Тета-вариант SARS-CoV-2
| Часть серии о |
| COVID-19 пандемия |
|---|
 |
|
 Портал COVID-19 |
Тета-вариант , также известный как линия P.3 , [а] является одним из SARS вариантов -CoV-2 , вируса, вызывающего COVID-19 . Вариант был впервые идентифицирован на Филиппинах 18 февраля 2021 года, когда на Центральных Висайских островах были обнаружены две вызывающие беспокойство мутации . [1] Он был обнаружен в Японии 12 марта 2021 года, когда путешественник из Филиппин прибыл в международный аэропорт Нарита в Токио . [2]
Он отличается от тех, которые были впервые обнаружены в Великобритании, Южной Африке и Бразилии, и считается, что он представляет аналогичную угрозу. Этот вариант более устойчив к нейтрализующим антителам , в том числе полученным в результате вакцинации, как, например, южноафриканский и бразильский варианты. [3]
В соответствии с упрощенной схемой наименования, предложенной Всемирной организацией здравоохранения , P.3 был помечен как вариант Theta и считался вариантом, представляющим интерес (VOI), но не вариантом, вызывающим беспокойство . [4]
По состоянию на июль 2021 года Тета больше не рассматривается ВОЗ как вариант, представляющий интерес. [4]
Классификация
Мы
17 марта 2021 года Служба общественного здравоохранения Англии (PHE) назвала Lineage P.3 VUI-21MAR-02 . [5]
1 июня 2021 года Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ) назвала линию P.3 вариантом Тета. [6]
Мутации
![Аминокислотные мутации тета-варианта SARS-CoV-2 нанесены на карту генома SARS-CoV-2 с акцентом на спайк.[7]](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/4b/SARS-CoV-2_Theta_variant.svg/3658px-SARS-CoV-2_Theta_variant.svg.png)
Аминокислотные мутации тета-варианта SARS-CoV-2 нанесены на карту генома SARS-CoV-2 с акцентом на спайк. [7]
![Аминокислотные мутации тета-варианта SARS-CoV-2 нанесены на карту генома SARS-CoV-2 с акцентом на спайк.[7]](http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/4b/SARS-CoV-2_Theta_variant.svg/3658px-SARS-CoV-2_Theta_variant.svg.png)
Всего во всех образцах наблюдалось 14 замен аминокислот (отмечено красным ниже), включая семь мутаций шиповидных белков . Среди мутаций белка-шипа четыре ранее были связаны с вызывающими беспокойство линиями (т.е. E484K, N501Y, D614G и P681H), тогда как три дополнительные замены наблюдались в направлении C-концевой области белка (т.е. E1092K, H1101Y и P681H). В1176Ф). Во всех образцах также была обнаружена замена одной аминокислоты на N-конце ORF8 (т.е. K2Q). Три другие мутации были обнаружены в 32 из 33 образцов (отмечены зеленым ), включая делецию трех аминокислот в положениях белка-шипа от 141 до 143. Наконец, пять синонимичных мутаций (отмечены серым во всех случаях также были обнаружены ). . [8]
История
18 февраля 2021 года Министерство здравоохранения Филиппин после подтвердило обнаружение двух мутаций COVID-19 на Центральных Висайских островах того, как образцы от пациентов были отправлены на секвенирование генома. Позже мутации были названы E484K и N501Y, которые были обнаружены в 37 из 50 образцов, причем обе мутации одновременно встречались в 29 из них. Официальных названий вариантов не было, и полная последовательность еще не была определена. [1]
12 марта 2021 года Япония обнаружила этот вариант у путешественника с Филиппин. [2]
13 марта 2021 года Министерство здравоохранения подтвердило, что мутации представляют собой новый вариант, получивший обозначение линии P.3. В тот же день он также подтвердил свой первый случай заражения линией P.1 в стране. Хотя линии P.1 и P.3 происходят от одной и той же линии B.1.1.28, в департаменте заявили, что влияние линии P.3 на эффективность и трансмиссивность вакцины еще предстоит выяснить. [10]
17 марта 2021 года Великобритания подтвердила свои первые два случая, где Министерство здравоохранения Англии (PHE) назвало его VUI-21MAR-02. [11]
30 апреля 2021 г. Малайзия выявила 8 случаев линии P.3 в Сараваке . [12]
Статистика
| Страна | ЯЩЕР [13] | outbreak.info [9] | Регенерон [14] | Другие источники |
|---|---|---|---|---|
 Филиппины | 455 | 513 | 516 | 461 [15] |
 олень | 17 | 20 | 17 | |
 Германия | 11 | 11 | 11 | |
 Малайзия | 10 | 10 | 10 | 13 [16] |
 Великобритания | 9 | 9 | 9 | 10 [17] |
 Япония | 7 | 8 | 8 | |
 Нидерланды | 7 | 7 | 7 | 4 [18] |
 Канада | 5 | 5 | 5 | |
 Австралия | 3 | 3 | 4 | |
 Бельгия | 3 | 3 | 3 | |
 Китай [б] | 3 | 14 | 14 | |
 Гуам | 3 | – | 3 | |
 Новая Зеландия | 3 | 3 | 3 | |
 Норвегия | 3 | 3 | 3 | |
 Сингапур | 3 | 3 | 3 | |
 Ангола | 2 | 2 | 2 | |
 Южная Корея | 2 | 2 | 2 | |
 Швеция | 2 | 2 | 2 | |
 Бразилия | 1 | 1 | 1 | |
 Финляндия | 1 | 1 | 1 | |
| Общий | 550 | 620 | 624 | 488 |
См. также
- Пандемия COVID-19 на Филиппинах
- Варианты SARS-CoV-2 : Альфа , Бета , Гамма , Дельта , Эпсилон , Зета , Эта , Йота , Каппа , Лямбда , Мю , Омикрон.
Примечания
Ссылки
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б Новости, CNN Филиппины (18 февраля 2021 г.). «Министерство здравоохранения подтверждает новые мутации COVID-19 в Центральных Висайских островах» . Архивировано из оригинала 26 ноября 2021 года . Проверено 2 мая 2021 г.
{{cite news}}:|last=имеет общее имя ( справка ) - ^ Jump up to: Перейти обратно: а б Новости, Киодо (12 марта 2021 г.). «Новый вариант коронавируса обнаружен у путешественника из Филиппин: Япония» . Проверено 2 мая 2021 г.
{{cite news}}:|last=имеет общее имя ( справка ) - ^ Новости, Japan Times (12 марта 2021 г.). «Японские власти обнаружили новый вариант коронавируса у путешественника из Филиппин» . Архивировано из оригинала 4 мая 2021 года . Проверено 2 мая 2021 г.
{{cite news}}:|last=имеет общее имя ( справка ) - ^ Jump up to: Перейти обратно: а б «Отслеживание вариантов SARS-CoV-2» . кто.инт . Всемирная организация здравоохранения.
- ^ «Варианты: распределение данных случаев» . gov.uk. Государственная цифровая служба .
- ^ «Отслеживание вариантов SARS-CoV-2» . 1 июня 2021 г. Проверено 1 июня 2021 г.
- ^ «Варианты с шипами: вариант Тета, он же B.1.128» . covdb.stanford.edu . База данных Стэнфордского университета по противовирусным препаратам и резистентности к коронавирусу. 1 июля 2021 г. Проверено 5 июля 2021 г.
- ^ Центр, Филиппинский геном. «Бюллетень PGC SARS-CoV-2 № 7: Обнаружение и характеристика новой линии SARS-CoV-2 P.3 с мутациями шиповых белков E484K, N501Y, P681H и делецией LGV 141–143, из образцов, секвенированных с помощью усиленного метода. Программа бионадзора UP-PGC, UP-NIH и DOH» . Филиппинский геномный центр .
- ^ Jump up to: Перейти обратно: а б «Отчет о происхождении P.3» . вспышка.информация .
- ^ Новости, ABS-CBN (13 марта 2021 г.). «Министерство здравоохранения подтверждает новый вариант COVID-19, впервые обнаруженный при ЛГ, первый случай бразильского варианта» . Проверено 2 мая 2021 г.
{{cite news}}:|last=имеет общее имя ( справка ) - ^ Новости, Rappler (17 марта 2021 г.). «Англия сообщает о двух случаях нового варианта COVID-19, обнаруженного на Филиппинах» . Проверено 2 мая 2021 г.
{{cite news}}:|last=имеет общее имя ( справка ) - ^ «Covid-19: Саравак обнаруживает вариант, зарегистрированный на Филиппинах» . 30 апреля 2021 г. Проверено 30 апреля 2021 г.
- ^ «Линии ПАНГО» . cov-lineages.org . Архивировано из оригинала 5 мая 2021 г. Проверено 2 мая 2021 г.
- ^ «Панель мониторинга Regeneron COVID-19» . covid19dashboard.regeneron.com . Проверено 27 августа 2021 г.
- ^ Лопес, Вирджил (29 сентября 2021 г.). «Министерство здравоохранения выявило еще 339 случаев варианта Дельта» . Новости ГМА . Проверено 1 октября 2021 г.
- ^ Пей Пей, Го (8 июля 2021 г.). «Вариант Дельта обнаружен в Сараваке» . Проверено 13 июля 2021 г.
По его словам, что касается варианта Тета, шесть случаев были выявлены в Кучинге и семь в Кота-Самарахане.
- ^ «Варианты: распространение данных о случаях, 13 августа 2021 года» . 13 августа 2021 г. . Проверено 13 августа 2021 г.
- ^ «Варианты в Нидерландах» . rivm.nl. Проверено 16 июля 2021 г.
Внешние ссылки
- Линии PANGO: Новый вариант отчета - Отчет о глобальном распространении линии B.1.1.7
- База данных секвенирования GISAID – отслеживание вариантов COVID-19
