВИЧ-1 энцефалите: роли рекрутирования макрофагов и нейропротекции в центральной нервной системе» . J. Immunol . 164 (3): 1333–9. doi : 10.4049/jimmunol.164.3.1333 . PMID 10640747 . S2CID 20616076 .
Faure S, Meyer L, Costagliola D, Vaneensberghe C, Genin E, Autran B, Delfraissy JF, McDermott DH, Murphy PM, Debé P, Théodorou I, Combadière C (2000). «Быстрое прогрессирование СПИДа у ВИЧ+ особей со структурным вариантом хемокинового рецептора Cx3cr1». Наука . 287 (5461): 2274–7. Bibcode : 2000sci ... 287.2274f . doi : 10.1126/science.287.5461.2274 . PMID 10731151 .
Гувер Д.М., Мизуэ Л.С., Гендель Т.М., Любковски Дж. (2000). «Кристаллическая структура хемокинового домена фракталкина показывает новое четвертичное расположение» . Дж. Биол. Химический 275 (30): 23187–93. doi : 10.1074/jbc.m002584200 . PMID 10770945 . S2CID 38835823 .
Meucci O, Fatatis A, Simen AA, Miller RJ (2000). «Экспрессия рецепторов хемокинов CX3CR1 на нейронах и их роль в выживании нейронов» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 97 (14): 8075–80. Bibcode : 2000pnas ... 97.8075m . doi : 10.1073/pnas.090017497 . PMC 16672 . PMID 10869418 .
Papadopoulos EJ, Fitzhugh DJ, Tkaczyk C, Gilfillan AM, Sassetti C, Metcalfe DD, Hwang St (2000). «Тучные клетки мигрируют, но не дегранулируют, в ответ на фракталкин, мембрановый хемокин, экспрессируемый конститутивно в разнообразных клетках кожи». Евро. J. Immunol . 30 (8): 2355–61. doi : 10.1002/1521-4141 (2000) 30: 8 <2355 :: AID-IMMU2355> 3.0.CO; 2-# . PMID 10940926 . S2CID 196597758 .
Лукас А.Д., Чедвик Н., Уоррен Б.Ф., Джуэлл Д.П., Гордон С., Паури Ф., Гривз Д.Р. (2001). «Трансмембранная форма хемокина CX3CL1 фракталкина экспрессируется преимущественно эпителиальными клетками in vivo» . Являюсь. J. Pathol . 158 (3): 855–66. doi : 10.1016/s0002-9440 (10) 64034-5 . PMC 1850344 . PMID 11238035 .
Garton KJ, Gough PJ, Blobel CP, Murphy G, Greaves DR, Dempsey PJ, Raines EW (2001). «Фактор некроза опухоли-альфа-конвертирующего фермента (ADAM17) опосредует расщепление и выброс фракталкина (CX3CL1)» . Дж. Биол. Химический 276 (41): 37993–8001. doi : 10.1074/jbc.m106434200 . PMID 11495925 .
Умехара Х., Блум Э.Т., Оказаки Т., Нагано Ю., Йоши О., Имаи Т (2004). «Фракталкин в сосудистой биологии: от основных исследований до клинических заболеваний» . Артериосклер. Тромб. Визит Биол . 24 (1): 34–40. doi : 10.1161/01.atv.0000095360.62479.1f . PMID 12969992 . S2CID 6183022 .
Умехаха Х., Танах М., Саваки Т., Джин З.К., Хуанг К.Р., Донг Л., Каванами Т., Чарм Х., Масаки Ю., Фукусима Т., Хирозе Ю., Оказаки Т. (2006). «Фракталкин при ревматоидном артрите и состояниях союзников» Мод ревматол 16 (3): 124–3 Doi : 10.1007/ s10165-006-0471-9 PMID 1676754 S2CID 10199059

[refGRCh38Ensembl-1] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000006210 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000031778 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[5] Pan Y, Lloyd C, Zhou H, Dolich S, Deeds J, Gonzalo JA, Vath J, Gosselin M, Ma J, Dussault B, Woolf E, Alperin G, Culpepper J, Gutierrez-Ramos JC, Gearing D (1997). «Нейротаксин, хемокин, закрепленный мембраной, активируется в воспалении мозга». Природа . 387 (6633): 611–617. Bibcode : 1997natur.387..611p . doi : 10.1038/42491 . PMID 9177350 . S2CID 4307876 .

[bazan-6] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в Базань Дж. Ф., Бэкон К.Б., Хардиман Г., Ван В., Су К., Росси Д., Гривз Д.Р., Злотник А., Шалл Т.Дж. (1997). «Новый класс хемокина с мембраной с мотивом CX3C». Природа . 385 (6617): 640–644. Bibcode : 1997natur.385..640b . doi : 10.1038/385640A0 . PMID 9024663 . S2CID 4322166 .

[7] Имаи Т., Хизехима К., Хаскелл С., Баба М., Нагира М., Нишимура М., Какизаки М., Такаги С., Номияма Х., Шалл Т.Дж., Йоши О (1997). «Идентификация и молекулярная характеристика рецептора Fractalkine CX3CR1, который опосредует как миграцию лейкоцитов, так и адгезию» . Клетка . 91 (4): 521–530. doi : 10.1016/s0092-8674 (00) 80438-9 . PMID 9390561 . S2CID 17281691 .

[8] Nomiyama H, Imai T, Kusuda J, Miura R, Callen Df, Yoshie O (1998). «Человеческие хемокины Fractalkine (SCYD1), MDC (SCYA22) и TARC (SCYA17) кластеризованы на хромосоме 16Q13». Цитогенет. Клеточная генера . 81 (1): 10–11. doi : 10.1159/000015000 (неактивный 2024-07-29). PMID 9691168 . S2CID 46851784 . {{cite journal}}: CS1 Maint: doi неактивен по состоянию на июль 2024 г. ( ссылка )

[9] Maciejewski-Lenoir D, Chen S, Feng L, Maki R, Bacon KB (1999-08-01). «Характеристика Fractalkine в клетках мозга крысы: миграционные и активационные сигналы для микроглии, экспрессирующей CX3CR-1» . Журнал иммунологии . 163 (3): 1628–1635. doi : 10.4049/jimmunol.163.3.1628 . ISSN 0022-1767 . PMID 10415068 .

[pmid25161610-10] Шеридан Г.К., Wdowicz A, Pickering M, Watters O, Halley P, O'Sullivan NC, Mooney C, O'Connell DJ, O'Connor JJ, Murphy KJ (2014). «CX3CL1 активируется в гиппокампе крысы во время синаптической пластичности, связанной с памятью» . Передние клеточные нейроски . 8 : 233. DOI : 10.3389/fncel.2014.00233 . PMC 4130185 . PMID 25161610 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[7]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]