Jump to content

Фосфоинозитид-зависимая киназа-1

ПДПК1
Доступные структуры
ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы PDPK1 , PDK1, PDPK2, PRO0461, PDPK2P, фосфоинозитид-зависимая киназа-1, 3-фосфоинозитид-зависимая протеинкиназа 1
Внешние идентификаторы Опустить : 605213 ; МГИ : 1338068 ; Гомологен : 37643 ; Генные карты : PDPK1 ; ОМА : ПДПК1 — ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Вместе
ЮниПрот
RefSeq (мРНК)

НМ_001261816
НМ_002613
НМ_031268

НМ_001080773
НМ_001286662
НМ_011062

RefSeq (белок)

НП_001248745
НП_002604
НП_112558

НП_001074242
НП_001273591
НП_035192

Местоположение (UCSC) Чр 16: 2,54 – 2,6 Мб Чр 17: 24.29 – 24.37 Мб
в PubMed Поиск [ 3 ] [ 4 ]
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

В области биохимии , PDPK1 относится к белку 3-фосфоинозитид-зависимой протеинкиназы-1 , ферменту кодируется PDPK1 . геном который у человека [ 5 ] Он участвует в развитии и прогрессировании меланомы . [ 6 ]

PDPK1 является мастер- киназой , которая имеет решающее значение для активации AKT /PKB и многих других киназ AGC, включая PKC , S6K , SGK . Важная роль PDPK1 заключается в сигнальных путях, активируемых несколькими факторами роста и гормонами, включая передачу сигналов инсулина .

Мыши, у которых отсутствует PDPK1, умирают на ранних стадиях эмбрионального развития, что указывает на то, что этот фермент имеет решающее значение для передачи сигналов, способствующих росту, необходимых для нормального развития млекопитающих.

Мыши с дефицитом PDPK1 имеют снижение массы тела на ≈40%, легкую непереносимость глюкозы и устойчивость к раку, вызванному гиперактивацией пути PI3K (PTEN+/-). [ 7 ] [ 8 ]

PDK1 растений играет важную роль в регуляции PIN-опосредованного транспорта ауксина и, таким образом, участвует в различных процессах развития, таких как эмбриональное развитие, образование боковых корней, формирование паттерна сосудистой сети, формирование апикального крючка, гравитропизм и фототропизм. [ 9 ]

Этимология

[ редактировать ]

означает - фосфоинозитид - зависимую протеинкиназу 1 . PDPK1 3 PDPK1 функционирует ниже PI3K посредством взаимодействия PDPK1 с мембранными фосфолипидами, включая фосфатидилинозитолы , фосфатидилинозитол(3,4)-бисфосфат и фосфатидилинозитол(3,4,5)-трифосфат . PI3K косвенно регулирует PDPK1 путем фосфорилирования фосфатидилинозитолов , которые, в свою очередь, образуют фосфатидилинозитол (3,4)-бисфосфат и фосфатидилинозитол (3,4,5)-трифосфат . Однако считается, что PDPK1 конститутивно активен и для своей активности не всегда требует фосфатидилинозитолов .

Фосфатидилинозитолы необходимы только для активации на мембране некоторых субстратов, включая АКТ . Однако PDPK1 не требует связывания мембранных липидов для эффективного фосфорилирования большинства своих субстратов в цитозоле (не на клеточной мембране).

Структура

[ редактировать ]

Структуру PDPK1 можно разделить на два домена; киназный или каталитический домен и домен PH . Домен PH функционирует главным образом во взаимодействии PDPK1 с фосфатидилинозитол-(3,4)-бисфосфатом и фосфатидилинозитол-(3,4,5)-трифосфатом , что важно для локализации и активации некоторых мембраносвязанных субстратов PDPK1, включая AKT .

Киназный домен имеет три лиганда сайта связывания ; сайт связывания субстрата, сайт связывания АТФ и сайт стыковки (также известный как карман PIF). Некоторые субстраты PDPK1, включая S6K и протеинкиназу C , требуют связывания в этом месте стыковки. Было показано, что низкомолекулярные аллостерические активаторы PDPK1 избирательно ингибируют активацию субстратов, требующих взаимодействия сайтов стыковки. Эти соединения не связываются с активным сайтом и позволяют PDPK1 активировать другие субстраты, которые не требуют взаимодействия с сайтом стыковки. PDPK1 конститутивно активна, и в настоящее время не существует известных белков-ингибиторов PDPK1.

Считается, что активация главного эффектора PDPK1, AKT, требует правильной ориентации киназных и PH-доменов PDPK1 и AKT на мембране.

Взаимодействия

[ редактировать ]

Было показано, что фосфоинозитид-зависимая киназа-1 взаимодействует с:

  1. ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000140992 Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024122 Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ «Ген Энтреза: PDPK1» .
  6. ^ Скортеганья М., Руллер С., Фэн Ю., Лазова Р., Клюгер Х., Ли Дж.Л., Де СК, Рикерт Р., Пеллеккья М., Бозенберг М., Ронай З.А. (2014). «Генетическая инактивация или фармакологическое ингибирование Pdk1 задерживает развитие и подавляет метастазирование меланомы Braf(V600E)::Pten(-/-)» . Онкоген . 33 (34): 4330–9. дои : 10.1038/onc.2013.383 . ПМЦ   3955742 . ПМИД   24037523 .
  7. ^ Мора А., Командер Д., ван Алтен Д.М., Алесси Д.Р. (апрель 2004 г.). «PDK1, главный регулятор передачи сигнала киназы AGC». Семин. Сотовое развитие. Биол . 15 (2): 161–70. дои : 10.1016/j.semcdb.2003.12.022 . ПМИД   15209375 .
  8. ^ Фрёдин М., Антал Т.Л., Дюммлер Б.А., Йенсен С.Дж., Дик М., Гаммельтофт С., Бионди Р.М. (октябрь 2002 г.). «Фосфосерин/треонин-связывающий карман в киназах AGC и PDK1 опосредует активацию путем фосфорилирования гидрофобного мотива» . ЭМБО Дж . 21 (20): 5396–407. дои : 10.1093/emboj/cdf551 . ПМК   129083 . ПМИД   12374740 .
  9. ^ Тан С., Чжан Х, Конг В., Ян XL, Молнар Г., Вондракова З., Филепова Р., Петрашек Дж., Фримл Дж., Сюэ Х.В. (2020). «Зависимый от липидного кода фосфопереключатель PDK1–D6PK активирует PIN-опосредованный отток ауксина у Arabidopsis» . Природные растения . 6 (5): 556–569. дои : 10.1038/s41477-020-0648-9 . ПМИД   32393881 . S2CID   218593545 .
  10. ^ Барри Ф.А., Гиббинс Дж.М. (апрель 2002 г.). «Протеинкиназа B регулируется в тромбоцитах гликопротеином VI рецептора коллагена» . Ж. Биол. Хим . 277 (15): 12874–8. дои : 10.1074/jbc.M200482200 . ПМИД   11825911 .
  11. ^ Персад С., Аттвелл С., Грей В., Мауджи Н., Денг Дж.Т., Люнг Д., Ян Дж., Сангера Дж., Уолш, член парламента, Дедхар С. (июль 2001 г.). «Регуляция фосфорилирования протеинкиназы B/Akt-серина 473 с помощью интегрин-связанной киназы: решающая роль для активности киназы и аминокислот аргинина 211 и серина 343» . Ж. Биол. Хим . 276 (29): 27462–9. дои : 10.1074/jbc.M102940200 . ПМИД   11313365 .
  12. ^ Jump up to: а б с Ходжкинсон CP, Сейл GJ (январь 2002 г.). «Регуляция как PDK1, так и фосфорилирования PKC-дзета и -дельта с помощью C-концевого фрагмента PRK2». Биохимия . 41 (2): 561–9. дои : 10.1021/bi010719z . ПМИД   11781095 .
  13. ^ Jump up to: а б с д Балендран А., Бионди Р.М., Чунг ПК, Касамайор А., Дик М., Алесси Д.Р. (июль 2000 г.). «Участок стыковки 3-фосфоинозитид-зависимой протеинкиназы-1 (PDK1) необходим для фосфорилирования протеинкиназы Czeta (PKCzeta) и PKC-родственной киназы 2 с помощью PDK1» . Ж. Биол. Хим . 275 (27): 20806–13. дои : 10.1074/jbc.M000421200 . ПМИД   10764742 .
  14. ^ Бионди Р.М., Чунг ПК, Касамайор А., Дик М., Карри Р.А., Алесси Д.Р. (март 2000 г.). «Идентификация кармана в киназном домене PDK1, который взаимодействует с PIF и C-концевыми остатками PKA» . ЭМБО Дж . 19 (5): 979–88. дои : 10.1093/emboj/19.5.979 . ПМК   305637 . ПМИД   10698939 .
  15. ^ Jump up to: а б Пак Дж., Леонг М.Л., Бусе П., Майяр А.С., Файерстоун Г.Л., Хеммингс Б.А. (июнь 1999 г.). «Сывороточная и глюкокортикоид-индуцируемая киназа (SGK) является мишенью сигнального пути, стимулируемого PI-3-киназой» . ЭМБО Дж . 18 (11): 3024–33. дои : 10.1093/emboj/18.11.3024 . ПМЦ   1171384 . ПМИД   10357815 .
  16. ^ Ле Гуд Дж.А., Зиглер В.Х., Парех Д.Б., Алесси Д.Р., Коэн П., Паркер П.Дж. (сентябрь 1998 г.). «Изотипы протеинкиназы C, контролируемые фосфоинозитид-3-киназой через протеинкиназу PDK1». Наука . 281 (5385): 2042–5. дои : 10.1126/science.281.5385.2042 . ПМИД   9748166 .
  17. ^ Jump up to: а б Чун Дж., Квон Т., Ли Э., Су П.Г., Чхве Э.Дж., Сунь Кан С. (октябрь 2002 г.). «Регуляторный фактор 2 обменника Na (+) / H (+) опосредует фосфорилирование сывороточной и глюкокортикоид-индуцированной протеинкиназы 1 с помощью 3-фосфоинозитид-зависимой протеинкиназы 1». Биохим. Биофиз. Рез. Общий . 298 (2): 207–15. дои : 10.1016/s0006-291x(02)02428-2 . ПМИД   12387817 .
  18. ^ Сато С., Фудзита Н., Цуруо Т. (октябрь 2002 г.). «Регуляция киназной активности 3-фосфоинозитид-зависимой протеинкиназы-1 путем связывания с 14-3-3» . Ж. Биол. Хим . 277 (42): 39360–7. дои : 10.1074/jbc.M205141200 . ПМИД   12177059 .

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 49f3f44e30a80621d4bd62534c108e0a__1712592660
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/49/0a/49f3f44e30a80621d4bd62534c108e0a.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Phosphoinositide-dependent kinase-1 - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)