XPB
ERCC3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | ERCC3 , Исключение восстановления группы поперечного комплементации 3, BTF2, GTF2H, RAD25, TFIIH, XPB, TTD2, ERCC Excision Repair 3, Tfiih Core Complex Subunite, SSL2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | Омим : 133510 ; MGI : 95414 ; Гомологен : 96 ; GeneCards : ERCC3 ; OMA : ERCC3 - Ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Викидид | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
XPB ( Xeroderma pigmentosum type B) является АТФ -зависимой ДНК -геликазой у людей, которая является частью TFIIH комплекса транскрипции .
Структура
[ редактировать ]3D-структура архейного гомолога XPB была решена рентгеновской кристаллографией доктором Джоном Тайнером и его группой в исследовательском институте Scripps . [ 5 ]
Функция
[ редактировать ]XPB играет значительную роль в нормальной базальной транскрипции, восстановлении транскрипции (TCR) и восстановлении нуклеотидного удаления (NER). Было показано, что очищенный XPB раскручивает ДНК с 3'-5 'полярностью.
Функция белка XPB (ERCC3) в NER состоит в том, чтобы помочь в расслаблении двойной спирали ДНК после того, как изначально распознается повреждение. NER-это многоэтапный путь, который удаляет широкий диапазон различных повреждений ДНК, который искажает нормальное сочетание оснований. Такие ущербы включают громоздкие химические аддукты, ультрафиолетовые димеры пиримидина и несколько форм окислительного повреждения . Мутации в гене XPB (ERCC3) могут привести к людям к Xeroderma Pigmentosum (XP) или XP в сочетании с синдромом Cockayne (XPC). [ 6 ] Мутантные клетки XPB от людей с фенотипом XPCS чувствительны к УФ -облучению и острым окислительным стрессом. [ 7 ]
XPD Helicase также является компонентом p53 -опосредованного пути программированной гибели клеток ( апоптоз ). [ 8 ]
Расстройства
[ редактировать ]Мутации в XPB и других связанных группах комплементации, XPA-XPG, приводят к ряду генетических расстройств, таких как пигментирование ксеродермы , синдром Кокейна и трихотиодистрофия .
Взаимодействия
[ редактировать ]Было показано, что XPB взаимодействует :
Маленькие ингибиторы молекул
[ редактировать ]Мощные биологически активные натуральные продукты, такие как триптолид, которые ингибируют транскрипцию млекопитающих посредством ингибирования субъединицы XPB общего фактора транскрипции TFIIH, недавно сообщалось в качестве конъюгата глюкозы для нацеливания гипоксических раковых клеток с повышенной экспрессией транспортера глюкозы. [ 19 ]
Смотрите также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а беременный в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000163161 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ Jump up to: а беременный в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000024382 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
- ^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
- ^ Fan L, Arvai AS, Cooper PK, Iwai S, Hanaoka F, Tainer JA (апрель 2006 г.). «Консервативная структура ядра XPB и мотивы для раскрытия ДНК: последствия для выбора пути транскрипции или восстановления удаления» . Молекулярная клетка . 22 (1): 27–37. doi : 10.1016/j.molcel.2006.02.017 . PMID 16600867 .
- ^ О К.С., Хан С.Г., Джасперс Н.Г., Раамс А., Уэда Т., Леманн А., Фридман П.С., Эммерт С., Грачев А., Лахлан К., Лукасан А., Бейкер К.К., Крамер К.Х. (2006). «Фенотипическая гетерогенность в ген -геликазе XPB (ERCC3): ксеродерма пигментосум без синдрома Кокейна» . Гул Мутат . 27 (11): 1092–103. doi : 10.1002/Humu.20392 . PMID 16947863 . S2CID 22852219 .
- ^ Andressoo Jo, Weeda G, De Wit J, Mitchell JR, Beems RB, Van Steeg H, Van Der Horst GT, Hoeijmakers JH (2009). «Модель мыши XPB для комбинированной ксеродермы пигментной пигментной и синдрома Кокейна выявляет признаки прогероидов при дальнейшем ослаблении репарации ДНК» . Мол Клетка. Биол . 29 (5): 1276–90. doi : 10.1128/mcb.01229-08 . PMC 2643825 . PMID 19114557 .
- ^ Wang XW, Vermeulen W, Coursen JD, Gibson M, Lupold SE, Forrester K, Xu G, Elmore L, Yeh H, Hoeijmakers JH, Harris CC (май 1996 г.). «ДНК-геликазы XPB и XPD представляют собой компоненты P53-опосредованного пути апоптоза». Гены Дев . 10 (10): 1219–32. doi : 10.1101/gad.10.10.1219 . PMID 8675009 .
- ^ Такеда Н., Шибуя М., Мару Й (январь 1999 г.). «Онкопротеин BCR-ABL потенциально взаимодействует с белком B-пигментной группы B-пигменты B» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 96 (1): 203–7. Bibcode : 1999pnas ... 96..203t . doi : 10.1073/pnas.96.1.203 . PMC 15117 . PMID 9874796 .
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон Гилья-Мари Г., Монета Ф., Раньский Дж., Горные линии Д., Телл А., Вейерс Н., Ясперс Н.Г., Раамс А., Аргентини М., из навыка П.Дж., Ботта Е., Стефанни М, Эгли Дж. М., Эберс Р., Аэберс. Июль 2004). «Новая, десятая субъединица или TFIIH отвечают за синдром, восстановленный ДНК, трихтродитром gup a» . НАТ Gnet . 36 (7): 714–9. doi : 10,1038/ng1387 . PMID 15220921 .
- ^ Jump up to: а беременный Россиньол М., Колб-Шайнел I, Эгли Дж. М. (апрель 1997 г.). «Субстратная специфичность активирующей CDK киназы (CAK) изменяется при связи с TFIIH» . Embo j . 16 (7): 1628–37. doi : 10.1093/emboj/16.7.1628 . PMC 1169767 . PMID 9130708 .
- ^ Yee A, Nichols MA, Wu L, Hall FL, Kobayashi R, Xiong Y (декабрь 1995 г.). «Молекулярное клонирование CDK7-ассоциированного MAT1 человека, циклин-зависимого киназы, активирующего киназу (CAK) фактор сборки». Рак . 55 (24): 6058–62. PMID 8521393 .
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый Marinoni JC, Roy R, Vermeulen W, Miniou P, Lutz Y, Weeda G, Seroz T, Gomez DM, Hoeijmakers JH, Egly JM (март 1997 г.). «Клонирование и характеристика p52, пятой субъединицы ядра транскрипции/ДНК репарации Tfiih» . Embo j . 16 (5): 1093–102. doi : 10.1093/emboj/16.5.1093 . PMC 1169708 . PMID 9118947 .
- ^ Drapkin R, Reardon JT, Ansari A, Huang JC, Zawel L, Ahn K, Sancar A, Reinberg D (апрель 1994 г.). «Двойная роль TFIIH в репарации удаления ДНК и в транскрипции с помощью РНК -полимеразы II». Природа . 368 (6473): 769–72. Bibcode : 1994natur.368..769d . doi : 10.1038/368769a0 . PMID 8152490 . S2CID 4363484 .
- ^ Айер Н., Рейган М.С., Ву К.Дж., Канагараджа Б., Фридберг ЕС (февраль 1996 г.). «Взаимодействия с участием транскрипции транскрипции/удаления транскрипции РНК -полимеразы человека/нуклеотидов TFIIH, белка восстановления нуклеотидного удаления XPG и белка синдрома Cockayne Group B (CSB)». Биохимия . 35 (7): 2157–67. doi : 10.1021/bi9524124 . PMID 8652557 .
- ^ Wang XW, Yeh H, Schaeffer L, Roy R, Moncollin V, Egly JM, Wang Z, Freidberg EC, Evans MK, Taffe BG (июнь 1995 г.). «P53 модуляция активности восстановления нуклеотидных ударов, ассоциированной с TFIIH» . НАТ Генет . 10 (2): 188–95. doi : 10.1038/ng0695-188 . HDL : 1765/54884 . PMID 7663514 . S2CID 38325851 .
- ^ Weeda G, Rossignol M, Fraser RA, Winkler GS, Vermeulen W, Van 'T Veer LJ , Ma L, Hoeijmakers JH, Egly JM (июнь 1997 г.). «Субъединица XPB восстановления/фактора транскрипции TFIIH напрямую взаимодействует с SUG1, субъединицей протеасомы 26S и предполагаемого транскрипционного фактора» . Нуклеиновые кислоты Res . 25 (12): 2274–83. doi : 10.1093/nar/25.12.2274 . PMC 146752 . PMID 9173976 .
- ^ Yokoi M, Masutani C, Maekawa T, Sugasawa K, Ohkuma Y, Hanaoka F (март 2000 г.). «Белковой комплекс Pigmentosum Group Comply Comply Complysum Complex X-HR23B играет важную роль в рекрутировании транскрипционного фактора IIH в поврежденную ДНК» . Дж. Биол. Химический 275 (13): 9870–5. doi : 10.1074/jbc.275.13.9870 . PMID 10734143 .
- ^ Datan E, Minn I, Peng X, He Ql, Ahn H, Yu B, Pomper Mg, Liu Jo (2020). «Конъюгат глюкозы-триптолида избирательно нацелен на раковые клетки при гипоксии» . ISCAING . 23 (9): 101536. Bibcode : 202020SICI ... 23J1536D . doi : 10.1016/j.isci.2020.101536 . PMC 7509213 . PMID 33083765 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Жанг К.Т. (1998). «TAT, TAT-ассоциированная киназа и транскрипция». J. Biomed. Наука 5 (1): 24–7. doi : 10.1007/bf02253352 . PMID 9570510 .
- Янкулов К., Бентли Д. (1998). «Транскрипционное управление: кофакторы TAT и удлинение транскрипции» . Карт Биол . 8 (13): R447–9. doi : 10.1016/s0960-9822 (98) 70289-1 . PMID 9651670 . S2CID 15480646 .
- Cleaver JE, Thompson LH, Richardson AS, States JC (1999). «Краткое изложение мутаций при УФ-чувствительных расстройствах: ксеродерма пигментосум, синдром Кокейна и трихотиодистрофия» . Гул Мутат . 14 (1): 9–22. doi : 10.1002/(sici) 1098-1004 (1999) 14: 1 <9 :: Aid-humu2> 3.0.co; 2-6 . PMID 10447254 . S2CID 24148589 .
- Ma L, Weeda G, Jochemsen AG, Bootsma D, Hoeijmakers JH, Van der EB AJ (1992). «Молекулярный и функциональный анализ промотора XPBC/ERCC-3: транскрипционная активность зависит от целостности сайта связывания SP1» . Нуклеиновые кислоты Res . 20 (2): 217–24. doi : 10.1093/nar/20.2.217 . PMC 310357 . PMID 1741247 .
- Weeda G, Weedgan J, Ploey M, Geerts of Kessel AH, EB AJ, Верховные суды JH (1991). «Локация Xoreerma Pigmentosum Group B, исправляющие гены ERCC3 в хромосому человека 2Q21» . Геномика . 10 (4): 1035–1040. doi : 10,1016/0888-7543 (91) 90195-K . HDL : 1765/3025 . PMID 1916809 .
- Weeda G, Ma LB, Van Ham RC, Van der EB AJ, Hoeijmakers JH (1991). «Структура и экспрессия гена XPBC/ERCC-3 человека, участвующих в расстройствах репарации ДНК, пигментированной пигментированием и синдромом Кокейна» . Нуклеиновые кислоты Res . 19 (22): 6301–6308. doi : 10.1093/nar/19.22.6301 . PMC 329143 . PMID 1956789 .
- Weeda G, Ham RC, Masurel R, Western Field A, Odik H, The White J, Bootsma D, EB AJ, Supremembers JH (1990). «Клонирование MOLC и биологическая хартрация или восстановление человека, восстановившие гены ERCCC-3» . Крот. Клетка. Биол . 10 (6): 2570–2581. doi : 10 1128/McB.10,6,2570 . PMC 360615 . PMID 2111438 .
- Weeda G, Van Ham RC, Vermeulen W, Bootsma D, Van der EB AJ, Hoeijmakers JH (1990). «Предполагаемая ДНК-геликаза, кодируемая ERCC-3, участвует в расстройствах восстановления человека, пигментной пигментировании и синдроме Кокейна» . Клетка . 62 (4): 777–91. doi : 10.1016/0092-8674 (90) 90122-U . HDL : 1765/3020 . PMID 2167179 . S2CID 31743602 .
- Wang XW, Yeh H, Schaeffer L, Roy R, Moncollin V, Egly JM, Wang Z, Freidberg EC, Evans MK, Taffe BG (1995). «P53 модуляция активности восстановления нуклеотидных ударов, ассоциированной с TFIIH» . НАТ Генет . 10 (2): 188–95. doi : 10.1038/ng0695-188 . HDL : 1765/54884 . PMID 7663514 . S2CID 38325851 .
- Maxon Me, Goodrich JA, Tjian R (1994). «Фактор транскрипции IIE связывается преимущественно с РНК -полимеразой IIA и рекрутирует TFIIH: модель для промотора» . Гены Дев . 8 (5): 515–24. doi : 10.1101/gad.8.5.515 . PMID 7926747 .
- Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-капитализация: простой метод замены структуры крышки эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
- Drapkin R, Reardon JT, Ansari A, Huang JC, Zawel L, Ahn K, Sancar A, Reinberg D (1994). «Двойная роль TFIIH в репарации удаления ДНК и в транскрипции с помощью РНК -полимеразы II». Природа . 368 (6473): 769–72. Bibcode : 1994natur.368..769d . doi : 10.1038/368769a0 . PMID 8152490 . S2CID 4363484 .
- из меха AJ, Verume W, Ma L, Weeda G, Appeldoor E, Jasper Ng, Slough EB AJ, Bootsma D, Supply JH, Humbert S (1994). «Коррекция или перекраска пигментов ксеродерма с помощью базального транскрипционного фактора BTF2 (TFIIH)» . Embo j . 13 (7): 1645–1653. doi : 10,1002/j.1460–2075,1994.tb06428.x . PMC 39495 . PMID 8157004 .
- Schefeffeffer L, Moncollin V, Roy R, Staub A, Mezzina M, Sarasin A, Weeda G, Hoeijmakers JH, Egly JM (1994). «Белок репарации ERC2/ДНК связан с транскрипционным фактором класса II BTF2/TFIIH » j Embo 13 (10): 2388–2 Doi : 10.1002/ j.1460-2075.1994.tb06522.x 395103PMC 8194528PMID
- Guzder SN, Sung P, Bailly V, Prakash L, Prakash S (1994). «RAD25 - это ДНК -геликаза, необходимая для репарации ДНК и транскрипции РНК -полимеразы II». Природа . 369 (6481): 578–81. Bibcode : 1994natur.369..578g . doi : 10.1038/369578A0 . PMID 8202161 . S2CID 4332757 .
- Вермейлен В., Скотт Р.Дж., Роджерс С., Мюллер Х.Дж., Коул Дж., Арлетт К.Ф., Клейджер В.Дж., Бутсма Д., Хоэймейкерс Дж. Х., Уида Г. (1994). Клиническая гетерогенность в ксеродерме пигментированной пигментированной « Являюсь. J. Hum. Genets 54 (2): 191–2 1918172PMC 8304337PMID
- Скотт Р.Дж., Итин П., Клейджер В.Дж., Колб К., Арлетт С., Мюллер Х (1993). «Ксеродерма пигментосум-кокейн-комплекс у двух пациентов: отсутствие опухолей кожи, несмотря на тяжелый дефицит восстановления удаления ДНК». J. Am. Академический Дерматол . 29 (5 пт 2): 883–9. doi : 10.1016/0190-9622 (93) 70263-S . PMID 8408834 .
- Blau J, Xiao H, McCracken S, O'Hare P, Greenblatt J, Bentley D (1996). «Три функциональных класса домена активации транскрипции» . Мол Клетка. Биол . 16 (5): 2044–2055. doi : 10.1128/mcb.16.5.2044 . PMC 231191 . PMID 8628270 .
- Айер Н., Рейган М.С., У К.Дж., Канагараджа Б., Фридберг Е.К. (1996). «Взаимодействия с участием транскрипции транскрипции/удаления транскрипции РНК -полимеразы человека/нуклеотидов TFIIH, белка восстановления нуклеотидного удаления XPG и белка синдрома Cockayne Group B (CSB)». Биохимия . 35 (7): 2157–2167. doi : 10.1021/bi9524124 . PMID 8652557 .
- Hwang JR, Moncollin V, Vermeulen W, Seroz T, Van Vurin H, Hoejmakers JH, Egly JM (1996). «Дефект геликазы 3 '→ 5' геликазы XPB в восстановлении/транскрипции Fatfih of Xederma Pigmentosum Group B влияет как на восстановление ДНК, так и транскрипцию » Дж. Биол. Химический 271 (27): 15898–9 Doi : 10.1074/ jbc.271.27.15898 HDL : 1765/3098 8663148PMID
Внешние ссылки
[ редактировать ]- GeneReviews/nih/ncbi/uw inpity на ксеродерме пигментосум
- Белок XPBC-ERCC-3+ в Национальной библиотеке Медицинской библиотеки Медицинской библиотеки (Mesh)