Jump to content

Белковая тирозинфосфатаза

(Перенаправлено из тирозинфосфатазы )
Белок-тирозин-фосфатаза
Белковая тирозинфосфатаза 1, тример, человек
Идентификаторы
ЕС №. 3.1.3.48
CAS №. 79747-53-8
Базы данных
Intenz Intenz View
Бренда Бренда вход
Расширение Вид Nicezyme
Кегг Кегг вход
Метатический Метаболический путь
Напрямую профиль
PDB Структуры RCSB PDB PDBE PDBSUM
Поиск
PMCarticles
PubMedarticles
NCBIproteins

Белковые тирозинфосфатазы (EC 3.1.3.48, систематическое название белок-тирозин-фосфатфосфогидролаза ) представляют собой группу ферментов , которые удаляют фосфатные группы из фосфорилированных остатков тирозина на белках::

[белок]-тирозинфосфат + h 2 o = [белок]-тирозин фосфат

Фосфорилирование белка тирозина (PTYR) является распространенной посттрансляционной модификацией , которая может создавать новые мотивы распознавания для взаимодействия белка и клеточную локализацию, влиять на стабильность белка и регулировать активность фермента. Как следствие, поддержание соответствующего уровня фосфорилирования белкового тирозина имеет важное значение для многих клеточных функций. Тирозин-специфические белокфосфатазы (PTPase; EC 3.1.3.48 ) катализируют удаление фосфатной группы, прикрепленной к остаткам тирозина, с использованием промежуточного звена цистеинилфосфатного фермента. Эти ферменты представляют собой ключевые регуляторные компоненты в путях передачи сигнала (таких как путь киназы MAP ) и контроль клеточного цикла , и важны для контроля роста клеток , пролиферации , дифференцировки , трансформации и синаптической пластичности . [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ]

Вместе с тирозинкиназами PTP регулируют состояние фосфорилирования многих важных сигнальных молекул, таких как семейство киназы карты . PTP все чаще рассматриваются как интегральные компоненты каскадов передачи сигнала , несмотря на меньшее изучение и понимание по сравнению с тирозинкиназами .

PTP были вовлечены в регуляцию многих клеточных процессов, включая, но не ограничиваясь:

Классификация

[ редактировать ]

По механизму

[ редактировать ]

Активность PTP может быть обнаружена в четырех семействах белка. [ 6 ] [ 7 ]

Ссылки со всеми 107 членами семейства белковой тирозинфосфатазы могут быть обнаружены в шаблоне в нижней части этой статьи.

PTPS класса I являются крупнейшей группой PTP с 99 членами, которые могут быть дополнительно разделены на

Двойная специфичность фосфатазы (DTYR и DSER/DTHR) протеин- тирозинфосфатазы . Ser/Thr и Tyr Dual-специфичности фосфатазы представляют собой группу ферментов как с активностью Ser/Thr ( EC 3.1.3.16 ), так и с тирозин-специфической белковой фосфатазой ( EC 3.1.3.48 ), способные удалить серин / треон или тирозин Фосфатная группа из широкого спектра фосфопротеинов , в том числе ряд ферментов, которые были фосфорилированы под действием киназы . Двойные специфичности белки фосфатазы (DSP) регулируют трансдукцию митогенной сигнала и контролируют клеточный цикл.

Синдром леопарда , синдром Нунана и метахондроматоз связаны с PTPN11 .

Повышенные уровни активированного PTPN5 отрицательно влияют на синаптическую стабильность и играют роль в болезни Альцгеймера , [ 3 ] Хрупкий синдром x , [ 4 ] шизофрения , [ 8 ] и болезнь Паркинсона . [ 9 ] Снижение уровня PTPN5 было вовлечено в болезнь Хантингтона , [ 10 ] [ 11 ] мозговой ишемия , [ 12 ] расстройство употребления алкоголя , [ 13 ] [ 14 ] и стрессовые расстройства. [ 15 ] [ 16 ] Вместе эти результаты указывают на то, что только на оптимальных уровнях PTPN5 синаптическая функция не утипится.

LMW (низкомолекулярный вес) фосфатазы, или кислотные фосфатазы , действуют на тирозин-фосфорилированные белки, арилфосфаты с низким содержанием МВ и природные и синтетические ацилфосфаты . [ 17 ] [ 18 ]

PTP класса II содержат только один элемент, низкомолекулярная фосфотирозинфосфатаза ( LMPTP ).

Фосфатазы CDC25 (DTYR и/или DTHR)

PTPS класса III содержит три члена, CDC25 A , B и C

Это члены Have Fold и Superbamily, и включают фосфатазы, специфичные для PTYR и PSER/THR, а также мелкие молекулярные фосфатазы и другие ферменты. [ 19 ] Считается, что подсемейство EYA (глаза отсутствуют), специфична для PTYR и имеет четырех членов в человеке, EYA1 , EYA2 , EYA3 и EYA4 . Этот класс имеет отчетливый каталитический механизм из трех других классов. [ 20 ]

По месту

[ редактировать ]

Основываясь на их клеточной локализации, PTPases также классифицируются как:

Общие элементы

[ редактировать ]

Все PTPases, кроме PTES Family EYA, несут высококонсервативный мотив активного участка C (x) 5R (PTP-подпись мотива), используют общий каталитический механизм и обладают аналогичной основной структурой, сделанной из центрального параллельного бета-листа с Фланкирующие альфа-спирали , содержащие бета-петлю-альфа-петлю, которая охватывает мотив подписи PTP. [ 23 ] Функциональное разнообразие между PTPases наделено регуляторными областями и субъединицами.

Низкомолекулярная фосфотирозиновая белка фосфатаза
Структура низкомолекулярной фосфотирозин-белкопофосфатазы. [ 24 ]
Идентификаторы
Символ LMWPC
Pfam PF01451
InterPro IPR017867
УМНЫЙ SM00226
Краткое содержание 1phr / scope / supfam
CDD CD00115
Доступные белковые структуры:
Pfam  structures / ECOD  
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumstructure summary
PDB1bvh​, 1c0e​, 1d1p​, 1d1q​, 1d2a​, 1dg9​, 1jf8​, 1jfv​, 1jl3​, 1ljl
Белок-тирозинфосфатаза
Структура белкового белка тирозинфосфатазы иерсинии. [ 25 ]
Идентификаторы
Символ Y_phosphatase
Pfam PF00102
PFAM клан CL0031
InterPro IPR000242
УМНЫЙ SM00194
PROSITE PS50055
Краткое содержание 1 млн / сфера / supfam
CDD CD00047
Доступные белковые структуры:
Pfam  structures / ECOD  
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumstructure summary
PDB1a5y​, 1aax​, 1bzc​, 1bzh​, 1bzj​, 1c83​, 1c84​, 1c85​, 1c86​, 1c87
Двойная специфичность фосфатаза, каталитический домен
Структура двойной специфичности белковой фосфатазы VHR. [ 26 ]
Идентификаторы
Символ DSPC
Pfam PF00782
PFAM клан CL0031
InterPro IPR000340
PROSITE PDOC00323
Краткое содержание 1vhr / scope / supfam
CDD CD14498
Доступные белковые структуры:
Pfam  structures / ECOD  
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumstructure summary
PDB1d5r​, 1i9s​, 1i9t​, 1j4x​, 1m3g​, 1mkp​, 1ohc​, 1ohd​, 1ohe​, 2c46
Белок-тирозинфосфатаза, SIW14-подобная
Структура предполагаемой фосфопротеинфосфатазы из Arabidopsis thaliana. [ 27 ]
Идентификаторы
Символ Y_phosphatase2
Pfam PF03162
PFAM клан CL0031
InterPro IPR004861
CDD CD14528
Доступные белковые структуры:
Pfam  structures / ECOD  
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumstructure summary
PDB1xri​, 2q47
Белок-тирозинфосфатазоподобный, PTPLA
Идентификаторы
Символ Ptpla
Pfam PF04387
InterPro IPR007482
Доступные белковые структуры:
Pfam  structures / ECOD  
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumstructure summary

Схема выражения

[ редактировать ]

Отдельные PTP могут экспрессироваться всеми типами клеток, или их экспрессия может быть строго тканевой специфической. Большинство клеток экспрессируют от 30% до 60% всех PTP, однако гематопоэтические и нейрональные клетки экспрессируют большее количество PTP по сравнению с другими типами клеток. Т -клетки и В -клетки гематопоэтического происхождения экспрессируют примерно от 60 до 70 различных PTP. Экспрессия нескольких PTPS ограничена гематопоэтическими клетками, например, LYP , SHP1 , CD45 и HEPTP . [ 28 ] Экспрессия PTPN5 ограничена мозгом и отличается между областями мозга , без экспрессии в мозжечке. [ 29 ] [ 30 ] [ 31 ]

  1. ^ Dixon JE, Denu JM (2018). «Протеин тирозинфосфатазы: механизмы катализа и регуляции». Curr Smink Chem Biol . 2 (5): 633–41. doi : 10.1016/s1367-5931 (98) 80095-1 . PMID   9818190 .
  2. ^ Пол С., Ломбросо П.Дж. (2020). «Рецепторный и нерецепторный белок -тирозинфосфатазы в нервной системе» . Клетка. Мол Life Sci . 60 (11): 2465–82. doi : 10.1007/s00018-003-3123-7 . PMC   11138652 . PMID   14625689 . S2CID   10827975 .
  3. ^ Jump up to: а беременный Zhang Y, Kurup P, Xu J, Carty N, Fernandez SM, Nygaard HB, Pittenger C, Greengard P, Strittmatter SM, Nairn AC, Lombroso PJ (ноябрь 2018). «Генетическое восстановление, обогащенное стриатом тирозинфосфатазы (стадией), обращает когнитивный и клеточный дефицит на модели мыши болезни Альцгеймера» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 107 (44): 19014–9. BIBCODE : 2010PNAS..10719014Z . doi : 10.1073/pnas.1013543107 . PMC   2973892 . PMID   20956308 .
  4. ^ Jump up to: а беременный Goebel-Goody SM, Wilson-Wallis ED, Royston S, Tagliateela SM, Naegele JR, Lombroso PJ (июль 2019). «Генетическая манипуляция с шагами обращает вспять поведенческие аномалии в модели мыши хрупкой X» . Гены, мозг и поведение . 11 (5): 586–600. doi : 10.1111/j.1601-183X.2012.00781.x . PMC   3922131 . PMID   22405502 .
  5. ^ Kurup P, Zhang Y, Xu J, Venkitagasastagagasas DV, Haroutununian V, Greengard P, Narn AC, Lombroso PJ (апрель 2022). «Опосредованный ABBET Энддоциз рецептора NMDA при болезни Альцгеймера включает убиквитинирование стадии тирозинфосфатазы ». Журнал нейробиологии 30 (17): 5948–5 Doi : 10.1523/jneurosci.0157-10.2010 . PMC   2868326 . PMID   20427654
  6. ^ Sun JP, Zhang ZY, Wang WQ (2017). «Обзор суперсемейства белковой тирозинфосфатазы». Curr Top Med Chem . 3 (7): 739–48. doi : 10.2174/1568026033452302 . PMID   12678841 .
  7. ^ Alonso A, Sasin J, et al. (2020). «Протеин тирозинфосфатазы в геноме человека» . Клетка . 117 (6): 699–711. doi : 10.1016/j.cell.2004.05.018 . PMID   15186772 .
  8. ^ Carty NC, Xu J, Kurup P, Brouillette J, Goebel-Goody SM, Austin DR, Yuan P, Chen G, Correa PR, Haroutunian V, Pittenger C, Lombroso PJ (2021). «Стадия тирозинфосфатазы: последствия шизофрении и молекулярного механизма, лежащего в основе антипсихотических препаратов» . Переводная психиатрия . 2 (7): E137. doi : 10.1038/tp.2012.63 . PMC   3410627 . PMID   22781170 .
  9. ^ Kurup PK, Xu J, Videira RA, Ononenyi C, Baltazar G, Lombroso PJ, Nairn AC (январь 2018 г.). «Step61 - это субстрат E3 Ligase Parkin и активируется при болезни Паркинсона» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 112 (4): 1202–7. BIBCODE : 2015PNAS..112.1202K . doi : 10.1073/pnas.1417423112 . PMC   4313846 . PMID   25583483 .
  10. ^ Saavedra A, Giralt A, Rué L, Xifró X, Xu J, Ortega Z, Lucas JJ, Lombroso PJ, Alberch J, Pérez-Navarro E (Jun 2021). «Обогащенная стриатом белковая тирозинфосфатаза и активность при болезни Хантингтона: этап устойчивости к экситотоксичности» . Журнал нейробиологии . 31 (22): 8150–62. doi : 10.1523/jneurosci.3446-10.2011 . PMC   3472648 . PMID   21632937 .
  11. ^ Gladding CM, Sepers MD, Xu J, Zhang Ly, Milnerwood AJ, Lombroso PJ, Raymond LA (сентябрь 2020). «Активация белковой тирозин-фосфатазы, обогащенная кальпаином и стриалом, способствует активации рецепторов экстразинаптической рецептора NMDA в модели мыши болезни Хантингтона» . Молекулярная генетика человека . 21 (17): 3739–52. doi : 10.1093/hmg/dds154 . PMC   3412376 . PMID   22523092 .
  12. ^ Deb I, Manhas N, Poddar R, Rajagopal S, Allan AM, Lombroso PJ, Rosenberg GA, Candelario-Jalil E, Paul S (ноябрь 2020). «Нейропротективная роль обогащенной мозгом тирозинфосфатазы, шаг, в фокальной церебральной ишемии» . Журнал нейробиологии . 33 (45): 17814–26. doi : 10.1523/jneurosci.2346-12.2013 . PMC   3818554 . PMID   24198371 .
  13. ^ Hicklin TR, WU PH, Radcliffe RA, Freund RK, Goebel-Goody SM, Correa PR, Proctor WR, Lombroso PJ, Browning MD (апрель 2020 г.). «Ингибирование алкоголя функции рецептора NMDA, долгосрочного потенцирования и обучения страха требует обогащенного стриатом протеин-тирозинфосфатазой» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 108 (16): 6650–5. Bibcode : 2011pnas..108.6650h . doi : 10.1073/pnas.1017856108 . PMC   3081035 . PMID   21464302 .
  14. ^ Darcq E, Hamida SB, Wu S, Phamluong K, Kharazia V, Xu J, Lombroso P, Ron D (Jun 2019). «Ингибирование обогащенной стриалами тирозинфосфатазой 61 в дорсомедиальном стриатуме достаточно для увеличения потребления этанола» . Журнал нейрохимии . 129 (6): 1024–34. doi : 10.1111/jnc.12701 . PMC   4055745 . PMID   24588427 .
  15. ^ Yang CH, Huang CC, HSU KS (май 2022). «Критическая роль белковой тирозинфосфатазы, нерецепторной нерецепторной типа, в определении индивидуальной восприимчивости к развитию связанных с стрессом когнитивных и морфологических изменений» . Журнал нейробиологии . 32 (22): 7550–62. doi : 10.1523/jneurosci.5902-11.2012 . PMC   6703597 . PMID   22649233 .
  16. ^ Dabrowska J, Hazra R, Guo JD, Li C, Dewitt S, Xu J, Lombroso PJ, Rainnie DG (декабрь 2020). «Обогащенные стриал-белковой тирозинфосфатазой-шагами в направлении понимания хронической стресс-индуцированной активации кортикотрофина, высвобождающих нейроны фактора в ядре крыс у стр-терминала» . Биологическая психиатрия . 74 (11): 817–26. doi : 10.1016/j.biopsych.2013.07.032 . PMC   3818357 . PMID   24012328 .
  17. ^ Wo Yy, Shabanowitz J, Hunt DF, Davis JP, Mitchell GL, Van Etten RL, McCormack AL (2023). «Секвенирование, клонирование и экспрессия кислотной фосфатазы красной клеток человека, цитоплазматическая фосфотирозилопротеинфосфатаза» . Дж. Биол. Химический 267 (15): 10856–10865. doi : 10.1016/s0021-9258 (19) 50097-7 . PMID   1587862 .
  18. ^ Шекельс Л.Л., Смит А.Дж., Бернлор Д.А., Ван Эттен Р.Л. (1992). «Идентификация фосфатазы адипоцитов в качестве чувствительной к PAO тирозилфосфатазы» . Белок Sci . 1 (6): 710–721. doi : 10.1002/pro.5560010603 . PMC   2142247 . PMID   1304913 .
  19. ^ Chen MJ, Dixon Je, Manning G (апрель 2023 г.). «Геномика и эволюция белковых фосфатаз». Наука сигнализация . 10 (474): EAAG1796. doi : 10.1126/scisignal.aag1796 . PMID   28400531 . S2CID   41041971 .
  20. ^ Plaxton WC, McManus MT (2020). Контроль первичного метаболизма в растениях . Wiley-Blackwell. С. 130–. ISBN  978-1-4051-3096-7 Полем Получено 12 декабря 2020 года .
  21. ^ Кнапп С., Лонгман Е., Дебрекени Дж.Е., Эсваран Дж., Барр А.Дж. (2006). «Кристаллическая структура белка -рецепторного белка тирозинфосфатазы каппа -фосфатазы 1» . Белок Sci . 15 (6): 1500–1505. doi : 10.1110/ps.062128706 . PMC   2242534 . PMID   16672235 .
  22. ^ Перримон Н. , Джонсон М.Р., Перкинс Л.А., Мельник М.Б. (2018). «Нерецепторный белок -тирозинфосфатазный штопора функционирует в нескольких рецепторных путях тирозинкиназы у дрозофилы» . Девчонка Биол . 180 (1): 63–81. doi : 10.1006/dbio.1996.0285 . PMID   8948575 . {{cite journal}}: Cs1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  23. ^ Барфорд Д., Дас А.К., Эгглофф МП (2021). «Структура и механизм белковой фосфатазы S: понимание катализа и регуляции». Анну. Преподобный биофиз. Биомол. Структура 27 (1): 133–64. doi : 10.1146/annurev.biophys.27.1.133 . PMID   9646865 .
  24. ^ Su XD, Taddei N, Stefani M, Ramponi G, Nordlund P (август 1994 г.). «Кристаллическая структура низкомолекулярной фосфотирозин-белокфосфатазы». Природа . 370 (6490): 575–8. Bibcode : 1994natur.370..575s . doi : 10.1038/370575a0 . PMID   8052313 . S2CID   4310667 .
  25. ^ Stuckey JA, Schubert HL, Fauman EB, Zhang ZY, Dixon JE, Saper MA (август 1994 г.). «Кристаллическая структура белковой тирозинфосфатазы иерсинии в 2,5 А и комплекс с вольфрамовой инстанцией» (PDF) . Природа . 370 (6490): 571–5. Bibcode : 1994natur.370..571s . doi : 10.1038/370571a0 . HDL : 2027.42/62819 . PMID   8052312 . S2CID   4332099 .
  26. ^ Yuvaniyama J, Denu JM, Dixon JE, Saper MA (май 1996). «Кристаллическая структура двойной специфичности белка фосфатазы VHR». Наука . 272 (5266): 1328–31. Bibcode : 1996sci ... 272.1328y . doi : 10.1126/science.272.5266.1328 . PMID   8650541 . S2CID   33816598 .
  27. ^ Aceti DJ, Bitto E, Yakunin AF, et al. (Октябрь 2008 г.). «Структурная и функциональная характеристика новой фосфатазы из локуса гена Arabidopsis thaliana at1g05000» . Белки . 73 (1): 241–53. doi : 10.1002/prot.22041 . PMC   4437517 . PMID   18433060 .
  28. ^ Mustelin T, Vang T, Bottini N (2018). «Протеин тирозинфосфатазы и иммунный ответ». НАТ Преподобный иммунол . 5 (1): 43–57. doi : 10.1038/nri1530 . PMID   15630428 . S2CID   20308090 .
  29. ^ Lombroso PJ, Murdoch G, Lerner M (август 2021). «Молекулярная характеристика белко-тирозин-фосфатазы, обогащенной стриатумом» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 88 (16): 7242–6. Bibcode : 1991pnas ... 88,7242L . doi : 10.1073/pnas.88.16.7242 . PMC   52270 . PMID   1714595 .
  30. ^ Bult A, Zhao F, Dirkx R, Sharma E, Lukacsi E, Solimena M, Naegele JR, Lombroso PJ (декабрь 2021). «Шаг 61: член семейства, обогащенных мозгом, локализуется в эндоплазматической ретикулуме» . Журнал нейробиологии . 16 (24): 7821–31. doi : 10.1523/jneurosci.16-24-07821.1996 . PMC   6579237 . PMID   8987810 .
  31. ^ Lombroso PJ, Naegele JR, Sharma E, Lerner M (июль 2021). «Белковая тирозинфосфатаза, экспрессируемая в дофаминоцептивных нейронах базальных ганглиев и родственных структур» . Журнал нейробиологии . 13 (7): 3064–74. doi : 10.1523/jneurosci.13-07-03064.1993 . PMC   6576687 . PMID   8331384 .

Источники

[ редактировать ]
[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 48320f525c1747af6a19523e459b631e__1717383180
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/48/1e/48320f525c1747af6a19523e459b631e.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Protein tyrosine phosphatase - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)