ПП1

ПП1
Идентификаторы
Псевдонимы	SMG1 , 61E3.4, ATX, LIP, нонсенс-опосредованный распад мРНК, связанный с киназой, родственной PI3K, киназа, связанная с нонсенс-опосредованным распадом мРНК SMG1, связанная с PI3K киназа
Внешние идентификаторы	Опустить : 607032 ; МГИ : 1919742 ; Гомологен : 56697 ; Генные карты : SMG1 ; ОМА : SMG1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 16 (human)
End	18,926,408 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	117,842,893 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	skin of thigh; ; sural nerve; ; epithelium of colon; ; skin of hip; ; Achilles tendon; ; epithelium of nasopharynx; ; parietal pleura; ; mucosa of sigmoid colon; ; visceral pleura; ; jejunal mucosa;
	Top expressed in
	tail of embryo; ; genital tubercle; ; lobe of cerebellum; ; cerebellar vermis; ; mesenteric lymph nodes; ; medullary collecting duct; ; Rostral migratory stream; ; renal corpuscle; ; neural layer of retina; ; spermatocyte;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	telomeric DNA binding; ATP binding; protein kinase activity; protein binding; kinase activity; metal ion binding; nucleotide binding; transferase activity; protein serine/threonine kinase activity; RNA binding;
Cellular component	nucleus; cytosol; cytoplasm; nucleoplasm;
Biological process	response to stress; mRNA export from nucleus; nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay; peptidyl-serine phosphorylation; phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process; cellular response to DNA damage stimulus; protein autophosphorylation; phosphorylation; regulation of telomere maintenance; DNA repair; regulation of response to DNA damage stimulus; protein phosphorylation;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	23049
	233789
	ENSG00000157106
	ENSMUSG00000030655
	Q96Q15
	Q8BKX6
	НМ_015092
	НМ_001031814 ; НМ_177180
	НП_055907
	НП_001026984
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Серин/треонин-протеинкиназа SMG1 представляет собой фермент , который у человека кодируется SMG1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} SMG1 принадлежит к семейству белков киназ, родственных фосфатидилинозитол-3-киназам .

Функция

Этот ген кодирует белок, участвующий в нонсенс-опосредованном распаде мРНК (NMD) как часть комплекса наблюдения мРНК. Белок обладает киназной активностью и, как полагают, действует при НМД путем фосфорилирования белка-регулятора нонсенс-транскриптов 1. Описаны альтернативные варианты сплайсированных транскриптов, но их полноразмерная природа не определена. ^{[ 8 ]}

Взаимодействия

Было показано, что SMG1 (ген) взаимодействует с PRKCI. ^{[ 9 ]} и УПФ1 . ^{[ 10 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000157106 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030655 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Исикава К., Нагасе Т., Накадзима Д., Секи Н., Охира М., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О (1998). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. VIII. 78 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . ДНК Рез . 4 (5): 307–13. дои : 10.1093/dnares/4.5.307 . ПМИД 9455477 .
^ Деннинг Дж., Джеймисон Л., Макват Л.Е., Томпсон Э.А., Филдс АП (июнь 2001 г.). «Клонирование новой киназы, связанной с фосфатидилинозитолкиназой: характеристика надзорного белка РНК SMG-1 человека» . Ж. Биол. Хим . 276 (25): 22709–14. дои : 10.1074/jbc.C100144200 . ПМИД 11331269 .
^ Морита Т., Ямасита А., Касима И., Огата К., Исиура С., Оно С. (март 2007 г.). «Отдаленные N- и C-концевые домены необходимы для внутренней киназной активности SMG-1, критического компонента нонсенс-опосредованного распада мРНК» . Ж. Биол. Хим . 282 (11): 7799–808. дои : 10.1074/jbc.M610159200 . ПМИД 17229728 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: SMG1 PI-3-киназа-родственная киназа SMG-1» .
^ Диас-Меко М.Т., Мунисио М.М., Санчес П., Лозано Х., Москат Дж. (январь 1996 г.). «Лямбда-взаимодействующий белок, новый белок, который специфически взаимодействует с доменом цинкового пальца атипичного изотипа лямбда/йота протеинкиназы С и стимулирует его киназную активность in vitro и in vivo» . Мол. Клетка. Биол . 16 (1): 105–14. дои : 10.1128/mcb.16.1.105 . ПМК 230983 . ПМИД 8524286 .
^ Ямасита А., Ониси Т., Касима И., Тая Ю., Оно С. (сентябрь 2001 г.). «Человеческий SMG-1, новая протеинкиназа, связанная с фосфатидилинозитол-3-киназой, связывается с компонентами комплекса наблюдения за мРНК и участвует в регуляции нонсенс-опосредованного распада мРНК» . Генс Дев . 15 (17): 2215–28. дои : 10.1101/gad.913001 . ПМК 312771 . ПМИД 11544179 .

Дальнейшее чтение

Накадзима Д., Оказаки Н., Ямакава Х., Кикуно Р., Охара О., Нагасе Т. (2002). «Создание готовых к экспрессии клонов кДНК для генов KIAA: ручное курирование 330 клонов кДНК KIAA». ДНК Рез . 9 (3): 99–106. CiteSeerX 10.1.1.500.923 . дои : 10.1093/dnares/9.3.99 . ПМИД 12168954 .
Авраам RT (2005). «Киназа, связанная с ATM, hSMG-1, соединяет пути наблюдения за геномом и РНК». Восстановление ДНК (Амст.) . 3 (8–9): 919–25. дои : 10.1016/j.dnarep.2004.04.003 . ПМИД 15279777 .
Диас-Меко М.Т., Мунисио М.М., Санчес П., Лозано Дж., Москат Дж. (1996). «Лямбда-взаимодействующий белок, новый белок, который специфически взаимодействует с доменом цинкового пальца атипичного изотипа лямбда/йота протеинкиназы С и стимулирует его киназную активность in vitro и in vivo» . Мол. Клетка. Биол . 16 (1): 105–14. дои : 10.1128/MCB.16.1.105 . ПМК 230983 . ПМИД 8524286 .
Санчес П., Де Карсер Г., Сандовал IV, Москат Дж., Диас-Меко М.Т. (1998). «Локализация атипичных изоформ протеинкиназы C в эндосомах, нацеленных на лизосомы, посредством взаимодействия с p62» . Мол. Клетка. Биол . 18 (5): 3069–80. дои : 10.1128/mcb.18.5.3069 . ПМК 110686 . ПМИД 9566925 .
Кармелиет П., Лампуньяни М.Г., Мунс Л., Бревиарио Ф., Компернолле В., Боно Ф., Балкони Г., Спаньуоло Р., Остхюс Б., Деверчин М., Занетти А., Анжеллило А., Матто В., Нуйенс Д., Лютгенс Е., Клотман Ф., де Рюитер. MC, Гиттенбергер-де Гроот А, Пельманн Р, Лупу Ф, Герберт Дж. М., Коллен Д., Дежана Э. (1999). «Направленный дефицит или цитозольное усечение гена VE-кадгерина у мышей ухудшает VEGF-опосредованное выживание эндотелия и ангиогенез» . Ячейка 98 (2): 147–57. дои : 10.1016/S0092-8674(00) 81010-7 ПМИД 10428027 . S2CID 2668221 .
Лофтус Б.Дж., Ким У.Дж., Снеддон В.П., Калуш Ф., Брэндон Р., Фурманн Дж., Мейсон Т., Кросби М.Л., Барнстед М., Кронин Л., Деслаттс Мэйс А., Цао Ю., Сюй Р.С., Кан Х.Л., Митчелл С., Эйхлер Э.Э., Харрис ПК, Вентер Дж. К., Адамс, доктор медицинских наук (1999). «Дупликации генома и другие особенности в последовательности ДНК размером 12 МБ из хромосомы 16p и 16q человека». Геномика . 60 (3): 295–308. дои : 10.1006/geno.1999.5927 . ПМИД 10493829 .
Диас Нето Э, Корреа Р.Г., Верёвски-Алмейда С., Брионес М.Р., Нагаи М.А., да Силва В., Заго М.А., Бордин С., Коста ФФ, Гольдман Г.Х., Карвальо А.Ф., Мацукума А., Бая Г.С., Симпсон Д.Х., Брунштейн А., де Оливейра П.С., Бучер П., Джонджинил К.В., О'Хара М.Дж., Соарес Ф., Брентани Р.Р., Рейс Л.Ф., де Соуза С.Дж., Симпсон А.Дж. (2000). «Секвенирование транскрипции человека с помощью меток последовательности, экспрессируемых ORF» . Учеб. Натл. Академический. наук. США . 97 (7): 3491–6. Бибкод : 2000PNAS...97.3491D . дои : 10.1073/pnas.97.7.3491 . ПМК 16267 . ПМИД 10737800 .
Ямашита А., Ониши Т., Касима И., Тая Ю., Оно С. (2001). «Человеческий SMG-1, новая протеинкиназа, связанная с фосфатидилинозитол-3-киназой, связывается с компонентами комплекса наблюдения за мРНК и участвует в регуляции нонсенс-опосредованного распада мРНК» . Генс Дев . 15 (17): 2215–28. дои : 10.1101/gad.913001 . ПМК 312771 . ПМИД 11544179 .
Эйхлер Э.Э., Джонсон М.Э., Алкан С., Тузун Э., Сахинальп С., Мишео Д., Арчидиаконо Н., Рокки М. (2002). «Дивергентное происхождение и согласованное расширение двух сегментных дупликаций на хромосоме 16» . Дж. Херед . 92 (6): 462–8. дои : 10.1093/jhered/92.6.462 . ПМИД 11948212 .
Чиу С.Ю., Серин Г., Охара О., Макват Л.Е. (2003). «Характеристика человеческого Smg5/7a: белок, сходный с Caenorhabditis elegans SMG5 и SMG7, который участвует в дефосфорилировании Upf1» . РНК . 9 (1): 77–87. дои : 10.1261/rna.2137903 . ПМК 1370372 . ПМИД 12554878 .
Ониши Т., Ямасита А., Касима И., Шелл Т., Андерс КР, Гримсон А., Хачия Т., Хентце М.В., Андерсон П., Оно С. (2003). «Фосфорилирование hUPF1 индуцирует образование комплексов наблюдения мРНК, содержащих hSMG-5 и hSMG-7» . Мол. Клетка . 12 (5): 1187–200. дои : 10.1016/S1097-2765(03)00443-X . ПМИД 14636577 .
Брамбо К.М., Оттернесс Д.М., Гейзен С., Оливейра В., Брогнар Дж., Ли Х, Лежен Ф., Тиббетс Р.С., Макват Л.Е., Авраам Р.Т. (2004). «Белок наблюдения мРНК hSMG-1 участвует в путях генотоксического стрессового ответа в клетках млекопитающих» . Мол. Клетка . 14 (5): 585–98. doi : 10.1016/j.molcel.2004.05.005 . ПМИД 15175154 .
Касима И, Ямасита А, Идзуми Н, Катаока Н, Моришита Р, Хосино С, Оно М, Дрейфус Г, Оно С (2006). «Связывание нового комплекса SMG-1-Upf1-eRF1-eRF3 (SURF) с комплексом соединения экзонов запускает фосфорилирование Upf1 и нонсенс-опосредованный распад мРНК» . Генс Дев . 20 (3): 355–67. дои : 10.1101/gad.1389006 . ПМК 1361706 . ПМИД 16452507 .
Аззалин СМ, Лингнер Дж (2006). «Фактор наблюдения за РНК человека UPF1 необходим для прогрессирования S-фазы и стабильности генома» . Курс. Биол . 16 (4): 433–9. Бибкод : 2006CBio...16..433A . дои : 10.1016/j.cub.2006.01.018 . PMID 16488880 . S2CID 17197870 .

Эта белках статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000157106 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030655 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9455477-5] Исикава К., Нагасе Т., Накадзима Д., Секи Н., Охира М., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О (1998). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. VIII. 78 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . ДНК Рез . 4 (5): 307–13. дои : 10.1093/dnares/4.5.307 . ПМИД 9455477 .

[pmid11331269-6] Деннинг Дж., Джеймисон Л., Макват Л.Е., Томпсон Э.А., Филдс АП (июнь 2001 г.). «Клонирование новой киназы, связанной с фосфатидилинозитолкиназой: характеристика надзорного белка РНК SMG-1 человека» . Ж. Биол. Хим . 276 (25): 22709–14. дои : 10.1074/jbc.C100144200 . ПМИД 11331269 .

[pmid17229728-7] Морита Т., Ямасита А., Касима И., Огата К., Исиура С., Оно С. (март 2007 г.). «Отдаленные N- и C-концевые домены необходимы для внутренней киназной активности SMG-1, критического компонента нонсенс-опосредованного распада мРНК» . Ж. Биол. Хим . 282 (11): 7799–808. дои : 10.1074/jbc.M610159200 . ПМИД 17229728 .

[entrez-8] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: SMG1 PI-3-киназа-родственная киназа SMG-1» .

[pmid8524286-9] Диас-Меко М.Т., Мунисио М.М., Санчес П., Лозано Х., Москат Дж. (январь 1996 г.). «Лямбда-взаимодействующий белок, новый белок, который специфически взаимодействует с доменом цинкового пальца атипичного изотипа лямбда/йота протеинкиназы С и стимулирует его киназную активность in vitro и in vivo» . Мол. Клетка. Биол . 16 (1): 105–14. дои : 10.1128/mcb.16.1.105 . ПМК 230983 . ПМИД 8524286 .

[pmid11544179-10] Ямасита А., Ониси Т., Касима И., Тая Ю., Оно С. (сентябрь 2001 г.). «Человеческий SMG-1, новая протеинкиназа, связанная с фосфатидилинозитол-3-киназой, связывается с компонентами комплекса наблюдения за мРНК и участвует в регуляции нонсенс-опосредованного распада мРНК» . Генс Дев . 15 (17): 2215–28. дои : 10.1101/gad.913001 . ПМК 312771 . ПМИД 11544179 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

v т и Ферменты
Активность	Активный сайт Связывающий сайт Каталитическая триада Оксианионная дырка Ферментная распущенность Фермент, ограниченный диффузией Кофактор Ферментативный катализ
Регулирование	Аллостерическая регуляция Кооперативность Ингибитор ферментов Активатор ферментов
Классификация	Номер ЕС Суперсемейство ферментов Семейство ферментов Список ферментов
Кинетика	Кинетика ферментов Диаграмма Иди – Хофсти Заговор Хейнса – Вульфа График Лайнуивера – Берка Кинетика Михаэлиса – Ментен
Типы	EC1 Оксидоредуктазы ( список ) EC2 Трансферазы ( список ) EC3 Гидролазы ( список ) EC4- лиазы ( список ) EC5 Изомеразы ( список ) EC6- лигазы ( список ) EC7 Транслоказы ( список )