CDC42BPA

CDC42BPA
Идентификаторы
Псевдонимы	CDC42BPA , MRCK, MRCKA, PK428, CDC42-связывающая протеинкиназа альфа
Внешние идентификаторы	Опустить : 603412 ; МГИ : 2441841 ; Гомологен : 55765 ; Генные карты : CDC42BPA ; OMA : CDC42BPA — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 1 (human) Band 1q42.13 Start 226,989,865 bp End 227,318,492 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 1 (mouse) Band 1|1 H4 Start 179,788,037 bp End 179,993,168 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in internal globus pallidus pylorus tibia lateral nuclear group of thalamus secondary oocyte external globus pallidus pars reticulata renal medulla Brodmann area 23 corpus callosum Top expressed in zygote superior frontal gyrus primary visual cortex cerebellar cortex dentate gyrus of hippocampal formation granule cell genital tubercle central gray substance of midbrain neural layer of retina medial geniculate nucleus nucleus of stria terminalis More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function transferase activity nucleotide binding protein serine/threonine kinase activity protein kinase activity protein binding ATP binding magnesium ion binding metal ion binding identical protein binding kinase activity Cellular component cytoplasm actomyosin extracellular exosome cell leading edge cell-cell junction lamellipodium cell projection cytoskeleton Biological process protein phosphorylation actomyosin structure organization intracellular signal transduction cell migration phosphorylation actin cytoskeleton reorganization actin cytoskeleton organization peptidyl-threonine phosphorylation Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 8476 226751 Вместе ENSG00000143776 ENSMUSG00000026490 ЮниПрот Q5VT25 Q3UU96 RefSeq (мРНК) showНМ_003607 НМ_014826 НМ_001366010 НМ_001366011 НМ_001366019 NM_001387550 NM_001394014 showНМ_001033285 НМ_001346804 НМ_001346805 НМ_001359541 НМ_001359542 NM_001359543 NM_001359544 NM_001359545 NM_001359546 NM_001359547 NM_001359548 NM_001359549 RefSeq (белок) НП_003598 НП_055641 НП_001352939 НП_001352940 НП_001352948 showНП_001028457 НП_001333733 НП_001333734 НП_001346470 НП_001346471 NP_001346472 NP_001346473 NP_001346474 NP_001346475 NP_001346476 NP_001346477 NP_001346478 Местоположение (UCSC) Chr 1: 226,99 – 227,32 Мб Chr 1: 179,79 – 179,99 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Серин/треонин-протеинкиназа MRCK-альфа представляет собой фермент , который у человека кодируется CDC42BPA геном .

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства серин /треониновых протеинкиназ. Эта киназа содержит несколько функциональных доменов. Его киназный домен очень похож на домен протеинкиназы миотонической дистрофии (DMPK). Эта киназа также содержит домен интерактивного связывания Rac (CRIB) и, как было показано, связывает CDC42. Он может функционировать как нижестоящий эффектор CDC42, опосредуя индуцированное CDC42 образование периферического актина и способствуя реорганизации цитоскелета . Описано множество альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов, и сообщалось о полноразмерной природе двух из них.

Внешние ссылки

• человека Расположение генома CDC42BPA и CDC42BPA страница сведений о гене в браузере генома UCSC .

Дальнейшее чтение

• Чжао Ю., Лойер П., Ли Х. и др. (1997). «Клонирование и хромосомное расположение нового члена семейства протеинкиназ миотонической дистрофии» . Ж. Биол. Хим . 272 (15): 10013–20. дои : 10.1074/jbc.272.15.10013 . ПМИД   9092543 .
• Люнг Т., Чен XQ, Тан И и др. (1998). «Cdc42-связывающая киназа, связанная с киназой миотонической дистрофии, действует как эффектор Cdc42, способствуя реорганизации цитоскелета» . Мол. Клетка. Биол . 18 (1): 130–40. дои : 10.1128/mcb.18.1.130 . ПМК   121465 . ПМИД   9418861 .
• Секи Н., Охира М., Нагасе Т. и др. (1998). «Характеристика клонов кДНК в фракционированных по размеру библиотеках кДНК из мозга человека» . ДНК Рез . 4 (5): 345–9. дои : 10.1093/dnares/4.5.345 . ПМИД   9455484 .
• Монкрифф К.Л., Бэйли М.Э., Моррисон Н., Джонсон К.Дж. (1999). «Клонирование и хромосомная локализация человеческой Cdc42-связывающей протеинкиназы бета». Геномика . 57 (2): 297–300. дои : 10.1006/geno.1999.5769 . ПМИД   10198171 .
• Эдвардс Д.К., Сандерс Л.К., Бокоч Г.М., Гилл Г.Н. (1999). «Активация LIM-киназы с помощью Pak1 пары Rac/Cdc42 GTPase, передающая сигнал динамике актинового цитоскелета». Нат. Клеточная Биол . 1 (5): 253–9. дои : 10.1038/12963 . ПМИД   10559936 . S2CID   25250183 .
• Охаси К., Нагата К., Маэкава М. и др. (2000). «Rho-ассоциированная киназа ROCK активирует LIM-киназу 1 путем фосфорилирования по треонину 508 внутри петли активации» . Ж. Биол. Хим . 275 (5): 3577–82. дои : 10.1074/jbc.275.5.3577 . ПМИД   10652353 .
• Диас Нето Э., Корреа Р.Г., Верёвски-Алмейда С. и др. (2000). «Секвенирование транскриптома человека с помощью меток последовательности, экспрессируемых ORF» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 97 (7): 3491–6. Бибкод : 2000PNAS...97.3491D . дои : 10.1073/pnas.97.7.3491 . ПМК   16267 . ПМИД   10737800 .
• Накамура Н., Оширо Н., Фуката Ю. и др. (2000). «Фосфорилирование белков ERM в филоподиях, индуцированное Cdc42» . Генные клетки . 5 (7): 571–81. дои : 10.1046/j.1365-2443.2000.00348.x . ПМИД   10947843 . S2CID   10022990 .
• Лам Л.Т., Фам Ю.К., Нгуен Т.М., Моррис Дж.Е. (2000). «Характеристика панели моноклональных антител показывает, что протеинкиназа миотонической дистрофии, DMPK, экспрессируется почти исключительно в мышцах и сердце» . Хм. Мол. Жене . 9 (14): 2167–73. дои : 10.1093/hmg/9.14.2167 . ПМИД   10958655 .
• Тан И, Сеоу К.Т., Лим Л., Люнг Т. (2001). «Межмолекулярные и внутримолекулярные взаимодействия регулируют каталитическую активность Cdc42-связывающей киназы альфа, связанной с киназой миотонической дистрофии» . Мол. Клетка. Биол . 21 (8): 2767–78. дои : 10.1128/MCB.21.8.2767-2778.2001 . ПМК   86907 . ПМИД   11283256 .
• Суми Т., Мацумото К., Сибуя А., Накамура Т. (2001). «Активация киназ LIM с помощью Cdc42-связывающей киназы альфа, связанной с киназой миотонической дистрофии» . Ж. Биол. Хим . 276 (25): 23092–6. дои : 10.1074/jbc.C100196200 . ПМИД   11340065 .
• Лемерсье С., Брокар М.П., ​​Пувион-Дютиль Ф. и др. (2002). «Деацетилазы гистонов класса II напрямую рекрутируются репрессором транскрипции BCL6» . Ж. Биол. Хим . 277 (24): 22045–52. дои : 10.1074/jbc.M201736200 . ПМИД   11929873 .
• Донг Дж.М., Люнг Т., Мансер Э., Лим Л. (2003). «Cdc42 противодействует индуктивному действию цАМФ на форму клеток посредством воздействия Cdc42-связывающей киназы, связанной с киназой миотонической дистрофии (MRCK), на фосфорилирование легкой цепи миозина». Евро. Дж. Клеточная Биол . 81 (4): 231–42. дои : 10.1078/0171-9335-00238 . ПМИД   12018391 .
• Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК   139241 . ПМИД   12477932 .
• Тан И, Чеонг А, Лим Л, Люнг Т (2003). «Геномная организация Cdc42-связывающей киназы альфа, связанной с киназой миотонической дистрофии человека, обнаруживает множественный альтернативный сплайсинг и функциональное разнообразие». Джин . 304 : 107–15. дои : 10.1016/S0378-1119(02)01185-X . ПМИД   12568720 .
• Уилкинсон С., Патерсон Х.Ф., Маршалл С.Дж. (2005). «Передача сигналов Cdc42-MRCK и Rho-ROCK взаимодействует в фосфорилировании миозина и клеточной инвазии». Нат. Клеточная Биол . 7 (3): 255–61. дои : 10.1038/ncb1230 . ПМИД   15723050 . S2CID   34732713 .
• Цмейла Р., Петрак Дж., Цмейлова Дж. (2006). «Новый элемент, реагирующий на железо, в 3'UTR человеческого MRCKalpha». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 341 (1): 158–66. дои : 10.1016/j.bbrc.2005.12.155 . ПМИД   16412980 .
• Грегори С.Г., Барлоу К.Ф., Маклей К.Э. и др. (2006). «Последовательность ДНК и биологическая аннотация хромосомы 1 человека» . Природа . 441 (7091): 315–21. Бибкод : 2006Natur.441..315G . дои : 10.1038/nature04727 . ПМИД   16710414 .
• Лефорт К., Мандинова А., Остано П. и др. (2007). «Notch1 представляет собой ген-мишень p53, участвующий в подавлении опухоли кератиноцитов человека посредством негативной регуляции киназ ROCK1/2 и MRCKalpha» . Генс Дев . 21 (5): 562–77. дои : 10.1101/gad.1484707 . ПМК   1820898 . ПМИД   17344417 .