Jump to content

Декарбоксилаза ароматических L -аминокислот

Декарбоксилаза ароматических L- аминокислот (декарбоксилаза ДОФА)
Ленточная диаграмма ДОФА-декарбоксилазы димера . [ 1 ]
Идентификаторы
Номер ЕС. 4.1.1.28
Номер CAS. 9042-64-2
Базы данных
ИнтЭнк вид IntEnz
БРЕНДА БРЕНДА запись
ЭксПАСи Просмотр NiceZyme
КЕГГ КЕГГ запись
МетаЦик метаболический путь
ПРЯМОЙ профиль
PDB Структуры RCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтология АмиГО / QuickGO
Поиск
PMCarticles
PubMedarticles
NCBIproteins

ДОФА-декарбоксилаза (декарбоксилаза ароматических L -аминокислот)
Гомодимер декарбоксилазы ароматических L-аминокислот, человека
Идентификаторы
Символ ДДК
ген NCBI 1644
HGNC 2719
МОЙ БОГ 107930
RefSeq НМ_000790
ЮниПрот P20711
Другие данные
Номер ЕС 4.1.1.28
Локус Хр. 7 п11
Искать
StructuresSwiss-model
DomainsInterPro

Декарбоксилаза ароматических L -аминокислот ( AADC или AAAD ), также известная как декарбоксилаза DOPA ( DDC ), триптофандекарбоксилаза и 5-гидрокситриптофандекарбоксилаза , представляет собой лиазный фермент ( EC 4.1.1.28 ), расположенный в области 7p12.2-p12. 1.

Механизм

[ редактировать ]

фермент использует пиридоксальфосфат (PLP), активную форму витамина B6 В качестве кофактора . PLP важен для механизма декарбоксилирования в AADC. В активном ферменте PLP связан с лизином -303 AADC в качестве основания Шиффа . субстрата При связывании субстрата Lys-303 замещается амином . Это помещает карбоксилат субстрата в активный центр так, что декарбоксилирование становится предпочтительным. Декарбоксилирование субстрата приводит к образованию хиноноидного промежуточного продукта, который впоследствии протонируется с образованием аддукта основания Шиффа PLP и декарбоксилированного продукта. Затем Lys-303 может регенерировать исходное основание Шиффа, высвобождая продукт, сохраняя при этом PLP. [ 2 ]

При исследовании декарбоксилирования, катализируемого PLP, было обнаружено, что pH между субстратами существует разница в концентрации и зависимости . ДОФА оптимально декарбоксилируется при рН 6,7 и концентрации ПЛП 0,125 мМ, тогда как условиями оптимального декарбоксилирования 5-HTP оказались pH 8,3 и 0,3 мМ ПЛП. [ 3 ]

Механизм декарбоксилазы ароматических L-аминокислот

Структура

[ редактировать ]

Декарбоксилаза ароматических L-аминокислот активна в виде гомодимера . До добавления кофактора пиридоксальфосфата апофермент существует в открытой конформации. При связывании кофактора происходит большая структурная трансформация, поскольку субъединицы сближаются и закрывают активный сайт. Это конформационное изменение приводит к образованию активной закрытой голофермента. [ 4 ]

моделях с дефицитом PLP На мышиных было замечено, что уровни дофамина существенно не отклоняются от образцов с добавлением PLP; однако концентрация серотонина в модели мозга с дефицитом была значительной. Этот переменный эффект дефицита PLP указывает на возможные изоформы AADC с различной субстратной специфичностью в отношении ДОФА и 5-HTP. Диализные исследования также показывают, что потенциальная изоформа, ответственная за декарбоксилирование ДОФА, имеет большую аффинность связывания с ПЛП, чем 5-HTP декарбоксилаза. [ 3 ]

Регулирование

[ редактировать ]

Регуляция AADC, особенно в отношении декарбоксилирования L-ДОФА, широко изучена. AADC имеет несколько консервативных сайтов узнавания протеинкиназы A (PKA) и протеинкиназы G , причем все остатки S220, S336, S359, T320 и S429 являются потенциальными акцепторами фосфата. Исследования in vitro подтвердили, что PKA и PKG могут фосфорилировать AADC, вызывая значительное увеличение активности. [ 5 ] [ 6 ] Кроме того, антагонисты дофаминовых рецепторов было показано, что повышают активность AADC на моделях грызунов, в то время как активация некоторых дофаминовых рецепторов подавляет активность AADC. [ 7 ] Такая регуляция, опосредованная рецептором, является двухфазной: за первоначальной кратковременной активацией следует долговременная активация. Считается, что краткосрочная активация происходит посредством активации киназы и последующего фосфорилирования AADC, тогда как чувствительность долгосрочной активации к ингибиторам трансляции белков предполагает регуляцию транскрипции мРНК . [ 8 ]

AADC катализирует несколько различных декарбоксилирования : реакций [ 9 ]

Однако некоторые из этих реакций, по-видимому, не имеют большого или какого-либо биологического значения. Например, гистамин биосинтезируется строго с помощью фермента гистидиндекарбоксилазы у людей и других организмов. [ 10 ] [ 11 ]

Путь биосинтеза серотонина человека

Клиническая значимость

[ редактировать ]

При нормальном синтезе нейротрансмиттеров дофамина и серотонина (5-НТ) AADC не является лимитирующей стадией ни в одной из реакций. Однако AADC становится лимитирующей стадией синтеза дофамина у пациентов, получающих L -ДОФА (например, при болезни Паркинсона ), и лимитирующей стадией синтеза серотонина у людей, получающих 5-HTP (например, при легкой депрессии или дистимия ). [ нужна ссылка ] AADC ингибируется карбидопой за пределами гематоэнцефалического барьера , чтобы ингибировать преждевременное превращение L -ДОФА в дофамин при лечении болезни Паркинсона .

У людей AADC также является ферментом, лимитирующим скорость образования следовых аминов . Дефицит декарбоксилазы ароматических L-аминокислот связан с различными симптомами, такими как тяжелая задержка развития, глазные кризы и вегетативная дисфункция. Молекулярный и клинический спектр дефицита AAAC неоднороден. Первый случай дефицита AADC был описан у братьев-близнецов в 1990 году. Пациентов можно лечить агонистами дофамина , ингибиторами МАО и пиридоксином ( витамином B6 ) . [ 15 ] Клинический фенотип и ответ на лечение варьируются, а долгосрочные и функциональные результаты неизвестны. Чтобы обеспечить основу для улучшения понимания эпидемиологии, корреляции генотип-фенотип и исходов этих заболеваний, их влияния на качество жизни пациентов, а также для оценки диагностических и терапевтических стратегий, некоммерческой Международной рабочей группой по Расстройства, связанные с нейротрансмиттерами (iNTD). [ 16 ]

Иммуногистохимические исследования показали, что AADC экспрессируется в различных типах нейрональных клеток, таких как серотонинергические и катехоламинергические нейроны. Нейроны, которые экспрессируют AADC, но не считаются классическими моноаминергическими клеточными нейронами, называются D-клетками. Клетки, иммунореактивные в отношении AADC, также были обнаружены в стволе мозга человека . Эти клетки включают пигментированные меланином клетки, которые обычно обозначаются как катехоламинергические, а также могут быть серотонинергическими. Сообщается о значительной локализации дофаминергических клеток, которые также иммунореактивны в отношении AADC, в черной субстанции , вентральной покрышке и мезэнцефалической ретикулярной формации . В отличие от предыдущих отчетов о моделях на животных, неаминергические (D-клетки) вряд ли будут наблюдаться в человеческом мозге. [ 17 ]

Генетика

[ редактировать ]

Ген , кодирующий фермент, называемый DDC, расположен на хромосоме 7 у человека. [ 18 ] Он состоит из 15 экзонов, кодирующих белок из 480 аминокислот . [ 19 ] Однонуклеотидные полиморфизмы и другие вариации генов были исследованы в связи с нервно-психическими расстройствами , например, делеция одной пары оснований в положении 601 и делеция пары четырех оснований в экзоне 1 в отношении биполярного расстройства. [ 20 ] и аутизм . Никакой прямой корреляции между вариациями генов и аутизмом обнаружено не было. [ 21 ]

Более 50 мутаций DDC коррелируют с дефицитом AADC. [ 22 ] Это состояние наиболее распространено в Азии, предположительно из-за эффекта основателя . [ 23 ]

Были обнаружены альтернативные события и промоторы сплайсинга , которые приводят к различным формам фермента AADC. Уникальное использование определенных промоторов приводит к транскрипции только первого экзона с образованием вненейрональной изоформы , а сплайсинг экзона 3 приводит к образованию продукта, лишенного ферментативной активности. Анализы образцов свиней выявили две изоформы AADC – возникшие в результате исключения экзона 5 и экзонов 5 и 6 – у которых отсутствует часть декарбоксилирующего домена. [ 19 ]

См. также

[ редактировать ]
  1. ^ PDB : 1JS3 ; Буркхард П., Доминичи П., Борри-Вольтатторни С., Янсониус Ю.Н., Малашкевич В.Н. (ноябрь 2001 г.). «Структурное понимание лечения болезни Паркинсона с помощью ингибированной лекарственными средствами декарбоксилазы ДОФА». Структурная биология природы . 8 (11): 963–7. дои : 10.1038/nsb1101-963 . ПМИД   11685243 . S2CID   19160912 .
  2. ^ Бертольди М. (март 2014 г.). «Дофа-декарбоксилаза млекопитающих: структура, каталитическая активность и ингибирование». Архив биохимии и биофизики . 546 : 1–7. дои : 10.1016/j.abb.2013.12.020 . ПМИД   24407024 .
  3. ^ Перейти обратно: а б Сиоу Ю.Л., Дакшинамурти К. (1985). «Влияние дефицита пиридоксина на декарбоксилазу ароматических L-аминокислот в мозге взрослых крыс». Экспериментальное исследование мозга . 59 (3): 575–81. дои : 10.1007/BF00261349 . ПМИД   3875501 . S2CID   22286973 .
  4. ^ Джардина Дж., Монтиоли Р., Джанни С., Челлини Б., Пайардини А., Вольтатторни CB, Катруццола Ф (декабрь 2011 г.). «Открытая конформация декарбоксилазы ДОФА человека раскрывает механизм присоединения PLP к декарбоксилазам группы II» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 108 (51): 20514–9. Бибкод : 2011PNAS..10820514G . дои : 10.1073/pnas.1111456108 . ПМК   3251144 . ПМИД   22143761 .
  5. ^ Дюшемен А.М., Берри М.Д., Нефф Н.Х., Хаджиконстантину М. (август 2000 г.). «Фосфорилирование и активация декарбоксилазы ароматических L-аминокислот мозга циклической AMP-зависимой протеинкиназой». Журнал нейрохимии . 75 (2): 725–31. дои : 10.1046/j.1471-4159.2000.0750725.x . ПМИД   10899948 . S2CID   19636477 .
  6. ^ Дюшемен А.М., Нефф Н.Х., Хаджиконстантину М. (июль 2010 г.). «Фосфорилирование и активация декарбоксилазы ароматических L-аминокислот с помощью PKGIalpha in vitro». Журнал нейрохимии . 114 (2): 542–52. дои : 10.1111/j.1471-4159.2010.06784.x . ПМИД   20456015 . S2CID   205622115 .
  7. ^ Хаджиконстантину М., Нефф Н.Х. (2008). «Усиление активности декарбоксилазы ароматических L-аминокислот: значение лечения L-ДОФА при болезни Паркинсона» . Нейронауки и терапия ЦНС . 14 (4): 340–51. дои : 10.1111/j.1755-5949.2008.00058.x . ПМК   6494005 . ПМИД   19040557 .
  8. ^ Берри, доктор медицины, Хуорио А.В., Ли К.М., Бултон А.А. (сентябрь 1996 г.). «Декарбоксилаза ароматических L-аминокислот: забытый и неправильно понятый фермент». Нейрохимические исследования . 21 (9): 1075–87. дои : 10.1007/BF02532418 . ПМИД   8897471 . S2CID   19823573 .
  9. ^ «ААДК» . База данных метаболома человека . Проверено 17 февраля 2015 г.
  10. ^ Хуан Х, Ли Ю, Лян Дж, Финкельман Ф.Д. (2018). «Молекулярная регуляция синтеза гистамина» . Границы в иммунологии . 9 : 1392. arXiv : 1802.02540 . дои : 10.3389/fimmu.2018.01392 . ПМК   6019440 . ПМИД   29973935 .
  11. ^ Чикава А., Танака С. (2012). «Биосинтез и функция гистамина». ЭЛС . Американское онкологическое общество. дои : 10.1002/9780470015902.a0001404.pub2 . ISBN  9780470015902 .
  12. ^ Бродли К.Дж. (март 2010 г.). «Сосудистые эффекты следовых аминов и амфетаминов». Фармакология и терапия . 125 (3): 363–375. doi : 10.1016/j.pharmthera.2009.11.005 . ПМИД   19948186 .
  13. ^ Линдеманн Л., Хонер MC (май 2005 г.). «Ренессанс следовых аминов, вдохновленный новым семейством GPCR». Тенденции в фармакологических науках . 26 (5): 274–281. дои : 10.1016/j.tips.2005.03.007 . ПМИД   15860375 .
  14. ^ Ван X, Ли Дж, Донг Дж, Юэ Дж (февраль 2014 г.). «Эндогенные субстраты CYP2D мозга». Европейский журнал фармакологии . 724 : 211–218. дои : 10.1016/j.ejphar.2013.12.025 . ПМИД   24374199 .
  15. ^ Понс Р., Форд Б., Чирибога К.А., Клейтон П.Т., Хинтон В., Хайланд К., Шарма Р., Де Виво, округ Колумбия (апрель 2004 г.). «Дефицит декарбоксилазы ароматических L-аминокислот: клинические особенности, лечение и прогноз». Неврология . 62 (7): 1058–65. дои : 10.1212/WNL.62.7.1058 . ПМИД   15079002 . S2CID   12374358 .
  16. ^ «Реестр пациентов» .
  17. ^ Китахама К., Икемото К., Жуве А., Аранеда С., Нагацу И., Рейно Б. и др. (октябрь 2009 г.). «Имунореактивные структуры декарбоксилазы ароматических L-аминокислот в среднем мозге, мосту и продолговатом мозге человека». Журнал химической нейроанатомии . 38 (2): 130–40. doi : 10.1016/j.jchemneu.2009.06.010 . ПМИД   19589383 . S2CID   20759513 .
  18. ^ Шерер Л.Дж., Макферсон Дж.Д., Васмут Дж.Дж., Марш Дж.Л. (июнь 1992 г.). «Дофа-декарбоксилаза человека: локализация на хромосоме 7p11 человека и характеристика кДНК печени» . Геномика . 13 (2): 469–71. дои : 10.1016/0888-7543(92)90275-W . ПМИД   1612608 . S2CID   37950853 .
  19. ^ Перейти обратно: а б Блехингберг Дж., Холм И.Е., Йохансен М.Г., Борглум А.Д., Нильсен А.Л. (январь 2010 г.). «Профилирование экспрессии декарбоксилазы ароматических L-аминокислот и обнаружение изоформ в развивающемся мозге свиньи». Исследования мозга . 1308 : 1–13. дои : 10.1016/j.brainres.2009.10.051 . ПМИД   19857468 . S2CID   8292103 .
  20. ^ Борглум А.Д., Бруун Т.Г., Кьельдсен Т.Е., Эвальд Х., Морс О., Киров Г. и др. (ноябрь 1999 г.). «Два новых варианта гена декарбоксилазы ДОФА: связь с биполярным аффективным расстройством» . Молекулярная психиатрия . 4 (6): 545–51. дои : 10.1038/sj.mp.4000559 . ПМИД   10578236 .
  21. ^ Лауритсен М.Б., Борглум А.Д., Бетанкур С., Филипп А., Крузе Т.А., Лебойер М., Эвальд Х. (май 2002 г.). «Исследование двух вариантов гена ДОФА-декарбоксилазы у больных аутизмом» . Американский журнал медицинской генетики . 114 (4): 466–70. дои : 10.1002/ajmg.10379 . ПМЦ   4826443 . ПМИД   11992572 .
  22. ^ Вассенберг Т., Молеро-Луис М., Йельч К., Хоффманн Г.Ф., Ассманн Б., Блау Н. и др. (январь 2017 г.). «Консенсусное руководство по диагностике и лечению дефицита декарбоксилазы ароматических L-аминокислот (AADC)» . Сиротский журнал редких заболеваний . 12 (1): 12. дои : 10.1186/s13023-016-0522-z . ПМК   5241937 . ПМИД   28100251 .
  23. ^ Ли Х.Ф., Цай Ч.Р., Чи К.С., Чанг Т.М., Ли Х.Дж. (март 2009 г.). «Дефицит декарбоксилазы ароматических L-аминокислот на Тайване». Европейский журнал детской неврологии . 13 (2): 135–40. дои : 10.1016/j.ejpn.2008.03.008 . ПМИД   18567514 .
[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 1c4f4fad93ba44bc9ae8d0d26628ead3__1708700700
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/1c/d3/1c4f4fad93ba44bc9ae8d0d26628ead3.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Aromatic L-amino acid decarboxylase - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)