Иммуноглобулин суперсемейство
| Иммуноглобулин суперсемейство | |||
|---|---|---|---|
 Антитело в комплексе с куриным яичным белками лизоцим. [ 1 ] | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | IGSF | ||
| Pfam | PF00047 | ||
| PFAM клан | CL0159 | ||
| Эко | 11.1.1 | ||
| InterPro | IPR013151 | ||
| PROSITE | PS50835 | ||
| Краткое содержание | 1tlk / scope / supfam | ||
| OPM Суперсемейство | 193 | ||
| OPM белок | 3BIB | ||
| CDD | CD00096 | ||
| Мембраном | 2 | ||
| |||
| Иммуноглобулиноподобный (лиганды) | |
|---|---|
| Идентификаторы | |
| Символ | Ig белковые лиганды |
| Мембраном | 64 |
| Иммуноглобулиноподобные молекулы адгезии | |
|---|---|
| Идентификаторы | |
| Символ | IGSF CAM |
| Мембраном | 110 |
( Суперсемейство иммуноглобулина IGSF ) представляет собой большую белковую суперсемейство клеточной поверхности и растворимых белков , которые участвуют в распознавания, связывания или адгезии процессах клеток . Молекулы классифицируются как члены этой суперсемейства на основе общих структурных особенностей с иммуноглобулинами (также известными как антитела); Все они обладают доменом, известным как домен иммуноглобулина или склад . Члены IGSF включают антигена рецепторы клеточной поверхности, корецепторы и костимуляторные молекулы иммунной системы , молекулы, участвующие в представлении антигена с лимфоцитами , молекулы клеточной адгезии , определенные цитокиновые рецепторы и белки внутриклеточных мышц. Они обычно связаны с ролями в иммунной системе. В противном случае, специфичный белок Izumo1 , член суперсемейства иммуноглобулина, также был идентифицирован как единственный белок сперматозоидов, необходимый для слияния сперматозоидов.
Иммуноглобулиновые домены
[ редактировать ]Белки IGSF обладают структурным доменом , известным как домен иммуноглобулина (IG) . Домены IG названы в честь молекул иммуноглобулина . Они содержат около 70-110 аминокислот и классифицируются в соответствии с их размером и функцией. [ 2 ] IG-домены обладают характерным Ig-Fold , который имеет сэндвич-подобную структуру, образованную двумя листами антипараллельных бета-пряди . Взаимодействие между гидрофобными аминокислотами на внутренней стороне сэндвича и высококонсервативными дисульфидными связями , образующимися между остатками цистеина в целях B и F, стабилизируют Ig-раз. [ Цитация необходима ]
Классификация
[ редактировать ]Домены, подобные IG, могут быть классифицированы как IGV, IGC1, IGC2 или IGI. [ 3 ]
Большинство доменов IG являются либо переменной (IGV), либо постоянной (IGC).
- IGV: IGV -домены с 9 бета -нити, как правило, длиннее доменов IGC с 7 бета -нити.
- IGC1 и IGC2: IG -домены некоторых членов IGSF напоминают домены IGV в аминокислотной последовательности, но схожи по размеру с доменами IGC. Они называются доменами IGC2, в то время как стандартные домены IGC называются доменами IGC1.
- IGI: существуют другие домены IG, которые называются промежуточными (i) доменами. [ 4 ]
Члены
[ редактировать ]Сообщалось, что домен IG является самым густонаселенным семейством белков в геноме человека с идентифицированными 765 членами. [ 5 ] Члены семьи могут быть найдены даже в телах животных с простой физиологической структурой, такими как пориферанские губки. Они также были обнаружены у бактерий, где их присутствие, вероятно, будет связано с дивергенцией от общего предка эукариотических доменов суперсемейства иммуноглобулина. [ 6 ]
| Функция молекулы/категория | Примеры | Описание |
|---|---|---|
| Антигеновые рецепторы | Рецепторы антигена, обнаруженные на поверхности лимфоцитов T и B во всех челюстных позвоночных, принадлежат IGSF. Молекулы иммуноглобулина ( антигенные рецепторы В -клеток ) являются основательными членами IGSF. У людей существует пять различных типов молекулы иммуноглобулина , которые содержат тяжелую цепь с четырьмя доменами Ig и легкую цепь с двумя доменами Ig. Рецептор антигена Т-клеток представляет собой Т-клеточный рецептор (TCR), который состоит из двух цепей, либо цепи TCR-Alpha и -бета, либо TCR-Delta и Gamma Chains. Все цепи TCR содержат два домена IG во внеклеточной части; Один домен IGV на N-конце и один домен IGC1, прилегающий к клеточной мембране . | |
| Антиген представляет молекулы | Лиганды . для TCR являются основными белками комплекса гистосовместимости (MHC) Они бывают двух форм; MHC класса I образует димер с молекулой, называемой бета-2 микроглобулин (β2M) и взаимодействует с TCR на цитотоксических T-клетках, а класс MHC II имеет две цепи (альфа и бета), которые взаимодействуют с TCR на TCR T-клетках. MHC класса I, MHC Class II и β2M -молекулы имеют домены IG и поэтому также являются членами IGSF. | |
| Корецепторы | Совместные рецепторы и вспомогательные молекулы: другие молекулы на поверхностях Т-клеток также взаимодействуют с молекулами MHC во время взаимодействия с TCR. Они известны как со-рецепторы . со-рецептора В популяциях лимфоцитов CD4 обнаруживается на Т-клетках Helper со-рецептора , а CD8 обнаруживается на цитотоксических Т-клетках . CD4 имеет четыре домена IG в своей внеклеточной части и функционирует как мономер . CD8, напротив, функционирует как димер с двумя идентичными альфа -цепями или, более обычно, с альфа -цепью. CD8-альфа и CD8-бета имеют один внеклеточный домен IgV в ее внеклеточной части. Комплекс совместного рецептора также используется BCR, включая CD19 , молекулу IGSF с двумя доменами IGC2. | |
| Молекулы аксессуаров антигена рецептора | На поверхности Т -клеток обнаружена дополнительная молекула, которая также участвует в передаче сигналов из TCR. CD3 - это молекула, которая помогает передавать сигнал из TCR после его взаимодействия с молекулами MHC. Три разных цепочка составляют CD3 у людей, гамма -цепь, дельта -цепь и цепь Epsilon, которые представляют собой молекулы IGSF с одним доменом IG.
Подобно ситуации с Т-клетками, В-клетки также имеют корецепторы клеточной поверхности и вспомогательные молекулы, которые помогают с активацией клеток рецептором В-клеток (BCR)/иммуноглобулином. Используются две сети или сигнализирует, CD79A и CD79B , которые обладают одним доменом IG. | |
| Костимуляторные или ингибирующие молекулы | Костимуляторные или ингибирующие молекулы: костимуляторные и ингибирующие сигнальные рецепторы и лиганды контролируют функции активации, расширения и эффекторных клеток. Одной из основных групп костимуляторных рецепторов IGSF являются молекулы семейства CD28; CD28 , CTLA-4 , программа Death-1 ( PD-1 ), аттенюатор B- и T-лимфоцитов ( BTLA , CD272) и индуцибельный ко-клеточный со-стимулятор (ICOS, CD278 ); [ 7 ] и их лиганды IGSF принадлежат семье B7; CD80 (B7-1), CD86 (B7-2), ICOS LIGAND , PD-L1 (B7-H1), PD-L2 (B7-DC), B7-H3 и B7-H4 (B7X/B7-S1) Полем [ 8 ] | |
| Рецепторы на естественных клетках убийцы | ||
| Рецепторы на лейкоцитах | ||
| IGSF CAMS | ||
| Цитокиновые рецепторы | ||
| Рецепторы фактора роста |
| |
| Рецепторные тирозинкиназы/фосфатазы |
| |
| Ig -связывающие рецепторы |
| |
| Цитоскелет | ||
| Другие |
|
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Dall'acqua W, Goldman ER, Lin W, Teng C, Tsuchiya D, Li H, Ysern X, Braden BC, Li Y, Smith-Gill SJ, Mariuzza RA (июнь 1998 г.). «Мутационный анализ связывающих взаимодействий в комплексе белка-белка антиген-антитела». Биохимия . 37 (22): 7981–91. doi : 10.1021/bi980148j . PMID 9609690 .
- ^ Barclay AN (август 2003 г.). «Мембранные белки с иммуноглобулиноподобными доменами-мастер суперсемейство молекул взаимодействия». Семинары по иммунологии . 15 (4): 215–23. doi : 10.1016/s1044-5323 (03) 00047-2 . PMID 14690046 .
- ^ BD Gomperts; Иджсбранд М. Крамер; Питер Эр Тэтэм (1 июля 2009 г.). Сигнальная трансдукция . Академическая пресса. С. 378–. ISBN 978-0-12-369441-6 Полем Получено 28 ноября 2010 года .
- ^ Harpaz Y, Chothia C (май 1994). «Многие из доменов суперсемейства иммуноглобулина в молекулах клеточной адгезии и поверхностных рецепторах принадлежат к новому структурному набору, который близок к тому, который содержат переменные домены». Журнал молекулярной биологии . 238 (4): 528–39. doi : 10.1006/jmbi.1994.1312 . PMID 8176743 .
- ^ Ландер Э.С., Линтон Л.М., Биррен Б., Нусбаум С., Зоди М.К., Болдуин Дж. И др. (Февраль 2001 г.). «Начальное секвенирование и анализ генома человека» (PDF) . Природа . 409 (6822): 860–921. doi : 10.1038/35057062 . PMID 11237011 .
- ^ Бейтман А., Эдди С.Р., Чотия С (сентябрь 1996 г.). «Члены суперсемейства иммуноглобулина у бактерий» . Белковая наука . 5 (9): 1939–41. doi : 10.1002/pro.5560050923 . PMC 2143528 . PMID 8880921 .
- ^ Peggs KS, Allison JP (сентябрь 2005 г.). «Совместные пути в регуляции лимфоцитов: суперсемейство иммуноглобулина» . Британский журнал гематологии . 130 (6): 809–24. doi : 10.1111/j.1365-2141.2005.05627.x . PMID 16156851 .
- ^ Гринвальд Р.Дж., Фриман Г.Дж., Шарп А.Х. (2005). «Семья B7 повторно посетила». Ежегодный обзор иммунологии . 23 : 515–48. doi : 10.1146/annurev.immunol.23.021704.115611 . PMID 15771580 .
- ^ Болес К.С., Степп С.Е., Беннетт М., Кумар В., Мэтью П.А. (июнь 2001 г.). «2B4 (CD244) и CS1: новые члены подмножества CD2 молекул суперсемейства иммуноглобулина, экспрессируемые на природных клетках -убийце и других лейкоцитах». Иммунологические обзоры . 181 : 234–49. doi : 10.1034/j.1600-065x.2001.1810120.x . PMID 11513145 . S2CID 21801197 .
- ^ Фрейзер CC, Howie D, Morra M, Qiu Y, Murphy C, Shen Q, Gutierrez-Ramos JC, Coyle A, Kingsbury GA, Terhorst C (февраль 2002 г.). «Идентификация и характеристика SF2000 и SF2001, двух новых членов семейства иммунных рецепторов/CD2». Иммуногенетика . 53 (10–11): 843–50. doi : 10.1007/s00251-001-0415-7 . PMID 11862385 . S2CID 10257502 .
- ^ Tangye SG, Nichols KE, Hare NJ, Van de Weerdt BC (сентябрь 2003 г.). «Функциональные требования к взаимодействию между белками, содержащими доменные доменные белки CD84 и SRC, и их вклад в активацию Т-клеток человека» . Журнал иммунологии . 171 (5): 2485–95. doi : 10.4049/jimmunol.171.5.2485 . PMID 12928397 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Трансмембранные белки человека из суперсемейства иммуноглобулина, классифицированных как рецепторы , лиганды и белки адгезии
- Домен иммуноглобулина в суперсемействе