Ген домашнего хозяйства

В молекулярной биологии гены «домашнего хозяйства» обычно представляют собой конститутивные гены , которые необходимы для поддержания основных клеточных функций и экспрессируются во всех клетках организма в нормальных и патофизиологических условиях. ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}^{[ 4 ]} Хотя некоторые гены домашнего хозяйства экспрессируются с относительно постоянной скоростью в большинстве непатологических ситуаций, экспрессия других генов домашнего хозяйства может варьироваться в зависимости от условий эксперимента. ^{[ 1 ]}^{[ 5 ]}

Происхождение термина «ген домашнего хозяйства» остается неясным. В литературе 1976 года этот термин использовался для описания конкретно тРНК и рРНК . ^{[ 6 ]} В экспериментальных целях экспрессия одного или нескольких генов домашнего хозяйства используется в качестве ориентира для анализа уровней экспрессии других генов. Ключевым критерием для использования гена домашнего хозяйства таким образом является то, что выбранный ген домашнего хозяйства экспрессируется равномерно с низкой дисперсией как в контрольных, так и в экспериментальных условиях. Проверка генов «домашнего хозяйства» должна проводиться перед их использованием в экспериментах по экспрессии генов, таких как RT-PCR . Недавно была разработана веб-база данных генов домашнего хозяйства человека и мыши и эталонных генов/транскриптов под названием « Атлас домашних хозяйств и эталонных транскриптов» (HRT Atlas), предлагающая обновленный список генов домашнего хозяйства и надежных кандидатов эталонных генов/транскриптов для данных RT-qPCR. нормализация. ^{[ 1 ]} Доступ к этой базе данных можно получить по адресу http://www.housekeeping.unicamp.br .

Регуляция генов домашнего хозяйства

Гены «домашнего хозяйства» составляют большинство активных генов в геноме, и их экспрессия, очевидно, жизненно важна для выживания. Уровни экспрессии генов «домашнего хозяйства» точно настроены для удовлетворения метаболических потребностей в различных тканях. Биохимические исследования инициации транскрипции промоторов генов домашнего хозяйства были трудными, отчасти из-за менее изученных мотивов промотора и процесса инициации транскрипции.

Промоторы генов «домашнего хозяйства» человека обычно обеднены ТАТА -боксом, имеют высокое содержание GC и высокую частоту CpG-островков . ^{[ 7 ]} У дрозофилы, где промотор- специфичные CpG-островки отсутствуют, промоторы генов домашнего хозяйства содержат элементы ДНК, такие как DRE, E-box или DPE. ^{[ 8 ]} Сайты начала транскрипции генов домашнего хозяйства могут охватывать область длиной около 100 п.н., тогда как сайты начала транскрипции генов, регулируемых развитием, обычно сосредоточены в узкой области. ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}^{[ 11 ]} О том, как устанавливается дисперсная инициация транскрипции гена домашнего хозяйства, известно немного. Существуют факторы транскрипции , которые специфически обогащаются и регулируют промоторы генов домашнего хозяйства. ^{[ 12 ]}^{[ 13 ]} Более того, промоторы «домашнего хозяйства» регулируются энхансерами «домашнего хозяйства» , а не энхансерами, регулируемыми развитием. ^{[ 14 ]}

Общие гены домашнего хозяйства у человека

Ниже приводится неполный список «генов домашнего хозяйства». Более полный и обновленный список см. в базе данных Атласа HRT, составленной Bidossessi W. Hounkpe et al. ^{[ 1 ]} База данных была создана путем анализа более 12 000 наборов данных секвенирования РНК человека и мыши. ^{[ 1 ]}

Экспрессия генов

Транскрипционные факторы

ATF1 NM_005171
ATF2 NM_001880
АТФ4 ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} Активирующий фактор транскрипции 4 NM_001675
ATF6 NM_007348
ATF7 NM_001206682
ATF7IP NM_018179
БТФ3 ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} NM_001207 Основной фактор транскрипции 3 человека разумного
Е2F4 ^{[ 2 ]} Транскрипционный фактор 4 E2F человека (Homo sapiens), p107/p130-связывающий (E2F4), мРНК
ЭРХ (гены) ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} Энхансер рудиментарного гомолога дрозофилы (который, в свою очередь, является первым ферментативным этапом синтеза пиримидина. Регулируется MITF)
HMGB1 ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} Групповой ящик с высокой подвижностью связывает ДНК
ILF2 ^{[ 2 ]} Фактор связывания энхансера интерлейкина 2, 45 кДа (ILF2) человека (Homo sapiens), мРНК
IER2 ^{[ 2 ]} ранее ETR101 Immediate Early Protein?
ЮНД ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} Протоонкоген (JUND) человека jun D, мРНК
TCEB2 ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} Элонгин Матео странный

Репрессоры

ППУ60 ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} Репрессор, взаимодействующий с белком, связывающим плавление (SIAHBP1), транскрипт Homo sapiens

Сплайсинг РНК

БАТ1 ^{[ 15 ]} он же DDX39B
HNRPD ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин D человека (Homo sapiens) (РНК, богатая AU-элементами
ХНРПК ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин К (HNRPK) человека разумного, транскрипт
ПАБПН1 ^{[ 2 ]} поли(А)-связывающий белок, ядерный 1
СРСФ3 ^{[ 15 ]} фактор сплайсинга, богатый аргинином/серином

Факторы перевода

ЭИФ1 ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]}он же SUI1
EIF1AD
EIF1B
EIF2A
ЕИФ2АК1
ЕИФ2АК3
ЕИФ2АК4
ЕИФ2АК1
EIF2B2
EIF2B3
EIF2B4
ЭИФ2С2
EIF3A
EIF3B
ЭИФ3D ^{[ 2 ]} ранее EIF3S4
EIF3G
EIF3I
EIF3H
EIF3J
ЭИФ3К
EIF3L
ЭИФ3М
ЭИФ3С5
ЕИФ3С8
EIF4A1
EIF4A2 ^{[ 2 ]}
EIF4A3
EIF4E2
EIF4G1
EIF4G2 ^{[ 2 ]}
EIF4G3
EIF4H
ЭИФ5
ЭИФ5
EIF5A
EIF5AL1
ЭИФ5Б
ЭИФ6
ТУФМ ^{[ 2 ]} Фактор трансляционной элонгации Tu митохондриальный

синтез тРНК

AARS NM_001605 аланил-тРНК-синтетаза
AARS2 NM_020745 аланил-тРНК-синтетаза 2, митохондриальная
AARSD1 NM_001261434 Домен аланил-тРНК-синтетазы, содержащий 1
CARS NM_001751 цистеинил-тРНК-синтетаза
CARS2 NM_024537 цистеинил-тРНК-синтетаза 2, митохондриальная (предполагаемая)
DARS NM_001349 аспартил-тРНК-синтетаза
DARS2 NM_018122 аспартил-тРНК-синтетаза 2, митохондриальная
EARS2 NM_001083614 глутамил-тРНК-синтетаза 2, митохондриальная
FARS2 NM_006567 фенилаланил-тРНК-синтетаза 2, митохондриальная
FARSA NM_004461 фенилаланил-тРНК-синтетаза, альфа-субъединица
FARSB NM_005687 фенилаланил-тРНК-синтетаза, бета-субъединица
GARS NM_002047 глицил-тРНК-синтетаза
HARS NM_002109 гистидил-тРНК-синтетаза
HARS2 NM_012208 гистидил-тРНК-синтетаза 2, митохондриальная
IARS NM_002161 изолейцил-тРНК-синтетаза
IARS2 NM_018060 изолейцил-тРНК-синтетаза 2, митохондриальная
KARS NM_005548 Лизил-тРНК-синтетаза (KARS) человека (Homo sapiens), мРНК
LARS2 NM_015340 изолейцил-тРНК-синтетаза 2, митохондриальная
MARS NM_004990 метионил-тРНК-синтетаза
MARS2 NM_138395 метионил-тРНК-синтетаза 2, митохондриальная
NARS NM_004539 аспарагинил-тРНК-синтетаза
NARS2 NM_024678 аспарагинил-тРНК-синтетаза 2, митохондриальная (предполагаемая)
QARS NM_005051 глутаминил-тРНК-синтетаза
RARS NM_002884 аргинил-тРНК-синтетаза
RARS2 NM_020320 аргинил-тРНК-синтетаза 2, митохондриальная
SARS NM_006513 Серил-тРНК-синтетаза (SARS) человека (Homo sapiens), мРНК
TARS NM_152295 треонил-тРНК-синтетаза
VARS2 NM_020442 валил-тРНК-синтетаза 2, митохондриальная
WARS2 NM_015836 триптофанил-тРНК-синтетаза 2, митохондриальная
YARS NM_003680 Тирозил-тРНК-синтетаза (YARS) человека (Homo sapiens), мРНК
YARS2 NM_001040436 Тирозил-тРНК-синтетаза (YARS), мРНК митохондриального человека (Homo sapiens)

РНК-связывающий белок

ЭЛАВЛ1 ^{[ 2 ]}

Рибосомальные белки

РПС19БП1

РПС20 ^{[ 15 ]}
РПС23 ^{[ 15 ]}
РПС24 ^{[ 2 ]}
РПС27 ^{[ 15 ]} транскрибируется с помощью убиквитина (см. FAU (ген) )
РПН1 ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} Рибофорин закрепляет рибосому на шероховатой эндоплазматической сети.

Митохондриальные рибосомальные белки

РНК-полимераза

Обработка белка

PPID Пептидил-пролил-цис-транс-изомераза D
PPIE Пептидил-пролил-цис-транс-изомераза E
PPIF Пептидил-пролил-цис-транс-изомераза F
PPIG Пептидил-пролил-цис-транс-изомераза G
ППИХ ^{[ 17 ]} Циклофилин Н
CANX ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} Кальнексин. Складывание гликопротеинов в эндоплазматическом ретикулуме
CAPN1 субъединица кальпаина
КАПН7
КАПНС1 ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} Субъединица кальпаиновой протеазы
НАКА ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} Возникающий полипептид-ассоциированный сложный альфа-полипептид
НАКА2
PFDN2 Префолдин 2
PFDN4 Префолдин 4
PFDN5 Префолдин 5
PFDN6 Префолдин 6
SNX2 Сортировка 2
SNX3 ^{[ 2 ]} Не сортировать 3
Не ставьте SNX4 Сортировка 4
SNX5 Сортировка 5
SNX6 Сортировка 6
SNX9 Сортировка 9
SNX12 Сортировка нексина 12
SNX13 Не сортировать 13
SNX17 ^{[ 15 ]} Не сортировать 17
SNX18 Не сортировать 18
SNX19 Не сортировать 19
SNX25 Не сортировать 25
SSR1 Транслокон-ассоциированный белок TRAPA. Транслокация белков в ER
ССР2 ^{[ 2 ]} Транслокон-ассоциированный белок TRAPB. Транслокация белков в ER
SSR3 Транслокон-ассоциированный белок TRAPG. Транслокация белков в ER
SUMO1 Нацеливание на белок
SUMO3 Нацеливание на белок

Белки теплового шока

Гистон

HIST1H2BC ^{[ 2 ]}
H1FX
H2AFV
H2AFX
H2AFY ^{[ 2 ]} Подсемейство гистонов 2
H2AFZ ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} необходим для эмбриогенеза

Клеточный цикл

Функции некоторых из этих белков существенно совпадают. В частности, гены, связанные с Rho, важны для транспортировки ядер (т.е. митоза), а также для подвижности по цитоскелету в целом. Эти гены представляют особый интерес в исследованиях рака.

ARHGAP35
ARHGAP5
АРХГДИА ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]}
ARHGEF10L Фактор обмена гуаниновых нуклеотидов Rho 10L
ARHGEF11 Фактор обмена гуаниновых нуклеотидов Rho 11
ARHGEF40 Фактор обмена гуаниновых нуклеотидов Rho 40
ARHGEF7 Фактор обмена гуаниновых нуклеотидов Rho 7
RAB10 NM_016131 Малые ГТФазы Rab являются ключевыми регуляторами внутриклеточного транспорта мембран, от образования транспортных везикул до их слияния с мембранами.
РАБ11А НМ_004663
RAB11B NM_004218
РАБ14 НМ_016322
РАБ18 НМ_021252
RAB1A NM_004161 RAB1A человека разумного, член семейства онкогенов RAS (RAB1A), мРНК
RAB1B NM_030981
RAB21 NM_014999
РАБ22А НМ_020673
РАБ2А НМ_002858
RAB2B NM_001163380
RAB3GAP1 NM_012233
RAB3GAP2 NM_012414
RAB40C NM_021168
RAB4A NM_004578
RAB5A NM_004162
RAB5B NM_002865
RAB5C NM_004583
RAB6A NM_002868
RAB7A NM_004637
RAB9A NM_004251
РАБЭП1 НМ_004703
РАБЕПК НМ_005833
РАБГЕФ1 НМ_014504
РАБГГТА NM_004581
РАБГГТБ NM_004582
CENPB ^{[ 2 ]} Центромерный белок B
CTBP1 ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} Центромерный белок Т
CCNB1IP1 NM_021178 Е3 убиквитин-белковая лигаза. Модулирует уровни циклина B и участвует в регуляции клеточного цикла через фазу G2.
CCNDBP1 NM_012142 Может отрицательно регулировать развитие клеточного цикла.
CCNG1 NM_004060 Может играть роль в регуляции роста.
CCNH NM_001239 Участвует в контроле клеточного цикла и в транскрипции РНК с помощью РНК-полимеразы II. Его экспрессия и активность постоянны на протяжении всего клеточного цикла.
CCNK NM_001099402 Регуляторная субъединица циклинзависимых киназ, опосредующая фосфорилирование большой субъединицы РНК-полимеразы II
CCNL1 NM_020307 Регулятор транскрипции, который участвует в регуляции процесса сплайсинга пре-мРНК.
CCNL2 NM_030937 Регулятор транскрипции, участвующий в регуляции процесса сплайсинга пре-мРНК. Также модулирует экспрессию критического апоптотического фактора, приводящего к апоптозу клеток.
CCNY NM_145012 Положительная регуляторная субъединица циклинзависимых киназ CDK14/PFTK1 и CDK16. Действует как регулятор клеточного цикла сигнального пути Wnt во время фазы G2/M.
PPP1CA NM_002708 Белковая фосфатаза, которая связывается с более чем 200 регуляторными белками с образованием высокоспецифичных холоферментов, которые дефосфорилируют сотни биологических мишеней.
PPP1CC NM_002710
PPP1R10 NM_002714
PPP1R11 NM_021959 Протеинфосфатаза 1 человека разумного, регуляторная (ингибиторная) субъединица 11 (PPP1R11),
PPP1R15B НМ_032833
PPP1R37 NM_019121
PPP1R7 NM_002712
PPP1R8 NM_002713
PPP2CA NM_002715
PPP2CB NM_001009552
PPP2R1A NM_014225 ^{[ 15 ]} Отрицательный регулятор роста и деления клеток протеинфосфатаза 2 Homo sapiens (ранее 2А), регуляторная субъединица А (PR 65),
PPP2R2A NM_002717
PPP2R2D NM_018461
PPP2R3C NM_017917
PPP2R4 NM_021131
PPP2R5A NM_006243
PPP2R5B NM_006244
PPP2R5C NM_002719
PPP2R5D NM_006245
PPP2R5E NM_006246
PPP4C NM_002720
PPP4R1 NM_005134
PPP4R2 NM_174907
PPP5C NM_006247
PPP6C NM_002721
PPP6R2 NM_014678
PPP6R3 НМ_018312
RAD1 Ингибитор рибонуклеазы/ангиогенина (RNH) Homo sapiens, мРНК
RAD17 NM_002869 Необходим для устойчивого роста клеток, поддержания хромосомной стабильности и ATR-зависимой активации контрольной точки при повреждении ДНК.
RAD23B НМ_002873
RAD50 NM_005732
RAD51C NM_002874
IST1 ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} (расположено до центральной линии раздела делящихся клеток)

Апоптоз

ПАПА1 ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} Защитник от гибели клеток
ДАП3 ^{[ 2 ]} Участвует в опосредовании гибели клеток, вызванной интерфероном-гамма.
ДАКХ ^{[ 2 ]} Связанный со смертью белок 6

Онкогены

МЕДЛЕННЫЙ ^{[ 2 ]}
МАЗ (гены) ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]}
МИК ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} также считается фактором транскрипции

Репарация/репликация ДНК

MCM3AP ^{[ 2 ]} возможно, примаза
XRCC5 НМ_021141 Ку80 ^{[ 2 ]}
XRCC6 NM_001469 Аутоантиген щитовидной железы человека (Homo sapiens): одноцепочечная ДНК-зависимая АТФ-зависимая геликаза. Играет роль в транслокации хромосом.

Метаболизм

ПРКАГ1 ^{[ 2 ]} Определяет уровень энергии и инактивирует HMGCoA-редуктазу и ацетил-КоА-карбоксилазу.
PRKAA1 NM_006251 Каталитическая субъединица AMP-активируемой протеинкиназы (AMPK), протеинкиназы энергетического сенсора, которая играет ключевую роль в регуляции клеточного энергетического метаболизма.
PRKAB1 NM_006253 Некаталитическая субъединица AMP-активируемой протеинкиназы (AMPK), протеинкиназы энергетического сенсора, которая играет ключевую роль в регуляции клеточного энергетического метаболизма.
PRKACA NM_002730 Фосфорилирует большое количество субстратов в цитоплазме и ядре.
PRKAG1 NM_002733 Протеинкиназа Homo sapiens, AMP-активируемая, некаталитическая субъединица гамма 1 (PRKAG1), мРНК
PRKAR1A NM_002734 Регуляторная субъединица цАМФ-зависимых протеинкиназ, участвующих в передаче сигналов цАМФ в клетках
PRKRIP1 NM_024653 Связывает двухцепочечную РНК. Ингибирует активность киназы EIF2AK2 (по сходству).

Углеводный обмен

^{[ 15 ]}

АЛДО ^{[ 15 ]}
B3GALT6 NM_080605
B4GALT3 NM_003779 UDP-Gal:betaGlcNAc бета-1,4-галактозилтрансфераза человека разумного, полипептид 3
B4GALT5 NM_004776
B4GALT7 NM_007255
ГСК3А ^{[ 2 ]}
ГСК3Б
ТПИ1 ^{[ 15 ]}
ПГК1 ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]}^{[ 17 ]}^{[ 18 ]} Фосфоглицерат киназа
ПГАМ5 ^{[ 15 ]}
ENOPH1 Энолаза фосфатаза
ЛДХА ^{[ 17 ]} Лактатдегидрогеназа
ТАЛДО1 ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} Трансальдолаза в пентозном шунте
ТСТА3 ^{[ 2 ]} Метаболизм маннозы

Цикл лимонной кислоты

СДХА ^{[ 2 ]} NM_004168 Субъединица А сукцинатдегидрогеназы
SDHAF2 NM_017841
SDHB NM_002973 Железо-серная белковая (IP) субъединица сукцинатдегидрогеназы (SDH), которая участвует в комплексе II митохондриальной цепи переноса электронов и отвечает за перенос электронов от сукцината к убихинону (коэнзим Q)
SDHC NM_003000 Мембранозакрепляющая субъединица сукцинатдегидрогеназы (SDH), которая участвует в комплексе II митохондриальной цепи переноса электронов и отвечает за перенос электронов от сукцината к убихинону (кофермент Q).
SDHD NM_003001

Липидный обмен

ХАХАХА ^{[ 2 ]} Трехфункциональная белковая субъединица альфа

Метаболизм аминокислот

КОМТ ^{[ 2 ]} Катехол-О-метилтрансфераза)

НАДН-дегидрогеназа

НДУФА2 НМ_002488 ^{[ 2 ]}
НДУФА3 НМ_004542
NDUFA4 NM_002489
NDUFA5 NM_005000
NDUFA6 NM_002490
НДУФА7 ^{[ 2 ]} NM_005001 НАДН-дегидрогеназа (убихинон) 1 альфа-субкомплекс человека (Homo sapiens), 7, 14,5 кДа
NDUFA8 NM_014222
NDUFA9 NM_005002
NDUFA10 NM_004544
NDUFA11 NM_175614
NDUFA12 NM_018838
NDUFA13 NM_015965
НДУФАФ2 NM_174889
НДУФАФ3 НМ_199069
НДУФАФ4 НМ_014165
НДУФБ2 НМ_004546
НДУФБ3 НМ_002491
НДУФБ4 НМ_004547
НДУФБ5 НМ_002492
НДУФБ6 НМ_002493
НДУФБ7 ^{[ 2 ]} NM_004146 Homo sapiens НАДН-дегидрогеназа (убихинон) 1 бета-субкомплекс, 7, 18 кДа
NDUFB10 NM_004548
NDUFB11 NM_019056
NDUFB8 NM_005004
NDUFB9 NM_005005
НДУФК1 ^{[ 2 ]} NM_002494Homo sapiens НАДН-дегидрогеназа (убихинон) 1, субкомплекс неизвестен, 1, 6 кДа
NDUFC2 NM_004549
NDUFC2-KCTD14 NM_001203260
НДУФС5 ^{[ 2 ]}
НДУФВ2 ^{[ 2 ]}
НДУФС2 НМ_004550
НДУФС3 НМ_004551
НДУФС4 НМ_002495
NDUFS5 NM_004552 Homo sapiens НАДН-дегидрогеназа (убихинон) Белок Fe-S 5, 15 кДа
НДУФС6 НМ_004553
НДУФС7 НМ_024407
НДУФС8 НМ_002496
NDUFV1 NM_007103 Флавопротеин 1, 51 кДа (NDUFV1) НАДН-дегидрогеназа (убихинон) человека (Homo sapiens),
NDUFV2 NM_021074 НАДН-дегидрогеназа (убихинон) флавопротеин 2, 24 кДа (NDUFV2) человека (Homo sapiens),

Цитохром С оксидаза

(Обратите внимание, что ЦОГ1, ЦОГ2 и ЦОГ3 кодируются митохондриями).

ЦОГ4I1 ^{[ 2 ]} 001861
ЦОГ5В ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} НМ_001862
COX6B1 ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} НМ_001863
COX6C NM_004374
COX7A2 NM_001865 Полипептид 2 субъединицы VIIa цитохрома с оксидазы человека (печень) (COX7A2),
COX7A2L ^{[ 2 ]} НМ_004718
COX7C ^{[ 2 ]} НМ_001867
ЦОГ8 ^{[ 2 ]}
COX8A NM_004074 Субъединица VIII цитохром с-оксидазы человека (COX8), кодирующий ядерный ген
COX11 NM_004375
COX14 NM_032901
COX15 NM_004376
COX16 NM_016468
COX19 NM_001031617
COX20 NM_198076
Цикл 1 ^{[ 2 ]} Цитохром c-1 (CYC1) человека разумного
UQCC NM_018244 Требуется для сборки комплекса убихинол-цитохром с-редуктазы (комплекс III митохондриальной дыхательной цепи или комплекс цитохрома b-c1)
UQCR10 NM_013387
UQCR11 NM_006830 Субъединица убихинол-цитохром с-редуктазы (6,4 кДа) (UQCR) человека (Homo sapiens), мРНК
UQCRB NM_006294
UQCRC1 NM_003365 Коровый белок I убихинол-цитохром с-редуктазы (UQCRC1) человека (Homo sapiens), мРНК
UQCRC2 NM_003366
UQCRHL NM_001089591
UQCRQ NM_014402 Низкомолекулярный убихинонсвязывающий белок (9,5 кДа) (QP-C) человека (Homo sapiens), мРНК

АТФаза

ATP2C1 NM_014382
ATP5A1 NM_004046 АТФ-синтаза человека (Homo sapiens), транспортирующая H+, митохондриальный комплекс F1, альфа
ATP5B NM_001686
ATP5C1 NM_005174
ATP5D NM_001687 АТФ-синтаза человека (Homo sapiens), транспортирующая H+, митохондриальный комплекс F1, дельта
ATP5F1 НМ_001688
ATP5G2 NM_005176
ATP5G3 NM_001689 АТФ-синтаза человека (Homo sapiens), транспортирующая H+, митохондриальный комплекс F0, субъединица c
ATP5H NM_006356 АТФ-синтаза человека (Homo sapiens), транспортирующая H+, митохондриальный комплекс F0, субъединица d
ATP5J NM_001685
ATP5J2 NM_004889 АТФ-синтаза человека (Homo sapiens), транспортирующая H+, митохондриальный комплекс F0, субъединица f,
ATP5J2-PTCD1 NM_001198879
ATP5L NM_006476
ATP5O NM_001697 АТФ-синтаза человека (Homo sapiens), транспортирующая H+, митохондриальный комплекс F1, О-субъединица
ATP5S НМ_015684
ATP5SL NM_018035
ATP6AP1 NM_001183 АТФаза, H+-транспортирующий, взаимодействующий с лизосомами белок 1 (ATP6IP1) человека (Homo sapiens),
ATP6V0A2 НМ_012463
ATP6V0B NM_004047 АТФаза Homo sapiens, транспортирующая H+, лизосомальная 21 кДа, субъединица c V0 (ATP6V0B),
ATP6V0C NM_001694 АТФаза Homo sapiens, транспортирующая H+, лизосомальная 16 кДа, субъединица c V0 (ATP6V0C),
ATP6V0D1 НМ_004691
ATP6V0E1 НМ_003945
ATP6V1C1 NM_001695
ATP6V1D НМ_015994
ATP6V1E1 NM_001696 АТФаза Homo sapiens, транспортирующая H+, лизосомальная 31 кДа, субъединица E изоформа 1 V1
ATP6V1F NM_004231 АТФаза Homo sapiens, транспортирующая H+, лизосомальная 14 кДа, субъединица F V1 (ATP6V1F),
ATP6V1G1 NM_004888 АТФаза Homo sapiens, транспортирующая H+, лизосомальная 13 кДа, субъединица G изоформы 1 V1
ATP6V1H НМ_015941
ATPAF2 NM_145691
ATPIF1 NM_016311

Лизосома

CTSD ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} может разрушать инсулин в гепатоцитах
CSTB ^{[ 2 ]} Может защитить клетку от утечки лизосом
ЛАМПА1 ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]}
ЛАМПА2
М6ПР ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]}

Протеасома

ПСМА1 НМ_002786
ПСМА2 НМ_002787
ПСМА3 НМ_002788
ПСМА4 НМ_002789
ПСМА5 НМ_002790
ПСМА6 НМ_002791
PSMA7 NM_002792 Субъединица протеасомы (просома, макропаин) человека, альфа-тип, 7 (PSMA7),
PSMB1 NM_002793 Субъединица протеасомы (просома, макропаин) человека, бета-тип, 1 (PSMB1), мРНК
PSMB2 NM_002794 Субъединица протеасомы (просома, макропаин) человека, бета-тип, 2 (PSMB2), мРНК
PSMB3 NM_002795
PSMB4 NM_002796 Субъединица протеасомы (просома, макропаин) человека, бета-тип, 4 (PSMB4), мРНК
PSMB5 NM_002797
PSMB6 NM_002798
PSMB7 NM_002799 Субъединица протеасомы (просома, макропаин) человека, бета-тип, 7 (PSMB7), мРНК
PSMC2 NM_002803
PSMC3 NM_002804
PSMC4 NM_006503
PSMC5 NM_002805
PSMC6 NM_002806
ПСМД1 НМ_002807
PSMD10 НМ_002814
PSMD11 NM_002815 Протеасома (просома, макропаин) человека 26S, не-АТФаза, 11
PSMD12 НМ_002816
PSMD13 НМ_002817
PSMD14 НМ_005805
ПСМД2 НМ_002808
ПСМД3 НМ_002809
PSMD4 NM_002810
PSMD5 NM_005047
ПСМД6 НМ_014814
PSMD7 NM_002811
PSMD8 NM_002812 Протеасома (просома, макропаин) 26S человека, не-АТФаза, 8 (PSMD8),
PSMD9 NM_002813
PSME2 NM_002818 Субъединица 2 активатора протеасомы (просомы, макропаина) человека (PA28 бета)
ПСМЕ3 НМ_005789
PSMF1 NM_006814
ПСМГ2 НМ_020232
ПСМГ3 НМ_032302
ПСМГ4 НМ_001128591
UBA1 NM_003334 Фермент E1, активирующий убиквитин человека (Homo sapiens) (температура A1S9T и BN75)
УБА2 НМ_005499
УБА3 НМ_003968
УБА5 НМ_024818
UBA52 NM_003333
UBAC2 NM_177967
UBALD1 NM_145253
УБАП1 НМ_016525
UBAP2L NM_014847
UBB NM_018955 Убиквитин B (UBB) человека (Homo sapiens), мРНК
UBC NM_021009 Убиквитин C (UBC) человека (Homo sapiens), мРНК
УБЭ2А НМ_003336
UBE2B NM_003337
UBE2D2 NM_003339 Фермент E2D 2, конъюгирующий убиквитин (гомолог UBC4/5, дрожжи) человека (Homo sapiens)
UBE2D3 NM_003340
UBE2D4 NM_015983
UBE2E1 NM_003341
UBE2E2 NM_152653
UBE2E3 NM_006357
УБЕ2Ф НМ_080678
UBE2G2 NM_003343
UBE2H NM_003344
UBE2I NM_003345 Энзим E2I, конъюгирующий убиквитин (гомолог UBC9, дрожжи) человека (UBE2I),
UBE2J1 NM_016021
UBE2J2 NM_058167
УБЭ2К НМ_005339
UBE2L3 NM_003347
UBE2M NM_003969 Фермент E2M, конъюгирующий убиквитин (гомолог UBC12, дрожжи) человека (UBE2M),
УБЭ2Н НМ_003348
UBE2NL NM_001012989
UBE2Q1 NM_017582
UBE2R2 NM_017811
УБЭ2В1 НМ_021988
УБЕ2В2 НМ_003350
UBE2W NM_018299
UBE2Z NM_023079
UBE3A NM_000462
UBE3B NM_130466
UBE3C NM_014671
UBE4A NM_004788
UBE4B NM_006048
USP10 NM_005153
USP14 NM_005151
USP16 NM_006447
USP19 NM_006677
USP22 NM_015276
USP25 NM_013396
USP27X NM_001145073
USP33 NM_015017
USP38 NM_032557
USP39 NM_006590
USP4 NM_003363
USP47 NM_017944
USP5 NM_003481
USP7 NM_003470
USP8 NM_005154
USP9X NM_001039590

Рибонуклеаза

РНХ ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} Ингибитор рибонуклеазы

Тиоредуктаза

TXN2 NM_012473
TXNDC11 NM_015914
TXNDC12 NM_015913
TXNDC15 NM_024715
TXNDC17 NM_032731
TXNDC9 NM_005783
TXNL1 NM_004786
TXNL4A NM_006701
TXNL4B NM_017853
TXNRD1 NM_003330

Структурный

Цитоскелетный

^{[ 2 ]}^{[ 17 ]} ^{[ 18 ]}

АНХА6 ^{[ 2 ]}
ANXA7
ARPC1A Актин-родственный пептид
ARPC2
ARPC5L
КАПЗА2
КАПЗБ ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]}
РОА ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} также участвует в регуляции клеточного цикла
РОБ
RHOT1 митохондриальный трафик
РОТ2
ТУББ ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} Тубулин, бета-полипептид
WDR1 ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} разборка актина?

Синтез органелл

Специализированная форма клеточной сигнализации

БЛОК1S1 ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]}
БЛОК1С2 НМ_173809
БЛОК1С3 НМ_212550
BLOC1S4 NM_018366
BLOC1S6 NM_012388
AP1G1 NM_001128
AP1M1 НМ_032493
AP2A1 NM_014203
AP2A2 NM_012305
АП2М1 ^{[ 2 ]}
AP2S1 NM_004069
AP3B1 NM_003664
AP3D1 NM_003938
AP3M1 НМ_012095
AP3S1 NM_001284
AP3S2 NM_005829
AP4B1 NM_006594
AP5M1 НМ_018229
АНХА6 ^{[ 2 ]} Аннексин 6
ANXA7 ^{[ 15 ]} Аннексин 7
AP1B1 ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} Покрытые везикулы
КЛТА ^{[ 2 ]} Клатрин А (везикулы)
CLTB ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} Клатрин Б (везикулы)
КЛТС

Митохондрия

МТХ2

Поверхность

Клеточная адгезия

CTNNA1 NM_001903
CTNNB1 ^{[ 2 ]}
CTNNBIP1 NM_020248
CTNNBL1 NM_030877
CTNND1 NM_001085458 дельта-катенин ^{[ 15 ]}

Каналы и транспортеры

ABCB10 NM_012089
ABCB7 NM_004299
ABCD3 NM_002857
ABCE1 NM_002939
ABCF1 NM_001090
ABCF2 NM_005692
ABCF3 NM_018358
СПОКОЙСТВИЕ1 ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} Кальмодулин захватывает ионы кальция
MFSD11 NM_024311 похож на MSFD10, также известный как TETRAN или белок, подобный транспортеру тетрациклина. ^{[ 2 ]}
МФСД12 НМ_174983
МФСД3 НМ_138431
МФСД5 НМ_032889
SLC15A4 НМ_145648
SLC20A1 NM_005415
SLC25A11 ^{[ 2 ]} митохондриальный оксоглутарат/малатный носитель
SLC25A26 НМ_173471
SLC25A28 НМ_031212
SLC25A3 НМ_002635
SLC25A32 НМ_030780
SLC25A38 НМ_017875
SLC25A39 НМ_016016
SLC25A44 НМ_014655
SLC25A46 НМ_138773
SLC25A5 НМ_001152
SLC27A4 NM_005094
SLC30A1 НМ_021194
SLC30A5 НМ_022902
SLC30A9 НМ_006345
SLC35A2 НМ_005660
SLC35A4 НМ_080670
SLC35B1 НМ_005827
SLC35B2 НМ_178148
SLC35C2 NM_015945
SLC35E1 NM_024881
SLC35E3 NM_018656
SLC35F5 НМ_025181
SLC38A2 НМ_018976
SLC39A1 NM_014437
SLC39A3 НМ_144564
SLC39A7 NM_006979
SLC41A3 NM_017836
SLC46A3 НМ_181785
SLC48A1 NM_017842

Рецепторы

ACVR1 NM_001105 похож на ACVRL1 семейство бета-рецепторов TGF, синдром Рендю-Ослера-Вебера
ACVR1B NM_004302
CD23 ^{[ 2 ]} Рецептор IgE с низким сродством FCER2 (лектин)

HLA/иммуноглобулин/распознавание клеток

БАТ1 ^{[ 2 ]} он же DDX39B, который участвует в сплайсинге РНК.
БСГ ^{[ 2 ]} Базигин Суперсемейство иммуноглобулинов, внеклеточная металлопротеиназа
МИФ ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} фактор, ингибирующий миграцию макрофагов
ТАПБП ^{[ 2 ]}

Киназы/сигнализация

АДРБК1 ^{[ 2 ]} может подавлять реакцию на адреналин
СООТВЕТСТВУЮЩИЙ1 ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} ацил-3-фосфоглицерин-ацилтрансфераза
АРФ1 ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]}
АРФ3 ^{[ 2 ]}
АРФ4 ^{[ 2 ]}
АРФ5 ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]}
АРЛ2 ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} Суперсемейство РАН
КСФ1 ^{[ 2 ]} Колониестимулирующий фактор не имеет высокой конститутивной экспрессии при 5–12.
CSK C-src тирозинкиназа ^{[ 2 ]}
ДКП ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} дофахром-таутомераза
EFNA3 ^{[ 2 ]}
ФКБП1А ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]}
ГСБ1 ^{[ 2 ]} Ингибитор диссоциации ВВП (семейство Rab)
ГНАС1 ^{[ 2 ]} повсеместно выражены, но дифференцированно запечатлены
ГНАИ2 ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]}
HAX1 ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} связанный с тирозинкиназами
ПЕРВЫЙ ^{[ 2 ]} Интегрин-связанная киназа
MAPKAPK2 ^{[ 2 ]}
МАП2К2 ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]}
МАП3К11 ^{[ 2 ]}
ПИТПНМ ^{[ 2 ]} Белок-переносчик фосфатидилинозитола
RAC1 ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} Ro ГТФаза участвует во многих сигнальных путях
РАП1Б ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} ГТФаза, участвующая в клеточной адгезии
МУЖЧИНЫ ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} Связывание GTP, связанное с Ras
СТК19 ^{[ 2 ]}
СТК24 ^{[ 2 ]} Серин/Треонин Киназа
НПО25 ^{[ 15 ]}
Иегова ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} Белок активации тирозин-3-монооксигеназы/триптофана-5-монооксигеназы, бета-полипептид
ЯХА ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} Белок активации тирозин-3-монооксигеназы/триптофана-5-монооксигеназы, полипептид h
ЯВАК ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} Белок активации тирозин-3-монооксигеназы/триптофана-5-монооксигеназы, тета-полипептид
ЯВАЗ ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} Белок активации тирозин-3-монооксигеназы/триптофана-5-монооксигеназы, зета-полипептид

Факторы роста

АИФ1 ^{[ 2 ]}
HDGF ^{[ 2 ]} Фактор роста гепатомы (транслоцируется в ядро)
ХГС ^{[ 2 ]}
ЛТБП4 ^{[ 2 ]}
ВЕГФБ ^{[ 2 ]}
ZFP36L1 ^{[ 2 ]}

Фактор некроза тканей

CD40 ^{[ 2 ]} ранее TNFRSF5

Казеинкиназа

ЦСНК1Е ^{[ 2 ]}
ЦСНК2Б ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]}

Разнообразный

ALAS1 Синтаза аминолевулиновой кислоты типа 1 (тип 2 — эритроидный и связан с порфирией)
ARHGEF2 ^{[ 2 ]} Фактор обмена ро-гуаниновых нуклеотидов
ОРУЖИЕ ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} Нейротрофический фактор мезенцефалического астроцитарного происхождения
АЕС ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} аминоконцевой усилитель расщепления
БЭКН1 ^{[ 2 ]} участвует в аутофагии и сотрудничает с PI3K
БУД31 ^{[ 2 ]} ранее транскрипт материнской G10
Креатинкиназа ^{[ 2 ]} ЦКБ (резервуар АТФ)
Цитидиндезаминаза ^{[ 2 ]} сомнительно: вообще не присутствует на очень высоких уровнях
CPNE1 ^{[ 2 ]}
ЭНСА (ген) ^{[ 2 ]}
ФТХ1 ^{[ 2 ]} Тяжелая цепь ферритина
GDI2 ^{[ 2 ]} везикулярный трафик раб/рас
ГУК1 ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} Гуанилаткиназа переносит фосфат от АТФ к ГМФ.
HPRT ^{[ 2 ]}^{[ 17 ]}^{[ 18 ]} Гипоксантин-гуанинфосфорибозилтрансфераза
ИФИТМ1 ^{[ 2 ]} Индуцируется интерфероном, трансмембранным белком
JTB (ген) ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} Прыжок точки останова транслокации
ММПЛ2 ^{[ 2 ]}
НМЭ2 ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} (ранее NM23B) Нуклеозиддифосфаткиназа
МОЛОКО ^{[ 2 ]}^{[ 17 ]}
P4HB ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]}
PRDX1 ^{[ 2 ]} пероксиредоксин (снижает количество перекисей)
ПТМА ^{[ 2 ]} Протимозин
РПА2 ^{[ 2 ]} Связывает ДНК во время репликации, сохраняя ее выпрямленную.
СУЛЬТ1А3 ^{[ 2 ]} Сульфатная конъюгация (примечание: SULT1C упоминается в более ранней литературе как повсеместно встречающаяся ^{[ 15 ]} но это может быть примером использования разных тегов для обозначения общей области двух тесно связанных генов. Если тег слишком короткий, он может быть недостаточно конкретным, чтобы действительно отличить одного члена семейства генов от другого.)
СИНГР2 ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} Синаптогирин (может участвовать в транслокации везикул)
Тетратрикопептид , ТТС1 ^{[ 2 ]} небольшой тетратрикопептид, богатый глютамином

Open_reading_frame

Сперма/Яички

Хотя эта страница посвящена генам, которые должны экспрессироваться повсеместно, этот раздел предназначен для генов, нынешнее название которых отражает их относительную активацию в семенниках.

СПАГ7 ^{[ 2 ]}
СРМ ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} Спермидинсинтаза
ДЕЛАЛ ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} Ингибитор Bax-1
ДАЗАП2 ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} Удаляется при азооспермии
МЕРЫ1 ^{[ 2 ]}^{[ 15 ]} Мужской усиленный антиген

См. также

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и Хункпе, Бидосесси Вильфред; Шену, Франсин; де-Лима, Франсиеле; Де-Паула, Эрих Винисиус (14 июля 2020 г.). «База данных HRT Atlas v1.0: новое определение генов домашнего хозяйства человека и мыши и эталонных транскриптов-кандидатов путем анализа массивных наборов данных РНК-секвенирования» . Исследования нуклеиновых кислот . 49 (Д1): Д947–Д955. дои : 10.1093/nar/gkaa609 . ISSN 0305-1048 . ПМЦ 7778946 . ПМИД 32663312 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н ^тот ^п ^д ^р ^с ^т ^в ^v ^В ^х ^и ^С ^аа ^аб ^и ^{объявление} ^но ^из ^в ^ах ^есть ^также ^и ^аль ^{являюсь} ^а ^к ^ап ^ак ^с ^как ^в ^В ^из ^хорошо ^топор ^{является} ^тот ^нет ^бб ^{до нашей эры} ^др. ^быть ^парень ^бг ^чб ^с ^минет ^БК ^с ^бм ^млрд ^быть ^б.п. ^БК ^бр ^бс ^БТ ^этот ^бв ^б ^бх ^к ^бз ^что ^КБ ^копия ^{компакт-диск} ^Этот ^см. ^cg ^ч ^Там ^СиДжей ^ск ^кл ^см ^CN ^со ^КП ^cq ^кр ^CS ^КТ ^с ^резюме ^cw ^сх ^сай ^{чешский} ^и ^БД ^{округ Колумбия} ^дд ^из ^дф ^дг ^д ^Из ^диджей ^дк ^дл ^дм ^дн ^делать ^дп ^дк ^доктор ^дс ^дт ^из ^дв ^ДВ ^дх ^ты ^дз ^из ^Эб ^ЕС ^Эд ^да ^если ^{например} ^ага ^нет ^ej ^я ^он ^в ^в ^там ^эп. ^экв. ^{является} ^{является} ^И ^{Евросоюз} ^этот ^{Вон тот} ^бывший ^эй ^нет ^но ^ФБ ^ФК ^ФД ^фе ^фф ^фг ^фх ^быть ^фджей ^хз ^в ^фм ^фн ^фо ^фп ^fq ^фр. ^фс ^футы ^{это было} ^фв ^фу Айзенберг Э., Леванон Э.Ю. (июль 2003 г.). «Гены домашнего хозяйства человека компактны». Тенденции в генетике . 19 (7): 362–365. arXiv : q-bio/0309020 . Бибкод : 2003q.bio.....9020E . дои : 10.1016/S0168-9525(03)00140-9 . ПМИД 12850439 . S2CID 7728312 .
^ Бьютт А.Дж., Дзау В.Дж., Глюк С.Б. (декабрь 2001 г.). «Дальнейшее определение «домашнего хозяйства» или «поддержания» генов. Сосредоточьтесь на «Сборнике экспрессии генов в нормальных тканях человека» . Физиологическая геномика . 7 (2): 95–96. doi : 10.1152/физиологгеномика.2001.7.2.95 . ПМИД 11773595 .
^ Чжу Дж, Хэ Ф, Ху С, Ю Дж (октябрь 2008 г.). «О природе генов домашнего хозяйства человека». Тенденции в генетике . 24 (10): 481–484. дои : 10.1016/j.tig.2008.08.004 . ПМИД 18786740 .
^ Грир С., Ханиуэлл Р., Гелету М., Аруланандам Р., Раптис Л. (апрель 2010 г.). «Гены домашнего хозяйства; уровни экспрессии могут меняться в зависимости от плотности культивируемых клеток». Журнал иммунологических методов . 355 (1–2): 76–79. дои : 10.1016/j.jim.2010.02.006 . ПМИД 20171969 .
^ Рифкинд Р.А., Маркс П.А., Банк А, Терада М., Маниатис Г.М., Рубен Р., Фибах Э. (ноябрь – декабрь 1976 г.). «Дифференцировка эритроида и клеточный цикл: некоторые последствия от мышиных эмбриональных и эритролейкозных клеток». Анналы иммунологии . 127 (6): 887–893. ПМИД 1070288 .
^ Смейл С.Т., Кадонага Дж.Т. (2003). «Основной промотор РНК-полимеразы II». Ежегодный обзор биохимии . 72 : 449–479. doi : 10.1146/annurev.biochem.72.121801.161520 . ПМИД 12651739 .
^ Рэч Э.А., Уинтер Д.Р., Бенджамин А.М., Коркоран Д.Л., Ни Т., Чжу Дж., Олер У. (январь 2011 г.). «Модели инициации транскрипции указывают на различные стратегии регуляции генов на уровне хроматина» . ПЛОС Генетика . 7 (1): e1001274. дои : 10.1371/journal.pgen.1001274 . ПМК 3020932 . ПМИД 21249180 .
^ Ни Т., Коркоран Д.Л., Рэч Э.А., Сонг С., Спана Э.П., Гао Ю., Олер У., Чжу Дж. (июль 2010 г.). «Стратегия парного секвенирования для картирования сложного ландшафта инициации транскрипции» . Природные методы . 7 (7): 521–527. дои : 10.1038/nmeth.1464 . ПМК 3197272 . ПМИД 20495556 .
^ Карнинчи П., Санделин А., Ленхард Б., Катаяма С., Симокава К., Поньявич Дж. и др. (июнь 2006 г.). «Полногеномный анализ архитектуры и эволюции промотора млекопитающих». Природная генетика . 38 (6): 626–635. дои : 10.1038/ng1789 . ПМИД 16645617 . S2CID 22205897 .
^ Хоскинс Р.А., Ландолин Дж.М., Браун Дж.Б., Сандлер Дж.Е., Такахаши Х., Лассманн Т. и др. (февраль 2011 г.). «Полногеномный анализ архитектуры промотора у Drosophila melanogaster» . Геномные исследования . 21 (2): 182–192. дои : 10.1101/гр.112466.110 . ПМК 3032922 . ПМИД 21177961 .
^ Лам К.К., Мюльпфордт Ф., Вакерисас Дж.М., Раджа С.Дж., Хольц Х., Ласкомб Н.М. и др. (2012). «Комплекс NSL регулирует гены домашнего хозяйства у дрозофилы» . ПЛОС Генетика . 8 (6): e1002736. дои : 10.1371/journal.pgen.1002736 . ПМЦ 3375229 . ПМИД 22723752 .
^ Лам К.С., Чунг Х.Р., Семплисио Г., Айер С.С., Гауб А., Бхардвадж В. и др. (февраль 2019 г.). «Нуклеосомный ландшафт, опосредованный комплексом NSL, необходим для поддержания точности транскрипции и подавления транскрипционного шума» . Гены и развитие . 33 (7–8): 452–465. дои : 10.1101/gad.321489.118 . ПМК 6446542 . ПМИД 30819819 .
^ Забиди М.А., Арнольд С.Д., Шернхубер К., Пагани М., Рат М., Фрэнк О., Старк А. (февраль 2015 г.). «Специфичность энхансера-ядра-промотора разделяет регуляцию генов развития и домашнего хозяйства» . Природа . 518 (7540): 556–559. Бибкод : 2015Natur.518..556Z . дои : 10.1038/nature13994 . ПМК 6795551 . ПМИД 25517091 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н ^тот ^п ^д ^р ^с ^т ^в ^v ^В ^х ^и ^С ^аа ^аб ^и ^{объявление} ^но ^из ^в ^ах ^есть ^также ^и ^аль ^{являюсь} ^а ^к ^ап ^ак ^с ^как ^в ^В ^из ^хорошо ^топор ^{является} ^тот ^нет ^бб ^{до нашей эры} ^др. ^быть ^парень ^бг ^чб ^с ^минет ^БК ^с ^бм ^млрд ^быть ^б.п. ^БК ^бр ^бс ^БТ ^этот ^бв ^б ^бх ^к ^бз ^что ^КБ ^копия ^{компакт-диск} ^Этот ^см. ^cg ^ч ^Там ^СиДжей ^ск ^кл ^см ^CN ^со [ Бесплатная статья PMC ] [ PubMed ] Велкулеску В.Е., Мэдден С.Л., Чжан Л., Лэш А.Е., Ю Дж., Раго С., Кинг А., Ван СиДжей, Бодри Г.А., Сириелло К.М., Кук Б.П., Дюфо М.Р., Фергюсон А.Т., Гао Ю., Хе ТК, Хермекинг Х, Хиральдо С.К., Хван П.М., Лопес М.А., Людерер Х.Ф., Мэтьюз Б., Петрозиелло Дж.М., Поляк К., Завел Л., Кинцлер К.В. (декабрь 1999 г.). «Анализ транскриптомов человека». Природная генетика . 23 (4): 387–388. дои : 10.1038/70487 . ПМИД 10581018 . S2CID 29173492 .
^ Сяо Л.Л., Дангонд Ф., Ёсида Т., Хонг Р., Дженсен Р.В., Мисра Дж. и др. (декабрь 2001 г.). «Сборник экспрессии генов в нормальных тканях человека». Физиологическая геномика . 7 (2): 97–104. CiteSeerX 10.1.1.333.2656 . doi : 10.1152/физиологгеномика.00040.2001 . ПМИД 11773596 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж Квиаген. «RT2 Profiler PCR Array (формат 96 лунок и формат 384 лунок»). Каталог Qiagen № 330231 PAHS-00ZA .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Карадек Дж., Сираб Н., Кемеугни С., Мутеро С., Чиминки М., Матар С., Рево Д., Бах М., Маниве П., Конти М., Лорик С. (март 2010 г.). « Отчаянные домашние гены: драматический пример гипоксии» . Британский журнал рака . 102 (6): 1037–1043. дои : 10.1038/sj.bjc.6605573 . ПМЦ 2844028 . ПМИД 20179706 .

Внешние ссылки

Хункпе Б (2020). «Обновленный список генов и транскриптов домашнего хозяйства человека и мыши. База данных Атласа HRT» . Исследования нуклеиновых кислот . 49 (Д1). Университет Кампинаса: D947–D955. дои : 10.1093/nar/gkaa609 . ПМЦ 7778946 . ПМИД 32663312 . От Хункпе Б.В., Ченоу Ф.; де Лима Ф; Де Паула Исследование нуклеиновых кислот E
Айзенберг Э. «Список генов домашнего хозяйства человека» . Тель-Авивский университет. От Айзенберга Э., Леванона Э.Ю.; Тенденции в генетике 19, 362–365 (2003).
Айзенберг Э. «Список генов домашнего хозяйства человека» . Тель-Авивский университет. От Айзенберга Э., Леванона Э.Ю.; Тенденции в генетике, 29 (2013)

[:0-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и Хункпе, Бидосесси Вильфред; Шену, Франсин; де-Лима, Франсиеле; Де-Паула, Эрих Винисиус (14 июля 2020 г.). «База данных HRT Atlas v1.0: новое определение генов домашнего хозяйства человека и мыши и эталонных транскриптов-кандидатов путем анализа массивных наборов данных РНК-секвенирования» . Исследования нуклеиновых кислот . 49 (Д1): Д947–Д955. дои : 10.1093/nar/gkaa609 . ISSN 0305-1048 . ПМЦ 7778946 . ПМИД 32663312 .

[housekeeping-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н ^тот ^п ^д ^р ^с ^т ^в ^v ^В ^х ^и ^С ^аа ^аб ^и ^{объявление} ^но ^из ^в ^ах ^есть ^также ^и ^аль ^{являюсь} ^а ^к ^ап ^ак ^с ^как ^в ^В ^из ^хорошо ^топор ^{является} ^тот ^нет ^бб ^{до нашей эры} ^др. ^быть ^парень ^бг ^чб ^с ^минет ^БК ^с ^бм ^млрд ^быть ^б.п. ^БК ^бр ^бс ^БТ ^этот ^бв ^б ^бх ^к ^бз ^что ^КБ ^копия ^{компакт-диск} ^Этот ^см. ^cg ^ч ^Там ^СиДжей ^ск ^кл ^см ^CN ^со ^КП ^cq ^кр ^CS ^КТ ^с ^резюме ^cw ^сх ^сай ^{чешский} ^и ^БД ^{округ Колумбия} ^дд ^из ^дф ^дг ^д ^Из ^диджей ^дк ^дл ^дм ^дн ^делать ^дп ^дк ^доктор ^дс ^дт ^из ^дв ^ДВ ^дх ^ты ^дз ^из ^Эб ^ЕС ^Эд ^да ^если ^{например} ^ага ^нет ^ej ^я ^он ^в ^в ^там ^эп. ^экв. ^{является} ^{является} ^И ^{Евросоюз} ^этот ^{Вон тот} ^бывший ^эй ^нет ^но ^ФБ ^ФК ^ФД ^фе ^фф ^фг ^фх ^быть ^фджей ^хз ^в ^фм ^фн ^фо ^фп ^fq ^фр. ^фс ^футы ^{это было} ^фв ^фу Айзенберг Э., Леванон Э.Ю. (июль 2003 г.). «Гены домашнего хозяйства человека компактны». Тенденции в генетике . 19 (7): 362–365. arXiv : q-bio/0309020 . Бибкод : 2003q.bio.....9020E . дои : 10.1016/S0168-9525(03)00140-9 . ПМИД 12850439 . S2CID 7728312 .

[Butte-3] Бьютт А.Дж., Дзау В.Дж., Глюк С.Б. (декабрь 2001 г.). «Дальнейшее определение «домашнего хозяйства» или «поддержания» генов. Сосредоточьтесь на «Сборнике экспрессии генов в нормальных тканях человека» . Физиологическая геномика . 7 (2): 95–96. doi : 10.1152/физиологгеномика.2001.7.2.95 . ПМИД 11773595 .

[Jiang-4] Чжу Дж, Хэ Ф, Ху С, Ю Дж (октябрь 2008 г.). «О природе генов домашнего хозяйства человека». Тенденции в генетике . 24 (10): 481–484. дои : 10.1016/j.tig.2008.08.004 . ПМИД 18786740 .

[Greer-5] Грир С., Ханиуэлл Р., Гелету М., Аруланандам Р., Раптис Л. (апрель 2010 г.). «Гены домашнего хозяйства; уровни экспрессии могут меняться в зависимости от плотности культивируемых клеток». Журнал иммунологических методов . 355 (1–2): 76–79. дои : 10.1016/j.jim.2010.02.006 . ПМИД 20171969 .

[oldest-6] Рифкинд Р.А., Маркс П.А., Банк А, Терада М., Маниатис Г.М., Рубен Р., Фибах Э. (ноябрь – декабрь 1976 г.). «Дифференцировка эритроида и клеточный цикл: некоторые последствия от мышиных эмбриональных и эритролейкозных клеток». Анналы иммунологии . 127 (6): 887–893. ПМИД 1070288 .

[7] Смейл С.Т., Кадонага Дж.Т. (2003). «Основной промотор РНК-полимеразы II». Ежегодный обзор биохимии . 72 : 449–479. doi : 10.1146/annurev.biochem.72.121801.161520 . ПМИД 12651739 .

[8] Рэч Э.А., Уинтер Д.Р., Бенджамин А.М., Коркоран Д.Л., Ни Т., Чжу Дж., Олер У. (январь 2011 г.). «Модели инициации транскрипции указывают на различные стратегии регуляции генов на уровне хроматина» . ПЛОС Генетика . 7 (1): e1001274. дои : 10.1371/journal.pgen.1001274 . ПМК 3020932 . ПМИД 21249180 .

[9] Ни Т., Коркоран Д.Л., Рэч Э.А., Сонг С., Спана Э.П., Гао Ю., Олер У., Чжу Дж. (июль 2010 г.). «Стратегия парного секвенирования для картирования сложного ландшафта инициации транскрипции» . Природные методы . 7 (7): 521–527. дои : 10.1038/nmeth.1464 . ПМК 3197272 . ПМИД 20495556 .

[10] Карнинчи П., Санделин А., Ленхард Б., Катаяма С., Симокава К., Поньявич Дж. и др. (июнь 2006 г.). «Полногеномный анализ архитектуры и эволюции промотора млекопитающих». Природная генетика . 38 (6): 626–635. дои : 10.1038/ng1789 . ПМИД 16645617 . S2CID 22205897 .

[11] Хоскинс Р.А., Ландолин Дж.М., Браун Дж.Б., Сандлер Дж.Е., Такахаши Х., Лассманн Т. и др. (февраль 2011 г.). «Полногеномный анализ архитектуры промотора у Drosophila melanogaster» . Геномные исследования . 21 (2): 182–192. дои : 10.1101/гр.112466.110 . ПМК 3032922 . ПМИД 21177961 .

[12] Лам К.К., Мюльпфордт Ф., Вакерисас Дж.М., Раджа С.Дж., Хольц Х., Ласкомб Н.М. и др. (2012). «Комплекс NSL регулирует гены домашнего хозяйства у дрозофилы» . ПЛОС Генетика . 8 (6): e1002736. дои : 10.1371/journal.pgen.1002736 . ПМЦ 3375229 . ПМИД 22723752 .

[13] Лам К.С., Чунг Х.Р., Семплисио Г., Айер С.С., Гауб А., Бхардвадж В. и др. (февраль 2019 г.). «Нуклеосомный ландшафт, опосредованный комплексом NSL, необходим для поддержания точности транскрипции и подавления транскрипционного шума» . Гены и развитие . 33 (7–8): 452–465. дои : 10.1101/gad.321489.118 . ПМК 6446542 . ПМИД 30819819 .

[14] Забиди М.А., Арнольд С.Д., Шернхубер К., Пагани М., Рат М., Фрэнк О., Старк А. (февраль 2015 г.). «Специфичность энхансера-ядра-промотора разделяет регуляцию генов развития и домашнего хозяйства» . Природа . 518 (7540): 556–559. Бибкод : 2015Natur.518..556Z . дои : 10.1038/nature13994 . ПМК 6795551 . ПМИД 25517091 .

[everycell-15] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н ^тот ^п ^д ^р ^с ^т ^в ^v ^В ^х ^и ^С ^аа ^аб ^и ^{объявление} ^но ^из ^в ^ах ^есть ^также ^и ^аль ^{являюсь} ^а ^к ^ап ^ак ^с ^как ^в ^В ^из ^хорошо ^топор ^{является} ^тот ^нет ^бб ^{до нашей эры} ^др. ^быть ^парень ^бг ^чб ^с ^минет ^БК ^с ^бм ^млрд ^быть ^б.п. ^БК ^бр ^бс ^БТ ^этот ^бв ^б ^бх ^к ^бз ^что ^КБ ^копия ^{компакт-диск} ^Этот ^см. ^cg ^ч ^Там ^СиДжей ^ск ^кл ^см ^CN ^со [ Бесплатная статья PMC ] [ PubMed ] Велкулеску В.Е., Мэдден С.Л., Чжан Л., Лэш А.Е., Ю Дж., Раго С., Кинг А., Ван СиДжей, Бодри Г.А., Сириелло К.М., Кук Б.П., Дюфо М.Р., Фергюсон А.Т., Гао Ю., Хе ТК, Хермекинг Х, Хиральдо С.К., Хван П.М., Лопес М.А., Людерер Х.Ф., Мэтьюз Б., Петрозиелло Дж.М., Поляк К., Завел Л., Кинцлер К.В. (декабрь 1999 г.). «Анализ транскриптомов человека». Природная генетика . 23 (4): 387–388. дои : 10.1038/70487 . ПМИД 10581018 . S2CID 29173492 .

[Hsiao-16] Сяо Л.Л., Дангонд Ф., Ёсида Т., Хонг Р., Дженсен Р.В., Мисра Дж. и др. (декабрь 2001 г.). «Сборник экспрессии генов в нормальных тканях человека». Физиологическая геномика . 7 (2): 97–104. CiteSeerX 10.1.1.333.2656 . doi : 10.1152/физиологгеномика.00040.2001 . ПМИД 11773596 .

[quiagen-17] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж Квиаген. «RT2 Profiler PCR Array (формат 96 лунок и формат 384 лунок»). Каталог Qiagen № 330231 PAHS-00ZA .

[desperate-18] Перейти обратно: ^а ^б ^с Карадек Дж., Сираб Н., Кемеугни С., Мутеро С., Чиминки М., Матар С., Рево Д., Бах М., Маниве П., Конти М., Лорик С. (март 2010 г.). « Отчаянные домашние гены: драматический пример гипоксии» . Британский журнал рака . 102 (6): 1037–1043. дои : 10.1038/sj.bjc.6605573 . ПМЦ 2844028 . ПМИД 20179706 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]