CXCL10

CXCL10
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	1O80, 1LV9, 1O7Y, 1O7Z
Идентификаторы
Псевдонимы	CXCL10 , C7, IFI10, INP10, IP-10, SCYB10, CRG-2, GIP-10, MOB-1, CXC Мотив Хемокин Лиганд 10, CXC Мотив Chemokine 10
Внешние идентификаторы	Омим : 147310 ; MGI : 1352450 ; Гомологен : 1203 ; GeneCards : CXCL10 ; OMA : CXCL10 - Ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 4 (human)
End	76,023,497 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 5 (mouse)
End	92,496,748 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	appendix; ; testicle; ; decidua; ; lymph node; ; rectum; ; monocyte; ; granulocyte; ; olfactory zone of nasal mucosa; ; smooth muscle tissue; ; epithelium of nasopharynx;
	Top expressed in
	mesenteric lymph nodes; ; thymus; ; spleen; ; spermatocyte; ; optic nerve; ; embryo; ; right kidney; ; subcutaneous adipose tissue; ; embryo; ; granulocyte;
	More reference expression data
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	cytokine activity; heparin binding; CXCR3 chemokine receptor binding; chemokine activity; protein binding; cAMP-dependent protein kinase regulator activity; signaling receptor binding; chemoattractant activity;
Cellular component	extracellular region; external side of plasma membrane; extracellular space; intracellular anatomical structure;
Biological process	regulation of endothelial tube morphogenesis; negative regulation of myoblast differentiation; cellular response to heat; response to vitamin D; positive regulation of cell migration; T cell chemotaxis; chemokine-mediated signaling pathway; cell-cell signaling; response to virus; muscle organ development; positive regulation of monocyte chemotaxis; positive regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol; endothelial cell activation; positive regulation of cAMP-mediated signaling; regulation of T cell chemotaxis; blood circulation; chemotaxis; positive regulation of leukocyte chemotaxis; cell surface receptor signaling pathway; response to lipopolysaccharide; negative regulation of myoblast fusion; defense response to virus; regulation of cell population proliferation; immune response; positive regulation of cell population proliferation; response to auditory stimulus; negative regulation of angiogenesis; response to cold; cellular response to lipopolysaccharide; response to gamma radiation; positive regulation of T cell migration; signal transduction; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; regulation of protein kinase activity; defense response; inflammatory response; antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide; regulation of signaling receptor activity; G protein-coupled receptor signaling pathway; cytokine-mediated signaling pathway; adenylate cyclase-activating G protein-coupled receptor signaling pathway; response to bacterium; neutrophil chemotaxis; leukocyte chemotaxis; positive chemotaxis; regulation of apoptotic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	3627
	15945
	ENSG00000169245
	Ensmusg00000034855
	P02778
	P17515
	NM_001565
	NM_021274
	NP_001556
	NP_067249
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

CXC мотив хемокиновой лиганд 10 (CXCL10), также известный как индуцированный интерферон-гамма-индуцированным белком 10 (IP-10) или мелкоиндуцируемый цитокин B10 8,7 кДа -это белок , который у людей кодируется CXCL10 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} CXC Motif Chemokine 10 - это небольшой цитокин, принадлежащий семейству хемокинов CXC .

Ген

Ген для CXCL10 расположен на хромосоме человека 4 ^{[ 7 ]} в кластере среди нескольких других хемокинов CXC. ^{[ 8 ]}

Функция

CXCL10 секретируется несколькими типами клеток в ответ на IFN-γ . Эти типы клеток включают моноциты , эндотелиальные клетки и фибробласты . ^{[ 5 ]} CXCL10 был приписан нескольким ролям, таким как хемоаттракция для моноцитов / макрофагов , Т -клеток , NK -клеток и дендритных клеток , пропаганда адгезии Т -клеток в эндотелиальные клетки , противоопухолевую активность и ингибирование костного мозга формирования колоний и ангиогенеза . ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}

клеточной поверхности Этот хемокин вызывает его эффект путем связывания с рецептором хемокина CXCR3 . ^{[ 11 ]}

Структура

Трехмерная кристаллическая структура этого хемокина была определена в 3 различных условиях с разрешением до 1,92 Å. ^{[ 12 ]} Коды доступа к белкам Банка данных для структур CXCL10 составляют 1LV9 , 1O7Y и 1O80 .

Биомаркеры

CXCL9, CXCL10 и CXCL11 доказали, что являются достоверными биомаркерами для развития сердечной недостаточности и дисфункции левого желудочка, что предполагает подчеркивающую патофизиологическую связь между уровнями этих хемокинов и развитием неблагоприятного ремоделирования сердца. ^{[ 13 ]} ^{[ 14 ]}

Клиническое значение

Базовые уровни предварительной обработки в плазме CXCL10 повышаются у пациентов, хронически инфицированных вирусом гепатита С (ВГС) генотипов 1 или 4, которые не достигают устойчивого вирусного ответа (SVR) после завершения антивирусной терапии. ^{[ 15 ]}^{[ 16 ]} CXCL10 в плазме отражается интрапеченочной мРНК CXCL10, и оба поразительно прогнозируют первые дни элиминации РНК HCV («снижение первого этапа») во время терапии интерферона/рибавирина для всех генотипов HCV. ^{[ 17 ]} Это также применимо к пациентам, коинфицированным ВИЧ, где уровни IP-10 предварительного лечения ниже 150 пг/мл являются прогнозирующими для благоприятного ответа и, таким образом, могут быть полезны для поощрения этих пациентов, затрудненных для лечения, инициировать терапию. ^{[ 18 ]} Фароген Leishmania майор использует протеазу GP63, которая расщепляет CXCL10, что включает в себя CXCL10 в защитных механизмах хозяина некоторых внутриклеточных патогенов, таких как Leishmania . ^{[ 19 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000169245 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000034855 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Luster AD, Unkless JC, Ravetch JV (1985). «Транскрипционно гамма-интерферон регулирует ген раннего ответа, содержащий гомологию для белков тромбоцитов». Природа . 315 (6021): 672–6. Bibcode : 1985natur.315..672L . doi : 10.1038/315672A0 . PMID 3925348 . S2CID 4358066 .
^ Luster AD, Jhanwar SC, Chaganti RS, Kersey JH, Ravetch JV (май 1987). «Индуцируемые интерфероном генные карты с хромосомной полосой, связанной с транслокацией (4; 11) в острых клетках лейкоза» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 84 (9): 2868–71. Bibcode : 1987pnas ... 84.2868L . doi : 10.1073/pnas.84.9.2868 . PMC 304761 . PMID 2437586 .
^ «CXCL10 CXC Мотив хемокин лиганд 10 [Homo Sapiens (Human)] - ген - NCBI» .
^ О'Донован Н., Гальвин М., Морган Дж.Г. (1999). «Физическое картирование локуса хемокинов CXC на хромосоме человека 4». Цитогенетика и клеточная генетика . 84 (1–2): 39–42. doi : 10.1159/000015209 . PMID 10343098 . S2CID 8087808 .
^ Dufour JH, Dziejman M, Liu MT, Leung JH, Lane TE, Luster AD (апрель 2002 г.). «Мыши-дефицит IFN-гамма-индуцируемый белок 10 (IP-10; CXCL10), дефицитные мыши, выявляют роль для IP-10 в генерации и переносе Т-клеток» . Журнал иммунологии . 168 (7): 3195–204. doi : 10.4049/jimmunol.168.7.3195 . PMID 11907072 .
^ Angiolillo AL, Sgadari C, Taub DD, Liao F, Farber JM, Maheshwari S, et al. (Июль 1995 г.). «Человеческий интерферон-индуцируемый белок 10 является мощным ингибитором ангиогенеза in vivo» . Журнал экспериментальной медицины . 182 (1): 155–62. doi : 10.1084/jem.182.1.155 . PMC 2192108 . PMID 7540647 .
^ Бут V, Keizer DW, Kamphuis MB, Clark-Lewis I, Sykes BD (август 2002 г.). «CXCR3 связывание хемокина IP-10/CXCL10: структура и рецепторные взаимодействия». Биохимия . 41 (33): 10418–25. doi : 10.1021/bi026020q . PMID 12173928 .
^ Swaminathan GJ, Holloway DE, Colvin RA, Campanella GK, Papageorgiou AC, Luster AD, Acharya KR (май 2003 г.). «Кристаллические структуры олигомерных форм хемокина IP-10/CXCL10» . Структура 11 (5): 521–32. doi : 10.1016/s0969-2126 (03) 00070-4 . PMID 12737818 .
^ Алтара Р., Гу Й.М., Струйкер-Баудиер Х.А., Тиджс Л., Стассен Дж. «Дисфункция левого желудочка и лиганды CXCR3 в гипертонии: от экспериментов на животных до популяционного пилотного исследования» . Plos один . 10 (10): E0141394. BIBCODE : 2015PLOSO..1041394A . doi : 10.1371/journal.pone.0141394 . PMC 4624781 . PMID 26506526 .
^ Алтара Р., Манка М., Хессель М.Х., Гу Й., Ван Варк Л.К., Аккерхуис К.М. и др. (Август 2016 г.). «CXCL10 является циркулирующим воспалительным маркером у пациентов с усовершенствованной сердечной недостаточностью: пилотное исследование» . Журнал сердечно -сосудистых трансляционных исследований . 9 (4): 302–14. doi : 10.1007/s12265-016-9703-3 . PMID 27271043 . S2CID 41188765 .
^ Ромеро А.И., отставание М., Вестин Дж., Диллон А.П., Дастин Л.Б., Павлоцкий Дж.М. и др. (Октябрь 2006 г.). «Интерферон (IFN) -гмма-индуцируемый белок-10: ассоциация с гистологическими результатами, вирусной кинетикой и исходом во время лечения пегилированной IFN-альфа 2A и рибавирином для хронического инфекции вируса гепатита С» . Журнал инфекционных заболеваний . 194 (7): 895–903. doi : 10.1086/507307 . PMID 16960776 .
^ Отставание М., Ромеро А.И., Вестин Дж., Норкранс Г., Диллон А.П., Павлоцкий Дж.М. и др. (Декабрь 2006 г.). «IP-10 предсказывает вирусный ответ и терапевтический исход у пациентов с трудностями с инфекцией генотипа 1 HCV» . Гепатология . 44 (6): 1617–25. doi : 10.1002/hep.21407 . PMID 17133471 . S2CID 27733803 .
^ Askarieh G, Alsiö A, Pugnale P, Negro F, Ferrari C, Neumann Au, et al. (Май 2010). «Системный и внутрипеченочный интерферон-гамма-индуцируемый белок 10 кДа предсказывает снижение первой фазы РНК вируса гепатита С и общий вирусный ответ на терапию при хроническом гепатите С» . Гепатология . 51 (5): 1523–30. doi : 10.1002/HEP.23509 . PMID 20186843 . S2CID 205873437 .
^ Falconer K, Askarieh G, Weis N, Hellstrand K, Alaeus A, отставание M (декабрь 2010 г.). «IP-10 предсказывает первое снижение фазы РНК HCV и общий вирусный ответ на терапию у пациентов, составленных с хронической инфекцией вируса гепатита С и ВИЧ». Скандинавский журнал инфекционных заболеваний . 42 (11–12): 896–901. doi : 10.3109/00365548.2010.498019 . PMID 20608766 . S2CID 28542340 .
^ Антония А.Л., Гиббс К.Д., Трахайр Э.Д., Питтман К.Дж., Мартин А.Т., Шотт Б.Х. и др. (2019). «Уклонение патогена ответа хемокинов посредством подавления CXCL10» . Границы в клеточной и инфекционной микробиологии . 9 : 280. DOI : 10.3389/fcimb.2019.00280 . PMC 6693555 . PMID 31440475 .

Внешние ссылки

Расположение генома человека C7 и страница детали гена C7 в браузере генома UCSC .
человека Местоположение генома CXCL10 и CXCL10 страница генов в браузере UCSC Genome .
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для Uniprot : P02778 (CXC Motif Chemokine 10) в PDBE-KB .

Дальнейшее чтение

Farber JM (март 1997 г.). «Миг и IP-10: хемокины CXC, которые нацелены на лимфоциты» . Журнал биологии лейкоцитов . 61 (3): 246–57. doi : 10.1002/jlb.61.3.246 . PMID 9060447 . S2CID 14935171 .
Neville LF, Mathiak G, Bagasra O (сентябрь 1997 г.). «Иммунобиология индуцируемого интерфероном-гамма белка 10 кД (IP-10): новый, плейотропный член суперсемейства хемокинов CXC». Обзоры цитокинов и факторов роста . 8 (3): 207–19. doi : 10.1016/s1359-6101 (97) 00015-4 . PMID 9462486 .

Эта статья о гене о хромосоме человека 4 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000169245 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000034855 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid3925348-5] Jump up to: ^а ^{беременный} Luster AD, Unkless JC, Ravetch JV (1985). «Транскрипционно гамма-интерферон регулирует ген раннего ответа, содержащий гомологию для белков тромбоцитов». Природа . 315 (6021): 672–6. Bibcode : 1985natur.315..672L . doi : 10.1038/315672A0 . PMID 3925348 . S2CID 4358066 .

[pmid2437586-6] Luster AD, Jhanwar SC, Chaganti RS, Kersey JH, Ravetch JV (май 1987). «Индуцируемые интерфероном генные карты с хромосомной полосой, связанной с транслокацией (4; 11) в острых клетках лейкоза» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 84 (9): 2868–71. Bibcode : 1987pnas ... 84.2868L . doi : 10.1073/pnas.84.9.2868 . PMC 304761 . PMID 2437586 .

[7] «CXCL10 CXC Мотив хемокин лиганд 10 [Homo Sapiens (Human)] - ген - NCBI» .

[pmid10343098-8] О'Донован Н., Гальвин М., Морган Дж.Г. (1999). «Физическое картирование локуса хемокинов CXC на хромосоме человека 4». Цитогенетика и клеточная генетика . 84 (1–2): 39–42. doi : 10.1159/000015209 . PMID 10343098 . S2CID 8087808 .

[pmid11907072-9] Dufour JH, Dziejman M, Liu MT, Leung JH, Lane TE, Luster AD (апрель 2002 г.). «Мыши-дефицит IFN-гамма-индуцируемый белок 10 (IP-10; CXCL10), дефицитные мыши, выявляют роль для IP-10 в генерации и переносе Т-клеток» . Журнал иммунологии . 168 (7): 3195–204. doi : 10.4049/jimmunol.168.7.3195 . PMID 11907072 .

[pmid7540647-10] Angiolillo AL, Sgadari C, Taub DD, Liao F, Farber JM, Maheshwari S, et al. (Июль 1995 г.). «Человеческий интерферон-индуцируемый белок 10 является мощным ингибитором ангиогенеза in vivo» . Журнал экспериментальной медицины . 182 (1): 155–62. doi : 10.1084/jem.182.1.155 . PMC 2192108 . PMID 7540647 .

[pmid12173928-11] Бут V, Keizer DW, Kamphuis MB, Clark-Lewis I, Sykes BD (август 2002 г.). «CXCR3 связывание хемокина IP-10/CXCL10: структура и рецепторные взаимодействия». Биохимия . 41 (33): 10418–25. doi : 10.1021/bi026020q . PMID 12173928 .

[pmid12737818-12] Swaminathan GJ, Holloway DE, Colvin RA, Campanella GK, Papageorgiou AC, Luster AD, Acharya KR (май 2003 г.). «Кристаллические структуры олигомерных форм хемокина IP-10/CXCL10» . Структура 11 (5): 521–32. doi : 10.1016/s0969-2126 (03) 00070-4 . PMID 12737818 .

[13] Алтара Р., Гу Й.М., Струйкер-Баудиер Х.А., Тиджс Л., Стассен Дж. «Дисфункция левого желудочка и лиганды CXCR3 в гипертонии: от экспериментов на животных до популяционного пилотного исследования» . Plos один . 10 (10): E0141394. BIBCODE : 2015PLOSO..1041394A . doi : 10.1371/journal.pone.0141394 . PMC 4624781 . PMID 26506526 .

[14] Алтара Р., Манка М., Хессель М.Х., Гу Й., Ван Варк Л.К., Аккерхуис К.М. и др. (Август 2016 г.). «CXCL10 является циркулирующим воспалительным маркером у пациентов с усовершенствованной сердечной недостаточностью: пилотное исследование» . Журнал сердечно -сосудистых трансляционных исследований . 9 (4): 302–14. doi : 10.1007/s12265-016-9703-3 . PMID 27271043 . S2CID 41188765 .

[pmid16960776-15] Ромеро А.И., отставание М., Вестин Дж., Диллон А.П., Дастин Л.Б., Павлоцкий Дж.М. и др. (Октябрь 2006 г.). «Интерферон (IFN) -гмма-индуцируемый белок-10: ассоциация с гистологическими результатами, вирусной кинетикой и исходом во время лечения пегилированной IFN-альфа 2A и рибавирином для хронического инфекции вируса гепатита С» . Журнал инфекционных заболеваний . 194 (7): 895–903. doi : 10.1086/507307 . PMID 16960776 .

[pmid17133471-16] Отставание М., Ромеро А.И., Вестин Дж., Норкранс Г., Диллон А.П., Павлоцкий Дж.М. и др. (Декабрь 2006 г.). «IP-10 предсказывает вирусный ответ и терапевтический исход у пациентов с трудностями с инфекцией генотипа 1 HCV» . Гепатология . 44 (6): 1617–25. doi : 10.1002/hep.21407 . PMID 17133471 . S2CID 27733803 .

[pmid20186843-17] Askarieh G, Alsiö A, Pugnale P, Negro F, Ferrari C, Neumann Au, et al. (Май 2010). «Системный и внутрипеченочный интерферон-гамма-индуцируемый белок 10 кДа предсказывает снижение первой фазы РНК вируса гепатита С и общий вирусный ответ на терапию при хроническом гепатите С» . Гепатология . 51 (5): 1523–30. doi : 10.1002/HEP.23509 . PMID 20186843 . S2CID 205873437 .

[pmid20608766-18] Falconer K, Askarieh G, Weis N, Hellstrand K, Alaeus A, отставание M (декабрь 2010 г.). «IP-10 предсказывает первое снижение фазы РНК HCV и общий вирусный ответ на терапию у пациентов, составленных с хронической инфекцией вируса гепатита С и ВИЧ». Скандинавский журнал инфекционных заболеваний . 42 (11–12): 896–901. doi : 10.3109/00365548.2010.498019 . PMID 20608766 . S2CID 28542340 .

[19] Антония А.Л., Гиббс К.Д., Трахайр Э.Д., Питтман К.Дж., Мартин А.Т., Шотт Б.Х. и др. (2019). «Уклонение патогена ответа хемокинов посредством подавления CXCL10» . Границы в клеточной и инфекционной микробиологии . 9 : 280. DOI : 10.3389/fcimb.2019.00280 . PMC 6693555 . PMID 31440475 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]