Хромосома 1
Хромосома 1 | |
---|---|
![]() Человеческая хромосома 1 пара после G-Banding . Один из матери, один от отца. | |
![]() Хромосома 1 пара У человеческой кариограммы . | |
Функции | |
Длина ( bp ) | 248 387 328 п.н. (CHM13) |
Количество генов | 1961 ( CCD ) [ 1 ] |
Тип | Автосом |
Центромерная позиция | Метацентрический [ 2 ] (123,4 млн. Мбит [ 3 ] ) |
Полные генные списки | |
КПК | Генный список |
HGNC | Генный список |
Uniprot | Генный список |
NCBI | Генный список |
Внешняя карта зрителей | |
Набор | Хромосома 1 |
Входить | Хромосома 1 |
NCBI | Хромосома 1 |
UCSC | Хромосома 1 |
Полные последовательности ДНК | |
Refseq | Nc_000001 ( исправлена ) |
Genbank | CM000663 ( исправлен ) |
Хромосома 1 является обозначением крупнейшей хромосомы человека . У людей есть две копии хромосомы 1, как это делают со всеми аутосом , которые являются не половыми хромосомами . Хромосома 1 охватывает около 249 миллионов пар нуклеотидных оснований , которые являются основными единицами информации для ДНК . [ 4 ] Он составляет около 8% от общей ДНК в клетках человека. [ 5 ]
Это была последняя завершенная хромосома, секвенированная через два десятилетия после начала проекта генома человека .
Гены
[ редактировать ]Количество генов
[ редактировать ]Ниже приведены некоторые оценки количества генов хромосомы человека 1. Поскольку исследователи используют различные подходы к аннотации генома, их прогнозы количества генов на каждой хромосоме варьируются (для технических деталей см. Прогнозирование генов ). Среди различных проектов проект совместной консенсусной последовательности кодирования ( CCDS ) принимает чрезвычайно консервативную стратегию. Таким образом, прогноз числа генов CCDS представляет собой более низкую границу общего числа генов, кодирующих белок человека. [ 6 ]
Оценивается по | Гены кодирования белка | Некодирующие гены РНК | Псевдогены | Источник | Дата выпуска |
---|---|---|---|---|---|
КПК | 1,961 | — | — | [ 1 ] | 2016-09-08 |
HGNC | 1,993 | 707 | 1,113 | [ 7 ] | 2017-05-12 |
Набор | 2,044 | 1,924 | 1,223 | [ 8 ] | 2017-03-29 |
Uniprot | 2,064 | — | — | [ 9 ] | 2018-02-28 |
NCBI | 2,093 | 1,790 | 1,426 | [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] | 2017-05-19 |
Генный список
[ редактировать ]Ниже приведен частичный список генов на хромосоме человека. 1. Полный список см. Ссылку в Infobox справа.
- C1ORF112 : Кодирующая белковая хромосома 1 Рамка открытого считывания 112
- C1ORF127 : Кодирующая белковая хромосома 1 Рамка открытого считывания 127
- C1ORF27 : кодирование белковой хромосомы 1 Рамка открытого считывания 27
- C1ORF38 : Кодирующая белковая хромосома 1 Рамка открытого считывания 38
- CCDC181 : Кодирующий белок, содержащий белок, содержащий белок 181.
- Denn1b : предположительно, чтобы быть связанным с астмой
- FHAD1 : Кодирующий домен, связанный с белком, содержащий белок 1
- LOC100132287 : нехарактеризованный белок
- LRRIQ3 : кодирующий белок, богатый лейцином, повторения и мотива IQ, содержащий 3
- Член семейства Шиса 4 : Кодирование белкового члена семьи Шиса 4
- Tinagl1 : кодирующий белок тубулоинтерстициальный нефрит антигенподобный
P-Arm
[ редактировать ]Частичный список генов, расположенных на P-Arm (короткая рука) человеческой хромосомы 1:
- AADACL3 : арилацетамид деацетилазоподобный 3
- AADACL4 : арилацетамид деацетилазоподобный 4
- Acadm : ацил-кофермент дегидрогеназа, C-4 до C-12 Прямой цепи
- Actg1p6 : кодирующий белковый актин, гамма 1 псевдог 6
- Actl8 : актин-подобный 8
- ADGRL2 (1P31.1): рецептор, связанный с протеином, адгезия G-белок L2
- ADPRHL2 : поли (АДФ-рибоза) гликогидролаза ARH3
- AMPD2 : кодирование фермента Amp Deaminase 2
- Arid1a (1p36)
- ATXN7L2 : атаксин 7-подобный 2
- Азин2 : ингибитор 2 -энзим -антизима (AZI2), также известный как аргинин -декарбоксилаза (ADC)
- BCAS2 : Амплифицированная рак молочной железы.
- Bcl10 (1p22)
- LRIF1 : кодирующий белковой лиганд-зависимый фактор-интерезатор ядерного рецептора 1
- C1ORF109 : хромосома 1 рамка открытого считывания 109
- C1ORF162 : Кодирующая белковая хромосома 1 Рамка открытого считывания 162
- C1ORF194 : кодирование белковой хромосомы 1 Рамка открытого считывания 194
- Czib : хромосома 1 рамка открытого считывания 123
- Cachd1, кодирующий домен белкового кэша, содержащий 1
- CAMK2N1 : кодирующий белок кальций/кальмодулин -зависимый ингибитор протеинкиназы 1
- CAMTA1 (1P36)
- CASP9 (1P36)
- Casz1 (1p36): Castor Zinc Finger 1
- CCDC17 : Кодирующий белковый домен с катушкой, содержащий 17
- CCDC18 : Кодирующий белковый домен с виновой катушкой, содержащий 18
- CEP85 : Кодирующий белок центросомный белок 85
- CFAP74 : кодирование белковых ресничек и ассоциированного белка 74
- CHD5 (1P36)
- CLIC4 (1P36)
- CLSPN (1P34)
- CMPK : киназа UMP-CMP
- Col16a1 (1p35)
- COL11A1 : коллаген, тип XI, альфа 1
- CPT2 : карнитин пальмитоилтрансфераза II
- Cryz : Crystallin Zeta
- CSDE1 : домен холодного шока, содержащий E1
- CYP4B1 (1P33)
- Cyr61 (1p22)
- DBT : дигидролипоамид разветвленная цепная трансацилаза E2
- DCLRE1B : ДНК-поперечная репарация 1B
- DEPDC1 Кодирующий домен DEP -белок, содержащий 1
- Diras3 (1p31): семейство Diras, GTP-связывающий Ras-подобные 3
- Disp3 : Кодирование белка, отправленное членом семейства RND Transporter 3
- DNASE2B : кодирующий белок дезоксирибонуклеаза 2 бета
- DPH5 : дифтиновая синтаза
- DVL1 (1P36)
- En1 (1p36)
- Epha2 (1p36)
- EPS15 (1P32)
- ESPN : Espin (аутосомная рецессивная глухота 36)
- EVI5 : Экотропная сайт вирусной интеграции 5
- EXO5 : кодирование белковой экзонуклеазы 5
- Extl1 : экзостозин, как гликозилтрансфераза 1
- Extl2 : экзостозин, как гликозилтрансфераза 2
- Детали : жирная амидная гидролаза 1 жирная кислота 1
- FAM46B : Семейство с сходством последовательностей 46, член B
- FAM46C : Семейство с сходством последовательностей 46, член C
- FAM76A : Семейство с сходством последовательностей 76, член A
- FAM87B : Кодирование семейства белков с сходством последовательностей 87 Член B
- FBXO2 : F-box белок 2
- FNBP1L- кодирующий белок -связывающий белок 1-подобный
- FPGT : Fucose-1-фосфат гуанлилтрансфераза
- Fubp1 (1p31)
- Гейл : UDP-галактозо-4-эпимераза
- GADD45A (1P31)
- GBP1 (1P22)
- GBP2 : Guanylate Binding Bletin 2
- GBP5 Кодирующий белок -связывающий белок 5
- GBP6 : кодирующий белок гуанилат -связывающий белок.
- GJB3 : белок разрывов, бета 3, 31 кДа (коннексин 31)
- GLMN (1P22)
- GNL2 : G белок нуклеолок 2
- GSTM1 (1P13)
- GUCA2B : кодирующий белок гуанилат -циклаза активатор 2b
- HDAC1 (1P35)
- HES2 : HES Family BHLH Транскрипционный фактор 2
- HES3 : HES Family BHLH Транскрипционный фактор 3
- HMGCL : 3-гидроксиметил-3-метилглютарил-кофермент аиза (гидроксиметилглютарикацидурия)
- HAO2 Кодирующий белок гидроксиацид оксидаза 2
- HMGCS2 : 3-гидрокси-3-метилглютарил-COA синтаза 2
- HP1BP3 : гетерохроматин белок 1, связывающий белок 3
- IFI6 : интерферон альфа-индуцируемый белок 6
- IL22R1 (1P36)
- INTS11 : комплексная субъединица интегратора 11
- Jak1 (1p31)
- Jun (1p32)
- Kank4 : кодирование белка KN Motif и Ankyrin Repeat Domains 4
- KCNQ4 : Главный канал калиевого напряжения, подсемейство, подобное KQT, член 4
- KIF1B : член семьи Кинезин 1B
- L1TD1 : транспозазовый домен типа Line-1, содержащий 1
- LCK (1P35)
- LINC01137 : кодирующий белок длинный межгенный небетральный кодирующий РНК 1137
- LRRC39 : богатый лейцином повторный белок 39
- LRRC40 : богатый лейцином повторный белок 40
- LRRC41 : богатый лейцином повторный белок 41
- LRRC8D : богатый лейцином повторный белок 8D
- Maco1 : кодирующий белок трансмембранного белка 57
- MAN1A2 : Маннозил-Олигосахарид 1,2-Альфа-Маннозидаза IB
- MAP3K6 : кодирующий белок-митоген-активированный протеинкиназа-киназа-киназа 6
- MEF6 : MySt/ESA1 связан с фактором 6
- MCR : Trans-2-enoyl-Coa Reduceese, Mycchondrial
- MFAP2 : микрофибриллярное белок 2
- Mib2 (1p36)
- Mier1 (1p31)
- Miga1 : кодирующий белок митогуардин 1
- Mfn2 : митофузин 2
- MFSD2 : основной домен суперсемейства, содержащий 2A, содержащий 2A
- MiR6079 : микроРНК 6079
- MMEL1 : мембранная металло-эндопептидаза-подобная 1
- MTFR1L : Регулятор деления митохондриального деления 1
- MTHFR (1P36): 5,10-метилентетрагидрофолатредуктаза (NADPH)
- MUL1 : Митохондриальный белок убиквитина E3 E3
- Mutyh (1p34): гомолог Muty (E. coli)
- NBPF3 : Нейробластома -точка второго члена семьи 3.
- NDUFA4P1 : кодирующий белок NADH дегидрогеназа (убихинон) 1 Альфа -субкомплекс, 4, 9 кДа, псевдоген 1
- NGF : фактор роста нерва
- NOL9 : нуклеолярный белок 9
- Пакет (1p13)
- Notch2 (1p12)
- Olfml3 : olfactomedin-подобный 3
- OMA1 : металлуендопептидаза OMA1, митохондриальный
- OVGP1 : яйцеклет -гликопротеин 1
- Park7 (1P36): болезнь Паркинсона (аутосомно -рецессивный, ранний начало) 7
- Pink1 : PTEN, индуцированная предполагаемой киназой 1
- Plod1 : Procollagen-Lysine 1, 2-оксоглутарат 5-диоксигеназа 1
- PRAMEF10 : Кодирование белкового праме члена семейства 10
- PRMT6 : белок -аргинин метилтрансфераза 6
- PRXL2B : кодирующий белок пероксиарсиноксин как 2b
- PSRC1 : пролин/серин, богатый белком 1, белок 1
- RAD54L : RAD54-подобный
- Rap1a (1p13)
- RBM15 (1p13)
- RCC2 : регулятор конденсации хромосом 2
- Reg4 (1p12)
- Rhbdl2 : romboid, как 2
- Rhoc (1p13)
- RIMS3 : кодирующий белок, регулирующий синаптическую мембрану экзоцитоз 3
- RLF : перестройка L-Myc Fusion
- RNF11 (1P32)
- RNF19B : кодирующий белок белок с белком 19b
- Rnf220 : белок без рукава 220
- RPA2 (1P35)
- RSPO1 (1P34)
- S100A1 (1Q21)
- SAMD11 : кодирующий белок стерильный домен альфа -мотива, содержащий 11
- SDC3 : Syndecan-3
- SDHB (1P36)
- SFPQ (1P34): кодирующий белок сплайсинг фактор пролина и глютамина богатый
- SGIP1 : SH3-домен GRB2-подобный белок 3-интернационный белок 1
- SH3BGRL3 : SH3-связывающий домен глютаминовой кислоты, богатый белком 3
- SLC16A1 (1P13)
- SLC2A1 Glucose Transporter 1
- SPSB1 : Spry Domain-содержащий Socs Box Protein 1
- Стиль (1p33)
- SYCP1 : синаптотемальный комплекс белок 1
- SZT2 : порог захвата 2 гомолог
- TACSTD2 : Ассоциированный опухолью кальциевый сигнал.
- Tal1 (1p33)
- TCTEX1D4 : кодирующий домен белка TCTEX1, содержащий 4
- TCEB3 : Коэффициент удлинения транскрипции B Полипептид 3
- TGFBR3 (1P22)
- Thrap3 (1p34)
- TIE1 (1P34)
- TM2D1 : кодирующий домен белка TM2, содержащий 1
- TMCO2 : кодирующий белок трансмембранные и спиральные домены 2
- TMCO4 : кодирующий белок трансмембранные и спиральную камеру домены 4
- TMEM48 : кодирующий белок нуклеопорин NDC1
- TMEM50A : трансмембранное белок 50A
- TMEM59 : трансмембранный белок 59
- TMEM69 : трансмембранный белок 69
- TMEM201 Кодирующий белок трансмембранный белок 201
- TMEM222 : трансмембранный белок 222
- TOE1 : мишень белка EGR1 1
- TRABD2B : кодирующий домен белка, содержащий 2b
- TRAPPC3 : Комплекс белковой частицы.
- TRIT1 : тРНК изопененилтрансфераза, митохондриальный
- TSHB : щитовидная железа, стимулирующая гормон, бета
- TTC39A : тетратропептидный повтор 39A
- UBR4 : E3 Ubiquitin-протеиновая лигаза компонент N-Recognin 4
- Урод : уропорфириноген декарбоксилаза (ген для порфирии Cutanea tarda )
- USP1 (1P31)
- USP48 : убиквитин карбоксил-концевая гидролаза 48
- Vav3 (1p13)
- VPS13D : белок, связанный с сортировкой вакуолярного белка, 13D
- Vtcn1 (1p13)
- Wars2 : триптофанил-тРНК-синтетаза, митохондриальный
- WDR77 (1P13)
- YBX1 (1P34)
- ZCCCHC17 : цинковой пальцы CCHC-тип, содержащий 17
- ZFP69 : кодирующий белок ZFP69 цинковой белок пальцев
- ZMYM1, кодирующий белок цинкового пальца Mym-тип, содержащий 1
- Znf436 : белок цинкового пальца 436
- Znf684 : кодирующий белок цинкового пальца 684
- Zyg11b Кодирующий белок Zyg-11 член семейства B, регулятор клеточного цикла
- ZZZ3 : ZZ-тип цинковой пальцы, содержащий белок 3
Q-ARM
[ редактировать ]Частичный список генов, расположенных на Q-Arm (длинная рука) хромосомы человека 1:
- ABL2 (1Q25)
- Adipor1 (1q32)
- AHCTF1 : кодирование белка эли
- Act3 (1q43-44)
- Angptl1 : связанный с ангиопоэтином белок 1
- Arhgef2 (1q22)
- ARID4B : кодирующий белок AT-богатый интерактивный домен, содержащий белок 4B
- ARV1, кодирующий белок ARV1 гомолог (S. cerevisiae)
- Arnt (1q21)
- ASPM (1Q31): определяющая среда размер мозга
- ATF3 (1q32)
- ATP2B4 (1Q32)
- Bcl9 (1q21)
- Catspere : кодирование белкового канала Catsper Вспомогательная субъединица Epsilon
- C1ORF21 : хромосома 1 рамка открытого считывания 21
- MMTAP2, кодирующий белок , ассоциированный с опухолью миеломы белок 2
- TEX35 : TEX35
- C1ORF74 : хромосома 1 открытая рамка считывания 74
- C2CD4D : C2 кальций-зависимый домен, содержащий 4D 4D
- CTSS: катепсин с
- CD5L : молекула CD5
- Cenpl : Centromere белок L
- Cenpf (1q41)
- CHTOP : хроматин -мишень PRMT1
- CNIH4 : Cornichon Homolog 4
- CNST : Консорсин
- CREG1 : клеточный репрессор E1A стимулированных генов 1
- CRP : C-реактивный белок
- CRTC2 (1Q21)
- CSRP1 : цистеин и глициновый белок 1
- DCAF8 : кодирующий белок DDB1 и CUL4, связанный с фактором 8
- DDX59 : Dead Box Helicase 59
- DEL1Q21 : Кодирующий белок -хромосома 1q21.1 Синдром делеции
- DPT : Dermatopontin
- DISC2 , длинная некодирующая РНК
- DNAH14 Кодирующий белок динеин, аксонемал, тяжелая цепь 14
- Dusp10 (1q41)
- DUSP27 : кодирующий белок двойной специфичности фосфатазы 27 (предполагаемое)
- ECM1 (1Q21)
- EDEM3 : ER, усиливающая альфа-маннозидазу, как белок 3
- Egln1 (1q42)
- ELF3 : кодирующий белок E74, как транскрипционный фактор ETS 3
- Эна (1q42)
- ESRRG (1Q41)
- FAM129A : Семейство с сходством последовательностей 129, член A
- FAM163A : Кодирующий секреторный белок, полученный из белковой нейробластомы
- FAM20B : FAM20B, гликозаминогликановый ксилозилкиназо
- FAM63A : Семейство с сходством последовательностей 63, член A
- FAM78B : Семейство с сходством последовательностей 78, член B
- FAM89A : кодирование белка FAM89A
- FBXO28 : F-box белок 28
- FCMR : FC -фрагмент рецептора IgM
- Fcgr2b (1q23)
- FCGR2C : кодирующий фрагмент белка FC рецептора IgG IIC (ген/псевдоген)
- FH (1q43): Fumarase
- FLAD1 : кодирующий белок флавин аденин -динуклеотид -синтетаза 1
- FLG-AS1 : кодирующий белок FLG антисмысловая РНК 1
- FMO3 : Flavin, содержащий монооксигеназу 3
- FRA1J, кодирующий белок, хрупкий сайт, 5-азицитидин, общий, FRA (1) (Q12)
- G0S2 : кодировка переключателя G0/G1 2
- Газ5 (1q25)
- GBA : глюкозидаза, бета; Кислота (включает глюкозилцеромидазу) (ген для болезни Гоше )
- GBAP1 : глюкозилцеромидаза бета -псевдоген 1
- GLC1A : ген для глаукомы
- GON4L : GON-4
- GPA33 (1Q24)
- GPR37L1 G-белок-связанный рецептор 37 как 1
- H3C13 : кодирующий белок гистоновый кластер 2 H3 Член семейства D D
- Heart1 : тепловой повтор, содержащий белок 1
- HFE2 : гемохроматоз типа 2 (несовершеннолетний)
- Hist2h2ab : гистон 2а тип 2-b
- Hist2h2bf : гистон H2B тип 2-F
- HIST2H3PS2 : гистоновый кластер 2, H3, псевдоген 2
- Hist3h2a : гистон H2A тип 3
- HIST3H2BB : гистон H2B Тип 3-B
- HRM2 : волосы, кудрявые
- IGSF8 (1q23)
- Инава : белок активатора врожденного иммунитета
- INTS3 : комплекс интегратора субъединицы 3
- IRF2BP2 : кодирующий белок -интерферон регуляторный фактор 2, связывающий белок 2
- IRF6 : ген для соединительной ткани формирования
- KCNH1 (1Q32)
- KIF14 (1q32)
- Lefty1 : коэффициент определения левого направления 1
- LHX9 Кодирующий белок LIM Homeobox 9
- Lmnns : Lemin A / C
- LMOD1 : кодирующий белок лейомодин 1
- LOC645166 Кодирующий белок- лимфоцит-специфический белок 1 псевдоген
- Lyplal1 : лизофосфолипаза, похожая на 1
- Mapkapk2 (1q32)
- MIR194-1 : микроРНК 194-1
- MiR5008 : микроРНК 5008
- MPC2 : митохондриальный пируватный носитель 2
- MOSC1 : Moco Sulphurase C-концевой домен, содержащий 1
- MOSC2 : MOSC Domain-содержащий белок 2, митохондриальный
- MPZ : миелиновый белок нулевой (charcot -marie -tooth невропатия 1b)
- MSTO1 : Мисато 1
- MTR : 5-метилтетрагидрофолат-гомоцистеин метилтрансферазаза
- NAV1 : Neuron Navigator 1
- NBPF16 : Семейство точек остановок нейробластомы, член 16
- NOC2L : гомолог белка 2 нуклеолярного комплекса 2
- Nucks1 : ядерный вездесущий казеин и циклин-зависимые киназы субстрат
- NVL : ядерный валозинсодержащий белок-подобный
- Olfml2b : olfactomedin-подобный 2b
- OPTC : Opticin
- OTUD7B : OTU-домен, содержащий белок 7b
- Пакер, кодирующий белок PTGS2 антисмысловый NFKB1-опосредованный регулятор экспрессии РНК
- PBX1 (1Q23)
- PEA15 (1Q23)
- PGDB5 : Piggybac Transposable Element, полученный 5
- PIAS3 (1q21)
- PI4KB : фосфатидилинозитол 4-киназа бета
- PIP5K1A (1Q21): фосфатидилинозитол-4-фосфат 5-киназа Альфа-1
- Pla2g4a (1q31)
- PPOPES : протопорфириноген оксидаза
- PRCC (1Q23)
- PRR9 Кодирующий белок пролин богатый 9
- PSEN2 (1Q42): презенилин 2 (болезнь Альцгеймера 4)
- Ptgs2 (1q31)
- Ptpn14 (1q32-41)
- Ptpn7 (1q32)
- Рабиф : Раб взаимодействующий фактор
- Rassf5 (1q32)
- RGS2 (1q31)
- RN5S1@ : RNA, 5S RIBOSOMAL 1Q42 кластер
- RPS27 (1q21)
- SCAMP3 : Мембранный белок 3-го, ассоциированного с секреторным носителем
- SDHC (1Q23)
- Sele (1q24)
- SFT2D2 : домен кодирования белка SFT2, содержащий 2
- SHC1 (1Q21)
- SHCBP1L : кодирование белка связывание SHC и связанное с шпинделем 1 подобно
- SLC30A10 : Кодирование белкового растворенного семейства носителей 30 Участник 10 10
- SLC39A1 (1Q21)
- SLC50A1 : Семейство растворенных перевозчиков 50 Член 1
- SMCP : ассоциированный митохондриальный белок, богатый митохондриальным цистеином
- SMG7 : бессмысленный фактор распада мРНК
- SMYD3 (1q44)
- SPG23
- Sprr1a : Cornifin-A
- SPRR1B : Cornifin-B
- SPRR2A : маленький пролиновый белок 2а, богатый пролином
- Sprtn : Спартанский
- TARBP1 : взятие (ВИЧ-1) РНК-связывающий белок 1
- TBCE : специфичный для тубулина шаперон E
- THBS3 : тромбоспондин 3
- TMCO1 : трансмембранная и спиральная доменная домен, содержащий белок 1
- TMEM9 : трансмембранный белок 9
- TMEM63A : трансмембранный белок 63A
- TMEM81 : трансмембранный белок 81
- TNFAIP8L2 : кодирование TNF альфа -индуцированного белка 8 подобно 2
- TNFSF18 (1Q25)
- TNNT2 : сердечный тропонин T2
- TOR1AIP1 : протеин 1-в-торсин-1A
- TOR3A : кодирование белкового турсина семейства 3 члена A
- TP53BP2 (1Q41)
- TRE-CCTC1-5 : перенос РНК-GLU (CTC) 1-5
- UAP1 : UDP-N-ацетилгексозамин пирофосфорилаза
- USH2A : Синдром Ашер 2A (аутосомно -рецессивный, мягкий)
- USF1 (1Q23)
- VANGL2 : кодирующий белок белок -полярность белка Вангл белок 2
- VPS45 : белок, связанный с сортировкой вакуолярного белка 45
- VPS72 : белок 72 вакуолярного белка.
- Yy1ap1 : yy1-ассоциированный белок 1
- ZBED6 : цинковый палец, тип кровати, содержащий 6
- Zc3h11a : Zinc Finger CCCH-домен, содержащий белок 11A
- ZNF648 Кодирующий белок белок цинкового пальца 648
- Znf669 : белок цинкового пальца 669
- Znf687 : белок цинкового пальца 687
- Znf692 : цинковый белок 692
- Znf695 : белок цинкового пальца 695
Болезни и расстройства
[ редактировать ]Есть 890 известных заболеваний, связанных с этой хромосомой. [ Цитация необходима ] Некоторые из этих заболеваний - потеря слуха , болезнь Альцгеймера , глаукома и рак молочной железы . Пересталкивания и мутации хромосомы 1 распространены при раке и многих других заболеваниях. Паттерны вариации последовательности выявляют сигналы недавнего отбора в конкретных генах, которые могут способствовать физической подготовке человека, а также в областях, где не является очевидной функции.
Полная моносомия (имеющая только одна копия всей хромосомы) неизменно смертельна перед рождением. [ 13 ] Полная трисомия (имеющая три копии всей хромосомы) смертельна в течение нескольких дней после зачатия . [ 13 ] Некоторые частичные делеции и частичные дубликации вызывают врожденные дефекты .
Следующие заболевания являются одними из тех, кто связан с генами на хромосоме 1 (которая содержит наиболее известные генетические заболевания любой хромосомы человека):
- 1q21.1 Синдром удаления
- 1q21.1 синдром дублирования
- Болезнь Альцгеймера
- Аутосомно-доминантный шарко-мари-зуб болезней 2 типа с гигантскими аксонами
- Биполярное расстройство
- Рак молочной железы
- Болезнь Брук Гринберг (синдром х)
- Карнитин пальмитоилтрансфераза II дефицит
- Чарко -мари -тит болезнь , типы 1 и 2
- коллагенопатия, типы II и XI
- врожденный гипотиреоз
- Элерс-Данлос Синдром
- Factor V Leiden thrombophilia
- Семейный аденоматозный полипоз
- Галаксия
- Болезнь Гоше
- Гохоподобная болезнь
- Желатиновая дистрофия роговицы, похожая на капель
- Глаукома
- Синдром дефицита GLUT1
- Потеря слуха , аутосомная рецессивная глухота 36
- Гемохроматоз
- Гепаторипоэтическая Порфирия
- Гомоцистинурия
- Синдром прогерии Хатчинсона Гилфорда
- 3-гидрокси-3-метилглютарил-коа-дефицит
- Гипертрофическая кардиомиопатия , аутосомная доминантная мутации TNNT2; Гипертрофия обычно легка; ограничительный фенотип может присутствовать; Может нести высокий риск внезапной сердечной смерти
- болезнь мочи кленового сиропа
- Ацил-кофермент средней цепь ацил-кофермента дегидрогеназы
- Микроцефалия
- Синдром Muckle -Hell
- Несиндромная глухота
- Олигодендроглиома
- Болезнь Паркинсона
- Феохромоцитома
- Порфирия
- Поздняя кожа Порфирия
- Синдром Perygium Perygium
- рак простаты
- СИНДОР СИКЛЕРА
- Принимает синдром
- Триметиламинурия
- Синдром Ашера
- Ашер Синдром тип II
- Синдром Ван дер Вуде
- Различные порфирии
Цитогенетическая полоса
[ редактировать ]Хр. | Рука [ 18 ] | Группа [ 19 ] | ISCN начинать [ 20 ] |
ISCN останавливаться [ 20 ] |
Базовая работа начинать |
Базовая работа останавливаться |
Пятно [ 21 ] | Плотность |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | п | 36.33 | 0 | 100 | 1 | 2,300,000 | Поглощение | |
1 | п | 36.32 | 100 | 244 | 2,300,001 | 5,300,000 | ГПО | 25 |
1 | п | 36.31 | 244 | 344 | 5,300,001 | 7,100,000 | Поглощение | |
1 | п | 36.23 | 344 | 459 | 7,100,001 | 9,100,000 | ГПО | 25 |
1 | п | 36.22 | 459 | 660 | 9,100,001 | 12,500,000 | Поглощение | |
1 | п | 36.21 | 660 | 861 | 12,500,001 | 15,900,000 | ГПО | 50 |
1 | п | 36.13 | 861 | 1206 | 15,900,001 | 20,100,000 | Поглощение | |
1 | п | 36.12 | 1206 | 1321 | 20,100,001 | 23,600,000 | ГПО | 25 |
1 | п | 36.11 | 1321 | 1521 | 23,600,001 | 27,600,000 | Поглощение | |
1 | п | 35.3 | 1521 | 1651 | 27,600,001 | 29,900,000 | ГПО | 25 |
1 | п | 35.2 | 1651 | 1780 | 29,900,001 | 32,300,000 | Поглощение | |
1 | п | 35.1 | 1780 | 1895 | 32,300,001 | 34,300,000 | ГПО | 25 |
1 | п | 34.3 | 1895 | 2210 | 34,300,001 | 39,600,000 | Поглощение | |
1 | п | 34.2 | 2210 | 2411 | 39,600,001 | 43,700,000 | ГПО | 25 |
1 | п | 34.1 | 2411 | 2770 | 43,700,001 | 46,300,000 | Поглощение | |
1 | п | 33 | 2770 | 2986 | 46,300,001 | 50,200,000 | ГПО | 75 |
1 | п | 32.3 | 2986 | 3273 | 50,200,001 | 55,600,000 | Поглощение | |
1 | п | 32.2 | 3273 | 3416 | 55,600,001 | 58,500,000 | ГПО | 50 |
1 | п | 32.1 | 3416 | 3732 | 58,500,001 | 60,800,000 | Поглощение | |
1 | п | 31.3 | 3732 | 3976 | 60,800,001 | 68,500,000 | ГПО | 50 |
1 | п | 31.2 | 3976 | 4206 | 68,500,001 | 69,300,000 | Поглощение | |
1 | п | 31.1 | 4206 | 4852 | 69,300,001 | 84,400,000 | ГПО | 100 |
1 | п | 22.3 | 4852 | 5210 | 84,400,001 | 87,900,000 | Поглощение | |
1 | п | 22.2 | 5210 | 5440 | 87,900,001 | 91,500,000 | ГПО | 75 |
1 | п | 22.1 | 5440 | 5741 | 91,500,001 | 94,300,000 | Поглощение | |
1 | п | 21.3 | 5741 | 5957 | 94,300,001 | 99,300,000 | ГПО | 75 |
1 | п | 21.2 | 5957 | 6029 | 99,300,001 | 101,800,000 | Поглощение | |
1 | п | 21.1 | 6029 | 6244 | 101,800,001 | 106,700,000 | ГПО | 100 |
1 | п | 13.3 | 6244 | 6459 | 106,700,001 | 111,200,000 | Поглощение | |
1 | п | 13.2 | 6459 | 6660 | 111,200,001 | 115,500,000 | ГПО | 50 |
1 | п | 13.1 | 6660 | 6861 | 115,500,001 | 117,200,000 | Поглощение | |
1 | п | 12 | 6861 | 7048 | 117,200,001 | 120,400,000 | ГПО | 50 |
1 | п | 11.2 | 7048 | 7119 | 120,400,001 | 121,700,000 | Поглощение | |
1 | п | 11.1 | 7119 | 7335 | 121,700,001 | 123,400,000 | кислота | |
1 | Q. | 11 | 7335 | 7579 | 123,400,001 | 125,100,000 | кислота | |
1 | Q. | 12 | 7579 | 8483 | 125,100,001 | 143,200,000 | Гвар | |
1 | Q. | 21.1 | 8483 | 8756 | 143,200,001 | 147,500,000 | Поглощение | |
1 | Q. | 21.2 | 8756 | 8957 | 147,500,001 | 150,600,000 | ГПО | 50 |
1 | Q. | 21.3 | 8957 | 9244 | 150,600,001 | 155,100,000 | Поглощение | |
1 | Q. | 22 | 9244 | 9459 | 155,100,001 | 156,600,000 | ГПО | 50 |
1 | Q. | 23.1 | 9459 | 9832 | 156,600,001 | 159,100,000 | Поглощение | |
1 | Q. | 23.2 | 9832 | 10048 | 159,100,001 | 160,500,000 | ГПО | 50 |
1 | Q. | 23.3 | 10048 | 10349 | 160,500,001 | 165,500,000 | Поглощение | |
1 | Q. | 24.1 | 10349 | 10507 | 165,500,001 | 167,200,000 | ГПО | 50 |
1 | Q. | 24.2 | 10507 | 10679 | 167,200,001 | 170,900,000 | Поглощение | |
1 | Q. | 24.3 | 10679 | 10894 | 170,900,001 | 173,000,000 | ГПО | 75 |
1 | Q. | 25.1 | 10894 | 11009 | 173,000,001 | 176,100,000 | Поглощение | |
1 | Q. | 25.2 | 11009 | 11196 | 176,100,001 | 180,300,000 | ГПО | 50 |
1 | Q. | 25.3 | 11196 | 11598 | 180,300,001 | 185,800,000 | Поглощение | |
1 | Q. | 31.1 | 11598 | 11827 | 185,800,001 | 190,800,000 | ГПО | 100 |
1 | Q. | 31.2 | 11827 | 11942 | 190,800,001 | 193,800,000 | Поглощение | |
1 | Q. | 31.3 | 11942 | 12172 | 193,800,001 | 198,700,000 | ГПО | 100 |
1 | Q. | 32.1 | 12172 | 12617 | 198,700,001 | 207,100,000 | Поглощение | |
1 | Q. | 32.2 | 12617 | 12803 | 207,100,001 | 211,300,000 | ГПО | 25 |
1 | Q. | 32.3 | 12803 | 13033 | 211,300,001 | 214,400,000 | Поглощение | |
1 | Q. | 41 | 13033 | 13320 | 214,400,001 | 223,900,000 | ГПО | 100 |
1 | Q. | 42.11 | 13320 | 13406 | 223,900,001 | 224,400,000 | Поглощение | |
1 | Q. | 42.12 | 13406 | 13607 | 224,400,001 | 226,800,000 | ГПО | 25 |
1 | Q. | 42.13 | 13607 | 13966 | 226,800,001 | 230,500,000 | Поглощение | |
1 | Q. | 42.2 | 13966 | 14153 | 230,500,001 | 234,600,000 | ГПО | 50 |
1 | Q. | 42.3 | 14153 | 14397 | 234,600,001 | 236,400,000 | Поглощение | |
1 | Q. | 43 | 14397 | 14756 | 236,400,001 | 243,500,000 | ГПО | 75 |
1 | Q. | 44 | 14756 | 15100 | 243,500,001 | 248,956,422 | Поглощение |
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Подпрыгнуть до: а беременный «Результаты поиска - 1 [CHR] и« Homo Sapiens »[Organism] и (« имеет CCD »[свойства] и живые [пропь]) - ген» . NCBI . CCDS выпустить 20 для Homo Sapiens . 2016-09-08 . Получено 2017-05-28 .
- ^ Том Страхан; Эндрю Рид (2 апреля 2010 г.). Молекулярная генетика человека . Гарлендская наука. п. 45. ISBN 978-1-136-84407-2 .
- ^ Подпрыгнуть до: а беременный в Страница украшения генома, NCBI. Данные идеограммы для гомополовой (850 дюйм в час, сборка GRCH38.P3) . Последнее обновление 2014-06-03. Получено 2017-04-26.
- ^ http://vega.sanger.ac.uk/homo_sapiens/mapview?chr=1 Размер хромосомы и количество генов, полученных из этой базы данных, получен 2012-03-11.
- ^ Грегори С.Г., Барлоу К.Ф., Маклай К.Е., Каул Р., Сварбрек Д., Данхэм А. и др. (Май 2006 г.). «Последовательность ДНК и биологическая аннотация хромосомы человека 1» . Природа . 441 (7091): 315–21. Bibcode : 2006natur.441..315G . doi : 10.1038/nature04727 . PMID 16710414 .
- ^ Pertea M, Salzberg SL (2010). «Между курицей и виноградом: оценка количества человеческих генов» . Геном биол . 11 (5): 206. DOI : 10.1186/GB-2010-11-5-206 . PMC 2898077 . PMID 20441615 .
- ^ «Статистика и загрузки для хромосомы 1» . Комитет по номенклатуру Хьюго . 2017-05-12. Архивировано из оригинала 2017-06-29 . Получено 2017-05-19 .
- ^ «Хромосома 1: резюме хромосомы - Homo Sapiens» . Ансамбл релиз 88 . 2017-03-29 . Получено 2017-05-19 .
- ^ «Человеческая хромосома 1: записи, названия генов и перекрестные ссылки, чтобы мамить» . Uniprot . 2018-02-28 . Получено 2018-03-16 .
- ^ «Результаты поиска - 1 [Chr] и« Homo sapiens »[организм] и (« кодирование белка генетипа »[свойства] и живые [пропь]) - ген» . NCBI . 2017-05-19 . Получено 2017-05-20 .
- ^ «Результаты поиска - 1 [Chr] и« Homo sapiens »[организм] и (« Genetype miscrna »[свойства] или« генетип Ncrna »[свойства] или« генетип рРНК »[свойства] или« генетипная тРНК »[свойства] Или «Genetype scrna» [свойства] или «генетип snrna» [свойства] или «генетип snorna» [свойства]), а не «кодирующий генетип белок» [свойства] и живые [пропь]) - ген » . NCBI . 2017-05-19 . Получено 2017-05-20 .
- ^ «Результаты поиска - 1 [Chr] и« Homo sapiens »[организм] и (« Genetype pseudo »[свойства] и живые [пропь]) - ген» . NCBI . 2017-05-19 . Получено 2017-05-20 .
- ^ Подпрыгнуть до: а беременный Герсен, Стивен Л.; Кигл, Марта Б. (2013-03-26). Принципы клинической цитогенетики . Springer Science & Business Media. п. 278. ISBN 9781441916884 .
- ^ Страница украшения генома, NCBI. Данные идеограммы для гомополовой (400 дюйм в час, сборка GRCH38.P3) . Последнее обновление 2014-03-04. Получено 2017-04-26.
- ^ Страница украшения генома, NCBI. Данные идеограммы для гомополовой (550 дюйм в час, сборка GRCH38.P3) . Последнее обновление 2015-08-11. Получено 2017-04-26.
- ^ Международный постоянный комитет по цитогенетической номенклатуре человека (2013). ISCN 2013: Международная система цитогенетической номенклатуры человека (2013) . Karger Medical и Scientific Publishers. ISBN 978-3-318-02253-7 .
- ^ Sethakulvichai, W.; Manitpornsut, S.; Wiboonrat, M.; Lilakiatsakun, W.; Assawamakin, A.; Tongsima, S. (2012). «Оценка разрешения уровня полос на изображениях хромосом человека» . 2012 Девятая Международная конференция по информатике и разработке программного обеспечения (JCSSE) . С. 276–282. doi : 10.1109/jcsse.2012.6261965 . ISBN 978-1-4673-1921-8 Полем S2CID 16666470 .
- ^ " P ": короткая рука; " Q ": длинная рука.
- ^ Для номенклатуры цитогенетической полосы, см. Статью Locus .
- ^ Подпрыгнуть до: а беременный Эти значения (ISCN Start/Stop) основаны на длине полос/идеограмм из книги ISCN, международной системы цитогенетической номенклатуры человека (2013). Произвольная единица .
- ^ GPO : область, которая положительно окрашивается G-полосой , как правило, AT-богатым и плохим геном; GNEG : область, которая негативно окрашивается G-полосой, обычно CG-богатым и богатым геном; Acen Centromere . var : переменная область; стебель : стебель.
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Мерфи В.Дж., Фроник Л., О'Брайен С.Дж., Стенон Р. (2003). «Происхождение человеческой хромосомы 1 и ее гомологов у плацентарных млекопитающих» . Геном Res . 13 (8): 1880–8. doi : 10.1101/gr.1022303 . PMC 403779 . PMID 12869576 .
- Revera, M.; Van der Merwe, l; и др. (2007). «Долгосрочное наблюдение семейств HCM R403WMHY7 и R92WTNNT2: мутации определяют размеры левого желудочка, но не толщина стенки во время прогрессирования заболевания» . Сердечно -сосудистый журнал Африки . 18 (3): 146–153. PMC 4213759 . PMID 17612745 .
- Schutte BC, Carpten JD, Forus A, Gregory SG, Horii A, White PS (2001). «Отчет и рефераты шестого международного семинара по хромосоме человека 1 Картирование 2000 года. Айова-Сити, штат Айова, США. 30 сентября-3 октября 2000 года». Cytogenet Cltle Genet . 92 (1–2): 23–41. doi : 10.1159/000056867 . PMID 11306795 . S2CID 202651814 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]
- Национальные институты здравоохранения. "Хромосома 1" . Генетика дома ссылка . Архивировано из оригинала 2012-02-04 . Получено 2017-05-06 .
- «Окончательный геном» глава «опубликована» . BBC News . 2006-05-18 . Получено 2017-05-06 .
- "Хромосома 1" . Информационный архив проекта по геному человека 1990–2003 гг . Получено 2017-05-06 .