Вариант SARS-CoV-2 Йота
| Часть серии о |
| COVID-19 пандемия |
|---|
 |
|
 Портал COVID-19 |
Йота вариант , [1] также известный как линия B.1.526 , является одним из SARS вариантов -CoV-2 , вируса, вызывающего COVID-19 . Впервые он был обнаружен в Нью-Йорке в ноябре 2020 года. Вариант появился с двумя заметными мутациями: шиповой мутацией E484K, которая может помочь вирусу уклоняться от антител, и мутацией S477N, которая помогает вирусу более прочно связываться с клетками человека. [2]
К февралю 2021 года он быстро распространился в регионе Нью-Йорка и составлял примерно одну из четырех вирусных последовательностей. [3] [4] К 11 апреля 2021 года этот вариант был обнаружен как минимум в 48 штатах США и 18 странах. [5] [6]
В соответствии с упрощенной схемой наименования, предложенной Всемирной организацией здравоохранения , B.1.526 был помечен как вариант Iota и считается вариантом, представляющим интерес (VOI), но еще не вариантом, вызывающим беспокойство . [7]
Мутации [ править ]
Геном Йоты (B.1.526) содержит следующие аминокислотные мутации, все из которых находятся в коде шиповидного белка вируса : L5F, T95I, D253G, E484K, D614G и A701V. [8]
![Аминокислотные мутации варианта Йота SARS-CoV-2 нанесены на карту генома SARS-CoV-2 с акцентом на спайк.[9]](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/32/SARS-CoV-2_Iota_variant.svg/3658px-SARS-CoV-2_Iota_variant.svg.png)
Аминокислотные мутации варианта SARS-CoV-2 Йота нанесены на карту генома SARS-CoV-2 с акцентом на спайк. [9]
![Аминокислотные мутации варианта Йота SARS-CoV-2 нанесены на карту генома SARS-CoV-2 с акцентом на спайк.[9]](http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/32/SARS-CoV-2_Iota_variant.svg/3658px-SARS-CoV-2_Iota_variant.svg.png)
История [ править ]
Увеличение числа вариантов Йоты было зафиксировано исследователями из Калифорнийского технологического института путем сканирования мутаций в базе данных, известной как GISAID , глобальной научной инициативе, которая задокументировала более 700 000 геномных последовательностей SARS-CoV-2. [10] [11]
Доля случаев в США, представленных вариантом Йота, резко снизилась к концу июля 2021 года, поскольку вариант Дельта стал доминирующим. [12]
Статистика [ править ]
| Страна | Подтвержденные случаи [заболевания | Последний зарегистрированный случай |
|---|---|---|
 олень | 45,985 | 24 июня 2021 г. |
 Эквадор | 168 | 10 июня 2021 г. |
 Канада | 158 | |
 Испания | 119 | 17 июня 2021 г. |
 Колумбия | 115 | 24 мая 2021 г. |
 Аруба | 103 | 10 июня 2021 г. |
 Германия | 56 | 22 июня 2021 г. |
 Мексика | 50 | 11 июня 2021 г. |
 Великобритания | 43 | 16 мая 2021 г. |
 Синт-Мартен | 17 | 27 мая 2021 г. |
 Ирландия | 13 | 7 мая 2021 г. |
 Швейцария | 12 | 17 мая 2021 г. |
 Чили | 11 | 12 мая 2021 г. |
 Дания | 9 | 31 мая 2021 г. |
 Израиль | 9 | 26 апреля 2021 г. |
 Суринам | 9 | 10 мая 2021 г. |
 Аргентина | 8 | 26 апреля 2021 г. |
 Бельгия | 8 | 18 апреля 2021 г. |
 Доминиканская Республика | 8 | 10 июня 2021 г. |
 Франция | 8 | 25 мая 2021 г. |
 Литва | 8 | 28 мая 2021 г. |
 Сингапур | 7 | 4 апреля 2021 г. |
 Австралия | 6 | 21 мая 2021 г. |
 Италия | 6 | 4 мая 2021 г. |
 Люксембург | 6 | 5 марта 2021 г. |
 Коста-Рика | 5 | 21 мая 2021 г. |
 Нидерланды | 5 | 19 апреля 2021 г. |
 Россия | 5 | 4 июня 2021 г. |
 Хорватия | 4 | 9 февраля 2021 г. |
 Япония | 4 | 7 мая 2021 г. |
 Южная Корея | 4 | 14 апреля 2021 г. |
 Швеция | 4 | 14 мая 2021 г. |
 Турция | 4 | 4 мая 2021 г. |
 Мальта | 4 | 21 декабря 2020 г. |
 Индия | 3 | 24 марта 2021 г. |
 Доминика | 3 | 15 января 2021 г. |
 Словения | 3 | 18 мая 2021 г. |
 Австрия | 2 | 22 апреля 2021 г. |
 Гана | 2 | 20 марта 2021 г. |
 Гренада | 2 | 17 января 2021 г. |
 Индонезия | 2 | 8 января 2021 г. |
 Ямайка | 2 | 2 февраля 2021 г. |
 Либерия | 2 | 14 мая 2021 г. |
 Португалия | 2 | 4 марта 2021 г. |
 Румыния | 2 | 17 апреля 2021 г. |
 Ангилья | 1 | 21 апреля 2021 г. |
 Антигуа и Барбуда | 1 | 3 мая 2021 г. |
 Британские Виргинские острова | 1 | 25 января 2021 г. |
 Каймановы острова | 1 | 15 апреля 2021 г. |
 Китай | 1 | |
 Кюрасао | 1 | 30 апреля 2021 г. |
 Финляндия | 1 | 14 марта 2021 г. |
| Гваделупа | 1 | 9 марта 2021 г. |
 Новая Зеландия | 1 | 16 марта 2021 г. |
 Польша | 1 | 31 марта 2021 г. |
 Острова Тёркс и Кайкос | 1 | 22 марта 2021 г. |
 Венесуэла | 1 | 8 мая 2021 г. |
| Мир (57 стран) | Итого: 46 589 | Итого по состоянию на 11 августа 2021 г. |
См. также [ править ]
- Варианты SARS-CoV-2 : Альфа , Бета , Гамма , Дельта , Эпсилон , Зета , Эта , Тета , Каппа , Лямбда , Мю , Омикрон.
Ссылки [ править ]
- ^ «Отслеживание вариантов SARS-CoV-2» . www.who.int . Проверено 1 июня 2021 г.
- ^ Бартон, Майкл I; Макгоуэн, Стюарт А; Кутузов Михаил А; Душек, Омер; Бартон, Джеффри Джон; ван дер Мерве, П. Антон (26 августа 2021 г.). Фушье, Рон AM; Ван дер Меер, Йос В.; Фушье, Рон А.М. (ред.). «Влияние общих мутаций в SARS-CoV-2 Spike RBD и его лиганде, рецепторе ACE2 человека, на аффинность связывания и кинетику» . электронная жизнь . 10 : е70658. дои : 10.7554/eLife.70658 . ISSN 2050-084X . ПМЦ 8480977 . ПМИД 34435953 .
- ^ Роза-Акино, Мэтт Стиб, Паола (21 марта 2021 г.). «Все, что мы знаем о распространении варианта коронавируса в Нью-Йорке» . Интеллигент . Проверено 10 апреля 2021 г.
{{cite web}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Мандавилли, Апурва (24 февраля 2021 г.). «Новый вариант коронавируса распространяется в Нью-Йорке, сообщают исследователи» . Нью-Йорк Таймс . ISSN 0362-4331 . Проверено 10 апреля 2021 г.
- ^ «outbreak.info» . вспышка.информация . Проверено 10 апреля 2021 г.
- ^ «Линии ПАНГО Lineage B.1.526» . cov-lineages.org . 22 апреля 2021 года. Архивировано из оригинала 22 апреля 2021 года . Проверено 22 апреля 2021 г.
- ^ «Отслеживание вариантов SARS-CoV-2» . www.who.int . Проверено 1 июня 2021 г.
- ^ «Классификации и определения вариантов SARS-CoV-2» . CDC.gov . Центры по контролю и профилактике заболеваний. 11 февраля 2020 г. . Проверено 5 июля 2021 г.
- ^ «Варианты шипов: вариант Йоты, он же B.1.526» . covdb.stanford.edu . База данных Стэнфордского университета по противовирусным препаратам и резистентности к коронавирусу. 1 июля 2021 г. . Проверено 5 июля 2021 г.
- ^ Корум, Джонатан; Циммер, Карл (9 февраля 2021 г.). «Варианты и мутации коронавируса» . Нью-Йорк Таймс . ISSN 0362-4331 . Проверено 10 апреля 2021 г.
- ^ Уэст, Энтони П.; Барнс, Кристофер О.; Ян, Чжи; Бьоркман, Памела Дж. (23 февраля 2021 г.). «Линия SARS-CoV-2 B.1.526, появившаяся в регионе Нью-Йорка, обнаружена с помощью программной утилиты, созданной для исследования ландшафта пиковых мутаций» . bioRxiv : 2021.02.14.431043. дои : 10.1101/2021.02.14.431043 . ПМК 8077570 . ПМИД 33907745 . S2CID 231981267 .
- ^ Последовательности SARS-CoV-2 по вариантам, 26 июля 2021 г., США. Наш мир в данных.
- ^ «GISAID – Варианты hCov19» . www.gisaid.org . Проверено 2 июля 2021 г.