Jump to content

ВИЧ

Это хорошая статья. Нажмите здесь для получения дополнительной информации.
Страница полузащищена
(Перенаправлено с антител к ВИЧ )

Вирусы иммунодефицита человека
Сканирующая электронная микрофотография ВИЧ-1 (зеленого цвета), отпочковавшегося из культивированного лимфоцита. Множественные округлые выступы на поверхности клеток представляют собой места сборки и отпочкования вирионов.
Сканирующая электронная микрофотография ВИЧ-1 (зеленого цвета), отпочковавшегося из культивированного лимфоцита . Множественные округлые выступы на поверхности клеток представляют собой места сборки и отпочкования вирионов.
Научная классификация Изменить эту классификацию
(без рейтинга): Вирус
Область : Рибовирия
Королевство: Паранавиры
Тип: Артвервирикота
Сорт: Ревтравирицеты
Заказ: Ортервирусы
Семья: Ретровирусиды
Подсемейство: Орторетровирины
Род: Лентивирус
Группы включены
Другие лентивирусы

Вирусы иммунодефицита человека ( ВИЧ ) представляют собой два вида лентивирусов (подгруппа ретровирусов ), которые заражают человека. Со временем они вызывают синдром приобретенного иммунодефицита (СПИД). [ 1 ] [ 2 ] состояние, при котором прогрессирующий отказ иммунной системы опасных для жизни оппортунистических инфекций и рака . приводит к развитию [ 3 ] Без лечения среднее время выживания после заражения ВИЧ оценивается в 9–11 лет, в зависимости от подтипа ВИЧ . [ 4 ]

В большинстве случаев ВИЧ является инфекцией, передающейся половым путем , и возникает при контакте или передаче крови , предэякулята , спермы и вагинальных выделений . [ 5 ] [ 6 ] Неполовым путем передача инфекции может произойти от инфицированной матери ее ребенку во время беременности , во время родов при контакте с ее кровью или вагинальной жидкостью, а также через грудное молоко . [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ] В этих жидкостях организма ВИЧ присутствует как в виде свободных вирусных частиц, так и в виде вируса внутри инфицированных иммунных клеток . Исследования показали (как для однополых, так и для разнополых пар), что ВИЧ не заразен во время полового акта без презерватива, если у ВИЧ-положительного партнера постоянно неопределяемая вирусная нагрузка . [ 5 ] [ 6 ]

ВИЧ инфицирует жизненно важные клетки иммунной системы человека, такие как Т-хелперы (в частности, CD4 + Т-клетки), макрофаги и дендритные клетки . [ 11 ] ВИЧ-инфекция приводит к снижению уровня CD4 + Т-клетки посредством ряда механизмов, включая пироптоз абортивно инфицированных Т-клеток, [ 12 ] апоптоз неинфицированных клеток-свидетелей, [ 13 ] прямое вирусное уничтожение инфицированных клеток и уничтожение инфицированного CD4 + Т-клетки CD8 + цитотоксические лимфоциты , распознающие инфицированные клетки. [ 14 ] Когда CD4 + Количество Т-клеток снижается ниже критического уровня, клеточный иммунитет теряется, и организм становится все более восприимчивым к оппортунистическим инфекциям, что приводит к развитию СПИДа.

Вирусология

Сравнение видов ВИЧ
Разновидность Вирулентность Инфекционность Распространенность Предполагаемое происхождение
ВИЧ-1 Высокий Высокий Глобальный Обыкновенный шимпанзе
ВИЧ-2 Ниже Низкий Западная Африка Закопченный мангабей

Классификация

ВИЧ относится к роду Lentivirus . [ 15 ] часть семейства Retroviridae . [ 16 ] Лентивирусы имеют много морфологических и биологических общих свойств. Многие виды заражены лентивирусами, которые обычно вызывают длительные заболевания с длительным инкубационным периодом . [ 17 ] Лентивирусы передаются в виде одноцепочечных положительной оболочкой РНК- содержащих с вирусов . При попадании в клетку-мишень вирусной РНК геном преобразуется (обратно транскрибируется) в двухцепочечную ДНК с помощью кодируемого вирусом фермента обратной транскриптазы , который транспортируется вместе с вирусным геномом в вирусной частице. Полученная вирусная ДНК затем импортируется в ядро ​​клетки и интегрируется в клеточную ДНК с помощью кодируемого вирусом фермента интегразы и кофакторов хозяина . [ 18 ] После интеграции вирус может стать латентным , позволяя вирусу и его клетке-хозяину избегать обнаружения иммунной системой в течение неопределенного периода времени. [ 19 ] Вирус может оставаться в спящем состоянии в организме человека до десяти лет после первичного заражения; в этот период вирус не вызывает симптомов. Альтернативно, интегрированная вирусная ДНК может быть транскрибирована , производя новые геномы РНК и вирусные белки, используя ресурсы клетки-хозяина, которые упаковываются и высвобождаются из клетки в виде новых вирусных частиц, которые начинают цикл репликации заново.

Охарактеризованы два типа ВИЧ: ВИЧ-1 и ВИЧ-2. ВИЧ-1 — это вирус, который был первоначально обнаружен и назван как вирусом, ассоциированным с лимфаденопатией (LAV), так и Т-лимфотропным вирусом человека 3 (HTLV-III). ВИЧ-1 более вирулентен и заразен , чем ВИЧ-2. [ 20 ] и является причиной большинства случаев ВИЧ-инфекции во всем мире. Более низкая инфекционность ВИЧ-2 по сравнению с ВИЧ-1 означает, что за один контакт заразится меньше людей, подвергшихся воздействию ВИЧ-2. Из-за относительно низкой способности передачи ВИЧ-2 в основном ограничивается Западной Африкой . [ 21 ]

Структура и геном

Схема вириона ВИЧ

ВИЧ по структуре похож на другие ретровирусы. Он примерно сферический [ 22 ] диаметром около 120 нм , что примерно в 100 000 раз меньше по объему, чем эритроцит . [ 23 ] Он состоит из двух копий с положительным смыслом одноцепочечной РНК вируса, , кодирующей девять генов заключенных в конический капсид, состоящий из 2000 копий вирусного белка p24 . [ 24 ] Одноцепочечная РНК прочно связана с белками нуклеокапсида p7 и ферментами, необходимыми для развития вириона, такими как обратная транскриптаза , протеазы , рибонуклеаза и интеграза . Матрица, состоящая из вирусного белка p17, окружает капсид, обеспечивая целостность частицы вириона. [ 24 ]

Он, в свою очередь, окружен вирусной оболочкой , которая состоит из липидного бислоя, взятого из мембраны клетки-хозяина человека, когда вновь образованные вирусные частицы отпочковываются от клетки. Вирусная оболочка содержит белки клетки-хозяина и относительно небольшое количество копий белка оболочки ВИЧ. [ 24 ] который состоит из колпачка, состоящего из трех молекул, известных как гликопротеин (gp) 120 , и стебля, состоящего из трех молекул gp41 , которые закрепляют структуру в вирусной оболочке. [ 25 ] [ 26 ] Белок оболочки, кодируемый геном env ВИЧ , позволяет вирусу прикрепляться к клеткам-мишеням и соединять вирусную оболочку с мембраной клетки- мишени , высвобождая вирусное содержимое в клетку и инициируя инфекционный цикл. [ 25 ]

Диаграмма белка-шипа ВИЧ (зеленый), эпитоп слитого пептида выделен красным, а антитело широкого нейтрализующего действия (желтый), связывающееся со слитым пептидом

Белок оболочки, единственный вирусный белок на поверхности вируса, является основной мишенью для разработки вакцины против ВИЧ . [ 27 ] Более половины массы шипа тримерной оболочки составляют N-связанные гликаны . Плотность высока, поскольку гликаны защищают основной вирусный белок от нейтрализации антителами. Это одна из наиболее плотно гликозилированных известных молекул, плотность которой достаточно высока, чтобы предотвратить нормальный процесс созревания гликанов во время биогенеза в эндоплазматическом аппарате и аппарате Гольджи. [ 28 ] [ 29 ] Таким образом, большинство гликанов представляют собой незрелые гликаны с высоким содержанием маннозы, которые обычно не присутствуют в гликопротеинах человека, которые секретируются или присутствуют на поверхности клеток. [ 30 ] Необычный процессинг и высокая плотность означают, что почти все идентифицированные к настоящему времени нейтрализующие антитела широкого спектра действия (у части пациентов, инфицированных в течение многих месяцев или лет) связываются с этими гликанами оболочки или адаптированы для борьбы с ними. [ 31 ]

Молекулярная структура вирусного шипа теперь определена с помощью рентгеновской кристаллографии. [ 32 ] и криогенная электронная микроскопия . [ 33 ] Эти достижения в структурной биологии стали возможными благодаря разработке стабильных рекомбинантных форм вирусного спайка путем введения межсубъединичной дисульфидной связи и изолейцина на пролин мутации ( радикальная замена аминокислоты) в gp41. [ 34 ] Так называемые тримеры SOSIP не только воспроизводят антигенные свойства нативного вирусного шипа, но также демонстрируют ту же степень незрелых гликанов, что и нативный вирус. [ 35 ] Рекомбинантные тримерные вирусные шипы являются многообещающими кандидатами на вакцины, поскольку они содержат меньше ненейтрализующих эпитопов , чем рекомбинантный мономерный gp120, который подавляет иммунный ответ на целевые эпитопы. [ 36 ]

Структура РНК-генома ВИЧ-1

Геном РНК состоит как минимум из семи структурных ориентиров ( LTR , TAR , RRE , PE, SLIP, CRS и INS) и девяти генов ( gag , pol и env , tat , rev , nef , vif , vpr , vpu , а иногда и десятый tev , который представляет собой слияние tat , env и rev ), кодирующего 19 белков. Три из этих генов, gag , pol и env , содержат информацию, необходимую для создания структурных белков для новых вирусных частиц. [ 24 ] Например, env кодирует белок gp160, который клеточная протеаза разрезает на две части, образуя gp120 и gp41. Шесть оставшихся генов, tat , rev , nef , vif , vpr и vpu (или vpx в случае ВИЧ-2), являются регуляторными генами белков, которые контролируют способность ВИЧ инфицировать клетки, продуцировать новые копии вируса ( копировать) или вызвать заболевание. [ 24 ]

Два белка tat (p16 и p14) являются транскрипционными трансактиваторами LTR, промотора действующими путем связывания элемента РНК TAR. TAR также может быть переработан в микроРНК , которые регулируют апоптоза гены ERCC1 и IER3 . [ 37 ] [ 38 ] Белок rev (p19) участвует в транспортировке РНК из ядра и цитоплазмы путем связывания с элементом РНК RRE . Белок vif (p23) предотвращает действие APOBEC3G (клеточного белка, который дезаминирует цитидин в уридин в одноцепочечной вирусной ДНК и/или препятствует обратной транскрипции). [ 39 ] ). Белок vpr (p14) останавливает деление клеток на уровне G2/M . Белок nef (p27) подавляет CD4 (основной вирусный рецептор), а также молекулы MHC класса I и класса II . [ 40 ] [ 41 ] [ 42 ]

Nef также взаимодействует с доменами SH3 . Белок vpu (p16) влияет на высвобождение новых вирусных частиц из инфицированных клеток. [ 24 ] Концы каждой цепи РНК ВИЧ содержат последовательность РНК, называемую длинным терминальным повтором (LTR). Области LTR действуют как переключатели, контролирующие выработку новых вирусов, и могут запускаться белками ВИЧ или клетки-хозяина. Элемент Psi участвует в упаковке вирусного генома и распознается белками gag и rev . Элемент SLIP ( ТТТТТТ ) участвует в сдвиге кадра в gag - pol, рамке считывания необходимом для создания функционального pol . [ 24 ]

Тропизм

Схема незрелой и зрелой форм ВИЧ

Термин вирусный тропизм относится к типам клеток, которые заражает вирус. ВИЧ может инфицировать различные иммунные клетки, такие как CD4. + Т-клетки , макрофаги и микроглиальные клетки . Проникновение ВИЧ-1 в макрофаги и CD4 + Т-клетки опосредованы взаимодействием гликопротеинов оболочки вириона (gp120) с молекулой CD4 на мембране клеток-мишеней, а также с хемокиновыми корецепторами . [ 25 ] [ 43 ]

Макрофаготропные (М-тропные) штаммы ВИЧ-1 или штаммы, не индуцирующие синцитий (NSI; теперь называемые вирусами R5). [ 44 ] ) используют рецептор β -хемокинов CCR5 для проникновения и, таким образом, способны реплицироваться как в макрофагах, так и в CD4. + Т-клетки. [ 45 ] Этот корецептор CCR5 используется почти всеми первичными изолятами ВИЧ-1, независимо от генетического подтипа вируса. Действительно, макрофаги играют ключевую роль в нескольких критических аспектах ВИЧ-инфекции. По-видимому, они являются первыми клетками, инфицированными ВИЧ, и, возможно, источником продукции ВИЧ, когда CD4 + клетки у пациента истощаются. Макрофаги и микроглиальные клетки – это клетки центральной нервной системы, инфицированные ВИЧ . В миндалинах и аденоидах ВИЧ-инфицированных пациентов макрофаги сливаются в многоядерные гигантские клетки , которые производят огромное количество вируса.

Т-тропные штаммы ВИЧ-1 или штаммы, индуцирующие синцитий (SI; теперь называемые вирусами X4). [ 44 ] ) реплицируются в первичном CD4 + Т-клетки, а также макрофаги используют для проникновения рецептор α -хемокина CXCR4 . [ 45 ] [ 46 ] [ 47 ]

Двойные тропные штаммы ВИЧ-1 считаются переходными штаммами ВИЧ-1 и, таким образом, способны использовать как CCR5, так и CXCR4 в качестве корецепторов для проникновения вируса.

α - хемокин SDF-1 , лиганд CXCR4, подавляет репликацию Т-тропных изолятов ВИЧ-1. Это происходит за счет снижения экспрессии CXCR4 на поверхности клеток-мишеней ВИЧ. М-тропные изоляты ВИЧ-1, использующие только рецептор CCR5, называются R5; те, которые используют только CXCR4, называются X4, а те, которые используют оба, X4R5. Однако использование только корецепторов не объясняет вирусный тропизм, поскольку не все вирусы R5 способны использовать CCR5 на макрофагах для продуктивной инфекции. [ 45 ] ВИЧ также может инфицировать подтип миелоидных дендритных клеток . [ 48 ] которые, вероятно, представляют собой резервуар , поддерживающий инфекцию, когда CD4 + Количество Т-клеток снизилось до чрезвычайно низкого уровня.

Некоторые люди устойчивы к определенным штаммам ВИЧ. [ 49 ] Например, люди с мутацией CCR5-Δ32 устойчивы к заражению вирусом R5, поскольку мутация не позволяет ВИЧ связываться с этим корецептором, снижая его способность инфицировать клетки-мишени.

Половой акт является основным способом передачи ВИЧ. ВИЧ как X4, так и R5 присутствует в семенной жидкости , что позволяет вирусу передаваться от мужчины к его сексуальному партнеру . Затем вирионы могут инфицировать многочисленные клеточные мишени и распространяться по всему организму. Однако процесс отбора [ нужны дальнейшие объяснения ] приводит к преимущественной передаче вируса R5 по этому пути. [ 50 ] [ 51 ] [ 52 ] У пациентов, инфицированных подтипом B ВИЧ-1, на поздних стадиях заболевания часто происходит переключение корецепторов и Т-тропные варианты, которые могут инфицировать различные Т-клетки посредством CXCR4. [ 53 ] Эти варианты затем реплицируются более агрессивно с повышенной вирулентностью, что вызывает быстрое истощение Т-клеток, коллапс иммунной системы и оппортунистические инфекции, которые знаменуют появление СПИДа. [ 54 ] ВИЧ-положительные пациенты приобретают чрезвычайно широкий спектр оппортунистических инфекций, что было особенно проблематично до появления ВААРТ- терапии; однако те же инфекции наблюдаются среди ВИЧ-инфицированных пациентов, обследованных посмертно после начала антиретровирусной терапии. [ 3 ] Таким образом, в ходе инфекции адаптация вируса к использованию CXCR4 вместо CCR5 может стать ключевым этапом развития СПИДа. Ряд исследований с участием людей, инфицированных подтипом B, установили, что от 40 до 50 процентов больных СПИДом могут быть носителями вирусов фенотипа SI и, предположительно, X4. [ 55 ] [ 56 ]

ВИЧ-2 гораздо менее патогенен, чем ВИЧ-1, и его распространение по всему миру ограничено Западной Африкой . Принятие ВИЧ-2 «вспомогательных генов» и более беспорядочное использование корецепторов (включая независимость от CD4) может помочь вирусу в его адаптации, чтобы избежать врожденных факторов рестрикции, присутствующих в клетках-хозяевах. Адаптация к использованию обычных клеточных механизмов для обеспечения передачи и продуктивного заражения также способствовала установлению репликации ВИЧ-2 у людей. Стратегия выживания любого инфекционного агента заключается не в том, чтобы убить своего хозяина, а в конечном итоге стать комменсальным организмом. Достигнув низкой патогенности, со временем будут выбраны более успешные при передаче варианты. [ 57 ]

Цикл репликации

Цикл репликации ВИЧ

Вход в камеру

Механизм проникновения вируса : 1. Первоначальное взаимодействие между gp120 и CD4. 2. Конформационные изменения gp120 позволяют осуществлять вторичное взаимодействие с CXCR4. 3. Дистальные кончики gp41 встраиваются в клеточную мембрану. 4. gp41 претерпевает значительные конформационные изменения; складываем пополам и образуем колечки. Этот процесс сближает вирусные и клеточные мембраны, сливая их.

Вирион ВИЧ проникает в макрофаги и CD4. + Т-клетки путем адсорбции гликопротеинов на своей поверхности к рецепторам клетки-мишени с последующим слиянием вирусной оболочки с мембраной клетки-мишени и высвобождением капсида ВИЧ в клетку. [ 58 ] [ 59 ]

Вход в клетку начинается посредством взаимодействия комплекса тримерной оболочки ( шип gp160 ) на оболочке вируса ВИЧ, а также CD4 и хемокинового корецептора (обычно либо CCR5 , либо CXCR4 , но известно, что взаимодействуют и другие) на поверхности клетки-мишени. [ 58 ] [ 59 ] Gp120 связывается с интегрином α 4 β 7, активируя LFA-1 , центральный интегрин, участвующий в создании вирусологических синапсов , которые способствуют эффективному распространению ВИЧ-1 от клетки к клетке. [ 60 ] Шип gp160 содержит связывающие домены как для CD4, так и для хемокиновых рецепторов. [ 58 ] [ 59 ]

Первый этап слияния включает высокоаффинное присоединение CD4-связывающих доменов gp120 к CD4. Как только gp120 связывается с белком CD4, комплекс оболочки претерпевает структурные изменения, обнажая домены связывания хемокинового рецептора gp120 и позволяя им взаимодействовать с целевым хемокиновым рецептором. [ 58 ] [ 59 ] Это обеспечивает более стабильное двустороннее прикрепление, что позволяет N-концевому слитому пептиду gp41 проникать через клеточную мембрану. [ 58 ] [ 59 ] Повторяющиеся последовательности в gp41, HR1 и HR2 затем взаимодействуют, вызывая коллапс внеклеточной части gp41 в форму шпильки. Эта петлевая структура сближает вирус и клеточные мембраны, обеспечивая слияние мембран и последующее проникновение вирусного капсида. [ 58 ] [ 59 ]

После того, как ВИЧ связался с клеткой-мишенью, в клетку вводятся РНК ВИЧ и различные ферменты, включая обратную транскриптазу, интегразу, рибонуклеазу и протеазу. [ 58 ] [ не удалось пройти проверку ] Во время транспорта в ядро ​​с помощью микротрубочек геном вирусной одноцепочечной РНК транскрибируется в двухцепочечную ДНК, которая затем интегрируется в хромосому хозяина.

ВИЧ может инфицировать дендритные клетки (ДК) по этому пути CD4-CCR5, но другой путь, использующий маннозоспецифические лектиновые рецепторы C-типа, такие как DC-SIGN . также можно использовать [ 61 ] ДК являются одними из первых клеток, с которыми сталкивается вирус при передаче половым путем. В настоящее время считается, что они играют важную роль, передавая ВИЧ Т-клеткам, когда вирус захватывается в слизистой оболочке ДК. [ 61 ] Считается, что наличие FEZ-1 , который естественным образом встречается в нейронах , предотвращает заражение клеток ВИЧ. [ 62 ]

Клатрин-опосредованный эндоцитоз

Долгое время считалось, что проникновение ВИЧ-1, как и многих других ретровирусов, происходит исключительно через плазматическую мембрану. Однако совсем недавно продуктивном заражении посредством рН -независимого клатрин-опосредованного эндоцитоза ВИЧ-1, и недавно было высказано предположение, что это единственный путь продуктивного проникновения. сообщалось о [ 63 ] [ 64 ] [ 65 ] [ 66 ] [ 67 ]

Репликация и транскрипция

Обратная транскрипция ВИЧ генома в двухцепочечную ДНК

Вскоре после того, как вирусный капсид попадает в клетку, фермент , называемый обратной транскриптазой, освобождает геном одноцепочечной РНК с положительным смыслом от прикрепленных вирусных белков и копирует его в молекулу комплементарной ДНК (кДНК). [ 68 ] Процесс обратной транскрипции чрезвычайно подвержен ошибкам, и возникающие в результате мутации могут вызвать устойчивость к лекарствам или позволить вирусу уклониться от иммунной системы организма. Обратная транскриптаза также обладает рибонуклеазной активностью, которая разрушает вирусную РНК во время синтеза кДНК, а также ДНК-зависимой активностью ДНК-полимеразы, которая создает смысловую ДНК из антисмысловой кДНК. [ 69 ] Вместе кДНК и ее комплемент образуют двухцепочечную вирусную ДНК, которая затем транспортируется в ядро ​​клетки . Интеграция вирусной ДНК в геном клетки-хозяина осуществляется другим вирусным ферментом, называемым интегразой . [ 68 ]

Интегрированная вирусная ДНК может затем находиться в спящем состоянии на латентной стадии ВИЧ-инфекции. [ 68 ] Для активной продукции вируса определенные клеточные факторы транскрипции должны присутствовать , наиболее важным из которых является NF- κ B (ядерный фактор каппа B), который активируется при активации Т-клеток. [ 70 ] Это означает, что ВИЧ с наибольшей вероятностью станет мишенью, проникнет в организм и впоследствии уничтожит те клетки, которые активно борются с инфекцией.

вируса интегрированная ДНК провируса транскрибируется Во время репликации в РНК. Полноразмерные геномные РНК (гРНК) могут быть упакованы в новые вирусные частицы в псевдодиплоидной форме. Селективность упаковки объясняется структурными свойствами димерного конформера гРНК. Димер гРНК характеризуется тандемным трехсторонним соединением внутри мономера гРНК, в котором шпильки SD и AUG , ответственные за сплайсинг и трансляцию соответственно, изолированы, а шпилька DIS (сигнал инициации димеризации) обнажена. Образование димера гРНК опосредовано «целующимся» взаимодействием между шпильками DIS мономеров гРНК. В то же время определенные остатки гуанозина в гРНК становятся доступными для связывания белка нуклеокапсида (NC), что приводит к последующей сборке вириона. [ 71 ] Сообщалось также, что лабильный димер гРНК достигает более стабильной конформации после связывания NC, при котором как DIS, так и области U5:AUG гРНК участвуют в обширном спаривании оснований. [ 72 ]

РНК также может быть подвергнута процессингу для получения зрелых матричных РНК (мРНК). В большинстве случаев этот процессинг включает сплайсинг РНК для получения мРНК, которые короче полноразмерного генома. Какая часть РНК удаляется во время сплайсинга РНК, определяет, какая из последовательностей, кодирующих белок ВИЧ, транслируется. [ 73 ]

Зрелые мРНК ВИЧ экспортируются из ядра в цитоплазму , где транслируются с образованием белков ВИЧ, Rev. включая По мере образования вновь полученного белка Rev он перемещается в ядро, где связывается с полноразмерными несплайсированными копиями вирусных РНК и позволяет им покинуть ядро. [ 74 ] Некоторые из этих полноразмерных РНК функционируют как мРНК, которые транслируются с образованием структурных белков Gag и Env. Белки Gag связываются с копиями генома РНК вируса, упаковывая их в новые вирусные частицы. [ 75 ] ВИЧ-1 и ВИЧ-2, по-видимому, по-разному упаковывают свою РНК. [ 76 ] [ 77 ] ВИЧ-1 связывается с любой подходящей РНК. [ 78 ] ВИЧ-2 будет преимущественно связываться с мРНК, которая использовалась для создания самого белка Gag. [ 79 ]

Рекомбинация

В каждой частице ВИЧ-1 заключены два генома РНК (см. Строение и геном ВИЧ ). При инфицировании и репликации, катализируемой обратной транскриптазой, может произойти рекомбинация между двумя геномами. [ 80 ] [ 81 ] Рекомбинация происходит, когда одноцепочечные геномы РНК с положительным смыслом подвергаются обратной транскрипции с образованием ДНК. Во время обратной транскрипции зарождающаяся ДНК может несколько раз переключаться между двумя копиями вирусной РНК. Эта форма рекомбинации известна как выбор копии. События рекомбинации могут происходить по всему геному. В каждом цикле репликации может происходить от двух до 20 событий рекомбинации на геном, и эти события могут быстро перетасовывать генетическую информацию, которая передается от родительских геномов к потомству. [ 81 ]

Вирусная рекомбинация приводит к генетическим вариациям, которые, вероятно, способствуют развитию устойчивости к антиретровирусной терапии . [ 82 ] Рекомбинация в принципе может также способствовать преодолению иммунной защиты хозяина. Тем не менее, чтобы реализовать адаптивные преимущества генетической изменчивости, два вирусных генома, упакованные в отдельные инфицирующие вирусные частицы, должны произойти от отдельных родительских вирусов-предшественников различной генетической конституции. Неизвестно, как часто такая смешанная упаковка встречается в естественных условиях. [ 83 ]

Бонхеффер и др. [ 84 ] предположили, что переключение матрицы с помощью обратной транскриптазы действует как процесс восстановления, устраняющий разрывы в геноме одноцепочечной РНК. Кроме того, Ху и Темин [ 80 ] предположили, что рекомбинация является адаптацией к восстановлению повреждений в геномах РНК. Переключение цепи (рекомбинация выбора копии) с помощью обратной транскриптазы может генерировать неповрежденную копию геномной ДНК из двух поврежденных копий генома одноцепочечной РНК. Этот взгляд на адаптивную пользу рекомбинации ВИЧ может объяснить, почему каждая частица ВИЧ содержит два полных генома, а не один. Более того, точка зрения, согласно которой рекомбинация является процессом репарации, подразумевает, что выгода от репарации может проявляться в каждом цикле репликации и что эта выгода может быть реализована независимо от того, различаются ли два генома генетически. С точки зрения того, что рекомбинация при ВИЧ является процессом репарации, возникновение рекомбинационных вариаций должно быть следствием, но не причиной эволюции переключения шаблонов. [ 84 ]

Инфекция ВИЧ-1 вызывает хроническое воспаление и выработку активных форм кислорода . [ 85 ] Таким образом, геном ВИЧ может быть уязвим к окислительному повреждению , включая разрывы одноцепочечной РНК. Для ВИЧ, как и для вирусов в целом, успешное заражение зависит от преодоления защитных стратегий хозяина, которые часто включают выработку повреждающих геном активных форм кислорода. Таким образом, Мишо и др. [ 86 ] предположили, что рекомбинация вирусов — это адаптация к восстановлению повреждений генома, а рекомбинационные вариации — это побочный продукт, который может принести отдельную пользу.

Сборка и выпуск

Сборка ВИЧ на поверхности инфицированного макрофага . Вирионы ВИЧ были помечены зеленой флуоресцентной меткой и затем просмотрены под флуоресцентным микроскопом.

Последний этап вирусного цикла — сборка новых вирионов ВИЧ-1 — начинается на плазматической мембране клетки-хозяина. Полипротеин Env (gp160) проходит через эндоплазматический ретикулум и транспортируется в аппарат Гольджи расщепляется , фурином . в результате чего образуются два гликопротеина оболочки ВИЧ, gp41 и gp120 , где [ 87 ] Они транспортируются к плазматической мембране клетки-хозяина, где gp41 закрепляет gp120 на мембране инфицированной клетки. Полипротеины Gag (p55) и Gag-Pol (p160) также связываются с внутренней поверхностью плазматической мембраны вместе с геномной РНК ВИЧ, когда формирующийся вирион начинает отпочковываться из клетки-хозяина. Почкующийся вирион все еще является незрелым, поскольку полипротеинам gag все еще необходимо расщепиться на настоящий матрикс, капсид и белки нуклеокапсида. Это расщепление опосредовано упакованной вирусной протеазой и может ингибироваться антиретровирусными препаратами класса ингибиторов протеазы . Затем различные структурные компоненты собираются, образуя зрелый вирион ВИЧ. [ 88 ] Только зрелые вирионы способны инфицировать другую клетку.

Распространение внутри тела

Анимация, демонстрирующая бесклеточное распространение ВИЧ

Классический процесс заражения клетки вирионом можно назвать «внеклеточным распространением», чтобы отличить его от недавно признанного процесса, называемого «от клетки к клетке». [ 89 ] При бесклеточном распространении (см. рисунок) вирусные частицы отпочковываются от инфицированной Т-клетки, попадают в кровь или внеклеточную жидкость , а затем после случайной встречи заражают другую Т-клетку. [ 89 ] ВИЧ также может распространяться путем прямой передачи от одной клетки к другой в процессе распространения от клетки к клетке, для чего описаны два пути. Во-первых, инфицированная Т-клетка может передавать вирус непосредственно Т-клетке-мишени через вирусологический синапс . [ 60 ] [ 90 ] Во-вторых, антигенпрезентирующая клетка (АПК), такая как макрофаг или дендритная клетка, может передавать ВИЧ Т-клеткам посредством процесса, который либо включает продуктивную инфекцию (в случае макрофагов), либо захват и перенос вирионов в транс (в случае макрофагов). случае дендритных клеток). [ 91 ] Какой бы путь ни использовался, сообщается, что заражение путем переноса вируса от клетки к клетке гораздо более эффективно, чем бесклеточное распространение вируса. [ 92 ] Этой повышенной эффективности способствует ряд факторов, в том числе поляризованное отпочкование вируса к месту межклеточного контакта, близкое расположение клеток, что сводит к минимуму диффузию вирионов в жидкой фазе, а также кластеризация рецепторов входа ВИЧ на клетке-мишени в направлении контактная зона. [ 90 ] Считается, что распространение от клетки к клетке особенно важно в лимфоидных тканях , где CD4 + Т-клетки плотно упакованы и, вероятно, часто взаимодействуют. [ 89 ] Исследования прижизненной визуализации подтвердили концепцию вирусологического синапса ВИЧ in vivo . [ 93 ] Многие механизмы распространения ВИЧ способствуют непрерывной репликации вируса, несмотря на антиретровирусную терапию. [ 89 ] [ 94 ]

Генетическая изменчивость

Филогенетическое древо ВИО и ВИЧ.

ВИЧ отличается от многих вирусов тем, что имеет очень высокую генетическую изменчивость . Такое разнообразие является результатом быстрого цикла репликации , при котором образуется около 10 10 вирионов каждый день в сочетании с высокой частотой мутаций примерно 3 x 10 −5 на нуклеотидное основание за цикл репликации и рекомбиногенные свойства обратной транскриптазы. [ 95 ] [ 96 ] [ 97 ]

Этот сложный сценарий приводит к образованию множества вариантов ВИЧ у одного инфицированного пациента в течение одного дня. [ 95 ] Эта изменчивость усугубляется, когда одна клетка одновременно инфицирована двумя или более разными штаммами ВИЧ. При одновременном заражении геном вирионов-потомков может состоять из цепей РНК двух разных штаммов. Этот гибридный вирион затем заражает новую клетку, где он подвергается репликации. Когда это произойдет, обратная транскриптаза, переключаясь между двумя разными матрицами РНК, будет генерировать вновь синтезированную последовательность ретровирусной ДНК , которая является рекомбинантной между двумя родительскими геномами. [ 95 ] Эта рекомбинация наиболее очевидна, когда она происходит между подтипами. [ 95 ]

Близкородственный вирус иммунодефицита обезьян (SIV) превратился во множество штаммов, классифицированных по естественным видам-хозяевам. Считается, что штаммы SIV африканской зеленой мартышки (SIVagm) и сажистого мангабея (SIVsmm) имеют долгую эволюционную историю со своими хозяевами. Эти хозяева адаптировались к присутствию вируса, [ 98 ] который присутствует в высоких концентрациях в крови хозяина, но вызывает лишь умеренный иммунный ответ, [ 99 ] не вызывает развитие обезьяньего СПИДа, [ 100 ] и не подвергается обширным мутациям и рекомбинациям, типичным для ВИЧ-инфекции у человека. [ 101 ]

Напротив, когда эти штаммы заражают виды, которые не адаптировались к SIV («гетерологичные» или подобные хозяева, такие как макаки-резусы или яванские макаки ), у животных развивается СПИД, и вирус генерирует генетическое разнообразие, подобное тому, что наблюдается при ВИЧ-инфекции человека. [ 102 ] SIV шимпанзе (SIVcpz), ближайший генетический родственник ВИЧ-1, связан с повышенной смертностью и СПИД-подобными симптомами у его естественного хозяина. [ 103 ] SIVcpz, по-видимому, передался популяциям шимпанзе и человека сравнительно недавно, поэтому их хозяева еще не адаптировались к вирусу. [ 98 ] Этот вирус также утратил функцию гена nef , который присутствует у большинства SIV. Для непатогенных вариантов SIV nef подавляет активацию Т-клеток через маркер CD3 . при Функция Nef непатогенных формах ВИО заключается в подавлении экспрессии воспалительных цитокинов MHC -1 и сигналов, влияющих на транспорт Т-клеток. При ВИЧ-1 и SIVcpz nef не ингибирует активацию Т-клеток и утратил эту функцию. Без этой функции более вероятно истощение Т-клеток, что приводит к иммунодефициту. [ 103 ] [ 104 ]

На основании различий в области оболочки ( env ) были идентифицированы три группы ВИЧ-1: M, N и O. [ 105 ] Группа M является наиболее распространенной и подразделяется на восемь подтипов (или клад ), основанных на всем геноме, которые географически различаются. [ 106 ] Наиболее распространены подтипы B (встречаются преимущественно в Северной Америке и Европе), A и D (встречаются преимущественно в Африке) и C (встречаются преимущественно в Африке и Азии); эти подтипы образуют ветви филогенетического дерева, представляющие линию М-группы ВИЧ-1. Коинфекция различными подтипами приводит к появлению циркулирующих рекомбинантных форм (CRF). В 2000 году, последнем году, когда был проведен анализ глобальной распространенности подтипа, 47,2% инфекций во всем мире были связаны с подтипом C, 26,7% были с подтипом A/CRF02_AG, 12,3% были с подтипом B, 5,3% были с подтипом D, 3,2% имели CRF_AE, а остальные 5,3% состояли из других подтипов и CRF. [ 107 ] Большинство исследований ВИЧ-1 сосредоточено на подтипе B; лишь немногие лаборатории специализируются на других подтипах. [ 108 ] Существование четвертой группы, «P», было выдвинуто на основе вируса, выделенного в 2009 году. [ 109 ] [ 110 ] Этот штамм, по-видимому, произошел от гориллы SIV (SIVgor), впервые выделенной от западных равнинных горилл в 2006 году. [ 109 ]

Ближайшим родственником ВИЧ-2 является SIVsm, штамм SIV, обнаруженный у сажистых мангабей. Поскольку ВИЧ-1 происходит от SIVcpz, а ВИЧ-2 — от SIVsm, генетическая последовательность ВИЧ-2 лишь частично гомологична ВИЧ-1 и более похожа на последовательность SIVsm. [ 111 ] [ 112 ]

Диагностика

Обобщенный график взаимосвязи между копиями ВИЧ (вирусной нагрузкой) и числом CD4 в течение среднего течения нелеченой ВИЧ-инфекции; Течение заболевания у каждого конкретного человека может значительно различаться.
  CD4 + Количество Т-клеток (клеток на мкл)
  Копии РНК ВИЧ на мл плазмы

Многие ВИЧ-положительные люди не подозревают, что они инфицированы этим вирусом. [ 113 ] Например, в 2001 году менее 1% сексуально активного городского населения в Африке прошли тестирование, а среди сельского населения эта доля еще ниже. [ 113 ] Более того, в 2001 году только 0,5% беременных женщин, посещавших городские медицинские учреждения, прошли консультацию, прошли тестирование или получили результаты анализов. [ 113 ] Опять же, в сельских медицинских учреждениях эта доля еще ниже. [ 113 ] Поскольку доноры могут не знать о своей инфекции, донорская кровь и продукты крови, используемые в медицине и медицинских исследованиях, регулярно проверяются на ВИЧ. [ 114 ]

Тестирование на ВИЧ-1 первоначально проводится с использованием иммуноферментного анализа (ИФА) для выявления антител к ВИЧ-1. Образцы с нереактивным результатом первоначального ИФА считаются ВИЧ-отрицательными, за исключением случаев, когда произошел новый контакт с инфицированным партнером или партнером с неизвестным ВИЧ-статусом. Образцы с реактивным результатом ИФА исследуются повторно в двух экземплярах. [ 115 ] Если результат любого из повторных тестов является реактивным, образец считается повторно реактивным и подвергается подтверждающему тестированию с более специфическим дополнительным тестом (например, полимеразной цепной реакцией (ПЦР), вестерн-блоттингом или, реже, иммунофлуоресцентным анализом (ИФА) )). ВИЧ-положительными и указывающими на ВИЧ-инфекцию считаются только те образцы, которые повторно реагируют с помощью ИФА и являются положительными с помощью ИФА или ПЦР или дают положительный результат с помощью вестерн-блоттинга. Образцы, которые повторно реагируют на ИФА, иногда дают неопределенный результат вестерн-блоттинга, который может быть либо неполным ответом антител на ВИЧ у инфицированного человека, либо неспецифическими реакциями у неинфицированного человека. [ 116 ]

Смертность от ВИЧ в 2014 году, исключая США: [ 117 ]

  Нигерия (15,76%)
  Индия (11,50%)
  Танзания (4,169%)
  Мозамбик (4,061%)
  Зимбабве (3,49%)
  Камерун (3,09%)
  Кения (2,98%)
  Уганда (2,97%)
  Малави (2,94%)
  ДР Конго (2,17%)
  Эфиопия (2,11%)
  Другое (29,21%)

Хотя ИФА можно использовать для подтверждения инфекции в этих неоднозначных случаях, этот метод широко не используется. Как правило, второй образец следует собрать более чем через месяц и повторно протестировать у лиц с неопределенными результатами вестерн-блоттинга. (например, метод амплификации вирусной РНК или провирусной ДНК) доступно гораздо реже, Хотя тестирование нуклеиновых кислот оно также может помочь в диагностике в определенных ситуациях. [ 115 ] Кроме того, несколько протестированных образцов могут дать неубедительные результаты из-за небольшого количества образцов. В таких ситуациях собирается второй образец и проверяется на ВИЧ-инфекцию.

Современное тестирование на ВИЧ является чрезвычайно точным, если период окна принять во внимание . Один скрининговый тест дает правильный результат более чем в 99% случаев. [ 118 ] Вероятность ложноположительного результата в стандартном двухэтапном протоколе тестирования оценивается примерно в 1 на 250 000 в группе низкого риска. [ 119 ] Тестирование после заражения рекомендуется проводить немедленно, а затем через шесть недель, три месяца и шесть месяцев. [ 120 ]

Последние рекомендации Центров по контролю и профилактике заболеваний США (CDC) показывают, что тестирование на ВИЧ должно начинаться с комбинированного иммунологического ВИЧ-1 и ВИЧ-2 анализа на антитела и антиген p24 . Отрицательный результат исключает заражение ВИЧ, а положительный результат должен сопровождаться иммуноанализом на дифференцировку антител ВИЧ-1/2, чтобы определить, какие антитела присутствуют. Это приводит к четырем возможным сценариям:

  • 1. ВИЧ-1 (+) и ВИЧ-2 (-): обнаружены антитела к ВИЧ-1.
  • 2. ВИЧ-1 (-) и ВИЧ-2 (+): обнаружены антитела к ВИЧ-2.
  • 3. ВИЧ-1 (+) и ВИЧ-2 (+): обнаружены антитела как к ВИЧ-1, так и к ВИЧ-2.
  • 4. ВИЧ-1 (-) или неопределенный и ВИЧ-2 (-): тест на нуклеиновую кислоту необходимо провести для выявления острой инфекции ВИЧ-1 или ее отсутствия. [ 121 ]

Исследовать

Исследования ВИЧ/СПИДа включают все медицинские исследования , направленные на профилактику, лечение или излечение ВИЧ/СПИДа , а также фундаментальные исследования природы ВИЧ как инфекционного агента и СПИДа как заболевания, вызываемого ВИЧ.

Многие правительства и исследовательские институты участвуют в исследованиях по ВИЧ/СПИДу. Эти исследования включают в себя вмешательства в области поведенческого здоровья , такие как исследования в области полового воспитания , и разработку лекарств , таких как исследования микробицидов для лечения заболеваний, передающихся половым путем , вакцин против ВИЧ и антиретровирусных препаратов . [ 122 ] Другие области медицинских исследований включают темы доконтактной профилактики , постконтактной профилактики , обрезания и эффектов ускоренного старения .

Лечение и передача

Лечение ВИЧ/СПИДа обычно включает использование нескольких антиретровирусных препаратов . Во многих частях мира ВИЧ стал хроническим заболеванием, при котором прогрессирование до СПИДа становится все более редким.

Латентный период ВИЧ и, как следствие, резервуар вируса в CD4 + Т-клетки, дендритные клетки, а также макрофаги являются основным барьером на пути уничтожения вируса. [ 19 ] [ 123 ]

Несмотря на высокую вирулентность ВИЧ, передача ВИЧ не происходит половым путем, если ВИЧ-положительный человек имеет постоянно неопределяемую вирусную нагрузку (<50 копий/мл) вследствие антиретровирусного лечения. Впервые об этом заявила Федеральная комиссия Швейцарии по СПИДу/ВИЧ в 2008 году в Заявлении Швейцарии , хотя в то время это заявление вызывало споры. [ 124 ] [ 125 ] Однако после многочисленных исследований стало ясно, что вероятность передачи ВИЧ половым путем фактически равна нулю, если у ВИЧ-положительного человека постоянно неопределяемая вирусная нагрузка; это известно как U=U, «Необнаружимый = Непередаваемый», также формулируется как «невозможно передать это дальше». [ 126 ] [ 127 ] Исследования, демонстрирующие U=U: Противоположности притягиваются, [ 128 ] ПАРТНЕР 1, [ 129 ] ПАРТНЕР 2, [ 5 ] [ 130 ] (для пар мужчина-мужчина) [ 131 ] и HPTN052 [ 132 ] (для гетеросексуальных пар), когда «партнер, живущий с ВИЧ, имел стойко подавленную вирусную нагрузку». [ 131 ] В эти исследования были включены пары, в которых один партнер был ВИЧ-положительным, а другой ВИЧ-отрицательным, и прошли регулярное тестирование на ВИЧ. Всего в четырех исследованиях приняли участие 4097 пар на четырех континентах и ​​было зарегистрировано 151 880 половых актов без презервативов; не было ни одного филогенетически связанного случая передачи ВИЧ, когда положительный партнер имел неопределяемую вирусную нагрузку. [ 133 ] После этого заявление о консенсусе «Н=Н», призывающее к использованию «нулевого риска», было подписано сотнями людей и организаций, в том числе Центром по контролю и профилактике заболеваний США , Британской ассоциацией по ВИЧ и медицинским журналом «Ланцет» . [ 134 ] Важность окончательных результатов исследования PARTNER 2 была описана медицинским директором Фонда Терренса Хиггинса как «невозможно переоценить», а ведущий автор Элисон Роджер заявила, что сообщение о том, что «неопределяемая вирусная нагрузка делает ВИЧ непередаваемым… может помочь положить конец пандемии ВИЧ, предотвращая передачу ВИЧ. [ 135 ] Авторы резюмировали свои выводы в The Lancet следующим образом: [ 5 ]

Наши результаты предоставляют тот же уровень доказательств в отношении подавления вируса и риска передачи ВИЧ для геев, что и ранее полученный для гетеросексуальных пар, и позволяют предположить, что риск передачи ВИЧ в однополых парах посредством секса без презервативов, когда вирусная нагрузка ВИЧ подавлена, фактически равен нулю. Наши результаты подтверждают идею кампании «Н=Н» (необнаружимое = непередаваемое), а также преимущества раннего тестирования и лечения ВИЧ. [ 5 ]

Этот результат согласуется с выводом, представленным Энтони С. Фаучи , директором Национального института аллергии и инфекционных заболеваний США Национального института здравоохранения , и его командой в точке зрения, опубликованной в Журнале Американской медицинской ассоциации , о том, что U=U – эффективный метод профилактики ВИЧ при сохранении неопределяемой вирусной нагрузки. [ 6 ] [ 131 ]

Реактивация вируса простого герпеса-2 (ВПГ-2) у лиц, пораженных генитальным герпесом , связана с увеличением количества CD4+ Т-клеток, обогащенных CCR-5, а также воспалительных дендритных клеток в дерме изъязвленной кожи половых органов, которые сохраняются после заживления. язва. Тропизм ВИЧ к CCR-5-положительным клеткам объясняет двух-трехкратное увеличение заболеваемости ВИЧ среди лиц с генитальным герпесом. Ежедневный прием противовирусных препаратов (например, ацикловира) не уменьшает субклиническое постреактивационное воспаление и, следовательно, не снижает риск заражения ВИЧ. [ 136 ] [ 137 ]

История

Открытие

Первая новость о «новой экзотической болезни» появилась 18 мая 1981 года в гей-газете New York Native . [ 138 ]

Впервые СПИД был клинически обнаружен в 1981 году в США. [ 139 ] Первоначальные случаи представляли собой группу потребителей инъекционных наркотиков и мужчин-геев без известной причины нарушения иммунитета, у которых проявлялись симптомы пневмоцистной пневмонии (PCP или PJP, последний термин означает, что возбудитель теперь называется Pneumocystis jirovecii ), редкой оппортунистической инфекции. известно, что это происходит у людей с очень ослабленной иммунной системой. [ 140 ] Вскоре после этого исследователи из Медицинской школы Нью-Йоркского университета изучали у мужчин-геев развитие ранее редкого рака кожи, называемого саркомой Капоши (СК). [ 141 ] [ 142 ] Появилось гораздо больше случаев PJP и KS, что предупредило Центры по контролю и профилактике заболеваний США (CDC), и для наблюдения за вспышкой была сформирована целевая группа CDC. [ 143 ] Считается, что самый ранний ретроспективно описанный случай СПИДа произошел в Норвегии в 1966 году. [ 144 ]

Вначале у CDC не было официального названия этого заболевания, часто называя его в виде связанных с ним заболеваний, например, лимфаденопатии — заболевания, в честь которого первооткрыватели ВИЧ первоначально назвали вирус. [ 145 ] [ 146 ] Они также использовали книгу Капоши «Саркома и оппортунистические инфекции» — название, под которым в 1981 году была создана целевая группа. [ 147 ] В широкой прессе был придуман термин ГРИД , обозначающий иммунодефицит геев . [ 148 ] CDC, в поисках названия и изучая зараженные сообщества, придумал «болезнь 4H», поскольку она, казалось, выделяла гомосексуалистов, потребителей героина, больных гемофилией и гаитян . [ 149 ] [ 150 ] Однако, установив, что СПИД не был изолирован только от гей-сообщества , [ 147 ] стало понятно, что термин GRID вводит в заблуждение, и СПИД был представлен на встрече в июле 1982 года. [ 151 ] К сентябрю 1982 года CDC начал использовать название «СПИД». [ 152 ]

В 1983 году две отдельные исследовательские группы во главе с американцем Робертом Галло и французскими исследователями Франсуазой Барре-Синусси и Люком Монтанье независимо друг от друга заявили, что новый ретровирус мог заражать больных СПИДом, и опубликовали свои выводы в том же выпуске журнала Science . [ 153 ] [ 146 ] [ 154 ] Галло утверждал, что вирус, выделенный его группой от человека, больного СПИДом, поразительно похож по форме на другие Т-лимфотропные вирусы человека (HTLV), которые его группа выделила первой. В 1987 году Галло признал, что вирус, который, как он утверждал, обнаружил в 1984 году, на самом деле был вирусом, присланным ему из Франции годом ранее. [ 155 ] Группа Галло назвала свой недавно выделенный вирус HTLV-III. Группа Монтанье выделила вирус от пациента, у которого наблюдались отек лимфатических узлов шеи и физическая слабость — два классических симптома первичной ВИЧ-инфекции. Вопреки отчету группы Галло, Монтанье и его коллеги показали, что основные белки этого вируса иммунологически отличаются от белков HTLV-I. Группа Монтанье назвала свой изолированный вирус вирусом, ассоциированным с лимфаденопатией (LAV). [ 143 ] Поскольку эти два вируса оказались одинаковыми, в 1986 году LAV и HTLV-III были переименованы в ВИЧ. [ 156 ]

Другой группой, работавшей одновременно с группами Монтанье и Галло, была группа Джея А. Леви из Калифорнийского университета в Сан-Франциско . Он независимо открыл вирус СПИДа в 1983 году и назвал его СПИД-ассоциированным ретровирусом (АРВ). [ 157 ] Этот вирус сильно отличался от вируса, о котором сообщили группы Монтанье и Галло. Штаммы АРВ-препаратов впервые показали гетерогенность изолятов ВИЧ, и некоторые из них остаются классическими примерами вируса СПИДа, обнаруженного в Соединенных Штатах. [ 158 ]

Происхождение

Считается, что и ВИЧ-1, и ВИЧ-2 возникли у приматов в западно-центральной Африке и, как полагают, передались человеку (процесс, известный как зооноз ) в начале 20 века. [ 159 ] [ 160 ]

ВИЧ-1, по-видимому, возник в южном Камеруне в результате эволюции SIVcpz, вируса иммунодефицита обезьян (SIV), который поражает диких шимпанзе (ВИЧ-1 происходит от SIVcpz, эндемичного для подвида шимпанзе Pan troglodytes troglodytes ). [ 161 ] [ 162 ] Ближайшим родственником ВИЧ-2 является SIVsmm, вирус сажистого мангабея ( Cercocebus atys atys ), обезьяны Старого Света, обитающей в прибрежной части Западной Африки (от южного Сенегала до западного Кот-д'Ивуара ). [ 21 ] Обезьяны Нового Света, такие как совы, устойчивы к инфекции ВИЧ-1, возможно, из-за геномного слияния двух генов вирусной устойчивости. [ 163 ]

Считается, что ВИЧ-1 преодолевал видовой барьер как минимум трижды, давая начало трем группам вируса: M, N и O. [ 164 ]

Слева направо: африканские зеленые мартышки — источник ВИО , сажистый мангабей — источник ВИЧ-2 и шимпанзе — источник ВИЧ-1.

Есть свидетельства того, что люди, которые участвуют в добыче мяса диких животных в качестве охотников или продавцов мяса диких животных, обычно заражаются ВИО. [ 165 ] Однако SIV — слабый вирус, и иммунная система человека обычно подавляет его в течение нескольких недель после заражения. Считается, что необходимо несколько передач вируса от человека к человеку в быстрой последовательности, чтобы дать ему достаточно времени для мутации в ВИЧ. [ 166 ] Более того, из-за относительно низкой скорости передачи от человека к человеку он может распространяться среди населения только при наличии одного или нескольких каналов передачи высокого риска, которые, как полагают, отсутствовали в Африке до 20-го века.

Конкретные предполагаемые каналы передачи высокого риска, позволяющие вирусу адаптироваться к человеку и распространяться по всему обществу, зависят от предполагаемых сроков скрещивания животного с человеком. Генетические исследования вируса предполагают, что самый последний общий предок группы ВИЧ-1 M датируется ок . 1910 год . [ 167 ] Сторонники этой датировки связывают эпидемию ВИЧ с возникновением колониализма и ростом крупных колониальных африканских городов, что приводит к социальным изменениям, включая различные модели сексуальных контактов (особенно множественные, одновременные партнерства), распространение проституции и сопутствующую высокую частоту генитальных язвенных заболеваний (таких как сифилис ) в зарождающихся колониальных городах. [ 168 ] Хотя уровень передачи ВИЧ во время вагинального полового акта обычно невелик, он многократно увеличивается, если у одного из партнеров есть инфекция, передающаяся половым путем, приводящая к образованию язв на половых органах. Колониальные города начала 1900-х годов отличались высокой распространенностью проституции и генитальных язв до такой степени, что по состоянию на 1928 год до 45% жительниц восточного Леопольдвилля (ныне Киншаса) считались проститутками, а по состоянию на 1933 год - около 15%. всех жителей одного и того же города были заражены одной из форм сифилиса . [ 168 ]

Самый ранний, хорошо документированный случай заражения ВИЧ у человека датируется 1959 годом в Бельгийском Конго . [ 169 ] Вирус мог присутствовать в Соединенных Штатах еще в середине-конце 1960-х годов, когда у шестнадцатилетнего мужчины по имени Роберт Рейфорд появились симптомы в 1966 году и он умер в 1969 году. [ 170 ]

Альтернативная и, вероятно, дополнительная гипотеза указывает на широкое использование небезопасных медицинских практик в Африке в годы после Второй мировой войны, таких как нестерильное повторное использование одноразовых шприцев во время массовой вакцинации, кампаний по лечению антибиотиками и против малярии. [ 166 ] [ 171 ] [ 172 ] Исследования времени появления самого недавнего общего предка групп M и O ВИЧ-1, а также групп A и B ВИЧ-2 показывают, что ВИО привел к появлению трансмиссивных линий ВИЧ на протяжении всего двадцатого века. [ 173 ] Рассредоточенное время передачи ВИЧ людям означает, что для объяснения межвидовой передачи ВИЧ не требуется какого-либо единого внешнего фактора. Это наблюдение согласуется с двумя преобладающими взглядами на происхождение эпидемии ВИЧ, а именно с передачей ВИО человеку во время забоя или разделки инфицированных приматов, а также с колониальной экспансией африканских городов к югу от Сахары. [ 173 ]

См. также

Ссылки

  1. ^ Вайс Р.А. (май 1993 г.). «Как ВИЧ вызывает СПИД?». Наука . 260 (5112): 1273–9. Бибкод : 1993Sci...260.1273W . дои : 10.1126/science.8493571 . ПМИД   8493571 .
  2. ^ Дуек Д.С., Редерер М., Куп Р.А. (2009). «Новые концепции иммунопатогенеза СПИДа» . Ежегодный обзор медицины . 60 : 471–84. дои : 10.1146/annurev.med.60.041807.123549 . ПМК   2716400 . ПМИД   18947296 .
  3. ^ Jump up to: а б Пауэлл М.К., Бенкова К., Селинджер П., Догоши М., Кинкорова Луначкова И., Кутникова Х., Лаштикова Дж., Рубичкова А., Шпуркова З., Лацлова Л., Эйс В., Шах Дж., Хенеберг П. (2016). «Оппортунистические инфекции у ВИЧ-инфицированных пациентов сильно различаются по частоте и спектрам между пациентами с низким количеством клеток CD4+, обследованными посмертно, и пациентами с компенсацией, обследованными прижизненно, независимо от эпохи ВААРТ» . ПЛОС ОДИН . 11 (9): e0162704. Бибкод : 2016PLoSO..1162704P . дои : 10.1371/journal.pone.0162704 . ПМК   5017746 . ПМИД   27611681 .
  4. ^ ЮНЭЙДС, ВОЗ (декабрь 2007 г.). «Обзор эпидемии СПИДа за 2007 год» (PDF) . п. 16.
  5. ^ Jump up to: а б с д и Роджер А.Дж., Камбиано В., Брюун Т., Вернацца П., Коллинз С., Деген О. и др. (июнь 2019 г.). «Риск передачи ВИЧ при сексе без презервативов в сероразличных гей-парах с ВИЧ-положительным партнером, принимающим супрессивную антиретровирусную терапию (ПАРТНЕР): окончательные результаты многоцентрового проспективного обсервационного исследования» . Ланцет . 393 (10189): 2428–2438. дои : 10.1016/S0140-6736(19)30418-0 . ПМК   6584382 . ПМИД   31056293 .
  6. ^ Jump up to: а б с Эйзингер Р.В., Диффенбах К.В., Фаучи А.С. (февраль 2019 г.). «Вирусная нагрузка ВИЧ и трансмиссивность ВИЧ-инфекции: неопределяемое равно непередаваемому». ДЖАМА . 321 (5): 451–452. дои : 10.1001/jama.2018.21167 . ПМИД   30629090 . S2CID   58599661 .
  7. ^ Мабука Дж., Ндуати Р., Одем-Дэвис К., Петерсон Д., Овербо Дж. (2012). Дерозье RC (ред.). «ВИЧ-специфические антитела, способные образовывать ADCC, часто встречаются в грудном молоке и связаны со снижением риска передачи инфекции у женщин с высокой вирусной нагрузкой» . ПЛОС Патогены . 8 (6): e1002739. дои : 10.1371/journal.ppat.1002739 . ПМЦ   3375288 . ПМИД   22719248 .
  8. ^ Хан Р.А., Инхорн MC, ред. (2009). Антропология и общественное здравоохранение: преодоление различий в культуре и обществе (2-е изд.). Оксфорд: Издательство Оксфордского университета. п. 449. ИСБН  978-0-19-537464-3 . OCLC   192042314 .
  9. ^ Мид Миннесота (2008). «Загрязнители в грудном молоке: взвешивание рисков и преимуществ грудного вскармливания» . Перспективы гигиены окружающей среды . 116 (10): А426–34. дои : 10.1289/ehp.116-a426 . ПМК   2569122 . ПМИД   18941560 . Архивировано из оригинала 6 ноября 2008 года.
  10. ^ Общественное достояние В эту статью включен текст из этого источника, который находится в свободном доступе : «Профилактика передачи ВИЧ от матери ребенку» . ВИЧ.gov . 15 мая 2017 г. Проверено 8 декабря 2017 г.
  11. ^ Каннингем А.Л., Донахи Х., Харман А.Н., Ким М., Тервилл С.Г. (август 2010 г.). «Манипулирование функцией дендритных клеток вирусами». Современное мнение в микробиологии . 13 (4): 524–9. дои : 10.1016/j.mib.2010.06.002 . ПМИД   20598938 .
  12. ^ Дойтш Г., Галлоуэй Н.Л., Гэн Х, Ян З., Монро К.М., Зепеда О. и др. (январь 2014 г.). «Гибель клеток в результате пироптоза приводит к истощению Т-клеток CD4 при инфекции ВИЧ-1» . Природа . 505 (7484): 509–14. Бибкод : 2014Natur.505..509D . дои : 10.1038/nature12940 . ПМК   4047036 . ПМИД   24356306 .
  13. ^ Гарг Х., Мол Дж., Джоши А. (ноябрь 2012 г.). «ВИЧ-1-индуцированный апоптоз свидетеля» . Вирусы . 4 (11): 3020–43. дои : 10.3390/v4113020 . ПМК   3509682 . ПМИД   23202514 .
  14. ^ Кумар В. (2012). Основная патология Роббинса (9-е изд.). Elsevier Науки о здоровье. п. 147. ИСБН  978-1-4557-3787-1 .
  15. ^ Международный комитет по таксономии вирусов (2002 г.). «61.0.6.Лентивирус» . Национальные институты здравоохранения . Архивировано из оригинала 14 октября 2006 года . Проверено 28 февраля 2006 г. {{cite web}}: CS1 maint: неподходящий URL ( ссылка )
  16. ^ Международный комитет по таксономии вирусов (2002 г.). «61. Ретровирусиды» . Национальные институты здравоохранения. Архивировано из оригинала 2 октября 2006 года . Проверено 28 февраля 2006 г. {{cite web}}: CS1 maint: неподходящий URL ( ссылка )
  17. ^ Леви Дж. А. (ноябрь 1993 г.). «Патогенез ВИЧ и долгосрочная выживаемость». СПИД . 7 (11): 1401–10. дои : 10.1097/00002030-199311000-00001 . ПМИД   8280406 .
  18. ^ Смит Дж. А., Дэниел Р. (май 2006 г.). «По пути вируса: использование механизмов репарации ДНК хозяина ретровирусами». АКС Химическая биология . 1 (4): 217–26. дои : 10.1021/cb600131q . ПМИД   17163676 .
  19. ^ Jump up to: а б Силициано РФ, Грин У.К. (сентябрь 2011 г.). «Латентный период ВИЧ» . Перспективы Колд-Спринг-Харбора в медицине . 1 (1): а007096. doi : 10.1101/cshperspect.a007096 . ПМК   3234450 . ПМИД   22229121 .
  20. ^ Гилберт П.Б., МакКег И.В., Эйзен Г., Маллинз С., Гей-Ндиай А., Мбоуп С., Канки П.Дж. (28 февраля 2003 г.). «Сравнение инфекционности ВИЧ-1 и ВИЧ-2 по результатам проспективного когортного исследования в Сенегале». Статистика в медицине . 22 (4): 573–593. дои : 10.1002/сим.1342 . ПМИД   12590415 . S2CID   28523977 .
  21. ^ Jump up to: а б Ривз JD, Домс RW (2002). «Вирус иммунодефицита человека 2-го типа» . Журнал общей вирусологии . 83 (Часть 6): 1253–65. дои : 10.1099/0022-1317-83-6-1253 . ПМИД   12029140 .
  22. ^ Макговерн С.Л., Казелли Э., Григорьев Н., Шойчет Б.К. (2002). «Общий механизм, лежащий в основе беспорядочных ингибиторов виртуального и высокопроизводительного скрининга». Журнал медицинской химии . 45 (8): 1712–22. дои : 10.1021/jm010533y . hdl : 11380/977912 . ПМИД   11931626 .
  23. ^ По сравнению с обзором в: Фишер Б., Харви Р.П., Чамп ПК (2007). Иллюстрированные обзоры Липпинкотта: Микробиология . Хагерстаун, Мэриленд: Липпинкотт Уильямс и Уилкинс. п. 3. ISBN  978-0-7817-8215-9 .
  24. ^ Jump up to: а б с д и ж г Разное (2008). Сборник последовательностей ВИЧ, 2008 г. Введение (PDF) . Проверено 31 марта 2009 г.
  25. ^ Jump up to: а б с Чан, округ Колумбия, Фасс Д., Бергер Дж. М., Ким П. С. (апрель 1997 г.). «Основная структура gp41 гликопротеина оболочки ВИЧ» (PDF) . Клетка . 89 (2): 263–73. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80205-6 . ПМИД   9108481 . S2CID   4518241 .
  26. ^ Кляйн Дж. С., Бьоркман П. Дж. (май 2010 г.). «Немногие и редкие: как ВИЧ может уклоняться от авидности антител» . ПЛОС Патогены . 6 (5): e1000908. дои : 10.1371/journal.ppat.1000908 . ПМЦ   2877745 . ПМИД   20523901 .
  27. ^ Национальный институт здравоохранения (17 июня 1998 г.). «Кристаллическая структура ключевого белка ВИЧ открывает новые цели профилактики и лечения» (пресс-релиз). Архивировано из оригинала 19 февраля 2006 года . Проверено 14 сентября 2006 г.
  28. ^ Беренс А.Дж., Васильевич С., Притчард Л.К., Харви Д.Дж., Андев Р.С., Крумм С.А. и др. (март 2016 г.). «Состав и антигенные эффекты отдельных гликановых участков тримерного гликопротеина оболочки ВИЧ-1» . Отчеты по ячейкам . 14 (11): 2695–706. дои : 10.1016/j.celrep.2016.02.058 . ПМЦ   4805854 . ПМИД   26972002 .
  29. ^ Притчард Л.К., Спенсер Д.И., Ройл Л., Бономелли С., Сибрайт Г.Е., Беренс А.Дж. и др. (июнь 2015 г.). «Кластеризация гликанов стабилизирует маннозный участок ВИЧ-1 и сохраняет уязвимость к нейтрализующим антителам широкого спектра действия» . Природные коммуникации . 6 : 7479. Бибкод : 2015NatCo...6.7479P . дои : 10.1038/ncomms8479 . ПМЦ   4500839 . ПМИД   26105115 .
  30. ^ Притчард Л.К., Харви DJ, Бономелли С., Криспин М., Дорес К.Дж. (сентябрь 2015 г.). «Клеточно- и белково-направленное гликозилирование нативной расщепленной оболочки ВИЧ-1» . Журнал вирусологии . 89 (17): 8932–44. дои : 10.1128/JVI.01190-15 . ПМК   4524065 . ПМИД   26085151 .
  31. ^ Криспин М., Дорес К.Дж. (апрель 2015 г.). «Нацеливание гликанов, полученных от хозяина, на вирусы с оболочкой для разработки вакцин на основе антител» . Современное мнение в вирусологии . 11 : 63–9. дои : 10.1016/j.coviro.2015.02.002 . ПМЦ   4827424 . ПМИД   25747313 .
  32. ^ Жюльен Дж.П., Купо А., Сок Д., Стэнфилд Р.Л., Люмкис Д., Деллер М.К. и др. (декабрь 2013 г.). «Кристаллическая структура растворимого расщепленного тримера оболочки ВИЧ-1» . Наука . 342 (6165): 1477–83. Бибкод : 2013Sci...342.1477J . дои : 10.1126/science.1245625 . ПМЦ   3886632 . ПМИД   24179159 .
  33. ^ Люмкис Д., Жюльен Ж.П., де Валь Н., Купо А., Поттер К.С., Класс П.Дж. и др. (декабрь 2013 г.). «Крио-ЭМ структура полностью гликозилированного растворимого расщепленного тримера оболочки ВИЧ-1» . Наука . 342 (6165): 1484–90. Бибкод : 2013Sci...342.1484L . дои : 10.1126/science.1245627 . ПМЦ   3954647 . ПМИД   24179160 .
  34. ^ Сандерс Р.В., Деркинг Р., Купо А., Жюльен Дж.П., Ясмин А., де Валь Н. и др. (сентябрь 2013 г.). «Расщепленный растворимый тример Env ВИЧ-1 следующего поколения, BG505 SOSIP.664 gp140, экспрессирует множество эпитопов для широко нейтрализующих, но не ненейтрализующих антител» . ПЛОС Патогены . 9 (9): e1003618. дои : 10.1371/journal.ppat.1003618 . ПМЦ   3777863 . ПМИД   24068931 .
  35. ^ Притчард Л.К., Василевич С., Озоровский Г., Сибрайт Г.Е., Купо А., Ринг Р. и др. (июнь 2015 г.). «Структурные ограничения определяют гликозилирование тримеров оболочки ВИЧ-1» . Отчеты по ячейкам . 11 (10): 1604–13. дои : 10.1016/j.celrep.2015.05.017 . ПМЦ   4555872 . ПМИД   26051934 .
  36. ^ де Тайе С.В., Озоровский Г., Торрентс де ла Пенья А., Гуттман М., Жюльен Дж.П., ван ден Керкхоф Т.Л. и др. (декабрь 2015 г.). «Иммуногенность стабилизированных тримеров оболочки ВИЧ-1 с уменьшенным воздействием ненейтрализующих эпитопов» . Клетка . 163 (7): 1702–15. дои : 10.1016/j.cell.2015.11.056 . ПМЦ   4732737 . ПМИД   26687358 .
  37. ^ Уэлле Д.Л., Планте И., Ландри П., Барат С., Джанель М.Э., Фламанд Л., Трембле М.Дж., Провост П. (апрель 2008 г.). «Идентификация функциональных микроРНК, высвобождаемых в результате асимметричного процессинга элемента TAR ВИЧ-1» . Исследования нуклеиновых кислот . 36 (7): 2353–65. дои : 10.1093/нар/gkn076 . ПМК   2367715 . ПМИД   18299284 .
  38. ^ Клас З., Виноград Р., Дэвис Дж., Карпио Л., Хилдрет Р., Гейдариан М., Фу С., Маккефри Т., Мейри Э., Аяш-Рашковский М., Гилад С., Бентвич З., Кашанчи Ф. (2009). «МиРНК TAR ВИЧ-1 защищает от апоптоза, изменяя экспрессию клеточных генов» . Ретровирусология . 6 (1): 18. дои : 10.1186/1742-4690-6-18 . ПМЦ   2654423 . ПМИД   19220914 .
  39. ^ Васудеван А.А., Смитс С.Х., Хеппнер А., Хойсингер Д., Кениг Б.В., Мунк С. (ноябрь 2013 г.). «Структурные особенности антивирусных ДНК-цитидиндезаминаз» . Биологическая химия (Представлена ​​рукопись). 394 (11): 1357–70. дои : 10.1515/hsz-2013-0165 . ПМИД   23787464 . S2CID   4151961 .
  40. ^ Гарсия СП, Миллер А.Д. (апрель 1991 г.). «Независимое от фосфорилирования серина подавление CD4 на клеточной поверхности с помощью nef». Природа . 350 (6318): 508–11. Бибкод : 1991Natur.350..508G . дои : 10.1038/350508a0 . ПМИД   2014052 . S2CID   1628392 .
  41. ^ Шварц О., Марешаль В., Ле Галл С., Лемонье Ф., Херд Дж. М. (март 1996 г.). «Эндоцитоз молекул главного комплекса гистосовместимости класса I индуцируется белком Nef ВИЧ-1». Природная медицина . 2 (3): 338–42. дои : 10.1038/nm0396-338 . ПМИД   8612235 . S2CID   7461342 .
  42. ^ Стамптнер-Кувелетт П., Моршуан С., Дугаст М., Ле Галл С., Рапозо Г., Шварц О., Бенарох П. (октябрь 2001 г.). «ВИЧ-1 Nef ухудшает презентацию и поверхностную экспрессию антигена MHC класса II» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (21): 12144–9. Бибкод : 2001PNAS...9812144S . дои : 10.1073/pnas.221256498 . ПМК   59782 . ПМИД   11593029 .
  43. ^ Аррилдт К.Т., Джозеф С.Б., Суонстром Р. (март 2012 г.). «Белок env ВИЧ-1: разноцветная оболочка» . Текущие отчеты о ВИЧ/СПИДе . 9 (1): 52–63. дои : 10.1007/s11904-011-0107-3 . ПМЦ   3658113 . ПМИД   22237899 .
  44. ^ Jump up to: а б Бергер Э.А., Домс Р.В., Феньё Э.М., Корбер Б.Т., Литтман Д.Р., Мур Дж.П., Саттентау К.Дж., Шуйтемейкер Х., Содроски Дж., Вайс Р.А. (1998). Новая классификация ВИЧ-1 « Природа 391 (6664): 240. Бибкод : 1998Nature.391..240B . дои : 10.1038/34571 . ПМИД   9440686 . S2CID   2159146 .
  45. ^ Jump up to: а б с Коакли Э., Петропулос С.Дж., Уиткомб Дж.М. (2005). «Оценка использования корецептора ch-vbгемокина при ВИЧ». Современное мнение об инфекционных заболеваниях . 18 (1): 9–15. дои : 10.1097/00001432-200502000-00003 . ПМИД   15647694 . S2CID   30923492 .
  46. ^ Дэн Х., Лю Р., Эллмайер В., Чой С., Унутмаз Д., Беркхарт М., Ди Марцио П., Мармон С., Саттон Р.Э., Хилл К.М., Дэвис С.Б., Пайпер С.С., Шалл Т.Дж., Литтман Д.Р., Ландау Н.Р. (1996). «Идентификация основного корецептора первичных изолятов ВИЧ-1». Природа . 381 (6584): 661–6. Бибкод : 1996Natur.381..661D . дои : 10.1038/381661a0 . ПМИД   8649511 . S2CID   37973935 .
  47. ^ Фэн Ю., Бродер К.С., Кеннеди П.Е., Бергер Э.А. (1996). «Кофактор входа ВИЧ-1: функциональное клонирование кДНК семитрансмембранного рецептора, связанного с G-белком» . Наука . 272 (5263): 872–7. Бибкод : 1996Sci...272..872F . дои : 10.1126/science.272.5263.872 . ПМЦ   3412311 . ПМИД   8629022 . S2CID   44455027 .
  48. ^ Найт С.К., Макатония С.Е., Паттерсон С. (1990). «ВИЧ I-инфекция дендритных клеток». Международное обозрение иммунологии . 6 (2–3): 163–75. дои : 10.3109/08830189009056627 . ПМИД   2152500 .
  49. ^ Тан Дж, Каслоу Р.А. (2003). «Влияние генетики хозяина на ВИЧ-инфекцию и прогрессирование заболевания в эпоху высокоактивной антиретровирусной терапии» . СПИД . 17 (Приложение 4): S51–S60. дои : 10.1097/00002030-200317004-00006 . ПМИД   15080180 .
  50. ^ Чжу Т, Мо Х, Ван Н, Нам Д.С., Цао Ю, Куп Р.А., Хо Д.Д. (1993). «Генотипическая и фенотипическая характеристика больных ВИЧ-1 с первичной инфекцией». Наука . 261 (5125): 1179–81. Бибкод : 1993Sci...261.1179Z . дои : 10.1126/science.8356453 . ПМИД   8356453 .
  51. ^ Вант Ваут А.Б., Коотстра Н.А., Малдер-Кампинга Г.А., Альбрехт-ван Лент Н., Шерпбир Х.Дж., Венстра Дж., Бур К., Коутиньо Р.А., Мидема Ф., Шуитемейкер Х (1994). «Макрофаготропные варианты инициируют заражение вирусом иммунодефицита человека типа 1 после половой, парентеральной и вертикальной передачи» . Журнал клинических исследований . 94 (5): 2060–7. дои : 10.1172/JCI117560 . ПМЦ   294642 . ПМИД   7962552 .
  52. ^ Чжу Т., Ван Н., Карр А., Нам Д.С., Мур-Янковски Р., Купер Д.А., Хо Д.Д. (1996). «Генетическая характеристика вируса иммунодефицита человека типа 1 в крови и генитальных выделениях: доказательства разделения вируса и селекции при передаче половым путем» . Журнал вирусологии . 70 (5): 3098–107. doi : 10.1128/JVI.70.5.3098-3107.1996 . ЧВК   190172 . ПМИД   8627789 .
  53. ^ Клевестиг П., Малькович И., Каспер С., Карленор Э., Линдгрен С., Навер Л., Болин А.Б., Феньё Э.М., Лейтнер Т., Эрнст А. (2005). «Фенотип X4 ВИЧ типа 1 развивается из R5 у двух детей от матерей, несущих X4, и не связан с передачей». Исследования СПИДа и ретровирусы человека . 21 (5): 371–8. дои : 10.1089/aid.2005.21.371 . ПМИД   15929699 .
  54. ^ Мур Дж. П. (1997). «Корецепторы: значение для патогенеза и терапии ВИЧ». Наука . 276 (5309): 51–2. дои : 10.1126/science.276.5309.51 . ПМИД   9122710 . S2CID   33262844 .
  55. ^ Карлссон А., Парсмир К., Аперия К., Сандстрем Э., Феньё Э.М., Альберт Дж (1994). «Тропизм клеток МТ-2 изолятов вируса иммунодефицита человека типа 1 как маркер ответа на лечение и развития лекарственной устойчивости». Журнал инфекционных болезней . 170 (6): 1367–75. дои : 10.1093/infdis/170.6.1367 . ПМИД   7995974 .
  56. ^ Кут М., ван 'т Ваут А.Б., Кустра Н.А., де Гёде Р.Е., Терсметте М., Шуйтемейкер Х (1996). «Связь между изменениями клеточной нагрузки, эволюцией вирусного фенотипа и клональным составом вирусных популяций при инфицировании вирусом иммунодефицита человека 1 типа» . Журнал инфекционных болезней . 173 (2): 349–54. дои : 10.1093/infdis/173.2.349 . ПМИД   8568295 .
  57. ^ Чейни К., Макнайт А. (2010). «Тропизм и болезни ВИЧ-2». Лентивирусы и макрофаги: молекулярные и клеточные взаимодействия . Кайстер Академик Пресс . ISBN  978-1-904455-60-8 . [ нужна страница ]
  58. ^ Jump up to: а б с д и ж г Чан, округ Колумбия, Ким П.С. (1998). «Проникновение ВИЧ и его ингибирование» . Клетка . 93 (5): 681–4. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81430-0 . ПМИД   9630213 . S2CID   10544941 .
  59. ^ Jump up to: а б с д и ж Вятт Р., Содроски Дж. (1998). «Гликопротеины оболочки ВИЧ-1: фузогены, антигены и иммуногены». Наука . 280 (5371): 1884–8. Бибкод : 1998Sci...280.1884W . дои : 10.1126/science.280.5371.1884 . ПМИД   9632381 .
  60. ^ Jump up to: а б Артос Дж., Чикала С., Мартинелли Е., Маклауд К., Ван Рик Д., Вэй Д., Сяо З., Венстра Т.Д., Конрад Т.П., Лемпицки Р.А., Маклафлин С., Паскуччо М., Гопол Р., МакНелли Дж., Круз CC, Ченсоплано Н., Чунг Э, Рейтано К.Н., Коттилил С., Гуд DJ, Фаучи А.С. (2008). «Белок оболочки ВИЧ-1 связывается и передает сигналы через интегрин альфа (4) бета (7), рецептор самонаведения слизистой оболочки кишечника для периферических Т-клеток». Природная иммунология . 9 (3): 301–9. дои : 10.1038/ni1566 . ПМИД   18264102 . S2CID   205361178 .
  61. ^ Jump up to: а б Папа М., Хаасе А.Т. (2003). «Передача, острая инфекция ВИЧ-1 и поиск стратегий предотвращения инфекции» . Природная медицина . 9 (7): 847–52. дои : 10.1038/nm0703-847 . ПМИД   12835704 . S2CID   26570505 .
  62. ^ Хедике Дж., Браун С., Нагави М.Х. (август 2009 г.). «Мозгоспецифичный фактор FEZ1 является определяющим фактором восприимчивости нейронов к инфекции ВИЧ-1» . Труды Национальной академии наук . 106 (33): 14040–14045. Бибкод : 2009PNAS..10614040H . дои : 10.1073/pnas.0900502106 . ПМК   2729016 . ПМИД   19667186 .
  63. ^ Даеке Дж., Факлер О.Т., Диттмар М.Т., Кроусслих Х.Г. (2005). «Участие клатрин-опосредованного эндоцитоза в проникновении вируса иммунодефицита человека типа 1» . Журнал вирусологии . 79 (3): 1581–1594. дои : 10.1128/jvi.79.3.1581-1594.2005 . ПМК   544101 . ПМИД   15650184 .
  64. ^ Мияучи К., Ким Ю., Латинович О., Морозов В., Меликян ГБ (2009). «ВИЧ проникает в клетки посредством эндоцитоза и динамин-зависимого слияния с эндосомами» . Клетка . 137 (3): 433–444. дои : 10.1016/j.cell.2009.02.046 . ПМК   2696170 . ПМИД   19410541 .
  65. ^ Кох П., Лампе М., Годинес В.Дж., Мюллер Б., Рор К., Кроусслих Х.Г., Леманн М.Дж. (2009). «Визуализация слияния псевдотипированных частиц ВИЧ-1 в реальном времени с помощью микроскопии живых клеток» . Ретровирусология . 6:84 . дои : 10.1186/1742-4690-6-84 . ПМЦ   2762461 . ПМИД   19765276 .
  66. ^ Торли Дж.А., Маккитинг Дж.А., Раппопорт Дж.З. (2010). «Механизмы проникновения вируса: пробраться через парадную дверь» . Протоплазма . 244 (1–4): 15–24. дои : 10.1007/s00709-010-0152-6 . ПМК   3038234 . ПМИД   20446005 .
  67. ^ Перманьер М., Баллана Э., Эсте Ж.А. (2010). «Эндоцитоз ВИЧ: все возможно». Тенденции в микробиологии . 18 (12): 543–551. дои : 10.1016/j.tim.2010.09.003 . ПМИД   20965729 .
  68. ^ Jump up to: а б с Чжэн Ю.Х., Ловсин Н., Петерлин Б.М. (2005). «Недавно идентифицированные факторы хозяина модулируют репликацию ВИЧ». Письма по иммунологии . 97 (2): 225–34. дои : 10.1016/j.imlet.2004.11.026 . ПМИД   15752562 .
  69. ^ «IV. Вирусы> F. Жизненные циклы вирусов животных> 3. Жизненный цикл ВИЧ» . Домашняя страница доктора Кайзера по микробиологии . Общественный колледж округа Балтимор. Январь 2008 г. Архивировано из оригинала 26 июля 2010 г.
  70. ^ Хискотт Дж., Квон Х., Генен П. (2001). «Враждебные поглощения: вирусное присвоение пути NF-kB» . Журнал клинических исследований . 107 (2): 143–151. дои : 10.1172/JCI11918 . ЧВК   199181 . ПМИД   11160127 .
  71. ^ Кин С.К., Хенг Х, Лу К., Харитончик С., Рамакришнан В., Картер Дж., Бартон С., Хосик А., Флорвик А., Сантос Дж., Болден NC (22 мая 2015 г.). «Структура упаковки сигнала РНК ВИЧ-1» . Наука . 348 (6237): 917–921. Бибкод : 2015Sci...348..917K . дои : 10.1126/science.aaa9266 . ISSN   0036-8075 . ПМЦ   4492308 . ПМИД   25999508 .
  72. ^ Кин С.К., Ван В., Фрэнк Х.М., Шиандра К.А., МакКоуин С., Сантос Дж., Хенг Икс, Саммерс М.Ф. (10 октября 2016 г.). «ЯМР-обнаружение сайтов межмолекулярного взаимодействия в димерном 5'-лидере генома ВИЧ-1» . Труды Национальной академии наук . 113 (46): 13033–13038. Бибкод : 2016PNAS..11313033K . дои : 10.1073/pnas.1614785113 . ISSN   0027-8424 . ПМЦ   5135362 . ПМИД   27791166 .
  73. ^ Оквиея К.Э., Шерил-Микс С., Мукерджи Р., Кастерс-Аллен Р., Дэвид П., Браун М. и др. (ноябрь 2012 г.). «Динамическая регуляция популяций мРНК ВИЧ-1, анализируемая с помощью обогащения одиночных молекул и долгосрочного секвенирования» . Исследования нуклеиновых кислот . 40 (20): 10345–55. дои : 10.1093/nar/gks753 . ПМЦ   3488221 . ПМИД   22923523 .
  74. ^ Поллард В.В., Малим М.Х. (1998). «Белок ВИЧ-1 Rev». Ежегодный обзор микробиологии . 52 : 491–532. дои : 10.1146/annurev.micro.52.1.491 . ПМИД   9891806 .
  75. ^ Бутч М., Борис-Лори К. (апрель 2002 г.). «Судьба несплайсированной ретровирусной РНК: рибосома и/или вирион?» . Журнал вирусологии . 76 (7): 3089–94. doi : 10.1128/JVI.76.7.3089-3094.2002 . ПМК   136024 . ПМИД   11884533 .
  76. ^ Хельмунд С., Левер А.М. (июль 2016 г.). «Координация упаковки геномной РНК со сборкой вируса ВИЧ-1» . Вирусы . 8 (7): 192. дои : 10.3390/v8070192 . ПМЦ   4974527 . ПМИД   27428992 .
  77. ^ Сото-Рифо Р., Лимузен Т., Рубилар П.С., Риччи Э.П., Десимо Д., Монкорже О. и др. (март 2012 г.). «Различное влияние структуры TAR на трансляцию геномной РНК ВИЧ-1 и ВИЧ-2» . Исследования нуклеиновых кислот . 40 (6): 2653–67. дои : 10.1093/nar/gkr1093 . ПМЦ   3315320 . ПМИД   22121214 .
  78. ^ Саад Дж.С., Мюрио Д.М. (28 июля 2015 г.). Роль липидов в сборке вируса . Фронтирс Медиа С.А. ISBN  978-2-88919-582-4 .
  79. ^ Риччи Э.П., Эрбрето С.Х., Децимо Д., Шаупп А., Датта С.А., Рейн А. и др. (июль 2008 г.). «Экспрессия геномной РНК ВИЧ-2 in vitro контролируется тремя отдельными входными сегментами внутренних рибосом, которые регулируются протеазой ВИЧ и полипротеином Gag» . РНК . 14 (7): 1443–55. дои : 10.1261/rna.813608 . ПМК   2441975 . ПМИД   18495939 .
  80. ^ Jump up to: а б Ху В.С., Темин Х.М. (1990). «Ретровирусная рекомбинация и обратная транскрипция». Наука . 250 (4985): 1227–33. Бибкод : 1990Sci...250.1227H . дои : 10.1126/science.1700865 . ПМИД   1700865 .
  81. ^ Jump up to: а б Шарпантье С., Нора Т., Тенайлон О., Клавель Ф., Ханс А.Дж. (2006). «Обширная рекомбинация среди квазивидов вируса иммунодефицита человека типа 1 вносит важный вклад в вирусное разнообразие у отдельных пациентов» . Журнал вирусологии . 80 (5): 2472–82. doi : 10.1128/JVI.80.5.2472-2482.2006 . ПМЦ   1395372 . ПМИД   16474154 .
  82. ^ Нора Т., Шарпантье С., Тенайлон О., Хёде С., Клавель Ф., Ханс А.Дж. (2007). «Вклад рекомбинации в эволюцию вирусов иммунодефицита человека, проявляющих устойчивость к антиретровирусному лечению» . Журнал вирусологии . 81 (14): 7620–8. дои : 10.1128/JVI.00083-07 . ЧВК   1933369 . ПМИД   17494080 .
  83. ^ Чен Дж., Пауэлл Д., Ху В.С. (2006). «Высокая частота генетической рекомбинации является общей чертой репликации лентивирусов приматов» . Журнал вирусологии . 80 (19): 9651–8. дои : 10.1128/JVI.00936-06 . ПМК   1617242 . ПМИД   16973569 .
  84. ^ Jump up to: а б Бонхеффер С., Чаппи С., Паркин Н.Т., Уиткомб Дж.М., Петропулос С.Дж. (2004). «Доказательства положительного эпистаза ВИЧ-1». Наука . 306 (5701): 1547–50. Бибкод : 2004Sci...306.1547B . дои : 10.1126/science.1101786 . ПМИД   15567861 . S2CID   45784964 .
  85. ^ Исраэль Н., Гужеро-Посидало М.А. (1997). «Окислительный стресс при инфекции вируса иммунодефицита человека» . Клеточные и молекулярные науки о жизни . 53 (11–12): 864–70. дои : 10.1007/s000180050106 . ПМЦ   11147326 . ПМИД   9447238 . S2CID   22663454 .
  86. ^ Мишод Р.Э., Бернштейн Х., Недельку А.М. (май 2008 г.). «Адаптивное значение пола у микробных патогенов» (PDF) . Инфекция, генетика и эволюция . 8 (3): 267–85. Бибкод : 2008InfGE...8..267M . дои : 10.1016/j.meegid.2008.01.002 . ПМИД   18295550 . Архивировано из оригинала (PDF) 16 мая 2017 года . Проверено 10 мая 2013 г.
  87. ^ Халленбергер С., Бош В., Англикер Х., Шоу Э., Кленк Х.Д., Гартен В. (26 ноября 1992 г.). «Ингибирование опосредованной фурином активации расщепления гликопротеина gp160 ВИЧ-1». Природа . 360 (6402): 358–61. Бибкод : 1992Nature.360..358H . дои : 10.1038/360358a0 . ПМИД   1360148 . S2CID   4306605 .
  88. ^ Гелдерблом Х.Р. (1997). «Тонкая структура ВИЧ и ВИО» (PDF) . В Национальной лаборатории Лос-Аламоса (ред.). Сборник последовательностей ВИЧ . Лос-Аламосская национальная лаборатория . стр. 31–44.
  89. ^ Jump up to: а б с д Чжан С., Чжоу С., Гроппелли Е., Пеллегрино П., Уильямс И., Заем П., Чейн Б.М., Джолли С. (2015). «Гибридные механизмы распространения и активация Т-клеток формируют динамику инфекции ВИЧ-1» . PLOS Вычислительная биология . 11 (4): e1004179. arXiv : 1503.08992 . Бибкод : 2015PLSCB..11E4179Z . дои : 10.1371/journal.pcbi.1004179 . ПМЦ   4383537 . ПМИД   25837979 .
  90. ^ Jump up to: а б Джолли С., Кашефи К., Холлинсхед М., Саттентау QJ (2004). «Перенос от клетки ВИЧ-1 к клетке через Env-индуцированный актин-зависимый синапс» . Журнал экспериментальной медицины . 199 (2): 283–293. дои : 10.1084/jem.20030648 . ПМК   2211771 . ПМИД   14734528 .
  91. ^ Саттентау К (2008). «Избегая пустоты: распространение вирусов человека от клетки к клетке» . Обзоры природы Микробиология . 6 (11): 815–826. дои : 10.1038/nrmicro1972 . ПМИД   18923409 . S2CID   20991705 .
  92. ^ Дункан CJ, Рассел Р.А., Саттентау QJ (2013). «Высокая множественность передачи ВИЧ-1 от клетки к клетке от макрофагов к CD4+ Т-клеткам ограничивает эффективность антиретровирусной терапии» . СПИД . 27 (14): 2201–2206. дои : 10.1097/QAD.0b013e3283632ec4 . ПМЦ   4714465 . ПМИД   24005480 .
  93. ^ Севальд X, Гонсалес Д.Г., Хаберман А.М., Мотес В. (2012). «Визуализация вирусологических синапсов in vivo» . Природные коммуникации . 3 : 1320. Бибкод : 2012NatCo...3.1320S . дои : 10.1038/ncomms2338 . ПМЦ   3784984 . ПМИД   23271654 .
  94. ^ Сигал А., Ким Дж.Т., Балаж А.Б., Декель Э., Мэйо А., Майло Р., Балтимор Д. (2011). «Распространение ВИЧ от клетки к клетке позволяет продолжать репликацию, несмотря на антиретровирусную терапию» . Природа . 477 (7362): 95–98. Бибкод : 2011Natur.477...95S . дои : 10.1038/nature10347 . ПМИД   21849975 . S2CID   4409389 .
  95. ^ Jump up to: а б с д Робертсон Д.Л., Хан Б.Х., Sharp PM (1995). «Рекомбинация в вирусах СПИДа» . Журнал молекулярной эволюции . 40 (3): 249–59. Бибкод : 1995JMolE..40..249R . дои : 10.1007/BF00163230 . ПМИД   7723052 . S2CID   19728830 .
  96. ^ Рамбо А., Посада Д., Крэндалл К.А., Холмс Э.К. (январь 2004 г.). «Причины и последствия эволюции ВИЧ» . Обзоры природы Генетика . 5 (52–61): 52–61. дои : 10.1038/nrg1246 . ПМИД   14708016 . S2CID   5790569 .
  97. ^ Перельсон А.С., Рибейро Р.М. (октябрь 2008 г.). «Оценка эффективности лекарств и параметров вирусной динамики: ВИЧ и ВГС» . Статистика в медицине . 27 (23): 4647–57. дои : 10.1002/сим.3116 . ПМИД   17960579 . S2CID   33662579 .
  98. ^ Jump up to: а б Содора Д.Л., Аллан Дж.С., Апетрей С., Бренчли Дж.М., Дуек Д.С., Эльза Дж.Г., Эстес Дж.Д., Хан Б.Х., Хирш В.М., Каур А., Кирххофф Ф., Мюллер-Трутвин М., Пандреа И., Шмитц Дж.Э., Сильвестри Г. (2009). «На пути к вакцине против СПИДа: уроки естественного заражения вирусом иммунодефицита обезьян африканских приматов-хозяев» . Природная медицина . 15 (8): 861–865. дои : 10.1038/нм.2013 . ПМЦ   2782707 . ПМИД   19661993 .
  99. ^ Хользаммер С., Хольцнагель Э., Каул А., Курт Р., Норли С. (2001). «Высокая вирусная нагрузка у африканских зеленых мартышек, инфицированных естественным и экспериментальным путем SIVagm» . Вирусология . 283 (2): 324–31. дои : 10.1006/виро.2001.0870 . ПМИД   11336557 .
  100. ^ Курт Р., Норли С. (1996). «Почему у естественных хозяев ВИО не развивается обезьяний СПИД?». Журнал исследований НИЗ . 8 : 33–37.
  101. ^ Байер М., Диттмар М.Т., Цичутек К., Курт Р. (1991). «Разработка vivo генетической изменчивости вируса иммунодефицита обезьян» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 88 (18): 8126–30. Бибкод : 1991PNAS...88.8126B . дои : 10.1073/pnas.88.18.8126 . ПМК   52459 . ПМИД   1896460 .
  102. ^ Дэниел МД, Кинг Н.В., Летвин Н.Л., Хант Р.Д., Сегал П.К., Дерозье Р.К. (1984). «Новый ретровирус типа D, выделенный от макак с синдромом иммунодефицита». Наука . 223 (4636): 602–5. Бибкод : 1984Sci...223..602D . дои : 10.1126/science.6695172 . ПМИД   6695172 .
  103. ^ Jump up to: а б Кил Б.Ф., Джонс Дж.Х., Терио К.А., Эстес Дж.Д., Рудиселл Р.С., Уилсон М.Л., Ли Ю, Лир Г.Х., Бисли Т.М., Шумахер-Стэнки Дж., Вроблевски Э., Моссер А., Рафаэль Дж., Каменя С., Лонсдорф Э.В., Трэвис Д.А., Мленгея Т., Кинсель М.Дж., Эльс Дж.Г., Сильвестри Дж., Гудолл Дж., Шарп П.М., Шоу Г.М., Пьюзи А.Е., Хан Б.Х. (2009). «Повышенная смертность и СПИД-подобная иммунопатология у диких шимпанзе, инфицированных SIVcpz» . Природа . 460 (7254): 515–519. Бибкод : 2009Natur.460..515K . дои : 10.1038/nature08200 . ПМЦ   2872475 . ПМИД   19626114 .
  104. ^ Шиндлер М, Мюнх Дж, Куч О, Ли Х, Сантьяго МЛ, Биболле-Рюш Ф, Мюллер-Трутвин МЦ, Новембре Ф.Дж., Петерс М, Курно В., Бейлс Э., Рокес П., Содора Д.Л., Сильвестри Г., Шарп П.М., Хан БХ, Кирхгоф Ф (2006). «Nef-опосредованное подавление активации Т-клеток было утрачено в лентивирусной линии, давшей начало ВИЧ-1» . Клетка . 125 (6): 1055–67. дои : 10.1016/j.cell.2006.04.033 . ПМИД   16777597 . S2CID   15132918 .
  105. ^ Томсон М.М., Перес-Альварес Л., Нахера Р. (2002). «Молекулярная эпидемиология генетических форм ВИЧ-1 и ее значение для разработки вакцин и терапии». Ланцет инфекционных заболеваний . 2 (8): 461–471. дои : 10.1016/S1473-3099(02)00343-2 . ПМИД   12150845 .
  106. ^ Карр Дж.К., Фоли Б.Т., Лейтнер Т., Салминен М., Корбер Б., Маккатчан Ф. (1998). «Эталонные последовательности, представляющие основное генетическое разнообразие ВИЧ-1 во время пандемии» (PDF) . В Национальной лаборатории Лос-Аламоса (ред.). Сборник последовательностей ВИЧ . Лос-Аламос, Нью-Мексико : Национальная лаборатория Лос-Аламоса . стр. 10–19.
  107. ^ Османов С., Патту С., Уокер Н., Швардлендер Б., Эспарза Дж. (2002). «Оценочное глобальное и региональное распространение генетических подтипов ВИЧ-1 в 2000 году». Журнал синдромов приобретенного иммунодефицита . 29 (2): 184–190. дои : 10.1097/00042560-200202010-00013 . ПМИД   11832690 . S2CID   12536801 .
  108. ^ Перрин Л., Кайзер Л., Йерли С. (2003). «Путешествия и распространение генетических вариантов ВИЧ-1». Ланцет инфекционных заболеваний . 3 (1): 22–27. дои : 10.1016/S1473-3099(03)00484-5 . ПМИД   12505029 .
  109. ^ Jump up to: а б Плантье Х.К., Леоз М., Дикерсон Дж.Э., Де Оливейра Ф., Кордонье Ф., Леме В., Дамонд Ф., Робертсон Д.Л., Саймон Ф. (август 2009 г.). «Новый вирус иммунодефицита человека, полученный от горилл». Природная медицина . 15 (8): 871–2. дои : 10.1038/нм.2016 . ПМИД   19648927 . S2CID   76837833 .
  110. ^ Смит Л. (3 августа 2009 г.). «У женщины обнаружен новый штамм ВИЧ от гориллы» . Независимый . Проверено 27 ноября 2015 г.
  111. ^ Sharp PM, Хан Б.Х. (август 2010 г.). «Эволюция ВИЧ-1 и происхождение СПИДа» . Философские труды Лондонского королевского общества. Серия Б, Биологические науки . 365 (1552): 2487–94. дои : 10.1098/rstb.2010.0031 . ПМК   2935100 . ПМИД   20643738 .
  112. ^ Кил Б.Ф., Ван Хеуверсвин Ф., Ли Ю., Бэйлз Э., Такехиса Дж., Сантьяго М.Л. и др. (июль 2006 г.). «Резервуары пандемического и непандемического ВИЧ-1 у шимпанзе» . Наука . 313 (5786): 523–6. Бибкод : 2006Sci...313..523K . дои : 10.1126/science.1126531 . ПМК   2442710 . ПМИД   16728595 .
  113. ^ Jump up to: а б с д Кумаранаяке Л., Уоттс С. (2001). «Распределение ресурсов и определение приоритетов мер по борьбе с ВИЧ / СПИДом: борьба с генерализованной эпидемией в странах Африки к югу от Сахары». Журнал международного развития . 13 (4): 451–466. дои : 10.1002/jid.797 .
  114. ^ Кляйнман С. (сентябрь 2004 г.). «Информация для пациентов: Донорство и переливание крови» . До настоящего времени. Архивировано из оригинала 12 апреля 2008 года.
  115. ^ Jump up to: а б Центры по контролю и профилактике заболеваний (2001). «Пересмотренные рекомендации по консультированию, тестированию и направлению на ВИЧ». Рекомендации и отчеты MMWR . 50 (РР–19): 1–57. ПМИД   11718472 .
  116. ^ Селум КЛ, Кумбс Р.В., Лафферти В., Инуи Т.С., Луи П.Х., Гейтс К.А., Маккриди Б.Дж., Иган Р., Гроув Т., Александр С. (1991). «Вестерн-блоттинг неопределенного вируса иммунодефицита человека типа 1: риск сероконверсии, специфичность дополнительных тестов и алгоритм оценки». Журнал инфекционных болезней . 164 (4): 656–664. дои : 10.1093/infdis/164.4.656 . ПМИД   1894929 .
  117. ^ «Сравнение стран :: ВИЧ/СПИД – Смертность» . Всемирная книга фактов, Центральное разведывательное управление. Архивировано из оригинала 30 апреля 2017 года . Проверено 22 ноября 2015 г.
  118. ^ Чоу Р., Селф С., Дана Т., Бугатсос С., Захер Б., Блазина И., Кортуис П.Т. (ноябрь 2012 г.). «Скрининг на ВИЧ: систематический обзор для обновления рекомендаций Целевой группы по профилактическим службам США 2005 года» . Анналы внутренней медицины . 157 (10): 706–18. дои : 10.7326/0003-4819-157-10-201211200-00007 . ПМИД   23165662 . S2CID   27494096 .
  119. ^ Чоу Р., Хаффман Л.Х., Фу Р., Смитс А.К., Кортуис П.Т. (июль 2005 г.). «Скрининг на ВИЧ: обзор данных для Целевой группы профилактических служб США» . Анналы внутренней медицины . 143 (1): 55–73. дои : 10.7326/0003-4819-143-1-200507050-00010 . ПМИД   15998755 . S2CID   24086322 .
  120. ^ Толле М.А., Шварцвальд Х.Л. (июль 2010 г.). «Постконтактная профилактика вируса иммунодефицита человека» . Американский семейный врач . 82 (2): 161–6. ПМИД   20642270 . Архивировано из оригинала 28 ноября 2023 года.
  121. ^ «Краткое справочное руководство — Лабораторное тестирование для диагностики ВИЧ-инфекции: обновленные рекомендации» (PDF) . Центры по контролю и профилактике заболеваний . Департамент здравоохранения штата Нью-Йорк. 27 июня 2014 г. стр. 1–2. Архивировано из оригинала (PDF) 2 марта 2017 г. Проверено 13 апреля 2017 г.
  122. ^ «Лечение ВИЧ: лекарства от ВИЧ, одобренные FDA» . СПИДинфо. Архивировано из оригинала 23 февраля 2017 года . Проверено 7 октября 2016 г.
  123. ^ Родари А., Дарсис Дж., Ван Линт К.М. (29 сентября 2021 г.). «Текущий статус агентов, обращающих латентность, для ремиссии ВИЧ-1» . Ежегодный обзор вирусологии . 8 (1): 491–514. doi : 10.1146/annurev-virology-091919-103029 . ISSN   2327-056X . PMID   34586875 .
  124. ^ Швейцарская национальная комиссия по СПИДу (15 октября 2016 г.). «Швейцарское заявление» . ВИЧ i-Base . Проверено 2 апреля 2019 г.
  125. ^ Вернацца П., Бернард Э.Дж. (29 января 2016 г.). «ВИЧ не передается при полностью супрессивной терапии: швейцарское заявление – восемь лет спустя» . Швейцарский медицинский еженедельник . 146 : w14246. дои : 10.4414/smw.2016.14246 . ПМИД   26824882 .
  126. ^ Журнал Lancet ВИЧ (ноябрь 2017 г.). «U=U взлетает в 2017 году» . Редакция. «Ланцет». ВИЧ . 4 (11): е475. дои : 10.1016/S2352-3018(17)30183-2 . ПМИД   29096785 .
  127. ^ «Не могу передать это дальше» . Фонд Терренса Хиггинса . 2019. Архивировано из оригинала 7 апреля 2019 года . Проверено 2 апреля 2019 г.
  128. ^ Бавинтон Б.Р., Пинто А.Н., Фануфак Н., Гринштейн Б., Престейдж Г.П., Заблоцка-Манос И.Б. и др. (август 2018 г.). «Подавление вируса и передача ВИЧ в серодискордантных мужских парах: международное проспективное обсервационное когортное исследование». «Ланцет». ВИЧ . 5 (8): е438–е447. дои : 10.1016/S2352-3018(18)30132-2 . ПМИД   30025681 . S2CID   51702998 .
  129. ^ Роджер А.Дж., Камбиано В., Бруун Т., Вернацца П., Коллинз С., ван Лунзен Дж. и др. (июль 2016 г.). «Сексуальная активность без презервативов и риск передачи ВИЧ в сероразличных парах, когда ВИЧ-положительный партнер использует супрессивную антиретровирусную терапию» . ДЖАМА . 316 (2): 171–81. дои : 10.1001/jama.2016.5148 . ПМИД   27404185 .
  130. ^ Роджер А. (июль 2018 г.). Риск передачи ВИЧ при сексе без презервативов у пар МСМ с супрессивной АРТ: исследование PARTNER2 расширило результаты среди мужчин-геев . СПИД2018: 22-я Международная конференция по СПИДу. Амстердам, Нидерланды . Получено 2 апреля 2019 г.
  131. ^ Jump up to: а б с Хоффман Х. (10 января 2019 г.). «Наука ясна: в случае ВИЧ неопределяемое равно непередаваемому» (пресс-релиз). Национальные институты здравоохранения . Национальный институт аллергии и инфекционных заболеваний . Проверено 3 мая 2019 г. Директор NIAID Энтони С. Фаучи, доктор медицинских наук, и его коллеги обобщают результаты крупных клинических испытаний и когортных исследований, подтверждающих U=U. Знаменательное клиническое исследование HPTN 052, финансируемое НИЗ, показало, что среди ВИЧ-сероразличных гетеросексуальных пар не наблюдалось связанной передачи ВИЧ, когда у партнера, живущего с ВИЧ, была устойчиво подавленная вирусная нагрузка. Впоследствии исследования PARTNER и Opposites Attract подтвердили эти результаты и распространили их на пары мужчина-мужчина. ... Успех Н=Н как метода профилактики ВИЧ зависит от достижения и поддержания неопределяемой вирусной нагрузки путем ежедневного приема АРТ в соответствии с предписаниями.
  132. ^ Коэн М.С. , Чен Ю.К., МакКоли М., Гэмбл Т., Хоссейнипур М.К., Кумарасами Н. и др. (сентябрь 2016 г.). «Антиретровирусная терапия для профилактики передачи ВИЧ-1» . Медицинский журнал Новой Англии . 375 (9): 830–9. дои : 10.1056/NEJMoa1600693 . ПМК   5049503 . ПМИД   27424812 .
  133. ^ Ходсон М. (17 ноября 2017 г.). Н=Н: Разговор с пациентами о риске передачи инфекции (PDF) . Осенняя конференция Британской ассоциации по ВИЧ 2017 г. Проверено 3 мая 2019 г. ( резюме для презентации от имени NAM/Aidsmap )
  134. ^ «Консенсусное заявление: Риск передачи ВИЧ половым путем от человека, живущего с ВИЧ и имеющего неопределяемую вирусную нагрузку» . Кампания по предотвращению доступа . 21 июля 2016 года . Проверено 2 апреля 2019 г. Примечание . Когда заявление и список одобрений были получены, последний раз он обновлялся 23 августа 2018 года и включал «более 850 организаций из почти 100 стран».
  135. ^ Бозли С., Девлин Х. (3 мая 2019 г.). «Конец СПИДу уже близок, поскольку масштабное исследование показало, что лекарства останавливают передачу ВИЧ» . Хранитель . Проверено 3 мая 2019 г.
  136. ^ Чжу Дж., Хладик Ф., Вудворд А., Клок А., Пэн Т., Джонстон С. и др. (август 2009 г.). «Сохранение рецептор-положительных клеток ВИЧ-1 после реактивации ВПГ-2 является потенциальным механизмом увеличения заражения ВИЧ-1» . Природная медицина . 15 (8): 886–92. дои : 10.1038/нм.2006 . ПМЦ   2723183 . ПМИД   19648930 .
  137. ^ Лукер К.Дж., Элмс Дж.А., Готлиб С.Л., Шиффер Дж.Т., Викерман П., Тернер К.М., Бойли MC (декабрь 2017 г.). «Влияние инфекции ВПГ-2 на последующее заражение ВИЧ: обновленный систематический обзор и метаанализ» . «Ланцет». Инфекционные болезни . 17 (12): 1303–1316. дои : 10.1016/S1473-3099(17)30405-X . ПМК   5700807 . ПМИД   28843576 .
  138. ^ «В этот день». Новости и записи . 18 мая 2020 г. стр. 2А.
  139. ^ Манделл Г.Л., Беннетт Дж.Э., Долин Р., ред. (2010). «Глава 169». Принципы и практика Манделла, Дугласа и Беннета в области инфекционных заболеваний (7-е изд.). Филадельфия: Черчилль Ливингстон/Эльзевир. ISBN  978-0-443-06839-3 . [ нужна страница ]
  140. ^ Готлиб М.С. (2006). «Пневмоцистная пневмония — Лос-Анджелес. 1981» . Американский журнал общественного здравоохранения . 96 (6): 980–1, обсуждение 982–3. дои : 10.2105/AJPH.96.6.980 . ПМК   1470612 . ПМИД   16714472 . Архивировано из оригинала 22 апреля 2009 года.
  141. ^ Фридман-Кин А.Е. (октябрь 1981 г.). «Десеминированный синдром саркомы Капоши у молодых гомосексуалистов». Журнал Американской академии дерматологии . 5 (4): 468–71. дои : 10.1016/S0190-9622(81)80010-2 . ПМИД   7287964 .
  142. ^ Хаймс К.Б., Чунг Т., Грин Дж.Б., Проуз Н.С., Маркус А., Баллард Х., Уильям Д.К., Лаубенштайн Л.Дж. (сентябрь 1981 г.). «Саркома Капоши у мужчин-гомосексуалистов — сообщение о восьми случаях». Ланцет . 2 (8247): 598–600. дои : 10.1016/S0140-6736(81)92740-9 . ПМИД   6116083 . S2CID   43529542 .
  143. ^ Jump up to: а б Басавапатруни А., Андерсон К.С. (декабрь 2007 г.). «Обратная транскрипция пандемии ВИЧ-1» . Журнал ФАСЭБ . 21 (14): 3795–3808. doi : 10.1096/fj.07-8697rev . ПМИД   17639073 . S2CID   24960391 .
  144. ^ Ледерберг Дж., изд. (2000). Энциклопедия микробиологии (2-е изд.). Берлингтон: Эльзевир. п. 106. ИСБН  978-0-08-054848-7 . Проверено 9 июня 2016 г.
  145. ^ Центры по контролю заболеваний (1982). «Стойкая генерализованная лимфаденопатия у гомосексуальных мужчин» . Еженедельный отчет о заболеваемости и смертности . 31 (19): 249–251. ПМИД   6808340 .
  146. ^ Jump up to: а б Барре-Синусси Ф, Шерманн Х.К., Рей Ф., Нугейр М.Т., Шамаре С., Грюст Дж., Доге С., Экслер-Блен С., Везине-Брюн Ф., Рузиу С., Розенбаум В., Монтанье Л. (1983). «Выделение Т-лимфотропного ретровируса от пациента с риском развития синдрома приобретенного иммунодефицита (СПИД)». Наука . 220 (4599): 868–871. Бибкод : 1983Sci...220..868B . дои : 10.1126/science.6189183 . ПМИД   6189183 . S2CID   390173 .
  147. ^ Jump up to: а б Центры по контролю заболеваний (1982). «Оппортунистические инфекции и саркома Капоши среди гаитян в США» . Еженедельный отчет о заболеваемости и смертности . 31 (26): 353–354, 360–361. ПМИД   6811853 .
  148. ^ Альтман Л.К. (11 мая 1982 г.). «Новое гомосексуальное расстройство беспокоит чиновников здравоохранения» . Нью-Йорк Таймс . Проверено 31 августа 2011 г.
  149. ^ Гилман С.Л. (1987). Гилман С.Л. (ред.). «СПИД и сифилис: иконография болезней». Октябрь . 43 : 87–107. дои : 10.2307/3397566 . JSTOR   3397566 .
  150. ^ «Достигая прогресса в ужасных обстоятельствах» (PDF) . Американская ассоциация содействия развитию науки . 28 июля 2006 г. Архивировано из оригинала (PDF) 24 июня 2008 г. . Проверено 23 июня 2008 г.
  151. ^ Хер У (27 июля 1982 г.). «Имя чумы» . Время . Архивировано из оригинала 7 марта 2008 года . Проверено 10 марта 2008 г.
  152. ^ Центры по контролю заболеваний (1982). «Обновленная информация о синдроме приобретенного иммунодефицита (СПИД) - США». Еженедельный отчет о заболеваемости и смертности . 31 (37): 507–508, 513–514. ПМИД   6815471 .
  153. ^ Галло Р.К., Сарин П.С., Гельманн Е.П., Роберт-Гурофф М., Ричардсон Э., Кальянараман В.С., Манн Д., Сидху Г.Д., Шталь Р.Э., Золла-Пазнер С., Лейбович Дж., Попович М. (1983). «Выделение вируса Т-клеточного лейкоза человека при синдроме приобретенного иммунодефицита (СПИД)». Наука . 220 (4599): 865–867. Бибкод : 1983Sci...220..865G . дои : 10.1126/science.6601823 . ПМИД   6601823 .
  154. ^ «Нобелевская премия по физиологии и медицине 2008 года — пресс-релиз» . www.nobelprize.org . Проверено 28 января 2018 г.
  155. ^ Крюдсон Дж. (30 мая 1991 г.). «ГАЛЛО ПРИЗНАЕТ, ЧТО ФРАНЦУЗЫ ОБНАРУЖИЛИ ВИРУС СПИДА» . Чикаго Трибьюн . Проверено 25 апреля 2020 г.
  156. ^ Олдрич Р., Уотерспун Дж., ред. (2001). Кто есть кто в истории геев и лесбиянок . Лондон: Рутледж. п. 154. ИСБН  978-0-415-22974-6 .
  157. ^ Леви Дж.А. и др. (1984). «Выделение лимфоцитопатических ретровирусов от больных СПИДом из Сан-Франциско». Наука . 225 (4664): 840–842. Бибкод : 1984Sci...225..840L . дои : 10.1126/science.6206563 . ПМИД   6206563 .
  158. ^ Леви Дж.А., Каминский Л.С., Морроу В.Дж., Стеймер К., Люцив П., Дина Д., Хокси Дж., Оширо Л. (1985). «Инфекция ретровирусом, связанная с синдромом приобретенного иммунодефицита». Анналы внутренней медицины . 103 (5): 694–699. дои : 10.7326/0003-4819-103-5-694 . ПМИД   2996401 .
  159. ^ Sharp PM, Хан Б.Х. (2011). «Истоки ВИЧ и пандемии СПИДа» . Перспективы Колд-Спринг-Харбора в медицине . 1 (1): а006841. doi : 10.1101/cshperspect.a006841 . ПМЦ   3234451 . ПМИД   22229120 .
  160. ^ Фариа Н.Р., Рамбо А., Сушард М.А., Бээле Г., Бедфорд Т., Уорд М.Дж., Татем А.Дж., Соуза Дж.Д., Аринаминпати Н., Пепин Дж., Посада Д., Питерс М., Пайбус О.Г., Лемей П. (2014). «Раннее распространение и возникновение эпидемии ВИЧ-1 среди населения» . Наука . 346 (6205): 56–61. Бибкод : 2014Sci...346...56F . дои : 10.1126/science.1256739 . ПМЦ   4254776 . ПМИД   25278604 .
  161. ^ Гао Ф., Бэйлз Э., Робертсон Д.Л., Чен Ю., Роденбург К.М., Майкл С.Ф., Камминс Л.Б., Артур Л.О., Питерс М., Шоу Г.М., Шарп П.М., Хан Б.Х. (1999). «Происхождение ВИЧ-1 у шимпанзе Pan troglodytes troglodytes» . Природа . 397 (6718): 436–41. Бибкод : 1999Natur.397..436G . дои : 10.1038/17130 . ПМИД   9989410 . S2CID   4432185 .
  162. ^ Кил Б.Ф., Ван Хьюверсвин Ф., Ли Ю., Бэйлс Е., Такехиса Дж., Сантьяго М.Л., Биболле-Руш Ф., Чен Ю., Уэйн Л.В., Льежуа Ф., Лоул С., Нголе Э.М., Бьенвеню Ю., Делапорте Е., Брукфилд Дж.Ф., Шарп П.М. , Шоу Г.М., Питерс М., Хан Б.Х. (2006). «Резервуары пандемического и непандемического ВИЧ-1 у шимпанзе» . Наука . 313 (5786): 523–6. Бибкод : 2006Sci...313..523K . дои : 10.1126/science.1126531 . ПМК   2442710 . ПМИД   16728595 .
  163. ^ Гудье Дж.Л., Казазян Х.Х. (2008). «Возвращение к ретротранспозонам: сдерживание и реабилитация паразитов» . Клетка . 135 (1): 23–35. дои : 10.1016/j.cell.2008.09.022 . ПМИД   18854152 . S2CID   3093360 .
  164. ^ Шарп П.М., Бэйлз Э., Чаудхури Р.Р., Роденбург К.М., Сантьяго М.О., Хан Б.Х. (2001). «Происхождение вирусов синдрома приобретенного иммунодефицита: где и когда?» . Философские труды Королевского общества Б. 356 (1410): 867–76. дои : 10.1098/rstb.2001.0863 . ПМК   1088480 . ПМИД   11405934 .
  165. ^ Калиш М.Л., Вулф Н.Д., Ндонгмо С.Б., МакНикол Дж., Роббинс К.Е., Айду М., Фонджунго П.Н., Алемни Г., Зех К., Джоко К.Ф., Мпуди-Нголе Е., Берк Д.С., Фолкс Т.М. (2005). «Охотники из Центральной Африки подверглись воздействию вируса иммунодефицита обезьян» . Новые инфекционные заболевания . 11 (12): 1928–30. дои : 10.3201/eid1112.050394 . ПМК   3367631 . ПМИД   16485481 .
  166. ^ Jump up to: а б Маркс П.А., Алькабес П.Г., Друкер Э. (2001). «Серийное заражение человека вирусом иммунодефицита обезьян путем нестерильных инъекций и возникновение эпидемии вируса иммунодефицита человека в Африке» . Философские труды Королевского общества Б. 356 (1410): 911–20. дои : 10.1098/rstb.2001.0867 . ПМК   1088484 . ПМИД   11405938 .
  167. ^ Воробей М., Геммел М., Теувен Д.Е., Хаселкорн Т., Канстман К., Банс М., Мюембе Дж.Дж., Кабонго Дж.М., Каленгайи Р.М., Ван Марк Э., Гилберт М.Т., Волински С.М. (2008). «Прямое свидетельство огромного разнообразия ВИЧ-1 в Киншасе к 1960 году» . Природа . 455 (7213): 661–4. Бибкод : 2008Natur.455..661W . дои : 10.1038/nature07390 . ПМЦ   3682493 . ПМИД   18833279 .
  168. ^ Jump up to: а б де Соуза Дж.Д., Мюллер В., Леми П., Вандам А.М. (2010). Мартин Д.П. (ред.). «Высокая заболеваемость GUD в начале 20-го века создала особенно благоприятное временное окно для возникновения и первоначального распространения эпидемических штаммов ВИЧ» . ПЛОС ОДИН . 5 (4): e9936. Бибкод : 2010PLoSO...5.9936S . дои : 10.1371/journal.pone.0009936 . ПМЦ   2848574 . ПМИД   20376191 .
  169. ^ Чжу Т., Корбер Б.Т., Намиас А.Дж., Хупер Э., Шарп П.М., Хо Д.Д. (1998). «Африканская последовательность ВИЧ-1 с 1959 года и последствия для происхождения эпидемии» . Природа . 391 (6667): 594–7. Бибкод : 1998Natur.391..594Z . дои : 10.1038/35400 . ПМИД   9468138 . S2CID   4416837 .
  170. ^ Колата Г. (28 октября 1987 г.). «Смерть мальчика в 1969 году позволяет предположить, что СПИД несколько раз вторгался в США» . Нью-Йорк Таймс . Проверено 11 февраля 2009 г.
  171. ^ Читнис А., Ролз Д., Мур Дж. (январь 2000 г.). «Происхождение ВИЧ типа 1 в колониальной Французской Экваториальной Африке?». Исследования СПИДа и ретровирусы человека . 16 (1): 5–8. дои : 10.1089/088922200309548 . ПМИД   10628811 . S2CID   17783758 .
  172. ^ Макнил Д. младший (16 сентября 2010 г.). «Предшественник ВИЧ находился у обезьян на протяжении тысячелетий» . Нью-Йорк Таймс . Архивировано из оригинала 3 января 2022 года . Проверено 17 сентября 2010 г. Доктор Маркс считает, что решающим событием стало появление в Африке миллионов недорогих шприцев массового производства в 1950-х годах. ...подозреваю, что виноват рост колониальных городов. До 1910 года ни в одном городе Центральной Африки не проживало более 10 000 человек. Но городская миграция выросла, увеличивая сексуальные контакты и приводя к появлению кварталов красных фонарей.
  173. ^ Jump up to: а б Вертхайм Дж.О., Воробей М. (май 2009 г.). «Датирование возраста линий SIV, которые дали начало ВИЧ-1 и ВИЧ-2» . PLOS Вычислительная биология . 5 (5): e1000377. Бибкод : 2009PLSCB...5E0377W . дои : 10.1371/journal.pcbi.1000377 . ПМЦ   2669881 . ПМИД   19412344 .

Дальнейшее чтение

Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 43faccdfa880ecc3aa3523dae5bd72b5__1722118500
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/43/b5/43faccdfa880ecc3aa3523dae5bd72b5.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
HIV - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)