Jump to content

Морские микроорганизмы

(Перенаправлено из морской микробной )

Роль микробного сообщества в морском углеродном цикле

Морские микроорганизмы определяются их средой обитания как микроорганизмы, живущие в морской среде , то есть в соленой воде моря или океана или солоноватой воды прибрежного устья . Микроорганизм (или микроб ) представляет собой любой микроскопический живой организм или вирус , который невидимо мал для невооруженного человеческого глаза без увеличения . Микроорганизмы очень разнообразны. Они могут быть одноклельными [ 1 ] или многоклеточный и включающий бактерии , археи , вирусы и большинство простейших , а также несколько грибов , водорослей и животных, таких как шпильки и тростниковые . Многие макроскопические животные и растения имеют микроскопические ювенильные стадии . Некоторые микробиологи также классифицируют вирусы как микроорганизмы, но другие считают их неживые. [ 2 ] [ 3 ]

Морские микроорганизмы по -разному составляют около 70%, [ 4 ] или около 90%, [ 5 ] [ 6 ] биомассы в океане . Взятые вместе они образуют морской микробиом . Через миллиарды лет этот микробиом развил много стилей жизни и адаптации и участвует в глобальном велосипеде практически всех химических элементов. [ 7 ] Микроорганизмы имеют решающее значение для утилизации питательных веществ в экосистемах , поскольку они действуют как декомпозиер . Они также ответственны за почти весь фотосинтез , который происходит в океане, а также на велосипеде углерода , азота , фосфора и других питательных веществ и следовых элементов. [ 8 ] Морские микроорганизмы изобилуют большие количества углерода и производят большую часть мирового кислорода.

Небольшая часть морских микроорганизмов является патогенными , вызывая заболевания и даже смерть у морских растений и животных. [ 9 ] Однако морские микроорганизмы перерабатывают основные химические элементы , которые производят и потребляют около половины всего органического вещества, генерируемого на планете каждый год. Как жители крупнейшей среды на Земле, микробные морские системы ведут изменения в каждой глобальной системе.

В июле 2016 года ученые сообщили о выявлении набора из 355 генов из последнего универсального общего предка (Лука) всей жизни на планете, включая морские микроорганизмы. [ 10 ] Несмотря на свое разнообразие, микроскопическая жизнь в океанах все еще плохо изучена. Например, роль вирусов в морских экосистемах едва изучена даже в начале 21 -го века. [ 11 ]

Микробные коврики
Микробные коврики - самая ранняя форма жизни на Земле, для которой есть хорошие ископаемые доказательства. Изображение показывает цианобактериальный -альгал -коврик.
Строматолиты образуются из микробных ковриков, поскольку микробы медленно движутся вверх, чтобы не задушить отложения.
Относительные размеры микроскопических сущностей

Микроорганизмы составляют около 70% морской биомассы . [ 4 ] Микроорганизм слишком маленький , , или микроб, представляет собой микроскопический организм, чтобы быть адекватно распознаваемым невооруженным глазом. На практике это включает в себя организмы меньше, чем около 0,1 мм. [ 12 ] : 13 

Такие организмы могут быть одноклельными [ 1 ] или многоклеточный . Микроорганизмы разнообразны и включают в себя все бактерии и археи , большинство протистов , включая водоросли , простейшие и грибкоподобные протисты, а также некоторых микроскопических животных, таких как шнифки . Многие макроскопические животные и растения имеют микроскопические ювенильные стадии . Некоторые микробиологи также классифицируют вирусы как микроорганизмы, но другие считают их неживыми. [ 2 ] [ 3 ]

Микроорганизмы имеют решающее значение для утилизации питательных веществ в экосистемах , поскольку они действуют как декомпозиер . Некоторые микроорганизмы являются патогенными , вызывающие заболевание и даже смерть у растений и животных. [ 9 ] Как жители крупнейшей среды на Земле, микробные морские системы ведут изменения в каждой глобальной системе. Микробы отвечают практически за весь фотосинтез , который происходит в океане, а также на велосипеде углерода , азота , фосфора и других питательных веществ и следовых элементов. [ 8 ]

Морские микроорганизмы

Хотя недавние технологические разработки и научные открытия были существенными, нам по -прежнему не хватает особого понимания на всех уровнях основных экологических вопросов в отношении микроорганизмов в наших морях и океанах. Эти фундаментальные вопросы:
1. Что там? Какие микроорганизмы присутствуют в наших морях и океанах и в каких числах они встречаются?
2. Что они делают? Какие функции выполняют каждый из этих микроорганизмов в морской среде и как они способствуют глобальным циклам энергии и материи?
3. Каковы факторы, которые определяют наличие или отсутствие микроорганизма и как они влияют на биоразнообразие и функции и наоборот?

- Европейский научный фонд , 2012 [ 12 ] : 14 

Диапазон размеров, показанных прокариотами (бактериями и археей) и вирусами относительно видов других организмов и биомолекул
Под увеличением, всплеск морской воды замирает микроскопической жизнью

Микроскопическая жизнь подводная жизнь разнообразна и все еще плохо изучена, например, для роли вирусов в морских экосистемах. [ 13 ] Большинство морских вирусов - это бактериофаги , которые безвредны для растений и животных, но имеют важное значение для регуляции соленой и пресноводных экосистем. [ 14 ] Они заражают и разрушают бактерии в водных микробных сообществах и являются наиболее важным механизмом утилизации углерода в морской среде. Органические молекулы, высвобождаемые из мертвых бактериальных клеток, стимулируют рост свежих бактерий и водорослей. [ 15 ] способствовать биологическому насосу , процесс, посредством которого углерод изолируется Вирусная активность также может в глубоком океане. [ 16 ]

Морский спрей, содержащий морские микроорганизмы, можно охватить высоко в атмосферу, где они становятся аэропланктоном , и могут путешествовать по миру, прежде чем упасть на Землю.

Поток воздушных микроорганизмов окружает планету над погодными системами, но ниже коммерческих воздушных дорожек. [ 17 ] Некоторые перипатетические микроорганизмы охвачены от наземных пыльных бури, но большинство из них происходят из морских микроорганизмов при морском спрея . В 2018 году ученые сообщили, что сотни миллионов вирусов и десятков миллионов бактерий ежедневно откладываются на каждом квадратном метре вокруг планеты. [ 18 ] [ 19 ]

Микроскопические организмы живут на протяжении всей биосферы . Масса прокариот -микроорганизмов, которые включают бактерии и археи, но не зародышевые микроорганизмы эукариот -микроорганизмов , может составлять до 0,8 триллионов углерода (общей биосферной массы , оцениваемой в 1-4 триллиона тонн). [ 20 ] Одноклеточные барофильные морские микробы были обнаружены на глубине 10 900 м (35 800 футов) в траншеи Мариан , самого глубокого места в океанах Земли. [ 21 ] [ 22 ] Микроорганизмы живут в скалах 580 м (1900 футов) ниже морского пола под 2590 м (8500 футов) океана у побережья северо -запада Соединенных Штатов , [ 21 ] [ 23 ] а также 2400 м (7900 футов; 1,5 мили) под морским дном у Японии. [ 24 ] Наибольшая известная температура, при которой может существовать срок службы микробов, составляет 122 ° C (252 ° F) ( Methanopyrus kandleri ). [ 25 ] В 2014 году ученые подтвердили существование микроорганизмов, живущих на 800 м (2600 футов) ниже льда Антарктиды . [ 26 ] [ 27 ] По словам одного исследователя, «вы можете найти микробы повсюду - они чрезвычайно адаптируются к условиям и выживают, где бы они ни находились». [ 21 ] Морские микроорганизмы служат «основой всех морских пищевых сетей, утилизации основных элементов и производства и потребления около половины органического вещества, создаваемого на земле каждый год». [ 28 ] [ 29 ]

Морские вирусы

[ редактировать ]
Вирус-хост взаимодействия в морской экосистеме,
включая вирусную инфекцию бактерий, фитопланктона и рыбы [ 30 ]

Вирус инфекционный - это небольшой агент , который повторяет только внутри живых клеток других организмов . Вирусы могут заразить все виды форм жизни , от животных и растений до микроорганизмов , включая бактерии и археи . [ 31 ]

Когда не внутри зараженной клетки или в процессе инфекции клетки, вирусы существуют в форме независимых частиц. Эти вирусные частицы, также известные как вирионы , состоят из двух или трех частей: (i) генетический материал (геном), изготовленный из ДНК или РНК , длинных молекул , которые несут генетическую информацию; (ii) белковое пальто, называемое капсидом , которое окружает и защищает генетический материал; и в некоторых случаях (iii) оболочка липидов , которая окружает белковое пальто, когда они находятся за пределами клетки. Формы этих вирусных частиц варьируются от простых спиральных и икосаэдрических форм для некоторых видов вирусов до более сложных структур для других. Большинство видов вирусов имеют вирионы, которые слишком малы, чтобы их можно было увидеть с помощью оптического микроскопа . Средний вирион составляет около одного сотого размера средней бактерии .

Происхождение вирусов в эволюционной истории жизни неясно: некоторые, возможно, развивались из плазмид - части ДНК, которые могут перемещаться между клетками, в то время как другие могли развиваться из бактерий. В эволюции вирусы являются важным средством горизонтального переноса генов , что увеличивает генетическое разнообразие . [ 32 ] Некоторые считают вирусами жизненной формой, потому что они несут генетический материал, воспроизводят и развиваются посредством естественного отбора . Тем не менее, им не хватает ключевых характеристик (таких как структура клеток), которые обычно считаются необходимыми для сведения как жизнь. Поскольку они обладают некоторыми, но не всеми такими качествами, вирусы были описаны как «организмы на грани жизни» [ 33 ] и как репликаторы. [ 34 ]

Бактериофаги (фаги)
Несколько фагов, прикрепленных к бактериальной клеточной стенке при увеличении 200 000 раз
Диаграмма типичного хвостового фага
Фаг вводит свой геном в бактерии

Вирусы встречаются везде, где бывает жизнь и, вероятно, существовали с тех пор, как живые клетки впервые развивались. [ 35 ] Происхождение вирусов неясно, потому что они не образуют окаменелости, поэтому молекулярные методы использовались для сравнения ДНК или РНК вирусов и являются полезным средством изучения того, как они возникли. [ 36 ]

Вирусы теперь признаются древними и имеют происхождение, которое предварительно дает дивергенцию жизни в три области . [ 37 ]

Мнения отличаются от того, являются ли вирусы формой жизни или органических структур, которые взаимодействуют с живыми организмами. [ 34 ] Некоторые считают, что они являются жизненной формой, потому что они несут генетический материал, воспроизводясь, создавая несколько копий самих себя посредством самосборки и развиваются посредством естественного отбора . Однако им не хватает ключевых характеристик, таких как клеточная структура, как правило, считается необходимым для считать жизнь. Поскольку они обладают некоторыми, но не всеми такими качествами, вирусы были описаны как репликаторы [ 34 ] и как «организмы на краю жизни». [ 33 ]

Это цианофаги , вирусы, которые заражают цианобактерии (масштабные стержни обозначают 100 нм)

Бактериофаги , часто называемые фагами , являются вирусами, которые паразиты бактерии и археи. Морские фаги паразит морские бактерии и археи, такие как цианобактерии . [ 38 ] Они являются общей и разнообразной группой вирусов и являются наиболее распространенной биологической сущностью в морской среде, потому что их хозяева, бактерии, обычно являются численной доминирующей клеточной жизнью в море. Как правило, в каждой мл морской воды насчитывается от 1 миллиона до 10 миллионов вирусов, или примерно в десять раз больше двухцепочечных ДНК-вирусов, чем клеточные организмы, [ 39 ] [ 40 ] Хотя оценки вирусного изобилия в морской воде могут варьироваться в широком диапазоне. [ 41 ] [ 42 ] В течение долгого времени хвостовые фаги ордена Каудовиралс, по -видимому, доминировали в морских экосистемах по количеству и разнообразию организмов. [ 38 ] Однако в результате более недавних исследований не хвост вирусы, по-видимому, доминируют по нескольким глубинах и океаническим регионам, за которыми следуют семьи каудовирал миовирусов, подовирусов и сифавирусов. [ 43 ] Фаги, принадлежащие семьям: Corticoviridae , [ 44 ] Inoviridae , [ 45 ] Microviridae , [ 46 ] и Autolykiviridae [ 47 ] [ 48 ] [ 49 ] [ 50 ] Также известно, что заражают разнообразные морские бактерии.

Существуют также архейские вирусы, которые реплицируются в археи : это двухцепочечные ДНК-вирусы с необычными, а иногда и уникальными формами. [ 51 ] [ 52 ] Эти вирусы были изучены наиболее подробно в термофильной археи, в частности, заказы сульфобалы и термопротеалы . [ 53 ]

Роль вирусов

[ редактировать ]

Микроорганизмы составляют около 70% морской биомассы. [ 4 ] По оценкам, вирусы убивают 20% этой биомассы каждый день, и что в океанах в 15 раз больше вирусов, чем бактерии и археи. Вирусы являются основными агентами, ответственными за быстрое разрушение вредных цветов водорослей , [ 40 ] которые часто убивают другую морскую жизнь. [ 54 ] Количество вирусов в океанах уменьшается дальше от берега и глубже в воду, где меньше организмов хозяина. [ 16 ]

Вирусы являются важным естественным средством передачи генов между различными видами, что увеличивает генетическое разнообразие и развивает эволюцию. [ 32 ] Считается, что вирусы сыграли центральную роль в ранней эволюции, до диверсификации бактерий, археи и эукариот, во время последнего универсального общего предка жизни на Земле. [ 55 ] Вирусы по -прежнему являются одним из крупнейших резервуаров неисследованного генетического разнообразия на Земле. [ 16 ]

Гигантские вирусы

[ редактировать ]
Гигантский мимивирус
Крупнейший известный вирус, Тупанвирус , названный в честь Тупа , высшего бога гуарани

Вирусы обычно варьируются в длину от 20 до 300 нанометров. Это может быть контрастировано с длиной бактерий, которая начинается с 400 нанометров. Существуют также гигантские вирусы , часто называемые прожилками , как правило, около 1000 нанометров (один микрон) в длину. Все гигантские вирусы принадлежат к филому нуклеоцитовирикоты (NCLDV), вместе с оспами . Самым крупным известным из них является Tupanvirus . Этот род гигантского вируса был обнаружен в 2018 году в глубоком океане, а также в газированном озере, и может достигать 2,3 микрона общей длины. [ 56 ]

Открытие и последующая характеристика гигантских вирусов вызвали некоторые дебаты, касающиеся их эволюционного происхождения. [ 57 ] Две основные гипотезы для их происхождения заключаются в том, что либо они эволюционировали из небольших вирусов, забирая ДНК из организмов-хозяев, либо эволюционировали из очень сложных организмов в нынешнюю форму, которая не является самодостаточной для размножения. [ 58 ] Из каких сложных вирусов гиганта организма могли бы расходиться, также является темой дебатов. Одним из предложений является то, что точка происхождения фактически представляет четвертую домену жизни, [ 59 ] [ 60 ] Но это было в значительной степени дисконтировано. [ 61 ] [ 62 ]

Прокариоты

[ редактировать ]

Морские бактерии

[ редактировать ]
Pelagibacter Ubique , наиболее распространенные бактерии в океане, играет важную роль в глобальном углеродном цикле .
Vibrio vulnificus , вирулентная бактерия, обнаруженная в устьях и вдоль прибрежных районов
Электронная микрофотография показывает вид широко распространенного Cyanobacteria synechococcus . Карбоксизомы появляются в виде многогранных темных структур.

Бактерии большой домен прокариотических микроорганизмов представляют собой . Обычно по длине нескольких микрометров бактерии имеют ряд форм, начиная от сфер до стержней и спиралей. Бактерии были одними из первых форм жизни, которые появлялись на Земле , и присутствуют в большинстве его средств обитания . Бактерии населяют почву, воду, кислотные горячие источники , радиоактивные отходы , [ 63 ] и глубокие части земной коры . Бактерии также живут в симбиотических и паразитных отношениях с растениями и животными.

Оказавшись рассматриваемыми как растения, составляющие классовые шизомицеты , бактерии в настоящее время классифицируются как прокариоты . В отличие от клеток животных и других эукариот , бактериальные клетки не содержат ядро ​​и редко содержат , связанные с мембранами мембраны . Хотя термин бактерии традиционно включал все прокариоты, научная классификация изменилась после открытия в 1990 -х годах, что прокариоты состоят из двух очень разных групп организмов, которые возникли из древнего общего предка. Эти эволюционные домены называются бактериями и археей . [ 64 ]

Предки современных бактерий были одноклеточными микроорганизмами, которые были первыми формами жизни , появившимися на Земле, около 4 миллиардов лет назад. В течение примерно 3 миллиардов лет большинство организмов были микроскопическими, а бактерии и археи были доминирующими формами жизни. [ 65 ] [ 66 ] Хотя существуют бактериальные окаменелости , такие как строматолиты , их отсутствие отличительной морфологии не позволяет их использовать для изучения истории эволюции бактерий или до настоящего времени времени происхождения конкретных видов бактерий. Тем не менее, последовательности генов могут использоваться для реконструкции бактериальной филогении , и эти исследования показывают, что бактерии смещались в первую очередь от архейной/эукариотической линии. [ 67 ] Бактерии также участвовали во второй великой эволюционной дивергенции, у археи и эукариот. Здесь эукариоты были получены в результате входа в древние бактерии в эндосимбиотические ассоциации с предками эукариотических клеток, которые сами по себе были связаны с архей . [ 68 ] [ 69 ] Это включало в себя поглощение протоукариотическими клетками альфапротеобактериальных симбионтов с образованием либо митохондрий , либо водородных средств , которые все еще обнаруживаются во всех известных эукарья. Позже некоторые эукариоты, которые уже содержали митохондрии, также охватили цианобактериальные организмы. Это привело к образованию хлоропластов в водорослях и растениях. Есть также некоторые водоросли, которые возникли даже из -за более поздних эндосимбиотических событий. Здесь эукариоты охватили эукариотические водоросли, которые превратились в пластид «второго поколения». [ 70 ] [ 71 ] Это известно как вторичный эндосимбиоз .

Pelagibacter Ubique и его родственники могут быть самыми распространенными организмами в океане, и было утверждено, что они, возможно, являются самыми распространенными бактериями в мире. Они составляют около 25% всех клеток микробного планктона , и летом они могут объяснить примерно половину клеток, присутствующих в поверхностных водах умеренного океана. Общая численность P. ubique и родственников оценивается около 2 × 10 28 Микробы. [ 73 ] HTVC010P бактериофаг Тем не менее, в феврале 2013 года сообщалось, что , который атакует P. ubique , был обнаружен, и «вероятно, это действительно самый распространенный организм на планете». [ 74 ] [ 75 ]

Самая большая известная бактерия, морская тиомаргарита namibiensis , может быть видна невооруженным глазом, а иногда достигает 0,75 мм (750 мкм). [ 76 ] [ 77 ]

Морская архея

[ редактировать ]
Археи первоначально рассматривались как экстремофилы, живущие в суровых условиях, такие как желтая археа, изображенная здесь в горячем источнике , но с тех пор они были обнаружены в гораздо более широком диапазоне среды обитания . [ 78 ]

Археи ( греческая для древних [ 79 ] ) представляют домен и королевство одноклеточных микроорганизмов собой . Эти микробы представляют собой прокариоты , что означает, что они не имеют клеточного ядра или каких-либо других мембранных органеллов в своих клетках.

Археи были первоначально классифицированы как бактерии , но эта классификация устарела. [ 80 ] Архаальные клетки обладают уникальными свойствами, отделяющими их от двух других доменов жизни, бактерий и эукариоты . Археи дополнительно разделены на множественные признанные фила . Классификация сложна, потому что большинство не были изолированы в лаборатории и были обнаружены только путем анализа их нуклеиновых кислот в образцах из окружающей среды.

Археи и бактерии, как правило, похожи по размеру и форме, хотя у нескольких археи есть очень странные формы, такие как плоские и квадратные клетки Haloquadratum walsbyi . [ 81 ] Несмотря на это морфологическое сходство с бактериями, Archaea обладает генами и несколькими метаболическими путями , которые более тесно связаны с эукариотами, в частности, ферментами, участвующими в транскрипции и трансляции . Другие аспекты архейной биохимии уникальны, такие как их зависимость от эфирных липидов в их клеточных мембранах , таких как археолы . Archaea использует больше источников энергии, чем эукариоты: они варьируются от органических соединений , таких как сахара, до аммиака , ионов металлов или даже газа водорода . Соленый устойчивый к археи (Haloarchaea ) используйте солнечный свет в качестве источника энергии, а другие виды археи фиксируют углерод ; Однако, в отличие от растений и цианобактерий , ни один известные виды археи не делают оба. Археи воспроизводится бесполезно бинарным делением , фрагментацией или подажником ; В отличие от бактерий и эукариот, ни один известные виды не образуют споры .

Археи особенно многочисленны в океанах, и археи в планктоне может быть одной из самых распространенных групп организмов на планете. Археи являются основной частью жизни Земли и могут играть роль как в углеродном цикле , так и в цикле азота . Термопротеота (также известная как эоциты или Crenarchaeota) представляют собой тип археи, который считается очень распространенным в морской среде и одним из основных участников фиксации углерода. [ 82 ]

Эукариоты

[ редактировать ]
Parakaryon myojinensis , возможная переходная форма между прокариотом и эукариот

Откуда взялись эукариотические клетки? - Путешествие в микрокосмос

Все живые организмы могут быть сгруппированы как прокариоты или эукариоты . Жизнь возникла как одноклеточные прокариоты, а затем превратилась в более сложные эукариоты. В отличие от прокариотических клеток, эукариотические клетки высокоорганизованы. Прокариоты являются бактериями и археей, в то время как эукариоты являются другими формами жизни - протистами , растениями, грибами и животными. Протисты обычно одноклеточны, в то время как растения, грибы и животные обычно многоклеточны .

Кажется очень правдоподобным, что корень эукариот лежит в археи; Самыми ближайшими родственниками в настоящее время известны, могут быть филом Heimdallarchaeota предлагаемого суперфилума Asgard . Эта теория является современной версией сценария, первоначально предложенного в 1984 году как гипотеза эоцитов , когда термопротета были самыми близкими известными архейными родственниками эукариот. Возможная переходная форма микроорганизма между прокариотом и эукариотом была обнаружена в 2012 году японскими учеными. Parakaryon Myojinensis - это уникальный микроорганизм, больше, чем типичный прокариот, но с ядерным материалом, заключенным в мембрану, как в эукариоте, и наличие эндосимбионтов . Это является первой правдоподобной эволюционной формой микроорганизма, демонстрирующей стадию развития от прокариота до эукариоте. [ 83 ] [ 84 ]

Морские протисты

[ редактировать ]

Протисты - это эукариоты, которые не могут быть классифицированы как растения, грибы или животные. Обычно они одноклеточные и микроскопические. Жизнь возникла как одноклеточные прокариоты (бактерии и археи), а затем превратились в более сложные эукариоты . Эукариоты - более развитые формы жизни, известные как растения, животные, грибы и протисты. Термин «Протист» исторически использовался в качестве условия удобства для эукариот, которые не могут быть строго классифицированы как растения, животные или грибы. Они не являются частью современной кладистики, потому что они парафилетические (отсутствуют общего предка).

По трофическому режиму

[ редактировать ]

Протисты могут быть в целом разделены на четыре группы в зависимости от того, является ли их питание, похожее на животные, похожие на грибковые, похожие на грибку, [ 85 ] или смесь из них. [ 86 ]

Протисты в соответствии с тем, как они получают еду
Тип профиста Описание Пример Некоторые другие примеры
Растение Автотрофические протисты, которые делают свою собственную пищу без необходимости потребления других организмов, обычно с помощью фотосинтеза Зеленые водоросли, пирамимоны Красные и коричневые водоросли , диатомовые и некоторые динофлагелляты . Растительные протисты являются важными компонентами фитопланктона, обсуждаемых ниже .
Животный Гетеротрофные протисты, которые получают пищу, потребляют другие организмы (бактерии, археи и небольшие водоросли) Радиоларийный профист, нарисованный Хейкель Фораминифераны и некоторые морские амебы , реснички и жгутики .
Грибкоподобный Сапротрофные протисты, которые получают пищу от остатков организмов, которые разбились и разлагались Морские сети слизи формируют лабиринтные сети трубок, в которых амеба без псевдопод может путешествовать Морской лишайник
Миксотропс
Различный
Миксотрофические и осмотрофные протисты, которые получают пищу из комбинации вышеупомянутого Euglena -изменение , фотосинтетический жгутичок Многие морские миксотропы обнаружены среди протистов, особенно среди ресничек и динофлагеллятов [ 87 ]
микрофотография
Клеточная схема
Считается, что choanoflagellates , одноклеточные «воротнистые» фластисты , являются самыми близкими живыми родственниками животных . [ 88 ]

Протисты представляют собой очень разнообразные организмы, в настоящее время организованные в 18 Phyla, но их нелегко классифицировать. [ 89 ] [ 90 ] Исследования показали, что высокое разнообразие протиста существует в океанах, глубоких морских и речных отложениях, что позволяет предположить, что большое количество эукариотических микробных сообществ еще не обнаружено. [ 91 ] [ 92 ] Было мало исследований по миксотрофным протистам, но недавние исследования в морских средах показали, что миксотрофные протесты вносят значительный вклад в профистную биомассу . [ 87 ] Поскольку протисты являются эукариотами, которые они обладают в своей клетке, по крайней мере, в одном ядре , а также органелле, таких как митохондрии и тела Гольджи . Протисты бесполые, но могут быстро воспроизводить через митоз или фрагментацию .

Внешние видео
видео значок Как микроскопические охотники получают свой обед
видео значок Евзоидлиноиды: одноклеточные оборотники
видео значок Как простейшие простейшие?

В отличие от клеток прокариот, клетки эукариот очень организованы. Растения, животные и грибы обычно являются многоклеточными и обычно макроскопические . Большинство протистов являются одноклельными и микроскопическими. Но есть исключения. Некоторые одноклеточные морские протисты макроскопичны. Некоторые морские плесень слизи имеют уникальные жизненные циклы, которые включают переключение между одноклеточными, колониальными и многоклеточными формами. [ 95 ] Другие морские протесты не являются ни одноклельными, ни микроскопическими, такими как морские водоросли .

Протисты были описаны как таксономический мешок с закусками, где может быть размещено все, что не вписывается в одно из основных биологических королевств . [ 98 ] Некоторые современные авторы предпочитают исключать многоклеточные организмы из традиционного определения протиста, ограничивающего протисты одноклеточными организмами. [ 99 ] [ 100 ] Это более ограниченное определение исключает много коричневых , многоклеточных красных и зеленых водорослей и слизи . [ 101 ]

По локоме

[ редактировать ]

Другой способ классификации протистов - в соответствии с их способом передвижения. Многие одноклеточные протисты, особенно простейшие, являются подвижными и могут генерировать движение, используя жгутиков , ресничек или псевдопод . Клетки, которые используют жгутиков для движения, обычно называют жгутиками , клетки, которые используют реснички, обычно называют ресничку , а клетки, которые используют псевдопод, обычно называют амебой или амебоидами . Другие протисты не являются подвижными и, следовательно, не имеют механизма движения.

Протисты в соответствии с тем, как они движутся
Тип профиста Механизм движения Описание Пример Другие примеры
Движения Жгутики Плачениц )-это придаток , (латынь для кнута похожий на ресниц, который выступает из клеточного тела некоторых протистов (а также некоторых бактерий). Плаговки используют от одного до нескольких жгутиков для передвижения, а иногда в качестве кормления и сенсорной органеллы . Криптофиты Все динофлагелляты и нанофлагелляты ( хоанофлагелляты , силикофлагелляты , большинство зеленых водорослей ) [ 102 ] [ 103 ]
(Другие протисты проходят фазу в качестве гамета , когда у них есть временный жгутичок - некоторые радиолярии , фораминиферс и apicomplexa )
Реснички Ресничка ( латынь для ресниц ) - это крошечный жгутичок. Инрустры используют несколько ресничек, которые могут насмехаться за многие сотни, чтобы питать себя через воду. Paramecium bursaria
Нажмите, чтобы увидеть реснички
Фораминифераны и некоторые морские амебы , реснички и жгутики .
Амеба
(амебоиды)
Амеба обладает способностью изменять форму, расширяя и убирая псевдопод (греческие для ложных ног ). [ 104 ]
Амеба Найдено в каждой крупной профильской линии . Амебоидные клетки встречаются среди простейших , но также у водорослей и грибов . [ 105 ] [ 106 ]
Не подвижный
никто
Диатомо Диатомовые , кокколитофоры и не мотильные виды phaeocystis [ 103 ] Среди простейших паразитические апикомпетки не являются мотильными.

Плаговки включают бактерии, а также протисты. Модель роторного двигателя, используемая бактериями, использует протоны электрохимического градиента для перемещения их жгутиков. Крутящий момент в жгутиках бактерий создается частицами, которые проводят протоны вокруг основания жгутика. Направление вращения жгутиков в бактериях происходит от занятости протонных каналов вдоль периметра жгутикового двигателя. [ 107 ]

Цилиаты, как правило, имеют сотни до тысяч ресничек, которые плотно упакованы вместе в массивах. Во время движения индивидуальный ресничек деформируется с использованием силового хода с высоким содержанием фарки с последующим ударом восстановления с низким содержанием фонаря. Поскольку на отдельном организме есть несколько ресничек, они демонстрируют коллективное поведение в метахрональном ритме . Это означает, что деформация одной реснички находится в фазе с деформацией его соседа, вызывая волны деформации, которые распространяются вдоль поверхности организма. Эти распространяющиеся волны ресничек - это то, что позволяет организму использовать реснички скоординированным образом для движения. Типичным примером ресничного микроорганизма является парамеция , одноклеточный ресничный протозой, покрытый тысячами ресничек. Избиение ресничек вместе позволяют парамециуму простираться через воду со скоростью 500 микрометров в секунду. [ 108 ]

Внешние видео
видео значок Paramecium: белая крыса ресничек

Морские грибы

[ редактировать ]
Лишайник на скале в морской зоне брызг . Лишайники являются взаимными ассоциациями между грибом и водорослей или цианобактерией.
Морская улитка , Littoraria irrorata , покрытая лишайкой. Эти улитки на фермах линейные грибки

Более 1500 видов грибов известны из морской среды. [ 109 ] Они паразита на морских водорослях или животных, или являются сапробами, питающимися мертвым органическим веществом из водорослей, кораллов, простейших кист, морских трав и других субстратов. [ 110 ] Споры многих видов имеют специальные придатки, которые облегчают привязанность к субстрату. [ 111 ] Морские грибы также можно найти в морской пене и вокруг гидротермальных районов океана. [ 112 ] разнообразные необычные вторичные метаболиты . Морские грибы производят [ 113 ]

Микопланктон являются сапротропными членами планктонов сообществ морских и пресноводных экосистем . [ 114 ] [ 115 ] Они состоят из нитевидных и дрожжей , грибков связанных с планктонными частицами или фитопланктоном . [ 116 ] Подобно бактериопланктону , эти водные грибы играют значительную роль в гетеротрофной минерализации и велосипеде питательных веществ . [ 117 ] Несмотря на то, что в основном микроскопические, некоторые микопланктон может иметь диаметр до 20 мм и длиной более 50 мм. [ 118 ]

Типичный миллилитр морской воды содержит около 10 3 до 10 4 Грибковые клетки. [ 119 ] Это число больше в прибрежных экосистемах и устьях из -за стока питания от наземных сообществ. Более высокое разнообразие микопланктона встречается вокруг побережья и в поверхностных водах до 1000 метров, с вертикальным профилем , который зависит от того, насколько обильным фитопланктоном является. [ 120 ] [ 121 ] Этот профиль изменяется между сезонами из -за изменений в доступности питательных веществ. [ 122 ] Морские грибы выживают в постоянной среде с дефицитом кислорода и, следовательно, зависят от диффузии кислорода с помощью турбулентности и кислорода, генерируемых фотосинтетическими организмами . [ 123 ]

Морские грибы можно классифицировать как: [ 123 ]

Лишайники - это взаимные ассоциации между грибом, обычно аскомицетом , и водорослей или цианобактерией . Несколько лишайников встречаются в морской среде. [ 124 ] Многие другие встречаются в зоне всплеска , где они занимают разные вертикальные зоны в зависимости от того, насколько они терпимы к погружению. [ 125 ] Некоторые лишайники живут долго; Один вид был датирован на 8600 лет. [ 126 ] Однако их продолжительность жизни трудно измерить, потому что то, что определяет один и тот же лишайник, не точнее. [ 127 ] Лишайники растут путем вегетативно разбивающегося кусочка, который может быть или не быть определен как один и тот же лишайник, и две лишайники разных возрастов могут слиться, поднимая проблему того, является ли это одним и тем же лишайником. [ 127 ]

Морская улитка Tittoraria Irrorata наносит ущерб растениям Спартина в морских болотах, где она живет, что позволяет спорам литоральных ашо -амортизированных грибов колонизировать растение. Улитка тогда ест грибковой рост в предпочтениях самой траве. [ 128 ]

Согласно Fossil Records, грибы датируются покойной протерозойской эпохой 900-570 миллионов лет назад. В Китае было обнаружено, что ископаемые морские лишайны 600 миллионов лет были обнаружены. [ 129 ] Было выдвинуто предположение, что микопланктон развивался из наземных грибов, вероятно, в палеозойскую эпоху (390 миллионов лет назад). [ 130 ]

Морские микроанимали

[ редактировать ]
Внешние видео
видео значок Coepods: Король планктона, разжигающий диатом
видео значок Гастротрии: четырехдневные бабушки
видео значок Взереки: очаровательно странно и часто игнорируется
видео значок Тардиграды: пухлые, неправильно понятые, а не бессмертные

Как несовершеннолетние, животные развиваются с микроскопических стадий, которые могут включать споры , яйца и личинки . По крайней мере, одна микроскопическая группа животных, паразитарная Cnidarian Myxozoa , является одноклеточной во взрослой форме и включает в себя морские виды. Другие взрослые морские микроанимали являются многоклеточными. Микроскопические взрослые членистоногих чаще встречаются внутренними в пресной воде, но есть и морские виды. Микроскопические морские ракообразные для взрослых включают в себя несколько копеподов , кладоцеров и тардиградов (водные медведи). Некоторые морские нематоды и шнурки также слишком малы, чтобы их можно было распознавать невооруженным глазом, как и многие Loricifera , в том числе недавно обнаруженные анаэробные виды, которые проводят свои жизни в аноксической среде. [ 131 ] [ 132 ] МОППОДЫ вносят больший вклад в второстепенную продуктивность и поглотику углерода мировых океанов, чем любая другая группа организмов.

Основные производители

[ редактировать ]
Композитное изображение, показывающее глобальное распределение фотосинтеза, включая как океанического фитопланктона , так и наземная растительность . Темно-красный и сине-зеленый указывает на области высокой фотосинтетической активности в океане и на земле, соответственно.

Основными производителями являются организмы AutoTroph , которые делают свою собственную пищу вместо того, чтобы употреблять другие организмы. Это означает, что основные производители становятся отправной точкой в ​​пищевой цепи для гетеротрофных организмов, которые едят другие организмы. Некоторые морские первичные производители являются специализированными бактериями и архей, которые являются хемотрофами , делая собственную пищу, собираясь вокруг гидротермальных вентиляционных отверстий и прохладных просачиваний и используя хемосинтез . Однако большая часть морской первичной продукции поступает от организмов, которые используют фотосинтез на углекисленном диоксиде, растворенной в воде. Этот процесс использует энергию от солнечного света для преобразования воды и углекислого газа [ 133 ] : 186–187  в сахара, которые можно использовать как в качестве источника химической энергии, так и органических молекул, которые используются в структурных компонентах клеток. [ 133 ] : 1242  Морские первичные производители важны, потому что они лежат в основе практически всей жизни морских животных, генерируя большую часть кислорода и пищи, которые предоставляют другие организмы с химической энергией, которую им необходимо существовать.

Основными морскими первичными производителями являются цианобактерии , водоросли и морские растения. Кислород , выпущенный в виде побочного продукта фотосинтеза, нужен почти всеми живыми существами для выполнения клеточного дыхания . Кроме того, первичные производители влияют на глобальные углеродные и водные циклы. Они стабилизируют прибрежные районы и могут предоставлять места обитания для морских животных. Термин «деление» традиционно использовалось вместо филома при обсуждении первичных производителей, но Международный кодекс номенклатуры для водорослей, грибов и растений в настоящее время принимает оба термина в качестве эквивалента. [ 134 ]

Цианобактерии

[ редактировать ]
Цианобактерии
Цианобактерии из микробного коврика . Цианобактерии были первыми организмами, которые высвобождали кислород с помощью фотосинтеза
Крошечный Cyanobacterium prochlorococcus является основным участником атмосферного кислорода
НАСА Изображение большого цветения узлов Cyanobacteria , кружащихся в Балтийском море [ 135 ]
Внешние видео
видео значок Как цианобактерии захватили мир

Цианобактерии были первыми организмами, которые развивали способность превращать солнечный свет в химическую энергию. Они образуют тип (разделение) бактерий, которые варьируются от одноклеточного до нитевидного и включают колониальные виды . Они встречаются почти везде на Земле: в влажной почве, как в пресной, так и в морской среде, и даже на антарктических породах. [ 136 ] В частности, некоторые виды встречаются как дрейфующие клетки, плавающие в океане, и как таковые были одними из первых из фитопланктона .

Первыми основными производителями, которые использовали фотосинтез, были океанические цианобактерии около 2,3 миллиардов лет назад. [ 137 ] [ 138 ] Высвобождение молекулярного кислорода цианобактериями в качестве побочного продукта фотосинтеза вызвало глобальные изменения в окружающей среде Земли. Поскольку кислород был токсичным для большинства жизни на Земле в то время, это привело к почти взысканию организмов-непереносимости кислорода , драматическом изменении , которое перенаправляло эволюцию основных видов животных и растений. [ 139 ]

Крошечный (0,6 мкм ) морской цианобактерий Prochlorococcus , обнаруженный в 1986 году, сегодня является важной частью основания океанической пищевой цепи и объясняет большую часть фотосинтеза открытого океана [ 140 ] и, по оценкам, 20% кислорода в атмосфере Земли. [ 141 ] Возможно, это самый обильный род на Земле: один миллилитр поверхностной морской воды может содержать 100 000 клеток или более. [ 142 ]

Первоначально биологи считали, что цианобактерии были водоросли, и называли его «сине-зелеными водорослями». Более позднее мнение состоит в том, что цианобактерии являются бактериями, и, следовательно, даже не в том же королевстве, что и водоросли. Большинство властей исключают все прокариоты и, следовательно, цианобактерии из определения водорослей. [ 143 ] [ 144 ]

Водоросли

[ редактировать ]

Волосли являются неформальным термином для широко распространенной и разнообразной группы фотосинтетических протистов , которые не обязательно связаны и, таким образом, являются полифилетическими . Морские водоросли можно разделить на шесть групп: зеленые , красные и коричневые водоросли , эвгленофиты , динофлагелляты и диатомовые ткатовые .

Динофлагелляты и диатомовые средства являются важными компонентами морских водорослей и имеют свои собственные участки ниже. Евгленфиты представляют собой тип одноклеточных жгутиков с несколькими морскими членами.

Не все водоросли микроскопичны. Зеленые, красные и коричневые водоросли имеют многоклеточные макроскопические формы, которые составляют знакомые морские водоросли . Зеленые водоросли , неформальная группа, содержит около 8000 признанных видов. [ 145 ] Многие виды живут большую часть своей жизни как отдельные клетки или являются нитевидными, в то время как другие образуют колонии, состоящие из длинных цепей клеток, или являются высоко дифференцированными макроскопическими морскими водорослями. Красные водоросли , а (оспариваемый) филом содержит около 7000 признанных видов, [ 146 ] В основном многоклеточные и включающие много известных морских водорослей. [ 146 ] [ 147 ] Коричневые водоросли образуют класс , содержащий около 2000 признанных видов, [ 148 ] В основном многоклеточные и включающие много морских водорослей, таких как водоросли . В отличие от более высоких растений, водорослей не хватает корней, стеблей или листьев. Они могут быть классифицированы по размеру как микроводоросли или макроводоросли .

Микроводоросли - это микроскопические виды водорослей, не видимые невооруженным глазом. Это в основном одноклеточные виды, которые существуют в качестве индивидуумов или в цепях или группах, хотя некоторые из них являются многоклеточными . Микроводоросли являются важными компонентами морских протистов, обсуждаемых выше , а также фитопланктона, обсуждаемых ниже . Они очень разнообразны . Было подсчитано, что было описано 200 000-800 000 видов, из которых было описано около 50 000 видов. [ 149 ] В зависимости от вида их размеры варьируются от нескольких микрометров (мкМ) до нескольких сотен микрометров. Они специально адаптированы к окружающей среде, в которой преобладают вязкие силы.

Одноклеточные организмы обычно являются микроскопическими. Есть исключения. Вейнглас «Русалочка» , родом субтропических зеленых водорослей , представляет собой одноклеточные, но удивительно большие и сложные по форме с одним большим ядром, что делает его образцовым организмом для изучения клеточной биологии . [ 150 ] Другие одноклеточные водоросли, Caulerpa Taxifolia , имеют появление сосудистого растения, в том числе «листья», устроенные аккуратно вверх по стеблям, как папоротник. Селективное размножение в аквариумах для производства более твердых штаммов привело к случайному выбросу в Средиземноморье, где он стал инвазивным видом, известным в разговорной речи как убийственных водорослей . [ 151 ]

Макроводоросли являются более крупными, многоклеточными и более заметными типами водорослей, обычно называемых морских водорослей . Морские водоросли обычно растут в неглубоких прибрежных водах, где они привязаны к морскому дну . Как и микроводоросли, макроводоросли (морские водоросли) можно рассматривать как морские протисты, поскольку они не являются настоящими растениями. Но они не микроорганизмы, поэтому они не находятся в рамках этой статьи.

Морской микропланктон

[ редактировать ]
Шесть относительно больших организмов по различной форме с десятками небольших светлых точек на фоне темного фона. Некоторые из организмов имеют антенны, которые длиннее их тел.
Планктон - это дрейфующие или плавающие организмы, которые не могут эффективно плавать против течения, и включают организмы из большинства областей жизни: бактерии , археи , водоросли , простейшие и животные .
Красный, оранжевый, желтый и зеленый представляют участки, где расцветает водоросль. Голубые области представляют собой зоны с питательными веществами, где фитопланктон существует в более низких концентрациях.

Планктон (от греческого для странников ) представляют собой разнообразную группу организмов, которые живут в толще воды из больших водоемов, но не могут плавать против течения. В результате они бродят или дрейфуют с течениями. [ 153 ] Планктон определяется их экологической нишей , а не какой -либо филогенетической или таксономической классификацией. Они являются важным источником пищи для многих морских животных, от кормовой рыбы до китов . Планктон можно разделить на растение, похожий на растение, и компонент животных.

Фитопланктон

[ редактировать ]
Phytoplankton - например, эта колония Chaetoceros socialis - естественно испускает красное флуоресцентное свет, который рассеивает избыточную солнечную энергию, которую они не могут употреблять с помощью фотосинтеза. Это свечение может быть обнаружена спутниками как показатель того, насколько эффективно океанский фитопланктон является фотосинтезированием. [ 154 ] [ 155 ]

Фитопланктон -это растения, подобные компонентам сообщества планктона («Фито» происходит от греческого для растения ). Они являются автотрофными (самосыпляющимися), что означает, что они генерируют свою собственную еду и не должны потреблять другие организмы.

Фитопланктон выполняет три важные функции: они генерируют почти половину мирового кислорода в атмосфере, они регулируют уровни углекислого газа в океане и атмосфере и образуют основание морской пищевой сети . Когда условия правы, цветы фитопланктонов водорослей могут происходить в поверхностных водах. Фитопланктон-это R-стратегии , которые быстро растут и могут удвоить свою популяцию каждый день. Цветы могут стать токсичными и истощать воду кислорода. Тем не менее, числа фитопланктона обычно контролируются фитопланктоном, исчерпавающим доступные питательные вещества и за счет выпаса зоопланктона. [ 156 ]

Фитопланктон состоят в основном из микроскопических фотосинтетических эукариот , которые обитают в верхнем солнечном слое во всех океанах. Им нужен солнечный свет, чтобы они могли фотосинтезировать. Большинство фитопланктона являются одноклеточными водорослями, но другие фитопланктон-бактерии, а некоторые- профили . [ 157 ] Фитопланктон включают цианобактерии (выше) , диатомовые тела , различные другие виды водорослей (красный, зеленый, коричневый и желто-зеленый), динофлагелляты , евзоиды , кокколитофориды , криптомонады , хлорофиты , празинофиты и силокофлагалтаты . Они формируют базу первичного производства , которая управляет океанской продовольственной паутиной , и учитывает половину нынешнего глобального первичного производства, больше, чем наземные леса. [ 158 ]

Диатомовые

[ редактировать ]
Диатомовые формы
Чертежи Haeckel 1904 (нажмите на детали)

Диатомы образуют (оспариваемый) филим, содержащий около 100 000 распознанных видов в основном одноклеточных водорослей. Диатомовые средства генерируют около 20 процентов кислорода, производимого на планете каждый год, [ 93 ] брать более 6,7 миллиардов метрических тонн кремния каждый год из вод, в которых они живут, [ 159 ] и внести почти половину органического материала, найденного в океанах.

Диатомовые
Диатомовые средства имеют раковину кремнезема ( надушка ) с радиальной (центрической) или двусторонней (трудовой) симметрией

Диатомы закрыты в оболочках защитного кремнезема (стекло), называемых ящиками . Каждая ямочка изготовлена ​​из двух взаимосвязанных деталей, покрытых крошечными отверстиями, через которые диатома обменивается питательными веществами и отходами. [ 156 ] Престолы мертвых диатомов дрейфовали на дно океана, где в течение миллионов лет они могут нарастать до половины мили глубиной . [ 160 ]

Структура центрика [ 162 ]
Внешние видео
видео значок Диатомовые: крошечные фабрики, которые вы можете увидеть из космоса

Кокколитофоры

[ редактировать ]

Кокколитофоры - это мельчайшие одноклеточные фотосинтетические протисты с двумя жгутиками для локомоции. Большинство из них защищены оболочкой, покрытой богато украшенными круглыми пластинами или чешуйками, называемыми кокколитами . Кокколиты изготовлены из карбоната кальция. Оболочки кальцита важны для морского углеродного цикла. [ 163 ] Термин кокколитофор вытекает с греческого языка для семян, несущего камень , ссылаясь на их небольшой размер и камни кокколита, которые они несут. При правильных условиях они цветут, как и другие фитопланктоны, и могут повернуть молочный белый. [ 164 ]

Микробный родопсин

[ редактировать ]
Модель механизма генерирования энергии у морских бактерий
(1) Когда солнечный свет поражает молекулу родопсина
(2) Он изменяет свою конфигурацию, поэтому протон исключен из ячейки
(3) Химический потенциал приводит к тому, что протон вытекает обратно в клетку
(4) таким образом генерируя энергию
(5) в форме аденозин трихосфат . [ 165 ]

Фототрофический метаболизм основан на одном из трех энергетических пигментов: хлорофилл , бактериохлорофилл и сетчатка . Сетчатка является хромофором, обнаруженным в родопсинах . Значение хлорофилла при преобразовании световой энергии было написано на протяжении десятилетий, но фототрофия, основанная на пигментах сетчатки, только начинает изучаться. [ 166 ]

Halobacteria в прудах испарения соли окрашенные фиолетовые [ 167 ]

В 2000 году команда микробиологов во главе с Эдвардом Делонгом сделала решающее открытие в понимании морских углеродных и энергетических циклов. Они обнаружили ген у нескольких видов бактерий [ 168 ] [ 169 ] Отвечает за продукцию белкового родопсина , ранее неслыханный у бактерий. Эти белки, обнаруженные в клеточных мембранах, способны преобразовать энергию света в биохимическую энергию из -за изменения конфигурации молекулы родопсина, когда солнечный свет наносит ее, вызывая накапливание протона изнутри и последующее воспаление, которое генерирует энергию. [ 170 ] Архаальные родопсины впоследствии были обнаружены среди разных таксонов, протистов, а также у бактерий и археи, хотя они редки в сложных многоклеточных организмах . [ 171 ] [ 172 ] [ 173 ]

Исследования в 2019 году показывают, что эти «защехающие солнечные бактерии» более распространены, чем предполагалось ранее, и могут изменить то, как глобальное потепление влияет на океаны. «Результаты преодолевают традиционную интерпретацию морской экологии, обнаруженной в учебниках, в которой говорится, что почти весь солнечный свет в океане захватывается хлорофиллом в водорослях. Вместо этого, оснащенные родопсином бактерий, такие как гибридные автомобили, приведенные в действии органическим веществом. Большинство бактерий - и под солнечным светом, когда питательные вещества мало ». [ 174 ] [ 166 ]

Существует астробиологическая гипотеза, называемая гипотезой Пурпурной Земли , которая предполагает, что первоначальные формы жизни на Земле были на основе сетчатки, а не на хлорофилле, что сделало бы землю фиолетовой вместо зеленого. [ 175 ] [ 176 ]

Redfield и F-соотношения

[ редактировать ]

В течение 1930 -х годов Альфред С. Редфилд обнаружил сходство между составом элементов в фитопланктоне и основными растворенными питательными веществами в глубоком океане. [ 177 ] Редфилд предположил, что отношение углерода к азоту к фосфору (106: 16: 1) в океане контролировалось требованиями фитопланктона, поскольку фитопланктон впоследствии высвобождает азот и фосфор, когда они повсеместны. Это соотношение стало известно как соотношение Редфилда и используется в качестве фундаментального принципа при описании стехиометрии эволюции морской воды и фитопланктона. [ 178 ]

Тем не менее, отношение Редфилда не является универсальным значением и может измениться с такими вещами, как географическая широта. [ 179 ] Основываясь на распределении ресурсов, Phytoplankton может быть классифицирован на три различных стратегии роста: выживший, Bloomer и генерал. Survivalist Phytoplankton имеет высокое соотношение N: P (> 30) и содержит множество механизма приобретения ресурсов для поддержания роста в условиях дефицитных ресурсов. Bloomer Phytoplankton имеет низкое соотношение N: P (<10), содержит высокую долю механизма роста и адаптирован к экспоненциальному росту. Общественный фитопланктон имеет аналогичное соотношение N: P к соотношению Redfield и содержит относительно равный механизм приобретения ресурсов и роста. [ 178 ]

F -Ratio представляет собой долю общего первичного производства, заправленного нитратом (в отличие от того, что питается другими азотными соединениями, такими как аммоний ). Соотношение было первоначально определено Ричардом Эппли и Брюсом Петерсоном в одной из первых работ, оценивающих глобальное производство океана. [ 180 ]

Зоопланктон

[ редактировать ]

Зопланктон - это компонент животных планктонного сообщества («зоопарк» происходит от греческого для животного ). Они гетеротрофны (в другом кормлении), что означает, что они не могут производить свою собственную пищу и должны потреблять вместо других растений или животных в качестве пищи. В частности, это означает, что они едят фитопланктон.

Зопланктон, как правило, больше, чем фитопланктон, в основном все еще микроскопический, но некоторые можно увидеть невооруженным глазом. Многие простейшие (одноклеточные протисты , которые охотятся на другую микроскопическую жизнь) являются зоопланктоном, в том числе Zooflagellates , Foraminiferans , радиолярий , некоторые динофлагелляты и морские микроанамалы . Макроскопический зоопланктон (обычно не рассматриваемый в этой статье) включают пелагических Cnidarians , Ctenophores , моллюсков , членистоногие и туникаты , а также планктонные стрелки и щетины .

Microzooplankton: майор Грейзер из планктона ...

Многие виды простейших ( эукариот ) и бактерий ( прокариоты ) добычи на других микроорганизмах; Режим кормления, очевидно, древний и много раз развивался в обеих группах. [ 181 ] [ 182 ] [ 183 ] Среди пресноводного и морского зоопланктона , часто встречаются одноклеточные или мультиклеточные, хищные выпас на фитопланктоне и меньший зоопланктон и обнаружены во многих видах нанофлагеллятов , динофлагеллятов , цилиатов , гниферов , разнообразных линейков меропланктонов и двух групп. ракообразных, а именно тростников и кладоцеранов . [ 184 ]

Радиоларии

[ редактировать ]
Радиояловые формы
Чертежи Haeckel 1904 (нажмите на детали)

Радиоларии являются одноклеточными хищными протистами, заключенными в сложные шаровые раковины, обычно изготовленные из кремнезема и пронзили отверстия. Их имя происходит от латыни для "радиуса". Они ловят добычу, расширяя части своего тела через отверстия. Как и в случае с кремнеземами ятомов, радиолоальные раковины могут погрузиться в дно океана, когда радиолориалы умирают и становятся сохраняемыми как часть океанского отложения . Эти останки, как микрофоссии , предоставляют ценную информацию о прошлых океанических условиях. [ 185 ]

Тьюринга и радиольфология
Раковина сферического радиоального
Микрофотографии снаряда
Компьютерное моделирование паттернов на сфере в сфере тесно воспроизводит некоторые радиоальные паттерны оболочки [ 186 ]
Внешние видео
видео значок Радиояловая геометрия
видео значок Радиооларийные гравюры Эрнста Хэкеля

Фораминиферанс

[ редактировать ]
Форраминиферанские формы
Чертежи Haeckel 1904 (нажмите на детали)

Подобно радиолььериям, фораминифераны ( Forams для коротких) представляют собой одноклеточные хищные протисты, также защищенные оболочками, которые имеют отверстия в них. Их имя происходит от латыни для «носителей отверстий». Их раковины, часто называемые тестами , находятся в камере (Формам добавляют больше камер по мере роста). Оболочки обычно изготовлены из кальцита, но иногда изготавливаются из агглютинированных частиц отложений или хитона и (редко) кремнезема. Большинство Forams являются бентическими, но около 40 видов являются планктическими. [ 187 ] Они широко исследованы с хорошо известными ископаемыми записями, которые позволяют ученым многое сделать в прошлой среде и климате. [ 185 ]

Фораминиферанс
... может иметь более одного ядра
... и защитные шипы
Фораминифераны являются важными одноклеточными протистами зоопланктона , с тестами кальция
Внешние видео
видео значок Фораминиферанс
видео значок Фараминиферальные сети и рост

Ряд FORAM - миксотрофные ( см. Ниже ). Они имеют одноклеточные водоросли в качестве эндосимбионтов , из различных линий, таких как зеленые водоросли , красные водоросли , золотые водоросли , диатомовые лечения и динофлагелляты . [ 187 ] Миксотрофные фораминифер особенно распространены в океанических водах с бедными питательными веществами. [ 189 ] Некоторые Forams являются kleptoplastic , сохраняя хлоропласты от проглатываемых водорослей для проведения фотосинтеза . [ 190 ]

Duration: 3 minutes and 58 seconds.
Амеба охватывает диатом

Амеба может быть обстреляна ( тестирование ) или обнаженной.

Реснички

[ редактировать ]
Ресничные формы
Чертежи Haeckel 1904 (нажмите на детали)
Tintinnopsis Campanula

Миксотрофы

[ редактировать ]
Миксотрофные радиолярии
Acantharian Radiolarian Hoss Phaeocystis Symbionts
Белая пена фейоцистиса водорослей мыть на пляже

Миксотроф - это организм, который может использовать смесь различных источников энергии и углерода , вместо того, чтобы иметь единый трофический режим на континууме от полной автотрофии на одном конце до гетеротрофии в другом. Предполагается, что миксотрофы составляют более половины всего микроскопического планктона. [ 192 ] Существуют два типа эукариотических миксотрофов: те, которые имеют свои хлоропласты , и те, у кого есть эндосимбионты - и другие, которые приобретают их через клептопластику или порабощают всю фототрофическую клетку. [ 193 ]

Различие между растениями и животными часто ломается в очень маленьких организмах. Возможными комбинациями являются фото- и хемотрофия , лито- и органотрофия , авто- и гетеротрофия или другие комбинации. Миксотрофы могут быть эукариотическими или прокариотическими . [ 194 ] Они могут воспользоваться различными условиями окружающей среды. [ 195 ]

Недавние исследования морского микроазурзопарина показали, что 30–45% численности киляграммы были миксотрофическими, а до 65% амебоидной, форум и радиоловой биомассы была миксотрофической. [ 87 ]

Phaeocystis является важным родом водорослей, обнаруженным как часть морского фитопланктона по всему миру. Он имеет полиморфный жизненный цикл, начиная от свободных клеток до больших колоний. [ 196 ] Он обладает способностью образовывать плавающие колонии, где сотни клеток встроены в гелевую матрицу, которая может массово увеличиваться в размерах во время цветов . [ 197 ] В результате, Phaeocystis вносит важное значение для морского углерода [ 198 ] и циклы серы . [ 199 ] Виды Phaeocystis представляют собой эндосимбионты для акантарских радиолариалов. [ 200 ] [ 201 ]

Миксотрофный планктон, который сочетает в себе фототрофию и гетеротрофию - таблица, основанная на Stoecker et al., 2017 [ 202 ]
Общие типы Описание Пример Дальнейшие примеры
Бактериопланктон Фотохетеротрофный бактериопланктон Вибрио холера Roseobacter spp.
Erythrobacter spp.
Gammaproteobacterial Clade OM60
Широко распространенная среди бактерий и археи
Фитопланктон Называется конститутивными миксотрофами Mitra et al., 2016. [ 203 ] Фитопланктон, которые едят: фотосинтетические протисты с унаследованными пластидами и способность принимать добычу. Ochromonas Виды Ochromonas spp.
Придневник маленький
примеры: фрагридий -субглобозум , гетерокапса -треугольный , карлодиний викенарум , неоцератийная вилка , оксифиз Динофлагеллятные
Зоопланктон Называется не совместимыми миксотрофами Mitra et al., 2016. [ 203 ] Зопланктон, которые являются фотосинтетическими: Microzooplankton или зоопланктон Metazoan, которые приобретают фототрофию через удержание хлоропластов а или поддержание эндосимбионтов водорослей.
Универсалы Протисты, которые сохраняют хлоропласты и редко другие органеллы от многих таксонов водорослей Большинство олиготрихских цилиат, которые сохраняют пластиды а
Специалисты 1. Протисты, которые сохраняют хлоропласты, а иногда и другие органеллы из одного вида водорослей или очень тесно связанных видов водорослей Динофиз акумината Динофиз Spp.
Myrionecta Red
2. Протисты или зоопланктон с эндосимбионтами водорослей только одного вида водорослей или очень тесно связанных видов водорослей Noctiluca Scintillans Метазуплтон с эндосимбионтами водорослей
Большинство миксотрофных Rhizaria ( Acantharea , Polycystinea и Foraminifera )
Зеленая Noctiluca Scintillans
а Хлоропласт (или пластид) удержание = секвестрация = порабощение. Некоторые виды, поддерживающие пластид, также сохраняют другие органеллы и добычу цитоплазму.

Dinoflagellates

[ редактировать ]
Динофлагеллятные формы
Неоруженные Dinoflagellates Kofoid (1921)
Haeckel Peridinea (1904)

Динофлагелляты являются частью группы водорослей и образуют тип одноклеточных жгутиков с около 2000 морских видов. [ 204 ] Название происходит от греческого «диноми», означающих вихрь и латинский «жгутичок», означающий кнут или ресницы . Это относится к двум привязанным к кнуту (жгутичье), используемые для движения вперед. Большинство динофлагеллятов защищены красной коричневой, целлюлозной броней. Как и другие фитопланктоны, динофлагелляты являются R-стратегистами , которые в правильных условиях могут цветут и создавать красные приливы . Раскопки могут быть самой базальной жгутиковой линией. [ 102 ]

По трофической ориентации динофлагелляты не могут быть равномерно классифицированы. Известно, что некоторые динофлагелляты являются фотосинтетическими , но большая часть из них на самом деле сочетая миксотрофическая , сочетающая фотосинтез с приглашением добычи ( фаготрофия ). [ 205 ] Некоторые виды представляют собой эндосимбионты морских животных и других протистов и играют важную роль в биологии коралловых рифов . Другие предшествуют другим простейшим, и несколько форм являются паразитными. Многие динофлагелляты являются миксотрофными и также могут быть классифицированы как фитопланктон.

Токсичный динофлагеллятный динофиз Acuta приобретает хлоропласты от своей добычи. «Он не может уловить криптофиты сами по себе, и вместо этого опирается на употребление ресничек, таких как красно -мирионекта , которая секвеста своих хлоропластов из определенного криптофита клады (Geminigera/Plagioselmis/Teleaulax)». [ 202 ]

Волна для серфинга ночью блестит синим светом из -за присутствия биолюминесцентного динофлагеллята, такого как полиэдрум лингулодиния
Предлагаемое объяснение светящегося моря [ 206 ]
Dinoflagellates
Бронированный
Безрубы
Традиционно динофлагелляты были представлены как бронированные или безвольные

Динофлагелляты часто живут в симбиозе с другими организмами. Многие населларийские радиолярийские дома находятся своих в тестах. [ 207 ] Nassellarian обеспечивает аммоний и углекислый газ для динофлагеллята, в то время как динофлагеллят обеспечивает населларию слизистую мембрану, полезную для охоты и защиты от вредных захватчиков. [ 208 ] есть данные о Из анализа ДНК том, что динофлагеллятный симбиоз с радиояльцами развивался независимо от других динофлагелляционных симбиозов, таких как с фораминифера . [ 209 ]

Некоторые динофлагелляты биолюминесцентные . Ночью вода океана может освещаться внутренне и сверкать синим светом из -за этих динофлагеллятов. [ 210 ] [ 211 ] Биолюминесцентные динофлагелляты обладают сцинтиллонами , отдельными цитоплазматическими телами, которые содержат динофлагеллят люциферазу , основной фермент, участвующий в люминесценции. Люминесценция, иногда называемая фосфоресценцией моря , возникает в виде коротких (0,1 с) синих вспышек или искры, когда индивидуальные сцинтиллоны стимулируются, как правило, механическими нарушениями, например, лодки или пловца или серфинга. [ 212 ]

Морские отложения и микрофоссили

[ редактировать ]
Каменный кинжал Отси Ледяной , который жил в медь -эпоху . Лезвие изготовлено из черта , содержащих радиолььеры, кальсферы, кальпионеллиды и несколько спикул губки. Присутствие кальпионеллидов , которые вымерли, использовалось для встречи с этим кинжалом. [ 216 ]

Отложения в нижней части океана имеют два основных происхождения, терригенные и биогенные.

Терригенные отложения составляют около 45% от общего морского осадка и возникают в эрозии пород на суше, транспортируемых реками и земельными стоками, ветроэнергетической пылью, вулканами или шлифованием ледниками.

Биогенные отложения учитывают остальные 55% от общего отложения и происходят в скелетных остатках морских протистов (одноклеточные микроорганизмы планктона и бентоса). Также могут присутствовать гораздо меньшие количества осажденных минералов и метеорической пыли. Происхождение , в контексте морского осадка, относится не к консистенции осадка, а к его биологическому происхождению. Термин «слизь» первоначально использовался Джоном Мюрреем , «отцом современной океанографии», который предложил термин радиояловый исток для отложений кремнезема радиоальных раковинов, приведенных на поверхность во время экспедиции Челленджер . [ 217 ] Биогенная слива - это пелагический осадок, содержащий не менее 30 процентов от скелетных остатков морских организмов.

Основные виды биогенной истощения
тип минерал
формы
профист
вовлеченный
Название скелета типичный размер
(мм)
Силисенский соз SIO 2
кремнезый
Кварц
стекло
опал
chert
диатомо Frustulula От 0,002 до 0,2 [ 218 ] Diatom Microfossil с 40 миллионов лет назад
радиояловый тест или оболочка От 0,1 до 0,2 сложная раковина кремнезема
Известняковая слива Како 3
кальцит
арагонит
известняк
мрамор
мела
Фараминиферан тест или оболочка <1 Кальцифицированный тест планктического фораминиферана. Около 10 000 живых видов фораминиферов [ 219 ]
Кокколитофор кокколиты <0,1 [ 220 ] Кокколитофоры являются крупнейшим глобальным источником биогенного карбоната кальция и значительно способствуют глобальному углеродному циклу. [ 221 ] Они являются основной составляющей меловых месторождений, таких как белые скалы Дувра .

Морские микробентос

[ редактировать ]
Рок Археи-Эта глубокая океанская скала укрыла черви, которые потребляли метановые археи

Морские микробентосы - это микроорганизмы, которые живут в бентической зоне океана - которые живут вблизи или на морском дне, или внутри или на поверхностных отложениях морского дна. Слово бентос происходит от греческого, что означает «глубина моря». Microbenthos встречаются повсюду на морском дне континентальных полков или вокруг, а также в более глубоких водах, с большим разнообразием в отложениях морского дна. В мелководье луга из морских трав , коралловые рифы и водоросли обеспечивают особенно богатые места обитания. В фотоамериканских зонах . В литоральных зонах изменение прилива сильно контролируют возможности для микробентоса.

Как фораминифера, так и диатомовые средства имеют планктонные и бентовые формы, то есть они могут дрейфовать в толще воды или жить на отложениях на дне океана. В любом случае, их снаряды оказываются на морском дне после смерти. Эти раковины широко используются в качестве климатических прокси . Химический состав оболочек является следствием химического состава океана в то время, когда были образованы раковины. Прошлые температуры воды также могут быть выведены из соотношений стабильных изотопов кислорода в раковинах, поскольку более легкие изотопы более легко испаряются в более теплой воде, оставляя более тяжелые изотопы в раковинах. Информация о прошлом климате может быть выведена дальше из изобилия фурматов и диатомовых ткатоев, поскольку они, как правило, более распространены в теплой воде. [ 223 ]

Внезапное событие вымирания , которое убило динозавров 66 миллионов лет назад, также вызвало вымершие три четверти всех других видов животных и растений. Однако глубоководные бентические фарамы процветали после последствий. В 2020 году сообщалось, что исследователи изучили химический состав тысяч образцов этих бентических фурамов и использовали свои результаты для создания наиболее подробной климатической записи Земли. [ 224 ] [ 225 ]

Некоторые эндолиты имеют чрезвычайно долгую жизнь. В 2013 году исследователи сообщили о доказательствах эндолитов в дне океана, возможно, миллионы лет, и время поколения составило 10 000 лет. [ 226 ] Они медленно метаболизируются, а не в состоянии покоя. Некоторым актиномицетота , обнаруженным в Сибири , по оценкам, полмиллиона лет. [ 227 ] [ 228 ] [ 229 ]

Морские микробиомы

[ редактировать ]

Симбиоз и Холобионты

[ редактировать ]
Основные типы микробных симбиозов
(А) Микробные взаимодействия варьируются от взаимовыгодного до вредного для одного или нескольких партнеров. Синие стрелки с двойными головами подчеркивают, что отношения могут двигаться между классификациями, на которые часто влияют условия окружающей среды. (B) Симбиозы в хосте-микробах следует учитывать в контексте микробных сообществ, где хозяин участвует в многочисленных и часто разных симбиотических отношениях. (C) Микробные сообщества подвержены влиянию различных симбиозов микроботового микроба, начиная от сотрудничества (например, синтрофия или совместного метаболизма) до конкуренции. Стрелки изображают в целом полезные (синие) и вредные (красные) результаты для одного (одиночная стрелка) или обоих (двойная стрелка). Примечание, как и в случае с симбиозами-хозяином-микробом, эти отношения можно рассматривать как жидкость и под влиянием условий окружающей среды. [ 230 ]

Концепция Holobiont была первоначально определена доктором Линн Маргулисом в ее книге 1991 года как источник эволюционного инновации как собрания хозяина и многих других видов, живущих в нем или вокруг него, которые вместе образуют отдельную экологическую единицу . [ 231 ] Компонентами голобиона являются отдельные виды или бионты , в то время как комбинированный геном всех бионтов является гологеномом . [ 232 ]

Концепция впоследствии развивалась с момента этого оригинального определения, [ 233 ] с фокусом, перемещающимся к микробным видам, связанным с хозяином. Таким образом, Holobiont включает в себя хозяин, вирус , микробиом и другие участники, каждый из которых каким -то образом способствует функции целого. [ 234 ] [ 235 ] Холобионт обычно включает в себя эукариота хозяин и все симбиотические вирусы , бактерии , грибы и т. Д., Которые живут на или внутри него. [ 236 ]

Тем не менее, существует противоречия по поводу того, можно ли рассматривать Holobionts как отдельные эволюционные единицы. [ 237 ]

Кораллы, создающие риф, представляют собой хорошо изученные голобионты, которые включают сам кораллы (эукариотические беспозвоночные в классе Anthozoa ), фотосинтетические динофлагелляты, называемые зооксантеллы ( симбиодиния ), а также связанные бактерии и вирусы. [ 238 ] Существуют коэволюционные паттерны для коралловых микробных сообществ и филогения кораллов. [ 239 ]

Морская пищевая сеть

[ редактировать ]

Морские микроорганизмы играют центральную роль в морской продовольственной паутине .

Путь вирусного шунтирования представляет собой механизм, который предотвращает микробных частиц миграцию органического вещества (POM) морских (POM) путем переработки их в растворенное органическое вещество (DOM), которое может быть легко занято микроорганизмами. [ 244 ] Вирусная шунтирование помогает поддерживать разнообразие в микробной экосистеме, предотвращая доминирование в микро-среде. [ 245 ] DOM, переработанный вирусным шунтированным путем, сопоставим с количеством, генерируемым другими основными источниками морского DOM. [ 246 ]

Роли грибов в морском углеродном цикле [ 247 ]
Путь вирусного шунтирования облегчает поток растворенного органического вещества (DOM) и органического вещества с частицами (POM) через морскую пищевую сеть
Внешние видео
видео значок Тайная жизнь планктона
Размер и классификация морских частиц [ 249 ]
Адаптировано из Simon et al., 2002. [ 250 ]

Нишевые сообщества

[ редактировать ]
Бактерии могут быть полезными. Этот червь Pompeii , экстремофил, обнаруженный только при гидротермальных вентиляционных отверстиях , имеет защитный покров симбиотических бактерий .

Морские микробные сообщества (SIMCO) относятся к группам микроорганизмов, живущих внутри и в интерфейсах морского льда на полюсах. Мягкая матрица, в которой они обитают, имеет сильные вертикальные градиенты солености, света, температуры и питательных веществ. На химию морского льда больше всего влияет соленость рассола, которая влияет на рН и концентрацию растворенных питательных веществ и газов. Рассох , образованный во время таящего морского льда, создает поры и каналы в морском льду, в которых могут жить эти микробы. В результате этих градиентов и динамических условий в нижнем слое льда обнаружено более высокое содержание микробов, хотя некоторые из них находятся в среднем и верхнем слоях. [ 251 ]

Гидротермальные вентиляционные отверстия расположены там, где тектонические пластины перемещаются и распространяются. Это позволяет воде из океана войти в кору Земли, где она нагревается магмой. Увеличивающее давление и температура вынуждают воду из этих отверстий, на выходе вода накапливает растворенные минералы и химические вещества из пород, с которыми она сталкивается. Вентиляционные отверстия можно охарактеризовать температурой и химическим составом как диффузные вентиляционные отверстия , которые высвобождают прозрачную относительно прохладную воду, обычно ниже 30 ° C, как белые курильщики , которые излучают молочную воду при более теплых температурах, около 200-330 ° C, и как черные курильщики , которые испускают воду затемнены накапливаемыми осадками сульфида при горячих температурах, около 300-400 ° C. [ 252 ]

Микробные сообщества гидротермических вентиляционных средств представляют собой микроскопические одноклеточные организмы, которые живут и размножаются в химически отдельной области вокруг гидротермальных вентиляционных отверстий. К ним относятся организмы в микробных матах , свободные плавающие клетки и бактерии в эндосимбиотических отношениях с животными. Поскольку на этих глубинах нет солнечного света, хемосинтез обеспечивается энергией , где симбиотические бактерии и археи образуют дно пищевой цепи и способны поддерживать различные организмы, такие как гигантские трубные черви и черви Pompeii . Эти организмы используют эту симбиотическую связь, чтобы использовать и получить химическую энергию, которая выделяется в этих областях гидротермальных вентиляционных средств. [ 253 ] Хемолитоавтотрофные бактерии могут получать питательные вещества и энергию от геологической активности при гидротермальном вентиляционном отверстии, чтобы исправить углерод в органические формы. [ 254 ]

Вирусы также являются частью гидротермального вентиляционного микробного сообщества, и их влияние на микробную экологию в этих экосистемах является растущей областью исследований. [ 255 ] Вирусы - самая распространенная жизнь в океане, содержит величайший резервуар генетического разнообразия. [ 256 ] Поскольку их инфекции часто являются смертельными, они представляют собой значительный источник смертности и, следовательно, оказывают широкое влияние на биологические океанографические процессы, эволюцию и биогеохимический велосипед в океане. [ 257 ] Однако были обнаружены доказательства того, что вирусы, обнаруженные в вентиляционных местах обитания, приняли более взаимную, чем паразитическую эволюционную стратегию, чтобы пережить экстремальную и нестабильную среду, в которой они существуют. [ 258 ] Было обнаружено, что глубоководные гидротермальные вентиляционные отверстия имеют большое количество вирусов, указывающих на высокую вирусную продукцию. [ 259 ] Как и в других морских средах, глубоководные гидротермальные вирусы влияют на изобилие и разнообразие прокариот и, следовательно, влияют на микробейный биогеохимический велосипед, лизируя своих хозяев. [ 260 ] Тем не менее, в отличие от их роли в качестве источника смертности и контроля населения, были также постулированы вирусы для повышения выживаемости прокариот в экстремальных средах, действующих в качестве резервуаров генетической информации. Поэтому считается, что взаимодействие виросферы с микроорганизмами при стрессах окружающей среды помогают выживанию микроорганизмов посредством рассеивания генов хозяина посредством горизонтального переноса генов . [ 261 ]

Глубокая биосфера и темная материя

[ редактировать ]
Флуоресцентная микроскопия различных пикопланктона в океане, большая часть которой не может быть эффективно изучена, потому что они сопротивляются попыткам лабораторной культуры

- Глубокая биосфера та часть биосферы , которая находится ниже первых нескольких метров поверхности. Он простирается как минимум на 5 километров ниже континентальной поверхности и 10,5 километров ниже поверхности моря, температура, которые могут превышать 100 ° C.

Над поверхностными живыми организмами потребляют органическое вещество и кислород. Ниже, они недоступны, поэтому они используют «пищевые» ( доноры электронов ), такие как водород, высвобождаемый из пород, различными химическими процессами, метаном, уменьшенными соединениями серы и аммония. Они «дышат» электронами, такие как нитраты и нитриты, оксиды марганца и железа, окисленные соединения серы и диоксид углерода.

На большей глубине очень мало энергии, и метаболизм может быть в миллион раз медленнее, чем на поверхности. Клетки могут жить в течение тысячелетий, прежде чем разделиться, и нет известных пределов их возраста. На подповерхностном приходится около 90% биомассы у бактерий и археи, а 15% от общей биомассы для биосферы. Эукариоты также обнаружены, в основном микроскопических, но включают в себя некоторую многоклеточную жизнь. Вирусы также присутствуют и заражают микробы.

Подповерхностные жизненные среды

В 2018 году исследователи из глубокой углеродной обсерватории объявили, что формы жизни , в том числе 70% бактерий и археи на Земле, общая биомасса в 23 миллиарда тонн углерода , живая до 4,8 км (3,0 миль) в глубине под землей, в том числе 2,5 км ( 1,6 мили) ниже морского дна. [ 262 ] [ 263 ] [ 264 ] В 2019 году были обнаружены микробные организмы, живущие на 7 900 футов (2400 м) ниже поверхности, дыхание серы и употребление в скалах, таких как пирит , как их обычный источник пищи. [ 265 ] [ 266 ] [ 267 ] Это открытие произошло в самой старой известной воде на земле. [ 268 ]

Эти аэробные микроорганизмы, обнаруженные глубоко в органически плохих отложениях, находятся в квазиспендированной анимации в течение 100 миллионов лет

В 2020 году исследователи сообщили, что они нашли то, что могло быть самыми длинными формами жизни: аэробные микроорганизмы, которые были в квазиспендированной анимации до 101,5 миллионов лет. Микроорганизмы были обнаружены в органически плохих отложениях 68,9 метра (226 футов) ниже морского дна в южно -тихоокеанском гире (SPG), «самого самого места в океане». [ 269 ] [ 270 ]

Неопознанный сферический микроорганизм водорослей, часть микробной темной материи

На сегодняшний день биологи не смогли культивировать в лаборатории подавляющее большинство микроорганизмов. Это особенно относится к бактериям и археи и связано с отсутствием знаний или способности обеспечивать необходимые условия роста. [ 271 ] [ 272 ] Термин «Микробная темная материя» стал использовать для описания микроорганизмов, которые ученые знают, есть ли существуют, но не смогли культивировать, и чьи свойства остаются неуловимыми. [ 271 ] Микробная темная материя не связана с темной веществом физики и космологии, но так называется сложностью в эффективном изучении ее. Трудно оценить его относительную величину, но принятая грубая оценка заключается в том, что менее одного процента микробных видов в данной экологической нише культурируют. В последние годы усилия предпринимаются для расшифровки большего количества микробной темной материи путем изучения генома последовательности ДНК из образцов окружающей среды [ 273 ] а затем, получая информацию об их метаболизме от их секвенированного генома, способствуя знаниям, необходимым для их выращивания.

Микробное разнообразие

[ редактировать ]

Методы отбора проб

[ редактировать ]
Стратегии для отбора проб планктона по классам и численности
Синий фон указывает отфильтрованный объем, необходимый для получения достаточных чисел организма для анализа.
Фактические объемы, из которых отображаются организмы, всегда регистрируются. [ 277 ]

Определение микроорганизмов

[ редактировать ]
Высокие объемы образцов планктона можно быстро проанализировать
Использование современных методов визуализации. [ 277 ]
Высокие объемы образцов планктона также могут быть быстро проанализированы с помощью методов секвенирования . [ 277 ]

Традиционно была выведена филогения микроорганизмов, и их таксономия была установлена ​​на основе исследований морфологии . Тем не менее, разработки в молекулярной филогенетике позволили установить эволюционную связь видов путем анализа более глубоких характеристик, таких как их последовательности ДНК и белков , например, рибосомальная ДНК . [ 278 ] Отсутствие легкодоступных морфологических особенностей, таких как те, которые присутствуют у животных и растений , особенно затрудненные ранние усилия по классификации бактерий и археи. Это привело к ошибочной, искаженной и запутанной классификации, примером которой, отмеченный Карл Возе , является Pseudomonas , этимология которых по иронии судьбы соответствовала его таксономии, а именно «ложная единица». [ 279 ] Многие бактериальные таксоны были реклассифицированы или пересмотрены с использованием молекулярной филогенетики.

Штрих -кодирование
Pelagibacter Ubique , самая распространенная бактерия в океане
Мариномонас Арктика , бактерия, которая растет внутри арктического морского ледя
Было бы трудно последовательно отделить эти два микроба, используя только изображения. Однако, если их штрих -коды выровнены друг с другом, и их основания окрашены, чтобы увидеть их более четко, становится легко видеть, какие основания различаются между этими двумя микробами. Таким образом, миллионы различных видов микробов можно различить. [ 280 ]
Выравнивание штрих -кода ДНК и сравнение между двумя видами морских бактерий, изображенных выше [ 280 ]
Методы, используемые для изучения фитопланктона
Три различные возможности для обработки выборки - это необработанные образцы, фиксацию или сохранение и фильтрацию. Для микроскопии и проточной цитометрии сырые образцы либо измеряются немедленно, либо должны быть зафиксированы для последующих измерений. Поскольку молекулярные методы, пигментный анализ и обнаружение молекулярных трассеров обычно требуют концентрированных клеток, остатки фильтров служат для измерений фитопланктона. Молекулярная характеристика и количественная оценка молекул трассировки выполняются с использованием хроматографии , масс -спектрометрии и ядерной магнитно -резонансной спектроскопии. [ 281 ]
Внешние видео
видео значок Микробы на самом деле ничего не похожи - познакомьтесь с микрокосмосом
видео значок Как идентифицировать микробы - соответствовать микрокосмосу
видео значок Дифференциальный интерференционный контраст (DIC) - встречает микрокосмос
Методы выявления микроорганизмов [ 282 ]
Chromogenic
media
Microscopy
techniques
Biochemical
techniques
Molecular
techniques
Traditional media
Bright field
Dark field
SEM
TEM
CLSM
ATM
Inverted microscopy
Spectrometry
    – FTIR
    – Raman spectrometry
Mass spectrometry
    – GC
    – LC
    – MALDI-TOF
    – ESI
Electrokinetic separation
Microfluidic chip
Propriety methods
    – Wickerham card
    – API
    – BBL Crystal
    – Vitek
    – Biolog
PCR
Real-time qPCR
Rapid PCR
PCR sequencing
RFLP
PFGE
Ribotyping
WGS
MALDI-TOF MS

Recent developments in molecular sequencing have allowed for the recovery of genomes in situ, directly from environmental samples and avoiding the need for culturing. This has led for example, to a rapid expansion in knowledge of the diversity of bacterial phyla. These techniques are genome-resolved metagenomics and single-cell genomics.

The new sequencing technologies and the accumulation of sequence data have resulted in a paradigm shift, highlighted both the ubiquity of microbial communities in association within higher organisms and the critical roles of microbes in ecosystem health.[283] These new possibilities have revolutionized microbial ecology, because the analysis of genomes and metagenomes in a high-throughput manner provides efficient methods for addressing the functional potential of individual microorganisms as well as of whole communities in their natural habitats.[284][285][286]

Using omics data

[edit]
DNA sequencing technologies used in marine metagenomics
The discovery process involves marine sampling, DNA sequencing and contig generation. Previously unknown genes, pathways and even whole genomes are being discovered. These genome-editing technologies are used to retrieve and modify valuable microorganisms for production, particularly in marine metagenomics. Organisms may be cultivable or uncultivable. Metagenomics is providing especially valuable information for uncultivable samples.[287]

Omics is a term used informally to refer to branches of biology whose names end in the suffix -omics, such as genomics, proteomics, metabolomics, and glycomics. Marine Omics has recently emerged as a field of research of its own.[288] Omics aims at collectively characterising and quantifying pools of biological molecules that translate into the structure, function, and dynamics of an organism or organisms. For example, functional genomics aims at identifying the functions of as many genes as possible of a given organism. It combines different -omics techniques such as transcriptomics and proteomics with saturated mutant collections.[289][290]

Many omes beyond the original genome have become useful and have been widely adopted in recent years by research scientists. The suffix -omics can provide an easy shorthand to encapsulate a field; for example, an interactomics study is reasonably recognisable as relating to large-scale analyses of gene-gene, protein-protein, or protein-ligand interactions, while proteomics has become established as a term for studying proteins on a large scale.

Any given omics technique, used just by itself, cannot adequately disentangle the intricacies of a host microbiome. Multi-omics approaches are needed to satisfactorily unravel the complexities of the host-microbiome interactions.[291] For instance, metagenomics, metatranscriptomics, metaproteomics and metabolomics methods are all used to provide information on the metagenome.[292]

Meta-omics data based biogeochemical modeling [293]
A schematic conceptual framework for marine biogeochemical modeling from environmental, imaging, and meta-omics data.[294] A semi-automatic computational pipeline is schematized for combining biomarkers with biogeochemical data [295] that can be incorporated into classic biogeochemical models [296] for creating a next generation of biogeochemical trait-based meta-omics models by considering their respective traits. Such novel meta-omics-enabled approaches aim to improve the monitoring and prediction of ocean processes while respecting the complexity of the planktonic system.[297][298]
Using omics data with marine phytoplankton[299]
As an example of how omics data can be used with marine phytoplankton to inform Earth system science, metatranscriptome sequences from natural phytoplankton communities were used to help identify physiological traits (cellular concentration of ribosomes and their rRNAs) underpinning adaptation to environmental conditions (temperature). A mechanistic phytoplankton cell model was used to test the significance of the identified physiological trait for cellular stoichiometry. Environmental selection in a trait‐based global marine ecosystem model was then linking emergent growth and cellular allocation strategies to large‐scale patterns in light, nutrients and temperature in the surface marine environment. Global predictions of cellular resource allocation and stoichiometry (N:P ratio) were consistent with patterns in metatranscriptome data[300] and latitudinal patterns in the elemental ratios of marine plankton and organic matter.[301] The three‐dimensional view of ribosome shows rRNA in dark blue and dark red. Lighter colours represent ribosomal proteins. Bands above show temperature‐dependent abundance of the eukaryotic ribosomal protein S14.[300]

See...

  • Brüwer, J.D. and Buck-Wiese, H. (2018) "Reading the Book of Life–Omics as a Universal Tool Across Disciplines". In: YOUMARES 8 – Oceans Across Boundaries: Learning from each other, pages 73–82. Springer. ISBN 9783319932842.

Anthropogenic impacts

[edit]
Microorganisms and climate change in marine and terrestrial biomes[6]

In marine environments, microbial primary production contributes substantially to CO2 sequestration. Marine microorganisms also recycle nutrients for use in the marine food web and in the process release CO2 to the atmosphere. Microbial biomass and other organic matter (remnants of plants and animals) are converted to fossil fuels over millions of years. By contrast, burning of fossil fuels liberates greenhouse gases in a small fraction of that time. As a result, the carbon cycle is out of balance, and atmospheric CO2 levels will continue to rise as long as fossil fuels continue to be burnt.[6]

Scientists' warning to humanity [6]

Microorganisms have key roles in carbon and nutrient cycling, animal (including human) and plant health, agriculture and the global food web. Microorganisms live in all environments on Earth that are occupied by macroscopic organisms, and they are the sole life forms in other environments, such as the deep subsurface and ‘extreme’ environments. Microorganisms date back to the origin of life on Earth at least 3.8 billion years ago, and they will likely exist well beyond any future extinction events... Unless we appreciate the importance of microbial processes, we fundamentally limit our understanding of Earth's biosphere and response to climate change and thus jeopardize efforts to create an environmentally sustainable future.[6]

History

[edit]

Marine microorganisms known as cyanobacteria first emerged in the oceans during the Precambrian era roughly 2 billion years ago. Over eons, the photosynthesis of marine microorganisms generated by oxygen has helped shape the chemical environment in the evolution of plants, animals and many other life forms. Marine microorganisms were first observed in 1675 by Dutch lensmaker Antonie van Leeuwenhoek.

See also

[edit]

References

[edit]
  1. ^ Jump up to: a b Madigan M; Martinko J, eds. (2006). Brock Biology of Microorganisms (13th ed.). Pearson Education. p. 1096. ISBN 978-0-321-73551-5.
  2. ^ Jump up to: a b Rybicki EP (1990). "The classification of organisms at the edge of life, or problems with virus systematics". South African Journal of Science. 86: 182–6. ISSN 0038-2353.
  3. ^ Jump up to: a b Lwoff A (1956). "The concept of virus". Journal of General Microbiology. 17 (2): 239–53. doi:10.1099/00221287-17-2-239. PMID 13481308.
  4. ^ Jump up to: a b c Bar-On, YM; Phillips, R; Milo, R (2018). "The biomass distribution on Earth". PNAS. 115 (25): 6506–6511. Bibcode:2018PNAS..115.6506B. doi:10.1073/pnas.1711842115. PMC 6016768. PMID 29784790.
  5. ^ Census Of Marine Life Accessed 29 October 2020.
  6. ^ Jump up to: a b c d e Cavicchioli, Ricardo; Ripple, William J.; Timmis, Kenneth N.; Azam, Farooq; et al. (2019). "Scientists' warning to humanity: Microorganisms and climate change". Nature Reviews Microbiology. 17 (9): 569–586. doi:10.1038/s41579-019-0222-5. PMC 7136171. PMID 31213707. Modified text was copied from this source, which is available under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
  7. ^ Bolhuis, H. and Cretoiu, M.S. (2016) "What is so special about marine microorganisms?". In: L. J. Stal and M. S. Cretoiu (Eds.) The Marine Microbiome, pages 3–20, Springer. ISBN 9783319330006
  8. ^ Jump up to: a b "Functions of global ocean microbiome key to understanding environmental changes". www.sciencedaily.com. University of Georgia. 10 December 2015. Retrieved 11 December 2015.
  9. ^ Jump up to: a b 2002 WHO mortality data Accessed 20 January 2007
  10. ^ Wade, Nicholas (25 July 2016). "Meet Luca, the Ancestor of All Living Things". New York Times. Retrieved 25 July 2016.
  11. ^ Suttle CA (2005). "Viruses in the Sea". Nature. 437 (9): 356–361. Bibcode:2005Natur.437..356S. doi:10.1038/nature04160. PMID 16163346. S2CID 4370363.
  12. ^ Jump up to: a b Glöckner, F.O., Gasol, J.M., McDonough, N., Calewaert, J.B. et al. (2012) Marine microbial diversity and its role in ecosystem functioning and environmental change. European Science Foundation, Position Paper 17. ISBN 978-2-918428-71-8
  13. ^ Suttle, C.A. (2005). "Viruses in the Sea". Nature. 437 (9): 356–361. Bibcode:2005Natur.437..356S. doi:10.1038/nature04160. PMID 16163346. S2CID 4370363.
  14. ^ Shors p. 5.[full citation needed]
  15. ^ Shors p. 593.[full citation needed]
  16. ^ Jump up to: a b c Suttle CA (2007). "Marine viruses—major players in the global ecosystem". Nature Reviews Microbiology. 5 (10): 801–12. doi:10.1038/nrmicro1750. PMID 17853907. S2CID 4658457.
  17. ^ Living Bacteria Are Riding Earth's Air Currents Smithsonian Magazine, 11 January 2016.
  18. ^ Robbins, Jim (13 April 2018). "Trillions Upon Trillions of Viruses Fall From the Sky Each Day". The New York Times. Retrieved 14 April 2018.
  19. ^ Reche, Isabel; D'Orta, Gaetano; Mladenov, Natalie; Winget, Danielle M; Suttle, Curtis A (29 January 2018). "Deposition rates of viruses and bacteria above the atmospheric boundary layer". ISME Journal. 12 (4): 1154–1162. Bibcode:2018ISMEJ..12.1154R. doi:10.1038/s41396-017-0042-4. PMC 5864199. PMID 29379178.
  20. ^ Staff (2014). "The Biosphere". Aspen Global Change Institute. Archived from the original on 2 September 2010. Retrieved 10 November 2014.
  21. ^ Jump up to: a b c Choi, Charles Q. (17 March 2013). "Microbes Thrive in Deepest Spot on Earth". LiveScience. Retrieved 17 March 2013.
  22. ^ Glud, Ronnie; Wenzhöfer, Frank; Middelboe, Mathias; Oguri, Kazumasa; Turnewitsch, Robert; Canfield, Donald E.; Kitazato, Hiroshi (17 March 2013). "High rates of microbial carbon turnover in sediments in the deepest oceanic trench on Earth". Nature Geoscience. 6 (4): 284–288. Bibcode:2013NatGe...6..284G. doi:10.1038/ngeo1773.
  23. ^ Oskin, Becky (14 March 2013). "Intraterrestrials: Life Thrives in Ocean Floor". LiveScience. Retrieved 17 March 2013.
  24. ^ Morelle, Rebecca (15 December 2014). "Microbes discovered by deepest marine drill analysed". BBC News. Retrieved 15 December 2014.
  25. ^ Takai K, Nakamura K, Toki T, Tsunogai U, et al. (2008). "Cell proliferation at 122°C and isotopically heavy CH4 production by a hyperthermophilic methanogen under high-pressure cultivation". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 105 (31): 10949–54. Bibcode:2008PNAS..10510949T. doi:10.1073/pnas.0712334105. PMC 2490668. PMID 18664583.
  26. ^ Fox, Douglas (20 August 2014). "Lakes under the ice: Antarctica's secret garden". Nature. 512 (7514): 244–246. Bibcode:2014Natur.512..244F. doi:10.1038/512244a. PMID 25143097.
  27. ^ Mack, Eric (20 August 2014). "Life Confirmed Under Antarctic Ice; Is Space Next?". Forbes. Retrieved 21 August 2014.
  28. ^ Armbrust, E.V.; Palumbi, S.R. (2015). "Uncovering hidden worlds of ocean biodiversity". Science. 348 (6237): 865–867. Bibcode:2015Sci...348..865A. doi:10.1126/science.aaa7378. PMID 25999494. S2CID 36480105.
  29. ^ Azam, F.; Malfatti, F. (2007). "Microbial structuring of marine ecosystems". Nature Reviews Microbiology. 5 (10): 782–791. doi:10.1038/nrmicro1747. PMID 17853906. S2CID 10055219.
  30. ^ Middelboe M, Brussaard C (2017). "Marine viruses: key players in marine ecosystems". Viruses. 9 (10): 302. doi:10.3390/v9100302. PMC 5691653. PMID 29057790.
  31. ^ Koonin EV, Senkevich TG, Dolja VV (2006). "The ancient Virus World and evolution of cells". Biology Direct. 1: 29. doi:10.1186/1745-6150-1-29. PMC 1594570. PMID 16984643.
  32. ^ Jump up to: a b Canchaya C, Fournous G, Chibani-Chennoufi S, Dillmann ML, Brüssow H (2003). "Phage as agents of lateral gene transfer". Current Opinion in Microbiology. 6 (4): 417–24. doi:10.1016/S1369-5274(03)00086-9. PMID 12941415.
  33. ^ Jump up to: a b Rybicki EP (1990). "The classification of organisms at the edge of life, or problems with virus systematics". South African Journal of Science. 86: 182–186.
  34. ^ Jump up to: a b c Koonin EV, Starokadomskyy P (October 2016). "Are viruses alive? The replicator paradigm sheds decisive light on an old but misguided question". Studies in History and Philosophy of Biological and Biomedical Sciences. 59: 125–134. doi:10.1016/j.shpsc.2016.02.016. PMC 5406846. PMID 26965225.
  35. ^ Iyer LM, Balaji S, Koonin EV, Aravind L (2006). "Evolutionary genomics of nucleo-cytoplasmic large DNA viruses". Virus Research. 117 (1): 156–84. doi:10.1016/j.virusres.2006.01.009. PMID 16494962.
  36. ^ Sanjuán R, Nebot MR, Chirico N, Mansky LM, Belshaw R (October 2010). "Viral mutation rates". Journal of Virology. 84 (19): 9733–48. doi:10.1128/JVI.00694-10. PMC 2937809. PMID 20660197.
  37. ^ Mahy, W.J.; Van Regenmortel, M.H.V., eds. (2009). Desk Encyclopedia of General Virology. Oxford: Academic Press. p. 28. ISBN 978-0-12-375146-1.
  38. ^ Jump up to: a b Mann NH (17 May 2005). "The Third Age of Phage". PLOS Biology. 3 (5): 753–755. doi:10.1371/journal.pbio.0030182. PMC 1110918. PMID 15884981.
  39. ^ Wommack KE, Colwell RR (2000). "Virioplankton: viruses in aquatic ecosystems". Microbiology and Molecular Biology Reviews. 64 (1): 69–114. doi:10.1128/MMBR.64.1.69-114.2000. PMC 98987. PMID 10704475.
  40. ^ Jump up to: a b Suttle CA (2005). "Viruses in the sea". Nature. 437 (7057): 356–361. Bibcode:2005Natur.437..356S. doi:10.1038/nature04160. PMID 16163346. S2CID 4370363.
  41. ^ Bergh O, Børsheim KY, Bratbak G, Heldal M (1989). "High abundance of viruses found in aquatic environments". Nature. 340 (6233): 467–8. Bibcode:1989Natur.340..467B. doi:10.1038/340467a0. PMID 2755508. S2CID 4271861.
  42. ^ Wigington CH, Sonderegger D, Brussaard CP, Buchan A, Finke JF, Fuhrman JA, Lennon JT, Middelboe M, Suttle CA, Stock C, Wilson WH, Wommack KE, Wilhelm SW, Weitz JS (2016). "Re-examination of the relationship between marine virus and microbial cell abundances" (PDF). Nature Microbiology. 1 (3): 15024. doi:10.1038/nmicrobiol.2015.24. PMID 27572161. S2CID 52829633.
  43. ^ Brum JR, Schenck RO, Sullivan MB (September 2013). "Global morphological analysis of marine viruses shows minimal regional variation and dominance of non-tailed viruses". The ISME Journal. 7 (9): 1738–51. Bibcode:2013ISMEJ...7.1738B. doi:10.1038/ismej.2013.67. PMC 3749506. PMID 23635867.
  44. ^ Krupovic M, Bamford DH (2007). "Putative prophages related to lytic tailless marine dsDNA phage PM2 are widespread in the genomes of aquatic bacteria". BMC Genomics. 8: 236. doi:10.1186/1471-2164-8-236. PMC 1950889. PMID 17634101.
  45. ^ Xue H, Xu Y, Boucher Y, Polz MF (2012). "High frequency of a novel filamentous phage, VCY φ, within an environmental Vibrio cholerae population". Applied and Environmental Microbiology. 78 (1): 28–33. Bibcode:2012ApEnM..78...28X. doi:10.1128/AEM.06297-11. PMC 3255608. PMID 22020507.
  46. ^ Roux S, Krupovic M, Poulet A, Debroas D, Enault F (2012). "Evolution and diversity of the Microviridae viral family through a collection of 81 new complete genomes assembled from virome reads". PLOS ONE. 7 (7): e40418. Bibcode:2012PLoSO...740418R. doi:10.1371/journal.pone.0040418. PMC 3394797. PMID 22808158.
  47. ^ Kauffman KM, Hussain FA, Yang J, Arevalo P, Brown JM, Chang WK, VanInsberghe D, Elsherbini J, Sharma RS, Cutler MB, Kelly L, Polz MF (2018). "A major lineage of non-tailed dsDNA viruses as unrecognized killers of marine bacteria". Nature. 554 (7690): 118–122. Bibcode:2018Natur.554..118K. doi:10.1038/nature25474. PMID 29364876. S2CID 4462007.
  48. ^ "Scientists Find New Type of Virus in World's Oceans: Autolykiviridae". Sci News. 25 January 2018.
  49. ^ Dockrill, Peter (25 January 2018). "Never-Before-Seen Viruses With Weird DNA Were Just Discovered in The Ocean". Sciencealert.
  50. ^ Schoch CL, et al. (2020). "Autolykiviridae". NCBI Taxonomy: A Comprehensive Update on Curation, Resources and Tools (Database (Oxford)). 2020. baaa062. doi:10.1093/database/baaa062. PMC 7408187. PMID 32761142.
  51. ^ Lawrence CM, Menon S, Eilers BJ (2009). "Structural and functional studies of archaeal viruses". Journal of Biological Chemistry. 284 (19): 12599–603. doi:10.1074/jbc.R800078200. PMC 2675988. PMID 19158076.
  52. ^ Пранджшвили Д., Фортерр П., Гаррет Р.А. (2006). «Вирусы археи: объединяющий взгляд». Nature Reviews Microbiology . 4 (11): 837–48. doi : 10.1038/nrmicro1527 . PMID   17041631 . S2CID   9915859 .
  53. ^ Пранджшвили Д., Гаррет Р.А. (2004). «Исключительно разнообразные морфотипы и геномы гипертертермофильных вирусов с пленахэальными вирусами» (PDF) . Биохимическое общество транзакций . 32 (Pt 2): 204–8. doi : 10.1042/bst0320204 . PMID   15046572 . S2CID   20018642 .
  54. ^ «Вредное цветение водорослей: Красный прилив: Главная | CDC HSB» . www.cdc.gov . Получено 19 декабря 2014 года .
  55. ^ Forterre P, Philippe H (1999). «Последний универсальный общий предок (Лука), простой или сложный?». Биологический бюллетень . 196 (3): 373–5, обсуждение 375–7. doi : 10.2307/1542973 . JSTOR   1542973 . PMID   11536914 .
  56. ^ Авраао, Джонатас; Сильва, Лорена; Сильва, Ладмила Сантос; Халил, Жак Яакуб Боу; и др. (27 февраля 2018 г.). «Гигантский гигант Тупанвирус обладает наиболее полным трансляционным аппаратом известной виросферы» . Природная связь . 9 (1): 749. Bibcode : 2018natco ... 9..749a . doi : 10.1038/s41467-018-03168-1 . PMC   5829246 . PMID   29487281 .
  57. ^ Рирдон, Сара (6 апреля 2017 г.). «Панчание гигантские вирусы высказывают дебаты по дереву жизни». Природа . doi : 10.1038/nature.2017.21798 . ISSN   1476-4687 . S2CID   89815981 .
  58. ^ Бичелл, Рей Эллен. «В гигантских генах вируса намекает на их таинственное происхождение» . Все учитывается .
  59. ^ Van Etten JL (июль -август 2011). «Гигантские вирусы» . Американский ученый . 99 (4): 304–311. doi : 10.1511/2011.91.304 .
  60. ^ Legendre M, Arslan D, Abergel C, Claverie JM (январь 2012 г.). «Геномика мегавируса и неуловимая четвертая область жизни» . Коммуникативная и интегративная биология . 5 (1): 102–6. doi : 10.4161/cib.18624 . PMC   3291303 . PMID   22482024 .
  61. ^ Schulz F, Yutin N, Ivanova NN, Ortega DR, Lee TK, Vierheilig J, Daims H, Horn M, Wagner M, Jensen GJ, Kyrpides NC, Koonin EV, Woyke T (апрель 2017 г.). «Гигантские вирусы с расширенным дополнением компонентов системы трансляции» (PDF) . Наука . 356 (6333): 82–85. Bibcode : 2017sci ... 356 ... 82 с . doi : 10.1126/science.aal4657 . PMID   28386012 . S2CID   206655792 .
  62. ^ Bäckstrating D, Yin N, Jøgensen SL, Dalamshi J, Homa F, Zaremba-Niedwiedzka K, Spang A, Wolf Yi, Contine EV, Ettema TJ (март 2019 г.). «Вирусные геномы из отложений глубоководного морского морского моря EEP морских отложений расширяют мегавиром океана и поддерживают независимое происхождение вирусного гиганса » Мбио 10 (2): E02497-0 Doi : 10.1128/ mbio.02497-1  6401483PMC  30837339PMID
  63. ^ Фредриксон Дж.К., Захара Дж. М., Балквилл Д.Л., Кеннеди Д., Ли С.М., Костандаритес Х.М., Дейли М.Дж., Ромин М.Ф., Брокман Ф.Дж. (2004). «Геомикробиология загрязненных ядерными отходами от отходов ядерных отходов на участке Хэнфорда, штат Вашингтон» . Прикладная и экологическая микробиология . 70 (7): 4230–41. Bibcode : 2004apenm..70.4230f . doi : 10.1128/aem.70.7.4230-4241.2004 . PMC   444790 . PMID   15240306 .
  64. ^ Woese CR, Kandler O, Wheelis ML (1990). «На пути к естественной системе организмов: предложение о доменах археи, бактерий и эурья» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 87 (12): 4576–9. Bibcode : 1990pnas ... 87.4576w . doi : 10.1073/pnas.87.12.4576 . PMC   54159 . PMID   2112744 .
  65. ^ Schopf JW (1994). «Разрозненные скорости, разные судьбы: темп и режим эволюции изменяются от докембрийца к фанерозойму» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (15): 6735–42. Bibcode : 1994pnas ... 91.6735s . doi : 10.1073/pnas.91.15.6735 . PMC   44277 . PMID   8041691 .
  66. ^ Делонг Эф, Пейс Н.Р. (2001). «Разнообразие окружающей среды бактерий и археи». Систематическая биология . 50 (4): 470–8. Citeseerx   10.1.1.321.8828 . doi : 10.1080/106351501750435040 . PMID   12116647 .
  67. ^ Браун -младший, Дулиттл В.Ф. (1997). «Археа и переход прокариот-эукариот» . Микробиология и молекулярная биология обзоры . 61 (4): 456–502. doi : 10.1128/mmbr.61.4.456-502.1997 . PMC   232621 . PMID   9409149 .
  68. ^ Dyall, Sabrina D.; Браун, Марк Т.; Джонсон, Патриция Дж. (9 апреля 2004 г.). «Древние вторжения: от эндосимбионтов до органелл». Наука . 304 (5668): 253–257. Bibcode : 2004sci ... 304..253d . doi : 10.1126/science.1094884 . ISSN   0036-8075 . PMID   15073369 . S2CID   19424594 .
  69. ^ Пул А.М., Пенни Д. (2007). «Оценка гипотез для происхождения эукариот». Биологии . 29 (1): 74–84. doi : 10.1002/bies.20516 . PMID   17187354 . S2CID   36026766 .
  70. ^ Ланг Б.Ф., Грей М.В., Бургер Г. (1999). «Эволюция митохондриального генома и происхождение эукариот». Ежегодный обзор генетики . 33 : 351–97. doi : 10.1146/annurev.genet.33.1.351 . PMID   10690412 .
  71. ^ McFadden GI (1999). «Эндосимбиоз и эволюция растительной клетки». Современное мнение о биологии растений . 2 (6): 513–9. Bibcode : 1999copb .... 2..513m . doi : 10.1016/s1369-5266 (99) 00025-4 . PMID   10607659 .
  72. ^ Патрик Дж. Килинг (2004). «Разнообразие и эволюционная история пластидов и их хозяев». Американский журнал ботаники . 91 (10): 1481–1493. doi : 10.3732/ajb.91.10.1481 . PMID   21652304 . S2CID   17522125 .
  73. ^ «Candidatus pelagibacter Ubique» . Бактерий геномы . Европейский институт биоинформатики. 2011. Архивировано из оригинала 1 декабря 2008 года . Получено 8 января 2012 года .
  74. ^ «Блошиный рынок: недавно обнаруженный вирус может быть самым распространенным организмом на планете» . Экономист . 16 февраля 2013 года . Получено 16 февраля 2013 года .
  75. ^ Zhao Y, Thempron B, Thrash JC, Schwalbach MS, Vergin KL, Landry ZC, Ellisman M, Deerinck T, Sullivan MB, Giovannoni SJ (2013). «Обильные вирусы SAR11 в океане». Природа . 494 (7437): 357–360. Bibcode : 2013natur.494..357Z . doi : 10.1038/nature11921 . PMID   23407494 . S2CID   4348619 .
  76. ^ «Крупнейшая бактерия: ученый обнаруживает новую бактериальную жизнь от африканского побережья» , Институт морской микробиологии Макса Планка , 8 апреля 1999 года, архивировано с оригинала 20 января 2010 г.
  77. ^ Список прокариотических имен с стоянием в номенклатуре - род Thiomargarita
  78. ^ Bang C, Schmitz RA (2015). «Архея, связанная с человеческими поверхностями: не быть недооценкой» . Обзоры микробиологии FEMS . 39 (5): 631–48. doi : 10.1093/femsre/fuv010 . PMID   25907112 .
  79. ^ Archaea Online Etymology Dictionary . Получено 17 августа 2016 года.
  80. ^ Пейс NR (май 2006 г.). «Время для перемен» . Природа . 441 (7091): 289. Bibcode : 2006natur.441..289p . doi : 10.1038/441289a . PMID   16710401 . S2CID   4431143 .
  81. ^ Stoeckenius W (1 октября 1981 г.). «Квадратная бактерия Уолсби: тонкая структура ортогонального прокари» . Журнал бактериологии . 148 (1): 352–60. doi : 10.1128/jb.148.1.352-360.1981 . PMC   216199 . PMID   7287626 .
  82. ^ Мэдиган М., Мартинко Дж, ред. (2005). Брок биология микроорганизмов (11 -е изд.). Прентис Холл. ISBN  978-0-13-144329-7 .
  83. ^ «Глубокие морские микроорганизмы и происхождение эукариотической клетки» (PDF) . Получено 24 октября 2017 года .
  84. ^ Ямагучи, Масаши; и др. (1 декабря 2012 г.). «Прокариот или эукариот? Уникальный микроорганизм из глубокого моря». Журнал электронной микроскопии . 61 (6): 423–431. doi : 10.1093/jmicro/dfs062 . PMID   23024290 .
  85. ^ Whittaker, RH; Маргулис Л. (1978). «Протестная классификация и королевства организмов». Биосистемы . 10 (1–2): 3–18. Bibcode : 1978bisys..10 .... 3W . doi : 10.1016/0303-2647 (78) 90023-0 . PMID   418827 .
  86. ^ Faure E, Not F, Benoiston AS, Labadie K, Bittner L, Ayata SD (2019). «Миксотрофные протисты демонстрируют контрастные биогеографии в глобальном океане» . ISME Journal . 13 (4): 1072–1083. Bibcode : 2019ismej..13.1072f . doi : 10.1038/s41396-018-0340-5 . PMC   6461780 . PMID   30643201 .
  87. ^ Jump up to: а беременный в Лелес С.Г., Митра А., Флинн К.Дж., Стокер Д.К., Хансен П.Дж., Кальбет А., Макманус Г.Б., Сандерс Р.В., Карон Д.А., не Ф, Галлегрэфф Г.М. (2017). «Океанические протисты с различными формами приобретенной фототрофии демонстрируют контрастные биогеографии и изобилие» . Труды Королевского общества B: Биологические науки . 284 (1860): 20170664. DOI : 10.1098/rspb.2017.0664 . PMC   5563798 . PMID   28768886 .
  88. ^ Бадд, Грэм Е; Дженсен, Sören (2017). «Происхождение животных и гипотеза« саванны »для ранней билатерианской эволюции» . Биологические обзоры . 92 (1): 446–473. doi : 10.1111/brv.12239 . PMID   26588818 .
  89. ^ Cavalier-Smith T (декабрь 1993 г.). «Королевство Протозоа и его 18 фила» . Микробиологические обзоры . 57 (4): 953–94. doi : 10.1128/mmbr.57.4.953-994.1993 . PMC   372943 . PMID   8302218 .
  90. ^ Corliss Jo (1992). «Должен ли быть отдельный код номенклатуры для протистов?». Биосистемы . 28 (1–3): 1–14. Bibcode : 1992bisys..28 .... 1c . doi : 10.1016/0303-2647 (92) 90003-H . PMID   1292654 .
  91. ^ Slapeta J, Moreira D, López-García P (2005). «Степень протестичного разнообразия: понимание молекулярной экологии пресноводных эукариот» . Труды Королевского общества B: Биологические науки . 272 (1576): 2073–81. doi : 10.1098/rspb.2005.3195 . PMC   1559898 . PMID   16191619 .
  92. ^ Moreira D, López-García P (2002). «Молекулярная экология микробных эукариот представляет скрытый мир» (PDF) . Тенденции в микробиологии . 10 (1): 31–8. doi : 10.1016/s0966-842x (01) 02257-0 . PMID   11755083 .
  93. ^ Jump up to: а беременный Эндрю Алверсон (14 октября 2022 г.). «Воздух, который ты дышишь? Диатом сделал это» . Livescience .
  94. ^ «Больше на диатомовых условиях» . Калифорнийский музей палеонтологии . Архивировано с оригинала 4 октября 2012 года . Получено 11 октября 2019 года .
  95. ^ Devreotes P (1989). «Dictyostelium discoideum: модельная система для взаимодействия клеток в разработке». Наука . 245 (4922): 1054–8. Bibcode : 1989sci ... 245.1054d . doi : 10.1126/science.2672337 . PMID   2672337 .
  96. ^ Михаил В. Мац; Тамара М. Франк; Н. Джастин Маршалл; Эдит А. Уэйддер; Сонке Джонсен (9 декабря 2008 г.). «Гигантский глубоководной профист производит билатерационные следы» (PDF) . Текущая биология . 18 (23). Elsevier Ltd: 1849–1854. Bibcode : 2008cbio ... 18.1849m . doi : 10.1016/j.cub.2008.10.028 . PMID   19026540 . S2CID   8819675 . Архивировано из оригинала (PDF) 16 декабря 2008 года.
  97. ^ Гудэй, AJ; Аранда да Силва, а.; Pawlowski, J. (1 декабря 2011 г.). «Ксенофиофоры (Rhizaria, Foraminifera) из Каньона Назаре (португальская маржа, NE Atlantic)». Глубоководные исследования, часть II: Актуальные исследования в области океанографии . Геология, геохимия и биология подводных каньонов к западу от Португалии. 58 (23–24): 2401–2419. Bibcode : 2011dsrii..58.2401g . doi : 10.1016/j.dsr2.2011.04.005 .
  98. ^ Neil AC, Reece JB, Simon EJ (2004) Основная биология с физиологией Пирсон/Бенджамин Каммингс, стр. 291. ISBN   9780805375039
  99. ^ О'Мэлли М.А., Симпсон А.Г., Роджер А.Дж. (2012). «Другие эукариоты в свете эволюционной протистологии». Биология и философия . 28 (2): 299–330. doi : 10.1007/s10539-012-9354-y . S2CID   85406712 .
  100. ^ ADL SM, Simpson AG, Farmer MA, Andersen RA, Anderson OR, Barta Jr, Bowser SS, Brugerolle G, Fensome RA, Fredericq S, James Ty, Karpov S, Kugrens P, Krug J, Lane Ce, Lewis La, Lodge J , Линн Д.Х., Манн Д.Г., Маккорт Р.М., Мендоса Л., Моэстру О., Мозли-Стандридж С.Е., Нерад Т.А., Ширер К.А., Смирнов А.В., Шпигель Ф.В., Тейлор М.Ф. (2005). «Новая классификация эукариот более высокого уровня с акцентом на таксономию протистов» (PDF) . Журнал эукариотической микробиологии . 52 (5): 399–451. doi : 10.1111/j.1550-7408.2005.00053.x . PMID   16248873 . S2CID   8060916 .
  101. ^ Margulis L, Chapman MJ (19 марта 2009 г.). Королевства и области: иллюстрированное руководство по филе жизни на Земле . Академическая пресса. ISBN  9780080920146 .
  102. ^ Jump up to: а беременный Доусон, Скотт С; Паредес, Александр Р. (2013). «Альтернативные цитоскелетные ландшафты: цитоскелетная новинка и эволюция в базальных протистах» . Современное мнение в клеточной биологии . 25 (1): 134–141. doi : 10.1016/j.ceb.2012.11.005 . PMC   4927265 . PMID   23312067 .
  103. ^ Jump up to: а беременный Аткинсон, а.; Polimene, L.; Филман, ES; Widdicombe, CE; Mcevoy, AJ; Смит, TJ; Djeghri, N.; Сайли, SF; Корнуэлл, Ле (2018). « Комментарий. Что движет сезонностью планктона в стратификационном полке море? Некоторые конкурирующие и дополнительные теории " " (PDF) . Лимнология и океанография . 63 (6): 2877–2884. Bibcode : 2018limoc..63.2877a . doi : 10.1002/lno.11036 . S2CID   91380765 .
  104. ^ Синглтон, Пол (2006). Словарь микробиологии и молекулярной биологии, 3 -е издание, пересмотренное . Чичестер, Великобритания: Джон Вили и сыновья. п. 32. ISBN  978-0-470-03545-0 .
  105. ^ Дэвид Дж. Паттерсон. «Амеба: Протисты, которые движутся и кормит с помощью псевдоподии» . Веб -проект Tree of Life.
  106. ^ "Амеба" . Университет Эдинбурга. Архивировано из оригинала 10 июня 2009 года.
  107. ^ Брэди, Ричард М. (1993). «Крутящий момент и переключение в бактериальном жгутиковом двигателе. Электростатическая модель» . Биофизический журнал . 64 (4): 961–973. Bibcode : 1993bpj .... 64..961b . doi : 10.1016/s0006-3495 (93) 81462-0 . PMC   1262414 . PMID   7684268 .
  108. ^ Лауга, Эрик; Томас Р. Пауэрс (25 августа 2009 г.). «Гидродинамика плавательных микроорганизмов». Отчеты о прогрессе в физике . 72 (9): 096601. Arxiv : 0812.2887 . Bibcode : 2009rpph ... 72i6601L . doi : 10.1088/0034-4885/72/9/096601 . S2CID   3932471 .
  109. ^ Хайд, KD; Ebj Jones; E. Leaño; SB указывает; ad poonyt; LLP Vrijmoed (1998). «Роль грибов в морских экосистемах» Биоразнообразие и сохранение 7 (9): 1147–1 Bibcode : 1998bicon ... 7.1147H Doi : 10.1023/a: 1008823515157 . S2CID   2264931 .
  110. ^ Kirk, PM, Cannon, PF, Minter, DW и Stalpers, J. «Словарь грибов». Edn 10. Cabi, 2008
  111. ^ Хайд, KD; EBJ Jones (1989). «Спора привязанность к морским грибам». Ботаника Марина . 32 (3): 205–218. doi : 10.1515/botm.1989.32.3.205 . S2CID   84879817 .
  112. ^ Le Calvez T, Burgaud G, Mahé S, Barbier G, Vandenkoornhuyse P (октябрь 2009 г.). «Грибковое разнообразие в глубоководных гидротермальных экосистемах» . Прикладная и экологическая микробиология . 75 (20): 6415–21. Bibcode : 2009apenm..75.6415L . doi : 10.1128/aem.00653-09 . PMC   2765129 . PMID   19633124 .
  113. ^ San-Martín, A.; S. orejanera; C. Галлардо; М. Сильва; Дж. Бесерра; Р. Рейнозо; MC Chamy; К. Вергара; J. Rovirosa (2008). «Стероиды из морского гриба Geotrichum sp» . Журнал Чилийского химического общества . 53 (1): 1377–1378. doi : 10.4067/s0717-97072008000100011 .
  114. ^ Jones, Ebg, Hyde, KD, & Pang, K.-L., eds. (2014). Пресноводные грибы: и грибковые организмы . Берлин/Бостон: де Грюйтер.
  115. ^ Джонс, Эбг; Панг, К.-Л., ред. (2012). Морские грибы и грибковые организмы . Морская и пресноводная ботаника. Берлин, Бостон: де Грюйтер (опубликовано в августе 2012 г.). doi : 10.1515/9783110264067 . ISBN  978-3-11-026406-7 Полем Получено 3 сентября 2015 года .
  116. ^ Ван, Синь; Сингх, Пурнима; Гао, Чжэн; Чжан, Сяобо; Джонсон, Закари I.; Ван, Гуанги (2014). «Распространение и разнообразие планктонных грибов в теплом бассейне в Западной части Тихого океана» . Plos один . 9 (7): E101523. BIBCODE : 2014PLOSO ... 9J1523W . doi : 10.1371/journal.pone.0101523.s001 . PMC   4081592 . PMID   24992154 .
  117. ^ Ван, Г.; Ван, х.; Лю, х.; Ли, Q. (2012). «Разнообразие и биогеохимическая функция планктонных грибов в океане» . В Рагхукумаре, С. (ред.). Биология морских грибов . Берлин, Гейдельберг: Springer-Verlag. С. 71–88. doi : 10.1007/978-3-642-23342-5 . ISBN  978-3-642-23341-8 Полем S2CID   39378040 . Получено 3 сентября 2015 года .
  118. ^ Дамаре, Самир; Рагукумар, Чандрата (11 ноября 2007 г.). «Грибы и макроагрегация в глубоководных отложениях». Микробная экология . 56 (1): 168–177. doi : 10.1007/s00248-007-9334-y . ISSN   0095-3628 . PMID   17994287 . S2CID   21288251 .
  119. ^ Кубанек, Джулия; Дженсен, Пол Р.; Кейфер, Пол А.; Саллард, М. Кэмерон; Коллинз, Дуайт О.; Феникал, Уильям (10 июня 2003 г.). «Устойчивость к морской водоросли к микробной атаке: целевая химическая защита от морских грибов» . Труды Национальной академии наук . 100 (12): 6916–6921. Bibcode : 2003pnas..100.6916K . doi : 10.1073/pnas.11318555100 . ISSN   0027-8424 . PMC   165804 . PMID   12756301 .
  120. ^ Jump up to: а беременный Гао, Чжэн; Джонсон, Закари I.; Ван, Гуанги (30 июля 2009 г.). «Молекулярная характеристика пространственного разнообразия и новых линий микопланктона в гавайских прибрежных водах» . Журнал ISME . 4 (1): 111–120. doi : 10.1038/ismej.2009.87 . ISSN   1751-7362 . PMID   19641535 .
  121. ^ Панзер, Катрин; Йилмаз, Пелин; Вейс, Майкл; Рейх, Лотар; Рихтер, Майкл; Визе, Джутта; Шмальджоханн, Рольф; Лабес, Анте; Имхофф, Йоханнес Ф. (30 июля 2015 г.). «Идентификация специфических для среды обитания биомов водных грибковых сообществ с использованием комплексного почти полноразмерного набора данных 18S рРНК, обогащенного контекстуальными данными» . Plos один . 10 (7): E0134377. BIBCODE : 2015PLOSO..1034377P . doi : 10.1371/journal.pone.0134377 . PMC   4520555 . PMID   26226014 .
  122. ^ Гутьеррес, Марсело Х; Pantoja, Silvio; Хиноны, Ренато А и Гонсалес, Родриго Р. Первая запись о мягких грибах в прибрежной экосистеме у центра Чили. Гаяна (Консеп.) [Онлайн]. 2010, Vol.74, N.1, pp. 66-73. ISSN   0717-6538 .
  123. ^ Jump up to: а беременный Шридхар, К.Р. (2009). «10. Водные грибы - они планктоничны?». Динамика Планктона индийских вод . Джайпур, Индия: Pratiksha Publications. С. 133–148.
  124. ^ «Виды высших морских грибов» . Морские грибы . Университет Южного Миссисипи. Архивировано из оригинала 22 апреля 2013 года . Получено 5 февраля 2012 года .
  125. ^ Hawksworth, DL (2000). «Пресноводная и морская лишайча, образуя грибы» (PDF) . Грибковое разнообразие . 5 : 1–7 . Получено 6 февраля 2012 года .
  126. ^ "Лишайники" . Служба национальных парков, Министерство внутренних дел США, правительство Соединенных Штатов. 22 мая 2016 года . Получено 4 апреля 2018 года .
  127. ^ Jump up to: а беременный «Веб, рост и развитие земной жизни в лишайках» . Earthlife.net. 14 февраля 2020 года.
  128. ^ Силлиман Б.Р., Ньюэлл Си (2003). «Грибковое земледелие в улитке» . ПНА . 100 (26): 15643–15648. Bibcode : 2003pnas..10015643S . doi : 10.1073/pnas.2535227100 . PMC   307621 . PMID   14657360 .
  129. ^ Юань Х, Сяо С. (2005). «Симбиоз, похожий на лишайника 600 миллионов лет назад». Наука . 308 (5724): 1017–1020. Bibcode : 2005sci ... 308.1017y . doi : 10.1126/science.1111347 . PMID   15890881 . S2CID   27083645 .
  130. ^ Джонс, Эб Гарет; ПЭТ 31 августа 2012 г.). Морские фяг-подобные организмы Уолтер Грютер. ISBN  9783110264067 .
  131. ^ Джанет Фан (6 апреля 2010 г.). «Животные процветают без кислорода на морском дне». Природа . 464 (7290): 825. Bibcode : 2010natur.464..825f . doi : 10.1038/464825b . PMID   20376121 . S2CID   4340458 .
  132. ^ «Бринистый глубокий бассейн может быть домом для животных, процветающих без кислорода» . Science News . 23 сентября 2013 года.
  133. ^ Jump up to: а беременный Кэмпбелл, Нил А.; Рис, Джейн Б.; Урри, Лиза Андреа; Каин, Майкл Л.; Вассерман, Стивен Александр; Минорский, Питер V.; Джексон, Роберт Брэдли (2008). Биология (8 -е изд.). Сан -Франциско: Пирсон - Бенджамин Каммингс. ISBN  978-0-321-54325-7 .
  134. ^ McNeill, J.; и др., ред. (2012). Международный кодекс номенклатуры для водорослей, грибов и заводов (Мельбурнский кодекс), принятый восемнадцатым международным ботаническим конгрессом Мельбурн, Австралия, июль 2011 г. (электронное изд.). Международная ассоциация таксономии растений . Получено 14 мая 2017 года .
  135. ^ Изменения концентраций кислорода в нашем океане могут нарушить фундаментальные биологические циклы Phys.org , 25 ноября 2019 года.
  136. ^ Уолш П.Дж., Смит С., Флеминг Л., Соло-Габриэле Х, Гервик В.Х., ред. (2 сентября 2011 г.). «Цианобактерии и цианобактериальные токсины» . Океаны и здоровье человека: риски и лекарства от морей . Академическая пресса. С. 271–296. ISBN  978-0-08-087782-2 .
  137. ^ «Рост кислорода» . Журнал астробиологии . 30 июля 2003 года. Архивировано с оригинала 3 апреля 2015 года . Получено 6 апреля 2016 года .
  138. ^ Flannery DT, Walter RM (2012). «Архейские тафтированные микробные маты и великое событие окисления: новое понимание древней проблемы». Австралийский журнал наук о Земле . 59 (1): 1–11. Bibcode : 2012aujes..59 .... 1f . doi : 10.1080/08120099.2011.607849 . S2CID   53618061 .
  139. ^ Ротшильд, Линн (сентябрь 2003 г.). «Поймите эволюционные механизмы и ограничения экологии жизни» . НАСА. Архивировано с оригинала 29 марта 2012 года . Получено 13 июля 2009 года .
  140. ^ Надис (декабрь 2003 г.). «Клетки, которые управляют морями» (PDF) . Scientific American . 289 (6): 52–53. Bibcode : 2003sciam.289f..52n . doi : 10.1038/Scientificamerican1203-52 . PMID   14631732 . Архивировано из оригинала (PDF) 19 апреля 2014 года . Получено 2 июня 2019 года .
  141. ^ Джо Палка (12 июня 2008 г.). «Самый важный микроб, о котором вы никогда не слышали» . npr.org .
  142. ^ GLOLEGOS P, Gallegos JL, Gordillo RA, Rincon J, Zabala LL, Jao N, Karl DM, Li WK, Lomas MW, Venezian D, Vera CS, Vrugt JA, Martiny AC (2013). глобальное распределение морских Cyanbacteria prochlorococcus и Synechococcus " Нынешнее и будущее Труды Национальной академии наук 110 (24): 9824–9 Bibcode : 2013pnas..110.9 Doi : 10.1073/pnas.1307701110 . PMC   3683724 . PMID   23703908
  143. ^ Nabors, Murray W. (2004). Введение в ботанику . Сан -Франциско, Калифорния: Pearson Education, Inc. ISBN  978-0-8053-4416-5 .
  144. ^ Аллаби, М., изд. (1992). «Волосли». Краткий словарь ботаники . Оксфорд: издательство Оксфордского университета.
  145. ^ Guiry MD (октябрь 2012 г.). «Сколько там видов водорослей?». Журнал Phycology . 48 (5): 1057–63. Bibcode : 2012jpcgy..48.1057g . doi : 10.1111/j.1529-8817.2012.01222.x . PMID   27011267 . S2CID   30911529 .
  146. ^ Jump up to: а беременный Guiry, MD; Guiry, GM (2016). «Ворот -водоросли» . www.algaebase.org . Получено 20 ноября 2016 года .
  147. ^ Д. Томас (2002). Морские водоросли . Life Series. Музей естественной истории, Лондон . ISBN  978-0-565-09175-0 .
  148. ^ Ван Хук, христианин; Человек, Дэвид; Jahns, HM (1995). Водоросли: и введение в Phyclooly . Издательство Кембриджского университета. п. 166. ISBN  9780521316873 Полем OCLC   443576944 .
  149. ^ Старккс, Сенн (31 октября 2012 г.). «Место на солнце» . Фландрия сегодня . Архивировано с оригинала 4 марта 2016 года . Получено 8 декабря 2012 года . Водоросли - это урожай будущего, по словам исследователей в Гиле
  150. ^ Мандоли Д.Ф. (1998). «Разработка плана тела и изменения фазы во время развития вертебуляции: как создается сложная архитектура гигантского Unicell?». Ежегодный обзор физиологии растений и молекулярной биологии растений . 49 : 173–198. doi : 10.1146/annurev.arplant.49.1.173 . PMID   15012232 . S2CID   6241264 .
  151. ^ Пьер Мэдл; Марисела Йип (2004). «Литература обзор Caulerpa Taxifolia» . Bufus-info . 19 (31). Архивировано из оригинала 8 октября 2022 года . Получено 11 октября 2019 года .
  152. ^ Duval, B.; Маргулис Л. (1995). «Микробное сообщество офридийских универсальных колоний: эндосимбионты, жители и арендаторы». Симбиоз . 18 : 181–210. PMID   11539474 .
  153. ^ Lalli, C.; Парсонс, Т. (1993). Биологическая океанография: введение . Баттерворт-Хейнеманн. ISBN  0-7506-3384-0 .
  154. ^ Eerie Red Glow Traces Ocean Plant Health Nasa Science , 28 мая 2009 г.
  155. ^ Behrenfeld, MJ; Westberry, TK; Босс, es; О'Мэлли, RT; Зигель, да; Виггерт, JD; Франц, Б.А.; McLain, Cr; Фельдман, GC; Дони, Южная Каролина; Мур, JK (2009). «Флуоресценция, обнаруженная спутником, выявляет глобальную физиологию океана фитопланктона» . Биогеонов . 6 (5): 779–794. Bibcode : 2009bgeo .... 6..779b . doi : 10.5194/bg-6-779-2009 . HDL : 1912/2854 .
  156. ^ Jump up to: а беременный Wassilieff, Maggy (2006) «Планнктон - заводный планктон» , Те Ара - Энциклопедия Новой Зеландии . Доступ: 2 ноября 2019 года.
  157. ^ Линдси Р., Скотт М. и Симмон Р. (2010) «Что такое фитопланктон» . НАСА Земля Обсерватория .
  158. ^ Поле, CB; Behrenfeld, MJ; Рандерсон, JT; Falwoski, PG (1998). «Первичное производство биосферы: интеграция наземных и океанических компонентов» . Наука . 281 (5374): 237–240. Bibcode : 1998sci ... 281..237f . doi : 10.1126/science.281.5374.237 . PMID   9657713 .
  159. ^ Treguer, P.; Нельсон, DM; Ван Беннеком, AJ; Демастер, диджей; Leynaert, A.; Queguiner, B. (1995). «Баланс кремнезема в мировом океане: рецензия». Наука . 268 (5209): 375–9. Bibcode : 1995sci ... 268..375t . doi : 10.1126/science.268.5209.375 . PMID   17746543 . S2CID   5672525 .
  160. ^ «Королевский колледж Лондон - Лейк Мегачад» . www.kcl.ac.uk. ​Получено 5 мая 2018 года .
  161. ^ Arsenieff, L.; Саймон, Н.; Rigaut-Jalabert, F.; Петух, ф.; Chaffron, S.; Run, e.; Как, E.; BIGEARD, E.; Baudoux, AC (2018). Деликатные вирусы Гвинардии Гвинардия Границы в микробиологии 9 3235. Два : :  6334475PMC  30687251PMID
  162. ^ Чжан, Д.; Wang, y.; Cai, J.; Пан, Дж.; Цзян, х.; Цзян, Ю. (2012). «Технология биопроизводства на основе диатомовой микро- и наноструктуры» . Китайский научный бюллетень . 57 (30): 3836–3849. Bibcode : 2012Chsbu..57.3836z . doi : 10.1007/s11434-012-5410-x .
  163. ^ Rost, B. and Riebesell, U. (2004) «Кокколитофоры и биологический насос: ответы на изменения окружающей среды». В кн.: Кокколитофоры: от молекулярных процессов до глобального воздействия , страницы 99–125, Springer. ISBN   9783662062784 .
  164. ^ Wassilieff, Maggy (2006) «Кокколитофор» , Te Ara - Энциклопедия Новой Зеландии . Доступ: 2 ноября 2019 года.
  165. ^ Делонг, ef; Beja, O. (2010). «Протеонооргодопсин, управляемый светом, усиливает бактериальную выживаемость в трудные времена» . PLOS Биология . 8 (4): E1000359. doi : 10.1371/journal.pbio.1000359 . PMC   2860490 . PMID   20436957 . E1000359.
  166. ^ Jump up to: а беременный Gómez-Consarnau, L.; Ворон, JA; Левин, NM; Каттер, LS; Ван, Д.; Seegers, B.; Aristegui, J.; Fuhrman, JA; Gasol, JM; Sañudo-Wilhelmy, SA (2019). «Микробные родопсины являются основными вкладчиками солнечной энергии, запечатленной в море» . Наука достижения . 5 (8): EAAW8855. Bibcode : 2019scia .... 5.8855g . doi : 10.1126/sciadv.aaw8855 . PMC   6685716 . PMID   31457093 .
  167. ^ Орен, Аарон (2002). «Молекулярная экология чрезвычайно галофильной археи и бактерий» . Микробиология FEMS Экология . 39 (1): 1–7. Bibcode : 2002femme..39 .... 1o . doi : 10.1111/j.1574-6941.2002.tb00900.x . ISSN   0168-6496 . PMID   19709178 .
  168. ^ Béja, O.; Aravind, L.; Кунин, ЭВ; Suzuki, Mt; Хадд, а.; Нгуен, LP; Йованович, SB; Гейтс, CM; Фельдман, Ра; Spudich, JL; Spudich, EN (2000). «Бактериальный родопсин: свидетельство нового типа фототрофии в море». Наука . 289 (5486): 1902–1906. Bibcode : 2000sci ... 289.1902b . doi : 10.1126/science.289.5486.1902 . PMID   10988064 . S2CID   1461255 .
  169. ^ «Интервью с стипендиатами: Эд Делонг» . Американская академия микробиологии . Архивировано с оригинала 7 августа 2016 года . Получено 2 июля 2016 года .
  170. ^ Бактерии с батареями , популярная наука, январь 2001 г., стр. 55.
  171. ^ Béja, O.; Aravind, L.; Кунин, ЭВ; Suzuki, Mt; Хадд, а.; Нгуен, LP; Йованович, SB; Гейтс, CM; Фельдман, Ра; Spudich, JL; Spudich, EN (2000). «Бактериальный родопсин: свидетельство нового типа фототрофии в море». Наука . 289 (5486): 1902–1906. Bibcode : 2000sci ... 289.1902b . doi : 10.1126/science.289.5486.1902 . PMID   10988064 .
  172. ^ Боуф, Доминик; Audic, Stéphane; Брилле-Гугуен, Лорейн; Карон, Кристоф; Жантон, Кристиан (2015). «Micrhode: кураторская база данных для анализа разнообразия и эволюции микробных родопсинов» . База данных . 2015 : BAV080. doi : 10.1093/база данных/bav080 . ISSN   1758-0463 . PMC   4539915 . PMID   26286928 .
  173. ^ Яво, милосердный; Кандори, Хидеки; Коайзуми, полагал (5 июня 2015 г.). Оптогенетика: светоотражающие белки и их применение Спрингер. Стр. 3–4 ISBN  978-4-431-55516-2 Полем Получено 30 сентября 2015 года .
  174. ^ Крошечный морской микроб может сыграть большую роль в университете по изменению климата Южной Калифорнии , пресс -комната, 8 августа 2019 года.
  175. ^ Dassarma, Shiladitya; Schwieterman, Edward W. (11 октября 2018 г.). «Ранняя эволюция фиолетовых пигментов сетчатки на Земле и последствия для биосигнатур экзопланеты» . Международный журнал астробиологии . 20 (3): 241–250. Arxiv : 1810.05150 . BIBCODE : 2018ARXIV181005150D . doi : 10.1017/s1473550418000423 . ISSN   1473-5504 . S2CID   119341330 .
  176. ^ Sparks, William B.; Dassarma, S.; Рейд, в (декабрь 2006 г.). «Эволюционная конкуренция между примитивными фотосинтетическими системами: существование ранней фиолетовой земли?». Американское астрономическое общество встречается тезисами . 38 : 901. Bibcode : 2006aas ... 209.0605s .
  177. ^ Редфилд, Альфред С. (1934). «О пропорциях органических производных в морской воде и их отношении к составу планктона». В Джонстоне, Джеймс; Даниэль, Ричард Джеллико (ред.). Мемориал Джеймса Джонстона . Ливерпуль: Университетская издательство Ливерпуля. С. 176–92. OCLC   13993674 .
  178. ^ Jump up to: а беременный Арриго, Кевин Р. (2005). «Морские микроорганизмы и глобальные циклы питательных веществ». Природа . 437 (7057): 349–55. Bibcode : 2005natur.437..349a . doi : 10.1038/nature04159 . PMID   16163345 . S2CID   62781480 .
  179. ^ Мартини, AC; Pham, Ct; Primeau, FW; Вругт, JA; Мур, JK; Левин, СА; Lomas, MW (2013). «Сильные широты в элементных соотношениях морского планктона и органического вещества» . Природа Геонаука . 6 (4): 279–283. Bibcode : 2013natge ... 6..279m . doi : 10.1038/ngeo1757 . S2CID   5677709 .
  180. ^ Эппли, RW; Петерсон, BJ (1979). «Пятницы органического вещества и новое планктонное производство в глубоком океане». Природа . 282 (5740): 677–680. Bibcode : 1979natur.282..677e . doi : 10.1038/282677A0 . S2CID   42385900 .
  181. ^ Velicer, Gregory J.; Mendes-Soares, Helena (2007). «Бактериальные хищники» (PDF) . Клетка . 19 (2): R55 - R56. doi : 10.1016/j.cub.2008.10.043 . PMID   19174136 . S2CID   5432036 .
  182. ^ Стивенс, Элисон Н.П. (2010). «Хищничество, травоядные и паразитизм» . Знания по природе . 3 (10): 36.
  183. ^ Jurkevitch, Edouard; Давидов, Яаков (2006). «Филогенетическое разнообразие и эволюция хищных прокариот». Хищные прокариоты . Спрингер. С. 11–56 . doi : 10.1007/7171_052 . ISBN  978-3-540-38577-6 .
  184. ^ Хансен, за Джуэль; Бьорнсен, Питер Кефоед; Хансен, Бенни Виндинг (1997). «Выпас и рост зоопланктона: масштабирование в пределах 2-2,-мкм размер тела» . Лимнология и океанография . 42 (4): 687–704. Bibcode : 1997limoc..42..687h . doi : 10.4319/lo.1997.42.4.0687 . суммирует результаты многих авторов.
  185. ^ Jump up to: а беременный Wassilieff, Maggy (2006) "Планнктон - Планштон животных" , Те Ара - Энциклопедия Новой Зеландии . Доступ: 2 ноября 2019 года.
  186. ^ Varea, C.; Арагон, JL; Баррио, Р.А. (1999). "Тьюринговые узоры на сфере". Физический обзор e . 60 (4): 4588–92. Bibcode : 1999frve..60.4588v . doi : 10.1103/physreve.60.4588 . PMID   11970318 .
  187. ^ Jump up to: а беременный GEMLEBEN, C.; Андерсон, или; Spindler, M. (1989). Современные планктонные фораминиферы . Springer-Verlag. ISBN  978-3-540-96815-3 .
  188. ^ Foraminifera: История обучения , Университетский колледж Лондон . Получено: 18 ноября 2019 года.
  189. ^ Finlay, BJ (2013). «Микроаэрофилия» . В Маршалле, KC (ред.). Достижения в области микробной экологии . Тол. 11. Springer Science & Business Media. п. 22. ISBN  978-1-4684-7612-5 .
  190. ^ Бернхард, JM; Баузер, С.М. (1999). «Бентические фораминиферы дизоксических отложений: секвестрация хлоропластов и функциональная морфология». Земля-наука обзоров . 46 (1): 149–165. Bibcode : 1999esrv ... 46..149b . doi : 10.1016/s0012-8252 (99) 00017-3 .
  191. ^ Дирссен, Хайди; Макманус, Джордж Б.; Хлус, Адам; Цю, Даджун; Гао, Бо-Кай; Лин, Сенджи (2015). «Изображение космической станции захватывает цветущий цветет красного прилива при высоком спектральном и пространственном разрешении» . Труды Национальной академии наук . 112 (48): 14783–14787. Bibcode : 2015pnas..11214783d . doi : 10.1073/pnas.15125388112 . PMC   4672822 . PMID   26627232 .
  192. ^ Ричард Коллинз (14 ноября 2016 г.). «Остерегайтесь миксотрофы - они могут уничтожить целые экосистемы« за считанные часы » . Ирландский экзаменатор .
  193. ^ «Микроскопические похитители тела заражают наши океаны» . Phys.org . 2 августа 2017 года.
  194. ^ Эйлер А (декабрь 2006 г.). «Доказательства повсеместного распространения миксотрофных бактерий в верхнем океане: последствия и последствия» . Appl Environ Microbiol . 72 (12): 7431–7. Bibcode : 2006apenm..72.7431e . doi : 10.1128/aem.01559-06 . PMC   1694265 . PMID   17028233 .
  195. ^ Катехакис А., Стибор Х (июль 2006 г.). «Mixotroph Ochromonas Tuberculata может вторгаться и подавлять специализированных специалистов по сообществам Phago- и Phototroph Plankton в зависимости от условий питательных веществ». Oecologia . 148 (4): 692–701. Bibcode : 2006oecol.148..692K . doi : 10.1007/s00442-006-0413-4 . PMID   16568278 . S2CID   22837754 .
  196. ^ Schoemann, Véronique; Becquevort, Sylvie; Стефельс, Жаклин; Руссо, Вероник; Ланселот, Кристиан (1 января 2005 г.). «Phaeocystis цветет в глобальном океане и их контролирующие механизмы: обзор». Журнал морских исследований . Железные ресурсы и океанические питательные вещества - продвижение глобального экологического моделирования. 53 (1–2): 43–66. Bibcode : 2005jsr .... 53 ... 43 с . Citeseerx   10.1.1.319.9563 . doi : 10.1016/j.seares.2004.01.008 .
  197. ^ «Добро пожаловать на домашнюю страницу проекта секвенирования генома Phaeocystis Antarctica» .
  198. ^ Дитуллио, Гр; Grebmeier, JM ; Арриго, Кр; Лизотт, М.П; Робинсон, DH; Leventer, A.; Барри, JP; Vanwoert, ML; Данбар, Р.Б. (2000). «Быстрый и ранний экспорт Phaeocystis Antarctica Blooms в море Росс, Антарктида». Природа . 404 (6778): 595–598. Bibcode : 2000natur.404..595d . doi : 10.1038/35007061 . PMID   10766240 . S2CID   4409009 .
  199. ^ J, Stefels; L, Dijkhuizen; WWC, Gieskes (20 июля 1995 г.). «DMSP-линейная активность в весеннем фитопланктоне расцветает у голландского побережья, связанной с численностью Phaeocystis sp. (PDF) . Серия прогресса в морской экологии . 123 : 235–243. Bibcode : 1995meps..123..235s . doi : 10.3354/meps123235 .
  200. ^ Decelle, Johan; Симо, Рафель; Гали, Марти; Варгас, Колумбан де; Колин, Себастьен; Desdevises, Ив; Биттнер, Люси; Пруберт, Ян; Нет, Фабрис (30 октября 2012 г.). «Оригинальный способ симбиоза в открытом океане» . Труды Национальной академии наук . 109 (44): 18000–18005. BIBCODE : 2012PNAS..10918000D . Doi : 10.1073/pnas.1212303109 . ISSN   0027-8424 . PMC   3497740 . PMID   23071304 .
  201. ^ Марс Брисбин, Маргарет; Гроссманн, Мэри М.; Mesrop, Lisa Y.; Митарай, Сатоши (2018). «Разнообразие внутрихоста и расширенное поддержание симбионта при фотосимбиотической акантарии (клада F)» . Границы в микробиологии . 9 : 1998. DOI : 10.3389/fmicb.2018.01998 . ISSN   1664-302X . PMC   6120437 . PMID   30210473 .
  202. ^ Jump up to: а беременный Stoecker, DK; Хансен, PJ; Карон, да; Митра А. (2017). «Миксотрофия в морской планктоне» . Ежегодный обзор морской науки . 9 : 311–335. Bibcode : 2017arms .... 9..311s . doi : 10.1146/annurev-marine-010816-060617 . PMID   27483121 .
  203. ^ Jump up to: а беременный Митра, а; Флинн, KJ; Тиллманн, U; Ворон, J; Карон, D; и др. (2016). «Определение планктонических протистских функциональных групп по механизмам получения энергии и питательных веществ; включение разнообразных миксотрофных стратегий» . Профист . 167 (2): 106–20. doi : 10.1016/j.protis.2016.01.003 . HDL : 10261/131722 . PMID   26927496 .
  204. ^ Gómez F (2012). «Контрольный список и классификация живых динофлагеллятов (Dinoflagellata, Alveolata)» . Cicimar oceánides . 27 (1): 65–140. doi : 10.37543/oceanides.v27i1.111 .
  205. ^ Stoecker DK (1999). «Миксотрофия среди динофлагеллятов». Журнал эукариотической микробиологии . 46 (4): 397–401. doi : 10.1111/j.1550-7408.1999.tb04619.x . S2CID   83885629 .
  206. ^ Предложил объяснение светящихся морей-включая в настоящее время светящиеся в настоящее время Калифорнийский Национальный научный фонд , 18 октября 2011 года.
  207. ^ Болтовскоя, Деметрио; Андерсон, О. Роджер; Корреа, Нэнси М. (2017). Справочник по протистам . Springer, Cham. С. 731–763. doi : 10.1007/978-3-319-28149-0_19 . ISBN  9783319281476 .
  208. ^ Андерсон, или (1983). Радиолария . Springer Science & Business Media.
  209. ^ Гаст, RJ; Карон, да (1 ноября 1996 г.). «Молекулярная филогения симбиотических динофлагеллятов из планктонных фораминиферов и радиоларии». Молекулярная биология и эволюция . 13 (9): 1192–1197. doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a025684 . ISSN   0737-4038 . PMID   8896371 .
  210. ^ Кастро П., Хубер М.Е. (2010). Морская биология (8 -е изд.). МакГроу Хилл. п. 95. ISBN  978-0071113021 .
  211. ^ Гастингс Дж.В. (1996). «Химии и цвета биолюминесцентных реакций: обзор». Ген . 173 (1 Спецификация нет): 5–11. doi : 10.1016/0378-1119 (95) 00676-1 . PMID   8707056 .
  212. ^ Хэддок С.Х., Молин М.А., Кейс Дж.Ф. (2009). «Биолюминесценция в море». Ежегодный обзор морской науки . 2 : 443–93. Bibcode : 2010Arms .... 2..443H . doi : 10.1146/annurev-marine-120308-081028 . PMID   21141672 . S2CID   3872860 .
  213. ^ «Протозои, заражающие жабры и кожу» . Ветеринарное руководство Merck . Архивировано с оригинала 3 марта 2016 года . Получено 4 ноября 2019 года .
  214. ^ Бренд, Ларри Э.; Кэмпбелл, Лиза; Бреснан, Эйлин (2012). « Карения : биология и экология токсичного рода» . Вредные водоросли . 14 : 156–178. Bibcode : 2012halga..14..156b . doi : 10.1016/j.hal.2011.10.020 . PMC   9891709 . PMID   36733478 .
  215. ^ Buskey, EJ (1995). «Рост и биолюминесценция Noctiluca Scintillans на различных диете водорослей». Журнал Plankton Research . 17 (1): 29–40. doi : 10.1093/plankt/17.1.29 .
  216. ^ Wierer, U.; Arrighi, S.; Бертола, с.; Кауфманн, Г.; Baumgarten, B.; Pedrotti, A.; Pernter, P.; Пелегрин Дж. (2018). «Литический инструментарий Iceman: сырье, технология, типология и использование» . Plos один . 13 (6): E0198292. BIBCODE : 2018PLOSO..1398292W . doi : 10.1371/journal.pone.0198292 . PMC   6010222 . PMID   29924811 .
  217. ^ Thomson, Charles Wyville (2014) Voyage of the Challenger: The Atlantic Cambridge University Press, Page235. ISBN   9781108074759 .
  218. ^ Грет Р. Хасл; Эрик Э. Сивертсен; Карен А. Стейдингер; Карл Танген (25 января 1996 г.). «Морские диатомовые» . В Кармело Р. Томас (ред.). Идентификация морских диатомовых и динофлагеллятов . Академическая пресса. С. 5–385. ISBN  978-0-08-053441-1 Полем Получено 13 ноября 2013 года .
  219. ^ Алд, См; и др. (2007). «Разнообразие, номенклатура и таксономия протистов» . Система Биол . 56 (4): 684–689. doi : 10.1080/10635150701494127 . PMID   17661235 .
  220. ^ Мохеймани, NR; Уэбб, JP; водорослей: обзор. потенциальные применения кокколитофоридных , MA ( «Биоремедиация и другие Borowitzka ) , 2012 J.Algal.2012.06.002
  221. ^ Тейлор, Ар; Chrachri, A.; Wheeler, G.; Годдард, ч.; Brownlee, C. (2011). «Управляемый напряжением H+-канал, лежащий в основе гомеостаза pH в кальцифицирующих кокколитофорах» . PLOS Биология . 9 (6): E1001085. doi : 10.1371/journal.pbio.1001085 . PMC   3119654 . PMID   21713028 .
  222. ^ Jump up to: а беременный Haq Bu и Boersma A. (Eds.) (1998) Введение в Marine Micropaleontology Elsevier. ISBN   9780080534961
  223. ^ Брукнер, Моника (2020) «Палеоклиматология: как мы можем сделать вывод прошлого климата?» Serc , Carleton College. Модифицировано 23 июля 2020 года. Получено 10 сентября 2020 года.
  224. ^ Земля, направляющаяся к «теплому» государству, не наблюдаемому за 50 миллионов лет, эпическая новая климатическая запись демонстрирует жизнь , 10 сентября 2020 года.
  225. ^ Вестер, Томас; Марван, Норберт; Друри, Анна Джой; Либранд, Дидерик; Агнини, Клаудия; Anannostou, Eleni; Барнет, Джеймс С.К.; Бохати, Стивен М.; Де Влешвер, Дэвид; Флоридо, Фабио; Фредерихс, Томас; Ходелл, Дэвид А.; Holbourn, Ann E.; Крун, Дик; Лауретано, Виттория; Литтлер, Кейт; Lourens, Lucas J.; Лайл, Митчелл; Пяковы, Хейко; Röhl, Урсула; живот, июнь; Уилкенс, Рой Х.; Уилсон, Пол А.; Зачос, Джеймс С. (11 сентября 2020 г.). «Астрономическая учет климата Земли и его предсказуемости за последние 66 миллионов лет » Наука 369 (6509): 1383–1 Bibcode : 2020sci ... 369.1 Doi : 10.1126/ science.ab6 HDL : 11577/3 PMID   32913105 S2CID   221593388
  226. ^ Боб Йирка (29 августа 2013 г.). «Почва под океаном, обнаруженная на давно проживающих бактериях, грибах и вирусах» . Phys.org .
  227. ^ Образец Яна (2 мая 2010 г.). «Самые старые живые организмы: древние выжившие с хрупким будущим» . Хранитель .
  228. ^ Джо Хансон. «Самое старое живое существо в мире» . Можно быть умным . Архивировано из оригинала 13 июля 2018 года . Получено 13 июля 2018 года .
  229. ^ Виллерслев, коробка; Фроэз, Дуэйн; Гиличинский, Дэвид; Ронн, Редин; Бунс, Майкл; Zuber, Maria T .; Гилберт, М. Томас П.; Бренд, Тина; Мунк, Каспер; Нильсен, Расмус; Мастепанов, Михаил; Кристенсен, Торбен Р.; Хебсгаард, Мартин б.; Джонсон, Сара Стюарт (4 сентября 2007 г.). «Древние бактерии показывают признаки восстановления ДНК» . Труды Национальной академии наук . 104 (36): 14401–14405. Bibcode : 2007pnas..10414401J . doi : 10.1073/pnas.0706787104 . PMC   1958816 . PMID   17728401 .
  230. ^ Egan, S., Fukatsu, T. и Francino, Mp, 2020. Возможности и проблемы для исследования микробного симбиоза в эпоху микробиомов. Границы в микробиологии, 11. Два : 10.3389/fmicb.2020.01150 . Модифицированный текст был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  231. ^ Маргулис, Линн; Фестер, Рене (1991). Симбиоз как источник эволюционных инноваций . MIT Press. ISBN  9780262132695 .
  232. ^ Борденштейн, Сет Р.; Тейс, Кевин Р. (2015). «Биология хозяина в свете микробиома: десять принципов голобионтов и гологеномов» . PLOS BIOL . 13 (8): E1002226. doi : 10.1371/journal.pbio.1002226 . ISSN   1545-7885 . PMC   4540581 . PMID   26284777 .
  233. ^ This, KR, Dheilly, NM, Klassen, JL, Brucker, RM, Baines, JF, Bosch, TC, Cryan, JF, Gilbert, SF, Goodnight, CJ, Lloyd, EA and Sapp, J. (2016) " Концепция Hologenome Right: экоэволюционная структура для хозяев и их микробиомов ». Msystems , 1 (2). doi : 10.1128/msystems.00028-16 . Модифицированный текст был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  234. ^ Bulgarelli, D., Schlaeppi, K., Spaepen, S., van Themaat, EVL и Schulze-Lefert, P. (2013) «Структура и функции бактериальной микробиоты растений». Ежегодный обзор биологии растений , 64 : 807–838. doi : 10.1146/annurev-arplant-050312-120106 .
  235. ^ Vandenkoornhuyse, Philippe; Quaiser, ахим; Дюамель, Мари; Ле Ван, Амандин; Дюфрес, Алексис (1 июня 2015 г.). «Важность микробиома растения Holobiont» . Новый фитолог . 206 (4): 1196–1206. doi : 10.1111/nph.13312 . ISSN   1469-8137 . PMID   25655016 .
  236. ^ Sánchez-Cañizares, C., Jorrín, B., Poole, PS и Tkacz, A. (2017) «Понимание голобионта: взаимозависимость растений и их микробиом». Текущее мнение в микробиологии , 38 : 188–196. Два : 10.1016/j.mib.2017.07.001 .
  237. ^ Douglas, AE и Werren, JH (2016) «Отверстия в голокоме: почему симбиозы хозяина-микроба не являются голобионтами». Mbio , 7 (2). Doi : 10.1128/race.02099-15 .
  238. ^ Knowlton, N. and Rohwer, F. (2003) «Многоспективные микробные взаимные взаимности на коралловых рифах: хозяин как среда обитания». Американский натуралист , 162 (S4): S51-S62. doi : 10.1086/378684 .
  239. ^ Поллок, Ф. Джозеф; МакМиндс, Райан; Смит, Стили; Борн, Дэвид Дж.; Уиллис, Бетт Л.; Медина, Моника; Тербер, Ребекка Вега; Zaneveld, Jesse R. (22 ноября 2018 г.). «Коралловые бактерии демонстрируют филосимбиоз и кофилогения» . Природная связь . 9 (1): 4921. Bibcode : 2018natco ... 9.4921p . doi : 10.1038/s41467-018-07275-x . ISSN   2041-1723 . PMC   6250698 . PMID   30467310 .
  240. ^ Thompson, JR, Rivera, HE, Closek, CJ и Medina, M. (2015) «Микробы в коралловом холобионте: партнеры посредством эволюции, развития и экологических взаимодействий». Границы в клеточной и инфекционной микробиологии , 4 : 176. Два : 10.3389/fcimb.2014.00176 .
  241. ^ Pita, L., Rix, L., Slaby, BM, Franke, A. and Hentschel, U. (2018) «Губка Holobiont в изменяющемся океане: от микробов до экосистемы». Микробиом , 6 (1): 46. Два : 10.1186/S40168-018-0428-1 . Модифицированный текст был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  242. ^ Ugarelli, K., Chakrabarti, S., Laas, P. and Stingl, U. (2017) "Holobiont и его микробиом". Микроорганизмы , 5 (4): 81. doi : 10.3390/microorganisms5040081 . Модифицированный текст был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  243. ^ Cavalcanti, GS, Shukla, P., Morris, M., Ribeiro, B., Foley, M., Doane, MP, Thompson, CC, Edwards, MS, Dinsdale, EA и Thompson, FL (2018). В изменяющемся океане: взаимодействия с хозяином-микробами опосредуют устойчивость кораллических водорослей при подкислении океана ». BMC Genomics , 19 (1): 1–13. Два : 10.1186/S12864-018-5064-4 . Модифицированный текст был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  244. ^ Вильгельм, Стивен У.; Саттл, Кертис А. (1999). «Вирусы и циклы питательных веществ в море» . Биоссака . 49 (10): 781–788. doi : 10.2307/1313569 . ISSN   1525-3244 . JSTOR   1313569 .
  245. ^ Вайнбауэр, Маркус Г.; и др. (2007). «Синергетическое и антагонистическое влияние вирусного лизиса и выпаса протистана на бактериальную биомассу, производство и разнообразие». Экологическая микробиология . 9 (3): 777–788. Bibcode : 2007envmi ... 9..777W . doi : 10.1111/j.1462-2920.2006.01200.x . PMID   17298376 .
  246. ^ Робинсон, Кэрол и Нагаппа Рамая. «Микробные гетеротрофные скорости метаболизма ограничивают микробного углеродного насоса». Американская ассоциация по развитию науки, 2011.
  247. ^ Гутьеррес, MH; Джара, Ам; Pantoja, S (2016). «Грибковые паразиты заражают морские диатомеры в экосистему Upwelling экосистемы текущей системы Гумбольдта от центрального чили». Среда Микробиол . 18 (5): 1646–1653. BIBCODE : 2016ENVMI..18.1646G . doi : 10.1111/1462-2920.13257 . HDL : 10533/148260 . PMID   26914416 .
  248. ^ Что такое морской снег? NOAA National Ocean Service . Обновлено: 25.06.18.
  249. ^ 2017 Геофизика , 24 : 293–3 doi : 10.5194/npg-24-293-2017 . Модифицированный текст был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 3.0 .
  250. ^ Саймон, М., Гроссарт Х., Швейцер Б. и Плуг, Х. (2002) «Микробная экология органических агрегатов в водных экосистемах». Водная микробная экология , 28 : 175–211. два : 10.3354/ame028175 .
  251. ^ Boetius, Antje; Anesio, Александр М.; Деминг, Джоди В.; Микаки, ​​Джилл А.; Рапп, Жозефина З. (1 ноября 2015 г.). «Микробная экология криосферы: морской лед и ледниковые места обитания». Nature Reviews Microbiology . 13 (11): 677–690. doi : 10.1038/nrmicro3522 . PMID   26344407 . S2CID   20798336 .
  252. ^ Лутц, Ричард А.; Кенниш, Майкл Дж. (1993). «Экология глубоководных гидротермальных вентиляционных сообществ: обзор». Отзывы геофизики . 31 (3): 211. Bibcode : 1993rvgeo..31..211l . doi : 10.1029/93rg01280 . ISSN   8755-1209 .
  253. ^ Кадар, Эник; Коста, Валентина; Сантос, Рикардо С.; Пауэлл, Джонатан Дж. (Июль 2006 г.). «Разделение тканей микроэффективных металлов в вентиляционных двустворчатых велосипедах батимодиола азорикуса и связанных с ними организмов (бактерии эндосимбионта и полихет паразита) от геохимически отличных вентиляционных вентиляционных технологий среднего атлантического хребта». Журнал морских исследований . 56 (1): 45–52. Bibcode : 2006jsr .... 56 ... 45K . doi : 10.1016/j.seares.2006.01.002 . ISSN   1385-1101 .
  254. ^ Андерсон, Рика Э.; Brazelton, William J.; Баросс, Джон А. (2011). «Затронут ли генетический ландшафт глубокой подземной биосферы вирусов?» Полем Границы в микробиологии . 2 : 219. doi : 10.3389/fmicb.2011.00219 . PMC   3211056 . PMID   22084639 .
  255. ^ Андерсон, Рика Э.; Brazelton, William J.; Баросс, Джон А. (2011). «Затронут ли генетический ландшафт глубокой подземной биосферы вирусов?» Полем Границы в микробиологии . 2 : 219. doi : 10.3389/fmicb.2011.00219 . ISSN   1664-302X . PMC   3211056 . PMID   22084639 .
  256. ^ Саттл, Кертис А. (сентябрь 2005 г.). «Вирусы в море». Природа . 437 (7057): 356–361. Bibcode : 2005natur.437..356s . doi : 10.1038/nature04160 . ISSN   0028-0836 . PMID   16163346 . S2CID   4370363 .
  257. ^ Саттл, Кертис А. (октябрь 2007 г.). «Морские вирусы - основные игроки в глобальной экосистеме». Nature Reviews Microbiology . 5 (10): 801–812. doi : 10.1038/nrmicro1750 . ISSN   1740-1526 . PMID   17853907 . S2CID   4658457 .
  258. ^ Андерсон, Рика Э.; Согин, Митчелл Л.; Баросс, Джон А. (3 октября 2014 г.). «Эволюционные стратегии вирусов, бактерий и археи в гидротермальных вентиляционных экосистемах, выявленные с помощью метагеномики» . Plos один . 9 (10): E109696. Bibcode : 2014ploso ... 9J9696A . doi : 10.1371/journal.pone.0109696 . ISSN   1932-6203 . PMC   4184897 . PMID   25279954 .
  259. ^ Ортманн, Алиса С.; Саттл, Кертис А. (август 2005 г.). «Высокое содержание вирусов в глубоководной гидротермальной вентиляционной системе указывает на вирусную микробную смертность». Deep Sea Research Part I: океанографические исследовательские работы . 52 (8): 1515–1527. Bibcode : 2005dsri ... 52.1515o . doi : 10.1016/j.dsr.2005.04.002 . ISSN   0967-0637 .
  260. ^ Breitbart, MYA (15 января 2012 г.). «Морские вирусы: правда или смелость». Ежегодный обзор морской науки . 4 (1): 425–448. Bibcode : 2012Arms .... 4..425b . doi : 10.1146/annurev-marine-120709-142805 . ISSN   1941-1405 . PMID   22457982 .
  261. ^ Голденфельд, Найджел; Woese, Carl (январь 2007 г.). «Следующая революция биологии». Природа . 445 (7126): 369. Arxiv : Q-Bio/0702015 . Bibcode : 2007natur.445..369G . doi : 10.1038/445369a . ISSN   0028-0836 . PMID   17251963 . S2CID   10737747 .
  262. ^ Глубокая углеродная обсерватория (10 декабря 2018 г.). «Жизнь в глубокой Земле насчитывает от 15 до 23 миллиардов тонн углерода - сотни раз больше, чем люди» . Эврикалерт! Полем Получено 11 декабря 2018 года .
  263. ^ Докрилл, Питер (11 декабря 2018 г.). «Ученые раскрывают огромную биосферу жизни, спрятанную под поверхностью Земли» . Наука оповещения . Получено 11 декабря 2018 года .
  264. ^ Габбатисс, Джош (11 декабря 2018 г.). «Массивное исследование« глубокой жизни »выявляет миллиарды тонн микробов, живущих далеко под поверхностью Земли» . Независимый . Получено 11 декабря 2018 года .
  265. ^ Lollar, Garnet S.; Уор, Оливер; Рассказ, Джон; Осберн, Магдалена Р.; Шервуд Лоллар, Барбара (2019). « Следуйте за водой»: гидрогеохимические ограничения на микробных исследованиях на 2,4 км ниже поверхности в глубокой жидкости и глубокой жизни на обсерватории и глубокой жизни ». Журнал геомикробиологии . 36 (10): 859–872. Bibcode : 2019gmbj ... 36..859L . doi : 10.1080/01490451.2019.1641770 . S2CID   199636268 .
  266. ^ «Самые старые в мире подземные воды поддерживают жизнь с помощью химии воды по стрижкам» . DeepCarbon.net . Глубокая углеродная обсерватория. 29 июля 2019 года. Архивировано с оригинала 10 сентября 2019 года.
  267. ^ Странные формы жизни, обнаруженные глубоко в шахте, на обширные «подземные галапагос» , Кори С. Пауэлл, 7 сентября 2019 года, nbcnews.com.
  268. ^ Старейшая вода на земле, обнаруженная глубоко в канадском щите , 14 декабря 2016 года, Мэгги Ромулд
  269. ^ Ву, Кэтрин Дж. (28 июля 2020 г.). «Эти микробы, возможно, выжили на 100 миллионов лет под морским днем-спасенные от их холодных, тесных и плотных питательных веществ, бактерии проснулись в лаборатории и росли» . New York Times . Получено 31 июля 2020 года .
  270. ^ Мороно, Юки; и др. (28 июля 2020 г.). «Аэробная микробная жизнь сохраняется в Oxic Marine Sepiter со старинным 101,5 миллионами лет» . Природная связь . 11 (3626): 3626. Bibcode : 2020natco..11.3626m . doi : 10.1038/s41467-020-17330-1 . PMC   7387439 . PMID   32724059 .
  271. ^ Jump up to: а беременный Filee, J.; Tetart, F.; Саттл, Калифорния; Krisch, HM (2005). «Морские бактериофаги типа T4, вездесущий компонент темной материи биосферы» . Труды Национальной академии наук . 102 (35): 12471–12476. Bibcode : 2005pnas..10212471F . doi : 10.1073/pnas.0503404102 . ISSN   0027-8424 . PMC   1194919 . PMID   16116082 .
  272. ^ Университет Теннесси в Ноксвилле (25 сентября 2018 г.). «Исследование: микробная темная материя доминирует в среде Земли» . Эврикалерт! Полем Получено 26 сентября 2018 года .
  273. ^ Хедлунд, Брайан П.; Додсворт, Джереми А.; Муругапиран, Senthil K.; Ринке, Кристиан; Войке, Танджа (2014). «Влияние одноклеточной геномики и метагеномики на новый взгляд на экстремофильный« микробная темная материя » . Экстремафилы . 18 (5): 865–875. doi : 10.1007/s00792-014-0664-7 . ISSN   1431-0651 . PMID   25113821 . S2CID   16888890 .
  274. ^ Май, RM (1988). «Сколько видов на земле?». Наука . 241 (4872): 1441–1449. Bibcode : 1988sci ... 241.1441m . doi : 10.1126/science.241.4872.1441 . PMID   17790039 . S2CID   34992724 .
  275. ^ Лоси, KJ; Леннон, JT (2016). «Законы масштабирования предсказывают глобальное микробное разнообразие» . Труды Национальной академии наук . 113 (21): 5970–5975. BIBCODE : 2016PNAS..113.5970L . doi : 10.1073/pnas.1521291113 . PMC   4889364 . PMID   27140646 .
  276. ^ Jump up to: а беременный Vitorino, LC; Бесса, Лос -Анджелес (2018). «Микробное разнообразие: разрыв между предполагаемым и известным» . Разнообразие . 10 (2): 46. doi : 10.3390/d10020046 . Модифицированный текст был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  277. ^ Jump up to: а беременный в Karsenti, E.; Акинас, SG; Борк, П.; Боулер, C.; De Vargas, C.; Raes, J.; Салливан, м.; Арендт, Д.; Benzoni, F.; Клавери, JM; Следует, М. (2011). «Целостный подход к биологии морской экосистем» . PLOS Биология . 9 (10): E1001177. doi : 10.1371/journal.pbio.1001177 . PMC   3196472 . PMID   22028628 .
  278. ^ Olsen GJ, Woese CR, Overbeek R (1994). «Ветры (эволюционных) изменений: вдыхая новую жизнь в микробиологию» . Журнал бактериологии . 176 (1): 1–6. doi : 10.2172/205047 . PMC   205007 . PMID   8282683 .
  279. ^ Woese, CR (1987). «Бактериальная эволюция» . Микробиологические обзоры . 51 (2): 221–71. doi : 10.1128/mmbr.51.2.221-271.1987 . PMC   373105 . PMID   2439888 .
  280. ^ Jump up to: а беременный Коллинз, Р. Эрик (2019) Небольшая и могущественная - микробная жизнь NOAA: исследования и исследования океана , экспедиция залива Аляски 2019 года. Общественный достояние Эта статья включает текст из этого источника, который находится в общественном доступе .
  281. ^ Käse L, Geuer JK. (2018) «Ответы фитопланктона на изменение морского климата - введение» . В Jungblut S., Liebich V., Bode M. (eds) Youmares 8 -Oceans по границам: обучение друг от друга , стр. 55–72, Springer. doi : 10.1007/978-3-319-93284-2_5 . Модифицированный текст был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  282. ^ Франко-Дуарте, Р.; Černáková, L.; Kadam, S.; Kaushik, K.; Salehi, B.; Bevilacqua, A.; Корбо, мистер; Антолак, Х.; Dybka-stępień, K.; Leszczewicz, M.; Relison Tintino, S. (2019). «Достижения в химических и биологических методах для выявления микроорганизмов - от прошлого до представления» . Микроорганизмы . 7 (5): 130. doi : 10.3390/microorganisms7050130 . PMC   6560418 . PMID   31086084 . Модифицированный текст был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  283. ^ Lozupone, CA, Stombaugh, Ji, Gordon, Ji, Jansson, JK and Knight, R. (2012) «Разнообразие, стабильность и устойчивость человеческой кишечной микробиоты». Nature , 489 (7415): 220–230. doi : 10.1038/nature11550 .
  284. ^ Venter, JC, Remington, K., Heidelberg, JF, Halpern, AL, Rusch, D., Eisen, JA, Wu, D., Paulsen, I., Nelson, KE, Nelson, W. и Fouts, de (DE (DE 2004) «Секвенирование ружья экологического генома моря Саргассо». Science , 304 (5667): 66–74. doi : 10.1126/science.1093857 .
  285. ^ Liu, L., Li, Y., Li, S., Hu, N., He, Y., Pong, R., Lin, D., Lu, L. and Law, M. (2012) "Сравнение систем секвенирования следующего поколения ». Biomed Research International , 2012 : 251364. doi : 10.1155/2012/251364 .
  286. ^ Медведь, Габриэль ; Дория Рыбоксова, Дорин Фиан, Томислав Чернава, Мари-Чристин Чампумер Верс, Тревор Чарльз, Сяоюлон, Кей Коко, Кзоу, Линдо Казу, Линдо Казу, Линия Ланге, Линия Ланге, Нельсон Лайма, Эмманлле Магюн, Тим Маучлайн, Рян Макайр, Рейн Мака. , Биргит Миттер, Мэтью Райан, Инга Серанд, Хауке Смидт, Хьюго Рум, Г. Сегал Киран, Джозеф Селвиан, Эйр, Эйр, Лиуза, Портуач Лео из Овербеля, Борбор, Борбор Борбор, Брайех К. Сингх К. Сингх К. Сингх. Микробийны , 8 (103): 1–22. Два : 10.1186/S40168-020-00875-0 . Модифицированный текст был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  287. ^ Kodzius, R.; Gojobori, T. (2015). «Морская метагеномика как источник для биопровождения» . Морская геномика . 24 : 21–30. Bibcode : 2015margn..24 ... 21k . doi : 10.1016/j.margen.2015.07.001 . HDL : 10754/567056 . PMID   26204808 . Модифицированный текст был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  288. ^ Джулиано, Лора; Барбье, Мишель; Бриан, Фредерик, ред. (Сентябрь 2010). Специальный выпуск: Морская Омика . Микробная биотехнология, вып. 3, n ° 5. Wiley-Blackwell. С. 489–621.
  289. ^ Холторф, Хаук; Гиттон, Мари-Кристин; Reski, Ralf (2002). «Планы функциональной геномики». Естественные науки . 89 (6): 235–249. Bibcode : 2002nw ..... 89..235H . Doi : 10.1007/s00114-002-0321-3 . PMID   12146788 . S2CID   7768096 .
  290. ^ Cain AK, Barquist L, Goodman AL, Paulsen IT, Parkhill J, Van Opijnen T (2020). «Десятилетие достижений в секвенировании транспозонов-инстерирования» . Nature Reviews Genetics . 21 (9): 526–540. doi : 10.1038/s41576-020-0244-x . HDL : 10033/622374 . PMC   7291929 . PMID   32533119 .
  291. ^ Zhang, W., Li, F. and Nie, L. (2010) «Интеграция множественного анализа« OMIC »для микробной биологии: применение и методологии». Микробиология , 156 (2): 287–301. два : 10.1099/small.0.034793-0 .
  292. ^ Сингх, Р.П. и Котари Р. (2017) «Эра Омика и микробиомы хозяина» . В: Singh RP, Kothari R, Koringa PG и Singh SP (Eds.) Понимание взаимодействия хозяина-микробиома-подход OMICS , стр. 3–12, Springer. ISBN   9789811050503 . doi : 10.1007/978-981-10-5050-3_1
  293. ^ Capotondi, A., Jacox, M., Bowler, C., Kavanaugh, M., Lehodey, P., Barrie, D., Brodie, S., Chaffron, S., Cheng, W., Dias, DF, EVEILLARD, D. и 20 других (2019) «Наблюдательные потребности в поддержке моделирования и прогнозирования морских экосистем: от глобального океана до региональных и прибрежных систем». Границы в морской науке , 6 : 623. Два : 10.3389/fmars.2019.00623 . Модифицированный текст был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  294. ^ Sunagawa, S., Coelho, LP, Chaffron, S., Kultima, JR, Labadie, K., Salazar, G., et al. (2015). «Ocean Plankton. Структура и функция глобального океанского микробиома». Наука , 348 : 1261359. doi : 10.1126/science.1261359 .
  295. ^ Guidi, L., Chaffron, S., Bittner, L., Eveillard, D., Larhlimi, A., Roux, S., et al. (2016). «Планктонные сети, управляющие экспортом углерода в олиготрофном океане». Природа , 532 : 465–470. doi : 10.1038/nature16942 .
  296. ^ Guyennon, A., Baklouti, M., Diaz, F., Palmieri, J., Beuvier, J., Lebaupin-Brossier, C., et al. (2015). «Новое понимание экспорта органического углерода в Средиземном море из трехмерного моделирования». Biogeosciences , 11 : 425–442. Два : 10.5194/BG-12-7025-2015 .
  297. ^ Лука С., Парфри, Л.В. и Доубели, М. (2016). «Функция развязки и таксономия в глобальном океанском микробиоме». Наука , 353 : 1272–1277. doi : 10.1126/science.aaf4507 .
  298. ^ Coles, VJ, Stukel, MR, Brooks, MT, Burd, A., Crump, BC, Moran, MA, et al. (2017). «Океанская биогеохимия смоделирована с геномикой на основе признаков». Наука , 358 : 1149–1154. doi : 10.1126/science.aan5712 .
  299. ^ Mock, T., Daines, SJ, Geider, R., Collins, S., Metodiev, M., Millar, AJ, Moulton, V. and Lenton, TM (2016). » Чтобы лучше понять, как изменения окружающей среды влияют на морские микробы ». Глобальная биология изменений , 22 (1): 61–75. Doi : 10.1111 / gcb.12983 . Модифицированный текст был скопирован из этого источника, который доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 .
  300. ^ Jump up to: а беременный Toseland A, Daines SJ и Clark Jr et al. (2013) «Влияние температуры на распределение ресурсов и метаболизма морского фитопланктона». Изменение климата природы , 3 : 979–984. два : 10.1038/климат1989 .
  301. ^ Martiny AC, Pham CTA, Primeau FW, Vrugt JA, Moore JK, Levin SA и Lomas MW (2013) «Сильные широтные закономерности в элементарных соотношениях морского планктона и органического вещества». Nature Geoscience , 6 : 279–283. два : 10.1038/ngeo1757 .

Общие ссылки

[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 7a6ca26b6a9dead4008f14eb96dd4eed__1717309860
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/7a/ed/7a6ca26b6a9dead4008f14eb96dd4eed.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Marine microorganisms - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)