ПТПРЗ1

ПТПРЗ1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	3JXF, 3S97, 5AWX
Идентификаторы
Псевдонимы	PTPRZ1 , HPTPZ, HPTPzeta, PTP-ZETA, PTP18, PTPRZ, PTPZ, R-PTP-zeta-2, RPTPB, RPTPbeta, фосфакан, протеинтирозинфосфатаза, рецептор типа Z1, рецептор протеинтирозинфосфатазы типа Z1
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 176891 ; МГИ : 97816 ; Гомологен : 2136 ; GeneCards : PTPRZ1 ; ОМА : PTPRZ1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 7 (human)
End	122,062,036 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 6 (mouse)
End	23,052,915 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ventricular zone; ; ganglionic eminence; ; endothelial cell; ; amygdala; ; Region I of hippocampus proper; ; optic nerve; ; caudate nucleus; ; nucleus accumbens; ; corpus callosum; ; external globus pallidus;
	Top expressed in
	vestibular membrane of cochlear duct; ; Rostral migratory stream; ; mammillary body; ; median eminence; ; ventromedial nucleus; ; lobe of cerebellum; ; arcuate nucleus; ; cerebellar vermis; ; lateral septal nucleus; ; anterior amygdaloid area;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	phosphoprotein phosphatase activity; phosphatase activity; protein binding; protein tyrosine phosphatase activity; transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity; hydrolase activity; integrin binding;
Cellular component	integral component of membrane; membrane; integral component of plasma membrane; extracellular region; perineuronal net; intrinsic component of plasma membrane; plasma membrane; extracellular matrix; synapse;
Biological process	axonogenesis; protein dephosphorylation; oligodendrocyte differentiation; regulation of oligodendrocyte progenitor proliferation; central nervous system development; hematopoietic progenitor cell differentiation; learning or memory; peptidyl-tyrosine dephosphorylation; dephosphorylation; cytokine-mediated signaling pathway; regulation of myelination; negative regulation of neuron apoptotic process; positive regulation of oligodendrocyte differentiation;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	5803
	19283
	ENSG00000106278
	ENSMUSG00000068748
	P23471
	Б9ЭКР1
	НМ_001206838 ; НМ_001206839 ; НМ_002851 ; НМ_001369395 ; НМ_001369396
	НМ_001081306 ; НМ_011219 ; НМ_178180 ; НМ_001311064 ; НМ_001361349
	НП_001193767 ; НП_001193768 ; НП_002842
showНП_001074775 ; НП_001297993 ; НП_001348278 ; НП_035349 ; НП_001389981 ;
	NP_001389982; NP_001389983
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Тирозин-протеинфосфатаза дзета рецепторного типа, также известная как фосфакан, представляет собой фермент , который у человека кодируется PTPRZ1 геном . ^[5]^[6]^[7]

Функция

Этот ген является членом семейства рецепторных тирозинфосфатаз и кодирует однопроходной мембранный белок типа I с двумя цитоплазматическими доменами тирозинпротеинфосфатазы, доменом альфа-карбоангидразы и доменом фибронектина типа III . Описаны альтернативные варианты сплайсинга, кодирующие разные изоформы белка, но их полноразмерная природа не определена. ^[7]

Клиническое значение

Экспрессия этого гена индуцируется в клетках рака желудка , в ремиелинизирующих олигодендроцитах поражений рассеянного склероза и в клетках эмбриональных почек человека в условиях гипоксии . И белок, и транскрипт сверхэкспрессируются в клетках глиобластомы , способствуя их гаптотактической миграции. ^[7]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000106278 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000068748 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Арияма Т., Хасегава К., Инадзава Дж., Мизуно К., Огимото М., Катагири Т., Якура Х. (июнь 1995 г.). «Присвоение гена человеческой протеинтирозинфосфатазы рецепторного типа дзета (PTPRZ) полосе хромосомы 7q31.3». Цитогенетический клеточный генетик . 70 (1–2): 52–4. дои : 10.1159/000133990 . ПМИД 7736789 .
^ Леви Дж.Б., Канолл П.Д., Сильвеннойнен О., Барнеа Дж., Морс Б., Онеггер А.М., Хуанг Дж.Т., Канниццаро Л.А., Парк Ш., Драк Т. (июнь 1993 г.). «Клонирование протеина тирозинфосфатазы рецепторного типа, экспрессируемого в центральной нервной системе» . J Биол Хим . 268 (14): 10573–81. дои : 10.1016/S0021-9258(18)82237-2 . ПМИД 8387522 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с «Ген Энтреза: протеин-тирозинфосфатаза PTPRZ1, рецепторного типа, Z-полипептид 1» .

Дальнейшее чтение

Крюгер NX, Сайто Х (1992). «Человеческая трансмембранная протеин-тирозин-фосфатаза, PTP-дзета, экспрессируется в головном мозге и имеет N-концевой рецепторный домен, гомологичный карбоангидразам» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 89 (16): 7417–21. Бибкод : 1992PNAS...89.7417K . дои : 10.1073/pnas.89.16.7417 . ПМК 49721 . ПМИД 1323835 .
Каплан Р., Морс Б., Хюбнер К., Кроче С., Хоук Р., Равера М., Рикка Г., Джей М., Шлессингер Дж. (1990). «Клонирование трех тирозинфосфатаз человека выявило мультигенное семейство рецептор-связанных протеинтирозинфосфатаз, экспрессируемых в мозге» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 87 (18): 7000–4. Бибкод : 1990PNAS...87.7000K . дои : 10.1073/pnas.87.18.7000 . ПМК 54670 . ПМИД 2169617 .
Крюгер NX, Штрёули М, Сайто Х (1990). «Структурное разнообразие и эволюция человеческих рецептороподобных протеинтирозинфосфатаз» . ЭМБО Дж . 9 (10): 3241–52. дои : 10.1002/j.1460-2075.1990.tb07523.x . ПМК 552056 . ПМИД 2170109 .
Мортон С.М., Вейл Р.А., Хелмс С., Ли М., Куо В.Л., Грей Дж., Донис-Келлер Х. (1998). «Субрегиональная локализация 21 специфичной для хромосомы 7 метки экспрессируемых последовательностей (EST) с помощью FISH с использованием недавно идентифицированных YAC и P1». Геномика . 46 (3): 491–4. дои : 10.1006/geno.1997.5051 . ПМИД 9441757 .
Оньянго П., Лубёва Б., Гарделлин П., Курцбауэр Р., Вейт А. (1998). «Молекулярное клонирование и анализ экспрессии пяти новых генов в хромосоме 1p36» . Геномика . 50 (2): 187–98. дои : 10.1006/geno.1997.5186 . ПМИД 9653645 .
Центр Сэнгера T, Центр секвенирования генома Вашингтонского университета (1999). «На пути к полной последовательности генома человека» . Геном Рез . 8 (11): 1097–108. дои : 10.1101/гр.8.11.1097 . ПМИД 9847074 .
Маэда Н., Итихара-Танака К., Кимура Т., Кадомацу К., Мурамацу Т., Нода М. (1999). «Рецептороподобный протеин-тирозинфосфатаза PTPzeta/RPTPbeta связывает гепарин-связывающий фактор роста мидкин. Участие аргинина 78 мидкина в высокоаффинном связывании с PTPzeta» . Ж. Биол. Хим . 274 (18): 12474–9. дои : 10.1074/jbc.274.18.12474 . ПМИД 10212223 .
Кавачи Х., Тамура Х., Ватакабе И., Синтани Т., Маэда Н., Нода М. (1999). «Протеин тирозинфосфатаза дзета/RPTPbeta взаимодействует с семейством PSD-95/SAP90». Мозговой Рес. Мол. Мозговой Рес . 72 (1): 47–54. дои : 10.1016/S0169-328X(99)00204-1 . ПМИД 10521598 .
Мэн К., Родригес-Пенья А., Димитров Т., Чен В., Ямин М., Нода М., Деуэль Т.Ф. (2000). «Плейотрофин сигнализирует об усилении фосфорилирования тирозина бета-катенина посредством инактивации внутренней каталитической активности протеина тирозинфосфатазы бета/дзета рецепторного типа» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 97 (6): 2603–8. Бибкод : 2000PNAS...97.2603M . дои : 10.1073/pnas.020487997 . ПМК 15975 . ПМИД 10706604 .
Кавачи Х., Фудзикава А., Маэда Н., Нода М. (2001). «Идентификация GIT1/Cat-1 как молекулы-субстрата протеинтирозинфосфатазы дзета/бета с помощью дрожжевой системы захвата субстрата» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 98 (12): 6593–8. Бибкод : 2001PNAS...98.6593K . дои : 10.1073/pnas.041608698 . ПМК 34398 . ПМИД 11381105 .
Томаиду Д., Кокилья Д., Мейнтанис С., Нода М., Ругон Г., Матсас Р. (2001). «Растворимые формы молекул адгезии нейрональных клеток NCAM и F3 способствуют миграции шванновских клеток: идентификация протеинтирозинфосфатаз дзета/бета как предполагаемых рецепторов F3 на шванновских клетках». Дж. Нейрохем . 78 (4): 767–78. дои : 10.1046/j.1471-4159.2001.00454.x . ПМИД 11520897 . S2CID 24682985 .
Харрох С., Фуртадо Г.К., Брюк В., Розенблут Дж., Лафай Дж., Чао М., Буксбаум Дж.Д., Шлессингер Дж. (2002). «Критическая роль рецептора протеинтирозинфосфатазы типа Z в функциональном восстановлении после демиелинизирующих поражений». Нат. Жене . 32 (3): 411–4. дои : 10.1038/ng1004 . ПМИД 12355066 . S2CID 19800079 .
Мюллер С., Кункель П., Ламшус К., Ульбрихт У., Лоренте Г.А., Нельсон А.М., фон Шак Д., Чин Д.Д., Лор С.К., Вестфаль М., Мельчер Т. (2003). «Роль рецептора тирозинфосфатазы-дзета в миграции клеток глиомы» . Онкоген . 22 (43): 6661–8. дои : 10.1038/sj.onc.1206763 . ПМИД 14555979 .
Бонора Э, Лэмб Дж.А., Барнби Дж., Сайкс Н., Моберли Т., Бейер К.С., Клаук С.М., Пустка Ф., Бачелли Е., Блази Ф., Маэстрини Э., Батталья А., Харакопос Д., Педерсен Л., Исагер Т., Эриксен Г., Вискум Б. , Соренсен ЕС, Брондум-Нильсен К., Коттерилл Р., ван Энгеланд Х., де Йонге М., Кемнер С., Стеггехейс К., Шерпенисс М., Раттер М., Болтон П.Ф., Парр Дж.Р., Пустка А., Бэйли А.Дж., Monaco AP (2005). «Скрининг мутаций и анализ ассоциаций шести генов-кандидатов на аутизм на хромосоме 7q» . Время. Дж. Хум. Жене . 13 (2): 198–207. дои : 10.1038/sj.ejhg.5201315 . ПМИД 15523497 .
Поликратис А., Катсорис П., Корти Дж., Пападимитриу Э. (2005). «Характеристика передачи сигналов регуляторного пептида, аффинного гепарина, в эндотелиальных клетках человека» . Ж. Биол. Хим . 280 (23): 22454–61. дои : 10.1074/jbc.M414407200 . ПМИД 15797857 .
Ван В., Дэвис Д.А., Хак М., Хуанг Л.Е., Ярчоан Р. (2005). «Дифференциальная активация генов с помощью индуцируемого гипоксией фактора-1альфа и индуцируемого гипоксией фактора-2альфа в клетках HEK293T». Рак Рез . 65 (8): 3299–306. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-04-4130 . ПМИД 15833863 .
Лу К.В., Чон К.А., Ким Г.И., Сингх Дж., Диа Э.К., Ёсимото К., Ван М.Ю., Клоузи Т.Ф. , Нельсон С.Ф., Мишель П.С. (2005). «Дифференциальная индукция миграции и роста глиобластомы двумя формами плейотрофина» . Ж. Биол. Хим . 280 (29): 26953–64. дои : 10.1074/jbc.M502614200 . ПМИД 15908427 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 7 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000106278 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000068748 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7736789-5] Арияма Т., Хасегава К., Инадзава Дж., Мизуно К., Огимото М., Катагири Т., Якура Х. (июнь 1995 г.). «Присвоение гена человеческой протеинтирозинфосфатазы рецепторного типа дзета (PTPRZ) полосе хромосомы 7q31.3». Цитогенетический клеточный генетик . 70 (1–2): 52–4. дои : 10.1159/000133990 . ПМИД 7736789 .

[pmid8387522-6] Леви Дж.Б., Канолл П.Д., Сильвеннойнен О., Барнеа Дж., Морс Б., Онеггер А.М., Хуанг Дж.Т., Канниццаро Л.А., Парк Ш., Драк Т. (июнь 1993 г.). «Клонирование протеина тирозинфосфатазы рецепторного типа, экспрессируемого в центральной нервной системе» . J Биол Хим . 268 (14): 10573–81. дои : 10.1016/S0021-9258(18)82237-2 . ПМИД 8387522 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б ^с «Ген Энтреза: протеин-тирозинфосфатаза PTPRZ1, рецепторного типа, Z-полипептид 1» .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

v т и Ферменты
Activity	Active site Binding site Catalytic triad Oxyanion hole Enzyme promiscuity Diffusion-limited enzyme Cofactor Enzyme catalysis
Regulation	Allosteric regulation Cooperativity Enzyme inhibitor Enzyme activator
Classification	EC number Enzyme superfamily Enzyme family List of enzymes
Kinetics	Enzyme kinetics Eadie–Hofstee diagram Hanes–Woolf plot Lineweaver–Burk plot Michaelis–Menten kinetics
Types	EC1 Oxidoreductases (list) EC2 Transferases (list) EC3 Hydrolases (list) EC4 Lyases (list) EC5 Isomerases (list) EC6 Ligases (list) EC7 Translocases (list)