Тромбомодулин

THBD
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1ADX, 1DQB, 1DX5, 1EGT, 1FGD, 1FGE, 1HLT, 1TMR, 1ZAQ, 2ADX, 3GIS
Идентификаторы
Псевдонимы	THBD , AHUS6, BDCA3, CD141, THPH12, THRM, TM, тромбомодулин, BDCA-3
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 188040 ; МГИ : 98736 ; Гомологен : 308 ; GeneCards : THBD ; OMA : THBD — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 20 (human)
End	23,049,672 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	148,250,108 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	gingival epithelium; ; vena cava; ; right lung; ; skin of hip; ; skin of abdomen; ; skin of thigh; ; periodontal fiber; ; lower lobe of lung; ; upper lobe of left lung; ; left coronary artery;
	Top expressed in
	right lung lobe; ; left lung; ; left lung lobe; ; calvaria; ; Gonadal ridge; ; ankle; ; aortic valve; ; ascending aorta; ; white adipose tissue; ; decidua;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	calcium ion binding; protein binding; transmembrane signaling receptor activity; signaling receptor activity;
Cellular component	integral component of membrane; cell surface; plasma membrane; integral component of plasma membrane; membrane; apicolateral plasma membrane; vacuolar membrane; extracellular space;
Biological process	hemostasis; female pregnancy; negative regulation of platelet activation; response to lipopolysaccharide; response to cAMP; negative regulation of fibrinolysis; blood coagulation; response to X-ray; signal transduction; negative regulation of blood coagulation; leukocyte migration;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	7056
	21824
	ENSG00000178726
	ENSMUSG00000074743
	P07204
	P15306
	НМ_000361
	НМ_009378
	НП_000352
	НП_033404
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Тромбомодулин ( ТМ ), CD 141 или BDCA-3 представляет собой интегральный мембранный белок, экспрессирующийся на поверхности эндотелиальных клеток и служащий кофактором тромбина . Он снижает свертываемость крови путем превращения тромбина из прокоагулянтного фермента в антикоагулянтный фермент. ^{[ 5 ]} Тромбомодулин также экспрессируется на мезотелиальных клетках человека . ^{[ 6 ]} моноциты и дендритные клетки .

Генетика и строение

У человека тромбомодулин кодируется THBD геном . ^{[ 7 ]} Белок имеет молекулярную массу 74 кДа и состоит из одной цепи с шестью тандемно повторяющимися EGF-подобными доменами , серином / треонином спейсером, богатым , и трансмембранным доменом. ^{[ 8 ]} Он является членом семейства 14 группы лектиновых доменов C-типа (CTLD). ^{[ 9 ]}

Функция

Тромбомодулин действует как кофактор в индуцированной тромбином активации протеина С в антикоагулянтном пути, образуя стехиометрический комплекс 1:1 с тромбином. Это увеличивает скорость активации протеина С в тысячу раз. Тромбомодулин-связанный тромбин одновременно оказывает прокоагулянтное действие, ингибируя фибринолиз путем расщепления активируемого тромбином ингибитора фибринолиза (TAFI, также известного как карбоксипептидаза B2) в его активную форму. ^{[ нужна ссылка ]}

Тромбомодулин представляет собой гликопротеин на поверхности эндотелиальных клеток, который, помимо связывания тромбина, регулирует инактивацию C3b фактором I. Сообщалось также, что мутации в гене тромбомодулина (THBD) связаны с атипичным гемолитико-уремическим синдромом (aHUS). ^{[ 10 ]}

Антиген , описанный как BDCA-3. ^{[ 11 ]} оказался идентичен тромбомодулину. ^{[ 12 ]} Таким образом, выяснилось, что эта молекула также встречается в очень редкой (0,02%) субпопуляции дендритных клеток человека , называемой MDC2. Его функция в этих клетках неизвестна. ^{[ нужна ссылка ]}

Взаимодействия

Было показано, что тромбомодулин взаимодействует с тромбином . ^{[ 13 ]}^{[ 14 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000178726 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000074743 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ IPR001491 Тромбомодулин, по состоянию на 19 января 2012 г.
^ Верхаген Х.Дж., Хейнен-Снайдер Г.Дж., Пронк А., Врум Т.М., ван Врунховен Т.Дж., Эйкельбум Б.С. и др. (декабрь 1996 г.). «Активность тромбомодулина в отношении мезотелиальных клеток: перспективы мезотелиальных клеток как альтернативы эндотелиальным клеткам для посева клеток на сосудистые трансплантаты». Британский журнал гематологии . 95 (3): 542–549. дои : 10.1046/j.1365-2141.1996.d01-1935.x . ПМИД 8943899 . S2CID 8417511 .
^ Вэнь Д.З., Диттман В.А., Йе Р.Д., Дивен Л.Л., Маджерус П.В., Сэдлер Дж.Е. (июль 1987 г.). «Человеческий тромбомодулин: полная последовательность кДНК и хромосомная локализация гена». Биохимия . 26 (14): 4350–4357. дои : 10.1021/bi00388a025 . ПМИД 2822087 .
^ Сэдлер Дж. Э. (июль 1997 г.). «Структура и функция тромбомодулина». Тромбоз и гемостаз . 78 (1): 392–395. дои : 10.1055/s-0038-1657558 . ПМИД 9198185 . S2CID 32297505 .
^ Хан К.А., МакМюррей Дж.Л., Мохаммед Ф., Бикнелл Р. (сентябрь 2019 г.). «Белки группы 14 доменов лектина C-типа в сосудистой биологии, раке и воспалении» . Журнал ФЭБС . 286 (17): 3299–3332. дои : 10.1111/февраль 14985 . ПМЦ 6852297 . ПМИД 31287944 .
^ Дельвай М., Норис М., Де Вриз А., Эсмон К.Т., Эсмон Н.Л., Феррелл Г. и др. (июль 2009 г.). «Мутации тромбомодулина при атипичном гемолитико-уремическом синдроме» . Медицинский журнал Новой Англии . 361 (4): 345–357. дои : 10.1056/NEJMoa0810739 . ПМК 3530919 . ПМИД 19625716 .
^ Дзионек А., Фукс А., Шмидт П., Кремер С., Зиск М., Милтеньи С. и др. (декабрь 2000 г.). «BDCA-2, BDCA-3 и BDCA-4: три маркера различных подмножеств дендритных клеток в периферической крови человека» . Журнал иммунологии . 165 (11): 6037–6046. дои : 10.4049/jimmunol.165.11.6037 . ПМИД 11086035 .
^ Дзионек А., Инагаки Ю., Окава К., Нагафуне Дж., Рёк Дж., Сохма Ю. и др. (декабрь 2002 г.). «Плазмоцитоидные дендритные клетки: от специфических поверхностных маркеров к специфическим клеточным функциям». Иммунология человека . 63 (12): 1133–1148. дои : 10.1016/S0198-8859(02)00752-8 . ПМИД 12480257 .
^ Байзар Л., Морсер Дж., Нешейм М. (июль 1996 г.). «TAFI, или плазменная прокарбоксипептидаза B, связывает коагуляционный и фибринолитический каскады через комплекс тромбин-тромбомодулин» . Журнал биологической химии . 271 (28): 16603–16608. дои : 10.1074/jbc.271.28.16603 . ПМИД 8663147 .
^ Якубовский Х.В., Оуэн В.Г. (июль 1989 г.). «Определители макромолекулярной специфичности тромбина для фибриногена и тромбомодулина» . Журнал биологической химии . 264 (19): 11117–11121. дои : 10.1016/S0021-9258(18)60437-5 . ПМИД 2544585 .

Дальнейшее чтение

Эсмон CT (июль 1995 г.). «Тромбомодулин как модель молекулярных механизмов, которые модулируют специфичность и функцию протеаз на поверхности сосудов» . Журнал ФАСЭБ . 9 (10): 946–955. дои : 10.1096/fasebj.9.10.7615164 . ПМИД 7615164 . S2CID 19565674 .
Олин А.К., Норлунд Л., Марлар Р.А. (июль 1997 г.). «Вариации гена тромбомодулина и тромбоэмболические заболевания». Тромбоз и гемостаз . 78 (1): 396–400. дои : 10.1055/s-0038-1657559 . ПМИД 9198186 . S2CID 25122238 .
Ван де Ваувер М., Коллен Д., Конвей Э.М. (август 2004 г.). «Система Тромбомодулин-белок C-EPCR: интегрирована для регулирования коагуляции и воспаления». Атеросклероз, тромбоз и сосудистая биология . 24 (8): 1374–1383. дои : 10.1161/01.ATV.0000134298.25489.92 . ПМИД 15178554 .
Боффа MC, Джекман Р.В., Пейри Н., Боффа Дж.Ф., Джордж Б. (1991). «Тромбомодулин в центральной нервной системе». Новый французский гематологический журнал . 33 (6): 423–429. ПМИД 1667949 .
Джекман Р.В., Билер Д.Л., Фрице Л., Софф Г., Розенберг Р.Д. (сентябрь 1987 г.). «Ген тромбомодулина человека лишен интронов: последовательности нуклеиновых кислот кДНК и гена предсказывают структуру белка и предполагают участки регуляторного контроля» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 84 (18): 6425–6429. Бибкод : 1987PNAS...84.6425J . дои : 10.1073/pnas.84.18.6425 . ПМК 299089 . ПМИД 2819876 .
Сузуки К., Кусумото Х., Деяшики Ю., Нисиока Дж., Маруяма И., Дзуси М. и др. (июль 1987 г.). «Структура и экспрессия человеческого тромбомодулина, рецептора тромбина на эндотелии, действующего как кофактор активации протеина С» . Журнал ЭМБО . 6 (7): 1891–1897. дои : 10.1002/j.1460-2075.1987.tb02448.x . ПМК 553573 . ПМИД 2820710 .
Вэнь Д.З., Диттман В.А., Йе Р.Д., Дивен Л.Л., Маджерус П.В., Сэдлер Дж.Е. (июль 1987 г.). «Человеческий тромбомодулин: полная последовательность кДНК и хромосомная локализация гена». Биохимия . 26 (14): 4350–4357. дои : 10.1021/bi00388a025 . ПМИД 2822087 .
Шираи Т., Сиодзири С., Ито Х., Ямамото С., Кусумото Х., Деясики Ю. и др. (февраль 1988 г.). «Геновая структура тромбомодулина человека, кофактора катализируемой тромбином активации белка С». Журнал биохимии . 103 (2): 281–285. CiteSeerX 10.1.1.1006.6759 . doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a122261 . ПМИД 2836377 .
Ёнезава С., Маруяма И., Танака С., Накамура Т., Сато Э. (август 1988 г.). «Иммуногистохимическая локализация тромбомодулина при хорионических заболеваниях матки и хориокарциноме желудка. Сравнительное исследование с распределением хорионического гонадотропина человека». Рак . 62 (3): 569–576. doi : 10.1002/1097-0142(19880801)62:3<569::AID-CNCR2820620322>3.0.CO;2-T . ПМИД 2839283 . S2CID 28744944 .
Исии Х., Маджерус П.В. (декабрь 1985 г.). «Тромбомодулин присутствует в плазме и моче человека» . Журнал клинических исследований . 76 (6): 2178–2181. дои : 10.1172/JCI112225 . ПМЦ 424339 . ПМИД 3001144 .
Адлер М., Сето М.Х., Нитецкий Д.Е., Лин Дж.Х., Лайт Д.Р., Морсер Дж. (октябрь 1995 г.). «Структура фрагмента из 19 остатков С-петли четвертого домена тромбомодулина, подобного эпидермальному фактору роста» . Журнал биологической химии . 270 (40): 23366–23372. дои : 10.1074/jbc.270.40.23366 . ПМИД 7559494 .
Олин А.К., Марлар Р.А. (январь 1995 г.). «Первая мутация, выявленная в гене тромбомодулина у 45-летнего мужчины с тромбоэмболической болезнью» . Кровь . 85 (2): 330–336. дои : 10.1182/blood.V85.2.330.330 . ПМИД 7811989 .
Сринивасан Дж., Ху С., Храбал Р., Чжу Ю., Комивес Е.А., Ни Ф. (ноябрь 1994 г.). «Связанная с тромбином структура субдомена EGF тромбомодулина человека, определяемая перенесенными ядерными эффектами Оверхаузера». Биохимия . 33 (46): 13553–13560. дои : 10.1021/bi00250a007 . ПМИД 7947766 .
Герлиц Б., Хасселл Т., Влахос С.Дж., Паркинсон Дж.Ф., Банг Н.У., Гриннелл Б.В. (октябрь 1993 г.). «Идентификация преобладающего места присоединения гликозаминогликанов в растворимом рекомбинантном тромбомодулине человека: потенциальная регуляция функциональности посредством конкуренции гликозилтрансфераз за серин474» . Биохимический журнал . 295 (1): 131–140. дои : 10.1042/bj2950131 . ПМЦ 1134829 . ПМИД 8216207 .
Ясуда К., Эспиноза Р., Дэвис Э.М., Ле Бо М.М., Белл Дж.И. (сентябрь 1993 г.). «Гены рецепторов соматостатина человека: локализация SSTR5 на хромосоме 20p11.2 человека». Геномика . 17 (3): 785–786. дои : 10.1006/geno.1993.1410 . ПМИД 8244401 .
Ямамото С., Мидзогучи Т., Тамаки Т., Окучи М., Кимура С., Аоки Н. (апрель 1993 г.). «Мочевой тромбомодулин, его выделение и характеристика». Журнал биохимии . 113 (4): 433–440. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a124063 . ПМИД 8390446 .
Майнингер Д.П., Хантер М.Дж., Комивес Е.А. (сентябрь 1995 г.). «Синтез, активность и предварительная структура четвертого EGF-подобного домена тромбомодулина» . Белковая наука . 4 (9): 1683–1695. дои : 10.1002/pro.5560040904 . ПМК 2143218 . ПМИД 8528067 .
Маглотт Д.Р. , Фельдблюм ТВ, Дуркин А.С., Нирман В.К. (май 1996 г.). «Радиационное гибридное картирование SNAP, PCSK2 и THBD (хромосома 20p человека)». Геном млекопитающих . 7 (5): 400–401. дои : 10.1007/s003359900120 . ПМИД 8661740 . S2CID 34951074 .

Внешние ссылки

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000178726 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000074743 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[5] IPR001491 Тромбомодулин, по состоянию на 19 января 2012 г.

[6] Верхаген Х.Дж., Хейнен-Снайдер Г.Дж., Пронк А., Врум Т.М., ван Врунховен Т.Дж., Эйкельбум Б.С. и др. (декабрь 1996 г.). «Активность тромбомодулина в отношении мезотелиальных клеток: перспективы мезотелиальных клеток как альтернативы эндотелиальным клеткам для посева клеток на сосудистые трансплантаты». Британский журнал гематологии . 95 (3): 542–549. дои : 10.1046/j.1365-2141.1996.d01-1935.x . ПМИД 8943899 . S2CID 8417511 .

[pmid2822087-7] Вэнь Д.З., Диттман В.А., Йе Р.Д., Дивен Л.Л., Маджерус П.В., Сэдлер Дж.Е. (июль 1987 г.). «Человеческий тромбомодулин: полная последовательность кДНК и хромосомная локализация гена». Биохимия . 26 (14): 4350–4357. дои : 10.1021/bi00388a025 . ПМИД 2822087 .

[8] Сэдлер Дж. Э. (июль 1997 г.). «Структура и функция тромбомодулина». Тромбоз и гемостаз . 78 (1): 392–395. дои : 10.1055/s-0038-1657558 . ПМИД 9198185 . S2CID 32297505 .

[9] Хан К.А., МакМюррей Дж.Л., Мохаммед Ф., Бикнелл Р. (сентябрь 2019 г.). «Белки группы 14 доменов лектина C-типа в сосудистой биологии, раке и воспалении» . Журнал ФЭБС . 286 (17): 3299–3332. дои : 10.1111/февраль 14985 . ПМЦ 6852297 . ПМИД 31287944 .

[10] Дельвай М., Норис М., Де Вриз А., Эсмон К.Т., Эсмон Н.Л., Феррелл Г. и др. (июль 2009 г.). «Мутации тромбомодулина при атипичном гемолитико-уремическом синдроме» . Медицинский журнал Новой Англии . 361 (4): 345–357. дои : 10.1056/NEJMoa0810739 . ПМК 3530919 . ПМИД 19625716 .

[pmid11086035-11] Дзионек А., Фукс А., Шмидт П., Кремер С., Зиск М., Милтеньи С. и др. (декабрь 2000 г.). «BDCA-2, BDCA-3 и BDCA-4: три маркера различных подмножеств дендритных клеток в периферической крови человека» . Журнал иммунологии . 165 (11): 6037–6046. дои : 10.4049/jimmunol.165.11.6037 . ПМИД 11086035 .

[pmid12480257-12] Дзионек А., Инагаки Ю., Окава К., Нагафуне Дж., Рёк Дж., Сохма Ю. и др. (декабрь 2002 г.). «Плазмоцитоидные дендритные клетки: от специфических поверхностных маркеров к специфическим клеточным функциям». Иммунология человека . 63 (12): 1133–1148. дои : 10.1016/S0198-8859(02)00752-8 . ПМИД 12480257 .

[pmid8663147-13] Байзар Л., Морсер Дж., Нешейм М. (июль 1996 г.). «TAFI, или плазменная прокарбоксипептидаза B, связывает коагуляционный и фибринолитический каскады через комплекс тромбин-тромбомодулин» . Журнал биологической химии . 271 (28): 16603–16608. дои : 10.1074/jbc.271.28.16603 . ПМИД 8663147 .

[pmid2544585-14] Якубовский Х.В., Оуэн В.Г. (июль 1989 г.). «Определители макромолекулярной специфичности тромбина для фибриногена и тромбомодулина» . Журнал биологической химии . 264 (19): 11117–11121. дои : 10.1016/S0021-9258(18)60437-5 . ПМИД 2544585 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

v т и Белки : кластеры дифференцировки (см. также список кластеров дифференцировки человека )
1–50	CD1 a-c 1A 1B 1D 1E CD2 CD3 γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50
51–100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64 A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 - CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101–150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151–200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201–250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 - CD248 CD249
251–300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301–350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD327 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350