КСНК2

КСНК2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	4TWK
Идентификаторы
Псевдонимы	KCNK2 , K2p2.1, TPKC1, TREK, TREK-1, TREK1, hTREK-1c, hTREK-1e, калиевый двухпоровый доменный канал, подсемейство K, член 2
Внешние идентификаторы	Опустить : 603219 ; МГИ : 109366 ; Гомологен : 7794 ; Генные карты : KCNK2 ; ОМА : KCNK2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	215,237,090 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 1 (mouse)
End	189,134,470 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	stromal cell of endometrium; ; right adrenal cortex; ; left adrenal gland; ; left adrenal cortex; ; Achilles tendon; ; ganglionic eminence; ; cartilage tissue; ; testicle; ; tibial nerve; ; prefrontal cortex;
	Top expressed in
	median eminence; ; arcuate nucleus; ; olfactory tubercle; ; ventromedial nucleus; ; nucleus accumbens; ; piriform cortex; ; gastrula; ; paraventricular nucleus of hypothalamus; ; vestibular membrane of cochlear duct; ; calvaria;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	potassium channel activity; voltage-gated potassium channel activity; potassium channel inhibitor activity; outward rectifier potassium channel activity; potassium ion leak channel activity;
Cellular component	axon terminus; integral component of membrane; endoplasmic reticulum membrane; membrane; voltage-gated potassium channel complex; plasma membrane; astrocyte projection; calyx of Held; cell surface; axon; neuronal cell body; apical plasma membrane; endoplasmic reticulum; neuron projection; nucleus; integral component of plasma membrane;
Biological process	cochlea development; G protein-coupled receptor signaling pathway; positive regulation of cell death; positive regulation of cellular response to hypoxia; regulation of membrane potential; cardiac ventricle development; response to mechanical stimulus; memory; ion transport; potassium ion transport; response to axon injury; potassium ion transmembrane transport; negative regulation of cardiac muscle cell proliferation; cellular response to hypoxia; negative regulation of DNA biosynthetic process; stabilization of membrane potential;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	3776
	16526
	ENSG00000082482
	ENSMUSG00000037624
	О95069
	P97438
	НМ_001017424 ; НМ_001017425 ; НМ_014217
	НМ_001159850 ; НМ_001281847 ; НМ_001281848 ; НМ_010607 ; НМ_001357119
	НП_001017424 ; НП_001017425 ; НП_055032
showНП_001153322 ; НП_001268776 ; НП_001268777 ; НП_034737 ; НП_001344048 ;
	NP_001389703; NP_001389704; NP_001389705; NP_001389755; NP_001389756
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Член 2 подсемейства калиевых каналов K , также известный как TREK-1, представляет собой белок , который у человека кодируется KCNK2 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Этот ген кодирует K _2P 2.1, липид-управляемый ионный канал, принадлежащий к семейству белков фоновых калиевых каналов с двумя доменами. Этот тип калиевых каналов образован двумя гомодимерами, которые создают канал, который высвобождает калий из клетки для контроля мембранного потенциала покоя. Канал открывается под действием анионных липидов, некоторых анестетиков, растяжения мембраны, внутриклеточного ацидоза и тепла. Для этого гена обнаружено три варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы. ^{[ 7 ]}

Функция в нейронах

TREK-1 является частью подсемейства механоуправляемых калиевых каналов , которые присутствуют в нейронах млекопитающих. Они могут быть закрыты как химическими, так и физическими способами и могут быть открыты как физическими, так и химическими стимулами. Каналы TREK-1 обнаруживаются в различных тканях, но особенно распространены в мозге и сердце и наблюдаются в различных типах нейронов. ^{[ 8 ]} С -конец каналов TREK-1 играет роль в механочувствительности каналов. ^{[ 9 ]}

В нейронах центральной нервной системы каналы TREK-1 играют важную роль в физиологических, патофизиологических и фармакологических процессах, в том числе играют роль в электрогенезе , ишемии и анестезии . TREK-1 играет важную роль в нейропротекции против эпилепсии , ишемии головного и спинного мозга и оценивается как потенциальная мишень для новых разработок терапевтических средств для неврологии и анестезиологии. ^{[ 10 ]}

При отсутствии правильно функционирующего цитоскелета каналы TREK-1 все еще могут открываться через механические ворота. ^{[ 9 ]} Клеточная мембрана функционирует независимо от цитоскелета, а толщина и кривизна мембраны способны модулировать активность каналов TREK-1. ^{[ 11 ]} Считается, что изменение толщины ощущается амфипатической спиралью, которая простирается от внутреннего листка мембраны. ^{[ 12 ]}

Введение в мембрану некоторых соединений, в том числе ингаляционных анестетиков и пропофола, активирует TREK-1 посредством фермента фосфолипазы D2 (PLD2). До добавления анестетика PLD2 связывается с липидными рафтами GM-1. После анестезии фермент или комплекс ферментов и каналов направляются в домены PIP2, где фермент вырабатывает фосфатидную кислоту, открывающую канал. ^{[ 13 ]}

См. также

Калиевый канал области тандемных пор

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000082482 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037624 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Лесаж Ф., Лаздунски М. (октябрь 1998 г.). «Картирование генов калиевых каналов человека TREK-1 (KCNK2) и TASK (KCNK3) на хромосомах 1q41 и 2p23». Геномика . 51 (3): 478–9. дои : 10.1006/geno.1998.5397 . ПМИД 9721223 .
^ Гольдштейн С.А., Бейлисс Д.А., Ким Д., Лесаж Ф., Плант Л.Д., Раджан С. (декабрь 2005 г.). «Международный союз фармакологов. Л.В. Номенклатура и молекулярные взаимоотношения двух-Р калиевых каналов» . Фармакол Рев . 57 (4): 527–40. дои : 10.1124/пр.57.4.12 . ПМИД 16382106 . S2CID 7356601 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: калиевый канал KCNK2, подсемейство K, член 2» .
^ Финк М., Дюпра Ф., Лесаж Ф., Рейес Р., Роми Дж., Эрто К., Лаздунски М. (1996). «Клонирование, функциональное выражение и локализация в мозге нового нетрадиционного внешнего выпрямительного канала K +» . Журнал ЭМБО . 15 (24): 6854–6862. дои : 10.1002/j.1460-2075.1996.tb01077.x . ПМК 452511 . ПМИД 9003761 .
^ Jump up to: ^а ^б Патель А.Дж., Оноре Э., Менгре Ф., Лесаж Ф., Финк М., Дюпра Ф., Лаздунски М. (1998). «Механически управляемый S-подобный K+-канал млекопитающих с двумя поровыми доменами» . Журнал ЭМБО . 17 (15): 4283–4290. дои : 10.1093/emboj/17.15.4283 . ПМЦ 1170762 . ПМИД 9687497 .
^ Джорда Р., Вайсберг Э.П., Ип Т.К., Трукко М. (1992). «Геномная структура и штамм-специфическая экспрессия рецептора естественных клеток-киллеров NKR-P1». Журнал иммунологии . 149 (6): 1957–1963. doi : 10.4049/jimmunol.149.6.1957 . ПМИД 1517565 .
^ Патель А.Дж., Лаздунски М., Оноре Э. (2001). «Липидные и механозависимые каналы 2P домена K (+)». Curr Opin Cell Biol . 13 (4): 422–428. дои : 10.1016/s0955-0674(00)00231-3 . ПМИД 11454447 .
^ Наебосадри А., Петерсен Э.Н., Кабанос С., Хансен С.Б. (2018). «Датчик толщины мембраны в каналах TREK-1 преобразует механическую силу» . Сеть исследований социальных наук. ССНН 3155650 . {{cite journal}}: Для цитирования журнала требуется |journal= ( помощь )
^ Павел М.А., Петерсен Э.Н., Ван Х., Лернер Р.А., Хансен С.Б. (28 мая 2020 г.). «Исследования о механизме общей анестезии» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 117 (24): 13757–13766. Бибкод : 2020PNAS..11713757P . дои : 10.1073/pnas.2004259117 . ПМК 7306821 . ПМИД 32467161 .

Дальнейшее чтение

Гольдштейн С.А., Бокенхауэр Д., О'Келли И., Зильберберг Н. (2001). «Каналы утечки калия и семейство субъединиц KCNK с двумя P-доменами» . Нат. Преподобный Нейроски . 2 (3): 175–84. дои : 10.1038/35058574 . ПМИД 11256078 . S2CID 9682396 .
Оноре Э (2007). «Нейронный фон K2P-каналов: фокус на TREK1». Нат. Преподобный Нейроски . 8 (4): 251–61. дои : 10.1038/nrn2117 . ПМИД 17375039 . S2CID 21421846 .
Финк М., Дюпра Ф., Лесаж Ф. и др. (1997). «Клонирование, функциональное выражение и локализация в мозге нового нетрадиционного внешнего выпрямительного канала K +» . ЭМБО Дж . 15 (24): 6854–62. дои : 10.1002/j.1460-2075.1996.tb01077.x . ПМК 452511 . ПМИД 9003761 .
Патель А.Дж., Оноре Э., Лесаж Ф. и др. (1999). «Ингаляционные анестетики активируют двухпоровые фоновые K+-каналы». Нат. Нейроски . 2 (5): 422–6. дои : 10.1038/8084 . ПМИД 10321245 . S2CID 23092576 .
Медоуз Х.Д., Бенхем К.Д., Кэрнс В. и др. (2000). «Клонирование, локализация и функциональная экспрессия человеческого ортолога калиевого канала TREK-1». Арка Пфлюгерса . 439 (6): 714–22. дои : 10.1007/s004240050997 . ПМИД 10784345 .
Мэйли Дж., Адельман Дж. П. (2001). «Подними меня, Скотти! Каналы TREK качаются в обе стороны». Нат. Нейроски . 4 (5): 457–8. дои : 10.1038/87402 . ПМИД 11319549 . S2CID 5982574 .
Бокенхауэр Д., Зильберберг Н., Гольдштейн С.А. (2001). «KCNK2: обратимое преобразование утечки калия из гиппокампа в потенциалзависимый канал» . Нат. Нейроски . 4 (5): 486–91. дои : 10.1038/87434 . ПМИД 11319556 . S2CID 7658182 .
Энйерт Дж.Дж., Сюй Л., Данти С., Энйерт Дж.А. (2003). «Фоновым K+-каналом в клетках надпочечников, регулируемым АКТГ и АТФ, является TREK-1» . Ж. Биол. Хим . 277 (51): 49186–99. дои : 10.1074/jbc.M207233200 . ПМИД 12368289 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Имабаяши Х., Мори Т., Годжо С. и др. (2003). «Редифференциация дедифференцированных хондроцитов и хондрогенез стромальных клеток костного мозга человека посредством образования хондросфер с профилированием экспрессии с помощью крупномасштабного анализа кДНК». Эксп. Сотовый Res . 288 (1): 35–50. дои : 10.1016/S0014-4827(03)00130-7 . ПМИД 12878157 .
Миллер П., Пирс С., Кемп П.Дж. (2004). «Полимодальная регуляция hTREK1 с помощью pH, арахидоновой кислоты и гипоксии: физиологическое влияние при ацидозе и алкалозе». Являюсь. J. Physiol., Cell Physiol . 286 (2): C272–82. doi : 10.1152/ajpcell.00334.2003 . ПМИД 14522822 . S2CID 25421690 .
Фу Г.К., Ван Дж.Т., Ян Дж. и др. (2005). «Циркулярная быстрая амплификация концов кДНК для высокопроизводительного расширенного клонирования частичных генов». Геномика . 84 (1): 205–10. дои : 10.1016/j.ygeno.2004.01.011 . ПМИД 15203218 .
Кеннард Л.Е., Чамбли Дж.Р., Ранатунга К.М. и др. (2005). «Ингибирование калиевого канала двухпорового домена человека, TREK-1, флуоксетином и его метаболитом норфлуоксетином» . Бр. Дж. Фармакол . 144 (6): 821–9. дои : 10.1038/sj.bjp.0706068 . ПМК 1576064 . ПМИД 15685212 .
Миллер П., Кемп П.Дж., Пирс С. (2005). «Структурные требования для восприятия O2 каналом домена тандем-P человека, hTREK1». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 331 (4): 1253–6. дои : 10.1016/j.bbrc.2005.04.042 . ПМИД 15883010 .
Мурбартиан Дж., Лей К., Сандо Дж.Дж., Бэйлисс Д.А. (2005). «Последовательное фосфорилирование опосредует рецепторно- и киназное ингибирование фоновых калиевых каналов TREK-1» . Ж. Биол. Хим . 280 (34): 30175–84. дои : 10.1074/jbc.M503862200 . ПМИД 16006563 .
Хьюз С., Магней Дж., Форман М. и др. (2006). «Экспрессия механочувствительного канала 2PK+ TREK-1 в остеобластах человека». Дж. Селл. Физиол . 206 (3): 738–48. дои : 10.1002/jcp.20536 . ПМИД 16250016 . S2CID 1788790 .
Кимура К., Вакамацу А., Судзуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация модуляции транскрипции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека» . Геном Рез . 16 (1): 55–65. дои : 10.1101/гр.4039406 . ПМК 1356129 . ПМИД 16344560 .

Внешние ссылки

KCNK2 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000082482 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037624 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9721223-5] Лесаж Ф., Лаздунски М. (октябрь 1998 г.). «Картирование генов калиевых каналов человека TREK-1 (KCNK2) и TASK (KCNK3) на хромосомах 1q41 и 2p23». Геномика . 51 (3): 478–9. дои : 10.1006/geno.1998.5397 . ПМИД 9721223 .

[pmid16382106-6] Гольдштейн С.А., Бейлисс Д.А., Ким Д., Лесаж Ф., Плант Л.Д., Раджан С. (декабрь 2005 г.). «Международный союз фармакологов. Л.В. Номенклатура и молекулярные взаимоотношения двух-Р калиевых каналов» . Фармакол Рев . 57 (4): 527–40. дои : 10.1124/пр.57.4.12 . ПМИД 16382106 . S2CID 7356601 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: калиевый канал KCNK2, подсемейство K, член 2» .

[8] Финк М., Дюпра Ф., Лесаж Ф., Рейес Р., Роми Дж., Эрто К., Лаздунски М. (1996). «Клонирование, функциональное выражение и локализация в мозге нового нетрадиционного внешнего выпрямительного канала K +» . Журнал ЭМБО . 15 (24): 6854–6862. дои : 10.1002/j.1460-2075.1996.tb01077.x . ПМК 452511 . ПМИД 9003761 .

[ReferenceA-9] Jump up to: ^а ^б Патель А.Дж., Оноре Э., Менгре Ф., Лесаж Ф., Финк М., Дюпра Ф., Лаздунски М. (1998). «Механически управляемый S-подобный K+-канал млекопитающих с двумя поровыми доменами» . Журнал ЭМБО . 17 (15): 4283–4290. дои : 10.1093/emboj/17.15.4283 . ПМЦ 1170762 . ПМИД 9687497 .

[10] Джорда Р., Вайсберг Э.П., Ип Т.К., Трукко М. (1992). «Геномная структура и штамм-специфическая экспрессия рецептора естественных клеток-киллеров NKR-P1». Журнал иммунологии . 149 (6): 1957–1963. doi : 10.4049/jimmunol.149.6.1957 . ПМИД 1517565 .

[11] Патель А.Дж., Лаздунски М., Оноре Э. (2001). «Липидные и механозависимые каналы 2P домена K (+)». Curr Opin Cell Biol . 13 (4): 422–428. дои : 10.1016/s0955-0674(00)00231-3 . ПМИД 11454447 .

[12] Наебосадри А., Петерсен Э.Н., Кабанос С., Хансен С.Б. (2018). «Датчик толщины мембраны в каналах TREK-1 преобразует механическую силу» . Сеть исследований социальных наук. ССНН 3155650 . {{cite journal}}: Для цитирования журнала требуется |journal= ( помощь )

[13] Павел М.А., Петерсен Э.Н., Ван Х., Лернер Р.А., Хансен С.Б. (28 мая 2020 г.). «Исследования о механизме общей анестезии» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 117 (24): 13757–13766. Бибкод : 2020PNAS..11713757P . дои : 10.1073/pnas.2004259117 . ПМК 7306821 . ПМИД 32467161 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]