Наборы данных о COVID-19

Наборы данных о COVID-19 — это общедоступные базы данных для обмена данными о случаях заболевания и медицинской информацией, связанной с пандемией COVID-19 .

Совокупная статистика

Соединенные Штаты

Волонтерская/неправительственная организация

Издатель	Дата первой публикации	В официальном использовании?	Обновлять Частота	Географический Уровень	Таймсерии	Тестирование Сайты	Тестирование Число	Случаи	Госпитализации	Летальные исходы	Вакцинация Сайты	Вакцинация Число	Описание
Программисты против COVID / GISCorps ^{[ 1 ]}	22 марта 2020 г. ^{[ 2 ]}	Да, FEMA ^{[ 3 ]} и штат Калифорния ^{[ 4 ]}	Ежедневно	Точка (широта/долгота)	Да	Да	Нет	Нет	Нет	Нет	Да	Нет	Набор данных о местах тестирования на COVID-19 в США и Пуэрто-Рико.
СШАФакты ^{[ 5 ]}	24 апреля 2020 г. ^{[ 6 ]}	Да, Центром по контролю и профилактике заболеваний (CDC) ^{[ 7 ]}	Ежедневно	Графство	Да	Нет	Нет	Да		Да	Нет	Нет	Набор данных о случаях заболевания и смертности от коронавируса на уровне округа, который обновляется ежедневно.
Проект отслеживания COVID ^{[ 8 ]}	7 марта 2020 г. ^{[ 9 ]}	Нет	Ежедневно	Состояние	Да	Нет	Да	Да	Да	Да	Нет	Нет	База данных тестов и медицинской статистики в США, управляемая волонтерами.
Анализ тональности отзывов пользователей о мобильных приложениях для отслеживания контактов с COVID-19 ^{[ 10 ]} ^{[ 11 ]}	март 2021 г.												Этот набор данных предназначен для поддержки анализа настроений пользователей в отношении мобильных приложений для отслеживания контактов с COVID-19.

Министерство здравоохранения и социальных служб США

Имя	Географический Уровень	Таймсерии	Тестирование Сайты	Тестирование Число	Случаи	Госпитализации	Летальные исходы	Вакцинация Сайты	Вакцинация Число
Временные ряды диагностических лабораторных испытаний на COVID-19 (ПЦР-тестирование), заархивированные 12 марта 2021 г. в Wayback Machine.	Состояние	Да	Нет	Да	Нет	Нет	Нет	Нет	Нет
Сообщения о влиянии COVID-19 на пациентов и пропускной способности больниц по учреждениям. Архивировано 12 марта 2021 г. в Wayback Machine.	Точка (широта/долгота)	Да	Нет	Нет	Нет	Да	Нет	Нет	Нет
Оценка воздействия COVID-19 на пациентов и пропускную способность больниц по государственным данным. Архивировано 12 марта 2021 г. в Wayback Machine.	Состояние	Нет	Нет	Нет	Нет	Да	Нет	Нет	Нет
Сообщения штата о влиянии COVID-19 на пациентов и пропускной способности больниц. Архивировано 8 марта 2021 г. в Wayback Machine.	Состояние	Нет	Нет	Нет	Нет	Да	Нет	Нет	Нет
Сообщения о влиянии COVID-19 на пациентов и пропускной способности больниц по государственным временным сериям. Архивировано 10 марта 2021 г. в Wayback Machine.	Состояние	Да	Нет	Нет	Нет	Да	Нет	Нет	Нет

Глобальный

Ресурсный центр Джона Хопкинса по коронавирусу: глобальные агрегированные данные, включая случаи, тестирование, отслеживание контактов и разработку вакцин. ^{[ 12 ]}
Информационная панель Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ) по коронавирусным заболеваниям: база данных подтвержденных случаев и смертей, зарегистрированных во всем мире с разбивкой по регионам. ^{[ 13 ]} Эта база данных является частью Платформы данных здравоохранения ВОЗ. ^{[ 14 ]}
Проект открытых данных о COVID-19 в Африке: управляемая волонтерами база данных и информационная панель, сообщающая о регионе, количестве случаев заболевания на уровне страны и района, смертности, инфекциях среди медицинских работников, медицинских услугах и неотложных потребностях. ^{[ 15 ]}

Центры данных

Health Data Research UK предоставляет доступный для поиска реестр ресурсов медицинских данных из Соединенного Королевства, включая наборы данных, связанные с COVID-19 .
Наборы данных открытого доступа NIH: Национальные институты здравоохранения предоставляют данные и вычислительные ресурсы открытого доступа, связанные с COVID-19. ^{[ 16 ]}
Набор данных открытых исследований COVID-19 (CORD-19): проект Semantic Scholar Института ИИ Аллена размещает CORD-19, общедоступный набор данных научных статей о COVID-19 и связанных с ним исследованиях. ^{[ 17 ]} Набор данных обновляется ежедневно и включает в себя как рецензируемые статьи, так и препринты. ^{[ 18 ]} CORD-19 был первоначально выпущен 16 марта 2020 года исследователями и руководителями Института искусственного интеллекта Аллена, Инициативы Чана Цукерберга , Центра безопасности и новых технологий Джорджтаунского университета , Microsoft и Национальной медицинской библиотеки . ^{[ 19 ]} Набор данных создается с помощью анализа текста текущей исследовательской литературы. ^{[ 20 ]}

Ресурсы по конкретным темам и интересам

Геномика

Согласованные данные о геноме SARS-CoV-2 доступны через GISAID для зарегистрированных пользователей. ^{[ 21 ]} и включен в интерактивную филогенетического дерева . информационную панель ^{[ 22 ]} в Nextstrain патогенов с открытым исходным кодом , проекте данных о геноме . ^{[ 23 ]}

Визуализация (радиология)

Характерные особенности визуализации на рентгенограммах грудной клетки и компьютерной томографии (КТ) у людей с симптомами включают асимметричные периферические помутнения по типу «матового стекла» без плеврального выпота . ^{[ 24 ]} В марте Университет Монреаля и Милы создали «Коллекцию данных изображений COVID-19», которая является общедоступным хранилищем данных изображений грудной клетки. ^{[ 25 ]}^{[ 26 ]}^{[ 27 ]} Банк данных медицинской визуализации Валенсийского региона опубликовал большой набор данных изображений грудной клетки из Испании. ^{[ 28 ]}^{[ 29 ]} Итальянское радиологическое общество собирает международную онлайн-базу данных результатов визуализации подтвержденных случаев. ^{[ 30 ]} Онлайн-платформы для обмена радиологическими случаями, такие как Eurorad и Radiopaedia, служат платформами для обмена данными о случаях заболевания COVID-19 и изображениями. ^{[ 31 ]}^{[ 32 ]}

Ссылки

^ Торпи, Холли; Кабальеро, доктор медицинских наук, Хорхе А. (ред.). «Данные о местах тестирования на COVID-19» . ГИСКорп/программисты против данных с мест тестирования на COVID . Проверено 14 декабря 2020 г.
^ «Группа волонтеров разрабатывает базу данных мест тестирования на COVID-19 в США» TechCrunch . Проверено 3 февраля 2021 г.
^ «Приложение недели: Поиск мест тестирования на COVID-19» . Федеральное агентство по чрезвычайным ситуациям (FEMA) . Проверено 3 февраля 2021 г.
^ «Площадки тестирования на Covid-19 в Калифорнии» . www.arcgis.com . Проверено 3 февраля 2021 г.
^ «Случаи и смерти от коронавируса в США» . USAFacts.org . 03 февраля 2021 г. Проверено 3 февраля 2021 г.
^ «Подробная методология и источники: данные о COVID-19» . СШАФакты . Проверено 3 февраля 2021 г.
^ «Статистика и данные о вспышках коронавируса» . СШАФакты . Проверено 3 февраля 2021 г.
^ Стивенс, Осень (21 августа 2020 г.). «Следящая звезда в Окленде» . Журнал Диабло . Проверено 18 сентября 2020 г.
^ "О нас" . Проект отслеживания COVID . Проверено 3 февраля 2021 г.
^ Ахмад, Кашиф (2021). «Эталонный набор данных для анализа настроений отзывов пользователей о приложениях для отслеживания контактов с COVID-19» . Гарвардская вселенная данных. дои : 10.7910/DVN/1RDRCM . {{cite journal}}: Для цитирования журнала требуется |journal= ( помощь )
^ Ахмад, Кашиф (2021). «Анализ настроений отзывов пользователей о приложениях для отслеживания контактов с COVID-19 с использованием эталонного набора данных». arXiv : 2103.01196 [ cs.CL ].
^ "Дом" . Ресурсный центр Джона Хопкинса по коронавирусу . Проверено 18 сентября 2020 г.
^ «Информационная панель ВОЗ по коронавирусному заболеванию (COVID-19)» . covid19.who.int . Проверено 18 сентября 2020 г.
^ «Всемирная платформа данных здравоохранения – ВОЗ» . www.who.int . Проверено 18 сентября 2020 г.
^ «Открытые данные о COVID-19 в Африке» . Проверено 16 ноября 2020 г.
^ «Данные открытого доступа и вычислительные ресурсы для борьбы с COVID-19 | Наука о данных в Национальном институте здравоохранения» . datascience.nih.gov . Проверено 13 октября 2020 г.
^ «КОРД-19» . Семантический учёный . Проверено 13 октября 2020 г.
^ «Анализ публикаций о COVID-19 выявляет пробелы в исследованиях» . ЭврекАлерт! . Проверено 13 октября 2020 г.
^ «Призыв к действию к техническому сообществу в отношении нового машиночитаемого набора данных о COVID-19» . Белый дом . Проверено 13 октября 2020 г. - из Национального архива .
^ «NLM использует данные и анализ текста для совершенствования баз данных исследований COVID-19» . Governmentciomedia.com . 11 мая 2020 г. Проверено 13 октября 2020 г.
^ «ГИСАИД» . www.gisaid.org . Проверено 29 декабря 2020 г. .
^ «Информационная панель Nexstrain SARS-CoV-2» . nextstrain.org . Проверено 29 декабря 2020 г. .
^ «Некстстрейн» . docs.nextstrain.org . Проверено 29 декабря 2020 г. .
^ Ли Ю, Ся Л (март 2020 г.). «Коронавирусная болезнь 2019 (COVID-19): роль КТ грудной клетки в диагностике и лечении» . Американский журнал рентгенологии . 214 (6): 1280–1286. дои : 10.2214/AJR.20.22954 . ПМИД 32130038 . S2CID 212416282 .
^ «Проекты, связанные с COVID-19» . Мила . Сбор данных изображений COVID-19 . Проверено 12 июля 2020 г.
^ «Сбор данных изображений COVID-19» . Гитхаб . Проверено 12 июля 2020 г.
^ Коэн, Джозеф (25 марта 2020 г.). «Сбор данных изображений COVID-19». arXiv : 2003.11597 [ eess.IV ].
^ «BIMCV-COVID19, Наборы данных, относящиеся к течению патологии COVID19» . Банк данных медицинских изображений в Валенсийском регионе . Проверено 12 июля 2020 г.
^ де ла Иглесиа Вайя, Мария (1 июня 2020 г.). «BIMCV COVID-19+: большой аннотированный набор данных RX и КТ-изображений пациентов с COVID-19». arXiv : 2006.01174 [ eess.IV ].
^ «База данных по COVID-19» . Итальянское общество медицинской и интервенционной радиологии (на итальянском языке) . Проверено 11 марта 2020 г.
^ «Пневмоторакс и пневмомедиастинум: редкое осложнение в развитии пневмонии, вызванной COVID-19» . Еврорад . Проверено 12 июля 2020 г.
^ Белл, Дэниел; Найп, Генри. «COVID-19 (краткое содержание)» . Радиопедия . Проверено 12 июля 2020 г.

[1] Торпи, Холли; Кабальеро, доктор медицинских наук, Хорхе А. (ред.). «Данные о местах тестирования на COVID-19» . ГИСКорп/программисты против данных с мест тестирования на COVID . Проверено 14 декабря 2020 г.

[2] «Группа волонтеров разрабатывает базу данных мест тестирования на COVID-19 в США» TechCrunch . Проверено 3 февраля 2021 г.

[3] «Приложение недели: Поиск мест тестирования на COVID-19» . Федеральное агентство по чрезвычайным ситуациям (FEMA) . Проверено 3 февраля 2021 г.

[4] «Площадки тестирования на Covid-19 в Калифорнии» . www.arcgis.com . Проверено 3 февраля 2021 г.

[5] «Случаи и смерти от коронавируса в США» . USAFacts.org . 03 февраля 2021 г. Проверено 3 февраля 2021 г.

[6] «Подробная методология и источники: данные о COVID-19» . СШАФакты . Проверено 3 февраля 2021 г.

[7] «Статистика и данные о вспышках коронавируса» . СШАФакты . Проверено 3 февраля 2021 г.

[8] Стивенс, Осень (21 августа 2020 г.). «Следящая звезда в Окленде» . Журнал Диабло . Проверено 18 сентября 2020 г.

[9] "О нас" . Проект отслеживания COVID . Проверено 3 февраля 2021 г.

[10] Ахмад, Кашиф (2021). «Эталонный набор данных для анализа настроений отзывов пользователей о приложениях для отслеживания контактов с COVID-19» . Гарвардская вселенная данных. дои : 10.7910/DVN/1RDRCM . {{cite journal}}: Для цитирования журнала требуется |journal= ( помощь )

[11] Ахмад, Кашиф (2021). «Анализ настроений отзывов пользователей о приложениях для отслеживания контактов с COVID-19 с использованием эталонного набора данных». arXiv : 2103.01196 [ cs.CL ].

[12] "Дом" . Ресурсный центр Джона Хопкинса по коронавирусу . Проверено 18 сентября 2020 г.

[13] «Информационная панель ВОЗ по коронавирусному заболеванию (COVID-19)» . covid19.who.int . Проверено 18 сентября 2020 г.

[14] «Всемирная платформа данных здравоохранения – ВОЗ» . www.who.int . Проверено 18 сентября 2020 г.

[15] «Открытые данные о COVID-19 в Африке» . Проверено 16 ноября 2020 г.

[16] «Данные открытого доступа и вычислительные ресурсы для борьбы с COVID-19 | Наука о данных в Национальном институте здравоохранения» . datascience.nih.gov . Проверено 13 октября 2020 г.

[17] «КОРД-19» . Семантический учёный . Проверено 13 октября 2020 г.

[18] «Анализ публикаций о COVID-19 выявляет пробелы в исследованиях» . ЭврекАлерт! . Проверено 13 октября 2020 г.

[19] «Призыв к действию к техническому сообществу в отношении нового машиночитаемого набора данных о COVID-19» . Белый дом . Проверено 13 октября 2020 г. - из Национального архива .

[20] «NLM использует данные и анализ текста для совершенствования баз данных исследований COVID-19» . Governmentciomedia.com . 11 мая 2020 г. Проверено 13 октября 2020 г.

[21] «ГИСАИД» . www.gisaid.org . Проверено 29 декабря 2020 г. .

[Nexstrain_SARS-CoV-2-22] «Информационная панель Nexstrain SARS-CoV-2» . nextstrain.org . Проверено 29 декабря 2020 г. .

[23] «Некстстрейн» . docs.nextstrain.org . Проверено 29 декабря 2020 г. .

[AJR-24] Ли Ю, Ся Л (март 2020 г.). «Коронавирусная болезнь 2019 (COVID-19): роль КТ грудной клетки в диагностике и лечении» . Американский журнал рентгенологии . 214 (6): 1280–1286. дои : 10.2214/AJR.20.22954 . ПМИД 32130038 . S2CID 212416282 .

[mila-covid-25] «Проекты, связанные с COVID-19» . Мила . Сбор данных изображений COVID-19 . Проверено 12 июля 2020 г.

[covid-image-github-26] «Сбор данных изображений COVID-19» . Гитхаб . Проверено 12 июля 2020 г.

[covid-image-arxiv-27] Коэн, Джозеф (25 марта 2020 г.). «Сбор данных изображений COVID-19». arXiv : 2003.11597 [ eess.IV ].

[BIMCV-COVID19-28] «BIMCV-COVID19, Наборы данных, относящиеся к течению патологии COVID19» . Банк данных медицинских изображений в Валенсийском регионе . Проверено 12 июля 2020 г.

[29] де ла Иглесиа Вайя, Мария (1 июня 2020 г.). «BIMCV COVID-19+: большой аннотированный набор данных RX и КТ-изображений пациентов с COVID-19». arXiv : 2006.01174 [ eess.IV ].

[Cx70C-30] «База данных по COVID-19» . Итальянское общество медицинской и интервенционной радиологии (на итальянском языке) . Проверено 11 марта 2020 г.

[31] «Пневмоторакс и пневмомедиастинум: редкое осложнение в развитии пневмонии, вызванной COVID-19» . Еврорад . Проверено 12 июля 2020 г.

[radiopaedia-covid-32] Белл, Дэниел; Найп, Генри. «COVID-19 (краткое содержание)» . Радиопедия . Проверено 12 июля 2020 г.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

[ 26 ]

[ 27 ]

[ 28 ]

[ 29 ]

[ 30 ]

[ 31 ]

[ 32 ]