✖


Jump to content

Морские прокариоты

Edit links
(Перенаправлено с Морских архей )

Части прокариота
Диаграмма выше содержит кликабельные ссылки.
Diagram above contains clickable links
Клеточные формы жизни можно разделить на прокариотов и эукариотов. Прокариоты — это бактерии или археи, и на диаграмме показаны некоторые (кликабельные) части, общие для них обоих. Но бактерии и археи также имеют фундаментальные различия, о чем свидетельствует их расположение в разных доменах.
Часть серии обзоров по
Морская жизнь

Морские прокариоты — это морские бактерии и морские археи . По среде обитания они определяются как прокариоты , обитающие в морской среде , то есть в соленой воде морей или океанов или в солоноватой воде прибрежных эстуариев . Все клеточные формы жизни можно разделить на прокариотов и эукариотов. Эукариоты — это организмы , клетки которых имеют ядро, заключенное в мембрану , тогда как прокариоты — это организмы, у которых нет ядра, заключенного в мембрану. [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] Трехдоменная система классификации жизни добавляет еще одно деление: прокариоты делятся на два домена жизни: микроскопические бактерии и микроскопические археи, тогда как все остальные, эукариоты, становятся третьим доменом. [ 4 ]

Прокариоты играют важную роль в экосистемах как разлагатели, перерабатывающие питательные вещества. Некоторые прокариоты являются патогенными , вызывая болезни и даже смерть растений и животных. [ 5 ] Морские прокариоты ответственны за значительный уровень фотосинтеза , происходящего в океане, а также за значительный круговорот углерода и других питательных веществ . [ 6 ]

Прокариоты обитают по всей биосфере . В 2018 году было подсчитано, что общая биомасса всех прокариот на планете эквивалентна 77 миллиардам тонн углерода (77 Гт C). Он состоит из 7 Гт С для архей и 70 Гт С для бактерий. Этим цифрам можно противопоставить оценку общей биомассы животных на планете, которая составляет около 2 Гт С, и общей биомассы человека, которая составляет 0,06 Гт С. [ 7 ] Это означает, что коллективная биомасса архей в 100 раз превышает коллективную биомассу человека, а бактерий — более чем в 1000 раз.

Нет четких свидетельств существования жизни на Земле в течение первых 600 миллионов лет ее существования. Когда жизнь действительно появилась, в течение 3200 миллионов лет над ней доминировали морские прокариоты. Более сложная жизнь в виде коронных эукариотов не появлялась до кембрийского взрыва, произошедшего всего 500 миллионов лет назад. [ 8 ]

Эволюция

[ редактировать ]

Земле . около 4,54 миллиарда лет [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ] Самые ранние неоспоримые свидетельства существования жизни на Земле датируются по меньшей мере 3,5 миллиарда лет назад. [ 12 ] [ 13 ] во время Эоархейской эры после того, как геологическая кора начала затвердевать после более раннего расплавленного Гадейского эона. микробного мата Окаменелости возрастом 3,48 миллиарда лет были обнаружены в песчанике в Западной Австралии . [ 14 ] [ 15 ]

Филогенетическое и симбиогенетическое древо живых организмов, показывающее взгляд на происхождение эукариот и прокариотов.

Предыдущие виды также оставили записи своей эволюционной истории. Окаменелости, наряду со сравнительной анатомией современных организмов, составляют морфологическую или анатомическую летопись. [ 16 ] Сравнивая анатомию современных и вымерших видов, палеонтологи могут сделать вывод о происхождении этих видов. Однако этот подход наиболее успешен для организмов, у которых были твердые части тела, такие как раковины, кости или зубы. Кроме того, поскольку прокариоты, такие как бактерии и археи, имеют ограниченный набор общих морфологий, их окаменелости не предоставляют информации об их происхождении.

Прокариоты населяли Землю примерно 3–4 миллиарда лет назад. [ 17 ] [ 18 ] Никаких очевидных изменений в морфологии или клеточной организации у этих организмов в течение следующих нескольких миллиардов лет не произошло. [ 19 ] Эукариотические клетки возникли между 1,6 и 2,7 миллиарда лет назад. Следующее серьезное изменение в клеточной структуре произошло, когда бактерии были поглощены эукариотическими клетками, образовав кооперативную ассоциацию, называемую эндосимбиозом . [ 20 ] [ 21 ] Поглощенные бактерии и клетка-хозяин затем подверглись совместной эволюции, при этом бактерии эволюционировали либо в митохондрии, либо в гидрогеносомы . [ 22 ] Очередное поглощение цианобактериоподобных организмов привело к образованию хлоропластов у водорослей и растений. [ 23 ]

в 2016 году Метагеномное представление древа жизни с использованием последовательностей рибосомальных белков . [ 24 ] Дерево включает 92 названных типа бактерий, 26 типов архей и пять супергрупп эукариот. Основные линии передачи обозначены произвольными цветами и названы курсивом с хорошо охарактеризованными названиями линий. Родословные, в которых отсутствует изолированный представитель, выделены не курсивом и красными точками.
Эукариоты против прокариотов
ЭвриархеотаНаноархеотаТермопротеотаПростейшиеВодорослиРастениеСлизевикиЖивотноеГрибокГрамположительные бактерииХламидиотаХлорофлексотаАктиномицетотаПланктомицетотаСпирохетатаФузобактериотаЦианобактериитермофилыАцидобактериотаПсевдомонадота
Вид филогенетического дерева, основанного на трехдоменной системе , показывающий расхождение современных видов от их общего предка в центре. [ 25 ] Три домена окрашены в синий цвет: бактерии синие, археи зеленые, а эукариоты красные.


История жизни была историей одноклеточных период в океанах начали появляться многоклеточные организмы прокариот и эукариот примерно до 610 миллионов лет назад, когда в эдиакарский . [ 17 ] [ 26 ] Эволюция многоклеточности происходила в ходе множества независимых событий в таких разнообразных организмах, как губки , бурые водоросли , цианобактерии , слизевики и миксобактерии . [ 27 ] В 2016 году ученые сообщили, что около 800 миллионов лет назад незначительное генетическое изменение в одной молекуле под названием GK-PID, возможно, позволило организмам перейти от одноклеточного организма к одной из многих клеток. [ 28 ]

Вскоре после появления этих первых многоклеточных организмов в течение примерно 10 миллионов лет появилось значительное биологическое разнообразие в результате события, названного Кембрийским взрывом . Здесь в палеонтологической летописи появилось большинство типов современных животных, а также уникальные линии, впоследствии вымершие. [ 29 ] Были предложены различные причины кембрийского взрыва, в том числе накопление кислорода в атмосфере в результате фотосинтеза. [ 30 ]

Фон

[ редактировать ]
Диапазон размеров прокариот (бактерий и архей) и вирусов по сравнению с размерами других организмов и биомолекул.

Слова прокариот и эукариот происходят от греческого языка, где pro означает «прежде», eu означает «ну» или «истинный», а karyon означает «орех», «ядро» или «ядро». [ 31 ] [ 32 ] [ 33 ] Таким образом, этимологически прокариот означает «до ядра», а эукариот означает «истинное ядро».

Разделение форм жизни на прокариотов и эукариотов было твердо установлено микробиологами Роджером Станье и К.Б. ван Нилем в их статье 1962 года «Концепция бактерии» . [ 34 ] Одной из причин этой классификации было то, что то, что тогда часто называли сине-зелеными водорослями (теперь называемыми цианобактериями ), перестало классифицироваться как растения, а было сгруппировано с бактериями.

В 1990 году Карл Везе и др. была введена трехдоменная система . [ 35 ] [ 36 ] Прокариоты были разделены на два домена : архей и бактерий, а эукариоты стали самостоятельным доменом. Ключевое отличие от более ранних классификаций — отделение архей от бактерий.

микробные маты
Микробные маты — самая ранняя форма жизни на Земле, существование которой подтверждено убедительными ископаемыми свидетельствами. На изображении изображен цианобактериально -водорослевой мат.
Строматолиты образуются из микробных матов, когда микробы медленно движутся вверх, чтобы не быть задушенными осадком.
Внешние видео
значок видео Насколько плохим было Великое событие окисления?
Морские брызги, содержащие морские микроорганизмы , в том числе прокариоты, могут быть унесены высоко в атмосферу, где они станут аэропланктоном , и могут путешествовать по земному шару, прежде чем упасть обратно на Землю.

Самые ранние свидетельства существования жизни на Земле получены из биогенных углеродных сигнатур и окаменелостей строматолитов, обнаруженных в породах возрастом 3,7 миллиарда лет. [ 37 ] [ 38 ] В 2015 году возможные «остатки биотической жизни » были обнаружены в породах возрастом 4,1 миллиарда лет. [ 39 ] [ 40 ] В 2017 году было сообщено о предполагаемых доказательствах, возможно, самых старых форм жизни на Земле в виде окаменелых микроорганизмов, обнаруженных в осадках гидротермальных жерл, которые, возможно, жили еще 4,28 миллиарда лет назад, вскоре после того, как 4,4 миллиарда лет назад образовались океаны , и вскоре после образования Земли 4,54 миллиарда лет назад. [ 41 ] [ 42 ]

Микробные маты из сосуществовавших бактерий и архей были доминирующей формой жизни в раннем архейском эоне , и считается, что многие основные этапы ранней эволюции произошли в этой среде. [ 43 ] Эволюция фотосинтеза около 3,5 млрд лет назад привела к накоплению кислорода в атмосфере, что привело к великому событию оксигенации, начавшемуся около 2,4 млрд лет назад. [ 44 ]

Самые ранние свидетельства существования эукариот датируются 1,85 млрд лет назад. [ 45 ] [ 46 ] и хотя они, возможно, присутствовали раньше, их диверсификация ускорилась, когда они начали использовать кислород в своем метаболизме . Позднее, около 1,7 млрд лет назад, многоклеточные организмы стали появляться , дифференцированные клетки которых выполняли специализированные функции. [ 47 ]

Оценки количества видов микробов в трех сферах жизни
Бактерии — самая старая и наиболее биоразнообразная группа, за ней следуют археи и грибы (самые новые группы). В 1998 году, еще до того, как стало известно о масштабах микробной жизни, Роберт М. Мэй [ 48 ] По оценкам, на планете существовало 3 миллиона видов живых организмов. Но в 2016 году Лоси и Леннон [ 49 ] По оценкам, количество видов микроорганизмов может достигать 1 триллиона. [ 50 ]

Поток переносимых по воздуху микроорганизмов, включая прокариотов, кружит по планете над погодными системами, но ниже коммерческих воздушных путей. [ 51 ] Некоторые странствующие микроорганизмы переносятся земными пыльными бурями, но большинство происходит из морских микроорганизмов, содержащихся в морских брызгах . В 2018 году ученые сообщили, что сотни миллионов вирусов и десятки миллионов бактерий ежедневно оседают на каждом квадратном метре планеты. [ 52 ] [ 53 ]

Подводная микроскопическая жизнь разнообразна и до сих пор плохо изучена, например, роль вирусов в морских экосистемах. [ 54 ] Большинство морских вирусов представляют собой бактериофаги , которые безвредны для растений и животных, но необходимы для регулирования морских и пресноводных экосистем. [ 55 ] Они заражают и уничтожают бактерии и археи в водных микробных сообществах и являются важнейшим механизмом переработки углерода в морской среде. Органические молекулы, высвобождаемые из мертвых бактериальных клеток, стимулируют рост новых бактерий и водорослей. [ 56 ] Вирусная активность также может способствовать биологическому насосу — процессу, посредством которого в глубинах углерод улавливается океана. [ 57 ]

Морские бактерии

[ редактировать ]
Бактерии различной формы ( кокки , палочки и спирохеты ) и их размеры по сравнению с шириной человеческого волоса. [ 58 ] Некоторые бактерии имеют форму запятой ( вибрион ). Археи имеют схожую форму, хотя архея Haloquadratum плоская и квадратная. [ 59 ]
Единица мкм — мера длины микрометр , равная 1/1000 миллиметра.
Pelagibacter ubique клады SAR11 является самой распространенной бактерией в океане и играет важную роль в глобальном углеродном цикле .
Сканирующая электронная микрофотография штамма Roseobacter , широко распространенного и важного рода морских бактерий. Для масштаба размер пор мембраны составляет 0,2   мкм в диаметре. [ 60 ]
Vibrio vulnificus — вирулентная бактерия, встречающаяся в устьях рек и прибрежных районах.
См. Также: Бактериопланктон.

Бактерии обширную область прокариотических микроорганизмов составляют . Обычно бактерии имеют длину несколько микрометров и имеют разную форму: от сфер до палочек и спиралей. Бактерии были одними из первых форм жизни, появившихся на Земле , и присутствуют в большинстве ее сред обитания . Бактерии обитают в почве, воде, кислых горячих источниках , радиоактивных отходах . [ 61 ] и глубокие части земной коры . Бактерии также живут в симбиотических и паразитических отношениях с растениями и животными.

Когда-то бактерии считались растениями, относящимися к классу шизомицетов , теперь их относят к прокариотам . В отличие от клеток животных и других эукариот , бактериальные клетки не содержат ядра и редко содержат мембраносвязанные органеллы . Хотя термин «бактерии» традиционно включал в себя всех прокариотов, научная классификация изменилась после открытия в 1990-х годах того, что прокариоты состоят из двух очень разных групп организмов, которые произошли от одного древнего общего предка. Эти эволюционные домены называются Бактерии и Археи . [ 62 ]

Предками современных бактерий были одноклеточные микроорганизмы, которые были первыми формами жизни , появившимися на Земле около 4 миллиардов лет назад. На протяжении примерно 3 миллиардов лет большинство организмов были микроскопическими, а доминирующими формами жизни были бактерии и археи. [ 63 ] [ 64 ] Хотя бактериальные окаменелости существуют, такие как строматолиты , отсутствие у них отличительной морфологии не позволяет использовать их для изучения истории эволюции бактерий или для определения времени происхождения определенного вида бактерий. Однако последовательности генов могут быть использованы для реконструкции бактериальной филогении , и эти исследования показывают, что бактерии сначала отделились от архейной/эукариотической линии. [ 65 ] Бактерии также участвовали во втором великом эволюционном расхождении – археях и эукариотах. Здесь эукариоты возникли в результате вступления древних бактерий в эндосимбиотические ассоциации с предками эукариотических клеток, которые сами, возможно, были родственны археям . [ 21 ] [ 66 ] Это включало поглощение протоэукариотическими клетками альфапротеобактериальных симбионтов с образованием либо митохондрий , либо гидрогеносом , которые до сих пор встречаются у всех известных эукариев. Позже некоторые эукариоты, уже содержащие митохондрии, также поглотили цианобактериоподобные организмы. Это привело к образованию хлоропластов у водорослей и растений. Есть также некоторые водоросли, возникшие в результате еще более поздних эндосимбиотических событий. Здесь эукариоты поглотили эукариотические водоросли, которые развились в пластиду «второго поколения». [ 67 ] [ 68 ] Это известно как вторичный эндосимбиоз .

Бактерии вырастают до фиксированного размера, а затем размножаются посредством бинарного деления , формы бесполого размножения . [ 69 ] В оптимальных условиях бактерии могут расти и делиться чрезвычайно быстро, а популяция бактерий может удваиваться каждые 9,8 минуты. [ 70 ]

Pelagibacter ubique и его родственники, возможно, являются наиболее распространенными микроорганизмами в океане, и утверждается, что они, возможно, являются самыми распространенными бактериями в мире. Они составляют около 25% всех клеток микробного планктона , а летом они могут составлять примерно половину клеток, присутствующих в поверхностных водах океана умеренного пояса. Общая численность P. ubique и его родственников оценивается примерно в 2 × 10 особей. 28 микробы. [ 71 ] сообщалось в журнале Nature Однако в феврале 2013 года , что бактериофаг HTVC010P , атакующий P. ubique , был обнаружен и, вероятно, является наиболее распространенным организмом на планете. [ 72 ] [ 73 ]

Roseobacter также является одним из самых распространенных и универсальных микроорганизмов в океане. Они разнообразны в различных типах морской среды обитания, от прибрежных до открытых океанов, от морского льда до морского дна, и составляют около 25% прибрежных морских бактерий. Представители рода Roseobacter играют важную роль в морских биогеохимических циклах и изменении климата, перерабатывая значительную часть общего углерода в морской среде. Они образуют симбиотические отношения, которые позволяют им разлагать ароматические соединения и поглощать следы металлов. Они широко используются в аквакультуре и для определения кворума. Во время цветения водорослей 20–30% сообщества прокариот составляют Roseobacter. [ 74 ] [ 75 ]

Самая крупная известная бактерия, морская Thiomargarita namibiensis , видна невооруженным глазом и иногда достигает 0,75 мм (750 мкм). [ 76 ] [ 77 ]

Морские бактерии
Морская Thiomargarita namibiensis , крупнейшая известная бактерия.
Бактерия Marinomonas arctica растет внутри арктического морского льда при минусовых температурах.

Цианобактерии

[ редактировать ]
Цианобактерии
Цианобактерии из микробного мата . Цианобактерии были первыми организмами, выделившими кислород посредством фотосинтеза.
Крошечная цианобактерия Prochromococcus вносит основной вклад в содержание кислорода в атмосфере.
Снимок НАСА: большое цветение цианобактерий Nodularia , кружащееся в Балтийском море. [ 78 ]

Цианобактерии были первыми организмами, развившими способность превращать солнечный свет в химическую энергию. Они образуют тип (подразделение) бактерий, который варьируется от одноклеточных до нитчатых и включает колониальные виды . Они встречаются практически повсюду на земле: во влажной почве, как в пресноводной, так и в морской среде и даже на антарктических скалах. [ 79 ] В частности, некоторые виды встречаются в виде дрейфующих клеток, плавающих в океане, и поэтому были одними из первых представителей фитопланктона .

Первыми первичными продуцентами, использовавшими фотосинтез, были океанические цианобактерии около 2,3 миллиарда лет назад. [ 80 ] [ 81 ] Выделение молекулярного кислорода цианобактериями как побочного продукта фотосинтеза вызвало глобальные изменения в окружающей среде Земли. Поскольку в то время кислород был токсичен для большей части жизни на Земле, это привело к почти исчезновению организмов, не переносящих кислород , — резкое изменение , которое изменило направление эволюции основных видов животных и растений. [ 82 ]

Колонии морских цианобактерий Trichodesmium
взаимодействуют с бактериями для получения железа из пыли
а. N 2 , фиксирующие Виды Trichodesmium , которые обычно встречаются в тропических и субтропических водах, имеют большое экологическое значение, удобряя океан важными питательными веществами.
б. Триходезмии могут вызвать массовое цветение в бедных питательными веществами регионах океана с высоким уровнем осаждения пыли, отчасти из-за их уникальной способности улавливать пыль, центрировать ее и впоследствии растворять.
в. Предлагаемый путь поглощения железа, связанного с пылью: Бактерии, живущие внутри колоний, производят сидерофоры (cI), которые реагируют с частицами пыли в ядре колонии и генерируют растворенный Fe (c-II). Это растворенное железо, образующее комплекс с сидерофорами, затем усваивается как Trichodesmium , так и его резидентными бактериями (c-III), что приводит к взаимной выгоде для обоих партнеров консорциума . [ 83 ]
  • Synechococcus — широко распространенная морская цианобактерия.
    Synechococcus — широко распространенная морская цианобактерия.
  • Карбоксисомы в виде многогранных темных структур у одного из видов Synechococcus.
    Карбоксисомы в виде многогранных темных структур у одного из видов Synechococcus.
Хлоропласты эндосимбиотическом глаукофитов происхождении имеют слой пептидогликана что свидетельствует об их цианобактерий от , . [ 84 ]

Крошечная (0,6   мкм ) морская цианобактерия Prochromococcus , открытая в 1986 году, сегодня составляет важную часть основы пищевой цепи океана и отвечает за большую часть фотосинтеза в открытом океане. [ 85 ] и примерно 20% кислорода в атмосфере Земли. [ 86 ] Возможно, это самый многочисленный род на Земле: один миллилитр поверхностной морской воды может содержать 100 000 и более клеток. [ 87 ]

Первоначально биологи отнесли цианобактерии к водорослям и называли их «сине-зелеными водорослями». Более поздняя точка зрения состоит в том, что цианобактерии — это бактерии и, следовательно, даже не относятся к тому же царству , что и водоросли. Большинство авторов исключают всех прокариотов и, следовательно, цианобактерий из определения водорослей. [ 88 ] [ 89 ]

Внешние видео
значок видео Как цианобактерии захватили мир

Другие бактерии

[ редактировать ]

Другие морские бактерии, помимо цианобактерий, распространены повсеместно или могут играть важную роль в океане. К ним относятся оппортунистический копиотроф Alteromonas macleodii . [ 90 ] [ 91 ]

Морские археи

[ редактировать ]
Первоначально архей считали экстремофилами , живущими в суровых условиях, как, например, желтые археи, изображенные здесь в горячем источнике , но с тех пор они были обнаружены в гораздо более широком диапазоне сред обитания . [ 92 ]

Архея . (по-гречески « древний») [ 93 ] составляют домен и царство одноклеточных микроорганизмов ) . Эти микробы являются прокариотами , то есть в их клетках нет клеточного ядра или каких-либо других мембраносвязанных органелл .

Первоначально архей относили к бактериям , но эта классификация устарела. [ 94 ] Клетки архей обладают уникальными свойствами, отличающими их от двух других областей жизни: бактерий и эукариот . Археи далее делятся на несколько признанных типов . Классификация сложна, поскольку большинство из них не были изолированы в лаборатории и были обнаружены только путем анализа их нуклеиновых кислот в образцах из окружающей среды.

Бактерии и археи в целом схожи по размеру и форме, хотя некоторые археи имеют очень странные формы, например, плоские и квадратные клетки Haloquadratum walsbyi . [ 95 ] Несмотря на это морфологическое сходство с бактериями, археи обладают генами и несколькими метаболическими путями , которые более тесно связаны с таковыми у эукариот, в частности, ферментами, участвующими в транскрипции и трансляции . Другие аспекты биохимии архей уникальны, например, их зависимость от эфирных липидов в клеточных мембранах , таких как археолы . Археи используют больше источников энергии, чем эукариоты: они варьируются от органических соединений , таких как сахара, до аммиака , ионов металлов или даже газообразного водорода . Солеустойчивые археи ( Haloarchaea ) используют солнечный свет в качестве источника энергии, а другие виды архей фиксируют углерод ; однако, в отличие от растений и цианобактерий , ни один известный вид архей не обладает обоими свойствами. Археи размножаются бесполым путем бинарным делением , фрагментацией или почкованием ; в отличие от бактерий и эукариотов, ни один известный вид не образует спор .

Археи особенно многочисленны в океанах, а археи в планктоне могут быть одной из самых многочисленных групп организмов на планете. Археи являются основной частью жизни на Земле и могут играть роль как в углеродном, так и в азотном цикле . Термопротеоты (также называемые кренархеотами или эоцитами) — это тип архей, который, как считается, очень распространен в морской среде и является одним из основных участников фиксации углерода. [ 96 ]

Две клетки Nanoarchaeum equitans с более крупным хозяином Ignicoccus

Nanoarchaeum equitans — вид морских архей, обнаруженный в 2002 году в гидротермальном источнике . Это термофил , который растет при температуре около 80 ° C (176 ° F). Наноархей, -видимому, является облигатным симбионтом архея по Ignicoccus . Чтобы выжить, он должен оставаться в контакте с организмом-хозяином, поскольку Nanoarchaeum equitans не может синтезировать липиды, а получает их от хозяина. Его клетки имеют диаметр всего 400 нм , что делает его одним из самых маленьких известных клеточных организмов и самым маленьким известным археем. [ 97 ] [ 98 ]

Морские археи классифицируются следующим образом: [ 99 ] [ 100 ] [ 101 ] [ 102 ] [ 103 ]

  • Морская группа I (MG-I или MGI): морские Nitrososphaerota с подгруппами Ia (также известными как Ia) до Id.
  • Морская группа II (MG-II): морские Euryarchaeota , отряд Poseidoniales. [ 104 ] с подгруппами от IIa до IId (IIa, напоминающие Poseidoniaceae , IIb, напоминающие Thalassarchaceae )
    Вирусы, паразитирующие на MGII, классифицируются как магровирусы.
  • Морская группа III (MG-III): также морские эвриархеоты, морская бентосная группа D. [ 105 ]
  • Морская группа IV (MG-IV): также морские эвриархеоты. [ 106 ]

Трофический режим

[ редактировать ]
Дополнительная информация: Микробный метаболизм.

Метаболизм прокариот классифицируется на группы питания на основе трех основных критериев: источник энергии , используемые доноры электронов и источник углерода , используемый для роста. [ 107 ] [ 108 ]

Типы питания в бактериальном метаболизме
Тип питания Источник энергии Источник углерода Примеры
 Фототрофы   Солнечный свет Органические соединения (фотогетеротрофы) или фиксация углерода (фотоавтотрофы) « Цианобактерии », зеленые серобактерии , хлорофлексота или пурпурные бактерии.
 Литотрофы Неорганические соединения Органические соединения (литогетеротрофы) или фиксация углерода (литоавтотрофы)  Thermodesulfobacteriota , Hydrogenophilaceae или Nitrospirota.
 Органотрофы Органические соединения Органические соединения (хемогетеротрофы) или фиксация углерода (хемоавтотрофы)  Бациллы , клостридии или энтеробактерии

Морские прокариоты сильно диверсифицировались за время своего долгого существования. Метаболизм прокариот гораздо более разнообразен, чем у эукариот, что приводит к появлению множества весьма различных типов прокариот. Например, помимо использования фотосинтеза или органических соединений для получения энергии, как это делают эукариоты, морские прокариоты могут получать энергию из неорганических соединений, таких как сероводород . Это позволяет морским прокариотам процветать как экстремофилы в суровых условиях, таких холодных, как ледяная поверхность Антарктиды, изучаемых в криобиологии , и таких жарких, как подводные гидротермальные источники , или в условиях высокой солености, как ( галофилы ). [ 109 ] Некоторые морские прокариоты живут в симбиозе с телами других морских организмов или на них.

Микробный мат, покрытый оксидом железа на склоне подводной горы, может содержать микробные сообщества, в которых доминируют окисляющие железо зетапротеобактерии.

Подвижность

[ редактировать ]
Бактериальный жгутик, вращаемый молекулярным мотором у его основания.
Основная статья: Подвижность бактерий

Подвижность – это способность организма передвигаться самостоятельно, используя метаболическую энергию.

Подвижность жгутиков

[ редактировать ]
Модель археллума  [ 117 ]
Жгутики прокариот совершают вращательные движения, а жгутики эукариот совершают изгибающиеся движения.
Дополнительная информация: жгутики и архаеллы.

Прокариоты, как бактерии, так и археи, в основном используют жгутики для передвижения.

Модель роторного двигателя, используемая бактериями, использует протоны электрохимического градиента для перемещения своих жгутиков. Крутящий момент в жгутиках бактерий создается частицами, которые проводят протоны вокруг основания жгутика. Направление вращения жгутиков у бактерий обусловлено заполненностью протонных каналов по периметру жгутикового мотора. [ 124 ]

Некоторые эукариотические клетки также используют жгутики — их можно обнаружить у некоторых простейших и растений, а также в клетках животных. Эукариотические жгутики представляют собой сложные клеточные выступы, которые совершают движения взад и вперед, а не круговые движения. Прокариотические жгутики используют вращающийся двигатель, а эукариотические жгутики используют сложную систему скользящих нитей. Эукариотические жгутики управляются АТФ , тогда как прокариотические жгутики могут управляться АТФ (археи) или протонами (бактерии). [ 125 ]

Внешние видео
значок видео Почему бактерии движутся, как вибрирующие змеи хаоса?

Подергивание моторики

[ редактировать ]
Дополнительная информация: подергивание моторики , пилуса и фимбрии (бактериология).

Подергивающаяся подвижность — это форма ползающей подвижности бактерий, используемая для перемещения по поверхностям. Подергивание опосредовано активностью волосообразных нитей, называемых пилями IV типа , которые выходят из внешней части клетки, связываются с окружающими твердыми субстратами и втягиваются, вытягивая клетку вперед, подобно действию крюка -кошки . [ 126 ] [ 127 ] [ 128 ] Название «подергивающаяся подвижность» происходит от характерных прерывистых и нерегулярных движений отдельных клеток, если смотреть под микроскопом. [ 129 ]

Скользящая подвижность

[ редактировать ]
Основная статья: скользящая моторика

Скользящая подвижность — это тип транслокации, который не зависит от двигательных структур, таких как жгутики или пили . [ 130 ] Скольжение позволяет микроорганизмам перемещаться по поверхности пленок с низким содержанием воды. Механизмы этой подвижности известны лишь частично. Скорость скольжения варьируется у разных организмов, а изменение направления, по-видимому, регулируется какими-то внутренними часами. [ 131 ] Например, апикомплексаны способны перемещаться с высокой скоростью от 1 до 10 мкм/с. Напротив, бактерии Myxococcus xanthus скользят со скоростью 5 мкм/мин. [ 132 ] [ 133 ]

Роящаяся подвижность

[ редактировать ]
Основная статья: роящаяся подвижность

Роевая подвижность — это быстрое (2–10 мкм/с) и скоординированное перемещение бактериальной популяции по твердым или полутвердым поверхностям. [ 134 ] и является примером бактериальной многоклеточности и роевого поведения . Впервые о роевой подвижности сообщил в 1972 году Йорген Хенрихсен. [ 135 ]

Неподвижный

[ редактировать ]
Дополнительная информация: неподвижные бактерии.

Неподвижным видам не хватает способностей и структур, которые позволили бы им самостоятельно передвигаться по окружающей среде. Когда неподвижные бактерии культивируют в колотой пробирке, они растут только вдоль линии укола. Если бактерии подвижны, линия будет выглядеть размытой и распространяться в среду. [ 136 ]

Такси: Направленное движение

[ редактировать ]

Магнитотаксис

[ редактировать ]
Магнитотактическая бактерия, содержащая цепочку магнитосом.
Цепь магнитосом с октаэдрическими привычками, смоделированная внизу справа. [ 137 ]

Магнитотактические бактерии ориентируются вдоль силовых линий Земли магнитного поля . [ 138 ] Считается, что такое выравнивание помогает этим организмам достичь областей с оптимальной концентрацией кислорода. [ 139 ] Для выполнения этой задачи у этих бактерий есть биоминерализованные органеллы, называемые магнитосомами , которые содержат магнитные кристаллы . Биологическое явление микроорганизмов, стремящихся двигаться в ответ на магнитные характеристики окружающей среды, известно как магнитотаксис . Однако этот термин вводит в заблуждение, поскольку любое другое его применение предполагает наличие механизма стимул-реакция. В отличие от магниторецепции животных, бактерии содержат фиксированные магниты, которые заставляют бактерии выравниваться — даже мертвые клетки притягиваются к ним, как стрелка компаса. [ 139 ]

Морская среда обычно характеризуется низкими концентрациями питательных веществ, которые поддерживаются в постоянном или прерывистом движении под действием течений и турбулентности. Морские бактерии разработали стратегии, такие как плавание и использование систем направленного зондирования и реагирования, для миграции к благоприятным местам в градиентах питательных веществ. Магнитотактические бактерии используют магнитное поле Земли для облегчения плавания вниз к кислородно-бескислородной границе раздела, которая является наиболее благоприятным местом для их существования и размножения, в химически стратифицированных отложениях или столбах воды. [ 140 ]

Магнитное поле Земли

В зависимости от широты и того, находятся ли бактерии к северу или югу от экватора, магнитное поле Земли имеет одну из двух возможных полярностей и направление, которое под разными углами указывает на глубины океана и в сторону от обычно более богатой кислородом поверхности. . Аэротаксис — это реакция, посредством которой бактерии мигрируют до оптимальной концентрации кислорода в кислородном градиенте. Различные эксперименты ясно показали, что магнитотаксис и аэротаксис у магнитотаксических бактерий действуют совместно. Было показано, что в каплях воды односторонние магнитотактические бактерии могут менять направление своего плавания и плыть назад в условиях понижения ниже оптимальной ( концентрация кислорода ), в отличие от кислородных условий (концентрация кислорода выше оптимальной).

Независимо от морфологии все изученные к настоящему времени магнитотактические бактерии подвижны за счет жгутиков. [ 141 ] Морские магнитотаксические бактерии, в частности, обычно обладают сложным жгутиковым аппаратом, который может включать до десятков тысяч жгутиков. Однако, несмотря на обширные исследования последних лет, еще предстоит установить, управляют ли магнитотактические бактерии своими жгутиковыми моторами в ответ на их выравнивание в магнитных полях. [ 140 ] Симбиоз с магнитотаксическими бактериями был предложен как объяснение магниторецепции у некоторых морских простейших . [ 142 ] В настоящее время проводятся исследования того, могут ли подобные отношения лежать в основе магниторецепции у позвоночных . и [ 143 ] Самые древние магнитофоссилии происходят из меловых пластов на юге Англии. [ 144 ] возрастом 1,9 миллиарда лет хотя менее точные сообщения о магнитофоссилиях распространяются на Ганфлинт Черт . [ 145 ]

Газовые вакуоли

[ редактировать ]
Часть серии о
Планктон
Фитопланктон
Трофический режим
По размеру
По таксономии
По среде обитания
Другие типы
Цветет
Связанные темы

Некоторые морские прокариоты обладают газовыми вакуолями . Газовые вакуоли представляют собой наноотделения, свободно проницаемые для газа, которые позволяют морским бактериям и археям контролировать свою плавучесть . Они принимают форму веретенообразных, связанных с мембраной везикул , и встречаются у некоторых планктонных прокариот, включая некоторые цианобактерии . [ 146 ] Положительная плавучесть необходима для удержания клеток в верхних слоях толщи воды, чтобы они могли продолжать осуществлять фотосинтез . Газовые вакуоли состоят из белковой оболочки, которая имеет сильно гидрофобную внутреннюю поверхность, что делает ее непроницаемой для воды (и предотвращает конденсацию водяного пара внутри), но проницаемой для большинства газов . Поскольку газовый пузырек представляет собой полый цилиндр, он может разрушиться при повышении окружающего давления . Естественный отбор точно настроил структуру газового пузырька, чтобы максимизировать его устойчивость к короблению , включая внешний укрепляющий белок GvpC, похожий на зеленую нить в плетеном шланге. Существует простая зависимость между диаметром газового пузырька и давлением, при котором он схлопывается: чем шире газовый пузырь, тем слабее он становится. Однако более широкие газовые везикулы более эффективны, обеспечивая большую плавучесть на единицу белка, чем узкие газовые везикулы. Различные виды производят газовые пузырьки разного диаметра, что позволяет им колонизировать разные глубины толщи воды (быстрорастущие, высококонкурентные виды с широкими газовыми пузырьками в большинстве верхних слоев; медленнорастущие, адаптированные к темноте виды с сильными узкими газовыми пузырьками в более глубокие слои).

Клетка достигает своей высоты в толще воды за счет синтеза газовых пузырьков. По мере того, как клетка поднимается вверх, она способна увеличить свою углеводную нагрузку за счет увеличения фотосинтеза. Слишком высокий уровень приведет к фотообесцвечиванию и возможной гибели клетки, однако углеводы, вырабатываемые во время фотосинтеза, увеличивают плотность клетки, заставляя ее тонуть. Ежедневного цикла накопления углеводов в результате фотосинтеза и катаболизма углеводов в темное время суток достаточно, чтобы точно настроить положение клетки в толще воды, поднять ее к поверхности, когда уровень углеводов низкий и она нуждается в фотосинтезе, и позволяя он уйдет от вредного УФ-излучения , когда уровень углеводов в клетке восполнится. Чрезмерный избыток углеводов вызывает значительное изменение внутреннего давления клетки, в результате чего газовые пузырьки изгибаются и схлопываются, а клетка погружается в воду.

Крупные вакуоли обнаружены у трех родов нитчатых серобактерий : Thioploca , Beggiatoa и Thiomargarita . Цитозоль у этих родов чрезвычайно редуцирован, и вакуоль может занимать от 40 до 98% клетки. [ 147 ] Вакуоль содержит высокие концентрации нитрат- ионов и поэтому считается органеллой хранения . [ 148 ]

Биолюминесценция

[ редактировать ]
См. Также: Биологический насос § Биолюминесцентный шунт и Частичные органические вещества § Гипотеза биолюминесцентного шунта.
Кальмары гавайского бобтейла живут в симбиозе с биолюминесцентными бактериями.
Vibrio harveyi инкубировали в морской воде при температуре 30°C в течение 3 дней. [ 149 ]

Биолюминесцентные бактерии — это светообразующие бактерии , которые преимущественно присутствуют в морской воде, морских отложениях, на поверхности разлагающейся рыбы и в кишечнике морских животных. Бактериальная биолюминесценция встречается не так часто, но также встречается у наземных и пресноводных бактерий. [ 126 ] Эти бактерии могут жить свободно (например, Vibrio harveyi ) или находиться в симбиозе с животными, такими как гавайский бобтейл-кальмар ( Aliivibrio fischeri ) или наземными нематодами ( Photorhabdus luminescens ). Организмы-хозяева обеспечивают этим бактериям безопасный дом и достаточное питание. Взамен хозяева используют свет, производимый бактериями, для маскировки, привлечения добычи и/или партнера. Биолюминесцентные бактерии развили симбиотические отношения с другими организмами, в которых оба участника получают почти одинаковую выгоду. [ 150 ] Другая возможная причина, по которой бактерии используют реакцию люминесценции, — это чувство кворума , способность регулировать экспрессию генов в ответ на плотность бактериальных клеток. [ 151 ]

Кальмар гавайского бобтейла живет в симбиозе с биолюминесцентными бактериями Aliivibrio fischeri, населяющими специальный световой орган в мантии кальмара. Бактерии получают от кальмара сахар и аминокислоты и, в свою очередь, скрывают силуэт кальмара, если смотреть снизу, контросвещая его, соответствуя количеству света, падающего на верхнюю часть мантии. [ 152 ] Кальмар служит модельным организмом для животно-бактериального симбиоза, и его взаимоотношения с бактериями широко изучены.

Vibrio harveyi представляет собой палочковидную, подвижную (с помощью полярных жгутиков ) биолюминесцентную бактерию, которая оптимально растет при температуре от 30 до 35 °C (от 86 до 95 °F). Его можно обнаружить в свободном плавании в тропических морских водах, комменсально в микрофлоре кишечника морских животных, а также в качестве первичного и условно-патогенного патогена у ряда морских животных. [ 153 ] Считается, что это является причиной эффекта молочного моря , когда морская вода в ночное время излучает однородное голубое свечение. Некоторые сияния могут покрывать почти 6000 квадратных миль (16 000 км2). 2 ).

Микробный родопсин

[ редактировать ]
Модель механизма генерации энергии у морских бактерий
(1) Когда солнечный свет падает на молекулу родопсина
(2) он меняет свою конфигурацию, поэтому протон вылетает из клетки
(3) химический потенциал заставляет протон возвращаться в клетку
(4) таким образом генерируя энергию
(5) в форме аденозинтрифосфата . [ 154 ]
Основная статья: Микробный родопсин

Фототрофический метаболизм основан на использовании одного из трех пигментов, преобразующих энергию: хлорофилла , бактериохлорофилла и ретиналя . Ретиналь – это хромофор, содержащийся в родопсинах . О значении хлорофилла в преобразовании световой энергии пишут уже десятилетия, но фототрофия, основанная на пигментах сетчатки, только начинает изучаться. [ 155 ]

Галобактерии в солевых прудах-испарителях, окрашенные бактериородопсином в фиолетовый цвет. [ 156 ]

В 2000 году группа микробиологов под руководством Эдварда Делонга сделала важнейшее открытие в понимании морских углеродных и энергетических циклов. Они обнаружили ген у нескольких видов бактерий [ 157 ] [ 158 ] отвечает за выработку белка родопсина , ранее не встречавшегося у бактерий. Эти белки, обнаруженные в клеточных мембранах, способны преобразовывать энергию света в биохимическую энергию за счет изменения конфигурации молекулы родопсина при попадании на нее солнечного света, вызывая перекачку протона изнутри наружу и последующий приток, генерирующий энергию. [ 159 ] Археоподобные родопсины впоследствии были обнаружены среди различных таксонов, протистов, а также у бактерий и архей, хотя они редки в сложных многоклеточных организмах . [ 160 ] [ 161 ] [ 162 ]

Исследования 2019 года показывают, что эти «похищающие солнце бактерии» более распространены, чем считалось ранее, и могут изменить влияние глобального потепления на океаны. «Результаты расходятся с традиционной интерпретацией морской экологии, представленной в учебниках, которая утверждает, что почти весь солнечный свет в океане улавливается хлорофиллом в водорослях. Вместо этого бактерии, оснащенные родопсином, действуют как гибридные автомобили, приводимые в движение органическими веществами, когда они доступны, большинство бактерий — и под воздействием солнечного света, когда питательных веществ не хватает». [ 163 ] [ 155 ]

Существует астробиологическая гипотеза, называемая гипотезой пурпурной Земли , которая предполагает, что первоначальные формы жизни на Земле были основаны на сетчатке, а не на хлорофилле, из-за чего Земля выглядела фиолетовой, а не зеленой. [ 164 ] [ 165 ]

Симбиоз

[ редактировать ]
Смотрите также: Морской микробный симбиоз.

Некоторые морские организмы вступают в симбиоз с бактериями или архей. Черви Помпеи живут на больших глубинах у гидротермальных источников при температуре до 80 ° C (176 ° F). У них что-то вроде волосатой спины, но на самом деле эти «волосы» представляют собой колонии бактерий, таких как Nautilia profundicola , которые, как полагают, обеспечивают червю некоторую степень изоляции. Железы на спине червя выделяют слизь, которой питаются бактерии, что является формой симбиоза .

Филогенетическое дерево, представляющее бактериальные OTU из библиотек клонов и секвенирования следующего поколения . OTU из секвенирования следующего поколения отображаются, если OTU содержала более двух последовательностей в неразреженной таблице OTU (3626 OTU). [ 167 ]

Эндосимбионтные бактерии — это бактерии, живущие внутри тела или клеток другого организма. Некоторые типы цианобактерий являются эндосимбионтами , и было обнаружено, что цианобактерии обладают генами, которые позволяют им подвергаться азотфиксации. [ 168 ]

Организмы обычно вступают в симбиотические отношения из-за ограниченности ресурсов в среде обитания или из-за ограничения источника пищи. Симбиотические хемосинтезирующие бактерии, обнаруженные в связи с мидиями ( Bathymodiolus ), расположенными вблизи гидротермальных источников, имеют ген, который позволяет им использовать водород в качестве источника энергии, а не серу или метан в качестве источника энергии для производства энергии. [ 169 ]

Olavius ​​algarvensis — это червь, который обитает в прибрежных отложениях Средиземноморья и питается симбиотическими бактериями. Он живет с пятью различными видами бактерий, расположенными под его кутикулой: двумя сульфидокисляющими , двумя сульфатредуцирующими и одной спирохетой . Симбиотические бактерии также позволяют червю использовать водород и угарный газ в качестве источников энергии и метаболизировать органические соединения, такие как малат и ацетат . [ 170 ] [ 171 ]

Astrangia poculata , северный звездчатый коралл, представляет собой каменистый коралл умеренного пояса , широко встречающийся вдоль восточного побережья Соединенных Штатов. Коралл может жить как с зооксантеллами (водорослевыми симбионтами), так и без них, что делает его идеальным модельным организмом для изучения взаимодействий микробного сообщества, связанных с симбиотическим состоянием. Однако возможность разработки праймеров и зондов для более специфичного воздействия на ключевые микробные группы затруднена из-за отсутствия полноразмерных последовательностей 16S рРНК , поскольку последовательности, полученные с помощью платформы Illumina, имеют недостаточную длину (около 250 пар оснований) для создания праймеры и зонды. [ 172 ] В 2019 году Голдсмит и др. продемонстрировало, что секвенирование по Сэнгеру способно воспроизводить биологически значимое разнообразие, обнаруженное с помощью более глубокого секвенирования следующего поколения , а также создавать более длинные последовательности, полезные исследовательскому сообществу для разработки зондов и праймеров (см. Диаграмму справа). [ 173 ]

Роль в морских пищевых сетях

[ редактировать ]
Бактериопланктон и пелагическая морская пищевая сеть
Солнечная радиация может иметь положительное (+) или отрицательное (-) воздействие, приводящее к увеличению или снижению гетеротрофной активности бактериопланктона. [ 174 ]
Дополнительная информация: Морская пищевая сеть.

Большая часть объема Мирового океана находится во тьме. Процессы, происходящие в тонком освещенном приземном слое ( фототическом слое от поверхности до глубин от 50 до 170 метров), имеют важное значение для глобальной биосферы. Например, видимая область солнечного спектра (так называемое фотосинтетически доступное излучение или ФАР), достигающая этого освещенного солнцем слоя, обеспечивает около половины первичной продуктивности планеты и отвечает за примерно половину атмосферного кислорода, необходимого для большей части жизни. на Земле. [ 175 ] [ 176 ]

Гетеротрофный бактериопланктон является основным потребителем растворенного органического вещества (РОВ) в пелагических морских пищевых цепях , включая освещенные солнцем верхние слои океана. Их чувствительность к ультрафиолетовому излучению (УФИ), а также некоторые недавно открытые механизмы, которые бактерии развили в процессе эволюции, чтобы извлечь выгоду из фотосинтетически доступного излучения (ФАР), позволяют предположить, что естественный солнечный свет играет важную, но трудно предсказуемую роль в модуляции бактериальных биогеохимических функций в океанах. [ 174 ]

Среда обитания на поверхности океана находится на границе между атмосферой и океаном. Биопленочная среда обитания на поверхности океана является местом обитания обитающих на поверхности микроорганизмов, обычно называемых нейстоном . Этот обширный интерфейс воздух-вода находится на пересечении основных процессов воздухообмена и воды, охватывая более 70% площади мировой поверхности. Бактерии в поверхностном микрослое океана, называемые бактерионейстоном , представляют интерес из-за практических применений, таких как газообмен между воздухом и морем парниковых газов, производство климатически активных морских аэрозолей и дистанционное зондирование океана. [ 177 ] Особый интерес представляет производство и разложение поверхностно-активных веществ (поверхностно-активных материалов) посредством микробных биохимических процессов. Основными источниками поверхностно-активных веществ в открытом океане являются фитопланктон, [ 178 ] земной сток и осаждение из атмосферы. [ 177 ]

Бактерии, морские пятна и спутниковое дистанционное зондирование
Поверхностно-активные вещества способны гасить короткие капиллярные волны на поверхности океана и сглаживать морскую поверхность. Спутниковое дистанционное зондирование радара с синтезированной апертурой (SAR) может обнаруживать области с концентрированными поверхностно-активными веществами или морскими пятнами, которые выглядят как темные области на изображениях SAR. [ 177 ]

В отличие от цветения цветных водорослей, бактерии, связанные с поверхностно-активными веществами, могут быть не видны на цветных изображениях океана. Возможность обнаруживать эти «невидимые» бактерии, связанные с поверхностно-активными веществами, с помощью радара с синтезированной апертурой дает огромные преимущества в любых погодных условиях, независимо от облачности, тумана или дневного света. [ 177 ] Это особенно важно при очень сильных ветрах, поскольку именно в этих условиях происходит наиболее интенсивный газообмен между воздухом и морем и образование морских аэрозолей. Таким образом, в дополнение к цветным спутниковым изображениям спутниковые изображения SAR могут дать дополнительную информацию о глобальной картине биофизических процессов на границе океана и атмосферы, обмене парниковых газов между воздухом и морем и образовании климатически активных морских аэрозолей. [ 177 ]

Экспортные процессы в океане по данным дистанционного зондирования [ 179 ]

океана На диаграмме справа показаны связи между биологическим насосом и пелагической пищевой сетью, а также возможность удаленного отбора проб этих компонентов с кораблей, спутников и автономных транспортных средств. Светло-голубые воды представляют собой эвфотическую зону , а более темные голубые воды представляют собой сумеречную зону . [ 179 ]

Роль в биогеохимическом цикле

[ редактировать ]
Дополнительная информация: Морские биогеохимические циклы , микробное окисление серы и микробные сообщества гидротермальных источников.

Археи перерабатывают такие элементы, как углерод , азот и сера , в различных средах обитания. [ 180 ] Археи выполняют множество этапов азотного цикла . Сюда входят как реакции, которые удаляют азот из экосистем (например, нитратное дыхание и денитрификация ), так и процессы, которые вносят азот (например, ассимиляция нитратов и фиксация азота ). [ 181 ] [ 182 ]

Недавно исследователи обнаружили участие архей в реакциях окисления аммиака . Эти реакции особенно важны в океанах. [ 183 ] [ 184 ] В цикле серы археи, которые растут за счет окисления соединений серы , выделяют этот элемент из горных пород, делая его доступным для других организмов, но археи, которые делают это, такие как Sulfolobus , производят серную кислоту в качестве побочного продукта, и рост этих организмов в заброшенных шахтах может способствовать кислотному дренажу шахт и другому экологическому ущербу. [ 185 ] В углеродном цикле метаногенные археи удаляют водород и играют важную роль в разложении органического вещества популяциями микроорганизмов, которые действуют как разлагатели в анаэробных экосистемах, таких как отложения и болота. [ 186 ]


См. также

[ редактировать ]

Ссылки

[ редактировать ]
  1. ^ Янгсон Р.М. (2006). Словарь Коллинза по биологии человека . Глазго: ХарперКоллинз. ISBN  978-0-00-722134-9 .
  2. ^ Нельсон Д.Л., Кокс М.М. (2005). Ленингерские принципы биохимии (4-е изд.). Нью-Йорк: WH Freeman. ISBN  978-0-7167-4339-2 .
  3. ^ Мартин Э.А., изд. (1983). Словарь наук о жизни Macmillan (2-е изд.). Лондон: Макмиллан Пресс. ISBN  978-0-333-34867-3 .
  4. ^ Фюрст Дж. А. (2010). «Помимо прокариотов и эукариотов: планктомицеты и клеточная организация» . Природное образование . 3 (9): 44.
  5. ^ Данные ВОЗ о смертности за 2002 г. По состоянию на 20 января 2007 г.
  6. ^ Университет Джорджии (10 декабря 2015 г.). «Функции микробиома глобального океана являются ключом к пониманию изменений окружающей среды» . www.sciencedaily.com . Проверено 11 декабря 2015 г.
  7. ^ Бар-Он Ю.М., Филлипс Р., Майло Р. (2018). «Распределение биомассы на Земле» (PDF) . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 115 (25): 6506–6511. Бибкод : 1998PNAS...95.6578W . дои : 10.1073/pnas.1711842115 . ПМК   6016768 . ПМИД   29784790 .
  8. ^ Jump up to: а б Доглиони С., Пиньятти Дж., Коулман М. (2016). «Почему жизнь на поверхности Земли возникла в кембрии?» . Геонаучные границы . 7 (6): 865–873. Бибкод : 2016GeoFr...7..865D . дои : 10.1016/j.gsf.2016.02.001 . hdl : 11573/925124 .
  9. ^ «Возраст Земли» . Геологическая служба США . 9 июля 2007 года . Проверено 31 мая 2015 г.
  10. ^ Далримпл 2001 , стр. 205–221.
  11. ^ Манхеса Дж., Аллегре С.Дж. , Дюпреа Б., Хамелен Б. (май 1980 г.). «Изотопное исследование свинца основных-ультраосновных слоистых комплексов: предположения о возрасте Земли и характеристиках примитивной мантии». Письма о Земле и планетологии . 47 (3): 370–382. Бибкод : 1980E&PSL..47..370M . дои : 10.1016/0012-821X(80)90024-2 .
  12. ^ Шопф Й.В. , Кудрявцев А.Б., Чая А.Д., Трипати А.Б. (5 октября 2007 г.). «Свидетельства архейской жизни: строматолиты и микроокаменелости». Докембрийские исследования . 158 (3–4): 141–155. Бибкод : 2007PreR..158..141S . doi : 10.1016/j.precamres.2007.04.009 .
  13. ^ Рэйвен и Джонсон 2002 , с. 68
  14. ^ Баумгартнер Р.Дж. и др. (2019). «Нанопористый пирит и органическое вещество в строматолитах возрастом 3,5 миллиарда лет свидетельствуют о первозданной жизни» (PDF) . Геология . 47 (11): 1039–1043. Бибкод : 2019Geo....47.1039B . дои : 10.1130/G46365.1 . S2CID   204258554 .
  15. ^ Самые ранние признаки жизни: ученые находят остатки микробов в древних камнях Phys.org . 26 сентября 2019 г.
  16. ^ Яблонски Д. (25 июня 1999 г.). «Будущее ископаемых пластинок». Наука . 284 (5423): 2114–2116. дои : 10.1126/science.284.5423.2114 . ПМИД   10381868 . S2CID   43388925 .
  17. ^ Jump up to: а б Кавалер-Смит Т. (29 июня 2006 г.). «Эволюция клеток и история Земли: застой и революция» . Философские труды Королевского общества B: Биологические науки . 361 (1470): 969–1006. дои : 10.1098/rstb.2006.1842 . ПМЦ   1578732 . ПМИД   16754610 .
  18. ^ Шопф JW (29 июня 2006 г.). «Ископаемые свидетельства архейской жизни» . Философские труды Королевского общества B: Биологические науки . 361 (1470): 869–885. дои : 10.1098/rstb.2006.1834 . ПМЦ   1578735 . ПМИД   16754604 .
  19. ^ Шопф JW (19 июля 1994 г.). «Разные темпы, разные судьбы: темп и способ эволюции менялись от докембрия к фанерозою» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (15): 6735–6742. Бибкод : 1994PNAS...91.6735S . дои : 10.1073/pnas.91.15.6735 . ПМЦ   44277 . ПМИД   8041691 .
  20. ^ Пул А.М., Пенни Д. (январь 2007 г.). «Оценка гипотез происхождения эукариот». Биоэссе . 29 (1): 74–84. doi : 10.1002/bies.20516 . ПМИД   17187354 .
  21. ^ Jump up to: а б Дьялл С.Д., Браун М.Т., Джонсон П.Дж. (9 апреля 2004 г.). «Древние вторжения: от эндосимбионтов к органеллам». Наука . 304 (5668): 253–257. Бибкод : 2004Sci...304..253D . дои : 10.1126/science.1094884 . ПМИД   15073369 . S2CID   19424594 .
  22. ^ Мартин В. (октябрь 2005 г.). «Недостающее звено между гидрогеносомами и митохондриями». Тенденции в микробиологии . 13 (10): 457–459. дои : 10.1016/j.tim.2005.08.005 . ПМИД   16109488 .
  23. ^ Ланг Б.Ф., Грей М.В., Бургер Дж. (декабрь 1999 г.). «Эволюция митохондриального генома и происхождение эукариот». Ежегодный обзор генетики . 33 : 351–397. дои : 10.1146/annurev.genet.33.1.351 . ПМИД   10690412 .
  24. ^ Обнимаю, Лаура А.; Бейкер, Бретт Дж.; Анантараман, Картик; Браун, Кристофер Т.; Пробст, Александр Дж.; Кастель, Синди Дж.; Баттерфилд, Кристина Н.; Хернсдорф, Алекс В.; Амано, Юки; Исе, Котаро; Сузуки, Йохей (11 апреля 2016 г.). «Новый взгляд на древо жизни» . Природная микробиология . 1 (5): 16048. doi : 10.1038/nmicrobiol.2016.48 . ISSN   2058-5276 . ПМИД   27572647 .
  25. ^ Чиккарелли Ф.Д., Доркс Т., фон Меринг С. и др. (3 марта 2006 г.). «На пути к автоматической реконструкции древа жизни с высоким разрешением». Наука . 311 (5765): 1283–1287. Бибкод : 2006Sci...311.1283C . CiteSeerX   10.1.1.381.9514 . дои : 10.1126/science.1123061 . ПМИД   16513982 . S2CID   1615592 .
  26. ^ Делонг Э.Ф. , Пейс Н.Р. (1 августа 2001 г.). «Экологическое разнообразие бактерий и архей». Систематическая биология . 50 (4): 470–478. CiteSeerX   10.1.1.321.8828 . дои : 10.1080/106351501750435040 . ПМИД   12116647 .
  27. ^ Кайзер Д. (декабрь 2001 г.). «Построение многоклеточного организма». Ежегодный обзор генетики . 35 : 103–123. дои : 10.1146/annurev.genet.35.102401.090145 . ПМИД   11700279 . S2CID   18276422 .
  28. ^ Циммер С (7 января 2016 г.). «Генетический переворот помог организмам перейти от одной клетки к множеству» . Нью-Йорк Таймс . Проверено 7 января 2016 г.
  29. ^ Валентайн Дж.В. , Яблонски Д., Эрвин Д.Х. (1 марта 1999 г.). «Ископаемые, молекулы и эмбрионы: новые взгляды на кембрийский взрыв» . Разработка . 126 (5): 851–859. дои : 10.1242/dev.126.5.851 . ПМИД   9927587 . Проверено 30 декабря 2014 г.
  30. ^ Оно С. (январь 1997 г.). «Причина, а также последствия кембрийского взрыва в эволюции животных». Журнал молекулярной эволюции . 44 (Приложение 1): С23–С27. Бибкод : 1997JMolE..44S..23O . дои : 10.1007/PL00000055 . ПМИД   9071008 . S2CID   21879320 .
  31. ^ Кэмпбелл, Н. «Биология: концепции и связи». Пирсон Образование. Сан-Франциско: 2003.
  32. ^ Харпер, Дуглас. «прокариот» . Интернет-словарь этимологии .
  33. ^ Харпер, Дуглас. «эукариотический» . Интернет-словарь этимологии .
  34. ^ Станье Р.Ю. , Ван Нил CB (1962). «Понятие о бактерии». Архив микробиологии . 42 :17-35. дои : 10.1007/BF00425185 . ПМИД   13916221 . S2CID   29859498 .
  35. ^ Woese CR, Fox GE (ноябрь 1977 г.). «Филогенетическая структура прокариотического домена: первичные царства» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 74 (11): 5088–90. Бибкод : 1977PNAS...74.5088W . дои : 10.1073/pnas.74.11.5088 . ПМК   432104 . ПМИД   270744 .
  36. ^ Вёзе Ч.Р., Кандлер О., Уилис М.Л. (июнь 1990 г.). «На пути к естественной системе организмов: предложение по доменам архей, бактерий и эукариев» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 87 (12): 4576–9. Бибкод : 1990PNAS...87.4576W . дои : 10.1073/pnas.87.12.4576 . ПМК   54159 . ПМИД   2112744 .
  37. ^ Отомо, Йоко; Какегава, Такеши; Исида, Акизуми; Нагасе, Тосиро; Розинг, Миник Т. (январь 2014 г.). «Свидетельства наличия биогенного графита в метаосадочных породах раннего архея Исуа». Природа Геонауки . 7 (1): 25–28. Бибкод : 2014NatGe...7...25O . дои : 10.1038/ngeo2025 .
  38. ^ Натман, Аллен П.; Беннетт, Вики С.; Друг, Кларк Р.Л.; Кранендонк, Мартин Дж. Ван; Чивас, Аллан Р. (сентябрь 2016 г.). «Быстрое возникновение жизни, продемонстрированное открытием микробных структур возрастом 3700 миллионов лет» . Природа . 537 (7621): 535–538. Бибкод : 2016Natur.537..535N . дои : 10.1038/nature19355 . ПМИД   27580034 . S2CID   205250494 .
  39. ^ Боренштейн, Сет (19 октября 2015 г.). «Намеки на жизнь на ранней Земле, которая считалась пустынной» . Возбуждайте . Йонкерс, Нью-Йорк: Интерактивная сеть Mindspark . Ассошиэйтед Пресс . Архивировано из оригинала 23 октября 2015 года . Проверено 8 октября 2018 г.
  40. ^ Белл, Элизабет А.; Бенике, Патрик; Харрисон, Т. Марк; и др. (19 октября 2015 г.). «Потенциально биогенный углерод сохранился в цирконе возрастом 4,1 миллиарда лет» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 112 (47): 14518–21. Бибкод : 2015PNAS..11214518B . дои : 10.1073/pnas.1517557112 . ПМЦ   4664351 . ПМИД   26483481 .
  41. ^ Додд, Мэтью С.; Папино, Доминик; Гренне, Тор; слабый, Джон Ф.; Риттнер, Мартин; Пирайно, Франко; О'Нил, Джонатан; Литтл, Криспин Т.С. (2 марта 2017 г.). «Доказательства ранней жизни в осадках старейших гидротермальных источников Земли» (PDF) . Природа . 543 (7643): 60–64. Бибкод : 2017Natur.543...60D . дои : 10.1038/nature21377 . ПМИД   28252057 . S2CID   2420384 .
  42. ^ Циммер, Карл (1 марта 2017 г.). «Ученые говорят, что окаменелости канадских бактерий могут быть древнейшими на Земле» . Нью-Йорк Таймс . Проверено 2 марта 2017 г.
  43. ^ Нисбет, Юан Г.; Фаулер, CMR (7 декабря 1999 г.). «Архейская метаболическая эволюция микробных матов» . Труды Лондонского королевского общества Б. 266 (1436): 2375–2382. дои : 10.1098/rspb.1999.0934 . ПМК   1690475 .
  44. ^ Анбар, Ариэль Д.; Юн Дуань; Лайонс, Тимоти В.; и др. (28 сентября 2007 г.). «Запах кислорода перед великим событием окисления?». Наука . 317 (5846): 1903–1906. Бибкод : 2007Sci...317.1903A . дои : 10.1126/science.1140325 . ПМИД   17901330 . S2CID   25260892 .
  45. ^ Нолл, Эндрю Х .; Жаво, Эммануэль Ж.; Хьюитт, Дэвид; Коэн, Фиби (29 июня 2006 г.). «Эукариотические организмы в протерозойских океанах» . Философские труды Королевского общества Б. 361 (1470): 1023–1038. дои : 10.1098/rstb.2006.1843 . ПМЦ   1578724 . ПМИД   16754612 .
  46. ^ Федонкин, Михаил А. (31 марта 2003 г.). «Происхождение Metazoa в свете протерозойской летописи окаменелостей» (PDF) . Палеонтологические исследования . 7 (1): 9–41. дои : 10.2517/prpsj.7.9 . S2CID   55178329 . Архивировано из оригинала (PDF) 26 февраля 2009 года . Проверено 2 сентября 2008 г.
  47. ^ Боннер, Джон Тайлер (1998). «Истоки многоклеточности». Интегративная биология . 1 (1): 27–36. doi : 10.1002/(SICI)1520-6602(1998)1:1<27::AID-INBI4>3.0.CO;2-6 .
  48. ^ Мэй, Р.М. (1988) «Сколько видов существует на Земле?». Science , 241 (4872): 1441–1449. дои : 10.1126/science.241.4872.1441 .
  49. ^ Лоси, К.Дж. и Леннон, Дж.Т. (2016) «Законы масштабирования предсказывают глобальное микробное разнообразие». Труды Национальной академии наук , 113 (21): 5970–5975. два : 10.1073/pnas.1521291113 .
  50. ^ Виторино, Л.К. и Бесса, Лос-Анджелес (2018) «Микробное разнообразие: разрыв между оценками и известными». Разнообразие , 10 (2):46. два : 10.3390/d10020046 . Измененный текст был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  51. ^ Живые бактерии движутся в воздушных потоках Земли Журнал Smithsonian , 11 января 2016 г.
  52. ^ Роббинс, Джим (13 апреля 2018 г.). «Триллионы и триллионы вирусов падают с неба каждый день» . Нью-Йорк Таймс . Проверено 14 апреля 2018 г.
  53. ^ Рече, Изабель; Д'Орта, Гаэтано; Младенов, Наталья; Вингет, Даниэль М; Саттл, Кертис А. (29 января 2018 г.). «Скорость осаждения вирусов и бактерий над пограничным слоем атмосферы» . Журнал ИСМЕ . 12 (4): 1154–1162. Бибкод : 2018ISMEJ..12.1154R . дои : 10.1038/s41396-017-0042-4 . ПМК   5864199 . ПМИД   29379178 .
  54. ^ Саттл, Калифорния (2005). «Вирусы в море». Природа . 437 (9): 356–361. Бибкод : 2005Natur.437..356S . дои : 10.1038/nature04160 . ПМИД   16163346 . S2CID   4370363 .
  55. ^ Шорс 2017 , с. 5
  56. ^ Шорс 2017 , с. 593
  57. ^ Саттл, Калифорния (2007). «Морские вирусы — основные игроки глобальной экосистемы». Обзоры природы Микробиология . 5 (10): 801–12. дои : 10.1038/nrmicro1750 . ПМИД   17853907 . S2CID   4658457 .
  58. ^ Шульц, Кестин; Смит, Мария В.; Херфорт, Лиди; Саймон, Холли М. (2018). «Невидимый мир в реке» . Границы для молодых умов . 6 . дои : 10.3389/фрим.2018.00004 . S2CID   3344238 . Измененный текст был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  59. ^ Стоекениус В. (октябрь 1981 г.). «Квадратная бактерия Уолсби: тонкая структура ортогонального прокариота» . Журнал бактериологии . 148 (1): 352–60. дои : 10.1128/JB.148.1.352-360.1981 . ПМК   216199 . ПМИД   7287626 .
  60. ^ Дарем, Бриндан П.; Гроте, Яна; Уиттакер, Керри А.; Бендер, Сара Дж.; Ло, Хайвэй; Грим, Шэрон Л.; Браун, Джулия М.; Кейси, Джон Р.; Дрон, Энтони; Флорес-Лейва, Леннин; Крупке, Андреас; Лурия, Екатерина М.; Мой, Арик Х.; Нигро, Оливия Д.; Патер, Сантиска; Талармин, Агата; Уир, Эмма К.; Вебер, Томас С.; Уилсон, Джесси М.; Черч, Мэтью Дж.; Делонг, Эдвард Ф.; Карл, Дэвид М.; Стюард, Григ Ф.; Эппли, Джон М.; Кирпидес, Никос К.; Шустер, Стефан; Раппе, Майкл С. (2014). «Проект последовательности генома морского альфапротеобактериального штамма HIMB11, первого культивируемого представителя уникальной линии внутри клады Roseobacter, обладающего необычно маленьким геномом» . Стандарты в геномных науках . 9 (3): 632–645. дои : 10.4056/sig.4998989 . ПМК   4148974 . ПМИД   25197450 .
  61. ^ Фредриксон Дж.К., Захара Дж.М., Балквилл Д.Л., Кеннеди Д., Ли С.М., Костандаритес Х.М., Дейли М.Дж., Ромин М.Ф., Брокман Ф.Дж. (2004). «Геомикробиология вадозных отложений, сильно загрязненных ядерными отходами, на полигоне в Хэнфорде, штат Вашингтон» . Прикладная и экологическая микробиология . 70 (7): 4230–41. Бибкод : 2004ApEnM..70.4230F . дои : 10.1128/АЕМ.70.7.4230-4241.2004 . ПМК   444790 . ПМИД   15240306 .
  62. ^ Вёзе Ч.Р., Кандлер О., Уилис М.Л. (1990). «На пути к естественной системе организмов: предложение по доменам архей, бактерий и эукариев» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 87 (12): 4576–9. Бибкод : 1990PNAS...87.4576W . дои : 10.1073/pnas.87.12.4576 . ПМК   54159 . ПМИД   2112744 .
  63. ^ Шопф Дж.В. (1994). «Разные темпы, разные судьбы: темп и способ эволюции менялись от докембрия к фанерозою» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (15): 6735–42. Бибкод : 1994PNAS...91.6735S . дои : 10.1073/pnas.91.15.6735 . ПМЦ   44277 . ПМИД   8041691 .
  64. ^ Делонг Э.Ф., Пейс Н.Р. (2001). «Экологическое разнообразие бактерий и архей». Систематическая биология . 50 (4): 470–8. CiteSeerX   10.1.1.321.8828 . дои : 10.1080/106351501750435040 . ПМИД   12116647 .
  65. ^ Браун-младший, Дулиттл В.Ф. (1997). «Археи и переход от прокариот к эукариотам» . Обзоры микробиологии и молекулярной биологии . 61 (4): 456–502. doi : 10.1128/mmbr.61.4.456-502.1997 . ПМК   232621 . ПМИД   9409149 .
  66. ^ Пул А.М., Пенни Д. (2007). «Оценка гипотез происхождения эукариот». Биоэссе . 29 (1): 74–84. doi : 10.1002/bies.20516 . ПМИД   17187354 . S2CID   36026766 .
  67. ^ Ланг Б.Ф., Грей М.В., Бургер Дж. (1999). «Эволюция митохондриального генома и происхождение эукариот». Ежегодный обзор генетики . 33 : 351–97. дои : 10.1146/annurev.genet.33.1.351 . ПМИД   10690412 .
  68. ^ Макфадден Дж.И. (1999). «Эндосимбиоз и эволюция растительной клетки». Современное мнение в области биологии растений . 2 (6): 513–9. Бибкод : 1999COPB....2..513M . дои : 10.1016/S1369-5266(99)00025-4 . ПМИД   10607659 .
  69. ^ Кох А.Л. (2002). «Контроль бактериального клеточного цикла путем роста цитоплазмы». Критические обзоры по микробиологии . 28 (1): 61–77. дои : 10.1080/1040-840291046696 . ПМИД   12003041 . S2CID   11624182 .
  70. ^ Иагон Р.Г. (апрель 1962 г.). «Pseudomonas natriegens, морская бактерия со временем генерации менее 10 минут» . Журнал бактериологии . 83 (4): 736–37. дои : 10.1128/jb.83.4.736-737.1962 . ПМК   279347 . ПМИД   13888946 .
  71. ^ "Кандидат Pelagibacter Ubique". Европейский институт биоинформатики. Европейский институт биоинформатики, 2011. Интернет. 8 января 2012 г. http://www.ebi.ac.uk/2can/genomes/bacteria/Candidatus_Pelagibacter_ubique.html. Архивировано 1 декабря 2008 г. в Wayback Machine.
  72. ^ «Блошиный рынок: недавно обнаруженный вирус может оказаться самым распространенным организмом на планете» . Экономист . 16 февраля 2013 года . Проверено 16 февраля 2013 г.
  73. ^ Чжао, Ю.; Темпертон, Б.; Трэш, Джей Си; Швальбах, М.С.; Вергин, КЛ; Лэндри, ЗК; Эллисман, М.; Диринк, Т.; Салливан, МБ; Джованнони, SJ (2013). «Обилие вирусов SAR11 в океане». Природа . 494 (7437): 357–360. Бибкод : 2013Natur.494..357Z . дои : 10.1038/nature11921 . ПМИД   23407494 . S2CID   4348619 .
  74. ^ Бентзон-Тилиа М., Грам Л. (2017). «Биотехнологическое применение группы Roseobacter». Биоразведка . Темы биоразнообразия и охраны природы. Том. 16. Спрингер, Чам. стр. 137–166. дои : 10.1007/978-3-319-47935-4_7 . ISBN  978-3-319-47933-0 .
  75. ^ Браузер таксономии NCBI: Национальный центр биотехнологической информации Roseobacter . Доступ: 8 мая 2020 г.
  76. ^ «Самая большая бактерия: ученый обнаруживает новую бактериальную форму жизни у африканского побережья» , Институт морской микробиологии Макса Планка , 8 апреля 1999 г., заархивировано из оригинала 20 января 2010 г.
  77. ^ Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре - Род Thiomargarita
  78. ^ Изменения концентрации кислорода в нашем океане могут нарушить фундаментальные биологические циклы Phys.org , 25 ноября 2019 г.
  79. ^ Уолш П.Дж., Смит С., Флеминг Л., Соло-Габриэль Х., Гервик У.Х., ред. (2 сентября 2011 г.). «Цианобактерии и цианобактериальные токсины» . Океаны и здоровье человека: морские риски и средства правовой защиты . Академическая пресса. стр. 271–296. ISBN  978-0-08-087782-2 .
  80. ^ «Повышение уровня кислорода — журнал астробиологии» . Журнал астробиологии . 30 июля 2003 г. Проверено 6 апреля 2016 г.
  81. ^ Фланнери, DT; Р. М. Уолтер (2012). «Архейские тафтинговые микробные маты и Великое событие окисления: новый взгляд на древнюю проблему». Австралийский журнал наук о Земле . 59 (1): 1–11. Бибкод : 2012AuJES..59....1F . дои : 10.1080/08120099.2011.607849 . S2CID   53618061 .
  82. ^ Ротшильд, Линн (сентябрь 2003 г.). «Понять эволюционные механизмы и экологические пределы жизни» . НАСА. Архивировано из оригинала 29 марта 2012 года . Проверено 13 июля 2009 г.
  83. ^ Басу, Субхаджит; Гледхилл, Марта; Де Бир, Дирк; Прабху Матондкар, генеральный директор; Шакед, Йела (2019). «Колонии морских цианобактерий Trichodesmium взаимодействуют с ассоциированными бактериями, приобретая железо из пыли» . Коммуникационная биология . 2 : 284. doi : 10.1038/s42003-019-0534-z . ПМК   6677733 . ПМИД   31396564 . Измененный текст был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  84. ^ Патрик Дж. Килинг (2004). «Разнообразие и история эволюции пластид и их хозяев» . Американский журнал ботаники . 91 (10): 1481–1493. дои : 10.3732/ajb.91.10.1481 . ПМИД   21652304 .
  85. ^ Надис С. (декабрь 2003 г.). «Клетки, управляющие морями» (PDF) . Научный американец . 289 (6): 52–3. Бибкод : 2003SciAm.289f..52N . doi : 10.1038/scientificamerican1203-52 . ПМИД   14631732 . Архивировано из оригинала (PDF) 19 апреля 2014 года . Проверено 2 июня 2019 г.
  86. ^ «Самый важный микроб, о котором вы никогда не слышали» . npr.org .
  87. ^ Фломбаум, П.; Гальегос, JL; Гордилло, РА; Корнер, Дж.; Забала, LL; Цзяо, Н.; Карл, DM; Ли, WKW; Ломас, Миссури; Венециано, Д.; Вера, CS; Вругт, Дж.А.; Мартини, AC (2013). «Настоящее и будущее глобальное распространение морских цианобактерий Prochromococcus и Synechococcus» . Труды Национальной академии наук . 110 (24): 9824–9 Бибкод : 2013PNAS..110.9824F . дои : 10.1073/pnas.1307701110 . ПМЦ   3683724 . ПМИД   23703908 .
  88. ^ Нэборс, Мюррей В. (2004). Введение в ботанику . Сан-Франциско, Калифорния: ISBN Pearson Education, Inc.  978-0-8053-4416-5 .
  89. ^ Аллаби, М., изд. (1992). «Водоросли». Краткий словарь ботаники . Оксфорд: Издательство Оксфордского университета.
  90. ^ Иварс-Мартинес, Елена; д'Аурия, Джузеппе; Родригес-Валера, Франциско; Санчес-Порро, Кристина; Вентоза, Антонио; Джойнт, ИАН; Мюлинг, Мартин (2008). «Биография вездесущей морской бактерии Alteromonas macleodi, определенная с помощью анализа мультилокусной последовательности». Молекулярная экология . 17 (18): 4092–4106. Бибкод : 2008MolEc..17.4092I . дои : 10.1111/j.1365-294x.2008.03883.x . ПМИД   19238708 . S2CID   38830049 .
  91. ^ Лопес-Перес, Марио; Гонзага, автор; Мартин-Куадрадо, Ана-Вифлеем; Онищенко, Ольга; Гавидель, Акбар; Гай, Рохит; Родригес-Валера, Франциско (2012). «Геномы поверхностных изолятов Alteromonas macleodii: жизнь широко распространенного морского оппортунистического копиотрофа» . Научные отчеты . 2 : 696. Бибкод : 2012NatSR...2E.696L . дои : 10.1038/srep00696 . ПМЦ   3458243 . ПМИД   23019517 .
  92. ^ Банг С., Шмитц Р.А. (2015). «Археи, связанные с человеческими поверхностями: нельзя недооценивать» . Обзоры микробиологии FEMS . 39 (5): 631–48. дои : 10.1093/femsre/fuv010 . ПМИД   25907112 .
  93. ^ Archaea Интернет-словарь этимологии . Проверено 17 августа 2016 г.
  94. ^ Пейс НР (май 2006 г.). «Время перемен» . Природа . 441 (7091): 289. Бибкод : 2006Natur.441..289P . дои : 10.1038/441289a . ПМИД   16710401 . S2CID   4431143 .
  95. ^ Стокениус В. (1 октября 1981 г.). «Квадратная бактерия Уолсби: тонкая структура ортогонального прокариота» . Журнал бактериологии . 148 (1): 352–60. дои : 10.1128/JB.148.1.352-360.1981 . ПМК   216199 . ПМИД   7287626 .
  96. ^ Мэдиган М., Мартинко Дж., ред. (2005). Брок Биология микроорганизмов (11-е изд.). Прентис Холл. ISBN  978-0-13-144329-7 .
  97. ^ Хубер, Харальд; и др. (2002). «Новый тип архей, представленный наноразмерным гипертермофильным симбионтом». Природа . 417 (6884): 63–67. Бибкод : 2002Natur.417...63H . дои : 10.1038/417063а . ПМИД   11986665 . S2CID   4395094 .
  98. ^ Брошье, Селин; Грибальдо, С; Живанович, Ю; Конфалоньери, Ф; и др. (2005). «Наноархеи: представители нового типа архей или быстро развивающейся эвриархейной линии, родственной Thermococcales?» . Геномная биология . 6 (5): Р42. дои : 10.1186/gb-2005-6-5-r42 . ПМЦ   1175954 . ПМИД   15892870 .
  99. ^ Орельяна, Луис Х.; Бен Фрэнсис, Т.; Крюгер, Карен; Тилинг, Ханно; Мюллер, Мари-Каролина; Фукс, Бернхард М.; Константинидис, Константинос Т.; Аманн, Рудольф И. (2019). «Диференциация ниш среди ежегодно повторяющихся прибрежных морских групп II эвриархеот» . Журнал ISME . 13 (12): 3024–3036. Бибкод : 2019ISMEJ..13.3024O . дои : 10.1038/s41396-019-0491-z . ПМК   6864105 . PMID   31447484 .
  100. ^ См. особенно рис. 4 в Нишимура, Ёсуке; Хонда, Такаши; Омаэ, Кимихо, Саймон; Ямамото, Кейго; Хингам, Ёсихико; Ёсида, Такаши (2017). в океане» . mSphere Вирусные 2 2 ( Сусуму ; геномы окружающей среды проливают новый свет на взаимодействие вируса и . «   ) хозяина ПМИД   28261669 .
  101. ^ Философ, Алон; Ютин, Наталья; Флорес-Урибе, Хосе; Шарон, Итай; Кунин Евгений Владимирович; Бежа, Одед (2017). «Новые многочисленные океанические вирусы некультивируемых морских эвриархей II группы» . Современная биология . 27 (9): 1362–1368. Бибкод : 2017CBio...27.1362P . дои : 10.1016/j.cub.2017.03.052 . ПМЦ   5434244 . ПМИД   28457865 .
  102. ^ Ся, Сяоминь; Го, Ван; Лю, Хунбин (2017). «Вариации состава и разнообразия архей Тихого океана в масштабах бассейна» . Границы микробиологии . 8 : 2057. doi : 10.3389/fmicb.2017.02057 . ПМК   5660102 . ПМИД   29109713 .
  103. ^ Мартин-Куадрадо, Ана-Белен; Гарсиа-Эредиа, Инмакулада; Молто, Айтор Гонзага; Лопес-Убеда, Ребека; Каймс, Николь; Лопес-Гарсия, «Очищение»; МОРЕЙРА, Дэвид; Родригес-Валера, Франциско (2015). «Новый класс морских эвриархей группы II из глубокого средиземноморского максимума хлорофилла» . Журнал ISME . 9 (7): 1619–1634. Бибкод : 2015ISMEJ...9.1619M . дои : 10.1038/ismej.2014.249 . ПМЦ   4478702 . ПМИД   25535935 .
  104. ^ NCBI: Кандидат Посейдониалес (орден)
  105. ^ NCBI: Группа морской пехоты III
  106. ^ NCBI: Группа морской пехоты IV
  107. ^ Зиллиг В. (декабрь 1991 г.). «Сравнительная биохимия архей и бактерий». Текущее мнение в области генетики и развития . 1 (4): 544–51. дои : 10.1016/S0959-437X(05)80206-0 . ПМИД   1822288 .
  108. ^ Слончевски Дж.Л., Фостер Дж.В. Микробиология: развивающаяся наука (3-е изд.). WW Нортон и компания. стр. 491–44.
  109. ^ Хоган CM (2010). «Экстремофил» . В Моноссон Э, Кливленд С (ред.). Энциклопедия Земли . Национальный совет науки и окружающей среды.
  110. ^ Юрков В.В.; Битти, Джей Ти (1998). «Аэробные аноксигенные фототрофные бактерии» . Обзоры микробиологии и молекулярной биологии . 62 (3): 695–724. дои : 10.1128/MMBR.62.3.695-724.1998 . ПМК   98932 . ПМИД   9729607 .
  111. ^ Лами, Р.; Коттрелл, Монтана; Рас, Дж.; Уллоа, О.; Оберностерер, И.; Клаустр, Х.; Кирчман, Д.Л.; Лебарон, П. (2007). «Высокая численность аэробных аноксигенных фотосинтетических бактерий в южной части Тихого океана» . Прикладная и экологическая микробиология . 73 (13): 4198–205. Бибкод : 2007ApEnM..73.4198L . дои : 10.1128/АЕМ.02652-06 . ЧВК   1932784 . ПМИД   17496136 .
  112. ^ Еженедельник наук о жизни. (2012). Бактерии; Отчеты Национального исследовательского совета Испании (CSIC) описывают последние достижения в области бактерий. ISSN   1552-2466 . Р.4582.
  113. ^ Цзяо, Няньчжи; Чжан, Яо; Цзэн, Юнхуэй; Хун, Нин; Лю, Рулонг; Чен, Фэн; Ван, Пинксянь (2007). «Четкая картина распределения численности и разнообразия аэробных аноксигенных фототрофных бактерий в мировом океане». Экологическая микробиология . 9 (12): 3091–3099. Бибкод : 2007EnvMi...9.3091J . дои : 10.1111/j.1462-2920.2007.01419.x . ПМИД   17991036 .
  114. ^ Лами, Рафаэль; Коттрелл, Мэтью Т.; Рас, ЖозеФин; Уллоа, Освальдо; Оберностерер, Ингрид; Клаустр, Эрве; Кирчман, Дэвид Л.; Лебарон, Филипп (2007). «Высокая численность аэробных аноксигенных фотосинтетических бактерий в южной части Тихого океана» . Прикладная и экологическая микробиология . 73 (13): 4198–4205. Бибкод : 2007ApEnM..73.4198L . дои : 10.1128/АЕМ.02652-06 . ЧВК   1932784 . ПМИД   17496136 .
  115. ^ Кольбер, З.С. (2001). «Вклад аэробных фотогетеротрофных бактерий в углеродный цикл в океане». Наука . 292 (5526): 2492–2495. дои : 10.1126/science.1059707 . ПМИД   11431568 . S2CID   1970984 .
  116. ^ Араньо М., Шлегель Х.Г. (1981). «Водородокисляющие бактерии». В Старр М.П., ​​Столп Х., Трюпер Х.Г., Баловс А., Шлегель Х.Г. (ред.). Прокариоты . Берлин, Гейдельберг: Springer. стр. 865–893. дои : 10.1007/978-3-662-13187-9_70 . ISBN  978-3-662-13187-9 .
  117. ^ Jump up to: а б Альберс С.В., Джаррелл К.Ф. (27 января 2015 г.). «Архееллум: как плавают археи» . Границы микробиологии . 6:23 . дои : 10.3389/fmicb.2015.00023 . ПМЦ   4307647 . ПМИД   25699024 .
  118. ^ Сильверман М., Саймон М. (май 1974 г.). «Вращение жгутиков и механизм подвижности бактерий». Природа . 249 (452): 73–4. Бибкод : 1974Natur.249...73S . дои : 10.1038/249073a0 . ПМИД   4598030 . S2CID   10370084 .
  119. ^ Мейстер Г.Л., Берг Х.К. (1987). «Быстрое вращение пучков жгутиков у плавающих бактерий». Природа . 325 (6105): 637–640. Бибкод : 1987Natur.325..637L . дои : 10.1038/325637a0 . S2CID   4242129 .
  120. ^ Берг Х.К., Андерсон Р.А. (октябрь 1973 г.). «Бактерии плавают, вращая свои жгутиковые нити». Природа . 245 (5425): 380–2. Бибкод : 1973Natur.245..380B . дои : 10.1038/245380a0 . ПМИД   4593496 . S2CID   4173914 .
  121. ^ Ян Т.Л., Бови ЕС (1965). «Передвижение и локомоция микроорганизмов». Ежегодный обзор микробиологии . 19 :21–58. дои : 10.1146/annurev.mi.19.100165.000321 . ПМИД   5318439 .
  122. ^ Харши РМ (2003). «Подвижность бактерий на поверхности: много путей к общей цели». Ежегодный обзор микробиологии . 57 : 249–73. дои : 10.1146/annurev.micro.57.030502.091014 . ПМИД   14527279 .
  123. ^ Джаррелл К. (2009). «Археальные жгутики и пили». Пили и жгутики: текущие исследования и будущие тенденции . Кайстер Академик Пресс. ISBN  978-1-904455-48-6 .
  124. ^ Брэди, Ричард М. (1993). «Крутящий момент и переключение бактериального жгутикового двигателя. Электростатическая модель» . Биофизический журнал . 64 (4): 961–973. Бибкод : 1993BpJ....64..961B . дои : 10.1016/S0006-3495(93)81462-0 . ПМЦ   1262414 . ПМИД   7684268 .
  125. ^ Штрайф С., Штаудингер В.Ф., Марван В., Остерхельт Д. (2008). «Вращение жгутиков у архей Halobacterium salinarum зависит от АТФ». Журнал молекулярной биологии . 384 (1): 1–8. дои : 10.1016/j.jmb.2008.08.057 . ПМИД   18786541 .
  126. ^ Jump up to: а б Скеркер, Дж. М.; Берг, ХК (5 июня 2001 г.). «Прямое наблюдение за расширением и втягиванием пилей IV типа» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (12): 6901–6904. Бибкод : 2001PNAS...98.6901S . дои : 10.1073/pnas.121171698 . ISSN   0027-8424 . ПМК   34450 . ПМИД   11381130 .
  127. ^ Мэттик, Джон С. (2002). «Пили IV типа и подергивания моторики». Ежегодный обзор микробиологии . 56 : 289–314. дои : 10.1146/annurev.micro.56.012302.160938 . ISSN   0066-4227 . ПМИД   12142488 .
  128. ^ Мерц, AJ; Итак, М.; Шитц, член парламента (7 сентября 2000 г.). «Втягивание пилуса приводит к подергивающейся подвижности бактерий». Природа . 407 (6800): 98–102. Бибкод : 2000Natur.407...98M . дои : 10.1038/35024105 . ISSN   0028-0836 . ПМИД   10993081 . S2CID   4425775 .
  129. ^ Хенриксен, Дж. (декабрь 1972 г.). «Бактериальная поверхностная транслокация: обзор и классификация» . Бактериологические обзоры . 36 (4): 478–503. дои : 10.1128/BR.36.4.478-503.1972 . ISSN   0005-3678 . ПМК   408329 . ПМИД   4631369 .
  130. ^ Нан, Бэйян (февраль 2017 г.). «Скользящая подвижность бактерий: разработка консенсусной модели» . Современная биология . 27 (4): Р154–Р156. Бибкод : 2017CBio...27.R154N . дои : 10.1016/j.cub.2016.12.035 . ПМИД   28222296 .
  131. ^ Нан, Бэйян; Макбрайд, Марк Дж.; Чен, Цзин; Зусман, Дэвид Р.; Остер, Джордж (февраль 2014 г.). «Бактерии, скользящие по спиральным дорожкам» . Современная биология . 24 (4): 169–174. Бибкод : 2014CBio...24.R169N . дои : 10.1016/j.cub.2013.12.034 . ПМЦ   3964879 . ПМИД   24556443 .
  132. ^ Сибли, Л.Дэвид; Хоканссон, Себастьян; Каррутерс, Верн Б. (1 января 1998 г.). «Скользящая подвижность: эффективный механизм проникновения в клетки» . Современная биология . 8 (1): С12–Р14. Бибкод : 1998CBio....8..R12S . дои : 10.1016/S0960-9822(98)70008-9 . ПМИД   9427622 . S2CID   17555804 .
  133. ^ Сибли, LDI (октябрь 2010 г.). «Как апикомплексные паразиты проникают в клетки и выходят из них» . Curr Opin Biotechnol . 21 (5): 592–8. дои : 10.1016/j.copbio.2010.05.009 . ПМЦ   2947570 . ПМИД   20580218 .
  134. ^ Харши, Расика М. (1 января 2003 г.). «Подвижность бактерий на поверхности: множество путей к общей цели». Ежегодный обзор микробиологии . 57 (1): 249–73. дои : 10.1146/annurev.micro.57.030502.091014 . ПМИД   14527279 .
  135. ^ Хенрихсен, Дж (1972). «Бактериальная поверхностная транслокация: обзор и классификация» . Бактериологические обзоры . 36 (4): 478–503. дои : 10.1128/BR.36.4.478-503.1972 . ПМЦ   408329 . ПМИД   4631369 .
  136. ^ «Лабораторное руководство BIOL 230: Неподвижные бактерии в подвижной среде» . факультет.ccbcmd.edu . Архивировано из оригинала 15 апреля 2017 года . Проверено 31 мая 2020 г.
  137. ^ Посфаи М., Лефевр К., Трубицын Д., Базылински Д.А. и Франкель Р. (2013) «Филогенетическое значение состава и кристаллической морфологии минералов магнитосом». Границы микробиологии , 4 : 344. два : 10.3389/fmicb.2013.00344 . Измененный текст был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 3.0 .
  138. ^ Линь, Вэй; Чжан, Вэньси; Чжао, Сян; Робертс, Эндрю; Патерсон, Грейг; Базылински, Деннис; Пан, Юнсинь (март 2018 г.). «Геномная экспансия магнитотаксисных бактерий показывает раннее общее происхождение магнитотаксиса с эволюцией, специфичной для каждой линии» . Журнал ISME . 12 (6): 1508–1519. Бибкод : 2018ISMEJ..12.1508L . дои : 10.1038/s41396-018-0098-9 . ПМЦ   5955933 . ПМИД   29581530 .
  139. ^ Jump up to: а б Дюсенбери, Дэвид Б. (2009). Жизнь на микроуровне: неожиданная физика маленького размера . Кембридж, Массачусетс: Издательство Гарвардского университета. стр. 100–101. ISBN  978-0-674-03116-6 .
  140. ^ Jump up to: а б Чжан, В.Дж. и Ву, Л.Ф., 2020. Жгутики и плавательное поведение морских магнитотаксических бактерий. Биомолекулы, 10(3), стр.460. два : 10.3390/biom10030460 . Измененный текст был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  141. ^ Джоглер, К.; Ваннер, Г.; Колинько С.; Ниблер, М.; Аманн, Р.; Петерсен, Н.; Кубе, М.; Рейнхардт, Р.; Шулер, Д. (2010). «Консервация генов и структур протеобактериальных магнитосом у некультивируемых представителей глубоко разветвленного типа Nitrospira» . Труды Национальной академии наук . 108 (3): 1134–1139. Бибкод : 2011PNAS..108.1134J . дои : 10.1073/pnas.1012694108 . ПМК   3024689 . ПМИД   21191098 .
  142. ^ Монтей, Кэролайн Л.; Валленет, Дэвид; Менги, Николас; Бензерара, Карим; Барб, Валери; Футо, Стефани; Круо, Коринн; Флориани, Магали; Виолье, Эрик; Адрианчик, Джеральдин; Леонхардт, Натали (июль 2019 г.). «Эктосимбиотические бактерии в основе магниторецепции у морских простейших» . ПриродаМикробиология . 4 (7): 1088–1095. дои : 10.1038/s41564-019-0432-7 . ISSN   2058-5276 . ПМК   6697534 . ПМИД   31036911 .
  143. ^ Натан, Эвиатар; Фитак, Роберт Роджерс; Вербер, Юваль; Вортман, Йони (28 сентября 2020 г.). «Симбиотическое магнитное зондирование: сбор доказательств и не только» . Философские труды Королевского общества B: Биологические науки . 375 (1808): 20190595. doi : 10.1098/rstb.2019.0595 . ПМЦ   7435164 . ПМИД   32772668 .
  144. ^ Копп, Р.Э. и Киршвинк, Дж.Л. (2007). «Идентификация и биогеохимическая интерпретация ископаемых магнитотактических бактерий» (PDF) . Обзоры наук о Земле . 86 (1–4): 42–61. Бибкод : 2008ESRv...86...42K . doi : 10.1016/j.earscirev.2007.08.001 .
  145. ^ Чанг, С.Р. и Дж.Л. Киршвинк (1989). «Магнитофоссилии, намагниченность отложений и эволюция биоминерализации магнетита». Ежегодный обзор наук о Земле и планетах . 17 : 169–195. Бибкод : 1989AREPS..17..169C . doi : 10.1146/annurev.ea.17.050189.001125 .
  146. ^ Уолсби А.Е. (1969). «Проницаемость газовакуольных мембран сине-зеленых водорослей для газа». Труды Лондонского королевского общества. Серия Б, Биологические науки . 173 (1031): 235–255. Бибкод : 1969RSPSB.173..235W . дои : 10.1098/rspb.1969.0049 . JSTOR   75817 . ОСЛК   479422015 . S2CID   95321956 .
  147. ^ Каланетра К.М., Хьюстон С.Л., Нельсон, округ Колумбия (декабрь 2004 г.). «Новые прикрепленные сероокисляющие бактерии в неглубоких гидротермальных источниках обладают вакуолями, не участвующими в накоплении нитратов в дыхательных путях» . Прикладная и экологическая микробиология . 70 (12): 7487–96. Бибкод : 2004ApEnM..70.7487K . дои : 10.1128/АЕМ.70.12.7487-7496.2004 . ПМЦ   535177 . ПМИД   15574952 .
  148. ^ Шульц-Фогт Х.Н. (2006). «Вакуоли». Включения у прокариот . Монографии по микробиологии. Том. 1. С. 295–298. дои : 10.1007/3-540-33774-1_10 . ISBN  978-3-540-26205-3 .
  149. ^ Монтанчес, Ичасо; Огаяр, Элизабет; Чума, Андер Эрнандес; Стивен-Кодина, Анна; Гомес-Гарридо, Джессика; Орруньо, Здравствуйте; Арана, Агнес; Кабердин, Владимир Робертович (2019). «Анализ адаптации Vibrio harveyi в микрокосмах морской воды при повышенной температуре дает представление о предполагаемых механизмах его сохранения и распространения во время глобального потепления» . Научные отчеты 9 (1): 289. Бибкод : 2019НацСР... 9..289М дои : 10.1038/ s41598-018-36483-0 ПМК   6343004 . ПМИД   30670759 . S2CID   58950215 .
  150. ^ Макфолл-Нгай, Маргарет; Хит-Хекман, Элизабет AC; Джилетт, Амани А.; Пейер, Сюзанна М.; Харви, Элизабет А. (2012). «Тайные языки совместно развившихся симбиозов: выводы из симбиоза сколопов Euprymna и Vibrio fischeri» . Семинары по иммунологии . 24 (1): 3–8. дои : 10.1016/j.smim.2011.11.006 . ПМК   3288948 . ПМИД   22154556 .
  151. ^ Уотерс, Кристофер М.; Басслер, Бонни Л. (7 октября 2005 г.). «ЗОНДИРОВАНИЕ КВОРУМА: Межклеточная связь у бактерий». Ежегодный обзор клеточной биологии и биологии развития . 21 (1): 319–346. doi : 10.1146/annurev.cellbio.21.012704.131001 . ПМИД   16212498 .
  152. ^ Янг, Р.; Ропер, К. (1976). «Биолюминесцентное затенение у средневодных животных: данные по живым кальмарам». Наука . 191 (4231): 1046–1048. Бибкод : 1976Sci...191.1046Y . дои : 10.1126/science.1251214 . ПМИД   1251214 .
  153. ^ Оуэнс, Ли; Бусико-Сальседо, Нанси (2006). «Vibrio harveyi: Симпатичные проблемы в раю (глава 19)». В Томпсоне, Фабиано; Остин, Брайан; Качели, Джин (ред.). Биология вибрионов . АСМ Пресс.
  154. ^ Делонг, EF; Бежа, О. (2010). «Светоуправляемый протонный насос протеородопсин повышает выживаемость бактерий в трудные времена» . ПЛОС Биология . 8 (4): e1000359. дои : 10.1371/journal.pbio.1000359 . ПМК   2860490 . ПМИД   20436957 . е1000359.
  155. ^ Jump up to: а б Гомес-Консарнау, Л.; Рэйвен, Дж.А.; Левин, Нью-Мексико; Каттер, Л.С.; Ван, Д.; Сигерс, Б.; Аристеги, Ж.; Фурман, Дж. А.; Газоль, Дж. М.; Саньюдо-Вильгельми, SA (2019). «Микробные родопсины вносят основной вклад в солнечную энергию, улавливаемую в море» . Достижения науки . 5 (8): eaaw8855. Бибкод : 2019SciA....5.8855G . doi : 10.1126/sciadv.aaw8855 . ПМЦ   6685716 . ПМИД   31457093 .
  156. ^ Орен, Аарон (2002). «Молекулярная экология чрезвычайно галофильных архей и бактерий» . ФЭМС Микробиология Экология . 39 (1): 1–7. дои : 10.1111/j.1574-6941.2002.tb00900.x . ПМИД   19709178 .
  157. ^ Бежа, О.; Аравинд, Л.; Кунин Е.В.; Сузуки, Монтана; Хадд, А.; Нгуен, LP; Йованович, С.Б.; Гейтс, КМ; Фельдман, РА; Спудич, Дж.Л.; Спудич, Э.Н. (2000). «Бактериальный родопсин: свидетельства нового типа фототрофии в море». Наука . 289 (5486): 1902–1906. Бибкод : 2000Sci...289.1902B . дои : 10.1126/science.289.5486.1902 . ПМИД   10988064 . S2CID   1461255 .
  158. ^ «Интервью с коллегами: Эд Делонг» . Американская академия микробиологии . Архивировано из оригинала 7 августа 2016 года . Проверено 2 июля 2016 г.
  159. ^ Бактерии с батарейками , Popular Science, январь 2001 г., стр. 55.
  160. ^ Бежа, О.; Аравинд, Л.; Кунин Е.В.; Сузуки, Монтана; Хадд, А.; Нгуен, LP; Йованович, С.Б.; Гейтс, КМ; Фельдман, РА; Спудич, Дж.Л.; Спудич, Э.Н. (2000). «Бактериальный родопсин: свидетельства нового типа фототрофии в море». Наука . 289 (5486): 1902–1906. Бибкод : 2000Sci...289.1902B . дои : 10.1126/science.289.5486.1902 . ПМИД   10988064 .
  161. ^ Бёф, Доминик; Аудик, Стефан; Брилье-Геген, Лорейн; Кэрон, Кристоф; Жантон, Кристиан (2015). «MicRhoDE: тщательно подобранная база данных для анализа разнообразия и эволюции микробного родопсина» . База данных . 2015 : bav080. дои : 10.1093/база данных/bav080 . ПМЦ   4539915 . ПМИД   26286928 .
  162. ^ Яво, Хиром; Кандори, Хидеки; Коидзуми, Амане (5 июня 2015 г.). Оптогенетика: светочувствительные белки и их применение . Спрингер. стр. 100-1 3–4. ISBN  978-4-431-55516-2 . Проверено 30 сентября 2015 г.
  163. ^ Крошечный морской микроб может сыграть большую роль в изменении климата Университет Южной Калифорнии , Пресс-центр, 8 августа 2019 г.
  164. ^ ДасСарма, Шиладитья; Швитерман, Эдвард В. (11 октября 2018 г.). «Ранняя эволюция фиолетовых пигментов сетчатки на Земле и значение биосигнатур экзопланеты». Международный журнал астробиологии . 20 (3): 241–250. arXiv : 1810.05150 . дои : 10.1017/S1473550418000423 . ISSN   1473-5504 . S2CID   119341330 .
  165. ^ Спаркс, Уильям Б.; ДасСарма, С.; Рид, Индиана (декабрь 2006 г.). «Эволюционная конкуренция между примитивными фотосинтетическими системами: существование ранней фиолетовой Земли?». Тезисы докладов о заседании Американского астрономического общества . 38 : 901. Бибкод : 2006AAS...209.0605S .
  166. ^ Дэйн Коноп (29 июля 1997 г.). «Ученые обнаружили метановых ледяных червей на дне Мексиканского залива» . Национальное управление океанических и атмосферных исследований . Архивировано из оригинала 9 июня 2010 года . Проверено 22 января 2010 г.
  167. ^ Шарп, Коти Х.; Пратте, Зои А.; Кервин, Эллисон Х.; Ротьян, Рэнди Д.; Стюарт, Фрэнк Дж. (2017). «Структурой микробиома коралла Astrangia poculata умеренного пояса управляет сезон, а не состояние симбионта» . Микробиом . 5 (1): 120. дои : 10.1186/s40168-017-0329-8 . ПМК   5603060 . ПМИД   28915923 .
  168. ^ Лема, К.А., Уиллис, Б.Л. и Борн, Д.Г. (2012) «Кораллы образуют характерные ассоциации с симбиотическими азотфиксирующими бактериями». Прикладная и экологическая микробиология , 78 (9): 3136-3144. два : 10.1128/АЕМ.07800-11 .
  169. ^ Петерсен, Джиллиан М.; Фрэнк У. Зелински; Томас Пейп; Ричард Зейферт; Кристина Морару; и др. (11 августа 2011 г.). «Водород является источником энергии для симбиозов гидротермальных источников». Природа . 476 (7359): 176–180. Бибкод : 2011Natur.476..176P . дои : 10.1038/nature10325 . ПМИД   21833083 . S2CID   25578 . Значок закрытого доступа
  170. ^ Кляйнер, Мануэль; Вентрап, Сесилия; Лотт, Кристиан; Тилинг, Ханно; Ветцель, Силке; Янг, Жак; Чанг, Юн-Хуан; Шах, Манеш; ВерБеркмоэс, Натан К. (8 мая 2012 г.). «Метапротеомика бескишечного морского червя и его симбиотического микробного сообщества открывает необычные пути использования углерода и энергии» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 109 (19): E1173–E1182. дои : 10.1073/pnas.1121198109 . ПМЦ   3358896 . ПМИД   22517752 .
  171. ^ Войке, Таня; Тилинг, Ханно; Иванова Наталья Н.; Хантеманн, Марсель; Рихтер, Майкл; Глекнер, Фрэнк Оливер; Боффелли, Дарио; Андерсон, Иэн Дж.; Барри, Керри В. (26 октября 2006 г.). «Понимание симбиоза посредством метагеномного анализа микробного консорциума» (PDF) . Природа . 443 (7114): 950–955. Бибкод : 2006Natur.443..950W . дои : 10.1038/nature05192 . ПМИД   16980956 . S2CID   140106758 .
  172. ^ Ученые Геологической службы США публикуют давно читаемые последовательности микробиома кораллов умеренного пояса, предоставляя сообществу ресурсы для разработки зондов и праймеров , Геологическая служба США , 6 марта 2019 г. Измененный текст был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  173. ^ б. Голдсмит, Дон; а. Пратте, Зоя; а. Келлог, Кристина; е. Снадер, Сара; час Шарп, Коти (2019). «Стабильность микробиома коралла Astrangia poculata умеренного пояса отражается в различных методологиях секвенирования» . АИМС Микробиология . 5 (1): 62–76. дои : 10.3934/микробиол.2019.1.62 . ПМК   6646935 . ПМИД   31384703 . Измененный текст был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  174. ^ Jump up to: а б Руис-Гонсалес К., Симо Р., Соммаруга Р. и Газоль Дж. М. (2013) «Вдали от темноты: обзор влияния солнечной радиации на активность гетеротрофного бактериопланктона». Границы микробиологии , 4 : 131. два : 10.3389/fmicb.2013.00131 . Измененный текст был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 3.0 .
  175. ^ Уокер, JCG (1980). Круговорот кислорода в природной среде и биогеохимические циклы. Берлин: Springer-Verlag.
  176. ^ Лонгхерст А., Сатиендранат С., Платт Т. и Каверхилл К. (1995). Оценка глобальной первичной продукции в океане по данным спутникового радиометра. Дж. Планктон Рез. 17, 1245–1271.
  177. ^ Jump up to: а б с д и Курата Н., Велла К., Гамильтон Б., Шивджи М., Соловьев А., Мэтт С., Тартар А. и Перри В. (2016) «Бактерии, связанные с поверхностно-активными веществами, в ближайшем будущем». -поверхностный слой океана». Научные отчеты , 6 (1): 1–8. два : 10.1038/srep19123 . Измененный текст был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  178. ^ Хутич В., Чосович Б., Марченко Э., Бихари Н. и Кршинич Ф. (1981) «Производство поверхностно-активных веществ морским фитопланктоном». Морская химия , 10 (6): 505–520. дои : 10.1016/0304-4203(81)90004-9 .
  179. ^ Jump up to: а б Сигел, Дэвид А.; Бюсселер, Кен О.; Беренфельд, Майкл Дж.; Бенитес-Нельсон, Клаудия Р.; Босс, Эммануэль; Бжезинский, Марк А.; Бурд, Адриан; Карлсон, Крейг А.; д'Асаро, Эрик А.; Дони, Скотт С.; Перри, Мэри Дж.; Стэнли, Рэйчел HR; Стейнберг, Дебора К. (2016). «Прогнозирование экспорта и судьбы чистой первичной продукции мирового океана: научный план экспорта» . Границы морской науки . 3 . дои : 10.3389/fmars.2016.00022 . hdl : 1912/8770 . Измененный текст был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  180. ^ Лю Икс, Пань Дж, Лю Ю, Ли М, Гу Дж.Д. (октябрь 2018 г.). «Разнообразие и распространение архей в глобальных эстуарных экосистемах». Наука об общей окружающей среде . 637–638: 349–358. Бибкод : 2018ScTEn.637..349L . doi : 10.1016/j.scitotenv.2018.05.016 . ПМИД   29753224 . S2CID   21697690 .
  181. ^ Кабельо П., Ролдан, доктор медицинских наук, Морено-Вивиан С. (ноябрь 2004 г.). «Редукция нитратов и круговорот азота у архей» . Микробиология . 150 (Часть 11): 3527–46. дои : 10.1099/mic.0.27303-0 . ПМИД   15528644 .
  182. ^ Мехта, член парламента, Баросс Дж.А. (декабрь 2006 г.). «Фиксация азота при 92 градусах Цельсия археями гидротермальных источников». Наука . 314 (5806): 1783–86. Бибкод : 2006Sci...314.1783M . дои : 10.1126/science.1134772 . ПМИД   17170307 . S2CID   84362603 .
  183. ^ Фрэнсис К.А., Беман Дж.М., Кайперс М.М. (май 2007 г.). «Новые процессы и участники азотного цикла: микробная экология анаэробного и архейного окисления аммиака» . Журнал ISME . 1 (1): 19–27. Бибкод : 2007ISMEJ...1...19F . дои : 10.1038/ismej.2007.8 . ПМИД   18043610 .
  184. ^ Кулен М.Дж., Аббас Б., ван Блейсвейк Дж., Хопманс Э.К., Кайперс М.М., Уэйкхэм С.Г., Синнингхе Дамсте Дж.С. и др. (апрель 2007 г.). «Предположительная кренархеота, окисляющая аммиак, в субкислородных водах Черного моря: экологическое исследование всего бассейна с использованием 16S рибосомных и функциональных генов и мембранных липидов». Экологическая микробиология . 9 (4): 1001–16. Бибкод : 2007EnvMi...9.1001C . дои : 10.1111/j.1462-2920.2006.01227.x . HDL : 1912/2034 . ПМИД   17359272 .
  185. ^ Бейкер Б.Дж., Банфилд Дж.Ф. (май 2003 г.). «Микробные сообщества в кислых шахтных дренажах» . ФЭМС Микробиология Экология . 44 (2): 139–52. Бибкод : 2003FEMME..44..139B . дои : 10.1016/S0168-6496(03)00028-X . ПМИД   19719632 .
  186. ^ Шимель Дж. (август 2004 г.). «Игра весов в метановом цикле: от микробной экологии до земного шара» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (34): 12400–01. Бибкод : 2004PNAS..10112400S . дои : 10.1073/pnas.0405075101 . ПМК   515073 . ПМИД   15314221 .

Библиография

[ редактировать ]
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Marine_prokaryotes&oldid=1239859554#Marine_archaea"
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: e806af5ed196741b0883f0dfdfca15dd__1723413360
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/e8/dd/e806af5ed196741b0883f0dfdfca15dd.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Marine prokaryotes - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)