Кальсенилин

KCNIP3
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	2E6W
Идентификаторы
Псевдонимы	KCNIP3 , CSEN, Dream, KCHIP3, управляющий калиевым напряжением взаимодействующий белок 3
Внешние идентификаторы	Омим : 604662 ; MGI : 1929258 ; Гомологен : 8382 ; GeneCards : KCNIP3 ; OMA : KCNIP3 - ортологи
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	127,364,014 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	prefrontal cortex; ; Brodmann area 9; ; left lobe of thyroid gland; ; amygdala; ; right lobe of thyroid gland; ; nucleus accumbens; ; caudate nucleus; ; hypothalamus; ; putamen; ; hippocampus proper;
	Top expressed in
	lumbar spinal ganglion; ; primary visual cortex; ; superior frontal gyrus; ; piriform cortex; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; cerebellar cortex; ; medial dorsal nucleus; ; subiculum; ; prefrontal cortex; ; medial geniculate nucleus;
	More reference expression data
	n/a
showДжин Онтология
Molecular function	DNA binding; calcium ion binding; sequence-specific DNA binding; potassium channel activity; transcription corepressor activity; voltage-gated ion channel activity; metal ion binding; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; protein binding; potassium channel regulator activity; transmembrane transporter binding;
Cellular component	cytoplasm; axon terminus; cytosol; Golgi apparatus; membrane; voltage-gated potassium channel complex; axon; dendrite; protein-DNA complex; endoplasmic reticulum; nucleus; plasma membrane;
Biological process	regulation of transcription, DNA-templated; regulation of transcription by RNA polymerase II; regulation of ion transmembrane transport; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; ion transport; transcription, DNA-templated; potassium ion transport; potassium ion transmembrane transport; protein localization to plasma membrane; intracellular protein transport; regulation of potassium ion transmembrane transport; signal transduction; apoptotic process; negative regulation of nucleic acid-templated transcription; cardiac conduction;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	30818
	56461
	n/a
	Ensmusg00000079056
	Q9Y2W7
	Q9QXT8 ; P0C092
	NM_001034914 ; NM_013434
	NM_001111331 ; NM_001291005 ; NM_019789
	NP_001030086 ; NP_038462
	NP_001104801 ; NP_001277934 ; NP_062763
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Кальсенилин - это белок , который у людей кодируется KCNIP3 геном . ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Этот ген кодирует члена семейства белков, управляемых напряжением калия (KV) , которые относятся к семейству нейрональных датчиков кальциевых датчиков. ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} Члены этого семейства являются небольшие белки, связывающие кальций, содержащие EF -ручные домены. Они являются интегральными компонентами субъединиц нативных комплексов каналов KV4, которые могут регулировать токи A-типа и, следовательно, возбудимость нейронов в ответ на изменения внутриклеточного кальция. Кодированный белок также функционирует как регулируемый кальцием репрессор транскрипции и взаимодействует с пресенилинами . Кроме того, было показано, что белок транскрипционно репрессирует экспрессию A20 ( TNFAIP3 ) и, таким образом, модулирует противовоспалительную передачу сигналов. ^{[ 9 ]} сплайсированных транскриптов, кодирующие различные изоформы. В качестве альтернативы были описаны варианты ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Кальсенилин, как было показано, взаимодействует с PSEN1 ^{[ 4 ]}^{[ 10 ]} и psen2 . ^{[ 4 ]}^{[ 11 ]}

Смотрите также

Направленный напряжением калиевый канал

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000079056 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Buxbaum JD, Choi Ek, Luo Y, Lilliehook C, Crowley AC, Merriam De, Wasco W (октябрь 1998 г.). «Кальсенилин: кальций связывающий белок, который взаимодействует с пресенилинами и регулирует уровни фрагмента пресенилина». Nat Med . 4 (10): 1177–81. doi : 10.1038/2673 . PMID 9771752 . S2CID 10799492 .
^ Carrión AM, Link WA, Ledo F, Mellström B, Naranjo Jr (март 1999 г.). «Мечта-это CA2+-регулируемый транскрипционным репрессором». Природа . 398 (6722): 80–4. Bibcode : 1999natur.398 ... 80c . doi : 10.1038/18044 . PMID 10078534 . S2CID 204991618 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: KCNIP3 KV -канал взаимодействующий белок 3, кальсенилин» .
^ Burgoyne Rd (2007). «Белки датчика кальция нейрона: генерирование разнообразия в передаче сигналов нейрональных Ca2+» . НАТ Rev. Neurosci . 8 (3): 182–193. doi : 10.1038/nrn2093 . PMC 1887812 . PMID 17311005 .
^ Burgoyne Rd, O'Callaghan DW, Hasdemir B, Haynes LP, Tepikin AV (2004). «Нейрональные белки Ca2+-Sensor: многоталентные регуляторы нейрональной функции». Тенденции Neurosci . 27 (4): 203–9. doi : 10.1016/j.tins.2004.01.010 . PMID 15046879 . S2CID 24156457 .
^ Tiruppathi C, Soni D, Wang DM, et al. (Март 2014 г.). «Фактор транскрипции мечтает A20 и опосредует воспаление» . Nat Immunol . 15 (3): 239–247. doi : 10.1038/ni.2823 . PMC 4005385 . PMID 24487321 .
^ Кашива А., Йошида Х., Ли С., Паладино Т., Лю Й., Чен К, Даргуш Р., Шуберт Д., Кимура Х (июль 2000 г.). «Выделение и характеристика нового презенилинового связывающего белка» . J. Neurochem . 75 (1): 109–16. doi : 10.1046/j.1471-4159.2000.0750109.x . PMID 10854253 . S2CID 24838995 .
^ Choi Ek, Zaidi NF, Miller JS, Crowley AC, Merriam DE, Lilliehook C, Buxbaum JD, Wasco W (июнь 2001 г.). «Кальсенилин-это субстрат для каспазы-3, который преимущественно взаимодействует с семейным С-концевым фрагментом, связанным с болезнью Альцгеймера, претензилина 2» . Дж. Биол. Химический 276 (22): 19197–204. doi : 10.1074/jbc.m008597200 . PMID 11278424 .

Дальнейшее чтение

Carrión AM, Mellström B, Naranjo JR (1998). «Протеинкиназа A-зависимая дрепрессия гена простинорфина человека посредством дифференциального связывания с элементом внутриагенного глушителя» . Мол Клетка. Биол . 18 (12): 6921–9. doi : 10.1128/mcb.18.12.6921 . PMC 109275 . PMID 9819380 .
WF, Bowlby MR, Betty M, Cao J, Ling HP, Mendoza G, Hinson JW, Mattsson Ki, Strassle BW, Trimmer JS, Rhodes KJ (2000). «Модуляция калиевых каналов A-типа семейством датчиков кальция». Природа . 403 (6769): 553–6. Bibcode : 2000natur.403..553a . doi : 10.1038/35000592 . PMID 10676964 . S2CID 4419472 .
Leissring MA, Yamasaki TR, Wasco W, Buxbaum JD, Parker I, Laferla FM (2000). «Кальсенилин меняет презенилино-опосредованное усиление передачи сигналов кальция» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 97 (15): 8590–3. Bibcode : 2000pnas ... 97.8590L . doi : 10.1073/pnas.97.15.8590 . PMC 26992 . PMID 10900016 .
Buxbaum JD, Lilliehook C, Chan JY, GO RC, Bassett SS, Tanzi Re, Wasco W, Blacker D (2000). «Геномная структура, паттерн экспрессии и хромосомная локализация гена кальсенилина человека: нет связи между экзоническим полиморфизмом и болезнью Альцгеймера». Нейроски. Летал 294 (3): 135–8. doi : 10.1016/s0304-3940 (00) 01553-6 . PMID 11072133 . S2CID 16765518 .
Ледо Ф., Кэррион А.М., Линк В.А., Меллстрём Б., Наранджо младший (2001). «Взаимодействие Dream-αcrm с помощью лейциновых доменов дерепресс вниз по течению регуляторного элемента, зависящая от транскрипции» . Мол Клетка. Биол . 20 (24): 9120–6. doi : 10.1128/mcb.20.24.9120-9126.2000 . PMC 102170 . PMID 11094064 .
Jo DG, Kim MJ, Choi YH, Kim IK, Song YH, Woo HN, Chung CW, Jung YK (2001). «Проапоптотическая функция кальсенилина/мечты/kchip3» . Faseb j . 15 (3): 589–91. doi : 10.1096/fj.00-0541fje . PMID 11259376 . S2CID 37815129 .
Choi Ek, Zaidi NF, Miller JS, Crowley AC, Merriam DE, Lilliehook C, Buxbaum JD, Wasco W (2001). «Кальсенилин-это субстрат для каспазы-3, который преимущественно взаимодействует с семейным С-концевым фрагментом, связанным с болезнью Альцгеймера, претензилина 2» . Дж. Биол. Химический 276 (22): 19197–204. doi : 10.1074/jbc.m008597200 . PMID 11278424 .
Осава М., Тонг Ки, Лиллихук С., Вайско В., Буксбаум Д.Д., Ченг Хи, Пеннингер Дж. М., Икура М., Эймс Дж. Б. (2001). «Связывание ДНК-регулируемого кальция и олигомеризация нейронального кальция-чувствительного белка, кальсенилина/мечта/KCHIP3» . Дж. Биол. Химический 276 (44): 41005–13. doi : 10.1074/jbc.m105842200 . PMID 11535596 .
Ченг Хи, Питчер Г.М., Лавиолетт С.Р., Уишоу Ик, Тонг Ки, Кикариц Л.К., Т., Йоза Н.А., Крепорвер М., Гонттт Дж., Сарерози И., Вулетт -младший, Солтер М.В., Пеннингер Дж. М. (2002). «Мечта - это критическое резервирование транскрипции для модуляции боли » Ячейка 108 (1): 31–43. Doi : 10.1016/s0092-8674 (01) 0629-8 PMID 11792319 S2CID 16602843
Lilliehook C, Chan S, Choi Ek, Zaidi NF, Wasco W, Mattson MP, Buxbaum JD (2002). «Кальсенилин усиливает апоптоз, изменяя передачу сигналов кальциевого эндоплазматического ретикулума». Мол Клетка. Нейроски . 19 (4): 552–9. doi : 10.1006/mcne.2001.1096 . PMID 11988022 . S2CID 42446025 .
Takimoto K, Yang EK, Concorti L (2002). «Палмитоилирование вариантов сплайсинга KCHIP требуется для эффективной экспрессии клеточной поверхности каналов KV4.3» . Дж. Биол. Химический 277 (30): 26904–11. doi : 10.1074/jbc.m203651200 . PMID 12006572 .
Ледо Ф., Кремер Л., Меллстрём Б., Наранджо младший (2002). «CA2+-зависимый блок транскрипции CREB-CBP с помощью Repressor Dream» . Embo j . 21 (17): 4583–92. doi : 10.1093/emboj/cdf440 . PMC 126180 . PMID 12198160 .
Zaidi NF, Berezovska O, Choi Ek, Miller JS, Chan H, Lilliehook C, Hyman BT, Buxbaum JD, Wasco W (2002). «Биохимическая и иммуноцитохимическая характеристика кальсенилина в мозге мыши». Нейробиология . 114 (1): 247–63. doi : 10.1016/s0306-4522 (02) 00251-8 . PMID 12207970 . S2CID 12738777 .
Санз С., Хорита М. Сигнализация и блокада Hamulomica . 87 (9): 903–7. PMID 12217801 .
Schrader LA, Anderson AE, Mayne A, Pfaffinger PJ, Sweett JD (2002). «Модуляция PKA калиевых каналов A-типа, кодируемых KV4.2, требует образования супрамолекулярного комплекса» . J. Neurosci . 22 (23): 10123–33. doi : 10.1523/jneurosci.22-23-10123.2002 . PMC 6758737 . PMID 12451113 .
Hong YM, Jo DG, Lee MC, Kim Sy, Jung YK (2003). «Снижение экспрессии кальсенилина/мечты/KCHIP3 в мозге пациентов с припадкой и эпилепсией, вызванным каиновой кислотой». Нейроски. Летал 340 (1): 33–6. doi : 10.1016/s0304-3940 (03) 00067-3 . PMID 12648752 . S2CID 10647796 .
Shibata R, Misonou H, Campomanes CR, Anderson AE, Schrader LA, Doliveira LC, Carroll Ki, Sweett JD, Rhodes KJ, Trimmer JS (2003). «Фундаментальная роль для KCHIP в определении молекулярных свойств и переноса каналов калия KV4,2» . Дж. Биол. Химический 278 (38): 36445–54. doi : 10.1074/jbc.m306142200 . PMID 12829703 .
Венн Н., Хейнс Л.П., Бургойн Р.Д. (2008). «Специфические эффекты KCHIP3/кальсенилина/мечты, но не KCHIPS 1, 2 и 4, на передачу сигналов и регулируемой секреции кальция в клетках PC12» . Биохимия. Дж . 413 (1): 71–80. doi : 10.1042/bj20080441 . PMC 2474559 . PMID 18393943 .

Внешние ссылки

KCNIP3+белок,+человек в Национальной библиотеке Медицинской библиотеки США. Медицинские заголовки (Mesh)
Белки NCS

Эта статья включает в себя текст из Национальной медицины Соединенных Штатов , которая находится в общественном достоянии .

Эта мембранным белком, статья, связанная с является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCm38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000079056 - Ensembl , май 2017 г.

[2] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[3] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid9771752-4] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Buxbaum JD, Choi Ek, Luo Y, Lilliehook C, Crowley AC, Merriam De, Wasco W (октябрь 1998 г.). «Кальсенилин: кальций связывающий белок, который взаимодействует с пресенилинами и регулирует уровни фрагмента пресенилина». Nat Med . 4 (10): 1177–81. doi : 10.1038/2673 . PMID 9771752 . S2CID 10799492 .

[pmid10078534-5] Carrión AM, Link WA, Ledo F, Mellström B, Naranjo Jr (март 1999 г.). «Мечта-это CA2+-регулируемый транскрипционным репрессором». Природа . 398 (6722): 80–4. Bibcode : 1999natur.398 ... 80c . doi : 10.1038/18044 . PMID 10078534 . S2CID 204991618 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: KCNIP3 KV -канал взаимодействующий белок 3, кальсенилин» .

[pmid17311005-7] Burgoyne Rd (2007). «Белки датчика кальция нейрона: генерирование разнообразия в передаче сигналов нейрональных Ca2+» . НАТ Rev. Neurosci . 8 (3): 182–193. doi : 10.1038/nrn2093 . PMC 1887812 . PMID 17311005 .

[pmid15046879-8] Burgoyne Rd, O'Callaghan DW, Hasdemir B, Haynes LP, Tepikin AV (2004). «Нейрональные белки Ca2+-Sensor: многоталентные регуляторы нейрональной функции». Тенденции Neurosci . 27 (4): 203–9. doi : 10.1016/j.tins.2004.01.010 . PMID 15046879 . S2CID 24156457 .

[PMC4005385-9] Tiruppathi C, Soni D, Wang DM, et al. (Март 2014 г.). «Фактор транскрипции мечтает A20 и опосредует воспаление» . Nat Immunol . 15 (3): 239–247. doi : 10.1038/ni.2823 . PMC 4005385 . PMID 24487321 .

[pmid10854253-10] Кашива А., Йошида Х., Ли С., Паладино Т., Лю Й., Чен К, Даргуш Р., Шуберт Д., Кимура Х (июль 2000 г.). «Выделение и характеристика нового презенилинового связывающего белка» . J. Neurochem . 75 (1): 109–16. doi : 10.1046/j.1471-4159.2000.0750109.x . PMID 10854253 . S2CID 24838995 .

[pmid11278424-11] Choi Ek, Zaidi NF, Miller JS, Crowley AC, Merriam DE, Lilliehook C, Buxbaum JD, Wasco W (июнь 2001 г.). «Кальсенилин-это субстрат для каспазы-3, который преимущественно взаимодействует с семейным С-концевым фрагментом, связанным с болезнью Альцгеймера, претензилина 2» . Дж. Биол. Химический 276 (22): 19197–204. doi : 10.1074/jbc.m008597200 . PMID 11278424 .

[1]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]