Jump to content

Фосфоинозитид-зависимая киназа-1

(Перенаправлен из PDPK1 )

PDPK1
Доступные структуры
PDB Поиск ортолога: PDBE RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы PDPK1 , PDK1, PDPK2, PRO0461, PDPK2P, фосфоинозитид-зависимая киназа-1, 3-фосфоинозитид-зависимая протеинкиназа 1
Внешние идентификаторы Омим : 605213 ; MGI : 1338068 ; Гомологен : 37643 ; GeneCards : PDPK1 ; OMA : PDPK1 - ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Набор
Uniprot
Refseq (мРНК)

NM_001261816
NM_002613
NM_031268

NM_001080773
NM_001286662
NM_011062

Refseq (белок)

NP_001248745
NP_002604
NP_112558

NP_001074242
NP_001273591
NP_035192

Расположение (UCSC) CHR 16: 2,54 - 2,6 МБ Chr 17: 24,29 - 24,37 МБ
PubMed Search [ 3 ] [ 4 ]
Викидид
Посмотреть/редактировать человека Посмотреть/редактировать мышь

В области биохимии , PDPK1 относится к белке 3-фосфоинозитидзависимой протеинкиназе-1 , ферменту который кодируется PDPK1 геном у людей. [ 5 ] Это связано с развитием и развитием меланомы . [ 6 ]

PDPK1 является мастер -киназой , которая имеет решающее значение для активации AKT /PKB и многих других AGC -киназ, включая PKC , S6K , SGK . Важной ролью для PDPK1 является сигнальные пути, активируемые несколькими факторами роста и гормонами, включая передачу сигналов инсулина .

Мыши, лишенные PDPK1, умирают во время раннего эмбрионального развития, что указывает на то, что этот фермент имеет решающее значение для передачи сигналов, способствующих развитию, необходимым для нормального развития млекопитающих.

Мыши, которые имеют дефицит в PDPK1, имеют снижение массы тела ≈40%, легкую непереносимость глюкозы и устойчивы к раку, вызванную гиперактивацией пути PI3K (PTEN +/-). [ 7 ] [ 8 ]

Plant PDK1 играет важную роль в регулировании PIN-опосредованного транспорта ауксина и, таким образом, участвует в различных процессах развития, таких как эмбриональное развитие, формирование бокового корня, паттерна сосудов, апикальное образование крючка, гравитропизм и фототропизм. [ 9 ]

Этимология

[ редактировать ]

PDPK1 обозначает 3 P hosphoinositide- Dependent 1 P Rotein K Inase - . PDPK1 функционирует вниз по течению от взаимодействия PI3K через взаимодействие PDPK1 с мембранными фосфолипидами, включая фосфатидилинозитолы , фосфатидилинозитол (3,4) -бисфосфат и фосфатидилинозитол (3,4,5) -трисфосфат . PI3K косвенно регулирует PDPK1 путем фосфорилирующих фосфатидилинозитолов , которые, в свою очередь, генерирует фосфатидилинозитол (3,4) -бисфосфат и фосфатидилинозитол (3,4,5) -трисфосфата . Тем не менее, PDPK1 считается конститутивно активным и не всегда требует фосфатидилинозитолов для ее деятельности.

Фосфатидилинозитолы необходимы только для активации на мембране некоторых субстратов, включая AKT . Однако PDPK1 не требует мембранного связывания липидов для эффективного фосфорилирования большинства его субстратов в цитозоле (не в клеточной мембране).

Структура

[ редактировать ]

Структура PDPK1 может быть разделена на два домена; киназа или каталитический домен и домен рН . Домен рН функционирует в основном во взаимодействии PDPK1 с фосфатидилинозитол (3,4) -бисфосфат и фосфатидилинозитол (3,4,5) -трисфосфат , что важна для локализации и активации некоторых мембранных субстратов PDPK1, включая AKT .

Домен киназы имеет три сайта связывания лиганда ; Сайт связывания субстрата, сайт связывания ATP и сайт стыковки (также известный как PIF Pocket). Несколько субстратов PDPK1, включая S6K и протеинкиназу C , требуют связывания на этом сайте стыковки. Было показано, что малые молекулы аллостерические активаторы PDPK1 селективно ингибируют активацию субстратов, которые требуют взаимодействия с участком стыковки. Эти соединения не связываются с активным сайтом и позволяют PDPK1 активировать другие субстраты, которые не требуют взаимодействия с участком стыковки. PDPK1 является конститутивно активным, и в настоящее время не существует известных ингибиторных белков для PDPK1.

Считается, что активация основного эффектора PDPK1, AKT, требует надлежащей ориентации доменов киназы и pH PDPK1 и AKT на мембране.

Взаимодействия

[ редактировать ]

Было показано, что фосфоинозитидзависимая киназа-1 взаимодействует :

  1. ^ Jump up to: а беременный в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000140992 - ENSEMBL , май 2017 г.
  2. ^ Jump up to: а беременный в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000024122 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
  4. ^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
  5. ^ "Entrez Gene: PDPK1" .
  6. ^ Скортеганьи М., Руллер С., Фенг Й, Лазова Р., Клугер Х., Ли Дж. Л., Де С.К., Рикерт Р., Пеллеккия М., Босенберг М., Ронаи За (2014). «Генетическая инактивация или фармакологическое ингибирование PDK1 задерживает развитие и ингибирует метастазирование BRAF (V600E) :: PTEN (-/-) Меланома» . Онкоген . 33 (34): 4330–9. doi : 10.1038/onc.2013.383 . PMC   3955742 . PMID   24037523 .
  7. ^ Мора А., Командер Д., Ван Альтен Д.М., Алесси Д.Р. (апрель 2004 г.). «PDK1, главный регулятор трансдукции сигнала AGC -киназы». Семин Клеточный дев. Биол . 15 (2): 161–70. doi : 10.1016/j.semcdb.2003.12.022 . PMID   15209375 .
  8. ^ Frödin M, Antal TL, Dümmler BA, Jensen CJ, Deak M, Gammeltoft S, Biondi RM (октябрь 2002 г.). «Фосфосерин-связывающий карман в agc-киназах и PDK1 опосредует активацию гидрофобным фосфорилированием мотива» . Embo j . 21 (20): 5396–407. doi : 10.1093/emboj/cdf551 . PMC   129083 . PMID   12374740 .
  9. ^ Tan S, Zhang X, Kong W, Yang XL, Molnár G, Vondráková Z, FilePová R, Petráshek J, Friml J, Xue HW (2020). «Липидный код-зависимый PhosphosWitch PDK1-D6PK активирует опосредованный выводом отток ауксина при арабидопсисе» . Природные растения . 6 (5): 556–569. doi : 10.1038/s41477-020-0648-9 . PMID   32393881 . S2CID   218593545 .
  10. ^ Барри Ф.А., Гиббинс Дж. М. (апрель 2002 г.). «Протеинкиназа B регулируется в тромбоцитах гликопротеином коллагенового рецептора VI» . Дж. Биол. Химический 277 (15): 12874–8. doi : 10.1074/jbc.m200482200 . PMID   11825911 .
  11. ^ Persad S, Attwell S, Grey V, Mawji N, Deng JT, Leung D, Yan J, Sanghera J, Walsh MP, Dedhar S (июль 2001 г.). «Регуляция фосфорилирования протеинкиназы B/Akt 473 с помощью интегрин-связанной киназы: критическая роль киназной активности и аминокислоты аргинина 211 и серина 343» . Дж. Биол. Химический 276 (29): 27462–9. doi : 10.1074/jbc.m102940200 . PMID   11313365 .
  12. ^ Jump up to: а беременный в Hodgkinson CP, Sale GJ (январь 2002 г.). «Регуляция как PDK1, так и фосфорилирования PKC-Zeta и -delta с помощью C-концевого фрагмента PRK2». Биохимия . 41 (2): 561–9. doi : 10.1021/bi010719z . PMID   11781095 .
  13. ^ Jump up to: а беременный в дюймовый Balendran A, Biondi RM, Cheung PC, Casamayor A, Deak M, Alessi DR (июль 2000 г.). «3-фосфоинозитидзависимый сайт протеинкиназы-1 (PDK1) необходим для фосфорилирования белкокиназы Цезет (PKCZETA) и связанной с PKC киназы 2 PDK1» . Дж. Биол. Химический 275 (27): 20806–13. doi : 10.1074/jbc.m000421200 . PMID   10764742 .
  14. ^ Бионди Р.М., Чеунг ПК, Касамайор А., Дик М., Керри Р.А., Алесси Д.Р. (март 2000 г.). «Идентификация кармана в домене киназы PDK1, который взаимодействует с PIF и C-концевыми остатками PKA» . Embo j . 19 (5): 979–88. doi : 10.1093/emboj/19.5.979 . PMC   305637 . PMID   10698939 .
  15. ^ Jump up to: а беременный Park J, Leong ML, Buse P, Maiyar AC, Firestone GL, Хеммингс Б.А. (июнь 1999 г.). «Сывороточная и глюкокортикоидная индуцируемая киназа (SGK) представляет собой мишень сигнального пути, стимулированного PI 3-киназой» . Embo j . 18 (11): 3024–33. doi : 10.1093/emboj/18.11.3024 . PMC   1171384 . PMID   10357815 .
  16. ^ Le Good Ja, Ziegler WH, Parekh DB, Alessi DR, Cohen P, Parker PJ (сентябрь 1998 г.). «Изотипы протеинкиназы С, контролируемые фосфоинозитид-3-киназой через PDK1 протеинкиназы». Наука . 281 (5385): 2042–5. doi : 10.1126/science.281.5385.2042 . PMID   9748166 .
  17. ^ Jump up to: а беременный Чун Дж, Квон Т., Ли Э., Су П.Г., Чой Э.Дж. "Затем (] Биохимия. Бифис. Резерв Общение 298 (2): 207–1 doi : 10.1016/s0006-291x (02) 02428-2 PMID   12387817 .
  18. ^ Sato S, Fujita N, Tsuruo T (октябрь 2002 г.). «Регуляция киназной активности 3-фосфоинозитид-зависимой протеинкиназы-1 путем связывания с 14-3-3» . Дж. Биол. Химический 277 (42): 39360–7. doi : 10.1074/jbc.m205141200 . PMID   12177059 .

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: e041035201021c2eeb11e3ce6d5405a5__1712592660
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/e0/a5/e041035201021c2eeb11e3ce6d5405a5.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Phosphoinositide-dependent kinase-1 - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)