Эфрин Б2

ЭФНБ2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2HLE, 2I85, 2VSK, 2VSM, 2WO2, 3GXU, 4UF7
Идентификаторы
Псевдонимы	EFNB2 , EPLG5, HTKL, Htk-L, LERK5, эфрин B2
Внешние идентификаторы	Опустить : 600527 ; МГИ : 105097 ; Гомологен : 3019 ; GeneCards : EFNB2 ; OMA : EFNB2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 13 (human)
End	106,535,662 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 8 (mouse)
End	8,711,242 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ventricular zone; ; ganglionic eminence; ; mucosa of sigmoid colon; ; visceral pleura; ; amniotic fluid; ; parietal pleura; ; periodontal fiber; ; secondary oocyte; ; nipple; ; hair follicle;
	Top expressed in
	lumbar spinal ganglion; ; medullary collecting duct; ; renal corpuscle; ; hair follicle; ; Rostral migratory stream; ; right lung; ; left lung; ; ganglionic eminence; ; vas deferens; ; vestibular membrane of cochlear duct;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	virus receptor activity; protein binding; signaling receptor binding; ephrin receptor binding; protein tyrosine kinase activity;
Cellular component	integral component of membrane; membrane; focal adhesion; plasma membrane; integral component of plasma membrane; Schaffer collateral - CA1 synapse; glutamatergic synapse; integral component of presynaptic membrane; integral component of postsynaptic density membrane;
Biological process	cell differentiation; blood vessel morphogenesis; negative regulation of keratinocyte proliferation; regulation of chemotaxis; cell-cell signaling; anatomical structure morphogenesis; T cell costimulation; lymph vessel development; nervous system development; cell migration involved in sprouting angiogenesis; multicellular organism development; cell adhesion; nephric duct morphogenesis; angiogenesis; animal organ morphogenesis; viral entry into host cell; positive regulation of cardiac muscle cell differentiation; viral process; venous blood vessel morphogenesis; positive regulation of aorta morphogenesis; positive regulation of cell population proliferation; ephrin receptor signaling pathway; axon guidance; negative regulation of neuron projection development; peptidyl-tyrosine phosphorylation; presynapse assembly; regulation of postsynaptic membrane neurotransmitter receptor levels; regulation of postsynaptic neurotransmitter receptor internalization; positive regulation of neuron death;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	1948
	13642
	ENSG00000125266
	ENSMUSG00000001300
	P52799
	P52800
	НМ_004093 ; НМ_001372056 ; НМ_001372057 ; НМ_001372058
	НМ_010111 ; НМ_001368299
	НП_004084 ; НП_001358985 ; НП_001358986 ; НП_001358987
	НП_034241 ; НП_001355228
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Эфрин-В2 — это белок , который у человека кодируется EFNB2 геном . ^{[ 5 ]}

Функция

Этот ген кодирует члена семейства эфринов (EPH). Эфрины и рецепторы, связанные с EPH, составляют самое большое подсемейство рецепторных протеинтирозинкиназ и участвуют в опосредовании событий развития, особенно в нервной системе и эритропоэзе . В зависимости от структуры и взаимоотношений последовательностей эфрины делятся на класс эфрина-А (EFNA), которые прикреплены к мембране с помощью гликозилфосфатидилинозитоловой связи, и класс эфрина-B (EFNB), которые представляют собой трансмембранные белки. Этот ген кодирует эфрин класса EFNB, который связывается с рецепторами EPHB4 и EPHA3 . ^{[ 6 ]}

Рак

Ген EFNB2 постепенно подавлялся в вирус папилломы человека , положительных на неопластических кератиноцитах шейки матки , полученных из предопухолевых поражений на разных уровнях злокачественности. ^{[ 7 ]} По этой причине EFNB2, вероятно, связан с онкогенезом и может быть потенциальным прогностическим маркером прогрессирования предопухолевых поражений шейки матки . ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что EFNB2 взаимодействует с EPHA3. ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]} и EPHB1 в развитии перекреста зрительных нервов . ^{[ 10 ]}

Также было показано, что EFNB2 служит рецептором вируса Хендра и вируса Нипах , опосредуя проникновение в клетку во время инфекции. ^{[ 11 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000125266 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000001300 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Бональдо М.Ф., Ю. М.Т., Еленц П., Браун С., Су Л., Лоутон Л., Дивен Л., Эфстратиадис А., Уорбертон Д., Соарес М.Б. (сентябрь 1994 г.). «Отбор кДНК с использованием хромосомно-специфичных геномных клонов: применение к хромосоме 13 человека». Молекулярная генетика человека . 3 (9): 1663–73. дои : 10.1093/hmg/3.9.1663 . ПМИД 7833926 .
^ «Ген Энтреза: EFNB2 эфрин-В2» .
^ Перейти обратно: ^а ^б Ротондо Х.К., Боси С., Басси К., Феррацин М., Ланца Г., Гафа Р., Магри Э., Селватичи Р., Торресани С., Марси Р., Гарутти П., Негрини М., Тоньон М., Мартини Ф (апрель 2015 г.). «Изменения экспрессии генов при прогрессировании неоплазии шейки матки, выявленные с помощью микроматричного анализа цервикальных неопластических кератиноцитов». J Клеточная Физиол . 230 (4): 802–812. дои : 10.1002/jcp.24808 . hdl : 11392/2066612 . ПМИД 25205602 . S2CID 24986454 .
^ Черретти Д.П., Ванден Бос Т., Нельсон Н., Козлоски С.Дж., Редди П., Марасковский Э., Парк Л.С., Лайман С.Д., Коупленд Н.Г., Гилберт Д.Д. (ноябрь 1995 г.). «Выделение LERK-5: лиганда тирозинкиназного рецептора, родственного eph» . Молекулярная иммунология . 32 (16): 1197–205. дои : 10.1016/0161-5890(95)00108-5 . ПМИД 8559144 .
^ Лакманн М., Манн Р.Дж., Кравец Л., Смит Ф.М., Буччи Т.А., Максвелл К.Ф., Хоулетт Дж.Дж., Олссон Дж.Э., Ванден Бос Т., Серретти Д.П., Бойд А.В. (июнь 1997 г.). «Лиганд киназы, связанной с EPH (LERK) 7, является предпочтительным лигандом с высоким сродством к рецептору HEK» . Журнал биологической химии . 272 (26): 16521–30. дои : 10.1074/jbc.272.26.16521 . ПМИД 9195962 .
^ Уильямс С.Э., Манн Ф., Эрскин Л., Сакураи Т., Вей С., Росси DJ, Гейл Н.В., Холт CE, Мейсон К.А., Хенкемейер М. (сентябрь 2003 г.). «Эфрин-B2 и EphB1 опосредуют расхождение аксонов сетчатки в перекресте зрительных нервов» . Нейрон . 39 (6): 919–35. дои : 10.1016/j.neuron.2003.08.017 . ПМИД 12971893 .
^ Бонапарт М.И., Димитров А.С., Боссарт К.Н., Крамери Г., Мангалл Б.А., Бишоп К.А., Чоудри В., Димитров Д.С., Ван Л.Ф., Итон Б.Т., Бродер CC (июль 2005 г.). «Лиганд эфрина-B2 является функциональным рецептором вируса Хендра и вируса Нипах» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (30): 10652–7. Бибкод : 2005PNAS..10210652B . дои : 10.1073/pnas.0504887102 . ПМЦ 1169237 . ПМИД 15998730 .

Дальнейшее чтение

Фланаган Дж. Г., Вандерхаген П. (1998). «Эфрины и рецепторы Eph в развитии нервной системы». Ежегодный обзор неврологии . 21 : 309–45. дои : 10.1146/annurev.neuro.21.1.309 . ПМИД 9530499 .
Чжоу Р. (март 1998 г.). «Рецепторы и лиганды семейства Eph». Фармакология и терапия . 77 (3): 151–81. дои : 10.1016/S0163-7258(97)00112-5 . ПМИД 9576626 .
Холдер Н., Кляйн Р. (май 1999 г.). «Рецепторы Eph и эфрины: эффекторы морфогенеза». Разработка . 126 (10): 2033–44. дои : 10.1242/dev.126.10.2033 . ПМИД 10207129 .
Уилкинсон Д.Г. (2000). «Рецепторы Eph и эфрины: регуляторы наведения и сборки». Международный обзор цитологии . 196 : 177–244. дои : 10.1016/S0074-7696(00)96005-4 . ISBN 9780123646002 . ПМИД 10730216 .
Сюй Ц, Меллитцер Г., Уилкинсон Д.Г. (июль 2000 г.). «Роль рецепторов Eph и эфринов в формировании сегментного паттерна» . Философские труды Лондонского королевского общества. Серия Б, Биологические науки . 355 (1399): 993–1002. дои : 10.1098/rstb.2000.0635 . ПМЦ 1692797 . ПМИД 11128993 .
Уилкинсон Д.Г. (март 2001 г.). «Множественные роли рецепторов EPH и эфринов в развитии нервной системы». Обзоры природы. Нейронаука . 2 (3): 155–64. дои : 10.1038/35058515 . ПМИД 11256076 . S2CID 205014301 .
Беннетт Б.Д., Зейглер ФК, Гу Q, Фендли Б, Годдард А.Д., Джиллетт Н., Мэтьюз В. (март 1995 г.). «Молекулярное клонирование лиганда протеинтирозинкиназы Htk, связанного с EPH» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (6): 1866–70. Бибкод : 1995PNAS...92.1866B . дои : 10.1073/pnas.92.6.1866 . ПМК 42383 . ПМИД 7534404 .
Черретти Д.П., Ванден Бос Т., Нельсон Н., Козлоски С.Дж., Редди П., Марасковский Э., Парк Л.С., Лайман С.Д., Коупленд Н.Г., Гилберт Д.Д. (ноябрь 1995 г.). «Выделение LERK-5: лиганда тирозинкиназного рецептора, родственного eph» . Молекулярная иммунология . 32 (16): 1197–205. дои : 10.1016/0161-5890(95)00108-5 . ПМИД 8559144 .
Черретти Д.П., Лайман С.Д., Козлоски С.Дж., Коупленд Н.Г., Гилберт Д.Д., Дженкинс Н.А., Валентайн В., Кирстейн М.Н., Шапиро Д.Н., Моррис С.В. (апрель 1996 г.). «Гены, кодирующие лиганды тирозинкиназы рецептора, родственного eph, LERK-1 (EPLG1, Epl1), LERK-3 (EPLG3, Epl3) и LERK-4 (EPLG4, Epl4), сгруппированы на хромосоме 1 человека и хромосоме 3 мыши» . Геномика . 33 (2): 277–82. дои : 10.1006/geno.1996.0192 . ПМИД 8660976 .
Гейл Н.В., Холланд С.Дж., Валенсуэла Д.М., Фленникен А., Пан Л., Райан Т.Е., Хенкемейер М., Стребхардт К., Хираи Х., Уилкинсон Д.Г., Поусон Т., Дэвис С., Янкопулос Г.Д. (июль 1996 г.). «Рецепторы и лиганды Eph включают два основных подкласса специфичности и взаимно компартментализируются во время эмбриогенеза» . Нейрон . 17 (1): 9–19. дои : 10.1016/S0896-6273(00)80276-7 . ПМИД 8755474 .
Холланд С.Дж., Гейл Н.В., Мбамалу Г., Янкопулос Г.Д., Хенкемейер М., Поусон Т. (октябрь 1996 г.). «Двунаправленная передача сигналов через рецептор Nuk семейства EPH и его трансмембранные лиганды». Природа . 383 (6602): 722–5. Бибкод : 1996Natur.383..722H . дои : 10.1038/383722a0 . hdl : 1807/9444 . ПМИД 8878483 . S2CID 4349898 .
Эфноменклатурный комитет (август 1997 г.). «Единая номенклатура рецепторов семейства Eph и их лигандов, эфринов. Комитет по номенклатуре Eph» . Клетка . 90 (3): 403–4. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80500-0 . ПМИД 9267020 .
Фогт Т., Штольц В., Уэлш Дж., Юнг Б., Кербель Р.С., Кобаяши Х., Ландталер М., Макклелланд М. (март 1998 г.). «Сверхэкспрессия информационной РНК Lerk-5/Eplg5: новый маркер повышенной онкогенности и метастатического потенциала при злокачественных меланомах человека». Клинические исследования рака . 4 (3): 791–7. ПМИД 9533549 .
Ван Ху, Чен Цзы Ф., Андерсон DJ (май 1998 г.). «Молекулярные различия и ангиогенное взаимодействие между эмбриональными артериями и венами, выявленные эфрином-B2 и его рецептором Eph-B4» . Клетка . 93 (5): 741–53. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81436-1 . ПМИД 9630219 .
Николова З, Джонов В, Цюрхер Г, Андрес А.С., Земецкий А (сентябрь 1998 г.). «Специфическая для клеточного типа и эстроген-зависимая экспрессия рецепторной тирозинкиназы EphB4 и ее лиганда эфрина-B2 во время морфогенеза молочной железы». Журнал клеточной науки . 111 (18): 2741–51. дои : 10.1242/jcs.111.18.2741 . ПМИД 9718367 .
Торрес Р., Файрстейн Б.Л., Донг Х., Штаудингер Дж., Олсон Э.Н., Хуганир Р.Л., Бредт Д.С., Гейл Н.В., Янкопулос Г.Д. (декабрь 1998 г.). «Белки PDZ связываются, группируются и синаптически колокализуются с рецепторами Eph и их эфриновыми лигандами» . Нейрон . 21 (6): 1453–63. дои : 10.1016/S0896-6273(00)80663-7 . ПМИД 9883737 .
Лин Д., Гиш Г.Д., Сонгян З., Поусон Т. (февраль 1999 г.). «Карбоксильный конец эфринов класса B представляет собой мотив связывания домена PDZ» . Журнал биологической химии . 274 (6): 3726–33. дои : 10.1074/jbc.274.6.3726 . ПМИД 9920925 .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 13 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000125266 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000001300 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7833926-5] Бональдо М.Ф., Ю. М.Т., Еленц П., Браун С., Су Л., Лоутон Л., Дивен Л., Эфстратиадис А., Уорбертон Д., Соарес М.Б. (сентябрь 1994 г.). «Отбор кДНК с использованием хромосомно-специфичных геномных клонов: применение к хромосоме 13 человека». Молекулярная генетика человека . 3 (9): 1663–73. дои : 10.1093/hmg/3.9.1663 . ПМИД 7833926 .

[entrez-6] «Ген Энтреза: EFNB2 эфрин-В2» .

[Rotondo_2015-7] Перейти обратно: ^а ^б Ротондо Х.К., Боси С., Басси К., Феррацин М., Ланца Г., Гафа Р., Магри Э., Селватичи Р., Торресани С., Марси Р., Гарутти П., Негрини М., Тоньон М., Мартини Ф (апрель 2015 г.). «Изменения экспрессии генов при прогрессировании неоплазии шейки матки, выявленные с помощью микроматричного анализа цервикальных неопластических кератиноцитов». J Клеточная Физиол . 230 (4): 802–812. дои : 10.1002/jcp.24808 . hdl : 11392/2066612 . ПМИД 25205602 . S2CID 24986454 .

[pmid8559144-8] Черретти Д.П., Ванден Бос Т., Нельсон Н., Козлоски С.Дж., Редди П., Марасковский Э., Парк Л.С., Лайман С.Д., Коупленд Н.Г., Гилберт Д.Д. (ноябрь 1995 г.). «Выделение LERK-5: лиганда тирозинкиназного рецептора, родственного eph» . Молекулярная иммунология . 32 (16): 1197–205. дои : 10.1016/0161-5890(95)00108-5 . ПМИД 8559144 .

[pmid9195962-9] Лакманн М., Манн Р.Дж., Кравец Л., Смит Ф.М., Буччи Т.А., Максвелл К.Ф., Хоулетт Дж.Дж., Олссон Дж.Э., Ванден Бос Т., Серретти Д.П., Бойд А.В. (июнь 1997 г.). «Лиганд киназы, связанной с EPH (LERK) 7, является предпочтительным лигандом с высоким сродством к рецептору HEK» . Журнал биологической химии . 272 (26): 16521–30. дои : 10.1074/jbc.272.26.16521 . ПМИД 9195962 .

[10] Уильямс С.Э., Манн Ф., Эрскин Л., Сакураи Т., Вей С., Росси DJ, Гейл Н.В., Холт CE, Мейсон К.А., Хенкемейер М. (сентябрь 2003 г.). «Эфрин-B2 и EphB1 опосредуют расхождение аксонов сетчатки в перекресте зрительных нервов» . Нейрон . 39 (6): 919–35. дои : 10.1016/j.neuron.2003.08.017 . ПМИД 12971893 .

[11] Бонапарт М.И., Димитров А.С., Боссарт К.Н., Крамери Г., Мангалл Б.А., Бишоп К.А., Чоудри В., Димитров Д.С., Ван Л.Ф., Итон Б.Т., Бродер CC (июль 2005 г.). «Лиганд эфрина-B2 является функциональным рецептором вируса Хендра и вируса Нипах» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (30): 10652–7. Бибкод : 2005PNAS..10210652B . дои : 10.1073/pnas.0504887102 . ПМЦ 1169237 . ПМИД 15998730 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

v т и Межклеточные сигнальные пептиды и белки/ лиганды
Growth factors	Epidermal growth factor Fibroblast growth factor Nerve growth factor Platelet-derived growth factor Transforming growth factor beta superfamily Vascular endothelial growth factor
Ephrin	EFNA1 EFNA2 EFNA3 EFNA4 EFNA5 EFNB1 EFNB2 EFNB3
Other	Adipokine Agouti signaling protein Agouti-related protein Angiogenic protein CCN intercellular signaling protein Cysteine-rich protein 61 Connective tissue growth factor Nephroblastoma overexpressed protein Cytokine Endothelin EDN1 EDN2 EDN3 Hedgehog protein Interferon Kinin Parathyroid hormone-related protein Semaphorin Somatomedin Tolloid-like metalloproteinase Tumor necrosis factor Wnt protein
see also extracellular ligand disorders