Кальций-связывающий митохондриальный белок-носитель Aralar1

SLC25A12
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	4P60, 4P5X,%%s4P5X, 4P60
Идентификаторы
Псевдонимы	SLC25A12 , AGC1, ARALAR, Семейство растворенных перевозчиков 25, член 12, EIEE39, DEE39
Внешние идентификаторы	Омим : 603667 ; MGI : 1926080 ; Гомологен : 48235 ; GeneCards : SLC25A12 ; OMA : SLC25A12 - Ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 2 (human)
End	171,999,859 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	biceps brachii; ; Skeletal muscle tissue of biceps brachii; ; triceps brachii muscle; ; vastus lateralis muscle; ; muscle of thigh; ; myocardium of left ventricle; ; muscle of trunk; ; gastrocnemius muscle; ; thoracic diaphragm; ; Skeletal muscle tissue of rectus abdominis;
	n/a
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	calcium ion binding; metal ion binding; L-aspartate transmembrane transporter activity; L-glutamate transmembrane transporter activity; acidic amino acid transmembrane transporter activity; transmembrane transporter activity; identical protein binding;
Cellular component	membrane; myelin sheath; mitochondrion; mitochondrial inner membrane; integral component of membrane;
Biological process	gluconeogenesis; malate-aspartate shuttle; response to calcium ion; transmembrane transport; aspartate transmembrane transport; L-glutamate transmembrane transport; transport; glutamate biosynthetic process; positive regulation of glucose metabolic process; positive regulation of myelination; L-aspartate transmembrane transport; negative regulation of glucose catabolic process to lactate via pyruvate; positive regulation of ATP biosynthetic process; mitochondrial calcium ion transmembrane transport;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	8604
	78830
	ENSG00000115840
	n/a
	O75746
	Q8BH59
	NM_003705
	NM_172436
	NP_003696
	NP_766024
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Кальций-связывающий митохондриальный белок-носитель Aralar1 -это белок , который у людей кодируется SLC25A12 геном . ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Aralar - это интегральный мембранный белок, расположенный во внутренней митохондриальной мембране . Его первичная функция в качестве аспартатом через внутреннюю митохондриальную в мембрану , антипортера - это транспорт цитоплазматического глутамата с митохондриальным зависимости от связывания одного кальция иона . Мутации в этом гене вызывают раннюю детскую эпилептическую энцефалопатию 39 (EIEE39), симптомируя глобальную гипомиелинирование центральной нервной системы , рефрактерные судороги и нарушение развития нервной системы . ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]} Этот ген имеет связь с аутизмом . ^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}

Структура

Ген SLC25A12 расположен на руке Q хромосомы 2 в положении 31.1 и охватывает 110 902 пар оснований. ^{[ 7 ]} Ген продуцирует белок 74,8 кДа, состоящий из 678 аминокислот . ^{[ 12 ]}^{[ 13 ]} Кодированный белок, Aralar1, представляет собой многопроходной мембранный белок, расположенный во внутренней митохондриальной мембране. ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]} N -концевая половина этого белка содержит 2 несовершенных EF-рук домена вместе с 3 каноническими доменами связывания кальция EF-руки; Эта часть белка связывает кальций in vitro. половина ARALAR C-концевая Акции 28-29% идентичности с другими членами митохондриальных растворенных носителей семейства , включая SLC25A11 , SLC25A5 , SLC25A1 , и имеет 6 предполагаемых трансмембранных доменов, таких как другие члены семейства митохондриальных растворителей . ^{[ 14 ]}^{[ 15 ]}

Функция

Белок, кодируемый SLC25A12 , ARALAR1, представляет собой митохондриальный кальций-связывающий носитель, который облегчает кальций-зависимый обмен цитоплазматическим глутаматом с митохондриальной аспататом через митохондриальную внутреннюю мембрану. Аралар связывается с одним ионом кальция с высокой аффинностью . После связывания кальция, EF-рука, содержащий регуляторный N-концевой домен связывается с C-концевым доменом, открывая вестибюль, который позволяет субстраты перемещать через домен носителя. В отсутствие кальция домен петли линкера может закрыть вестибюль, что может помешать субстратам войти в домен несущей. ^{[ 16 ]} Будучи членом малат -аспартатного nadh upttle , Aralar также участвует в передаче цитозольных редуцирующих эквивалентов от цитозоля в митохондриальную матрицу . ^{[ 17 ]} Aralar, наряду с белком, кодируемым SLC25A13 , являются кальциевыми связующими аспартатами / глутаматными носителями, которые являются субстратами в TIMM8A / TIMM13 комплексе .

Клиническое значение

Сверхэкспрессия Aralar1 увеличивает метаболизм митохондрий и увеличивает секрецию инсулина в клетках поджелудочной железы . ^{[ 18 ]} Аралар экспрессируется как транскрипт мРНК 3,2 КБ и 2,9 кб в сердца и скелетных мышц клетках головного и почек . , а также в меньших количествах в клетках ^{[ 14 ]}^{[ 15 ]}

Эпилептическая энцефалопатия

Мутации в гене SLC25A12 вызывают раннюю инфантильную эпилептическую энцефалопатию 39 (EIEE39), характеризующиеся рефрактерными припадками, нарушением развития нервной системы и плохим прогнозом . Развитие является нормальным до начала захвата , после чего становятся очевидными когнитивные и моторные задержки. EIEE39 характеризуется глобальной гипомиелинией центральной нервной системы, причем серое вещество казается относительно не влияющим. Наследование является аутосомно -рецессивным . ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}

Аутизм

2 SNP в интронах 3 и 16 гена SLC25A12 могут быть связаны с аутизмом . ^{[ 10 ]} В области Бродмана (BA) 46 более сильно выражается префронтальной коры SLC25A12 в нейронах аутичных людей. Сверхэкспрессия SLC25A12 может модифицировать нейрональные сети в определенных субрегионах мозга во время развития плода у пациентов с аутизмом. ^{[ 11 ]}

Взаимодействия

Aralar взаимодействует с SCO1 , ATF2 , COX14 , COA3 , в дополнение к 36 другим белкам. ^{[ 19 ]}

Смотрите также

Семья растворенных перевозчиков

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000115840 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Del Arco A, Satrústegui J (сентябрь 1998 г.). «Молекулярное клонирование аралара, нового члена суперсемейства митохондриального носителя, который связывает кальций и присутствует в мышцах и мозге человека» . Журнал биологической химии . 273 (36): 23327–34. doi : 10.1074/jbc.273.36.23327 . PMID 9722566 .
^ Crackower MA, Sinasac DS, Lee JR, Herbrick JA, Tsui LC, Scherer SW (апрель 2000 г.). «Назначение гена SLC25A12, кодирующего кальций-связывающий митохондриальный растворенный белок с кальцием, аралар с хромосомой 2Q24 человека 2Q24». Цитогенетика и клеточная генетика . 87 (3–4): 197–8. doi : 10.1159/000015465 . PMID 10702666 . S2CID 28029151 .
^ Palmieri L, Pardo B, Lasorsa FM, Del Arco A, Kobayashi K, Iijima M, Runswick MJ, Walker JE, Saheki T, Satrústegui J, Palmieri F (сентябрь 2001 г.). «Цитрин и аралар1 являются Ca (2+)-стимулированными аспартатами/глутаматными переносчиками в митохондриях» . Embo Journal . 20 (18): 5060–9. doi : 10.1093/emboj/20.18.5060 . PMC 125626 . PMID 11566871 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: SLC25A12 семейство растворенных носителей 25 (митохондриальный носитель, Aralar), член 12» . Эта статья включает текст из этого источника, который находится в общественном доступе .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в «SLC25A12 - Кальций -связывающий митохондриальный белок -носитель Aralar1 - Homo Sapiens (Human) - SLC25A12 Ген и белок» . www.uniprot.org . Получено 2018-08-22 . Эта статья включает в себя текст, доступный по лицензии CC по 4,0 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в «Uniprot: универсальная база знаний белка» . Исследование нуклеиновых кислот . 45 (D1): D158 - D169. Январь 2017 года. DOI : 10.1093/nar/gkw1099 . PMC 5210571 . PMID 27899622 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Segurado R, Conroy J, Meally E, Fitzgerald M, Gill M, Gallagher L (ноябрь 2005 г.). «Подтверждение связи между аутизмом и геном митохондриального аспартата/глутамата носителя SLC25A12 на хромосоме 2Q31». Американский журнал психиатрии . 162 (11): 2182–4. doi : 10.1176/appi.ajp.162.11.2182 . HDL : 2262/34993 . PMID 16263864 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Lepagnol-Bestel AM, Maussion G, Boda B, Cardona A, Iwayama Y, Delezoide AL, Moalic JM, Muller D, Dean B, Yoshikawa T, Gorwood P, Buxbaum JD, Ramoz N, Simonneau M (апрель 2008 г.). «Экспрессия SLC25A12 связана с исходом нейритов и активируется в префронтальной коре аутичных субъектов». Молекулярная психиатрия . 13 (4): 385–97. doi : 10.1038/sj.mp.4002120 . PMID 18180767 . S2CID 28912813 .
^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J, J, J, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J, Odeberg. , Duan H, Ulen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии и медицины сердечного протеома специализированной базой знаний» . Исследование циркуляции . 113 (9): 1043–53. doi : 10.1161/circresaha.113.301151 . PMC 4076475 . PMID 23965338 .
^ «SLC25A12 - кальций -связывающий митохондриальный белок -носитель Aralar1» . Сердечный органеллерный белок Атлас База знаний (copakb) . Архивировано с оригинала 2018-08-25 . Получено 2018-08-24 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Del Arco A, Satrústegui J (сентябрь 1998 г.). «Молекулярное клонирование аралара, нового члена суперсемейства митохондриального носителя, который связывает кальций и присутствует в мышцах и мозге человека» . Журнал биологической химии . 273 (36): 23327–34. doi : 10.1074/jbc.273.36.23327 . PMID 9722566 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Онлайн Менделевский наследство в человеке, OMIM®. Университет Джона Хопкинса, Балтимор, Мэриленд. Номер MIM: {603667}: {08/01/2016} :. URL World Wide Web: https://omim.org/
^ Thangaratnarajah C, Ruprecht JJ, Kunji ER (ноябрь 2014). «Индуцированные кальцием конформационные изменения регуляторного домена человеческих митохондриальных аспартатных/глутаматных носителей» . Природная связь . 5 : 5491. Bibcode : 2014natco ... 5.5491t . doi : 10.1038/ncomms6491 . PMC 4250520 . PMID 25410934 .
^ Джалил М.А., Бегум Л., Контрерас Л., Пардо Б., Иджима М., Ли Мкс, Рамос М., Мармол П., Хориучи М., Шимоцу К., Накагава С., Окубо А, Самешима М., Ишик Й., Делько А., Кобайаши К, Сатерстегуи J, Saheki T (сентябрь 2005 г.). «Пониженные уровни N-ацетиласпатата у мышей, лишенных араалара, митохндриального аспартамата-митохнологического цикла мозга и мышц » Журнал биологической химии 280 (35): 313333–9 Doi : 10.1074/ jbc.m505286200 15987682PMID
^ Rubi B, Del Arco A, Bartley C, Satrustegui J, Maechler P (декабрь 2004 г.). «Малат-аспартатный член NADH Шаттл ARALAR1 определяет метаболическую судьбу глюкозы, митохондриальную активность и секрецию инсулина в бета-клетках» . Журнал биологической химии . 279 (53): 55659–66. doi : 10.1074/jbc.m409303200 . PMID 15494407 .
^ Нетронутый. "SLC25A12 взаимодействия" . www.ebi.ac.uk. Получено 2018-08-23 .

Дальнейшее чтение

Kobayashi K, SinaSac DS, Iijima M, Boright AP, Begum L, Lee JR, Yasuda T, Ikeda S, Hirano R, Terazono H, Crackower MA, Kondo I, Tsui LC, Scherer SW, Saheki T (июнь 1999 г.). «Ген, мутированный у взрослых, цитруллинойии типа II кодирует предполагаемый белок митохондриального носителя». Природа генетика . 22 (2): 159–63. doi : 10.1038/9667 . PMID 10369257 . S2CID 20137905 .
Sanz R, Del Arco A, Ayuso C, Ramos C, Satrústegui J (2000). «Назначение гена митохондриального носителя митохондриального носителя кальция (SLC25A12) к группе хромосом человека 2Q31 с помощью гибридизации in situ». Цитогенетика и клеточная генетика . 89 (3–4): 143–4. doi : 10.1159/000015595 . PMID 10965105 . S2CID 31225203 .
Рамос Н., Рейхерт Дж.Г., Смит С.Дж., Сильверман Дж. М., Беспалова В. В., Дэвис К.Л., Буксбаум Дж.Д. (апрель 2004 г.). «Связь и ассоциация гена митохондриального аспартата/глутамата SLC25A12 с аутизмом». Американский журнал психиатрии . 161 (4): 662–9. doi : 10.1176/appi.ajp.161.4.662 . PMID 15056512 .
Rubi B, Del Arco A, Bartley C, Satrustegui J, Maechler P (декабрь 2004 г.). «Малат-аспартатный член NADH Шаттл ARALAR1 определяет метаболическую судьбу глюкозы, митохондриальную активность и секрецию инсулина в бета-клетках» . Журнал биологической химии . 279 (53): 55659–66. doi : 10.1074/jbc.m409303200 . PMID 15494407 .
Rabionet R, McCauley JL, Jaworski JM, Ashley-Koch Ae, Martin ER, Sutcliffe JS, Haines JL, Delong GR, Abramson RK, Wright HH, Cuccaro ML, Gilbert JR, Pericak-Vance MA (май 2006 г.). «Отсутствие связи между аутизмом и SLC25A12». Американский журнал психиатрии . 163 (5): 929–31. doi : 10.1176/appi.ajp.163.5.929 . PMID 16648338 .
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х, Тейлор П., Клили С., МакБрум-Сираджевский Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарзее М., Хо Й., Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Dudewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). «Крупномасштабное картирование взаимодействия белка белка человека с помощью масс-спектрометрии» . Биология молекулярных систем . 3 (1): 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .
Hong CJ, Liou YJ, Liao DL, Hou SJ, Yen FC, Tsai SJ (октябрь 2007 г.). «Исследование ассоциации полиморфизмов в гене митохондриального аспартата/глутамата SLC25A12 (аралар) с шизофренией». Прогресс в нейропсихофармакологии и биологической психиатрии . 31 (7): 1510–3. doi : 10.1016/j.pnpbp.2007.07.010 . PMID 17693006 . S2CID 25829510 .

Эта статья включает в себя текст из Национальной медицины Соединенных Штатов , которая находится в общественном достоянии .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000115840 - ENSEMBL , май 2017 г.

[2] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[3] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid9722566-4] Del Arco A, Satrústegui J (сентябрь 1998 г.). «Молекулярное клонирование аралара, нового члена суперсемейства митохондриального носителя, который связывает кальций и присутствует в мышцах и мозге человека» . Журнал биологической химии . 273 (36): 23327–34. doi : 10.1074/jbc.273.36.23327 . PMID 9722566 .

[pmid10702666-5] Crackower MA, Sinasac DS, Lee JR, Herbrick JA, Tsui LC, Scherer SW (апрель 2000 г.). «Назначение гена SLC25A12, кодирующего кальций-связывающий митохондриальный растворенный белок с кальцием, аралар с хромосомой 2Q24 человека 2Q24». Цитогенетика и клеточная генетика . 87 (3–4): 197–8. doi : 10.1159/000015465 . PMID 10702666 . S2CID 28029151 .

[pmid11566871-6] Palmieri L, Pardo B, Lasorsa FM, Del Arco A, Kobayashi K, Iijima M, Runswick MJ, Walker JE, Saheki T, Satrústegui J, Palmieri F (сентябрь 2001 г.). «Цитрин и аралар1 являются Ca (2+)-стимулированными аспартатами/глутаматными переносчиками в митохондриях» . Embo Journal . 20 (18): 5060–9. doi : 10.1093/emboj/20.18.5060 . PMC 125626 . PMID 11566871 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: SLC25A12 семейство растворенных носителей 25 (митохондриальный носитель, Aralar), член 12» . Эта статья включает текст из этого источника, который находится в общественном доступе .

[:0-8] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в «SLC25A12 - Кальций -связывающий митохондриальный белок -носитель Aralar1 - Homo Sapiens (Human) - SLC25A12 Ген и белок» . www.uniprot.org . Получено 2018-08-22 . Эта статья включает в себя текст, доступный по лицензии CC по 4,0 .

[:3-9] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в «Uniprot: универсальная база знаний белка» . Исследование нуклеиновых кислот . 45 (D1): D158 - D169. Январь 2017 года. DOI : 10.1093/nar/gkw1099 . PMC 5210571 . PMID 27899622 .

[:2-10] Jump up to: ^а ^{беременный} Segurado R, Conroy J, Meally E, Fitzgerald M, Gill M, Gallagher L (ноябрь 2005 г.). «Подтверждение связи между аутизмом и геном митохондриального аспартата/глутамата носителя SLC25A12 на хромосоме 2Q31». Американский журнал психиатрии . 162 (11): 2182–4. doi : 10.1176/appi.ajp.162.11.2182 . HDL : 2262/34993 . PMID 16263864 .

[:4-11] Jump up to: ^а ^{беременный} Lepagnol-Bestel AM, Maussion G, Boda B, Cardona A, Iwayama Y, Delezoide AL, Moalic JM, Muller D, Dean B, Yoshikawa T, Gorwood P, Buxbaum JD, Ramoz N, Simonneau M (апрель 2008 г.). «Экспрессия SLC25A12 связана с исходом нейритов и активируется в префронтальной коре аутичных субъектов». Молекулярная психиатрия . 13 (4): 385–97. doi : 10.1038/sj.mp.4002120 . PMID 18180767 . S2CID 28912813 .

[COPaKB-12] Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J, J, J, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J, Odeberg. , Duan H, Ulen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии и медицины сердечного протеома специализированной базой знаний» . Исследование циркуляции . 113 (9): 1043–53. doi : 10.1161/circresaha.113.301151 . PMC 4076475 . PMID 23965338 .

[url_COPaKB-13] «SLC25A12 - кальций -связывающий митохондриальный белок -носитель Aralar1» . Сердечный органеллерный белок Атлас База знаний (copakb) . Архивировано с оригинала 2018-08-25 . Получено 2018-08-24 .

[:5-14] Jump up to: ^а ^{беременный} Del Arco A, Satrústegui J (сентябрь 1998 г.). «Молекулярное клонирование аралара, нового члена суперсемейства митохондриального носителя, который связывает кальций и присутствует в мышцах и мозге человека» . Журнал биологической химии . 273 (36): 23327–34. doi : 10.1074/jbc.273.36.23327 . PMID 9722566 .

[:1-15] Jump up to: ^а ^{беременный} Онлайн Менделевский наследство в человеке, OMIM®. Университет Джона Хопкинса, Балтимор, Мэриленд. Номер MIM: {603667}: {08/01/2016} :. URL World Wide Web: https://omim.org/

[16] Thangaratnarajah C, Ruprecht JJ, Kunji ER (ноябрь 2014). «Индуцированные кальцием конформационные изменения регуляторного домена человеческих митохондриальных аспартатных/глутаматных носителей» . Природная связь . 5 : 5491. Bibcode : 2014natco ... 5.5491t . doi : 10.1038/ncomms6491 . PMC 4250520 . PMID 25410934 .

[17] Джалил М.А., Бегум Л., Контрерас Л., Пардо Б., Иджима М., Ли Мкс, Рамос М., Мармол П., Хориучи М., Шимоцу К., Накагава С., Окубо А, Самешима М., Ишик Й., Делько А., Кобайаши К, Сатерстегуи J, Saheki T (сентябрь 2005 г.). «Пониженные уровни N-ацетиласпатата у мышей, лишенных араалара, митохндриального аспартамата-митохнологического цикла мозга и мышц » Журнал биологической химии 280 (35): 313333–9 Doi : 10.1074/ jbc.m505286200 15987682PMID

[18] Rubi B, Del Arco A, Bartley C, Satrustegui J, Maechler P (декабрь 2004 г.). «Малат-аспартатный член NADH Шаттл ARALAR1 определяет метаболическую судьбу глюкозы, митохондриальную активность и секрецию инсулина в бета-клетках» . Журнал биологической химии . 279 (53): 55659–66. doi : 10.1074/jbc.m409303200 . PMID 15494407 .

[19] Нетронутый. "SLC25A12 взаимодействия" . www.ebi.ac.uk. Получено 2018-08-23 .

[1]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]