Микробная экология
Микробная экология (или экологическая микробиология ) — это : их экология микроорганизмов взаимоотношения друг с другом и с окружающей средой. Это касается трех основных сфер жизни — эукариот , архей и бактерий , — а также вирусов . [ 2 ]
Микроорганизмы своим вездесущим воздействием оказывают влияние на всю биосферу . Микробная жизнь играет первостепенную роль в регулировании биогеохимических систем практически во всех средах нашей планеты, включая некоторые из самых экстремальных , от замерзшей среды и кислых озер до гидротермальных источников на дне самых глубоких океанов, а также некоторых из наиболее известных, таких как человека как тонкая кишка , нос и рот . [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] Вследствие количественной величины микробной жизни (рассчитанной как 5,0 × 10 30 клетки; на восемь порядков больше, чем количество звезд в наблюдаемой Вселенной. [ 6 ] [ 7 ] ) микробы, только благодаря своей биомассе , представляют собой значительный поглотитель углерода . [ 8 ] Помимо фиксации углерода, ключевые коллективные метаболические процессы микроорганизмов (включая фиксацию азота , фиксацию углерода , метаболизм метана и метаболизм серы ) контролируют глобальный биогеохимический цикл. [ 9 ] Масштабы производства микроорганизмов таковы, что даже при полном отсутствии эукариотической жизни эти процессы, вероятно, продолжались бы без изменений. [ 10 ]
История
[ редактировать ]Хотя микробы изучаются с семнадцатого века, эти исследования велись преимущественно с физиологической, а не экологической точки зрения. [ 11 ] Например, Луи Пастер и его ученики интересовались проблемой распространения микробов как на суше, так и в океане. [ 12 ] Мартинус Бейеринк изобрел накопительную культуру — фундаментальный метод изучения микробов из окружающей среды. Ему часто ошибочно приписывают создание микробной биогеографической идеи о том, что «все есть везде, но среда выбирает», которую высказал Лоренс Баас Бекинг . [ 13 ] Сергей Виноградский был одним из первых исследователей, попытавшихся понять микроорганизмы вне медицинского контекста, что сделало его одним из первых студентов, изучающих микробную экологию и микробиологию окружающей среды, открывших хемосинтез и разработавших колонку Виноградского . в процессе [ 14 ] : 644
Однако Бейеринк и Виндоградский были сосредоточены на физиологии микроорганизмов, а не на их среде обитания или их экологических взаимодействиях. [ 11 ] Современную микробную экологию начали Роберт Хангейт и его коллеги, исследовавшие экосистему рубца . Изучение рубца потребовало от Хангейта разработки методов культивирования анаэробных микробов, а также он впервые применил количественный подход к изучению микробов и их экологической активности, который дифференцировал относительный вклад видов и катаболических путей . [ 11 ]
Прогресс в микробной экологии связан с разработкой новых технологий. Измерение скорости биогеохимических процессов в природе стало возможным благодаря доступности радиоизотопов, начиная с 1950-х годов. Например, 14 CO 2 позволил проанализировать скорость фотосинтеза в океане (ссылка). Еще один значительный прорыв произошел в 1980-х годах, когда были разработаны микроэлектроды, чувствительные к химическим веществам, таким как O2. [ 15 ] Эти электроды имеют пространственное разрешение 50–100 мкм и позволяют анализировать пространственную и временную биогеохимическую динамику в микробных матах и осадках. [ нужна ссылка ]
Хотя измерение скорости биогеохимических процессов могло проанализировать, какие процессы происходят, они были неполными, поскольку не давали информации о том, какие конкретные микробы ответственны за это. Давно было известно, что «классические» методы культивирования позволяют восстановить менее 1% микробов из естественной среды обитания. Однако, начиная с 1990-х годов, был разработан ряд независимых от культивирования методов определения относительной численности микробов в среде обитания. Карл Вёзе первым продемонстрировал, что последовательность молекулы 16S рибосомальной РНК можно использовать для анализа филогенетических взаимоотношений. [ 16 ] Норм Пейс взял эту плодотворную идею и применил ее к анализу «кто там» в естественной среде. Процедура включает в себя (а) выделение нуклеиновых кислот непосредственно из естественной среды, (б) ПЦР-амплификацию последовательностей генов малых субъединиц рРНК, (в) секвенирование ампликонов и (г) сравнение этих последовательностей с базой данных последовательностей из чистых источников. культуры и ДНК окружающей среды. [ 17 ] Это дало огромное представление о разнообразии среды обитания микробов. Однако он не решает, как связать конкретных микробов с их биогеохимической ролью. Метагеномика , секвенирование тотальной ДНК, извлеченной из окружающей среды, может дать представление о биогеохимическом потенциале. [ 18 ] тогда как метатранскриптомика и метапротеомика могут измерить фактическое выражение генетического потенциала, но остаются более сложными с технической точки зрения. [ 19 ]
Роли
[ редактировать ]Микроорганизмы являются основой всех экосистем , но особенно в тех зонах, где фотосинтез невозможен из-за отсутствия света. В таких зонах хемосинтезирующие микробы обеспечивают энергию и углерод другим организмам. Эти хемотрофные организмы также могут функционировать в средах с недостатком кислорода, используя другие акцепторы электронов . для дыхания [ нужна ссылка ]
Другие микробы являются разлагателями и способны перерабатывать питательные вещества из продуктов жизнедеятельности других организмов. Эти микробы играют жизненно важную роль в биогеохимических циклах. [ 20 ] Цикл азота , цикл фосфора , цикл серы и цикл углерода — все они так или иначе зависят от микроорганизмов. Каждый цикл работает вместе, чтобы регулировать микроорганизмы в определенных процессах. [ 21 ] Например, газообразный азот , составляющий 78% атмосферы Земли, недоступен для большинства организмов до тех пор, пока он не будет преобразован в биологически доступную форму в результате микробного процесса фиксации азота . [ 22 ] В отличие от циклов азота и углерода, в цикле фосфора в окружающей среде не создаются стабильные газообразные соединения. Микроорганизмы играют роль в растворении фосфатов, улучшении здоровья почвы и роста растений. [ 23 ]
Из-за высокого уровня горизонтального переноса генов между микробными сообществами [ 24 ] микробная экология также важна для изучения эволюции . [ 25 ]
Эволюция
[ редактировать ]Микробная экология вносит свой вклад в эволюцию во многих частях мира. Например, различные виды микробов развили динамику и функции CRISPR , что позволяет лучше понять здоровье человека. [ 26 ]
Симбиоз
[ редактировать ]Микробы, особенно бактерии, часто вступают в симбиотические отношения ( положительные или отрицательные ) с другими микроорганизмами или более крупными организмами. Несмотря на физически небольшие размеры, симбиотические отношения между микробами играют важную роль в эукариотических процессах и их эволюции. [ 27 ] [ 28 ] Типы симбиотических отношений, в которых участвуют микробы, включают мутуализм , комменсализм , паразитизм , [ 29 ] и аменсализм [ 30 ] которые во многом влияют на экосистему.
мутуализм
[ редактировать ]Мутуализм в микробной экологии — это отношения между видами микробов и людьми, которые позволяют обеим сторонам получать выгоду. [ 31 ] Одним из таких примеров может быть синтрофия , также известная как перекрестное кормление. [ 30 ] которых является Methanobacterium omelianski . классическим примером [ 32 ] [ 33 ] Этот консорциум образован организмом, ферментирующим этанол, и метаногеном . Организм, ферментирующий этанол, снабжает партнера-архей H 2 , который необходим этому метаногену для роста и производства метана. [ 27 ] [ 33 ] Было высказано предположение, что синтрофия играет значительную роль в средах с ограниченным количеством энергии и питательных веществ, таких как глубокие недра, где она может помочь микробному сообществу с разнообразными функциональными свойствами выживать, расти и производить максимальное количество энергии. [ 34 ] [ 35 ] Анаэробное окисление метана (АОМ) осуществляется мутуалистическим консорциумом сульфатредуцирующей бактерии и анаэробной метанокисляющей археи . [ 36 ] [ 37 ] Реакция, используемая бактериальным партнером для производства H 2 , является эндергонической (и, следовательно, термодинамически неблагоприятной), однако в сочетании с реакцией, используемой партнером-архей, общая реакция становится экзергонической . [ 27 ] Таким образом, два организма находятся в мутуалистических отношениях, которые позволяют им расти и процветать в среде, смертельной для любого вида в отдельности. Лишайник является примером симбиотического организма. [ 33 ]
Комменсализм
[ редактировать ]Комменсализм очень распространен в микробном мире и буквально означает «есть за одним столом». [ 38 ] Продукты метаболизма одной микробной популяции используются другой микробной популяцией без какой-либо выгоды или вреда для первой популяции. Существует множество «пар» видов микробов, которые выполняют реакции окисления или восстановления по одному и тому же химическому уравнению. Например, метаногены производят метан путем восстановления CO 2 до CH 4 , а метанотрофы окисляют метан обратно в CO 2 . [ 39 ]
Аменсализм
[ редактировать ]Аменсализм (также широко известный как антагонизм) — это тип симбиотических отношений, при которых одному виду/организму наносится вред, а другой остается незатронутым. [ 31 ] Одним из примеров таких взаимоотношений, которые имеют место в микробной экологии, являются виды микробов Lactobacillus casei и Pseudomonas taetrolens . [ 40 ] При сосуществовании в окружающей среде Pseudomonas taetrolens подавляет рост и снижает выработку лактобионовой кислоты (ее основного продукта), скорее всего, из-за побочных продуктов, образуемых Lactobacillus casei во время производства молочной кислоты. [ 41 ] Однако Lactobacillus casei не демонстрирует никаких различий в своем поведении, и такие отношения можно определить как аменсализм. [ нужна ссылка ]
Управление микробными ресурсами
[ редактировать ]Биотехнология может использоваться наряду с микробной экологией для решения ряда экологических и экономических проблем. Например, молекулярные методы, такие как дактилоскопия сообществ или метагеномика, могут использоваться для отслеживания изменений в микробных сообществах с течением времени или оценки их биоразнообразия . Управление углеродным циклом с целью улавливания углекислого газа и предотвращения избыточного метаногенеза важно для смягчения глобального потепления , а перспективы биоэнергетики расширяются за счет разработки микробных топливных элементов . Управление микробными ресурсами пропагандирует более прогрессивное отношение к болезням , при этом агенты биологического контроля отдают предпочтение попыткам их искоренения. потоки в микробных сообществах . Для реализации потенциала этой области необходимо лучше охарактеризовать [ 42 ] Кроме того, существуют и клинические последствия, поскольку морские микробные симбиозы являются ценным источником существующих и новых противомикробных агентов и, таким образом, предлагают еще одно направление исследований в эволюционной гонке вооружений устойчивости к антибиотикам , что вызывает насущную озабоченность исследователей. [ 43 ]
В искусственной среде и человеческом взаимодействии
[ редактировать ]Микробы существуют во всех помещениях, включая дома, офисы, коммерческие центры и больницы. В 2016 году журнал Microbiome опубликовал сборник различных работ, посвященных микробной экологии искусственной среды . [ 44 ]
Исследование патогенных бактерий, проведенное в больницах в 2006 году, показало, что их способность к выживанию варьируется в зависимости от типа: некоторые выживают всего несколько дней, а другие - месяцы. [ 45 ]
Продолжительность жизни микробов в доме варьируется аналогичным образом. Обычно бактериям и вирусам требуется влажная среда с влажностью более 10 процентов. [ 46 ] E. coli может выжить от нескольких часов до суток. [ 46 ] Бактерии, образующие споры, могут выживать дольше: Staphylococcus aureus потенциально выживает в течение нескольких недель или, в случае Bacillus anthracis , лет. [ 46 ]
Домашние животные могут быть переносчиками бактерий; например, рептилии обычно являются переносчиками сальмонеллы. [ 47 ]
S. aureus особенно распространен и бессимптомно колонизирует около 30% населения; [ 48 ] попытки деколонизации авиаперевозчиков увенчались ограниченным успехом [ 49 ] и обычно включают назальный прием мупироцина и промывание хлоргексидином , возможно, вместе с ванкомицином и котримоксазолом для лечения инфекций кишечника и мочевыводящих путей. [ 50 ]
противомикробные препараты
[ редактировать ]Некоторые металлы, особенно медь , серебро и золото, обладают противомикробными свойствами. Использование противомикробных сенсорных поверхностей из медного сплава — это метод, который начал использоваться в 21 веке для предотвращения передачи бактерий. [ 51 ] [ 52 ] Наночастицы серебра также начали включать в строительные поверхности и ткани, хотя высказывались опасения по поводу потенциальных побочных эффектов крошечных частиц на здоровье человека. [ 53 ] Из-за антимикробных свойств некоторых металлов, такие продукты, как медицинские устройства, изготавливаются с использованием этих металлов. [ 52 ]
См. также
[ редактировать ]- Микробная биогеография
- Микробная петля
- Очерк экологии
- Международное общество микробной экологии
- Журнал ISME
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Гугенгольц, П. (2002). «Изучение прокариотического разнообразия в эпоху генома» . Геномная биология . 3 (2): обзоры0003.обзоры0001. doi : 10.1186/gb-2002-3-2-reviews0003 . ПМК 139013 . ПМИД 11864374 .
- ^ Бартон, Ларри Л.; Нортап, Диана Э. (9 сентября 2011 г.). Микробная экология . Уайли-Блэквелл. Оксфорд: Джон Уайли и сыновья. п. 22. ISBN 978-1-118-01582-7 . Проверено 25 мая 2013 г.
- ^ Боулер, Крис; Карл, Дэвид М.; Колвелл, Рита Р. (2009). «Микробная океанография в море возможностей». Природа . 459 (7244): 180–4. Бибкод : 2009Natur.459..180B . дои : 10.1038/nature08056 . ПМИД 19444203 . S2CID 4426467 .
- ^ Конопка, Аллан (2009). «Что такое экология микробного сообщества?» . Журнал ISME . 3 (11): 1223–30. Бибкод : 2009ISMEJ...3.1223K . дои : 10.1038/ismej.2009.88 . ПМИД 19657372 .
- ^ Хентгес, Дэвид Дж. (1993). «Анаэробная микрофлора организма человека» . Клинические инфекционные болезни . 16 : С175–С180. doi : 10.1093/clinids/16.Supplement_4.S175 . ISSN 1058-4838 . JSTOR 4457097 . ПМИД 8324114 .
- ^ Уитмен, ВБ; Коулман, округ Колумбия; Вибе, WJ (1998). «Прокариоты: невидимое большинство» . Труды Национальной академии наук . 95 (12): 6578–83. Бибкод : 1998PNAS...95.6578W . дои : 10.1073/pnas.95.12.6578 . JSTOR 44981 . ПМК 33863 . ПМИД 9618454 .
- ^ «количество звезд в наблюдаемой Вселенной — Вольфрам|Альфа» . Проверено 22 ноября 2011 г.
- ^ Редди, К. Рамеш; ДеЛон, Рональд Д. (15 июля 2004 г.). Биогеохимия водно-болотных угодий: наука и приложения . Бока-Ратон: Тейлор и Фрэнсис. п. 116. ИСБН 978-0-203-49145-4 . Проверено 25 мая 2013 г.
- ^ Делонг, Эдвард Ф. (2009). «Микробный океан от геномов к биомам» (PDF) . Природа . 459 (7244): 200–6. Бибкод : 2009Natur.459..200D . дои : 10.1038/nature08059 . hdl : 1721.1/69838 . ПМИД 19444206 . S2CID 205216984 .
- ^ Лупп, Клаудия (2009). «Микробная океанография» . Природа . 459 (7244): 179. Бибкод : 2009Natur.459..179L . дои : 10.1038/459179а . ПМИД 19444202 .
- ^ Jump up to: а б с Конопка, А. (2009). «Экология, микробиология». Энциклопедия микробиологии . стр. 91–106. дои : 10.1016/B978-012373944-5.00002-X . ISBN 978-0-12-373944-5 .
- ^ Адлер, Энтони; Дюкер, Эрик (5 апреля 2017 г.). «Когда пастеровская наука вышла в море: рождение морской микробиологии». Журнал истории биологии . 51 (1): 107–133. дои : 10.1007/s10739-017-9477-8 . ISSN 0022-5010 . ПМИД 28382585 . S2CID 22211340 .
- ^ Де Вит, Рутгер; Бувье, Тьерри (2006). « Все есть повсюду, но среда выбирает»; что на самом деле говорили Баас Беккинг и Бейеринк?». Экологическая микробиология . 8 (4): 755–8. Бибкод : 2006EnvMi...8..755D . дои : 10.1111/j.1462-2920.2006.01017.x . ПМИД 16584487 .
- ^ Мэдиган, Майкл Т. (2012). Брока биология микроорганизмов (13-е изд.). Сан-Франциско: Бенджамин Каммингс. ISBN 978-0-321-64963-8 .
- ^ Ревсбех, Нильс Петер; Йоргенсен, Бо Баркер (1986), «Микроэлектроды: их использование в микробной экологии», в Маршалле, К.К. (редактор), « Достижения в микробной экологии» , том. 9, Бостон, Массачусетс: Springer US, стр. 293–352, doi : 10.1007/978-1-4757-0611-6_7 , ISBN. 978-1-4757-0613-0 , получено 21 сентября 2020 г.
- ^ Вёзе, Карл Р.; Фокс, Джордж Э. (15 ноября 1977 г.). «Филогенетическая структура прокариотической области: первичные царства» . Труды Национальной академии наук . 74 (11): 5088–5090. Бибкод : 1977PNAS...74.5088W . дои : 10.1073/pnas.74.11.5088 . ISSN 0027-8424 . ПМК 432104 . ПМИД 270744 .
- ^ Хьюгерт, Луиза В.; Андерссон, Андерс Ф. (2017). «Анализ состава микробного сообщества посредством секвенирования ампликонов: от отбора проб до проверки гипотез» . Границы микробиологии . 8 : 1561. дои : 10.3389/fmicb.2017.01561 . ISSN 1664-302X . ПМЦ 5591341 . ПМИД 28928718 .
- ^ Нью, Фелиция Н.; Брито, Илана Л. (8 сентября 2020 г.). «Чему нас учит метагеномика и что упускается из виду?» . Ежегодный обзор микробиологии . 74 (1): 117–135. doi : 10.1146/annurev-micro-012520-072314 . ISSN 0066-4227 . ПМИД 32603623 . S2CID 220282070 .
- ^ Шакья, Мигун; Ло, Чиен-Чи; Цепочка, Патрик С.Г. (2019). «Достижения и проблемы метатранскриптомного анализа» . Границы генетики . 10 : 904. дои : 10.3389/fgene.2019.00904 . ISSN 1664-8021 . ПМК 6774269 . ПМИД 31608125 .
- ^ Фенчел, Том; Блэкберн, Генри; Кинг, Гэри М. (24 июля 2012 г.). Бактериальная биогеохимия: экофизиология круговорота минералов (3-е изд.). Бостон, Массачусетс: Academic Press/Elsevier. п. 3. ISBN 978-0-12-415974-7 . Проверено 25 мая 2013 г.
- ^ Ли, Вэньцзин; Ван, Цзиньлун; Цзян, Ламей; Льв, Гуанхуэй; Ху, Донг; Ву, Деян; Ян, Сяодун (1 марта 2023 г.). «Эффект ризосферы и ограничение воды совместно определили роль микроорганизмов в круговороте фосфора в почве в засушливых пустынных регионах» . КАТЕНА . 222 : 106809. Бибкод : 2023Caten.22206809L . дои : 10.1016/j.catena.2022.106809 . ISSN 0341-8162 . S2CID 256786335 .
- ^ Делвич, CC (1970). «Азотный цикл» . Научный американец . 223 (3): 136–147. Бибкод : 1970SciAm.223c.136D . doi : 10.1038/scientificamerican0970-136 . ISSN 0036-8733 . JSTOR 24925899 . ПМИД 5459723 . S2CID 201233849 .
- ^ Тянь, Цзян; Ге, Фэй; Чжан, Дайи; Дэн, Сунцян; Лю, Синван (17 февраля 2021 г.). «Роль микроорганизмов, солюбилизирующих фосфат, от управления дефицитом фосфора в почве до опосредования биогеохимического цикла P» . Биология . 10 (2): 158. doi : 10.3390/biology10020158 . ISSN 2079-7737 . ПМЦ 7922199 . ПМИД 33671192 .
- ^ МакДэниел, LD; Янг, Э.; Делани, Дж.; Рунау, Ф.; Ричи, КБ; Пол, Дж. Х. (2010). «Высокая частота горизонтального переноса генов в океанах». Наука . 330 (6000): 50. Бибкод : 2010Sci...330...50M . дои : 10.1126/science.1192243 . ПМИД 20929803 . S2CID 45402114 .
- ^ Сметс, Барт Ф.; Баркай, Тамар (2005). «Горизонтальный перенос генов: перспективы на стыке научных дисциплин». Обзоры природы Микробиология . 3 (9): 675–8. дои : 10.1038/nrmicro1253 . ПМИД 16145755 . S2CID 2265315 .
- ^ Вестра, Эдзе Р.; ван Хаут, Стинеке; Гандон, Сильвен; Уитакер, Рэйчел (2019). «Экология и эволюция микробных CRISPR-Cas адаптивных иммунных систем» . Философские труды: Биологические науки . 374 (1772): 1–8. дои : 10.1098/rstb.2019.0101 . ISSN 0962-8436 . JSTOR 26643687 . ПМК 6452260 . ПМИД 30905294 . S2CID 85501449 .
- ^ Jump up to: а б с Кирчман, Дэвид Л. (2012). Процессы в микробной экологии . Оксфорд: Издательство Оксфордского университета. ISBN 978-0-19-958693-6 . OCLC 777261246 .
- ^ Лопес-Гарсия, «Очищение»; Мать, Лора; Морейра, Дэвид (7 декабря 2017 г.). «Симбиоз в эволюции эукариот» . Журнал теоретической биологии . Происхождение митозирующих клеток: 50-летие классической статьи Линн Саган (Маргулис). 434 (Приложение C): 20–33. Бибкод : 2017JThBi.434...20L . дои : 10.1016/j.jtbi.2017.02.031 . ПМК 5638015 . ПМИД 28254477 .
- ^ Краснер, Роберт И. (2010). Микробная проблема: наука, болезни и общественное здравоохранение (2-е изд.). Садбери, Массачусетс: Издательство Jones and Bartlett. ISBN 978-0-7637-5689-5 . OCLC 317664342 .
- ^ Jump up to: а б Фауст, Каролина; Раес, Йерун (16 июля 2012 г.). «Микробные взаимодействия: от сетей к моделям». Обзоры природы. Микробиология . 10 (8): 538–550. дои : 10.1038/nrmicro2832 . ПМИД 22796884 . S2CID 22872711 .
- ^ Jump up to: а б Шила, Шривастава (2003). Понимание бактерий . Шривастава, П.С. (Прем С.). Дордрехт: Kluwer Academic Publishers. ISBN 978-1-4020-1633-2 . OCLC 53231924 .
- ^ Брайант, член парламента; Волин, Э.А.; Волин, MJ; Вулф, Р.С. (1967). «Methanobacillus omelianski, симбиотическая ассоциация двух видов бактерий». Архив микробиологии . 59 (1–3): 20–31. дои : 10.1007/bf00406313 . ISSN 0302-8933 . ПМИД 5602458 . S2CID 10348127 .
- ^ Jump up to: а б с Лопес-Гарсия, «Очищение»; Мать, Лора; Морейра, Дэвид (декабрь 2017 г.). «Симбиоз в эволюции эукариот» . Журнал теоретической биологии . Происхождение митозирующих клеток: 50-летие классической статьи Линн Саган (Маргулис). 434 (Приложение C): 20–33. Бибкод : 2017JThBi.434...20L . дои : 10.1016/j.jtbi.2017.02.031 . ПМК 5638015 . ПМИД 28254477 .
- ^ Лау, Мэгги Сай; Кифт, Томас Л.; Кулойо, Олукайоде; Линаж-Альварес, Борха; ван Херден, Эста; Линдси, Мелоди Р.; Магнабоско, Кара; Ван, Вэй; Виггинс, Джессика Б.; Го, Линг; Перлман, Дэвид Х. (6 декабря 2016 г.). «В олиготрофном глубоко недрах сообщества, зависящем от синтрофии, доминируют автотрофные денитрификаторы, управляемые серой» . Труды Национальной академии наук . 113 (49): E7927–E7936. Бибкод : 2016PNAS..113E7927L . дои : 10.1073/pnas.1612244113 . ISSN 0027-8424 . ПМК 5150411 . ПМИД 27872277 .
- ^ Шинк, Бернхард; Стамс, Альфонс Дж. М. (2013), «Синтрофизм среди прокариотов» , «Прокариоты» , Springer Berlin Heidelberg, стр. 471–493, doi : 10.1007/978-3-642-30123-0_59 , ISBN 978-3-642-30122-3
- ^ Боэций, Антье; Равеншлаг, Кэтрин; Шуберт, Карстен Дж.; Рикерт, Дирк; Виддель, Фридрих; Гизеке, Армин; Аманн, Рудольф; Йоргенсен, Бо Баркер; Витте, Урсула; Пфанкуче, Олаф (октябрь 2000 г.). «Морской микробный консорциум, очевидно, опосредующий анаэробное окисление метана». Природа 407 (6804): 623–626. Бибкод : 2000Nature.407..623B . дои : 10.1038/35036572 . ISSN 0028-0836 . ПМИД 11034209 . S2CID 205009562 .
- ^ Рагобарсинг, Ашна А.; Пол, Арьян; ван де Пас-Шоонен, Катинка Т.; Смолдерс, Альфонс Дж. П.; Эттвиг, Катарина Ф.; Рийпстра, В. Ирен К.; Схоутен, Стефан; Дамсте, Яап С. Синнингхе; Оп ден Кэмп, Хууб Дж.М.; Джеттен, Майк С.М.; Строус, Марк (апрель 2006 г.). «Микробный консорциум сочетает анаэробное окисление метана с денитрификацией» (PDF) . Природа . 440 (7086): 918–921. Стартовый код : 2006Natur.440..918R . дои : 10.1038/nature04617 . hdl : 1874/22552 . ISSN 0028-0836 . ПМИД 16612380 . S2CID 4413069 .
- ^ Богитш, Бертон Дж.; Картер, Клинт Э.; Ольтманн, Томас Н. (2013), «Симбиоз и паразитизм», Паразитология человека , Elsevier, стр. 1–13, doi : 10.1016/b978-0-12-415915-0.00001-7 , ISBN 978-0-12-415915-0 , S2CID 88750087
- ^ Кэнфилд, Дональд Э.; Эрик Кристенсен; Бо Тамдруп (2005), «Структура и рост микробных популяций», « Достижения в морской биологии » , Elsevier, стр. 23–64, doi : 10.1016/s0065-2881(05)48002-5 , ISBN 978-0-12-026147-5
- ^ Гарсиа, Кристина; Рендуэлес, Мануэль; Диас, Марио (сентябрь 2017 г.). «Синбиотическая ферментация для совместного производства молочной и лактобионовой кислот из остаточной молочной сыворотки». Биотехнологический прогресс . 33 (5): 1250–1256. дои : 10.1002/btpr.2507 . ПМИД 28556559 . S2CID 23694837 .
- ^ Краснер, Роберт И. (2010). Микробная проблема: наука, болезни и общественное здравоохранение (2-е изд.). Садбери, Массачусетс: Издательство Jones and Bartlett. ISBN 978-0-7637-5689-5 . OCLC 317664342 .
- ^ Верстраете, Вилли (2007). «Микробная экология и экологическая биотехнология» . Журнал ISME . 1 (1): 4–8. Бибкод : 2007ISMEJ...1....4В . дои : 10.1038/ismej.2007.7 . ПМИД 18043608 .
- ^ Отт, Дж. (2005). Морские микробные тиотрофные эктосимбиозы . Океанография и морская биология: Ежегодный обзор. Том. 42. С. 95–118. ISBN 978-0-203-50781-0 .
- ^ «Микробиология искусственной среды» . www.biomedcentral.com . Проверено 18 сентября 2016 г.
- ^ Крамер, Аксель; Швебке, Ингеборг; Кампф, Гюнтер (16 августа 2006 г.). «Как долго внутрибольничные патогены сохраняются на неодушевленных поверхностях? Систематический обзор» . БМК Инфекционные болезни . 6 (1): 130. дои : 10.1186/1471-2334-6-130 . ПМК 1564025 . ПМИД 16914034 .
- ^ Jump up to: а б с «Как долго микробы, такие как бактерии и вирусы, живут на поверхностях дома при нормальной комнатной температуре?» . 23 августа 2002 года . Проверено 18 сентября 2016 г.
- ^ «Сырое питание связано с сальмонеллой» . 9 июня 2009 года . Проверено 18 сентября 2016 г.
- ^ Тонг С.Ю.; Дэвис Дж.С.; Эйхенбергер Э; Голландия ТЛ; Фаулер В.Г. (июль 2015 г.). «Инфекции, вызванные золотистым стафилококком: эпидемиология, патофизиология, клинические проявления и лечение» . Обзоры клинической микробиологии . 28 (3): 603–661. дои : 10.1128/CMR.00134-14 . ПМЦ 4451395 . ПМИД 26016486 .
- ^ «Множество факторов, участвующих в деколонизации S. aureus» . www.healio.com . Проверено 18 сентября 2016 г.
- ^ Бюльманн, М.; Фрей, Р.; Феннер, Л.; Дангель, М.; Флюкигер, У.; Видмер, А.Ф. (1 июня 2008 г.). «Высокоэффективная схема деколонизации метициллин-резистентных носителей золотистого стафилококка» (PDF) . Инфекционный контроль и госпитальная эпидемиология . 29 (6): 510–516. дои : 10.1086/588201 . ПМИД 18510460 . S2CID 34294193 .
- ^ «Суперэлемент, борющийся с бактериями, возвращается в больницы: медь» . Вашингтон Пост . Проверено 18 сентября 2016 г.
- ^ Jump up to: а б Эванс, Андрис; Кавана, Кевин А. (7 мая 2021 г.). «Оценка антимикробных соединений на основе металлов для лечения бактериальных патогенов» . Журнал медицинской микробиологии . 70 (5): 001363. doi : 10.1099/jmm.0.001363 . ISSN 0022-2615 . ПМК 8289199 . ПМИД 33961541 .
- ^ «Наночастицы серебра убивают микробы и вызывают проблемы со здоровьем» . Проверено 18 сентября 2016 г.