Фармакогеномика

Информацию о журнале см. в разделе «Фармакогеномика» (журнал) .

Фармакогеномика , часто сокращенно «PGx», представляет собой исследование роли генома в реакции на лекарство . Ее название ( фармако- + геномика ) отражает сочетание фармакологии и геномики . Фармакогеномика анализирует, как генетический состав пациента влияет на его реакцию на лекарства. Он рассматривает влияние приобретенных и унаследованных генетических вариаций на реакцию на лекарство путем корреляции мутаций ДНК (включая точечные мутации , вариации числа копий и структурные вариации ) с фармакокинетическими ( абсорбция , распределение , метаболизм и выведение лекарственного средства ), фармакодинамическими (эффекты, опосредованные лекарственным средством препарата ). через биологические мишени ) и/или иммуногенные конечные точки.

Целью фармакогеномики является разработка рациональных средств оптимизации лекарственной терапии пациентов с учетом генотипа для достижения максимальной эффективности при минимальных побочных эффектах . Есть надежда, что с помощью фармакогеномики фармацевтические методы лечения лекарств смогут отклониться от так называемого подхода «одна доза подходит всем». Фармакогеномика также пытается исключить метод проб и ошибок при назначении лекарств, позволяя врачам принимать во внимание гены своего пациента, функциональность этих генов и то, как это может повлиять на эффективность текущего или будущего лечения пациента (и, где это применимо, предоставлять объяснение неэффективности предыдущего лечения). Такие подходы обещают появление точной медицины и даже персонализированной медицины , в которой лекарства и комбинации лекарств оптимизированы для узких групп пациентов или даже для уникального генетического состава каждого человека.

Независимо от того, используется ли он для объяснения реакции пациента (или его отсутствия) на лечение или в качестве прогностического инструмента, он надеется достичь лучших результатов лечения и большей эффективности, а также снизить токсичность лекарств и побочные реакции на лекарства (НЛР). Пациентам, которые не реагируют на лечение, могут быть назначены альтернативные методы лечения, которые лучше всего соответствуют их потребностям. Чтобы предоставить фармакогеномические рекомендации для данного лекарственного средства, можно использовать два возможных типа входных данных: генотипирование , экзомное или полногеномное секвенирование . Секвенирование дает гораздо больше данных, включая обнаружение мутаций, которые преждевременно прекращают синтез синтезируемого белка (ранний стоп-кодон ).

Фармакогенетика против фармакогеномики

Термин фармакогеномика часто используется как синоним фармакогенетики . Хотя оба термина относятся к реакции на лекарство, основанной на генетических влияниях, между ними существуют различия. Фармакогенетика ограничена моногенными фенотипами (т.е. взаимодействиями одного гена с лекарственным средством). Фармакогеномика относится к полигенным фенотипам реакции на лекарственные средства и включает транскриптомику , протеомику и метаболомику .

Механизмы фармакогенетических взаимодействий

Фармакокинетика

Фармакокинетика включает в себя всасывание, распределение, метаболизм и выведение фармацевтических препаратов. Этим процессам часто способствуют такие ферменты, как переносчики лекарств или ферменты, метаболизирующие лекарства (подробно обсуждаются ниже). Вариации в локусах ДНК, ответственных за выработку этих ферментов, могут изменить их экспрессию или активность так, что изменится их функциональный статус. Увеличение, уменьшение или потеря функции транспортеров или метаболизирующих ферментов может в конечном итоге изменить количество лекарства в организме и в месте действия. лекарства Это может привести к отклонению от терапевтического окна и привести либо к токсичности, либо к потере эффективности.

Ферменты, метаболизирующие лекарства

Большинство клинически значимых фармакогенетических вариаций происходит в генах, которые кодируют ферменты, метаболизирующие лекарственные средства, включая те, которые участвуют в метаболизме как фазы I , так и фазы II . Семейство ферментов цитохрома P450 отвечает за метаболизм 70-80% всех лекарств, используемых в клинической практике. CYP3A4 , CYP2C9 , CYP2C19 и CYP2D6 являются основными ферментами CYP, участвующими в метаболизме лекарств, и все они известны своей высокой полиморфностью. Дополнительные ферменты, метаболизирующие лекарственные средства, которые участвуют в фармакогенетических взаимодействиях, включают UGT1A1 ( UDP-глюкуронозилтрансфераза ), DPYD и TPMT .

Транспортеры наркотиков

Многие лекарства используют транспортеры, которые пересекают клеточные мембраны и перемещаются между жидкостями организма, такими как кровь, просвет кишечника, желчь, моча, мозг и спинномозговая жидкость. К основным переносчикам относятся переносчики растворенных веществ , АТФ-связывающая кассета и переносчики органических анионов . Транспортеры, которые, как было показано, влияют на реакцию на лекарства, включают OATP1B1 ( SLCO1B1 ) и белок устойчивости к раку молочной железы (BCRP) ( ABCG2 ).

Фармакодинамика

Фармакодинамика относится к влиянию лекарства на организм или механизму его действия.

Цели по наркотикам

Мишенью лекарства являются конкретные места, где лекарство осуществляет свою фармакологическую активность. Взаимодействие между лекарственным средством и этим сайтом приводит к модификации мишени, которая может включать ингибирование или потенцирование. Большинство фармакогенетических взаимодействий, в которых участвуют лекарственные средства, находятся в области онкологии и включают таргетную терапию, предназначенную для устранения соматических мутаций (см. также «Фармакогеномика рака» ). Например, EGFR, ингибиторы такие как гефитиниб (Иресса) или эрлотиниб (Тарцева), показаны только пациентам со специфическими мутациями EGFR .

Зародышевые мутации в мишенях лекарств также могут влиять на реакцию на лекарства, хотя это новая область фармакогеномики. Одним из хорошо известных взаимодействий генов и лекарств, включающих мутацию зародышевой линии в мишень лекарства, является варфарин (кумадин) и VKORC1 , который кодирует эпоксидредуктазу витамина К (VKOR) . Варфарин связывается и ингибирует VKOR, который является важным ферментом в цикле витамина К. Ингибирование ВКОР предотвращает снижение уровня витамина К , который является кофактором, необходимым для образования свертывания крови факторов II , VII , IX и X а также ингибиторов белков C и S. ,

Нецелевые сайты

Лекарства могут иметь нецелевые эффекты (обычно неблагоприятные), которые возникают в результате взаимодействия между лекарством и/или его метаболитами и сайтом, отличным от предполагаемой мишени. Генетические вариации нецелевых сайтов могут влиять на это взаимодействие. Основным примером такого типа фармакогеномного взаимодействия является глюкозо-6-фосфатдегидрогеназа (Г6ФД) . G6PD — это фермент, участвующий в первом этапе пентозофосфатного пути , который генерирует НАДФН (из НАДФ). НАДФН необходим для производства восстановленного глутатиона в эритроцитах и ​​необходим для функции каталазы . Глутатион и каталаза защищают клетки от окислительного стресса, который в противном случае привел бы к лизису клеток . Определенные варианты G6PD приводят к дефициту G6PD , при котором клетки более восприимчивы к окислительному стрессу. Когда лекарства, обладающие значительным окислительным эффектом, назначаются лицам с дефицитом G6PD, они подвергаются повышенному риску лизиса эритроцитов, который проявляется как гемолитическая анемия .

Иммунологический

Система человеческого лейкоцитарного антигена (HLA), также называемая главным комплексом гистосовместимости (MHC), представляет собой комплекс генов, важных для адаптивной иммунной системы . Мутации в комплексе HLA связаны с повышенным риском развития реакций гиперчувствительности в ответ на некоторые лекарства.

Ресурсы по клинической фармакогеномике

Консорциум по внедрению клинической фармакогенетики (CPIC)

Консорциум по внедрению клинической фармакогенетики (CPIC) — это «международный консорциум отдельных добровольцев и небольшого преданного своему делу персонала, которые заинтересованы в облегчении использования фармакогенетических тестов для ухода за пациентами. Цель CPIC — устранить препятствия на пути клинического внедрения фармакогенетических тестов путем создания и курирования и размещение в свободном доступе, рецензируемых, основанных на фактических данных, обновляемых и подробных руководств по клинической практике генов/лекарств, соответствующих стандартизированным руководствам CPIC. форматы, включают систематическую классификацию доказательств и клинические рекомендации, используют стандартизированную терминологию, рецензируются и публикуются в журнале (в партнерстве с Clinical Pharmacology and Therapeutics) с одновременной публикацией на cpicpgx.org, где они регулярно обновляются».

Рекомендации CPIC «призваны помочь клиницистам понять, КАК доступные результаты генетических тестов следует использовать для оптимизации лекарственной терапии, а не то, следует ли назначать тесты. Ключевое предположение, лежащее в основе рекомендаций CPIC, заключается в том, что клинические высокопроизводительные и упреждающие генотипирование по рецепту станет более распространенным, и клиницисты столкнутся с необходимостью иметь в наличии генотипы пациентов, даже если они явно не заказывали тест с учетом рекомендаций и процессов CPIC. и проекты были одобрены несколькими профессиональными обществами».

Управление по контролю за продуктами и лекарствами США

Таблица фармакогенетических ассоциаций

В феврале 2020 года FDA опубликовало Таблицу фармакогенетических ассоциаций. Что касается пар ген-лекарство, включенных в таблицу, «FDA провело оценку и полагает, что имеется достаточно научных данных, позволяющих предположить, что подгруппы пациентов с определенными генетическими вариантами или фенотипами, обусловленными генетическими вариантами (например, затронутая подгруппа в таблице ниже) , вероятно, приводят к изменению метаболизма лекарств и, в некоторых случаях, к различным терапевтическим эффектам, включая различия в рисках побочных эффектов».

«Информация в этой таблице предназначена в первую очередь для лиц, назначающих лекарства, и пациентам не следует корректировать свои лекарства без консультации со своим врачом. Эта версия таблицы ограничена фармакогенетическим ассоциациями, которые связаны с вариантами генов ферментов, метаболизирующих лекарства, вариантами генов-переносчиков лекарств и варианты генов, которые связаны с предрасположенностью к определенным нежелательным явлениям. FDA признает, что существуют различные другие фармакогенетические ассоциации, которые не перечислены здесь, и эта таблица будет периодически обновляться дополнительными фармакогенетическим ассоциациями, подтвержденными достаточными научными данными».

Таблица фармакогеномных биомаркеров в маркировке лекарственных средств

В Таблице фармакогеномных биомаркеров FDA в маркировке лекарств перечислены одобренные FDA лекарства, фармакогеномная информация которых содержится в маркировке лекарств. «Биомаркеры в таблице включают, помимо прочего, варианты зародышевого или соматического гена (полиморфизмы, мутации), функциональные недостатки генетической этиологии, различия в экспрессии генов и хромосомные аномалии; также выбраны белковые биомаркеры, которые используются для выбора лечения пациентов. включено».

ФармГКБ

База знаний по фармакогеномике (PharmGKB) — это « ресурс, финансируемый НИЗ , который предоставляет информацию о том, как генетические вариации человека влияют на реакцию на лекарства. PharmGKB собирает, курирует и распространяет знания о клинически действенных связях генов и лекарств и отношениях генотип-фенотип».

Коммерческие лаборатории фармакогенетических испытаний

Во всем мире существует множество коммерческих лабораторий, которые предлагают фармакогеномное тестирование в виде лабораторно разработанного теста (LDT) . Предлагаемые тесты могут значительно различаться в разных лабораториях, включая проверяемые гены и аллели, определение фенотипа и любые предоставленные клинические аннотации. За исключением нескольких тестов, предназначенных непосредственно для потребителя, все фармакогенетические исследования требуют назначения уполномоченного медицинского работника. Чтобы результаты можно было использовать в клинических условиях в США , лаборатория, проводящая тест, должна быть сертифицирована CLIA . Другие правила могут различаться в зависимости от страны и штата.

Окончательные согласованные условия относительно функционального статуса и фенотипа аллелей

Фармакогенетическое тестирование непосредственно потребителю

Фармакогенетические тесты , ориентированные непосредственно на потребителя (DTC), позволяют потребителям пройти фармакогенетическое тестирование без заказа от врача, назначающего препарат. Фармакогенетические тесты DTC обычно проверяются FDA для определения обоснованности заявлений об испытаниях. FDA ведет генетических тестов DTC список одобренных .

Общая фармакогеномно-специфическая номенклатура

Генотип

Существует несколько способов представления фармакогеномного генотипа . Обычно используемая система номенклатуры заключается в сообщении гаплотипов с использованием звездочки (*) аллеля (например, CYP2C19 *1/*2). Однонуклеотидные полиморфизмы (SNP) могут быть описаны с использованием идентификатора их эталонного кластера SNP (rsID) или на основе местоположения затронутой пары оснований или аминокислоты .

Фенотип

В 2017 году CPIC опубликовала результаты экспертного опроса по стандартизации терминов, связанных с результатами клинических фармакогенетических испытаний. Был достигнут консенсус в отношении терминов, описывающих функциональный статус аллелей, фенотип для ферментов, метаболизирующих лекарства, фенотип для переносчиков лекарств и фенотип для статуса генотипа высокого риска.

Приложения

В приведенном ниже списке представлены еще несколько широко известных применений фармакогеномики:

• Повысить безопасность лекарств и снизить риск побочных эффектов;
• Адаптировать лечение с учетом уникальной генетической предрасположенности пациентов, определяя оптимальную дозировку;
• Улучшить открытие лекарств, направленных на борьбу с болезнями человека; и
• Улучшите доказательство принципа для испытаний эффективности.

Фармакогеномика может применяться в нескольких областях медицины, включая обезболивание , кардиологию , онкологию и психиатрию . также может найтись место В судебно-медицинской патологии , где фармакогеномика может использоваться для определения причины смерти в случаях смерти, связанной с наркотиками, когда результаты аутопсии не выявляются .

При лечении рака фармакогеномические тесты используются для определения того, какие пациенты с наибольшей вероятностью будут реагировать на определенные противораковые препараты . В области поведенческого здоровья фармакогеномные тесты предоставляют врачам и лицам, осуществляющим уход, инструменты, позволяющие лучше управлять выбором лекарств и уменьшать побочные эффекты. Фармакогеномика также известна как сопутствующая диагностика, то есть тесты, связанные с лекарствами. Примеры включают KRAS тест с цетуксимабом и EGFR тест с гефитинибом . Помимо эффективности, фармакогенетика зародышевой линии может помочь идентифицировать пациентов, которые могут подвергнуться тяжелой токсичности при приеме цитотоксических препаратов, демонстрирующих нарушение детоксикации в связи с генетическим полиморфизмом, таких как канонический 5-ФУ. В частности, генетические нарушения, затрагивающие гены, кодирующие DPD , UGT1A1 , TPMT , CDA и CYP2D6, теперь считаются критическими проблемами для пациентов, получающих лечение 5-ФУ/капецитабином, иринотеканом, меркаптопурином/азатиоприном, гемцитабином/капецитабином/AraC и тамоксифеном соответственно.

При сердечно-сосудистых заболеваниях основной проблемой является реакция на лекарства, включая варфарин , клопидогрел , бета-блокаторы и статины . У пациентов с CYP2C19, принимающих клопидогрел, повышен сердечно-сосудистый риск, что приводит к обновлению инструкций к лекарству со стороны регулирующих органов. У пациентов с 2 типа диабетом генотипирование гаптоглобина (Hp) оказывает влияние на сердечно-сосудистые заболевания, при этом Hp2-2 подвергается более высокому риску, а дополнительный прием витамина Е снижает риск, влияя на ЛПВП .

В психиатрии по состоянию на 2010 год исследования были сосредоточены, в частности, на 5-HTTLPR и DRD2 .

Клиническая реализация

Дополнительная информация: Образование в области персонализированной медицины.

Инициативы по стимулированию внедрения клиницистами включают программу «Повсеместная фармакогеномика» (U-PGx) в Европе и Консорциум по внедрению клинической фармакогенетики (CPIC) в США. По данным опроса европейских врачей, проведенного в 2017 году, в предыдущем году две трети не заказывали фармакогенетический тест.

В 2010 году Медицинский центр Университета Вандербильта запустил Фармакогеномный ресурс для принятия более эффективных решений в области ухода и лечения (PREDICT); в опросе 2015 года две трети врачей заказали фармакогенетический тест.

В 2019 году крупнейшая частная медицинская страховая компания UnitedHealthcare объявила, что будет платить за генетическое тестирование для прогнозирования реакции на психиатрические препараты.

В 2020 году , четвертая по величине страховая компания в Канаде , занимающаяся медицинским и стоматологическим страхованием Green Shield Canada , объявила, что оплатит фармакогенетическое тестирование и связанное с ним программное обеспечение для поддержки клинических решений для оптимизации и персонализации рецептов в области психического здоровья.

Уменьшение полипрагмазии

Потенциальная роль фармакогеномики заключается в уменьшении случаев полипрагмазии : предполагается, что при индивидуальном медикаментозном лечении пациентам не нужно будет принимать несколько лекарств для лечения одного и того же заболевания. Таким образом, они потенциально могут снизить возникновение побочных реакций на лекарства , улучшить результаты лечения и сэкономить затраты, избегая покупки некоторых лекарств. Например, возможно, из-за неправильного назначения пациентов психиатрические пациенты, как правило, получают больше лекарств, чем непсихиатрические пациенты того же возраста.

Потребность в фармакогеномически адаптированной лекарственной терапии может быть наиболее очевидной в исследовании, проведенном Эпидемиологическим центром Слона при Бостонском университете с февраля 1998 года по апрель 2007 года. Исследование показало, что в среднем 82% взрослых в Соединенных Штатах принимают по крайней мере один препарат. лекарства (лекарства, отпускаемые по рецепту или без рецепта, витамины/минералы, травяные/натуральные добавки), а 29% принимают пять или более. Исследование показало, что люди в возрасте 65 лет и старше продолжают оставаться крупнейшими потребителями лекарств: 17-19% в этой возрастной группе принимают не менее десяти лекарств в неделю. Также было показано, что полипрагмазия увеличилась с 2000 года с 23% до 29%.

Примеры тематических исследований

Случай А – Побочная реакция на антипсихотические препараты

Пациент А страдает шизофренией. Их лечение включало комбинацию зипразидона, оланзапина, тразодона и бензтропина . У пациента возникло головокружение и седативный эффект, поэтому ему отказали от зипразидона и оланзапина и перевели на кветиапин. Тразодон был отменен. Затем у пациента появилось повышенное потоотделение, тахикардия и боли в шее, он значительно набрал вес и у него появились галлюцинации. Через пять месяцев дозу кветиапина снизили и прекратили, а в схему лечения снова включили зипразидон из-за чрезмерного увеличения веса. Хотя пациенты потеряли лишний вес, который они набрали, у них затем появилась ригидность мышц, зубчатое колесо , тремор и ночная потливость. Когда к ним был добавлен бензтропин, у них возникло нечеткое зрение. Еще через пять месяцев пациентку перевели с зипразидона на арипипразол. В течение 8 месяцев у пациента А постепенно наблюдалось увеличение веса и седативный эффект, а также у него появились трудности с походкой, скованность, зубчатые колеса и дискинетические движения глаз. Позже фармакогеномический тест подтвердил, что у пациента был CYP2D6 *1/*41, который имеет прогнозируемый фенотип ИМ, и CYP2C19 *1/*2 также с прогнозируемым фенотипом ИМ.

Случай Б – Управление болью

Пациентка Б — женщина, родившая путем кесарева сечения. Ее врач прописал кодеин от боли после кесарева сечения. Она приняла стандартную предписанную дозу, но во время приема кодеина у нее возникли тошнота и головокружение. Она также заметила, что ее ребенок, находящийся на грудном вскармливании, был вялым и плохо ел. Когда пациентка рассказала об этих симптомах своему врачу, тот рекомендовал ей прекратить употребление кодеина. Через несколько дней симптомы как у пациентки, так и у ее ребенка исчезли. Предполагается, что если бы пациентка прошла фармакогеномный тест, то выяснилось бы, что у нее могла быть дупликация гена CYP2D6, что поместило бы ее в категорию сверхбыстрых метаболизаторов (UM), что объясняет ее реакцию на употребление кодеина.

Случай C – Предупреждение FDA о передозировке кодеина у младенцев

20 февраля 2013 г. FDA опубликовало заявление, в котором выражается серьезная обеспокоенность по поводу связи между детьми, известными как CYP2D6 UM, и фатальными реакциями на кодеин после тонзиллэктомии и/или аденоидэктомии (операции по удалению миндалин и/или аденоидов). Они выпустили самое сильное предупреждение в штучной упаковке, чтобы разъяснить опасность употребления кодеина UM CYP2D6. Кодеин преобразуется в морфин с помощью CYP2D6, и те, у кого есть фенотипы УМ, подвергаются опасности выработки большого количества морфина из-за усиленной функции гена. Уровень морфия может достигать опасных для жизни или смертельных уровней, что стало очевидным после смерти троих детей в августе 2012 года.

Проблемы

Последовательные фазы и связанные с ними проблемы фармакогеномики.

Несмотря на то, что среди врачей и медицинских работников, по-видимому, существует общее признание основного принципа фармакогеномики, существует ряд проблем, которые замедляют внедрение, внедрение и стандартизацию фармакогеномики. Среди вопросов, вызывающих обеспокоенность у врачей, можно назвать:

• Ограничения на применение теста в клинической практике и лечении;
• Общее ощущение недоступности теста;
• Понимание и интерпретация научно обоснованных исследований;
• Объединение результатов анализов с другими данными пациентов для оптимизации назначений; и
• Этические, правовые и социальные проблемы.

Проблемы, связанные с доступностью теста, включают:

• Отсутствие научных данных : хотя существует значительное количество ферментов, метаболизирующих лекарства, участвующих в метаболических путях лекарств, лишь часть из них имеет достаточные научные данные для обоснования их использования в клинических условиях; и
• Демонстрация экономической эффективности фармакогеномики : Публикаций по фармакоэкономике фармакогеномики мало, поэтому в настоящее время не существует достаточных доказательств для подтверждения экономической эффективности и финансовых последствий теста.

Хотя другие факторы способствуют медленному развитию фармакогеномики (например, разработка руководств по клиническому использованию), вышеуказанные факторы, по-видимому, являются наиболее распространенными. Все более существенные доказательства и рекомендации отраслевых организаций по клиническому использованию фармакогенетики сделали ее подходом к точной медицине для всего населения. Стоимость, возмещение, обучение и простота использования в местах оказания медицинской помощи остаются серьезными препятствиями на пути широкого внедрения.

Споры

Расовая медицина

В медицине звучат призывы отказаться от расовой и этнической принадлежности и вместо этого использовать генетическое происхождение как способ категоризации пациентов. некоторые аллели Было показано, что , частота которых варьируется в разных популяциях, связаны с различными реакциями на определенные лекарства . В результате некоторые рекомендации по конкретным заболеваниям рекомендуют фармакогенетическое тестирование только для групп населения, где аллели высокого риска встречаются чаще. и, аналогичным образом, некоторые страховые компании будут платить за фармакогенетическое тестирование только бенефициарам групп высокого риска.

Генетическая исключительность

В начале 2000-х годов отношение к генетической информации как к исключительной, включая правовую или нормативную защиту, получило мощную поддержку. Утверждалось, что геномная информация может нуждаться в специальной политике и практике защиты в контексте электронных медицинских карт (ЭМК). В 2008 году был принят Закон о недискриминации генетической информации (GINA) для защиты пациентов от компаний медицинского страхования, дискриминирующих человека на основе генетической информации.

Совсем недавно утверждалось, что срок годности генетической исключительности истек, поскольку мы вступаем в эпоху смешанной геномики и больших данных в медицине, однако практика исключительности продолжает проникать в клиническое здравоохранение и сегодня. Гаррисон и др. недавно передал призыв к действию по обновлению пустословия от генетической исключительности к геномному контекстуализму, поскольку мы признаем фундаментальную двойственность генетической информации. Это дает возможность по-разному относиться к различным типам генетической информации, признавая при этом, что геномная информация похожа и в то же время отличается от другой информации, связанной со здоровьем. Геномный контекстуализм позволит проводить индивидуальный анализ технологии и контекста ее использования (например, клиническая практика, исследования, вторичные результаты).

Другие утверждают, что генетическая информация действительно отличается от другой информации, связанной со здоровьем, но не настолько, чтобы требовать правовой/нормативной защиты, подобно другим конфиденциальным данным, связанным со здоровьем, таким как ВИЧ-статус. Кроме того, Эванс и др. утверждают, что ЭУЗ имеет достаточные стандарты конфиденциальности для хранения другой конфиденциальной информации, такой как номера социального страхования, и что фундаментальная природа ЭУЗ заключается в хранении очень личной информации. Аналогичным образом, систематический обзор показал, что общественность обеспокоена конфиденциальностью генетической информации, при этом 60% согласились, что сохранение конфиденциальности невозможно; однако 96% согласились с тем, что компания, занимающаяся тестированием напрямую с потребителями, защитила их конфиденциальность, а 74% заявили, что их информация будет так же или лучше защищена в EHR. С ростом технологических возможностей ЭМК становится возможным маскировать или скрывать генетические данные от некоторых поставщиков, и нет единого мнения о том, как, когда и от кого следует маскировать генетическую информацию. Утверждается, что строгая защита и маскирование генетической информации препятствуют дальнейшему научному прогрессу и клиническому внедрению в повседневную клиническую практику.

История

Фармакогеномика была впервые признана Пифагором около 510 г. до н.э., когда он установил связь между опасностью употребления фава в пищу с гемолитической анемией и окислительным стрессом . В 1950-х годах эта идентификация была подтверждена и объяснена дефицитом G6PD и названа фавизмом . Хотя первая официальная публикация состоялась только в 1961 году, неофициальное начало этой науки было примерно в 1950-х годах. Сообщения о длительном параличе и фатальных реакциях, связанных с генетическими вариантами, у пациентов, у которых отсутствовала бутирилхолинэстераза («псевдохолинэстераза») после инъекции сукцинилхолина во время анестезии, впервые были зарегистрированы в 1956 году. Термин «фармакогенетика» был впервые введен в 1959 году Фридрихом Фогелем из Гейдельберга , Германия (хотя некоторые статьи предполагают, что это было в 1957 или 1958 году). В конце 1960-х годов исследования близнецов подтвердили вывод о генетическом участии в метаболизме лекарств: однояйцевые близнецы имели поразительное сходство в реакции на лекарства по сравнению с разнояйцевыми близнецами. Термин «фармакогеномика» впервые появился примерно в 1990-х годах.

Первое одобрение FDA фармакогенетического теста было в 2005 году. для аллелей CYP2D6 CYP2C19 и ) (

Будущее

Вычислительные достижения позволили удешевить и ускорить секвенирование. Исследования были сосредоточены на комбинаторной химии . геномный майнинг, омные технологии и высокопроизводительный скрининг .

Поскольку стоимость генетического теста снижается, развитие персонализированной лекарственной терапии будет увеличиваться. Сегодня технология позволяет проводить генетический анализ сотен целевых генов, участвующих в метаболизме и реакции лекарств, менее чем за 24 часа и менее чем за 1000 долларов. Это огромный шаг на пути внедрения фармакогенетических технологий в повседневные медицинские решения. Аналогичным образом, такие компании, как deCODE Genetics , MD Labs Pharmacogenetics, Navigenics и 23andMe, предлагают сканирование генома. Компании используют те же чипы генотипирования , которые используются в исследованиях GWAS, и предоставляют клиентам описание индивидуального риска различных признаков и заболеваний, а также тестирование на 500 000 известных SNP. Стоимость варьируется от 995 до 2500 долларов США и включает обновления с новыми данными исследований по мере их появления. Более дорогие пакеты включали даже телефонный разговор с консультантом по генетике для обсуждения результатов.

Этика

Фармакогенетика стала спорным вопросом в области биоэтики . Конфиденциальность и конфиденциальность являются основными проблемами. Доказательства пользы или риска генетического теста могут носить лишь предположительный характер, что может вызвать дилеммы у поставщиков услуг. Это может повлиять на разработку лекарств, а редкие генетические варианты, возможно, будут подвергаться меньшим исследованиям. Доступ и автономия пациентов также открыты для обсуждения.

Веб-ресурсы

Веб-ресурсы по фармакогеномике

Источник данных	Основное использование	Цитирование
ФармВар	Центральное хранилище вариаций фармакогенов, в котором основное внимание уделяется структуре гаплотипов и аллельным вариациям.
Инструмент биоинформатики SuperCYP	Содержит 1170 препаратов с более чем 3800 взаимодействиями и около 2000 известных SNP. Эти SNP перечислены и упорядочены в соответствии с их влиянием на экспрессию и/или активность.
ФармГКБ	База знаний по фармакогеномике (PharmGKB) — это интерактивный инструмент для исследователей, исследующих, как генетические вариации влияют на реакцию на лекарства.
база данных dbSNP	Репозиторий SNP и других вариантов, о которых сообщалось после открытия, составленный и официально названный. Это SNP по всем направлениям.
НАЙТИбазу	Репозиторий частот аллелей фармакогенетических маркеров в разных популяциях
Фармакогеномные биомаркеры в маркировке лекарств	Таблица, в которой указано, какие лекарства, одобренные FDA, имеют предупреждающие надписи, связанные с фармакогеномикой.
СНПедия	Биоинформационная база данных SNP на базе Wiki.
Сеть исследований фармакогеномики (PGRN)	PGRN содержит ресурсы и информацию для стимулирования совместных исследований в области фармакогеномики и точной медицины.

См. также

• Геномика
  • Хемогеномика
  • Клиномика
  • Генная инженерия
  • Токсикогеномика
  • Фармакогеномика рака
• Метаболомика
• Фармаконадзор
• Группы населения в биомедицине
• Токсигностика
• Медицинская терминология
  • ЛОИНК
  • СНОМЕД КТ
  • ГПО
  • грузовой автомобиль
• HL7
  • МУЖЧИНА

• Генетическое тестирование

Дальнейшее чтение

• Кацнельсон А (август 2005 г.). «Наркотик, который можно назвать своим: станет ли медицина наконец-то личной?» . Научный американец .
• Карчевский К.Дж., Данешжу Р., Альтман Р.Б. (2012). «Глава 7: Фармакогеномика» . PLOS Вычислительная биология . 8 (12): e1002817. Бибкод : 2012PLSCB...8E2817K . дои : 10.1371/journal.pcbi.1002817 . ПМЦ   3531317 . ПМИД   23300409 .

Внешние ссылки

• «Информационный бюллетень по фармакогеномике» . Национальный центр биотехнологической информации (NCBI), Национальная медицинская библиотека США . Проверено 11 июля 2011 г. быстрое введение в индивидуальные препараты
• «Образовательные инициативы в области фармакогеномики» . Управление по контролю за продуктами и лекарствами США. 24 сентября 2010 г. Проверено 11 июля 2011 г.
• «Персонализированная медицина (Фармакогенетика)» . Учебный центр генетических наук Университета Юты. Архивировано из оригинала 19 мая 2011 г. Проверено 11 июля 2011 г.
• «Центр фармакогеномики и индивидуализированной терапии» . Центр фармакогеномики и индивидуализированной терапии Университета Северной Каролины в Чапел-Хилл. Архивировано из оригинала 06 августа 2014 г. Проверено 25 июня 2014 г.

Журналы:

• «Фармакогеномика» . ООО «Фьючер Медицина», 24 августа 2023 г.
• «Фармакогенетика и геномика» . Липпинкотт Уильямс и Уилкинс. ISSN   1744-6872 .
• «Журнал фармакогеномики» . Журнал «Фармакогеномика» . Издательская группа «Природа». 20 октября 2021 г. ISSN   1470-269X .