Б3ГАТ1

Б3ГАТ1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1V82, 1V83, 1V84
Идентификаторы
Псевдонимы	B3GAT1 , CD57, GLCATP, GLCUATP, HNK1, LEU7, NK-1, NK1, бета-1,3-глюкуронилтрансфераза 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 151290 ; МГИ : 1924148 ; Гомологен : 49551 ; Генные карты : B3GAT1 ; ОМА : B3GAT1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 11 (human)
End	134,412,242 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 9 (mouse)
End	26,674,397 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	C1 segment; ; right frontal lobe; ; amygdala; ; anterior cingulate cortex; ; prefrontal cortex; ; Brodmann area 9; ; hippocampus proper; ; putamen; ; nucleus accumbens; ; Region I of hippocampus proper;
	Top expressed in
	habenula; ; visual cortex; ; primary visual cortex; ; piriform cortex; ; superior frontal gyrus; ; subiculum; ; dentate gyrus; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; lateral septal nucleus; ; superior colliculus;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	transferase activity; metal ion binding; galactosylgalactosylxylosylprotein 3-beta-glucuronosyltransferase activity; UDP-galactose:beta-N-acetylglucosamine beta-1,3-galactosyltransferase activity;
Cellular component	integral component of membrane; Golgi apparatus; membrane; extracellular region; endoplasmic reticulum; endoplasmic reticulum membrane; intracellular membrane-bounded organelle; Golgi membrane;
Biological process	glycosaminoglycan metabolic process; protein glycosylation; chondroitin sulfate proteoglycan biosynthetic process; chondroitin sulfate metabolic process; carbohydrate metabolic process; cellular response to hypoxia;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	27087
	76898
	ENSG00000109956
	ENSMUSG00000045994
	Q9P2W7
	Q9CW73
	НМ_018644 ; НМ_054025 ; НМ_001367973
	НМ_029792 ; НМ_001310766
	НП_061114 ; НП_473366 ; НП_001354902
	НП_001297695 ; НП_084068
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

3-бета-глюкуронозилтрансфераза 1 (B3GAT1) представляет собой фермент , который у человека кодируется B3GAT1 геном CD57 , ферментативная активность которого создает эпитоп на других белках клеточной поверхности. ^{[ 5 ]} В иммунологии CD57 антиген (CD означает «кластер дифференцировки ») также известен как HNK1 (естественный киллер человека-1) или LEU7. Он выражается в виде углеводного эпитопа , содержащего сульфоглюкуронильный остаток в нескольких молекулах адгезии нервной системы . ^{[ 6 ]}

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства генов глюкуронилтрансферазы. Эти ферменты проявляют строгую акцепторную специфичность, распознавая невосстанавливающие концевые сахара и их аномерные связи. Этот генный продукт действует как ключевой фермент в реакции переноса глюкуронила во время биосинтеза углеводного эпитопа HNK-1 (естественный киллер-1 человека, также известный как CD57 и LEU7). Охарактеризованы альтернативные варианты транскрипционного сплайсинга. ^{[ 5 ]}

Иммуногистохимия

В анатомической патологии CD57 (иммуноокрашивание) аналогичен CD56 и используется для дифференциации нейроэндокринных опухолей от других. ^{[ 7 ]} С помощью иммуногистохимии молекулу CD57 можно обнаружить примерно в 10–20% лимфоцитов , а также в некоторых эпителиальных , нервных и хромаффинных клетках . Среди лимфоцитов CD57-положительные клетки обычно представляют собой либо Т-клетки , либо NK-клетки и чаще всего обнаруживаются в зародышевых центрах лимфатических узлов , миндалин и селезенки. ^{[ 8 ]}

Отмечается увеличение количества циркулирующих CD57-положительных клеток в крови пациентов, недавно перенесших трансплантацию органов или тканей, особенно костного мозга, а также у пациентов с ВИЧ . Повышенное количество CD57+ также было зарегистрировано при ревматоидном артрите и синдроме Фелти , а также при других состояниях. ^{[ 8 ]} Высокий уровень экспрессии CD57 среди циркулирующих CD8+ Т-клеток связан с другими маркерами иммунного старения (иммуностарение) и может быть связан с повышенным риском рака у реципиентов почечного трансплантата. ^{[ 9 ]}

Неопластические CD57-положительные клетки наблюдаются в таких различных состояниях, как крупный гранулярный лимфоцитарный лейкоз , мелкоклеточная карцинома , рак щитовидной железы , а также нервные и карциноидные опухоли. Хотя антиген особенно часто встречается в карциноидных опухолях, он обнаруживается в таком широком диапазоне других состояний, что его меньше можно использовать для дифференциации этих опухолей от других, чем более специфические маркеры, такие как хромогранин и NSE . ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000109956 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000045994 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: бета-1,3-глюкуронилтрансфераза B3GAT1 (глюкуронозилтрансфераза P)» .
^ Мицумото Ю, Ока С, Сакума Х, Инадзава Дж, Кавасаки Т (апрель 2000 г.). «Клонирование и хромосомное картирование глюкуронилтрансферазы человека, участвующей в биосинтезе углеводного эпитопа HNK-1». Геномика . 65 (2): 166–173. дои : 10.1006/geno.2000.6152 . ПМИД 10783264 .
^ Вик М.Р. (2010). «Глава 11 – Иммуногистология средостения». В DJ Dabbs (ред.). Диагностическая иммуногистохимия: тераностические и геномные применения (3-е изд.). Филадельфия, Пенсильвания: Сондерс/Эльзевир. стр. 345–6. дои : 10.1016/B978-1-4160-5766-6.00015-7 . ISBN 978-1-4160-5766-6 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Леонг А.С., Купер К., Леонг Ф.Дж. (2003). Руководство по диагностическим антителам для иммуногистологии (2-е изд.). Лондон: Гринвичские медицинские СМИ. стр. 131–134. ISBN 978-1-84110-100-2 .
^ Боттомли М.Дж., Харден П.Н., Вуд К.Дж. (май 2016 г.). «Иммуностарение CD8+ предсказывает посттрансплантационную плоскоклеточную карциному кожи у пациентов из группы высокого риска» . Журнал Американского общества нефрологов . 27 (5): 1505–1515. дои : 10.1681/ASN.2015030250 . ПМЦ 4849821 . ПМИД 26563386 .

Дальнейшее чтение

Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Дж.Ю., Лю В., Гиббс Р.А. (апрель 1996 г.). «Метод «двойного адаптера» для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Аналитическая биохимия . 236 (1): 107–113. дои : 10.1006/abio.1996.0138 . ПМИД 8619474 .
Ю В., Андерссон Б., Уорли К.С., Музный Д.М., Дин Ю., Лю В. и др. (апрель 1997 г.). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК» . Геномные исследования . 7 (4): 353–358. дои : 10.1101/гр.7.4.353 . ПМК 139146 . ПМИД 9110174 .
Тоне Y, Китагава Х, Имия К, Ока С, Кавасаки Т, Сугахара К (октябрь 1999 г.). «Характеристика рекомбинантной человеческой глюкуронилтрансферазы I, участвующей в биосинтезе области гликозаминогликан-белковой связи протеогликанов» . Письма ФЭБС . 459 (3): 415–420. дои : 10.1016/S0014-5793(99)01287-9 . ПМИД 10526176 . S2CID 7878952 .
Мицумото Ю, Ока С, Сакума Х, Инадзава Дж, Кавасаки Т (апрель 2000 г.). «Клонирование и хромосомное картирование глюкуронилтрансферазы человека, участвующей в биосинтезе углеводного эпитопа HNK-1». Геномика . 65 (2): 166–173. дои : 10.1006/geno.2000.6152 . ПМИД 10783264 .
Педерсен Л.К., Цучида К., Китагава Х., Сугахара К., Дарден Т.А., Негиши М. (ноябрь 2000 г.). «Биосинтез гепаран/хондроитинсульфата. Структура и механизм глюкуронилтрансферазы I человека» . Журнал биологической химии . 275 (44): 34580–34585. дои : 10.1074/jbc.M007399200 . ПМИД 10946001 .
Себо С., Дюрье В., Лагант П., Маес Э., Флореа Д., Лефевр Т. и др. (апрель 2002 г.). «Функциональное и молекулярное моделирование взаимодействия человеческого интерлейкина 6 и его олигосахаридных лигандов HNK-1» . Журнал биологической химии . 277 (14): 12246–12252. дои : 10.1074/jbc.M106816200 . ПМИД 11788581 .
Уззин М., Гулберти С., Левуан Н., Неттер П., Магдалу Дж., Фурнель-Жиглё С. (июль 2002 г.). «Специфичность донорского субстрата бета-1,3-глюкуронозилтрансферазы I человека по отношению к УДФ-глюкуроновой кислоте определяется двумя важными остатками гистидина и аргинина» . Журнал биологической химии . 277 (28): 25439–25445. дои : 10.1074/jbc.M201912200 . ПМИД 11986319 .
Бренчли Дж.М., Карандикар Н.Дж., Беттс М.Р., Амброзак Д.Р., Хилл Б.Дж., Кротти Л.Е. и др. (апрель 2003 г.). «Экспрессия CD57 определяет репликативное старение и антиген-индуцированную апоптотическую гибель CD8+ Т-клеток» . Кровь . 101 (7): 2711–2720. дои : 10.1182/кровь-2002-07-2103 . ПМИД 12433688 .
Йирасек Т., Хозак П., Мэндис В. (2003). «Различные закономерности экспрессии хромогранина А и Leu-7 (CD57) при желудочно-кишечных карциноидах: исследование иммуногистохимической и конфокальной лазерной сканирующей микроскопии». Новообразование . 50 (1): 1–7. ПМИД 12687271 .
Джеффрис А.Р., Мангалл А.Дж., Доусон Э., Холлс К., Лэнгфорд К.Ф., Мюррей Р.М. и др. (июль 2003 г.). «Ген бета-1,3-глюкуронилтрансферазы-1 считается кандидатом на шизофреноподобный психоз посредством молекулярного анализа сбалансированной транслокации» . Молекулярная психиатрия . 8 (7): 654–663. дои : 10.1038/sj.mp.4001382 . ПМИД 12874601 .
Чочи К., Ичикура Т., Мадзима Т., Кавабата Т., Мацумото А., Сугасава Х. и др. (2004). «Увеличение CD57+ Т-клеток в периферической крови и нарушение их иммунных функций у пациентов с распространенным раком желудка». Отчеты онкологии . 10 (5): 1443–1448. дои : 10.3892/или.10.5.1443 . ПМИД 12883721 .
Какуда С., Шиба Т., Исигуро М., Тагава Х., Ока С., Кадзихара Ю. и др. (май 2004 г.). «Структурная основа распознавания акцепторного субстрата человеческой глюкуронилтрансферазы GlcAT-P, фермента, играющего решающую роль в биосинтезе углеводного эпитопа HNK-1» . Журнал биологической химии . 279 (21): 22693–22703. дои : 10.1074/jbc.M400622200 . ПМИД 14993226 .
Мацубара К., Юра К., Хирата Т., Нигами Х., Харигая Х., Нозаки Х. и др. (2005). «Острый лимфобластный лейкоз с коэкспрессией CD56 и CD57: отчет о случае». Детская гематология и онкология . 21 (7): 677–682. дои : 10.1080/08880010490501105 . ПМИД 15626024 . S2CID 41086927 .
Ибегбу CC, Сюй YX, Харрис В., Маджио Д., Миллер Дж.Д., Куртис А.П. (май 2005 г.). «Экспрессия лектиноподобного рецептора G1 клеток-киллеров на антигенспецифических CD8+ Т-лимфоцитах человека во время активной, латентной и разрешившейся инфекции и ее связь с CD57» . Журнал иммунологии . 174 (10): 6088–6094. дои : 10.4049/jimmunol.174.10.6088 . ПМИД 15879103 .
Ассути М., Виниос Д.Х., Анагностидес С.Т., Пападопулос Г., Георгакопулос К.Д., Гартаганис С.П. (январь 2006 г.). «Коллаген IX типа и эпитоп HNK-1 в слезах пациентов с псевдоэксфолиативным синдромом» . Биохимия и биофизика Acta (BBA) - Молекулярные основы болезней . 1762 (1): 54–58. дои : 10.1016/j.bbadis.2005.09.005 . ПМИД 16257185 .
Барре Л., Венкатесан Н., Магдалу Дж., Неттер П., Фурнель-Жигле С., Уззин М. (август 2006 г.). «Доказательства кальций-зависимого пути регуляции экспрессии гена бета1,3-глюкуронозилтрансферазы-1 человека (GlcAT-I): ключевой фермент в синтезе протеогликанов» . Журнал ФАСЭБ . 20 (10): 1692–1694. doi : 10.1096/fj.05-5073fje . ПМИД 16807373 . S2CID 16549210 .
Сада-Овалье И., Торре-Бускуле Л., Вальдес-Васкес Р., Мартинес-Каир С., Зентено Э., Ласкурен Р. (декабрь 2006 г.). «Характеристика цитотоксической субпопуляции CD57+ Т-клеток пациентов с туберкулезом легких». Клиническая иммунология . 121 (3): 314–323. дои : 10.1016/j.clim.2006.08.011 . ПМИД 17035093 .

Внешние ссылки

Антиген CD57 + в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
Расположение генома человека B3GAT1 и B3GAT1 страница сведений о гене в браузере генома UCSC .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000109956 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000045994 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: бета-1,3-глюкуронилтрансфераза B3GAT1 (глюкуронозилтрансфераза P)» .

[pmid10783264-6] Мицумото Ю, Ока С, Сакума Х, Инадзава Дж, Кавасаки Т (апрель 2000 г.). «Клонирование и хромосомное картирование глюкуронилтрансферазы человека, участвующей в биосинтезе углеводного эпитопа HNK-1». Геномика . 65 (2): 166–173. дои : 10.1006/geno.2000.6152 . ПМИД 10783264 .

[Wick_2010-7] Вик М.Р. (2010). «Глава 11 – Иммуногистология средостения». В DJ Dabbs (ред.). Диагностическая иммуногистохимия: тераностические и геномные применения (3-е изд.). Филадельфия, Пенсильвания: Сондерс/Эльзевир. стр. 345–6. дои : 10.1016/B978-1-4160-5766-6.00015-7 . ISBN 978-1-4160-5766-6 .

[Leong-8] Jump up to: ^а ^б ^с Леонг А.С., Купер К., Леонг Ф.Дж. (2003). Руководство по диагностическим антителам для иммуногистологии (2-е изд.). Лондон: Гринвичские медицинские СМИ. стр. 131–134. ISBN 978-1-84110-100-2 .

[9] Боттомли М.Дж., Харден П.Н., Вуд К.Дж. (май 2016 г.). «Иммуностарение CD8+ предсказывает посттрансплантационную плоскоклеточную карциному кожи у пациентов из группы высокого риска» . Журнал Американского общества нефрологов . 27 (5): 1505–1515. дои : 10.1681/ASN.2015030250 . ПМЦ 4849821 . ПМИД 26563386 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

v т и Белки : кластеры дифференциации (см. также список кластеров дифференцировки человека )
1–50	CD1 a-c 1A 1B 1D 1E CD2 CD3 γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50
51–100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64 A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 - CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101–150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151–200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201–250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 - CD248 CD249
251–300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301–350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD327 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350