3-гидрокси-3-метилглутарил-КоА-лиаза

показывать Поиск
PMC	articles
PubMed	articles
NCBI	proteins

Гидроксиметилглутарил-КоА-лиаза
Гидроксиметилглутарил-КоА-лиаза
	Димер лиазы HMG-CoA, человек
Идентификаторы
Номер ЕС.	4.1.3.4
Номер CAS.	9030-83-5
Базы данных
ИнтЭнк	вид IntEnz
БРЕНДА	БРЕНДА запись
Экспаси	Просмотр NiceZyme
КЕГГ	КЕГГ запись
МетаЦик	метаболический путь
ПРЯМОЙ	профиль
PDB Структуры	RCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтология	АмиГО / QuickGO
PMC
показывать Поиск
PMC	articles
PubMed	articles
NCBI	proteins

3-гидрокси-3-метилглутарил-КоА-лиаза
Идентификаторы
Псевдонимы	HMG-CoA_lyaseгидроксиметилглутарил-CoA-лиазаHMG-CoA-лиаза3-гидрокси-3-метилглутарилкофермент A лиаза(S)-3-гидрокси-3-метилглутарил-CoA ацетоацетат-лиаза (ацетил-КоА-образующая)(S)-3-гидрокси-3 -метилглутарил-КоА ацетоацетат-лиаза3-гидрокси-3-метилглутарат-КоА-лиазагидроксиметилглутарилкофермент А-лиаза
Внешние идентификаторы	Генные карты : [1] ; ОМА : - ортологи
hideОртологи
	н/д
	н/д
	н/д
	н/д
	н ; а
	н/д
	н/д
	н/д
	н/д
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека

3-гидроксиметил-3-метилглутарил-коэнзим А лиаза (гидроксиметилглутарикацидурия)

Идентификаторы

Символ

HMGCL

Другие данные

Хр. 1 п36.1-п35

Искать
Structures	Swiss-model
Domains	InterPro

3-Гидрокси-3-метилглутарил-КоА-лиаза (или HMG-CoA- лиаза ) представляет собой фермент ( EC 4.1.3.4 , который у человека кодируется геном HMGCL , расположенным на хромосоме 1 ). Это ключевой фермент в кетогенезе ( кетоновых тел) образовании . ). Это кетогенный фермент в печени, который катализирует образование ацетоацетата из ГМГ-КоА в митохондриях. Он также играет важную роль в катаболизме аминокислоты лейцина.

Структура

Ген HMGCL кодирует белок массой 34,5 кДа, локализованный в митохондриях и пероксисомах . ^{[ 1 ]} известны множественные изоформы белков Благодаря альтернативному сплайсингу . Основная изоформа (изоформа 1) наиболее высоко экспрессируется в печени. ^{[ 1 ]} тогда как изоформа 2 обнаруживается в энергопотребляющих тканях, включая мозг , сердце и скелетные мышцы . ^{[ 2 ]}

Структура белка HMGCL была определена с помощью рентгеновской кристаллографии с разрешением 2,1 Å и показала, что белок может функционировать как димер . Доступ субстрата к активному сайту фермента HMGCL включает связывание субстрата через полость, расположенную на С-конце структуры бета-цилиндра. ^{[ 3 ]} остаток лизина 48, который мутирует у пациентов с дефицитом 3-гидрокси-3-метилглутарил-КоА-лиазы, необходим для связывания субстрата. Кроме того, обнаружено, что ^{[ 4 ]}

Функция

Белок HMGCL играет важную роль в расщеплении пищевых белков и жиров для получения энергии. Он катализирует реакцию:

( S )-3-гидрокси-3-метилглутарил-КоА = ацетил-КоА + ацетоацетат

и требует иона двухвалентного металла в качестве кофактора . ^{[ 5 ]}

Фермент необходим для кетогенеза в печени, а также отвечает за переработку аминокислоты лейцина внутри митохондрий.

Дефицит Дефицит HMG-CoA-лиазы вызывает гипокетотическую гипогликемию, аналогичную той, которая вызывается мутациями HMGCS2, но также приводит к накоплению органических кислот и метаболическому ацидозу из-за изменения метаболизма лейцина. Это расстройство можно ошибочно принять за синдром Рея из-за симптомов рвоты, вялости и судорог.

Клиническое значение

Мутации в HMGCL гене вызывают дефицит 3-гидрокси-3-метилглутарил-КоА-лиазы (HMGCLD), редкое аутосомно-рецессивное врожденное нарушение метаболизма, характеризующееся нарушением кетогенеза и L-лейцина катаболизма . На сегодняшний день более 30 различных мутаций, включая миссенс-мутации различных остатков, связаны с пациентами с HMGCLD в разных семьях и этнических группах. ^{[ 6 ]} HMGCLD обычно проявляется в первый год жизни пациента после периода голодания. Клинические острые симптомы включают рвоту, судороги , метаболический ацидоз , гипокетотическую гипогликемию и летаргию. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

HMGCL взаимодействует сам с собой с образованием гомодимеров и гомотетрамеров . также показано В экспериментах с двумя гибридами дрожжей взаимодействие с DNAJA1 .

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б Ашмарина Л.И., Роберт М.Ф., Элслигер М.А., Митчелл Г.А. (1996). «Характеристика предшественника гидроксиметилглутарил-КоА-лиазы, белка, нацеленного на пероксисомы и митохондрии» . Биохим. Дж . 315 (Часть 1): 71–5. дои : 10.1042/bj3150071 . ПМК 1217198 . ПМИД 8670134 .
^ Пуисак Б, Рамос М, Арнедо М, Менао С, Хиль-Родригес МК, Тереза-Родриго МЭ, Пье А, де Карам ХК, Весселинк Х.Дж., Хименес И., Рамос Ф.Дж., Казальс Н., Гомес-Пуэртас П., Хегардт Ф.Г., Пье Дж (2012). «Характеристика сплайс-вариантов генов, кодирующих митохондриальную HMG-CoA-лиазу человека и HMG-CoA-синтазу, ключевые ферменты киназного пути». Мол. Биол. Представитель . 39 (4): 4777–85. дои : 10.1007/s11033-011-1270-8 . ПМИД 21952825 . S2CID 16280588 .
^ Фу З., Ранквист Дж. А., Монтгомери С., Мизиорко Х. М., Ким Дж. Дж. (2010). «Функциональное понимание человеческой HMG-CoA-лиазы на основе структур ацил-КоА-содержащих тройных комплексов» . Ж. Биол. Хим . 285 (34): 26341–9. дои : 10.1074/jbc.M110.139931 . ПМК 2924059 . ПМИД 20558737 .
^ Карраско П., Менао С., Лопес-Виньяс Э., Санпере Г., Клотет Дж., Сьерра А.Ю., Гратакос Э., Пуисак Б., Гомес-Пуэртас П., Хегардт Ф.Г., Пи Дж., Казальс Н. (2007). «С-конец и аминокислота Lys48 в HMG-CoA-лиазе участвуют в связывании субстрата и активности фермента». Мягкий. Жене. Метаб . 91 (2): 120–7. дои : 10.1016/j.ymgme.2007.03.007 . ПМИД 17459752 .
^ Туинстра Р.Л., Мизиорко Х.М. (2003). «Исследование консервативных кислотных остатков в 3-гидрокси-3-метилглутарил-КоА-лиазе: значение для болезней человека и функциональной роли в семействе родственных белков» . Ж. Биол. Хим . 278 (39): 37092–8. дои : 10.1074/jbc.M304472200 . ПМИД 12874287 .
^ Менао С, Лопес-Виньяс Е, Мир К, Пуисак Б, Гратакос Е, Арнедо М, Карраско П, Морено С, Рамос М, Хиль MC, Пье А, Рибес А, Перес-Серда С, Угарте М, Клейтон П.Т., Корман С.Х., Серра Д., Асинс Г., Рамос Ф.Дж., Гомес-Пуэртас П., Хегардт Ф.Г., Казальс Н., Пье Дж. (2009). «Десять новых мутаций HMGCL у 24 пациентов различного происхождения с 3-гидрокси-3-метил-глутаровой ацидурией» . Человеческая мутация . 30 (3): E520–9. дои : 10.1002/humu.20966 . ПМИД 19177531 . S2CID 2826349 .
^ Интернет-менделевское наследование у человека (OMIM): дефицит 3-гидрокси-3-метилглутарилкоалиазы; HMGCLD - 246450

Внешние ссылки

3-гидрокси-3-метилглутарил-коэнзим + А + лиаза Национальной медицинской библиотеки США в медицинских предметных рубриках (MeSH)

Эта о лиазе статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[auto-1] Jump up to: ^а ^б Ашмарина Л.И., Роберт М.Ф., Элслигер М.А., Митчелл Г.А. (1996). «Характеристика предшественника гидроксиметилглутарил-КоА-лиазы, белка, нацеленного на пероксисомы и митохондрии» . Биохим. Дж . 315 (Часть 1): 71–5. дои : 10.1042/bj3150071 . ПМК 1217198 . ПМИД 8670134 .

[2] Пуисак Б, Рамос М, Арнедо М, Менао С, Хиль-Родригес МК, Тереза-Родриго МЭ, Пье А, де Карам ХК, Весселинк Х.Дж., Хименес И., Рамос Ф.Дж., Казальс Н., Гомес-Пуэртас П., Хегардт Ф.Г., Пье Дж (2012). «Характеристика сплайс-вариантов генов, кодирующих митохондриальную HMG-CoA-лиазу человека и HMG-CoA-синтазу, ключевые ферменты киназного пути». Мол. Биол. Представитель . 39 (4): 4777–85. дои : 10.1007/s11033-011-1270-8 . ПМИД 21952825 . S2CID 16280588 .

[3] Фу З., Ранквист Дж. А., Монтгомери С., Мизиорко Х. М., Ким Дж. Дж. (2010). «Функциональное понимание человеческой HMG-CoA-лиазы на основе структур ацил-КоА-содержащих тройных комплексов» . Ж. Биол. Хим . 285 (34): 26341–9. дои : 10.1074/jbc.M110.139931 . ПМК 2924059 . ПМИД 20558737 .

[4] Карраско П., Менао С., Лопес-Виньяс Э., Санпере Г., Клотет Дж., Сьерра А.Ю., Гратакос Э., Пуисак Б., Гомес-Пуэртас П., Хегардт Ф.Г., Пи Дж., Казальс Н. (2007). «С-конец и аминокислота Lys48 в HMG-CoA-лиазе участвуют в связывании субстрата и активности фермента». Мягкий. Жене. Метаб . 91 (2): 120–7. дои : 10.1016/j.ymgme.2007.03.007 . ПМИД 17459752 .

[5] Туинстра Р.Л., Мизиорко Х.М. (2003). «Исследование консервативных кислотных остатков в 3-гидрокси-3-метилглутарил-КоА-лиазе: значение для болезней человека и функциональной роли в семействе родственных белков» . Ж. Биол. Хим . 278 (39): 37092–8. дои : 10.1074/jbc.M304472200 . ПМИД 12874287 .

[6] Менао С, Лопес-Виньяс Е, Мир К, Пуисак Б, Гратакос Е, Арнедо М, Карраско П, Морено С, Рамос М, Хиль MC, Пье А, Рибес А, Перес-Серда С, Угарте М, Клейтон П.Т., Корман С.Х., Серра Д., Асинс Г., Рамос Ф.Дж., Гомес-Пуэртас П., Хегардт Ф.Г., Казальс Н., Пье Дж. (2009). «Десять новых мутаций HMGCL у 24 пациентов различного происхождения с 3-гидрокси-3-метил-глутаровой ацидурией» . Человеческая мутация . 30 (3): E520–9. дои : 10.1002/humu.20966 . ПМИД 19177531 . S2CID 2826349 .

[7] Интернет-менделевское наследование у человека (OMIM): дефицит 3-гидрокси-3-метилглутарилкоалиазы; HMGCLD - 246450

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

v т и Углерод-углеродные лиазы ( КФ 4.1)
4.1.1: Carboxy-lyases	Acetoacetate decarboxylase Adenosylmethionine decarboxylase Arginine decarboxylase Aromatic L-amino acid decarboxylase Glutamate decarboxylase Histidine decarboxylase Lysine decarboxylase Malonyl-CoA decarboxylase Ornithine decarboxylase Oxaloacetate decarboxylase Phosphoenolpyruvate carboxykinase Phosphoenolpyruvate carboxylase Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase Pyrophosphomevalonate decarboxylase Pyruvate decarboxylase RuBisCO Uridine monophosphate synthetase/Orotidine 5'-phosphate decarboxylase Uroporphyrinogen III decarboxylase
4.1.2: Aldehyde-lyases	Fructose-bisphosphate aldolase Aldolase A Aldolase B Aldolase C 2-hydroxyphytanoyl-CoA lyase Threonine aldolase
4.1.3: Oxo-acid-lyases	Isocitrate lyase 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA lyase
4.1.99: Other	Tryptophanase Photolyase CPD lyase Spore photoproduct lyase

v т и Ферменты
Activity	Active site Binding site Catalytic triad Oxyanion hole Enzyme promiscuity Diffusion-limited enzyme Cofactor Enzyme catalysis
Regulation	Allosteric regulation Cooperativity Enzyme inhibitor Enzyme activator
Classification	EC number Enzyme superfamily Enzyme family List of enzymes
Kinetics	Enzyme kinetics Eadie–Hofstee diagram Hanes–Woolf plot Lineweaver–Burk plot Michaelis–Menten kinetics
Types	EC1 Oxidoreductases (list) EC2 Transferases (list) EC3 Hydrolases (list) EC4 Lyases (list) EC5 Isomerases (list) EC6 Ligases (list) EC7 Translocases (list)