Фосфоинозитид-зависимая киназа-1
PDPK1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | PDPK1 , PDK1, PDPK2, PRO0461, PDPK2P, фосфоинозитид-зависимая киназа-1, 3-фосфоинозитид-зависимая протеинкиназа 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | Омим : 605213 ; MGI : 1338068 ; Гомологен : 37643 ; GeneCards : PDPK1 ; OMA : PDPK1 - ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Викидид | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
В области биохимии , PDPK1 относится к белке 3-фосфоинозитидзависимой протеинкиназе-1 , ферменту который кодируется PDPK1 геном у людей. [ 5 ] Это связано с развитием и развитием меланомы . [ 6 ]
Функция
[ редактировать ]PDPK1 является мастер -киназой , которая имеет решающее значение для активации AKT /PKB и многих других AGC -киназ, включая PKC , S6K , SGK . Важной ролью для PDPK1 является сигнальные пути, активируемые несколькими факторами роста и гормонами, включая передачу сигналов инсулина .
Мыши, лишенные PDPK1, умирают во время раннего эмбрионального развития, что указывает на то, что этот фермент имеет решающее значение для передачи сигналов, способствующих развитию, необходимым для нормального развития млекопитающих.
Мыши, которые имеют дефицит в PDPK1, имеют снижение массы тела ≈40%, легкую непереносимость глюкозы и устойчивы к раку, вызванную гиперактивацией пути PI3K (PTEN +/-). [ 7 ] [ 8 ]
Plant PDK1 играет важную роль в регулировании PIN-опосредованного транспорта ауксина и, таким образом, участвует в различных процессах развития, таких как эмбриональное развитие, формирование бокового корня, паттерна сосудов, апикальное образование крючка, гравитропизм и фототропизм. [ 9 ]
Этимология
[ редактировать ]PDPK1 обозначает 3 P hosphoinositide- Dependent 1 P Rotein K Inase - . PDPK1 функционирует вниз по течению от взаимодействия PI3K через взаимодействие PDPK1 с мембранными фосфолипидами, включая фосфатидилинозитолы , фосфатидилинозитол (3,4) -бисфосфат и фосфатидилинозитол (3,4,5) -трисфосфат . PI3K косвенно регулирует PDPK1 путем фосфорилирующих фосфатидилинозитолов , которые, в свою очередь, генерирует фосфатидилинозитол (3,4) -бисфосфат и фосфатидилинозитол (3,4,5) -трисфосфата . Тем не менее, PDPK1 считается конститутивно активным и не всегда требует фосфатидилинозитолов для ее деятельности.
Фосфатидилинозитолы необходимы только для активации на мембране некоторых субстратов, включая AKT . Однако PDPK1 не требует мембранного связывания липидов для эффективного фосфорилирования большинства его субстратов в цитозоле (не в клеточной мембране).
Структура
[ редактировать ]Структура PDPK1 может быть разделена на два домена; киназа или каталитический домен и домен рН . Домен рН функционирует в основном во взаимодействии PDPK1 с фосфатидилинозитол (3,4) -бисфосфат и фосфатидилинозитол (3,4,5) -трисфосфат , что важна для локализации и активации некоторых мембранных субстратов PDPK1, включая AKT .
Домен киназы имеет три сайта связывания лиганда ; Сайт связывания субстрата, сайт связывания ATP и сайт стыковки (также известный как PIF Pocket). Несколько субстратов PDPK1, включая S6K и протеинкиназу C , требуют связывания на этом сайте стыковки. Было показано, что малые молекулы аллостерические активаторы PDPK1 селективно ингибируют активацию субстратов, которые требуют взаимодействия с участком стыковки. Эти соединения не связываются с активным сайтом и позволяют PDPK1 активировать другие субстраты, которые не требуют взаимодействия с участком стыковки. PDPK1 является конститутивно активным, и в настоящее время не существует известных ингибиторных белков для PDPK1.
Считается, что активация основного эффектора PDPK1, AKT, требует надлежащей ориентации доменов киназы и pH PDPK1 и AKT на мембране.
Взаимодействия
[ редактировать ]Было показано, что фосфоинозитидзависимая киназа-1 взаимодействует :
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а беременный в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000140992 - ENSEMBL , май 2017 г.
- ^ Jump up to: а беременный в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000024122 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
- ^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
- ^ "Entrez Gene: PDPK1" .
- ^ Скортеганьи М., Руллер С., Фенг Й, Лазова Р., Клугер Х., Ли Дж. Л., Де С.К., Рикерт Р., Пеллеккия М., Босенберг М., Ронаи За (2014). «Генетическая инактивация или фармакологическое ингибирование PDK1 задерживает развитие и ингибирует метастазирование BRAF (V600E) :: PTEN (-/-) Меланома» . Онкоген . 33 (34): 4330–9. doi : 10.1038/onc.2013.383 . PMC 3955742 . PMID 24037523 .
- ^ Мора А., Командер Д., Ван Альтен Д.М., Алесси Д.Р. (апрель 2004 г.). «PDK1, главный регулятор трансдукции сигнала AGC -киназы». Семин Клеточный дев. Биол . 15 (2): 161–70. doi : 10.1016/j.semcdb.2003.12.022 . PMID 15209375 .
- ^ Frödin M, Antal TL, Dümmler BA, Jensen CJ, Deak M, Gammeltoft S, Biondi RM (октябрь 2002 г.). «Фосфосерин-связывающий карман в agc-киназах и PDK1 опосредует активацию гидрофобным фосфорилированием мотива» . Embo j . 21 (20): 5396–407. doi : 10.1093/emboj/cdf551 . PMC 129083 . PMID 12374740 .
- ^ Tan S, Zhang X, Kong W, Yang XL, Molnár G, Vondráková Z, FilePová R, Petráshek J, Friml J, Xue HW (2020). «Липидный код-зависимый PhosphosWitch PDK1-D6PK активирует опосредованный выводом отток ауксина при арабидопсисе» . Природные растения . 6 (5): 556–569. doi : 10.1038/s41477-020-0648-9 . PMID 32393881 . S2CID 218593545 .
- ^ Барри Ф.А., Гиббинс Дж. М. (апрель 2002 г.). «Протеинкиназа B регулируется в тромбоцитах гликопротеином коллагенового рецептора VI» . Дж. Биол. Химический 277 (15): 12874–8. doi : 10.1074/jbc.m200482200 . PMID 11825911 .
- ^ Persad S, Attwell S, Grey V, Mawji N, Deng JT, Leung D, Yan J, Sanghera J, Walsh MP, Dedhar S (июль 2001 г.). «Регуляция фосфорилирования протеинкиназы B/Akt 473 с помощью интегрин-связанной киназы: критическая роль киназной активности и аминокислоты аргинина 211 и серина 343» . Дж. Биол. Химический 276 (29): 27462–9. doi : 10.1074/jbc.m102940200 . PMID 11313365 .
- ^ Jump up to: а беременный в Hodgkinson CP, Sale GJ (январь 2002 г.). «Регуляция как PDK1, так и фосфорилирования PKC-Zeta и -delta с помощью C-концевого фрагмента PRK2». Биохимия . 41 (2): 561–9. doi : 10.1021/bi010719z . PMID 11781095 .
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый Balendran A, Biondi RM, Cheung PC, Casamayor A, Deak M, Alessi DR (июль 2000 г.). «3-фосфоинозитидзависимый сайт протеинкиназы-1 (PDK1) необходим для фосфорилирования белкокиназы Цезет (PKCZETA) и связанной с PKC киназы 2 PDK1» . Дж. Биол. Химический 275 (27): 20806–13. doi : 10.1074/jbc.m000421200 . PMID 10764742 .
- ^ Бионди Р.М., Чеунг ПК, Касамайор А., Дик М., Керри Р.А., Алесси Д.Р. (март 2000 г.). «Идентификация кармана в домене киназы PDK1, который взаимодействует с PIF и C-концевыми остатками PKA» . Embo j . 19 (5): 979–88. doi : 10.1093/emboj/19.5.979 . PMC 305637 . PMID 10698939 .
- ^ Jump up to: а беременный Park J, Leong ML, Buse P, Maiyar AC, Firestone GL, Хеммингс Б.А. (июнь 1999 г.). «Сывороточная и глюкокортикоидная индуцируемая киназа (SGK) представляет собой мишень сигнального пути, стимулированного PI 3-киназой» . Embo j . 18 (11): 3024–33. doi : 10.1093/emboj/18.11.3024 . PMC 1171384 . PMID 10357815 .
- ^ Le Good Ja, Ziegler WH, Parekh DB, Alessi DR, Cohen P, Parker PJ (сентябрь 1998 г.). «Изотипы протеинкиназы С, контролируемые фосфоинозитид-3-киназой через PDK1 протеинкиназы». Наука . 281 (5385): 2042–5. doi : 10.1126/science.281.5385.2042 . PMID 9748166 .
- ^ Jump up to: а беременный Чун Дж, Квон Т., Ли Э., Су П.Г., Чой Э.Дж. "Затем (] Биохимия. Бифис. Резерв Общение 298 (2): 207–1 doi : 10.1016/s0006-291x (02) 02428-2 PMID 12387817 .
- ^ Sato S, Fujita N, Tsuruo T (октябрь 2002 г.). «Регуляция киназной активности 3-фосфоинозитид-зависимой протеинкиназы-1 путем связывания с 14-3-3» . Дж. Биол. Химический 277 (42): 39360–7. doi : 10.1074/jbc.m205141200 . PMID 12177059 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Vanhaesebroeck B, Alessi DR (2000). «Подключение PI3K-PDK1: больше, чем просто дорога к PKB» . Биохимия. Дж . 346 Pt 3 (3): 561–76. doi : 10.1042/0264-6021: 3460561 . PMC 1220886 . PMID 10698680 .
- Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-капитализация: простой метод замены структуры крышки эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
- Алесси Д.Р., Джеймс С.Р., Даунс С.П., Холмс А.Б., Гаффни П.Р., Риз К.Б., Коэн П. (1997). «Характеристика 3-фосфоинозитидзависимой протеинкиназы, которая фосфорилирует и активирует протеинкиназу Balpha» . Карт Биол . 7 (4): 261–9. Bibcode : 1997cbio .... 7..261a . doi : 10.1016/s0960-9822 (06) 00122-9 . PMID 9094314 . S2CID 2094414 .
- Мозер Б.А., Деннис П.Б., Пуллен Н., Пирсон Р.Б., Уильямсон Н.А., Веттенхолл Р.Е., Козма С.К., Томас Г. (1997). «Двойное требование для вновь идентифицированного места фосфорилирования в P70S6K» . Мол Клетка. Биол . 17 (9): 5648–55. doi : 10.1128/mcb.17.9.5648 . PMC 232413 . PMID 9271440 .
- Alessi DR, Deak M, Casamayor A, Caudwell FB, Morrice N, Norman DG, Gaffney P, Reese CB, Macdougall CN, Harbison D, Ashworth A, Bownes M (1997). «3-фосфоинозитидзависимая протеинкиназа-1 (PDK1): структурная и функциональная гомология с киназой Drosophila DSTPK61» . Карт Биол . 7 (10): 776–89. Bibcode : 1997cbio .... 7..776a . doi : 10.1016/s0960-9822 (06) 00336-8 . PMID 9368760 . S2CID 1167390 .
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). «Строительство и характеристика обогащенной полной длиной и библиотекой кДНК с 5'-эндом». Ген . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/s0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
- Meier R, Alessi DR, Cron P, Andjelković M, Hemmings BA (1997). «Митогенная активация, фосфорилирование и ядерная транслокация протеинкиназы Bbeta» . Дж. Биол. Химический 272 (48): 30491–7. doi : 10.1074/jbc.272.48.30491 . PMID 9374542 .
- Alessi DR, Kozlowski MT, Weng QP, Morrice N, Avruch J (1998). «3-фосфоинозитид-зависимая протеинкиназа 1 (PDK1) фосфорилирует и активирует P70 S6-киназу in vivo и in vitro» (PDF) . Карт Биол . 8 (2): 69–81. Bibcode : 1998cbio .... 8 ... 69a . doi : 10.1016/s0960-9822 (98) 70037-5 . PMID 9427642 . S2CID 18688785 .
- Далби К.Н., Моррис Н., Каудвелл Ф.Б., Аверч Дж., Коэн П. (1998). «Идентификация регуляторных сайтов фосфорилирования в митоген-активируемой протеинкиназе (MAPK), активированной протеинкиназой-1А/p90RSK, которые индуцируются MAPK» . Дж. Биол. Химический 273 (3): 1496–505. doi : 10.1074/jbc.273.3.1496 . PMID 9430688 .
- Пуллен Н., Деннис П.Б., Анджелкович М., Дюфнер А., Козма С.К., Хеммингс Б.А., Томас Г. (1998). «Фосфорилирование и активация P70S6K с помощью PDK1». Наука . 279 (5351): 707–10. Bibcode : 1998sci ... 279..707p . doi : 10.1126/science.279.5351.707 . PMID 9445476 .
- Стивенс Л., Андерсон К., Стоко Д., Эрджиммент-Бромуж Х., Художник Г.Ф., Холмс А.Б., Гаффни П.Р., Риз К.Б., Маккормик Ф., Темпст П., Коадуэлл Дж., Хокинс П.Т. (1998). «Протеинкиназа B киназы, которые опосредуют фосфатидилинозитол 3,4,5-трисфосфат-зависимая активация протеинкиназы B». Наука . 279 (5351): 710–4. Bibcode : 1998sci ... 279..710S . doi : 10.1126/science.279.5351.710 . PMID 9445477 .
- Уокер К.С., Дик М., Патерсон А., Хадсон К., Коэн П., Алесси Д.Р. (1998). «Активация бета-изоформ протеинкиназы B и гамма с помощью инсулина in vivo и 3-фосфоинозитид-зависимой протеинкиназы-1 in vitro: сравнение с альфа-альтой протеинкиназы В» . Биохимия. Дж . 331 (Pt 1) (1): 299–308. doi : 10.1042/bj3310299 . PMC 1219352 . PMID 9512493 .
- Андерсон К.Е., Коадуэлл Дж., Стивенс Л.Р., Хокинс П.Т. (1998). «Транслокация PDK-1 в плазматическую мембрану важна для того, чтобы PDK-1 активировал протеинкиназу B» . Карт Биол . 8 (12): 684–91. Bibcode : 1998cbio .... 8..684a . doi : 10.1016/s0960-9822 (98) 70274-x . PMID 9637919 . S2CID 13936854 .
- Le Good Ja, Ziegler WH, Parekh DB, Alessi DR, Cohen P, Parker PJ (1998). «Изотипы протеинкиназы С, контролируемые фосфоинозитид-3-киназой через PDK1 протеинкиназы». Наука . 281 (5385): 2042–5. doi : 10.1126/science.281.5385.2042 . PMID 9748166 .
- Керри Р.А., Уокер К.С., Грей А., Дик М., Касамайор А., Даунс С.П., Коэн П., Алесси Д.Р., Лучк Дж. (1999). «Роль фосфатидилинозитола 3,4,5-трисфосфата в регуляции активности и локализации 3-фосфоинозитид-зависимой протеинкиназы-1» . Биохимия. Дж . 337 (Pt 3) (3): 575–83. doi : 10.1042/0264-6021: 3370575 . PMC 1220012 . PMID 9895304 .
- Кобаяши Т., Коэн П. (1999). «Активация сывороточной и глюкокортикоидной регулируемой протеинкиназы агонистами, которые активируют фосфатидилинозитид-3-киназу опосредуется 3-фосфоинозитидзависимой протеинкиназой-1 (PDK1) и PDK2» . Биохимия. Дж . 339 (Pt 2) (2): 319–28. doi : 10.1042/0264-6021: 3390319 . PMC 1220160 . PMID 10191262 .
- Balendran A, Casamayor A, Deak M, Paterson A, Gaffney P, Currie R, Downes CP, Alessi DR (1999). «PDK1 приобретает активность PDK2 в присутствии синтетического пептида, полученного из карбоксильного конца PRK2» . Карт Биол . 9 (8): 393–404. Bibcode : 1999cbio .... 9..393b . doi : 10.1016/s0960-9822 (99) 80186-9 . PMID 10226025 . S2CID 16473977 .
- Park J, Leong ML, Buse P, Maiyar AC, Firestone GL, Hemmings BA (1999). «Сывороточная и глюкокортикоидная индуцируемая киназа (SGK) представляет собой мишень сигнального пути, стимулированного PI 3-киназой» . Embo j . 18 (11): 3024–33. doi : 10.1093/emboj/18.11.3024 . PMC 1171384 . PMID 10357815 .
- Paradis S, Ailion M, Toker A, Thomas JH, Ruvkun G (1999). «Гомолог PDK1 необходим и достаточен для преобразования сигналов PI3-киназы AGE-1, которые регулируют диапаузу у Caenorhabditis elegans» . Гены Дев . 13 (11): 1438–52. doi : 10.1101/gad.13.11.1438 . PMC 316759 . PMID 10364160 .
- Casamayor A, Morrice NA, Alessi DR (1999). «Фосфорилирование Ser-241 необходимо для активности 3-фосфоинозитид-зависимой протеинкиназы-1: идентификация пяти сайтов фосфорилирования in vivo» . Биохимия. Дж . 342 (Pt 2) (2): 287–92. doi : 10.1042/0264-6021: 3420287 . PMC 1220463 . PMID 10455013 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- 3-фосфоинозитидзависимый+белок+киназа в Национальной библиотеке Медицинской библиотеки США ( Mesh)