Нет (белок)

НЕТ
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	4C57, 4C58, 4C59, 4O38, 4Y8D
Идентификаторы
Псевдонимы	NO , D130045N16RIK, DNAJ26, DNAJC26, Cyclin G, связанная киназа
Внешние идентификаторы	Омим : 602052 ; MGI : 2442153 ; Гомолог : 3846 ; GeneCards : нет ; OMA : нет - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 4 (human)
End	932,373 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 5 (mouse)
End	108,777,621 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	pancreatic ductal cell; ; endothelial cell; ; mucosa of transverse colon; ; granulocyte; ; right hemisphere of cerebellum; ; minor salivary glands; ; mucosa of ileum; ; left testis; ; body of stomach; ; right testis;
	Top expressed in
	tail of embryo; ; genital tubercle; ; granulocyte; ; intestinal villus; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; crypt of lieberkuhn of small intestine; ; duodenum; ; epithelium of small intestine; ; thymus; ; lip;
	More reference expression data
	n/a
showДжин Онтология
Molecular function	transferase activity; nucleotide binding; protein serine/threonine kinase activity; protein kinase activity; protein binding; ATP binding; kinase activity; cyclin binding; chaperone binding; clathrin binding;
Cellular component	cytoplasm; perinuclear region of cytoplasm; vesicle; cell junction; Golgi apparatus; membrane; intracellular membrane-bounded organelle; focal adhesion; cytosol; synapse; presynapse;
Biological process	protein phosphorylation; cell cycle; negative regulation of neuron projection development; Golgi organization; phosphorylation; clathrin-dependent endocytosis; clathrin coat disassembly; Golgi to lysosome transport; endoplasmic reticulum organization; synaptic vesicle uncoating; chaperone cofactor-dependent protein refolding; membrane organization; clathrin-coated pit assembly; receptor-mediated endocytosis; protein localization to plasma membrane; protein localization to Golgi apparatus;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	2580
	231580
	ENSG00000178950
	Ensmusg00000062234
	O14976
	Q99KY4
	NM_001286833 ; NM_005255 ; NM_001318134
showNM_001282051 ; NM_001282052 ; NM_153569 ; NM_001359922 ; NM_001359923 ;
	NM_001359924
	NP_001305063 ; NP_005246
showNP_001268980 ; NP_001268981 ; NP_705797 ; NP_001346851 ; NP_001346852 ;
	NP_001346853
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Циклин G-ассоциированная киназа ( GAK ) представляет собой сериновую/треонинкиназу, которая у людей кодируется GAK геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Во всех эукариотах клеточный цикл определяется циклин-зависимыми протеинкиназами (CDK), чьи активности регулируются циклинами и ингибиторами CDK в разнообразных механизмах, которые включают контроль фосфорилирования и дефосфорилирование остатков SER или тира. Циклины - это молекулы, которые обладают консенсусным доменом, называемым «циклинской коробкой». В клетках млекопитающих было идентифицировано 9 видов циклина, и они называются циклинами A до I. Cyclin G - прямая транскрипционная мишень для продукта гена P53 опухоли -супрессора и, таким образом, функционирует ниже p53. Гак является партнером по ассоциации Cyclin G и CDK5 . ^{[ 5 ]}

Cyclin G-ассоциированная киназа получила свое название, потому что она иммунопреципитирована с помощью Cyclin G, хотя теперь она, по-видимому, не связана с ней. Циклин G-ассоциированная киназа гомологичен по функции белка, который в связи с клатрином HSC70 Uncoats в нейрональных клетках. Тем не менее, расположение циклинной G-ассоциированной киназы находится не в мозге, а вблизи транс-Гольджи-сети ненейрональных клеток, такая как те, которые обнаружены в печени и яичках. Также известно, что Гак ассоциируется с очаговыми спассами, хотя точная связь между ними неизвестна. ^{[ 7 ]}

Структура

Структура GAK определяли с использованием рентгеновской дифракции до разрешения 2,10 Å. ^{[ 8 ]}

Циклин G-ассоциированная киназа представляет собой цистолический белок с двумя доменом. Заинтересованным доменом является С-концевой домен, который состоит из трех поддоменов, таких как С-терминальный домен J, клатрин домен, подобный растяжению -связывающий домен и N-терминальный . Другим доменом является домен N -терминальной киназы, который представляет собой функциональную протеинкиназу Ser/Thr. N-концевой киназный домен способен фосфорилировать гистон H1. Функция N N-терминала, подобная растяжению поддожа, еще не определена, хотя домен разделяет высокую гомологию для PTEN Dupressant опухоли . Ключевой характеристикой является цистеиновая группа, которая необходима для фосфорилирования; Однако, похожий на растяжение N-терминального субдомена, отсутствует в некоторых важных функциональных остатках, которые есть PTEN. С-концевой J-домен отвечает за взаимодействие с HSC70 , которое является молекулярным шапероном, ответственным за неподвижение везикул, покрытых клатрином во время эндоцитоза . Клатрин-связывающий домен собирается клатрин в корзины. При pH 7 GAK позволяет HSC70 к корзинам клатрина и при pH 6 HSC70 связывает корзины клатрина без неподвижного клатрина. Не принимая во внимание киназную домен Gak, Gak 43% идентичен Auxilin , нейрональный кофактор, не покрывающий клатрин, в его аминокислотной композиции. Gak на 57% гомологичен Auxilin, если консервативные остатки включены в сравнение. Хотя сходные домены этих двух молекул предполагают и имеют сходные функции, белки выполняют эти функции разными манерами. Гак инициирует сборку клатриновых корзин стехиометрически, но при разных PH оно будет либо связывать HSC70 с корзинами, либо индуцирует HSC70, чтобы уточить корзины клатрина, каталитически, что является одним из различий между вспочением и гейком. Этот каталитический маршрут объясняет, почему требуется меньше GAK, чем необходимо для выполнения аналогичной функции. ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000178950 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000062234 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: циклин G, связанная с киназой» .
^ Кимура Ш., Цуруга Х., Ябута Н., Эндо Й, Ноджима Х (сентябрь 1997 г.). «Структура, экспрессия и хромосомная локализация человеческого Gak». Геномика . 44 (2): 179–87. doi : 10.1006/geno.1997.4873 . PMID 9299234 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Kanaoka Y, Kimura SH, Okazaki I, Ikeda M, Nojima H (январь 1997 г.). «Gak: связанная с ассоциированной киназой циклин G содержит домен, подобный тензина/вспомогатель,» . Письма Febs . 402 (1): 73–80. doi : 10.1016/s0014-5793 (96) 01484-6 . PMID 9013862 . S2CID 22697554 .
^ Zhang R, Hatzos-Skintges C, Weger A, Eswaran J, Fedorov O, King O, Von Delft F, Bountra C, Arrowsmith CH, Weigelt J, Edwards A, Knapp S, Joachimiak A, центр Среднего Запада для структурной геномики (MCSG) (2010). «Кристаллическая структура человеческой циклин, связанной с киназой». Всемирный банк данных белка . doi : 10.2210/pdb3ll6/pdb .

Дальнейшее чтение

Greener T, Zhao X, Nojima H, Eisenberg E, Greene Le (январь 2000 г.). «Роль циклина G-ассоциированной киназы в неподвижных клатриновых везикулах из ненейрональных клеток» . Журнал биологической химии . 275 (2): 1365–70. doi : 10.1074/jbc.275.2.1365 . PMID 10625686 .

Эта статья включает в себя текст из Национальной медицины Соединенных Штатов , которая находится в общественном достоянии .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000178950 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000062234 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[entrez-5] Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: циклин G, связанная с киназой» .

[pmid9299234-6] Кимура Ш., Цуруга Х., Ябута Н., Эндо Й, Ноджима Х (сентябрь 1997 г.). «Структура, экспрессия и хромосомная локализация человеческого Gak». Геномика . 44 (2): 179–87. doi : 10.1006/geno.1997.4873 . PMID 9299234 .

[Kanaoka_1997-7] Jump up to: ^а ^{беременный} Kanaoka Y, Kimura SH, Okazaki I, Ikeda M, Nojima H (январь 1997 г.). «Gak: связанная с ассоциированной киназой циклин G содержит домен, подобный тензина/вспомогатель,» . Письма Febs . 402 (1): 73–80. doi : 10.1016/s0014-5793 (96) 01484-6 . PMID 9013862 . S2CID 22697554 .

[Zhang_2010-8] Zhang R, Hatzos-Skintges C, Weger A, Eswaran J, Fedorov O, King O, Von Delft F, Bountra C, Arrowsmith CH, Weigelt J, Edwards A, Knapp S, Joachimiak A, центр Среднего Запада для структурной геномики (MCSG) (2010). «Кристаллическая структура человеческой циклин, связанной с киназой». Всемирный банк данных белка . doi : 10.2210/pdb3ll6/pdb .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

v Т и Ферменты
Активность	Активный сайт Связующий сайт Каталитическая триада Оксинион Хоул Распущенность фермента Ограниченный диффузию фермент Кофактор Ферментный катализ
Регулирование	Аллостерическая регуляция Кооперативность Ингибитор фермента Фермент активатор
Классификация	ЕС номер Фермент суперсемейство Семья ферментов Список ферментов
Кинетика	Кинетика фермента Eadie -court чайная диаграмма Хейнс -Вулф Участок Lineweaver - Burk Stury Михаэлис -Мюминен Кинетика
Типы	EC1 оксидоредуктазы ( список ) EC2 Трансферы ( список ) EC3 Гидролазы ( список ) EC4 Lyases ( список ) EC5 изомеразы ( список ) Ec6 лигазы ( список ) EC7 Translocases ( список )