Глоссарий клеточной и молекулярной биологии (0–L)

Этот словарь клеточной и молекулярной биологии представляет собой список определений терминов и понятий, обычно используемых при изучении клеточной биологии , молекулярной биологии и смежных дисциплин, включая генетику , биохимию и микробиологию . ^[1] Он разделен на две статьи:

На этой странице « Глоссарий клеточной и молекулярной биологии (0–L)» перечислены термины, начинающиеся с цифр и букв от A до L.
В словаре клеточной и молекулярной биологии (M – Z) перечислены термины, начинающиеся с букв от M до Z.

Этот глоссарий предназначен в качестве вводного материала для новичков (более конкретные и технические подробности см. в статье, соответствующей каждому термину). Он был разработан как дополнение к Глоссарию по генетике и эволюционной биологии , который содержит множество пересекающихся и связанных терминов; другие связанные глоссарии включают Глоссарий вирусологии и Глоссарий химии .

0–9

3'-нетранслируемая область (3'-UTR)
3'-конец: Один из двух концов одной линейной цепи ДНК или РНК , а именно конец, на котором цепь нуклеотидов заканчивается у третьего атома углерода в фуранозном кольце дезоксирибозы или рибозы (т.е. конец, на котором 3'-углерод не присоединен). с другим нуклеотидом посредством связи фосфодиэфирной in vivo 3'-углерод часто все еще связан с гидроксильной группой). По соглашению, последовательности и структуры, расположенные ближе к 3'-концу относительно других, называются нижестоящими . Контрастный 5'-конец .
5-футовая крышка: Специально измененный нуклеотид, прикрепленный к 5'-концу некоторых первичных транскриптов РНК как часть набора посттранскрипционных модификаций , которые превращают необработанные транскрипты в зрелые продукты РНК. Точная структура 5'-кэпа сильно различается в зависимости от организма; у эукариот самая основная кепка состоит из метилированного гуанинового нуклеозида, связанного с трифосфатной группой, которая завершает 5'-конец последовательности РНК. Помимо других функций, кэпирование помогает регулировать экспорт зрелых РНК из ядра , предотвращать их деградацию экзонуклеазами и способствовать трансляции в цитоплазме. Зрелые мРНК также могут быть декепированы .
5'-нетранслируемая область (5'-UTR)
5-бромдезоксиуридин: См. бромдезоксиуридин .
5'-конец: Один из двух концов одной линейной цепи ДНК или РНК , в частности, конец, на котором цепь нуклеотидов заканчивается у пятого атома углерода в фуранозном кольце дезоксирибозы или рибозы (т.е. конец, на котором 5'-углерод не присоединен). с другим нуклеотидом посредством фосфодиэфирной связи in vivo 5'-углерод часто все еще связан с фосфатной группой). По соглашению, последовательности и структуры, расположенные ближе к 5'-концу относительно других, называются вышележащими . Контрастный 3'-конец .
5-метилурацил: См . Тимин .

А

ацентрический: (линейной хромосомы или фрагмента хромосомы) Не имеющий центромеры . ^[2]
ацетил-коэнзим А (ацетил-КоА): Биохимическое соединение, состоящее из молекулы кофермента А , в которой имеется ацетильная группа ( –COCH
₃ ) присоединяется посредством высокоэнергетической тиоэфирной связи. Ацетилирование кофермента А происходит как часть метаболизма белков , бета - углеводов ( гликолиз ) и жирных кислот ( окисление ), после чего он участвует в качестве переносчика энергии в нескольких важных биохимических путях , особенно в цикле лимонной кислоты в котором гидролиз , ацетильная группа высвобождает энергию, которая в конечном итоге улавливается в 11 АТФ и одном ГТФ .
ацетилирование: Ковалентное присоединение ацетильной группы ( –COCH
₃ ) в химическое соединение, белок или другую биомолекулу посредством этерификации реакции уксусной кислотой , спонтанно или посредством ферментативного катализа. Ацетилирование играет важную роль в нескольких метаболических путях и в модификации гистонов . Контрастное деацетилирование .
ацетилтрансфераза: Любой из класса трансфераз ферментов , которые катализируют ковалентное связывание ацетильной группы ( -COCH
₃ ) в другое соединение, белок или биомолекулу — процесс, известный как ацетилирование .
акроцентрический: (линейной хромосомы или фрагмента хромосомы) Наличие центромеры, расположенной очень близко к одному концу хромосомы, а не к концу или середине . ^[2]
потенциал действия: Локальное изменение напряжения , которое происходит, когда мембранный потенциал определенного участка мембраны клетки быстро нервный деполяризуется, например, когда импульс передается между нейронами .
активация: См . повышение регуляции .
активатор: Тип фактора транскрипции который увеличивает транскрипцию гена , или набора генов. Большинство активаторов действуют путем связывания со специфической последовательностью, расположенной внутри или рядом с энхансером или промотором , и облегчая связывание РНК-полимеразы и других транскрипционных механизмов в той же области. См. также коактиватор ; контрастный репрессор .
активный сайт: Область фермента , с которой связывается одна или несколько молекул субстрата , заставляя субстрат или другую молекулу подвергаться химической реакции. Эта область обычно состоит из одного или нескольких аминокислотных фермента остатков (обычно трех или четырех), которые при правильном сворачивании способны образовывать временные химические связи с атомами молекулы субстрата; он также может включать один или несколько дополнительных остатков, которые при взаимодействии с субстратом способны катализировать специфическую реакцию с участием субстрата. Хотя активный центр составляет лишь небольшую часть всех остатков, составляющих фермент, его специфичность к конкретным субстратам и реакциям отвечает за биологическую функцию фермента.
активный транспорт: Транспорт вещества (например, белка или лекарства ) через мембрану против градиента концентрации . В отличие от пассивного транспорта , активный транспорт требует затрат энергии.
аденин ( А ): Пуриновое в нуклеиновое основание, используемое в качестве одного из четырех стандартных нуклеиновых оснований как в молекулах ДНК , так и РНК . Аденин образует пару оснований с тимином в ДНК и с урацилом в РНК.
аденозин ( А ): Один из четырех стандартных нуклеозидов, используемых в молекулах РНК , состоящий из аденинового основания которого _{N 9} , азот связан C ₁ с углеродом сахара рибозы . Аденин, связанный с дезоксирибозой , известен как дезоксиаденозин , версия, используемая в ДНК .
аденозиндифосфат (АДФ)
аденозинмонофосфат (АМФ)
аденозинтрифосфат (АТФ): Органическое соединение, полученное из аденина , которое действует как основной источник энергии для химических реакций внутри живых клеток . Он встречается во всех формах жизни, и его часто называют «молекулярной валютой» внутриклеточной передачи энергии.
А-ДНК: Одна из трёх основных биологически активных структурных конформаций ДНК двойной спирали , наряду с B-ДНК и Z-ДНК . Спираль А-формы имеет правостороннюю закрутку с 11 парами оснований на полный оборот, лишь немного более компактна, чем В-ДНК, но ее основания резко наклонены относительно оси спирали. Это часто предпочтительнее в обезвоженных условиях и в последовательностях последовательных пуриновых нуклеотидов (например, GAAGGGGA ); это также первичная конформация, принятая двухцепочечной РНК и гибридами РНК-ДНК . ^[3]
затронутая относительная пара: Любая пара организмов, генетически связанных между собой и обладающих одним и тем же признаком . Например, два двоюродных брата, у которых оба голубые глаза, являются затронутой родственной парой, поскольку на них обоих влияет аллель , кодирующая голубые глаза.
щелочной лизис
аллель: Одна из нескольких альтернативных версий отдельного гена , каждая из которых представляет собой жизнеспособную последовательность ДНК , занимающую определенное положение или локус на хромосоме . Например, у людей один аллель гена цвета глаз отвечает за голубые глаза, а другой аллель того же гена отвечает за карие глаза.
аллосомный: Любая хромосома , отличающаяся от обычной аутосомы размером, формой или поведением и отвечающая за определение пола организма. У человека Х-хромосома и Y-хромосома являются половыми хромосомами.
альфа-спираль (α-спираль): Общий структурный мотив во вторичных структурах белков, состоящий из конформации правосторонней спирали, возникающей в результате образования водородных связей между аминокислотными остатками, которые не находятся непосредственно рядом друг с другом.
альтернативный сплайсинг: Регулируемый феномен экспрессии генов эукариот , при котором определенные экзоны или части экзонов одного и того же первичного транскрипта по-разному включаются в окончательный зрелый транскрипт информационной РНК или удаляются из него. Класс посттранскрипционных модификаций , альтернативный сплайсинг, позволяет одному гену кодировать несколько изоформ белка и значительно увеличивает разнообразие белков, которые могут производиться отдельным геномом . См. также сплайсинг РНК .
янтарь: Один из трех стоп-кодонов, используемых в стандартном генетическом коде ; в РНК он определяется нуклеотидным триплетом UAG . Два других стоп-кодона называются охрой и опалом .
аминокислота: Любое из класса органических соединений, основная структурная формула которых включает центральный атом углерода, связанный с амино- и карбоксильными функциональными группами , а также с переменной боковой цепью . Из почти 500 известных аминокислот набор из 20 кодируется стандартным генетическим кодом и включается в длинные полимерные цепи в качестве строительных блоков пептидов и, следовательно, полипептидов и белков . Конкретные последовательности аминокислот в полипептидных цепях, образующих белок, в конечном итоге ответственны за определение структуры и функции белка.
аминоконец: См. N-конец .
аминоацил-тРНК-синтетаза: Любой из набора ферментов, катализирующих реакцию переэтерификации , приводящую к присоединению определенной аминокислоты (или ее предшественника) к одной из родственных ей молекул транспортной РНК , образуя аминоацил-тРНК . Каждая из 20 различных аминокислот, используемых в генетическом коде, распознается и прикрепляется своим собственным специфическим ферментом синтетазой, и большинство синтетаз родственны нескольким различным тРНК в соответствии с их специфическими антикодонами .
аминоацил-тРНК (аа-тРНК): , Транспортная РНК с которой родственная аминокислота химически связана ; т.е. продукт реакции переэтерификации, катализируемой аминоацил-тРНК-синтетазой . тРНК связываются с аминоацильным участком рибосомы трансляции во время Аминоацил - .
ампликон: Любая последовательность или фрагмент ДНК или РНК, которая является источником и/или продуктом реакции амплификации . Этот термин чаще всего используется для описания многочисленных копируемых фрагментов, которые являются продуктами полимеразной цепной реакции или лигазной цепной реакции , хотя он также может относиться к последовательностям, которые естественным образом амплифицируются внутри генома, например, путем дупликации гена .
усиление: Репликация , либо естественным путем (например, путем биомолекулы, в частности, производство одной или нескольких копий последовательности нуклеиновой кислоты , известной как ампликон спонтанной дупликации ), либо искусственно (например, с помощью ПЦР ), и, в частности, подразумевающее множество повторяющихся событий репликации, приводящих к в тысячах, миллионах или миллиардах копий целевой последовательности, о которой затем говорят, что она амплифицирована .
анафаза: Стадия митоза и мейоза , наступающая после метафазы и перед телофазой , когда реплицированные хромосомы расходятся и каждая из сестринских хроматид перемещается в противоположные стороны клетки .
задержка анафазы: Неспособность одной или нескольких пар хроматид или гомологичных хромосом правильно мигрировать к противоположным сторонам клетки во время анафазы митоза сестринских или мейоза из-за дефекта веретенообразного аппарата . Следовательно, обе дочерние клетки являются анеуплоидными : в одной отсутствует одна или несколько хромосом (создает моносомию ), а в другой имеется одна или несколько дополнительных копий тех же хромосом (создается полисомия ).
анеуцентрический: (линейной хромосомы или фрагмента хромосомы) Наличие аномального количества центромер , т.е. более одной. ^[4]
анеуплоидия: Состояние клетки или организма, имеющего аномальное количество одной или нескольких определенных хромосом (но исключая аномальное количество полных наборов хромосом, которое вместо этого известно как эуплоидия ).
отжиг: Гибридизация спаренными двух одноцепочечных молекул нуклеиновой кислоты содержащих комплементарные последовательности, создает двухцепочечную молекулу со , нуклеиновыми основаниями . Этот термин используется, в частности, для описания этапов лабораторных методов, таких как полимеразная цепная реакция , когда двухцепочечные молекулы ДНК многократно денатурируются в одиночные цепи путем нагревания, а затем подвергаются воздействию более низких температур, заставляя цепи повторно связываться друг с другом или с комплементарными цепями. праймеры . Точная температура, при которой происходит отжиг, сильно зависит от длины и конкретной последовательности отдельных нитей.
антитело
антикодон: Ряд из трех последовательных нуклеотидов в транспортной РНК , которые дополняют три нуклеотида кодона транскрипта мРНК . Во время трансляции каждая тРНК, рекрутированная в рибосому, содержит один триплет антикодона, который спаривается с комплементарным ему кодоном из последовательности мРНК, что позволяет каждому кодону указывать конкретную аминокислоту , которую необходимо добавить к растущей пептидной цепи. Антикодоны, содержащие инозин в первом положении, способны образовывать пары с более чем одним кодоном благодаря явлению, известному как спаривание оснований колебания .
антиметаболит: Любая молекула, которая действует как антагонист метаболического процесса , ограничивая или ингибируя нормальный клеточный метаболизм; т.е. метаболический яд. ^[4]
антимитотический: Любое соединение, подавляющее нормальный митоз в клетке или популяции клеток. ^[4]
антикоген: Ген , который помогает регулировать рост клеток и подавлять опухоли при правильном функционировании, поэтому его отсутствие или неисправность могут привести к неконтролируемому росту клеток и, возможно, к раку. ^[5] Сравните онкоген .
антипараллельный: Ориентация двух нитей двухцепочечной нуклеиновой кислоты (и, в более общем случае, любой пары биополимеров ), параллельных друг другу, но с противоположной направленностью . Например, две комплементарные цепи молекулы ДНК идут бок о бок, но в противоположных направлениях, при этом одна цепь ориентирована 5’- к- 3’ , а другая – 3’-к-5’.
антипортер: Транспортный белок , который осуществляет обмен двух разных ионов или небольших молекул через мембрану в противоположных направлениях одновременно или последовательно. ^[6]
антисмысловой: См. прядь шаблона .
антисмысловая РНК (асРНК): Одноцепочечная , некодирующая молекула РНК содержащая антисмысловую последовательность, которая комплементарна смысловой цепи, такой как информационная РНК , с которой она легко гибридизуется , тем самым ингибируя дальнейшую активность смысловой цепи (например, трансляцию в белок). Многие различные классы встречающихся в природе РНК, такие как миРНК, функционируют по этому принципу, что делает их мощными сайленсерами генов в различных регуляции генов механизмах . Синтетическая антисмысловая РНК также нашла широкое применение в исследованиях нокдауна генов и в практических применениях, таких как антисмысловая терапия .
безъядерный: (клетки или организма) Отсутствие ядра клетки , т.е. дискретной, связанной с мембраной органеллы, содержащей геномную ДНК , используется, в частности, в клетках, которые обычно имеют ядро, но из которых ядро было удалено (например, при искусственном переносе ядра ), а также специализированных типов клеток, которые развиваются без ядер, несмотря на то, что клетки других тканей, входящих в состав того же организма, обычно имеют ядра (например, эритроциты млекопитающих ).
апикальное сужение
апоптоз: Строго регулируемая форма запрограммированной гибели клеток , происходящая в многоклеточных организмах.
аптамер
искусственный синтез генов: Набор лабораторных методов, используемых при ) de novo синтезе гена ( или любой другой последовательности нуклеиновой кислоты из свободных нуклеотидов , т.е. без использования существующей цепи матрицы .
ассимиляционный процесс: Любой процесс, при котором химические соединения, содержащие различные незаменимые элементы (C, H, O, N, P, S, Se, Fe, Co, Ni, Cu, Zn, Mo или другие олигоэлементы), поглощаются микроорганизмами и включаются в организм. сложные биомолекулы с целью синтеза различных клеточных компонентов. Напротив, диссимиляционный процесс использует энергию, выделяемую при разложении экзогенных молекул, для обеспечения клеточного метаболизма , а затем выводит остаточные или токсичные соединения из клетки, вместо того, чтобы повторно использовать их для создания новых молекул.
асинапсис: Неспособность гомологичных хромосом правильно спариваться друг с другом во время мейоза . ^[4] Сравните синапсис и десинапсис .
прилагается X: Одна моноцентрическая хромосома, содержащая две или более физически прикрепленные копии нормальной Х-хромосомы в результате естественной внутренней дупликации или любого из множества методов генной инженерии . Полученная составная хромосома фактически несет две или более дозы всех генов и последовательностей, включенных в X, но во всех других отношениях функционирует как одна хромосома, а это означает, что гаплоидные гаметы «XX» (а не обычные гаметы «X») будут вырабатывается путем мейоза и наследуется потомством. В таких механизмах, как генный баланс , при котором пол организма определяется общей дозой X-сцепленных генов, аномальная зигота «XXY» , оплодотворенная одной гаметой XX и одной гаметой Y, разовьется в самку.
аутолиз: Лизис ; или клетки собственными ферментами переваривание или определенного фермента другим экземпляром того же фермента. См. также аутофагия .
аутосома: Любая хромосома , не являющаяся аллосомой и, следовательно, не участвующая в определении пола организма . В отличие от половых хромосом, аутосомы в диплоидной клетке существуют парами, причем члены каждой пары имеют одинаковую структуру, морфологию и генетические локусы .
автозигота: Клетка или организм, гомозиготный по локусу , в котором две гомологичные аллели идентичны по происхождению, причем оба произошли от одного гена у общего предка. ^[4] Контрастная аллозигота .
ауксис: Рост многоклеточного организма происходит за счет увеличения размеров его клеток, а не за счет увеличения числа клеток.
аксенический: Описание культуры клеток , в которой присутствует только один вид, разновидность или штамм и которая, следовательно, полностью свободна от загрязняющих организмов, включая симбиотов и паразитов.

Б

В-хромосома: Любая нештатная молекула ядерной ДНК , которая не является дубликатом и не гомологична какому-либо стандартному набору нормальных хромосом «А», составляющих геном. Обычно очень маленькие и лишенные структурных генов, В-хромосомы по определению не необходимы для жизни. Хотя они встречаются в природе у многих видов эукариот, они не наследуются стабильно и поэтому сильно различаются по количеству копий даже между близкородственными особями. ^[4]
обратная мутация: Мутация , которая обращает вспять эффект предыдущей мутации, инактивировавшей ген, тем самым восстанавливая дикого типа . функцию ^[7] См. также обратную мутацию .
обратное скрещивание: Разведение гибридного организма с одним из его родителей или особью, генетически сходной с одним из своих родителей, часто преднамеренно как вид селекционного разведения с целью получения потомства с генетической идентичностью, более близкой к генетической идентичности родителя. Репродуктивное событие и полученное потомство называются обратным скрещиванием , которое в генетике часто сокращается до символа BC .
бактериальная искусственная хромосома (BAC)
балансирующая хромосома
база: Аббревиатура азотистого основания и азотистого основания .
пара оснований (п.н.): Пара двух азотистых оснований на комплементарных цепях ДНК или РНК , связанных друг с другом водородными связями . Способность последовательных пар оснований укладываться друг на друга способствует образованию длинноцепочечных двойных спиральных структур, наблюдаемых как в двухцепочечных молекулах ДНК , так и в двухцепочечных молекулах РНК.
базовый уровень: Мера уровня экспрессии гена отрицательном или генов до нарушения в эксперименте, например, в контроле . Базовая экспрессия может также относиться к ожидаемой или исторической мере экспрессии гена.
базовый инструмент поиска локального выравнивания (BLAST): Компьютерный алгоритм, широко используемый в биоинформатике для выравнивания и сравнения первичной информации о биологических последовательностях, такой как нуклеотидные последовательности ДНК или РНК или аминокислотные последовательности белков. Программы BLAST позволяют ученым быстро проверять гомологию между двумя или более последовательностями путем прямого сравнения нуклеотидов или аминокислот, присутствующих в каждом положении внутри каждой последовательности; обычное использование - поиск совпадений между определенной последовательностью запроса и базой данных цифровых последовательностей, такой как библиотека генома , при этом программа возвращает список последовательностей из базы данных, которые напоминают последовательность запроса, превышающую указанный порог сходства. Такие сравнения могут позволить идентифицировать организм из неизвестного образца или сделать вывод об эволюционных отношениях между генами, белками или видами.
Б-ДНК: «Стандартная» или классическая структурная конформация ДНК in двойной спирали vivo , которая, как полагают, представляет собой среднее из различных различных конформаций, принимаемых очень длинными молекулами ДНК в физиологических условиях. ^[3] Двойная спираль B-формы имеет правостороннюю закрутку диаметром 23,7 ангстрем и шагом 35,7 ангстрем или около 10,5 пар оснований на полный оборот, так что каждая пара нуклеотидов повернута на 36° вокруг оси спирали относительно своей оси. соседние пары. См. также А-ДНК и Z-ДНК .
бета-окисление
двунаправленная репликация: Общий механизм репликации ДНК , при котором две репликационные вилки движутся в противоположных направлениях от одного и того же источника ; в результате образуется пузырчатая область , в которой дуплексная молекула локально разделена на две одиночные цепи . ^[4]
бинарное деление
сайт связывания
биоанализ
биохимический путь
биоэнергетика
биопленка: Сообщество симбиотических микроорганизмов, особенно бактерий, где клетки производят и внедряются в слизистый, липкий внеклеточный матрикс , состоящий из различных высокомолекулярных биополимеров , прилипающих друг к другу, а иногда и к субстрату , который может быть биотической или абиотической поверхностью. . ^[8] Многие бактерии могут существовать либо как независимые одиночные клетки, либо переходить к физиологически отличному фенотипу биопленки; те, кто создает биопленки, часто делают это, чтобы защитить себя от вредной окружающей среды. Клетки, находящиеся внутри биопленок, могут легко обмениваться питательными веществами и общаться , а субпопуляции клеток могут дифференцироваться для выполнения специализированных функций, поддерживающих всю биопленку. ^[9]
биомаркер: Измеримый индикатор некоторого биологического состояния, особенно соединения или биомолекулы , присутствие или отсутствие которых в биологической системе является надежным признаком нормального или аномального процесса, состояния или заболевания. ^[10] Вещи, которые могут служить биомаркерами, включают прямые измерения концентрации определенного соединения или молекулы в образце ткани или жидкости или любого другого характерного физиологического, гистологического или рентгенологического сигнала (например, изменение частоты сердечных сокращений или отчетливую морфологию при микроскоп). Они регулярно используются в качестве прогностических или диагностических инструментов в клинической медицине и лабораторных исследованиях.
биомолекулярный градиент
двухвалентный
только: Любой из множества методов молекулярной биологии, с помощью которых электрофоретически или хроматографически разделенные образцы ДНК , РНК или белка переносятся из поддерживающей среды, такой как полиакриламидный или агарозный гель, на иммобилизирующий носитель, такой как нитроцеллюлоза или мембрана из ПВДФ . Некоторые методы включают перенос молекул посредством капиллярного действия (например, Саузерн- и нозерн-блоттинг ), тогда как другие полагаются на транспорт заряженных молекул посредством электрофореза (например, вестерн-блоттинг ). Перенесенные молекулы затем визуализируются с помощью окрашивания красителем, авторадиографии или путем обнаружения специфических последовательностей или эпитопов с помощью гибридизационных зондов или антител, связанных с хемилюминесцентными репортерами. ^[4]
тупой конец: используемый для описания конца двухцепочечной молекулы ДНК , где концевые азотистые основания на каждой цепи спарены Термин , друг с другом, так что ни одна цепь не имеет одноцепочечного «навеса» из неспаренных оснований, в отличие от такового. - так называемый « липкий конец », когда выступ создается за счет того, что одна прядь на одно или несколько оснований длиннее другой. Тупые и липкие концы актуальны при лигировании нескольких молекул ДНК, например, при рестрикционном клонировании , поскольку молекулы с липкими концами не будут легко отжигаться друг с другом, если у них нет совпадающих выступов; Молекулы с тупыми концами таким образом не отжигаются, поэтому необходимо использовать специальные процедуры, чтобы обеспечить соединение фрагментов с тупыми концами в правильных местах.
бромдезоксиуридин (БУДР, Брду)

С

кадастровый ген: Регуляторный , ген который ограничивает экспрессию других генов в определенных тканях или частях тела организма, обычно путем производства генных продуктов , которые по-разному ингибируют или разрешают транскрипцию других генов в разных типах клеток. ^[4] Этот термин чаще всего используется в генетике растений .
кадгерин: Любой представитель класса трансмембранных белков , зависящих от ионов кальция (Ca ²⁺) и чьи внеклеточные домены действуют как медиаторы межклеточной адгезии в слипчивых соединениях в эукариотических тканях.
мозоль: Неорганизованная масса паренхиматозных клеток, которая естественным образом образуется на месте ран в растительных тканях и которую обычно искусственно вызывают в культуре тканей растений как средство инициации соматического эмбриогенеза . ^[11]
Цикл Кальвина
ген-кандидат: Ген , расположение которого на хромосоме связано с определенным фенотипом (часто фенотипом, связанным с заболеванием), и поэтому предполагается, что он вызывает или способствует фенотипу. Гены-кандидаты часто выбираются для исследования на основе априорных знаний или предположений об их функциональной значимости для исследуемого признака или заболевания.
каноническая последовательность: См. последовательность консенсуса .
углевод: Любое из класса органических соединений, имеющих общую химическую формулу (CH
_2О )
_n и один из нескольких основных классов биомолекул, повсеместно встречающихся в биологических системах. К углеводам относятся отдельные моносахариды , а также более крупные полимеры, которые они образуют ( олигосахариды , полисахариды и т. д.), когда несколько моносахаридных единиц соединяются гликозидными связями . ^[11] Обильные и повсеместные, эти соединения участвуют во многих важных биохимических процессах и путях ; они широко используются в качестве источника энергии для клеточного метаболизма , в качестве формы хранения энергии, в качестве сигнальных молекул и в качестве биомаркеров для маркировки или изменения активности других молекул. Углеводы часто в просторечии называют «сахарами»; префикс глико- используется для обозначения соединения или процесса, содержащего или включающего углеводы, а суффикс -оза обычно означает, что соединение представляет собой углевод или его производное.
карбоксильный конец: См. С-конец .
белок-носитель: 1. Мембранный белок , который действует как переносчик , связываясь с растворенным веществом и облегчая его перемещение через мембрану, претерпевая ряд конформационных изменений . ^[6]; 2. Белок, с которым специфический лиганд или гаптен конъюгирован и который, таким образом, несет антиген, способный вызывать гуморальный ответ. ^[12]; 3. Белок, который включается в анализ в высоких концентрациях, чтобы предотвратить неспецифическое взаимодействие реагентов анализа с поверхностями сосудов, компонентами образца или другими реагентами. ^[12] Например, во многих блоттинга методах альбумину намеренно позволяют неспецифически связываться с блоттинговой мембраной перед флуоресцентным мечением , чтобы «блокировать» потенциальное нецелевое связывание флуорофора с мембраной, которое в противном случае могло бы вызвать фоновую флуоресценцию. что скрывает подлинный сигнал от цели.
каспаза
кассета: Ранее существовавшая последовательность или конструкция нуклеиновой кислоты, особенно ДНК- вектор с аннотированной последовательностью и точно расположенными регуляторными элементами , в которую или рекомбинировать один или несколько фрагментов можно легко встроить с помощью различных методов генной инженерии . Рекомбинантные плазмидные векторы, содержащие надежные промоторы , точки начала репликации и гены устойчивости к антибиотикам, коммерчески производятся в виде кассет, что позволяет ученым легко перемещать интересующие гены в активный «слот» или локус внутри плазмиды и из него. См. также сайт множественного клонирования .
коробка CCAAT: Высококонсервативная сайта регуляторная последовательность ДНК расположена примерно на 75 пар оснований выше (т.е. -75) от начала транскрипции для многих эукариотических генов. ^[2]
кДНК: См. комплементарную ДНК .
клетка
клеточная биология: Раздел биологии , изучающий структуры, функции, процессы и свойства биологических клеток — самостоятельных единиц жизни, общих для всех живых организмов.
компартментализация клеток: Подразделение внутренней части клетки на отдельные, обычно мембраносвязанные отсеки, включая ядро и органеллы ( эндоплазматический ретикулум , митохондрии , хлоропласты , внутриклеточные везикулы и т. д.), определяющая особенность эукариев . ^[11]
клеточная кора: Специализированный слой цитоплазматических белков, выстилающий внутреннюю поверхность клеточной мембраны большинства эукариотических клеток, состоящий в основном из актиновых микрофиламентов и миозина моторных белков и обычно толщиной 100–1000 нанометров, который действует как модулятор поведения мембраны и свойств клеточной поверхности.
подсчет клеток: Процесс определения количества клеток в биологическом образце или культуре любым из множества методов. Подсчет клеток — важный аспект цитометрии, широко используемый в исследованиях и клинической медицине. Обычно это достигается с помощью ручного или цифрового цитометра для подсчета количества клеток, присутствующих в небольших фракциях образца, а затем экстраполяции для оценки количества клеток, присутствующих во всем образце. Результирующая количественная оценка обычно выражается как плотность или концентрация, т.е. количество клеток на единицу площади или объема.
клеточная культура: Процесс, посредством которого живые клетки выращиваются и поддерживаются или «культивируются» в тщательно контролируемых условиях, как правило, за пределами их естественной среды. Оптимальные условия роста сильно различаются для разных типов клеток, но обычно состоят из подходящего сосуда (например, культуральной пробирки или чашки Петри ), содержащего специально разработанный субстрат или питательную среду , которая поставляет все питательные вещества, необходимые для жизни ( аминокислоты , углеводы , витамины, минералы и т. д.), а также любые желательные факторы роста и гормоны , обеспечивает газообмен (при необходимости) и регулирует окружающую среду, поддерживая постоянные физико-химические свойства ( рН , осмотическое давление, температура и т. д.). требуется твердая поверхность, к которой они могут прилипать Некоторым типам клеток для размножения , тогда как другие можно выращивать, свободно плавая в жидкой или желеобразной суспензии . Большинство клеток имеют генетически детерминированный предел размножения, но иммортализованные клетки будут делиться бесконечно, если им обеспечить оптимальные условия.
клеточный цикл
деление клеток: Разделение отдельной родительской клетки на две дочерние каким-либо процессом. Деление клетки обычно происходит в результате сложной, тщательно структурированной последовательности событий, включающей реорганизацию внутреннего содержимого родительской клетки, физическое расщепление цитоплазмы и плазматической мембраны , а также равномерное распределение содержимого между двумя образовавшимися клетками, так что каждая в конечном итоге содержит примерно половину исходного материала исходной клетки. Обычно это подразумевает размножение посредством репликации генетического материала родительской клетки до деления, хотя клетки также могут делиться без репликации своей ДНК. В прокариотических клетках бинарное деление является основной формой клеточного деления. В эукариотических клетках бесполое деление происходит путем митоза и цитокинеза , тогда как определенные линии клеток, предназначенные для полового размножения, могут дополнительно делиться посредством мейоза . ^[6]
слияние клеток: Слияние или объединение двух или более клеток в одну клетку, происходящее при слиянии гамет с образованием зиготы . Обычно это происходит за счет дестабилизации плазматической мембраны каждой клетки и образования цитоплазматических мостиков между ними, которые затем расширяются до тех пор, пока две цитоплазмы полностью не смешаются; межклеточные структуры или органеллы , такие как ядра, также могут сливаться, а могут и не сливаться. Некоторые клетки можно искусственно заставить сливаться друг с другом, обрабатывая их фузогеном, таким как полиэтиленгликоль , или пропуская через них электрический ток. ^[11]
клеточная мембрана: Избирательно проницаемая мембрана, окружающая все прокариотические и эукариотические клетки, определяющая внешнюю границу клетки и физически отделяющая цитоплазму от внеклеточной среды. ^[13] Как и все мембраны , клеточная мембрана представляет собой гибкий, жидкий, листовидный фосфолипидный бислой с мембранными белками , углеводами и множеством других молекул, встроенных в него или взаимодействующих с ним как с внутренней, так и с внешней стороны. Встроенные молекулы часто имеют свободу перемещаться в поперечном направлении вдоль липидов мембраны. Хотя клеточную мембрану могут свободно пересекать многие ионы, небольшие органические молекулы и вода, большинству других веществ требуется активный транспорт через специальные поры или каналы или путем эндоцитоза или экзоцитоза, чтобы войти или выйти из клетки, обычно очень крупных или электрически заряженных. молекулы, такие как белки и нуклеиновые кислоты. Помимо регулирования транспорта веществ в клетку и из клетки, клеточная мембрана создает организованное внутреннее пространство, в котором осуществляется деятельность по поддержанию жизни, и играет фундаментальную роль во всех взаимодействиях клетки с внешней средой, что делает ее важной в передаче сигналов клетки. , подвижность , защита и разделение , среди множества других процессов.
клеточная физиология
полярность ячейки
клеточная сигнализация: Разнообразный набор процессов, с помощью которых клетки передают и получают информацию от себя, других клеток или окружающей среды. Передача сигнала происходит во всех типах клеток, как прокариотических, так и эукариотических, и имеет решающее значение для способности клетки ориентироваться и выживать в физическом окружении. Бесчисленные механизмы передачи сигналов развились в различных организмах, которые часто классифицируются в зависимости от близости между отправителем и реципиентом ( аутокринные , интракринные , юкстакринные , паракринные или эндокринные ).
рецептор клеточной поверхности: Любой из класса рецепторных белков, встроенный внутрь или прикрепленный к внешней поверхности клеточной мембраны , с одним или несколькими сайтами связывания , обращенными к внеклеточной среде, и одним или несколькими эффекторными сайтами , которые связывают связывание определенного лиганда с внутриклеточным событием или процессом. . Рецепторы клеточной поверхности являются основным средством, с помощью которого сигналы окружающей среды принимаются клеткой и передаются через мембрану внутрь клетки. Некоторые из них могут также связывать экзогенные лиганды и транспортировать их в клетку в процессе, известном как рецептор-опосредованный эндоцитоз . ^[14]
клеточная стенка
внеклеточная ДНК (вкДНК): Любая молекула ДНК , существующая вне клетки или ядра , свободно плавающая во внеклеточной жидкости, такой как плазма крови .
сотовый: Относящийся к, состоящий из клетки или клеток, произведенный ими или напоминающий их.
клеточная дифференциация
клеточный иммунитет
сотовый шум
клеточное перепрограммирование: Преобразование окончательно дифференцированной клетки из одного тканеспецифического типа клеток в другой. Это предполагает дедифференцировку до плюрипотентного состояния; примером является перевод соматических клеток мыши в недифференцированное эмбриональное состояние, которое зависит от транскрипционных факторов Oct4 , Sox2 , Myc и Klf4 . ^[15]
клеточное старение
сантиморган (см): Единица измерения генетического сцепления, определяемая как расстояние между хромосомными локусами , для которого ожидаемое среднее количество промежуточных хромосомных кроссинговеров в одном поколении составляет 0,01. Хотя это и не является фактической мерой физического расстояния, оно используется для вывода о фактическом расстоянии между двумя локусами на основе очевидной вероятности кроссинговера, происходящего между ними в любом данном мейотическом делении.
центральная догма молекулярной биологии: Обобщенная основа для понимания потока генетической информации между макромолекулами в биологических системах. Центральная догма излагает фундаментальный принцип, согласно которому информация о последовательности, закодированная в трех основных классах биополимеров — ДНК , РНК и белке , — может передаваться между этими тремя классами только определенными способами, а не другими: в частности, передача информации между нуклеиновые кислоты и от нуклеиновой кислоты к белку возможны, но перенос от белка к белку или от белка обратно к любому типу нуклеиновой кислоты невозможен и не происходит естественным путем.
центриоль: Цилиндрическая органелла , состоящая из микротрубочек , присутствует только у некоторых эукариот. Пара центриолей мигрирует и определяет два противоположных полюса делящейся клетки , где, как часть центросомы , они инициируют рост веретенообразного аппарата .
центромера: Специализированная последовательность ДНК внутри хромосомы , связывающая пару сестринских хроматид . Основная функция центромеры - служить местом сборки кинетохор , белковых комплексов, которые направляют прикрепление волокон веретена к центромере и облегчают сегрегацию хроматид во время митоза или мейоза .
центромерный индекс: Доля общей длины хромосомы, охватываемая ее коротким плечом , обычно выражается в процентах; например, хромосома с центромерным индексом 15 является акроцентрической , с коротким плечом, составляющим только 15% ее общей длины. ^[4]
центросома
вкДНК: См . внеклеточная ДНК .
канальный белок: Тип трансмембранного белка , форма которого образует водную пору в мембране , позволяющую проходить определенным растворенным веществам, часто небольшим ионам, через мембрану в одном или обоих направлениях. ^[6]
Правила Чаргаффа: Набор аксиом, которые утверждают, что в ДНК любой хромосомы, вида или организма общее количество аденина ( А ) остатков будет примерно равно общему количеству остатков тимина ( Т ) и количеству гуанина ( G ) остатков будет равно числу остатков цитозина ( C ); соответственно, общее количество пуринов ( А + G ) будет равно общему количеству пиримидинов ( Т + С ). Эти наблюдения иллюстрируют весьма специфичную природу комплементарного спаривания оснований , которое происходит во всех дуплексных молекулах ДНК: хотя нестандартные спаривания технически возможны, они исключительно редки, поскольку стандартные спаривания сильно предпочтительнее в большинстве условий. Тем не менее, эквивалентность 1:1 редко бывает точной, поскольку в любой момент времени соотношения нуклеиновых оснований неизбежно искажаются в некоторой небольшой степени из-за неустраненных несоответствий , отсутствующих оснований и неканонических оснований. Присутствие одноцепочечных полимеров ДНК также меняет пропорции, поскольку последовательность отдельной цепи может содержать любое количество любых оснований.
заряженная тРНК: Транспортная РНК , к которой аминокислота присоединена ; т.е. аминоацилированная тРНК . В незаряженных тРНК отсутствуют аминокислоты. ^[4]
чДНК: См. ДНК хлоропластов .
хемиосмос
хемокинез: Ненаправленное случайное изменение в движении молекулы, клетки или организма в ответ на химический стимул, например, изменение скорости в результате воздействия определенного химического соединения.
хемотаксис: Направленное, неслучайное изменение в движении молекулы, клетки или организма в ответ на химический стимул, например, в сторону или от области с высокой концентрацией определенного химического соединения. ^[6]
хиазма: Крестообразное соединение, которое образует физическую точку контакта между двумя несестринскими хроматидами, принадлежащими гомологичным хромосомам, во время синапса . Помимо обеспечения правильного разделения хромосом, эти соединения также являются точками разрыва , в которых хромосомный кроссинговер может произойти во время митоза или мейоза , что приводит к взаимному обмену ДНК между синапсированными хроматидами.
химеризм: Наличие двух и более популяций клеток с различными генотипами в отдельном организме, известном как химера , развившаяся в результате слияния клеток, происходящих из отдельных зигот ; каждая популяция клеток сохраняет свой собственный геном, так что организм в целом представляет собой смесь генетически неидентичных тканей. Генетический химеризм может передаваться по наследству (например, при слиянии нескольких эмбрионов во время беременности) или приобретаться после рождения (например, при аллогенной трансплантации клеток, тканей или органов от генетически неидентичного донора); у растений это может быть результатом прививки или ошибок деления клеток. Он похож на мозаицизм, но отличается от него .
хлоропласт: Тип небольшой пластидной органеллы в форме линзы , обнаруженной в клетках зеленых водорослей и растений, которая содержит светочувствительные фотосинтетические пигменты ряд биохимических реакций, составляющих фотосинтез и в которой происходит . Подобно митохондриям , хлоропласты связаны двойной мембраной, содержат собственные внутренние кольцевые молекулы ДНК , от которых они управляют транскрипцией уникального набора генов, и реплицируются независимо от ядерного генома. ^[11]^[12]
ДНК хлоропластов (хпДНК, хДНК, ктДНК): Набор молекул ДНК , содержащихся в хлоропластах , типе фотосинтетических пластидных органелл, расположенных внутри клеток некоторых эукариот, таких как растения и водоросли, представляющих собой полуавтономный геном , отдельный от генома внутри ядра клетки. Как и другие типы пластидной ДНК, хпДНК обычно существует в форме небольших кольцевых плазмид .
хондриома: Полный набор митохондрий или митохондриальной ДНК внутри клетки, ткани, организма или вида.
хроматида: Одна копия вновь скопированной хромосомы , которая соединена с исходной хромосомой центромерой . Парные копии одной и той же отдельной хромосомы известны как сестринские хроматиды .
хроматин: Комплекс ДНК , РНК и белка, обнаруженный в эукариотических клетках и являющийся основным веществом, составляющим хромосомы . Хроматин действует как средство упаковки очень длинных молекул ДНК в высокоорганизованные и плотно уплотненные формы, что предотвращает запутывание нитей, укрепляет ДНК во время деления клеток , помогает предотвратить повреждение ДНК и играет важную роль в регуляции экспрессии генов и Репликация ДНК .
иммунопреципитация хроматина (ChIP)
хромоцентр: Центральная аморфная масса политенных хромосом , обнаруженная в ядрах клеток слюнных желез личинок дрозофилы и возникающая в результате слияния гетерохроматических участков, окружающих центромеры соматически парных хромосом, с расходящимися наружу дистальными эухроматическими плечами. ^[4]
хромомера: Область хромосомы , которая была локально уплотнена или свернута в хроматин , заметная под микроскопом как «бусинка», узел или темная полоса, особенно по сравнению с близлежащими неуплотненными цепочками ДНК.
хромосомный кроссовер
хромосомная ДНК: ДНК содержится в хромосомах , в отличие от внехромосомной ДНК . Этот термин обычно используется как синоним геномной ДНК .
хромосомная дупликация: Дупликация , а всей хромосомы не ее сегмента или отдельного гена .
хромосомная нестабильность
хромосома: Молекула ядерной ДНК, содержащая часть или весь генетический материал организма. Хромосомы можно рассматривать как своего рода молекулярную «упаковку» для переноса ДНК внутри ядра клетки. У большинства эукариот они состоят из длинных нитей ДНК, свитых упаковочными белками , которые связываются и конденсируют нити, чтобы предотвратить их превращение в неуправляемую структуру. запутывать. Хромосомы легче всего различать и изучать в их полностью конденсированных формах, возникающих только при делении клеток . Некоторые простые организмы имеют только одну хромосому, состоящую из кольцевой ДНК, тогда как у большинства эукариот есть несколько хромосом, состоящих из линейной ДНК.
конденсация хромосом: Процесс, при котором эукариотические хромосомы становятся короче, толще, плотнее и более заметными под микроскопом во время нитей ДНК при подготовке профазы из-за системного скручивания и суперспирализации хроматических к делению клетки .
сегрегация хромосом: Процесс, при котором сестринские хроматиды или парные гомологичные хромосомы отделяются друг от друга и мигрируют к противоположным сторонам делящейся клетки во время митоза или мейоза .
ходьба по хромосоме: См. букварь «Ходьба» .
ресница: Тонкий, нитевидный, ограниченный мембраной выступ, отходящий от поверхности эукариотической клетки, длиннее микроворсинки , но короче жгутика . Большинство эукариотических клеток имеют по крайней мере одну первичную ресничку, выполняющую сенсорные или сигнальные функции; некоторые клетки используют тысячи подвижных ресничек, покрывающих всю их поверхность, чтобы обеспечить передвижение или переместить внеклеточный материал мимо клетки.
кольцевая ДНК: Любая ДНК молекула , одноцепочечная или двухцепочечная , образующая непрерывную замкнутую петлю без концов; например, бактериальные хромосомы , митохондриальная и пластидная ДНК , а также многие другие разновидности внехромосомной ДНК , включая плазмиды и некоторые вирусные ДНК. Контрастная линейная ДНК .
циркулирующая опухолевая ДНК (цДНК): Любые фрагменты внеклеточной ДНК, полученные из опухолевых клеток, свободно циркулирующие в кровотоке.
цис: На той же стороне; прилегающий к; действующий от одной и той же молекулы. Контрастный транс .
цис -действующий: Воздействие на ген или последовательность той же молекулы нуклеиновой кислоты. Локус -действующей, если она влияет или действует на другие последовательности , или последовательность внутри конкретной молекулы ДНК, такой как хромосома, считается цис расположенные на коротких расстояниях (т.е. физически рядом, обычно, но не обязательно ниже ) на той же молекуле или хромосоме; или, в самом широком смысле, если он влияет или действует на другие последовательности, расположенные где угодно (не обязательно на небольшом расстоянии) на той же хромосоме гомологичной пары . Цис -действующие факторы часто участвуют в регуляции экспрессии генов , ингибируя или облегчая транскрипцию . Противопоставление трансакции .
цис- доминантная мутация: Мутация , происходящая внутри цис -регуляторного элемента (например, оператора ), которая изменяет функционирование близлежащего гена или генов на той же хромосоме . Цис -доминантные мутации влияют на экспрессию генов, поскольку они происходят в сайтах, контролирующих транскрипцию, а не внутри самих генов.
цисгенез
цис- регуляторный элемент (CRE): Любая последовательность или участок некодирующей ДНК , которая регулирует транскрипцию факторов близлежащих генов (например , промотора , оператора , сайленсера или энхансера ), обычно служа сайтом связывания для одного или нескольких транскрипции . Контраст трансрегуляторный .
танк: Любой из класса уплощенных, связанных с мембраной или мешочков гладкой и . шероховатой эндоплазматической сети и аппарата Гольджи везикул Путешествуя через одну или несколько цистерн, каждая из которых содержит отдельный набор ферментов, вновь созданные белки и полисахариды подвергаются химическим модификациям, таким как фосфорилирование и гликозилирование , которые используются в качестве сигналов упаковки для направления их транспорта в определенные пункты назначения внутри клетки. ^[16]
цистрон
цикл лимонной кислоты
классическая генетика: Раздел генетики, основанный исключительно на наблюдении видимых результатов репродуктивных актов, в отличие от того, что стало возможным благодаря современным методам и методам молекулярной биологии . Сравните молекулярную генетику .
расщепление
борозда расщепления: Выемка в форме корыта на поверхности материнской клетки , часто бросающаяся в глаза при взгляде через микроскоп, которая инициирует расщепление цитоплазмы ( цитокинез ), поскольку сократительное кольцо начинает сужаться во время деления клетки .
клональный отбор
клонирование: Процесс производства естественным или искусственным путем отдельных организмов или клеток, генетически идентичных друг другу. Клоны являются результатом всех форм бесполого размножения , а клетки, подвергающиеся митозу, производят дочерние клетки, которые являются клонами родительской клетки и друг друга. Клонирование может также относиться к биотехнологическим методам, которые искусственно создают копии организмов или клеток или, при молекулярном клонировании , копии фрагментов ДНК или других молекул.
закрытый хроматин: См . Гетерохроматин .
коактиватор: Тип корегулятора , который увеличивает экспрессию одного или нескольких генов путем связывания с активатором .
кодирующая цепь: Цепь двухцепочечной молекулы ДНК, нуклеотидная последовательность которой непосредственно соответствует последовательности транскрипта РНК, образующегося в процессе транскрипции (за исключением того, что тиминовые основания заменены на урациловые в молекуле РНК основания). Хотя она сама не транскрибируется, кодирующая цепь по соглашению является цепью, используемой при отображении последовательности ДНК из-за прямой аналогии между ее последовательностью и кодонами продукта РНК. Контрастная шаблонная прядь ; см. также смысл .
кодон: Ряд из трех последовательных нуклеотидов в кодирующей области последовательности нуклеиновой кислоты . Каждый из этих триплетов кодирует определенную аминокислоту или сигнал остановки во время синтеза белка . Молекулы ДНК и РНК записываются на языке с использованием четырех «букв» (четырех разных нуклеиновых оснований ), но язык, используемый для построения белков, включает 20 «букв» (20 различных аминокислот). Кодоны предоставляют ключ, который позволяет этим двум языкам переводиться друг в друга. В общем, каждый кодон соответствует одной аминокислоте (или стоп-сигналу). Полный набор кодонов называется генетическим кодом .
смещение использования кодонов: Предпочтительное использование определенного кодона для кодирования определенной аминокислоты , а не альтернативных кодонов, которые являются синонимами одной и той же аминокислоты, о чем свидетельствуют различия между организмами в частотах появления синонимичных кодонов в их кодирующей ДНК. Поскольку генетический код вырожден , большинство аминокислот могут кодироваться несколькими кодонами. Тем не менее, некоторые кодоны имеют тенденцию быть перепредставленными (а другие недостаточно) у разных видов.
ценоцит: Многоядерная , масса цитоплазмы ограниченная клеточной стенкой и возникающая в результате непрерывного роста цитоплазмы и повторного деления ядер без цитокинеза , обнаруженная у некоторых видов водорослей и грибов, например Vaucheria и Physarum . ^[11]
кофермент: Относительно небольшая независимая молекула, которая связывается со специфическим ферментом и участвует в реакции, которую катализирует фермент, часто образуя ковалентную связь с субстратом . Примеры включают биотин , НАД. ⁺и коэнзим А. ^[6]
коэнзим А (КоА)
кофактор: Любое небелковое органическое соединение, связанное с ферментом . Кофакторы необходимы для инициации катализа .
сравнительная геномная гибридизация (CGH)
компетентность
взаимодополняемость: Свойство нуклеиновых кислот биополимеров , при котором две полимерные цепи или « цепи », выровненные антипараллельно друг другу, имеют тенденцию образовывать пары оснований, состоящие из водородных связей между отдельными нуклеиновыми основаниями , составляющими каждую цепь, причем каждый тип нуклеиновых оснований спаривается почти исключительно с одним другим типом нуклеиновых оснований. азотистое основание; например, в двухцепочечных ДНК молекулах пары A соединяются только с T а пары C - только с G. , Пряди, спаренные таким образом, и сами основания называются комплементарными . Степень комплементарности между двумя цепями сильно влияет на стабильность дуплексной молекулы; определенные последовательности также могут быть внутренне комплементарными, что может приводить к связыванию одной цепи самой с собой . Комплементарность является фундаментальной для механизмов, управляющих репликацией , транскрипцией и репарацией ДНК .
комплементарная ДНК (кДНК): ДНК , которая синтезируется из матрицы одноцепочечной РНК (обычно мРНК или микроРНК ) в реакции, катализируемой ферментом обратной транскриптазой . кДНК производится как естественным путем с помощью ретровирусов , так и искусственно с помощью определенных лабораторных методов, в частности молекулярного клонирования . В биоинформатике этот термин также может использоваться для обозначения последовательности транскрипта мРНК, выраженной в виде аналога его кодирующей цепи ДНК (т.е. с тимином заменой урацила ).
дополнение
соединение X: См прикрепленный файл X. .
условное выражение: Контролируемая, индуцируемая трансгена in экспрессия vitro или in vivo .
слияние: В клеточной культуре — мера доли площади поверхности культурального сосуда , покрытой прикрепившимися клетками , обычно выражаемая в процентах. Культура, в которой вся поверхность полностью покрыта непрерывным монослоем , так что все клетки непосредственно примыкают и находятся в прямом физическом контакте с другими клетками, без промежутков или пустот, считается 100-процентно сливающейся. Различные клеточные линии демонстрируют различия в скорости роста или экспрессии генов в зависимости от степени слияния. Из-за контактного ингибирования большинство из них демонстрируют значительное снижение скорости деления клеток по мере приближения к полному слиянию, хотя некоторые иммортализованные клетки могут продолжать делиться, расширяясь вертикально, а не горизонтально, складываясь поверх родительских клеток , пока не будут использованы все доступные питательные вещества. истощены. ^[11]^[12]
конформация: Трехмерная пространственная конфигурация атомов, составляющих молекулу или макромолекулярную структуру. ^[11] Конформация белка — это физическая форма, в которую его полипептидные цепи принимают себя во время сворачивания белка , которая не обязательно является жесткой и может меняться в зависимости от конкретного химического окружения белка.
конформационное изменение: Изменение пространственной конформации или физической формы молекулы или макромолекулы, такой как белок или нуклеиновая кислота, редко спонтанно, но чаще в результате некоторого изменения химического окружения молекулы (например, температуры, pH, концентрации соли и т. д.) или взаимодействие с другой молекулой. Изменения в третичной структуре белков могут влиять на то, насколько сильно они связывают лиганды или субстраты ; индукция этих изменений является распространенным средством (как естественным, так и искусственным) активации, инактивации или иного контроля функции многих ферментов и рецепторных белков. ^[12]
конгресс: Движение хромосом к экватору веретена во время прометафазной и метафазной стадий митоза . ^[4]
консенсусная последовательность: Рассчитанный порядок наиболее частых остатков (нуклеотидов или аминокислот ) , обнаруженных в каждом положении при общем выравнивании последовательностей и полученный путем сравнения нескольких близкородственных выравниваний последовательностей.
консервативная репликация: Гипотетический способ репликации ДНК , при котором две родительские цепи исходной двухцепочечной молекулы ДНК в конечном итоге остаются комплементарными друг другу в конце процесса репликации, а две дочерние цепи в конечном итоге образуют свою собственную отдельную молекулу; следовательно, одна молекула состоит из обеих исходных цепей, а другая полностью состоит из вновь синтезированных цепей. В этом отличие от полуконсервативной репликации , при которой каждая молекула представляет собой гибрид одной старой и одной новой цепи. См. также дисперсионную репликацию .
консервативная последовательность: Последовательность нуклеиновой кислоты или белка , которая очень похожа или идентична у многих видов или внутри генома , что указывает на то, что она оставалась относительно неизменной на протяжении длительного периода эволюционного времени.
сородичей: Принадлежность к одному и тому же виду.
конститутивное выражение: 1. Непрерывная транскрипция гена , при в отличие от факультативной экспрессии которой ген транскрибируется только по мере необходимости. Ген, который транскрибируется непрерывно, называется конститутивным геном .; 2. Ген, экспрессия которого зависит только от эффективности его промотора связывать РНК-полимеразу , ^[4] а не на какие-либо транскрипционные факторы или другие регуляторные элементы , которые могут способствовать или ингибировать его транскрипцию.
контактное торможение: В клеточной культуре — явление, при котором большинство нормальных эукариотических клеток, прикрепившихся к плоскому субстрату, перестают расти и делиться при достижении критической плотности клеток, обычно когда они приближаются к полному слиянию или вступают в физический контакт с другими клетками. В результате многие типы клеток, культивируемые на чашках или чашках Петри, будут продолжать размножаться до тех пор, пока не покроют всю поверхность культурального сосуда, после чего скорость деления клеток резко снижается или полностью прекращается, образуя таким образом сливающийся монослой. с минимальным перекрытием между соседними клетками, даже если питательная среда остается обильной, а не складываются друг на друга. ^[14] Трансформированные или неопластические клетки имеют тенденцию не реагировать на плотность клеток одинаковым образом и могут продолжать пролиферировать при высокой плотности. ^[11] Этот тип зависящего от плотности торможения роста похож на родственное явление контактного торможения движения и может возникать одновременно с ним, но, тем не менее, отличается от него. ^[12] при этом движущиеся клетки реагируют на физический контакт, временно останавливаясь, а затем меняя направление своего движения в сторону от точки контакта.
контиг: Непрерывная последовательность геномной ДНК , созданная путем сборки клонированных фрагментов посредством их перекрывающихся последовательностей. ^[7]
сотрудничество
копировать ДНК (кДНК): См. комплементарную ДНК .
ошибка копирования: Мутация , возникающая в результате ошибки, допущенной при репликации ДНК . ^[4]
изменение количества копий (CNV): Явление, при котором участки генома повторяются , а количество повторов варьируется у разных особей в популяции, обычно в результате событий дупликации или делеции , которые затрагивают целые гены или участки хромосом. Вариации числа копий играют важную роль в создании генетических вариаций внутри популяции.
корегулятор: Белок, который работает вместе с одним или несколькими факторами транскрипции, регулируя экспрессию генов .
корепрессор: Тип корегулятора , который снижает (подавляет) экспрессию одного или нескольких генов путем связывания и активации репрессора .
космида
хпДНК: См. ДНК хлоропластов .
Остров CpG: Область генома , в которой сайты CpG встречаются повторно или с высокой частотой.
CpG-сайт: Последовательность ДНК, в которой за нуклеотидом цитозина сразу следует нуклеотид гуанина на той же цепи 5'-к-3' в направлении ; «p» в CpG относится просто к промежуточной фосфатной группе, соединяющей два последовательных нуклеотида.
Редактирование генов CRISPR
Криста: Любая из многочисленных складок или впячиваний во внутренней митохондриальной мембране, которые придают этой мембране характерную морщинистую форму и увеличивают площадь поверхности, на которой может происходить аэробный газообмен и поддерживающие реакции переноса электронов . Кристы усеяны белками, такими как АТФ-синтаза и различные цитохромы .
пересечение: См. хромосомный кроссовер .
сшивка: Любая химическая связь или ряд связей, нормальных или аномальных, естественных или искусственных, которые соединяют две или более полимерные молекулы друг с другом, создавая еще более крупный, часто структурно жесткий и механически прочный макромолекулярный комплекс. Сшивки могут состоять из ковалентных , ионных или межмолекулярных взаимодействий или даже обширных физических переплетений молекул и могут быть обратимыми или необратимыми; в химии полимеров этот термин часто используется для описания макроструктур, которые предсказуемо образуются в присутствии определенного реагента или катализатора. В молекулярной биологии этот термин обычно подразумевает аномальную связь (естественную или экспериментально вызванную) между различными биомолекулами (или разными частями одной и той же биомолекулы), которые обычно разделены, особенно нуклеиновыми кислотами и белками . Сшивка ДНК может происходить между азотистыми основаниями на противоположных нитях двухцепочечной молекулы ДНК ( межцепочечные ) или между основаниями на одной и той же цепи ( внутрицепочечные ), в частности, за счет образования ковалентных связей, которые более прочны, чем водородные связи нормальных базовое спаривание ; это общие цели путей репарации ДНК . Белки также подвержены сшивке с ДНК или другими белками посредством связей со специфическими поверхностными остатками - процесс, который искусственно индуцируется во многих лабораторных методах, таких как фиксация , и который может быть полезен для изучения взаимодействий между белками в их нативном состоянии . Сшивки генерируются различными экзогенными и эндогенными агентами, включая химические соединения и высокоэнергетическое излучение, и имеют тенденцию мешать нормальным клеточным процессам, таким как ДНК репликация и транскрипция , а это означает, что их сохранение обычно ставит под угрозу здоровье клеток.
загадочный нестабильный транскрипт (CUT)
ктДНК: 1. Аббревиатура циркулирующей опухолевой ДНК .; 2. Аббревиатура хлоропластной ДНК .
C-терминал: Конец линейной цепи аминокислот (т.е. пептида ), который заканчивается свободной карбоксильной группой ( -СООН ) последней аминокислоты, которая будет добавлена к цепи во время трансляции . Эту аминокислоту называют С-концевой . По соглашению, последовательности, домены, активные сайты или любая другая структура, расположенная ближе к С-концу полипептида или свернутого белка, который он образует относительно других, описываются как расположенные ниже . Контрастный N-конец .
резать
C-значение: Общее количество ДНК , содержащееся в гаплоидном ядре (например, гамете ) конкретного организма или вида, выраженное в количестве пар оснований или в единицах массы (обычно пикограммах ); или, что эквивалентно, половина количества в диплоидной соматической клетке . Для простых диплоидных эукариот этот термин часто используется как синоним размера генома , но в некоторых случаях, например, в гибридных полиплоидах, произошедших от родителей разных видов, значение C может фактически обозначать два или более различных генома, содержащихся в одном ядре. Значения C применимы только к геномной ДНК и, в частности, исключают внеядерную ДНК .
Загадка значения C: Термин, используемый для описания разнообразных вопросов, касающихся огромных различий в значении ядерного C или размера генома среди видов эукариот, в частности, наблюдения о том, что размер генома не коррелирует с воспринимаемой сложностью организмов и не обязательно с количеством генов. они обладают; например, геномы многих одноклеточных протистов содержат в тысячи раз больше ДНК, чем геном человека . Это считалось парадоксальным до тех пор, пока не было обнаружено, что геномы эукариот состоят в основном из некодирующей ДНК , в которой полностью отсутствуют гены. С тех пор фокус загадки сместился на понимание того, почему и как геномы оказались заполнены таким большим количеством некодирующей ДНК и почему некоторые геномы имеют более высокое содержание генов, чем другие.
циклический аденозинмонофосфат (цАМФ)
циклоз: См. поток цитоплазмы .
цитидин ( C , Cyd): Один из четырех стандартных нуклеозидов, используемых в молекулах РНК , состоящий из цитозинового основания которого _{N 9} , азот связан C ₁ с углеродом сахара рибозы . Цитозин, связанный с дезоксирибозой , известен как дезоксицитидин , который является версией, используемой в ДНК .
цитохимия: Раздел клеточной биологии, включающий обнаружение и идентификацию различных структур и компонентов внутри клеток посредством биохимического анализа и визуализации, в частности локализацию клеточных компонентов с использованием таких методов, как химическое окрашивание и иммуноокрашивание , спектрофотометрия и спектроскопия , радиоавтография и электронная микроскопия .
цитогенетика: Раздел генетики , изучающий хромосом влияние на поведение и функции клеток , особенно во время митоза и мейоза .
цитокин
цитокинез: Конечный этап клеточного деления как при митозе , так и при мейозе , обычно сразу после деления ядра , во время которого цитоплазма материнской клетки расщепляется и делится примерно поровну между двумя дочерними клетками . В животных клетках этот процесс происходит путем замыкания микрофиламентов сократительного кольца в экваториальной области делящейся клетки. Контрастный кариокинез .
цитология: Изучение морфологии, процессов и истории жизни живых клеток , в частности методами световой и электронной микроскопии. ^[11] Этот термин также иногда используется как синоним более широкой области клеточной биологии .
цитолиз: См. лизис .
цитометр
цитомика: Междисциплинарная область, изучающая клеточную биологию , цитологию и биохимию на уровне отдельной клетки с использованием молекулярных методов отдельных клеток и современной микроскопии для визуализации взаимодействия клеточных компонентов in vivo . ^[17]
цитоплазма
цитоплазматический поток: Поток цитоплазмы внутри клетки, обусловленный силами, действующими на цитоплазматическую жидкость со стороны цитоскелета . Частично этот поток функционирует для ускорения транспорта молекул и органелл, взвешенных в цитоплазме, к различным частям клетки, которым в противном случае пришлось бы полагаться на пассивную диффузию для движения. Чаще всего это наблюдается в очень крупных эукариотических клетках, для которых существует большая потребность в эффективности транспорта.
цитопласт: Энуклеированная эукариотическая клетка; или все другие клеточные компоненты, помимо ядра (т.е. клеточная мембрана, цитоплазма, органеллы и т. д.), рассматриваемые в совокупности. Этот термин чаще всего используется в контексте экспериментов по переносу ядра , во время которых цитопласт иногда может оставаться жизнеспособным в отсутствие ядра до 48 часов. ^[14]
цитозин ( С ): Пиримидиновое используемое нуклеиновое основание, в качестве одного из четырех стандартных нуклеиновых оснований как в молекулах ДНК , так и в РНК . Цитозин образует пару оснований с гуанином .
цитозоль: Растворимая водная фаза цитоплазмы , мелкие частицы, такие как рибосомы , белки , нуклеиновые кислоты в которой суспендированы или растворены и многие другие молекулы, за исключением более крупных структур и органелл, таких как митохондрии , хлоропласты , лизосомы и эндоплазматическая сеть . ^[11]

Д

дочерняя клетка: Клетка , возникающая в результате деления исходного предшественника, известного как родительская клетка . Обычно за одно деление образуются две дочерние клетки. ^[11]
снова мутация: Спонтанная мутация в геноме отдельного организма, новая для линии этого организма, впервые появившаяся в зародышевой клетке одного из родителей организма или в оплодотворенной яйцеклетке, из которой развивается организм; т.е. мутация, которой не было в геноме ни одного из родителей. ^[4]
снова синтез: Сборка синтетической последовательности нуклеиновой кислоты из свободных нуклеотидов без использования существующей цепи-матрицы , т.е. de novo , с помощью любого из множества лабораторных методов. Синтез de novo теоретически позволяет создавать полностью искусственные молекулы без встречающихся в природе эквивалентов и без ограничений по размеру или последовательности. Это обычно выполняется при коммерческом производстве индивидуальных, изготовленных на заказ олигонуклеотидных последовательностей, таких как праймеры .
деацетилирование
децеллюляризация
вырождение: Избыточность генетического кода проявляется в множественности различных кодонов , определяющих одну и ту же аминокислоту . Например, в стандартном генетическом коде аминокислота серин определяется шестью уникальными кодонами ( UCA , UCG , UCC , UCU , AGU и AGC ). Вырождение кодонов объясняет существование синонимичных мутаций .
дегрануляция
удаление: Тип мутации , при котором один или несколько нуклеотидов удаляются из последовательности нуклеиновой кислоты .
деметилирование
денатурация: Процесс, при котором нуклеиновые кислоты или белки теряют свою четвертичную , третичную и/или вторичную структуру обратимо или необратимо в результате воздействия какого-либо внешнего химического или механического воздействия, например, при нагревании, взбалтывании или воздействии сильной кислоты или основания. , все из которых могут разрушать межмолекулярные силы, такие как водородные связи , и тем самым изменять или разрушать химическую активность. Денатурированные белки могут быть как причиной, так и следствием гибели клеток. Денатурация также может быть нормальным процессом; денатурация двухцепочечных молекул ДНК Например, , которая разрывает водородные связи между парами оснований и вызывает разделение дуплексной молекулы на две одиночные цепи , является необходимым этапом ДНК репликации и транскрипции и, следовательно, обычно выполняется такими ферментами, как как геликазы . Тот же механизм является фундаментальным для лабораторных методов, таких как ПЦР .
дезоксиаденозин: Один из четырех стандартных дезоксирибонуклеозидов, используемых в молекулах ДНК , состоящий из аденинового основания с _{N 9} азотом , связанным C ₁ с углеродом сахара дезоксирибозы . Аденин, связанный с рибозой, образует альтернативное соединение, известное просто как аденозин , которое используется в РНК .
дезоксицитидин: Один из четырех стандартных дезоксирибонуклеозидов, используемых в молекулах ДНК , состоящий из цитозинового основания с _{N 9} азотом , связанным C ₁ с углеродом сахара дезоксирибозы . Цитозин, связанный с рибозой, образует альтернативное соединение, известное просто как цитидин , которое используется в РНК .
дезоксигуанозин: Один из четырех стандартных дезоксирибонуклеозидов, используемых в молекулах ДНК , состоящий из гуанинового основания с _{N 9} азотом , связанным C ₁ с углеродом сахара дезоксирибозы . Гуанин, связанный с рибозой, образует альтернативное соединение, известное просто как гуанозин , которое используется в РНК .
дезоксирибонуклеаза (ДНКаза): Любой из класса нуклеазных ферментов, которые катализируют гидролитическое расщепление фосфодиэфирных связей в молекулах ДНК , тем самым разрывая и вызывая цепи дезоксирибонуклеотидов распад полимеров ДНК на более мелкие компоненты. Сравните рибонуклеазы .
дезоксирибонуклеиновая кислота (ДНК): Полимерная , молекула нуклеиновой кислоты состоящая из ряда ковалентно связанных дезоксирибонуклеотидов , каждый из которых включает одно из четырех азотистых оснований : аденин ( А ), гуанин ( G ), цитозин ( С ) и тимин ( Т ). ДНК чаще всего встречается в форме , которая состоит из двух комплементарных антипараллельных нуклеотидных цепей, в которых каждое нуклеиновое основание на каждой отдельной цепи спарено двухцепочечной посредством водородных связей с одним на противоположной цепи; эта структура обычно принимает форму двойной спирали . ДНК также может существовать в одноцепочечной форме. Храня и кодируя генетическую информацию в последовательности этих нуклеиновых оснований, ДНК служит универсальной молекулярной основой биологического наследования и фундаментальной матрицей, на основе которой строятся все белки, клетки и живые организмы.
дезоксирибонуклеотид: Нуклеотид , содержащий дезоксирибозу в качестве компонента пентозного сахара, а также мономер или субъединицу, используемый для построения молекул дезоксирибонуклеиновой кислоты (ДНК). Дезоксирибонуклеотиды канонически включают любое из четырех азотистых оснований : аденин ( А ), гуанин ( G ), цитозин ( С ) и тимин ( Т ). Сравните рибонуклеотиды .
дезоксирибоза: Моносахарид - пентоза, полученный из рибозы путем замены гидроксильной группы, присоединенной к углероду С _2, на один атом водорода. D-дезоксирибоза в своей циклической кольцевой форме является одной из трех основных функциональных групп дезоксирибонуклеотидов и, следовательно, молекул дезоксирибонуклеиновой кислоты (ДНК).
дезокситимидин: См . тимидин .
дефосфорилирование
дериватизация: Искусственная модификация молекулы или белка с целью изменения ее растворимости или других химических свойств, чтобы обеспечить возможность анализа (например, с помощью масс-спектроскопии или хроматографии ) или маркировки путем присоединения обнаруживаемого химического фрагмента (например, флуоресцентной метки) к облегчить идентификацию и отслеживание in vivo . Молекулы, модифицированные таким образом, описываются как производные своих природных аналогов и считаются дериватизированными . ^[12]
десмосома: Специализированный клеточный контакт между соседними эпителиальными клетками, в котором клетки удерживаются вместе сетью кератиновых нитей и структурных белков, перекрывающих разрыв между плазматическим мембранами. ^[12]
вектор назначения
десинапсис: Неспособность гомологичных хромосом , которые синапсировали нормально во время пахинемы , оставаться парными во время диплонемы . Десинапсис обычно возникает из-за неправильного формирования хиазм . ^[4] Контрастная асинапсис .
биология развития
диакинез: В мейозе — пятая и последняя подстадия профазы I , следующая за диплонемой и предшествующая метафазе I. В ходе диакинеза хромосомы еще больше конденсируются, две центросомы достигают противоположных полюсов клетки, и веретенообразный аппарат начинает простираться от полюсов к экватору. ^[4]
дицентрик: (линейной хромосомы или фрагмента хромосомы) Наличие двух центромер вместо нормальной. ^[2]
дифференциация
димер: Молекулярный агрегат, состоящий из двух субъединиц . Этот термин часто используется для описания белкового комплекса , состоящего из двух белков: либо одного и того же белка ( гомодимер ), либо разных белков ( гетеродимер ); или к отдельному белку, состоящему из двух полипептидов . Сравните мономер , тример и тетрамер .
динуклеотид: Молекулярный димер , состоящий ровно из двух ковалентно связанных нуклеотидов ; или любые два нуклеотида, которые находятся непосредственно рядом друг с другом на одной и той же цепи более длинного полимера нуклеиновой кислоты .
диплоидный: (клетки или организма) Наличие двух гомологичных копий каждой хромосомы . Сравните гаплоид и полиплоид .
диплом: Мейоз — четвёртая из пяти подстадий профазы I , следующая за пахинемой и предшествующей диакинезу . При диплонеме синаптонемный комплекс распадается, и парные гомологичные хромосомы начинают отделяться друг от друга, хотя они остаются прочно связанными в хиазмах , где кроссинговер . произошел
прямой повтор: Любые два или более повторения определенной последовательности нуклеотидов, встречающиеся в одной и той же ориентации (т.е. точно в том же порядке и не перевернутые ) и на одной и той же цепи , разделенные промежуточными нуклеотидами или нет. Примером может служить последовательность TACCG nnnnnn TACCG , в которой TACCG встречается дважды, хотя и разделена шестью нуклеотидами, не являющимися частью повторяющейся последовательности. Прямой повтор, при котором повторы непосредственно примыкают друг к другу, известен как тандемный повтор .
направленность: Химическая ориентация «конец-в-конец» одной линейной цепи или последовательности полимера нуклеиновой кислоты или полипептида . Номенклатура, используемая для обозначения направленности нуклеиновой кислоты, основана на химическом соглашении идентификации отдельных атомов углерода в рибозных или дезоксирибозных сахарах нуклеотидов, в частности, -углерода и 3'-углерода пентозного 5' кольца. Последовательность нуклеотидов в полимерной цепи можно читать или интерпретировать в направлении от 5'-к 3', т.е. начиная с концевого нуклеотида, в котором 5'-углерод не связан с другим нуклеотидом, и переходя к другому концевому нуклеотиду. , в котором 3'-углерод не связан с другим нуклеотидом - или в противоположном направлении от 3' к 5'. Большинство типов синтеза нуклеиновых кислот, включая ДНК репликацию и транскрипцию , работают исключительно в направлении 5'-к-3', поскольку участвующие в этом процессе полимеразы могут катализировать только добавление свободных нуклеотидов к открытому 3'-концу предыдущего нуклеотида. цепь. По этой причине при написании любой последовательности нуклеиновой кислоты принято представлять ее в направлении 5'-к-3' слева направо. В двухцепочечные нуклеиновые кислоты, две парные цепи должны быть ориентированы в противоположных направлениях, чтобы образовать пару оснований друг с другом. Направленность полипептида аналогичным образом основана на маркировке функциональных групп, включающих аминокислоты , в частности аминогруппы, которая образует N-конец , и карбоксильной группы, которая образует С-конец ; Аминокислотные последовательности во время трансляции собираются в направлении от N к C и по соглашению записываются в том же направлении.
дисахарид: Углеводы , состоящие из двух моносахаридов (одинаковых или разных), соединенных ковалентной гликозидной связью . ^[12] См. также олигосахарид и полисахарид .
дисперсионная репликация
диссимиляционный процесс: Любой экзергонический процесс микробного катаболизма , при котором окислительно -восстановительные химические соединения участвуют в окислительно-восстановительных реакциях (обмене электронами), обеспечивая клетку энергией, необходимой для поддержания метаболической активности. Внешние вещества поглощаются клеткой из окружающей среды, а затем разлагаются с выделением энергии, а побочные продукты впоследствии выводятся из клетки. Это контрастирует с ассимиляционным процессом , при котором атомы внешних веществ повторно используются в синтезе биомолекул или производстве клеточных компонентов.
мера расстояния: Любая величина, используемая для измерения различий между уровнями экспрессии разных генов . ^[18]
ДНК: См. дезоксирибонуклеиновая кислота .
ДНК-штрихкодирование: Метод таксономической идентификации, при котором короткие последовательности ДНК одного или нескольких специфических генов выделяют из неидентифицированных образцов и затем сравнивают с последовательностями из справочной библиотеки, чтобы однозначно идентифицировать вид или другой таксон, из которого произошли образцы. Последовательности, используемые для сравнения, тщательно выбираются из генов, которые широко консервативны и демонстрируют большую изменчивость между видами, чем внутри вида, например, ген цитохром-с-оксидазы для эукариот или определенные рибосомальной РНК гены для прокариот. Эти гены присутствуют почти во всех живых организмах, но имеют тенденцию вызывать разные мутации у разных видов, так что уникальный вариант последовательности может быть связан с одним конкретным видом, эффективно создавая уникальный идентификатор, аналогичный розничному штрих-коду . Штрих-кодирование ДНК позволяет идентифицировать неизвестные образцы из неразличимых в противном случае тканей или частей тела, где идентификация по морфологии была бы затруднительна или невозможна, а библиотека штрих-кодов организмов в настоящее время достаточно обширна, чтобы часто можно было идентифицировать даже ранее неизвестные науке организмы. филогенетически классифицированы с уверенностью. Одновременная идентификация нескольких разных видов из смешанной выборки известна как метабаркодирование .
конденсация ДНК: Процесс сжатия очень длинных молекул ДНК в плотно упакованные, упорядоченные конфигурации, такие как хромосомы , либо in vivo , либо in vitro .
ДНК-дактилоскопия
Метилирование ДНК
ДНК-микрочип: Высокопроизводительная технология , используемая для измерения экспрессии уровней транскриптов мРНК или обнаружения определенных изменений в нуклеотидной последовательности . Он состоит из множества тысяч микроскопических пятен ДНК олигонуклеотидов , называемых признаками , каждое из которых содержит пикомоли определенной последовательности ДНК. Это может быть короткий участок гена или любой другой элемент ДНК, который используется в качестве зонда для гибридизации кДНК , кРНК или образца геномной ДНК (называемого мишенью ) в условиях высокой строгости . зонда-мишени Гибридизацию обычно выявляют и количественно определяют путем флуоресцентного обнаружения мишеней, меченных флуорофором .
ДНК-полимераза: Любой из класса ферментов , синтезирующих молекулы ДНК из отдельных дезоксирибонуклеотидов . ДНК-полимеразы необходимы для репликации ДНК и обычно работают парами, создавая идентичные копии двух цепей исходной двухцепочечной молекулы. Они строят длинные цепи ДНК, добавляя нуклеотиды по одному к 3'-концу цепи ДНК, обычно полагаясь на матрицу, обеспечиваемую комплементарной цепью, для точного копирования нуклеотидной последовательности.
восстановление ДНК: Набор процессов, с помощью которых клетка идентифицирует и исправляет структурные повреждения или мутации в молекулах ДНК , кодирующих ее геном . Способность клетки восстанавливать свою ДНК жизненно важна для целостности генома и нормального функционирования организма.
репликация ДНК: Процесс, посредством которого молекула ДНК копирует сама себя, создавая две идентичные копии одной исходной молекулы ДНК.
секвенирование ДНК: из множества различных методов и технологий порядка оснований в длинной цепи нуклеотидов, составляющей последовательность ДНК Процесс определения с помощью любого .
оборот ДНК: Любой механизм, с помощью которого ДНК последовательности заменяются невзаимно (например, посредством конверсии генов , транспозиции или неравного кроссинговера ), который вызывает постоянные колебания числа копий ДНК мотивов в течение жизни организма. Такие механизмы часто являются основными движущими силами видообразования между популяциями. ^[14]
ДНК-связывающий домен (DBD): Белковый домен, по крайней мере один структурный мотив, способный узнавать и взаимодействовать с нуклеотидами двухцепочечной содержащий или одноцепочечной молекулы ДНК . ДНК-связывающие домены могут связываться со специфическими последовательностями или иметь неспецифическое сродство к ДНК. Они являются основными функциональными компонентами ДНК-связывающих белков , включая многие факторы транскрипции и регуляторные белки.
ДНК-связывающий белок (DBP): Любой полипептид или белок, содержащий один или несколько доменов, способных химически взаимодействовать с одной или несколькими частями молекулы ДНК и, следовательно, обладающих специфическим или общим сродством к одно- и/или двухцепочечной ДНК . ДНК-связывающая активность часто зависит от присутствия и физической доступности определенной последовательности нуклеиновых оснований и в основном возникает в большой бороздке , поскольку она обнажает больше функциональных групп, которые однозначно идентифицируют основания. На связывание также влияют пространственная конформация цепи ДНК и присутствие других белков рядом с местом связывания; многие белки не могут связываться с ДНК, не претерпев предварительно конформационных изменений, вызванных взаимодействием с другими молекулами.
ДНКаза: См. дезоксирибонуклеаза .
домен: Дискретная, обычно непрерывная область белка или соответствующая аминокислотная последовательность полипептида , , которая выполняет определенную функцию или определяется определенными физико-химическими свойствами (например, гидрофобными полярными, неполярными, глобулярными и т. д.). ^[12] и особенно тот, который принимает уникальную, узнаваемую пространственную конформацию белка как часть третичной структуры и который способствует или определяет его биологическую активность. Большие белки обычно состоят из нескольких доменов, связанных между собой короткими промежуточными полипептидными последовательностями. ^[6] Домены обычно группируются в классы со схожими свойствами или функциями, например, ДНК-связывающие домены . В более широком смысле этот термин также может использоваться для обозначения дискретной структурной единицы внутри любой биомолекулы, включая функционально или композиционно различные субобласти последовательностей нуклеиновых кислот и хромосом . ^[14]
донорский вектор
компенсация дозы: Любой механизм, с помощью которого организмы нейтрализуют большую разницу в дозах генов, вызванную наличием разного количества половых хромосом у разных полов, тем самым уравнивая экспрессию сцепленных с полом генов, так что представители каждого пола получают одинаковое или одинаковое количество половых хромосом. продукты . таких генов Примером является Х-инактивация у самок млекопитающих.
двойная спираль: Форма, которую чаще всего принимают двухцепочечные молекулы нуклеиновой кислоты , напоминающая лестницу, закрученную на своей длинной оси, со ступенями лестницы, состоящими из парных нуклеиновых оснований . Эта вторичная структура представляет собой наиболее энергетически стабильную конформацию двухцепочечных форм как ДНК, так и РНК в большинстве естественных условий, возникающую вследствие первичной структуры фосфодиэфирного остова и укладки связанных с ним нуклеотидов . В B-ДНК , наиболее распространенном варианте ДНК, встречающемся в природе, двойная спираль имеет правостороннее закручивание примерно с 10 парами оснований на полный оборот, а молекулярная геометрия приводит к чередующемуся рисунку «бороздок» разной ширины (рис. большая бороздка и малая бороздка ) между параллельными основами.
двухцепочечный разрыв (DSB): Потеря непрерывности фосфатно-сахарного остова в обеих цепях двухцепочечной молекулы ДНК , особенно когда два разрыва происходят в участках, которые расположены непосредственно напротив друг друга или очень близко друг к другу на комплементарных цепях. ^[14] Контрастный однонитевой разрыв .
двухцепочечный: Состоит из двух антипараллельных , комплементарных нуклеиновой кислоты молекул или цепей ( ДНК-ДНК , РНК-РНК или гибрида ДНК-РНК ), которые удерживаются вместе водородными связями между комплементарными азотистыми основаниями каждой цепи, известными как спаривание оснований . Сравните одноцепочечные .
двухцепочечная ДНК (дцДНК): Любая молекула ДНК , состоящая из двух антипараллельных комплементарных дезоксирибонуклеотидных водородными полимеров, известных как нити , которые связаны друг с другом связями между комплементарными азотистыми основаниями . Хотя ДНК может существовать в виде одной цепи , она, как правило, более стабильна и чаще встречается в двухцепочечной форме. В большинстве случаев комплементарная пара оснований заставляет двойные нити скручиваться друг вокруг друга в форме двойной спирали .
двухцепочечная РНК (дсРНК): Любая молекула РНК состоящая из двух антипараллельных комплементарных рибонуклеотидных , полимеров, известных как нити , которые связаны друг с другом водородными связями между комплементарными азотистыми основаниями . Хотя РНК обычно встречается в одноцепочечной форме , она также способна образовывать дуплексы так же, как ДНК ; примером является спаривание транскрипта мРНК с антисмысловой версией того же транскрипта, которое эффективно подавляет ген, из которого транскрибировалась мРНК, путем предотвращения трансляции. Как и в дцДНК, спаривание оснований в дцРНК обычно приводит к тому, что двойные нити скручиваются друг вокруг друга в форме двойной спирали .
понижающее регулирование: Любой процесс, естественный или искусственный, который снижает уровень экспрессии определенного гена . Ген, экспрессия которого наблюдается на относительно низких уровнях (например, путем обнаружения более низких уровней его транскриптов мРНК ) в одном образце по сравнению с другим образцом, называется подавленным . контрастности Повышение .
ниже по течению: Ближе к 3'-концу цепи нуклеотидов или к -концу пептидной С цепи. Контраст вверх по течению .
дцДНК: См. двухцепочечную ДНК .
дсРНК: См. двухцепочечную РНК .
дуплекс: См. двухцепочечный .
дублирование: Производство второй копии части или всей нуклеотидной последовательности или аминокислотной последовательности естественным или искусственным путем и сохранение обеих копий; особенно когда и копия, и исходная последовательность сохраняются in situ внутри одной и той же молекулы, часто, но не обязательно, рядом друг с другом. См. также дупликацию гена , хромосомную дупликацию и повтор .
диада: См. сестринские хроматиды .
дисплазия: Аномальный рост или развитие ткани или органа; изменение в росте, поведении или организации клеток внутри ткани или наличие клеток аномального типа, приводящее к нарушению состояния ткани, ^[6] событие, которое часто предшествует развитию рака .

И

сигнал «съешь меня»: Молекула, выходящая на поверхность клетки, которая эффективно маркирует клетку для фагоцитоза , побуждая фагоциты поглощать или «съедать» ее. Присутствие окисленных фосфолипидов или фосфатидилсерина или отсутствие сиаловой кислоты клеточной поверхности в гликопротеинах или гликолипидах обычно используются в качестве сигналов «съешь меня» в определенных типах клеток. См. также сигнал «найди меня» .
цепь переноса электронов
электропорация: Метод молекулярной биологии, при котором сильное электрическое поле применяется к живым клеткам с целью временного увеличения проницаемости их клеточных мембран, позволяя экзогенным нуклеиновым кислотам, белкам или химическим соединениям легко проходить через мембрану и тем самым проникать в клетки. Это распространенный метод трансформации и трансфекции .
удлинение: Линейный рост полимера нуклеиновой кислоты путем последовательного добавления отдельных нуклеотидных мономеров к образующейся цепи , например, во время транскрипции или репликации , особенно когда это происходит путем комплементарного спаривания с матричной цепью . Этот термин часто используется для описания этапов определенных лабораторных методов, таких как полимеразная цепная реакция .
эмбрион
возникновение: Качество генетических признаков , возникающее в результате определенной конфигурации взаимодействующих генов , а не просто их комбинации.
эндоцитоз: Любой процесс, посредством которого вещество активно поглощается или вносится внутрь клетки , пересекая плазматическую мембрану из внеклеточного пространства во внутриклеточное пространство , который включает подклассы пиноцитоза , фагоцитоза и рецептор-опосредованных процессов. Все они включают окружение внеклеточной молекулы, белка или даже другой клетки или организма расширением или впячиванием клеточной мембраны, которая затем «отпочковывается» или отделяется от остальной части мембраны на цитоплазматической стороне, образуя мембрану. Закрытый везикула, содержащая проглоченные материалы. Благодаря этому механизму материал может пересекать липидный бислой, не подвергаясь воздействию гидрофобного пространства между ними, вместо этого оставаясь во взвешенном состоянии в жидкости внеклеточного пространства. Многие крупные полярные макромолекулы, которые не могут просто диффундировать через мембрану, такие как метаболиты и гормоны , транспортируются в клетку путем эндоцитоза. Он отличается от альтернативных путей, таких как прохождение через белковые каналы. или сопровождаются транспортными белками . Обратный процесс называется экзоцитозом .
эндомембрана: Любая мембрана, окружающая внутриклеточную органеллу или везикулу , например мембрану эндоплазматического ретикулума , аппарата Гольджи , лизосому , вакуоль , ядро ( ядерную оболочку ) и т. д. ^[11]
эндонуклеаза: Любой фермент , активность которого заключается в расщеплении фосфодиэфирных связей внутри цепи нуклеотидов , включая те, которые расщепляют относительно неспецифично (без учета последовательности ), и те, которые расщепляют только очень специфические последовательности (так называемые эндонуклеазы рестрикции ). Когда требуется распознавание определенной последовательности, эндонуклеазы разрезают ее в середине последовательности. Контрастная экзонуклеаза .
эндоплазматическая сеть (ЭР)
эндосома
усилитель: Область ДНК рядом с геном , которая может быть связана активатором для увеличения экспрессии гена или репрессором для снижения экспрессии.
энхансерная РНК (еРНК): Подкласс длинных некодирующих РНК, транскрибируемых с участков ДНК, содержащих энхансерные последовательности. Экспрессия данной еРНК обычно коррелирует с активностью соответствующего энхансера в усилении транскрипции его генов-мишеней, указывая тем самым, что еРНК играют активную роль в регуляции генов в цис- или транс -гене .
энуклеировать: Искусственно удалить ядро из клетки , например, с помощью микроманипуляций в лаборатории или путем разрушения его путем облучения ультрафиолетовым светом, в результате чего клетка становится безъядерной . ^[11]
инвагинация
фермент: Белок , который действует как катализатор биологического процесса, ускоряя определенную химическую реакцию , обычно связывая одну или несколько молекул субстрата и уменьшая энергию активации, необходимую для инициирования конкретной реакции с участием субстрата(ов). Ферментативный катализ часто приводит к химическому превращению субстрата(ов) в один или несколько продуктов, которые затем ингибируют или разрешают последующие реакции. Все метаболические пути состоят из серии отдельных реакций, каждая из которых зависит от одного или нескольких специфических ферментов, которые ускоряют их движение со скоростью, достаточной для поддержания жизни.
эпигенетика
эпигеном
эписома: 1. Другое название плазмиды , особенно той, которая способна интегрироваться в хромосому .; 2. У эукариот — любая неинтегрированная внехромосомная кольцевая молекула ДНК , которая стабильно поддерживается и реплицируется в ядре одновременно с остальной частью клетки-хозяина. Такие молекулы могут включать вирусные геномы, бактериальные плазмиды и аберрантные хромосомные фрагменты.
эпистаз: Коллективное действие множества генов, взаимодействующих во время экспрессии генов . Эпистаз, форма действия генов, может быть аддитивным или мультипликативным по своему влиянию на определенные фенотипические признаки .
эпитоп: Конкретный сайт или область внутри антигенной макромолекулы , такой как белок или углевод , который распознается В- или Т-клетками иммунной системы, против которого вырабатывается специфическое антитело антитела и с которым специфически взаимодействует или связывается паратоп . В белках эпитопы обычно представляют собой мотивы из 4–5 аминокислотных остатков, последовательных или несмежных, которые благодаря особой пространственной конформации, которую они принимают при сворачивании белка, способны уникальным образом взаимодействовать с конкретным паратопом. В этом смысле их можно считать сайтами связывания , хотя они не обязательно перекрываются с сайтами связывания лигандов и не обязательно должны каким-либо образом иметь отношение к нормальной функции белка. Очень большие молекулы могут иметь несколько эпитопов, каждый из которых распознается отдельным антителом.
эргономичный: См . полисома .
эухроматин: Относительно открытая, слегка уплотненная форма хроматина , в которой ДНК лишь спорадически связывается с нуклеосомами и, таким образом, широко доступна для связывания и манипуляций со стороны белков и других молекул. Эухроматиновые области генома часто обогащены генами и активно подвергаются транскрипции , в отличие от гетерохроматина , который относительно беден генами, богат нуклеосомами и менее доступен для транскрипционного аппарата.
эуплоидия: Состояние клетки или организма, имеющего аномальное количество полных наборов хромосом , возможно, исключая половые хромосомы . Эуплоидия отличается от анеуплоидии , при которой клетка или организм имеет аномальное количество одной или нескольких конкретных отдельных хромосом.
эволюция: Изменение наследственных характеристик биологических популяций на протяжении последующих поколений. В самом традиционном смысле это происходит путем изменения частот аллелей популяции в генофонде .
ex vivo: Происходящий вне клетки или организма, например, наблюдения или эксперименты, проводимые в клетках или тканях или над ними , которые были изолированы или удалены из их естественного контекста во внешнюю среду (обычно тщательно контролируемую среду с минимальным изменением естественных условий, например, культура клеток , выращиваемая в лаборатории). Это контрастирует с наблюдениями in vivo , которые проводятся в совершенно естественном контексте.
иссечение: Ферментативное удаление полинуклеотидной последовательности из одной или нескольких нитей нуклеиновой кислоты или полипептидной последовательности из белка , обычно подразумевающее как разрыв полимерной молекулы в двух местах, так и последующее воссоединение двух точек разрыва после последовательности между их удалили. Этот термин можно использовать для описания широкого спектра процессов, выполняемых различными ферментами, включая большинство сплайсинга и репарации ДНК . путей ^[4]
экзоцитоз: Любой активный транспортный процесс, посредством которого вещество секретируется из клетки или выводится из нее , пересекая плазматическую мембрану изнутри клетки во внеклеточное пространство , особенно тот, который происходит путем слияния мембраны, окружающей секреторный пузырь , с более крупным клеточная мембрана. Это слияние приводит к слиянию внутривезикулярного пространства с внеклеточной жидкостью, высвобождая содержимое пузырька на внешнюю сторону клетки, не подвергая его воздействию гидрофобного пространства между липидным бислоем . В более узком смысле этот термин может относиться, в частности, к массовому транспорту большого количества молекул из клетки одновременно, часто метаболитов или гормонов, которые слишком велики и полярны, чтобы самостоятельно пассивно диффундировать через мембрану. Обратный процесс, при котором материалы внедряются в клетку, известен как эндоцитоз .
экзом: Полный набор экзонов в пределах конкретного генома , включая нетранслируемые области зрелых мРНК, а также кодирующие области .
экзон: Любая часть гена , которая кодирует часть окончательной зрелой информационной РНК, продуцируемой этим геном после интронов удаления путем альтернативного сплайсинга . Этот термин относится как к последовательности, существующей внутри молекулы ДНК, так и к соответствующей последовательности в транскриптах РНК.
пропуск экзона
экзонуклеаза: Любой фермент , активность которого заключается в расщеплении фосфодиэфирных связей внутри цепи нуклеотидов , включая те, которые расщепляются только при распознавании определенной последовательности (так называемые экзонуклеазы рестрикции ). Экзонуклеазы разрезают либо 3'-, либо 5'-конец последовательности (а не посередине, как у эндонуклеаз ).
экзосома: 1. ( белковый комплекс ) Внутриклеточный мультибелковый комплекс, который выполняет функцию расщепления различных типов молекул РНК .; 2. ( везикула ) Тип мембраносвязанной внеклеточной везикулы, образующийся во многих эукариотических клетках путем отпочкования эндосомы внутрь и последующего слияния эндосомы с плазматической мембраной , вызывающий высвобождение везикулы в различные внеклеточные пространства, в том числе биологические. жидкости, такие как кровь и слюна, где они могут выполнять любую из самых разнообразных физиологических функций, от удаления отходов до межклеточной передачи сигналов.
экзосомный комплекс: Внутриклеточный мультибелковый комплекс, выполняющий функцию расщепления различных типов молекул РНК .
вектор выражения: Тип вектора , обычно плазмидный или вирусный вектор , разработанный специально для экспрессии трансгенной как вставки в клетке-мишени, а не для каких-либо других целей, таких клонирование .
экстейн: Любая часть аминокислотной последовательности , которая сохраняется в полипептиде- предшественнике , т.е. не вырезается в результате посттрансляционного сплайсинга белка и, следовательно, присутствует в зрелом белке , аналогично экзонам транскриптов РНК. Контрастный интеин .
расширение: См . удлинение .
внеклеточный: Вне плазматической мембраны клетки или клеток ; т.е. расположены или происходят снаружи клетки. Контраст внутриклеточный ; см. также межклеточные .
внеклеточный матрикс (ECM): Сеть взаимодействующих макромолекул и минералов, секретируемых и существующих снаружи и между клетками в многоклеточных структурах, таких как ткани и биопленки , образующая гидратированную, сетчатую, полутвердую суспензию, которая не только удерживает клетки вместе организованным образом, но и обеспечивает структурную и биохимическую поддержку, действуя как эластичный, сжимаемый буфер против внешних стрессов, а также регулируя и влияя на многочисленные аспекты поведения клеток, в том числе клеточную адгезию , подвижность , метаболизм , деление и межклеточную связь . Состав и свойства ЕСМ сильно различаются в зависимости от организма и типа ткани, но обычно он имеет форму полисахаридного геля , в который различные волокнистые белки (особенно коллаген и эластин ), ферменты и гликопротеины встроены . Сами клетки одновременно производят компоненты матрикса и постоянно реагируют на состав локального матрикса, что является источником обратной связи с окружающей средой, которая имеет решающее значение для дифференцировки. , организация и развитие тканей. ^[11]^[19]
внехромосомная ДНК: Любая ДНК , которая не содержится в хромосомах или ядре клетки и, следовательно, не является геномной ДНК . Это может включать ДНК, содержащуюся в плазмидах или органеллах, таких как митохондрии или хлоропласты , или, в самом широком смысле, ДНК, введенную вирусной инфекцией . Внехромосомная ДНК обычно демонстрирует значительные структурные отличия от ядерной ДНК в том же организме.

Ф

факультативное выражение: Транскрипция только по гена , мере необходимости, в отличие от конститутивной экспрессии при которой ген транскрибируется непрерывно. Ген, который транскрибируется по мере необходимости, называется факультативным геном .
жирная кислота
ферментация
филоподий
сигнал найди меня: Молекула, выходящая на поверхность клетки, предназначенная для апоптоза , которая используется для привлечения фагоцитов для поглощения и уничтожения клетки путем фагоцитоза . См. также сигнал «Съешь меня» .
пятипростая кепка: См. крышку 5 футов .
пятипростой конец: См. 5'-конец .
пятизначная непереведенная область: См. 5' нетранслируемую область .
фиксация: 1. ( гистология ) Сохранение биологического материала путем обработки его химическим фиксатором , который предотвращает или замедляет естественные посмертные процессы распада (например, аутолиз и гниение ), которые в противном случае в конечном итоге привели бы к потере клеток, тканей и биомолекул их характерных структур и характеристики. Биологические образцы обычно фиксируются с широкой целью остановить или замедлить биохимические реакции на время, достаточное для их детального изучения, по существу «замораживая» клеточные процессы в их естественном состоянии в определенный момент времени, сводя при этом к минимуму нарушение существующих структур и механизмов. все это может улучшить последующее окрашивание и микроскопию фиксированных образцов. Хотя фиксация имеет тенденцию необратимо прекращать любые текущие реакции, тем самым убивая фиксированные клетки, она позволяет получить информацию о молекулярных деталях, которые происходят слишком быстро или кратковременно, чтобы их можно было изучать на живых образцах. Обычные фиксаторы, такие как формальдегид, действуют, отключая протеолитические ферменты, коагулирующие и денатурирующие макромолекулы, создающие поперечные связи между ними и защищающие образцы от разложения бактериями и грибами.; 2. ( популяционная генетика ) Процесс, при котором одной аллели определенного гена с множеством различных аллелей увеличивается частота в данной популяции, так что она становится навсегда единственной аллелью в этом локусе популяции в генофонде .
фиксатор
жгутиковый: (клетки) Имеющий один или несколько жгутиков .
жгутик
флуоресцентная гибридизация in situ (FISH)
передовая генетика: Экспериментальный подход в молекулярной генетике , при котором исследователь начинает с определенного известного фенотипа и пытается определить генетическую основу этого фенотипа с помощью любого из множества лабораторных методов, обычно путем индукции случайных мутаций в геноме организма и последующего скрининга изменений в геноме организма. интересующий фенотип. Предполагается, что наблюдаемые фенотипические изменения являются результатом мутации(й), присутствующих в проверенном образце, которые затем могут быть сопоставлены с конкретными геномными локусами и, в конечном счете, с одним или несколькими конкретными генами-кандидатами . Эта методология контрастирует с обратной генетикой , в которой конкретным геном или его генным продуктом манипулируют индивидуально, чтобы определить функцию гена.
прямая мутация
мутация сдвига рамки: Тип мутации в последовательности нуклеиновой кислоты, вызванный вставкой или удалением ряда нуклеотидов , не кратного трем. Из-за триплетной природы, с помощью которой нуклеотиды кодируют аминокислоты, мутация такого типа вызывает сдвиг рамки считывания нуклеотидной последовательности, в результате чего последовательность кодонов после места мутации полностью отличается от исходной.
сублимационная сушка: См. лиофилизацию .
Общество данных функциональной геномики (FGED): Организация, которая работает вместе с другими «над разработкой стандартов качества, аннотирования и обмена данными биологических исследований», а также программных инструментов, облегчающих их использование. ^[20]

Г

G-полоска: Метод, используемый в цитогенетике для получения видимого кариотипа путем окрашивания конденсированных хромосом красителем Гимзы . Окрашивание создает последовательные и узнаваемые узоры из темных и светлых «полос» в областях хроматина , что позволяет легко различать определенные хромосомы.
Г1
G2
гамета: Гаплоидная клетка , представляющая собой мейотический предшественника продукт зародышевой клетки- и конечный продукт зародышевой линии у многоклеточных организмов, размножающихся половым путем . Гаметы — это средство, с помощью которого организм передает свою генетическую информацию потомству; при оплодотворении две гаметы (по одной от каждого родителя) сливаются в одну диплоидную зиготу .
гаметогенез
GC-контент: См. содержание гуанина-цитозина .
гДНК: См. геномную ДНК .
ген: Любой сегмент или набор сегментов молекулы нуклеиновой кислоты , который содержит информацию, необходимую для РНК контролируемого производства функционального транскрипта . В живых организмах гены часто считаются фундаментальными единицами наследственности и обычно закодированы в ДНК . У конкретного гена может быть несколько различных версий или аллелей , и один ген может привести к образованию генного продукта , который влияет на множество различных фенотипов .
генная кассета: Смотри кассету .
дозировка гена: Число копий определенного гена, присутствующего в геноме . Дозировка генов напрямую влияет на количество генного продукта, которое клетка способна экспрессировать, хотя появились различные средства контроля, которые жестко регулируют экспрессию генов . Изменения в дозировке генов, вызванные мутациями, включают изменения числа копий .
дупликация генов: Тип мутации , определяемый как любое дублирование участка ДНК , содержащего ген . Сравните хромосомную дупликацию .
экспрессия генов: Набор процессов, с помощью которых информация, закодированная в гене, используется в синтезе продукта гена , такого как белок или некодирующая РНК , или иным образом становится доступной для воздействия на один или несколько фенотипов . Канонически первым шагом является транскрипция , в результате которой образуется молекула информационной РНК, комплементарная молекуле ДНК , в которой кодируется ген; для генов, кодирующих белок, вторым этапом является трансляция , при которой информационная РНК считывается рибосомой с образованием белка . Однако информация, содержащаяся в последовательности ДНК, не обязательно должна быть транскрибирована и транслирована, чтобы оказать влияние на молекулярные события; более широкие определения охватывают огромное количество других способов выражения генетической информации.
Омнибус экспрессии генов (GEO): База данных высокопроизводительной функциональной геномики и данных об экспрессии генов , полученных на основе экспериментальных чипов и секвенирования нового поколения и управляемая Национальным центром биотехнологической информации . ^[21]^[22]
слияние генов: Объединение, либо путем естественной мутации, либо с помощью рекомбинантных лабораторных методов, двух или более ранее независимых генов, которые кодируют разные генные продукты, так что они становятся объектом контроля со стороны одних и тех же регуляторных систем. Полученная гибридная последовательность известна как слитый ген . ^[4]
картирование генов: Любой из множества методов, используемых для точного определения местоположения конкретного гена в молекуле ДНК (например, хромосомы) и/или физических расстояний или расстояний сцепления между ним и другими генами.
интересующий ген (GOI): Ген , изучаемый в ходе научного эксперимента, особенно такого, который является предметом такого метода генной инженерии, как клонирование .
генный продукт: Любой биохимический материал, образующийся в результате экспрессии гена , белок чаще всего интерпретируется как функциональный транскрипт мРНК, полученный в результате транскрипции гена, или полностью сконструированный , полученный в результате трансляции транскрипта, хотя некодирующие молекулы РНК, такие как транспортные РНК, могут также можно считать генными продуктами. Измерение количества данного генного продукта, обнаруживаемого в клетке или ткани, иногда используется для вывода о том, насколько активен соответствующий ген.
регуляция генов: Широкий спектр механизмов, используемых клетками для контроля активности своих генов, особенно для разрешения, запрета, увеличения или уменьшения производства или экспрессии определенных генных продуктов , таких как РНК или белки . Генная регуляция повышает универсальность и адаптивность организма, позволяя его клеткам экспрессировать различные генные продукты, когда этого требуют изменения в окружающей среде. В многоклеточных организмах регуляция экспрессии генов также стимулирует клеточную дифференцировку и морфогенез у эмбриона , что позволяет создавать разнообразные типы клеток из одного и того же генома .
подавление генов: Любой механизм регуляции генов , который резко снижает или полностью предотвращает экспрессию определенного гена. Замалчивание генов может происходить естественным образом во время транскрипции или трансляции . Лабораторные методы часто используют естественные механизмы молчания для достижения нокдауна генов .
генная терапия: Вставка функционального гена или гена дикого типа или части гена в организм (особенно пациента) с целью исправления генетического дефекта либо путем прямой замены дефектного гена, либо путем добавления второй функциональной версии. ^[14]
ловушка генов: Высокопроизводительная технология , используемая для одновременной инактивации, идентификации и сообщения об экспрессии целевого гена в геноме млекопитающих путем введения инсерционной мутации, состоящей из беспромоторного репортерного гена и/или селектируемого генетического маркера, фланкированного вышестоящим сайтом сплайсинга и нижележащая полиаденилированная терминирующая последовательность.
поколение: 1. В любом данном организме - единый репродуктивный цикл или фаза между двумя последовательными репродуктивными событиями, т. е. между воспроизводством отдельного организма и потомством этого воспроизводства; или фактическая или средняя продолжительность времени, необходимая для завершения одного репродуктивного цикла, либо для конкретной линии , либо для популяции или вида в целом.; 2. В данной популяции - те особи (часто, но не обязательно, живущие одновременно), которые в равной степени удалены от данного общего предка в силу одинакового числа репродуктивных событий, произошедших между ними и этим предком. ^[14]
генетический фон
генетический код: Набор правил, по которым информация, закодированная в нуклеиновых кислотах преобразуется , в белки живыми клетками . Эти правила определяют, как последовательности триплетов нуклеотидов , называемые кодонами, определяют, какая аминокислота будет добавлена следующей во время синтеза белка . Подавляющее большинство живых организмов используют один и тот же генетический код (иногда называемый «стандартным» генетическим кодом ), но варианты кодов . существуют
генетическое заболевание: организма Любая болезнь, заболевание или другая проблема со здоровьем, непосредственно вызванная одним или несколькими аномалиями в геноме , которые являются врожденными (присутствующими при рождении) и не приобретенными в более позднем возрасте. Причины могут включать мутацию одного или нескольких генов или хромосомную аномалию , например анеуплоидию определенной хромосомы. Ответственная мутация может возникнуть спонтанно во время эмбрионального развития или может быть унаследована от одного или обоих родителей, и в этом случае генетическое нарушение также классифицируется как наследственное заболевание . Хотя сама аномалия присутствует еще до рождения, фактическое заболевание, которое она вызывает, может развиться гораздо позже в жизни; некоторые генетические нарушения не обязательно гарантируют возможное заболевание, а просто увеличивают риск его развития.
генетическая дистанция: Мера генетического расхождения между видами, популяциями внутри вида или особями, используемая особенно в филогенетике для выражения либо времени, прошедшего с момента существования общего предка , либо степени дифференциации последовательностей ДНК , составляющих геномы каждой популяции, или индивидуальный.
генная инженерия: организма с использованием любого из множества биотехнологических методов, включая вставку или удаление генов Прямые, преднамеренные манипуляции с генетическим материалом , перенос генов внутри вида и между видами, мутацию существующих последовательностей и создание новых последовательностей с использованием искусственных синтез генов . Генная инженерия включает в себя широкий набор технологий, с помощью которых генетический состав отдельных клеток, тканей или целых организмов может быть изменен для различных целей, обычно для изучения функций и экспрессии отдельных генов, для производства гормонов, вакцин и других лекарства, а также создавать генетически модифицированные организмы для использования в исследованиях и сельском хозяйстве.
генетический маркер: Специфический, легко идентифицируемый и обычно высокополиморфный ген или другая ДНК последовательность с известным расположением на хромосоме , которая может быть использована для идентификации человека или вида, обладающих им.
генетическая рекомбинация: Любая рекомбинация или обмен генетическим материалом внутри отдельного организма или между особями одного и того же или разных видов, особенно тот, который создает генетическую изменчивость . В самом широком смысле этот термин охватывает разнообразный класс естественных механизмов, с помощью которых последовательности нуклеиновых кислот копируются или физически переносятся в различные генетические среды, включая гомологичную рекомбинацию во время мейоза или митоза или как нормальную часть репарации ДНК ; события горизонтального переноса генов , такие как бактериальная конъюгация , вирусная трансдукция или трансформация ; или ошибки в репликации ДНК или делении клеток. Искусственная рекомбинация занимает центральное место во многих методах генной инженерии , позволяющих производить рекомбинантную ДНК .
генетическая избыточность: Избыточное кодирование двух или более различных генных продуктов , которые в конечном итоге выполняют одну и ту же биохимическую функцию. Мутации в одном из этих генов могут оказывать меньшее влияние на приспособленность, чем можно было бы ожидать, поскольку избыточные гены часто компенсируют любую потерю функции и устраняют любое ее усиление .
генетическая регуляторная сеть (GRN): График , показывающий сложность регуляции экспрессии генов . Вершины (узлы) представлены различными регуляторными элементами и продуктами генов , а ребра (связи) представлены их взаимодействиями. Эти сетевые структуры также представляют функциональные отношения, аппроксимируя скорость, с которой транскрибируются гены .
генетическое тестирование: Широкий класс различных процедур, используемых для выявления особенностей конкретных хромосом, генов или белков человека с целью определения происхождения или происхождения , диагностики уязвимости к наследственным заболеваниям или обнаружения мутантных аллелей, связанных с повышенным риском развития генетических нарушений . Генетическое тестирование широко используется в медицине, сельском хозяйстве и биологических исследованиях.
генетически модифицированный организм (ГМО): Любой организм, генетический материал которого был изменен с помощью методов генной инженерии , особенно таким образом, который не происходит естественным образом в результате спаривания или естественной генетической рекомбинации .
генетика: Область биологии , изучающая гены , генетические вариации и наследственность живых организмов.
геном: Полный набор генетического материала, содержащегося в хромосомах организма, органеллы или вируса . Этот термин также используется для обозначения коллективного набора генетических локусов, общих для каждого члена популяции или вида, независимо от различных аллелей , которые могут присутствовать в этих локусах у разных людей.
нестабильность генома
размер генома: Общее количество ДНК , содержащееся в одной копии генома , обычно измеряется по массе (в пикограммах или дальтонах ) или по общему количеству пар оснований (в килобазах или мегабазах ). Для диплоидных организмов размер генома часто используется как синоним C-значения .
полногеномное исследование ассоциаций (GWAS)
геномная ДНК (гДНК): ДНК , содержащаяся в хромосомах , в отличие от внехромосомной ДНК, содержащейся в отдельных структурах, таких как плазмиды или органеллы, такие как митохондрии или хлоропласты .
геномный импринтинг: Эпигенетическое . вызывающее генов экспрессию явление , способом, зависящим от конкретного родителя, от которого этот ген был унаследован Это происходит, когда эпигенетические метки, такие как метилирование ДНК или гистонов, устанавливаются или «впечатываются» в зародышевые клетки родительского организма и впоследствии сохраняются посредством клеточных делений в соматических клетках потомства организма; в результате ген в потомстве, унаследованный от отца, может экспрессироваться иначе, чем другая копия того же гена, унаследованная от матери.
геномный остров (GI): Область генома , в которой наблюдаются признаки горизонтального переноса от другого организма. Этот термин используется, в частности, при описании микробных геномов, таких как геномы бактерий, где геномные острова, имеющие одинаковые или похожие последовательности, обычно встречаются у видов или штаммов, которые в остальном имеют лишь отдаленное родство, подразумевая, что они не перешли через вертикальное происхождение от общего. предка, но посредством некоторой формы латерального переноса, такой как конъюгация . Эти островки часто содержат функциональные гены, которые придают адаптивные свойства, такие как устойчивость к антибиотикам .
геномика: Междисциплинарная область, изучающая структуру, функции, эволюцию, картирование и редактирование целых геномов , а не отдельных генов .
генотоксичность: Способность некоторых химических агентов вызывать повреждение генетического материала внутри живой клетки (например, посредством одно- или двухцепочечных разрывов, сшивания или точечных мутаций ), что может привести или не привести к постоянной мутации . Хотя все мутагены генотоксичны, не все генотоксичные соединения являются мутагенными.
генотип: Полный набор аллелей конкретного человека присутствует в геноме , что приводит к его фенотипу .
генотипирование: Процесс определения различий в генотипе человека путем изучения последовательностей ДНК человека в геноме с помощью биологических анализов и сравнения их с последовательностями другого человека или эталонной последовательностью.
зародышевая клетка: Любая клетка , дающая начало гаметам организма , размножающегося половым путем . Зародышевые клетки — это сосуды для генетического материала, который в конечном итоге будет передан потомкам организма, и их обычно отличают от соматических клеток , которые полностью отделены от зародышевой линии .
зародышевая линия: 1. В многоклеточных организмах - субпопуляция клеток, которые способны передавать свой генетический материал потомству организма и поэтому (по крайней мере теоретически) отличаются от соматических клеток , которые не могут передавать свой генетический материал кроме своей собственной непосредственной митотической дочерней клетки . клетки. Клетки зародышевой линии называются половыми клетками .; 2. Линия зародышевых клеток, охватывающая многие поколения и содержащая генетический материал, переданный человеку от его предков.
гигабаза (Гб): Единица длины нуклеиновой кислоты , равная одному миллиарду (1 × 10 ⁹) оснований в одноцепочечных молекулах или один миллиард пар оснований в дуплексных молекулах, таких как двухцепочечная ДНК .
глюкогенная аминокислота: Любая аминокислота , которая может быть преобразована в глюкозу посредством глюконеогенеза , в отличие от кетогенных аминокислот , которые могут быть преобразованы в кетоновые тела. У человека 18 из 20 аминокислот являются глюкогенными; только лейцин и лизин не являются таковыми. Пять аминокислот ( фенилаланин , изолейцин , треонин , триптофан и тирозин ) являются как глюкогенными, так и кетогенными.
глюконеогенез (ГНГ): Цепь метаболических реакций, приводящая к образованию глюкозы из некоторых неуглеводных углеродных субстратов, включая глюкогенные аминокислоты . Это один из двух основных путей, используемых большинством животных для поддержания уровня сахара в крови (второй — гликогенолиз ), особенно в периоды голодания, голодания и интенсивных физических упражнений.
глюкоза
гликоген
гликогенолиз
гликолипиды: Любой подкласс липидов , состоящий из центральной полярной молекулы (чаще всего глицерина или сфингозина ), которая ковалентно присоединена к одному или нескольким моносахаридам или олигосахаридам посредством гликозидных связей , а также к одной или нескольким длинным неполярным цепям жирных кислот . ^[6] Гликолипиды являются одним из трех основных типов мембранных липидов, входящих во все биологические мембраны, наряду с фосфолипидами и холестерином .
гликолиз: Метаболический путь , в котором углеводные сахара, такие как глюкоза, расщепляются на более простые молекулы, высвобождая химическую энергию, которая затем может быть использована для различных клеточных функций. В серии из десяти ферментативно-катализируемых реакций каждая молекула глюкозы превращается в две молекулы пирувата , причем освобождающаяся при этом свободная энергия одновременно используется для образования высокоэнергетических связей в двух молекулах восстановленного никотинамидадениндинуклеотида (НАДН). и две молекулы аденозинтрифосфата (АТФ). В аэробных условиях пируват и НАДН дополнительно окисляются в митохондриях ; в анаэробных условиях НАДН сам впоследствии восстанавливает пируват до лактата .
гликопротеин: Белок молекулами с одной или несколькими углеводов , обычно с короткими олигосахаридными цепями, ковалентно присоединенными к одной или нескольким боковым цепям аминокислот. ^[6] Белки, которые экспонируются на внешней поверхности плазматической мембраны или секретируются во внеклеточное пространство, обычно гликозилируются таким способом.
гликозид: Любое химическое соединение, в котором молекула углевода ковалентно связана с другой молекулой, содержащей гидроксильную группу (включая другие углеводы), посредством одной или нескольких C–O гликозидных связей . Когда обе молекулы представляют собой углеводы, гликозид представляет собой дисахарид или полисахарид . ^[11]
гликозидная связь
гликозилирование: Присоединение олигосахарида ( например, глюкозы ) к остатку аспарагина в пептиде или белке путем ковалентной связи, процесс, который происходит в шероховатой эндоплазматической сети или вблизи нее . ^[11]
Коробка Гольдберга-Хогнесса: См. вставку ТАТА .
Аппарат Гольджи
гРНК: См . руководство РНК .
гуанин ( G ): Пуриновое в нуклеиновое основание, используемое в качестве одного из четырех стандартных нуклеиновых оснований как в молекулах ДНК , так и РНК . Гуанин образует пару оснований с цитозином .
содержание гуанина-цитозина: Доля азотистых оснований в нуклеиновой кислоте , которые представляют собой гуанин ( G ) или цитозин ( C ), обычно выражается в процентах. Молекулы ДНК и РНК с более высоким содержанием GC обычно более термостабильны , чем молекулы с более низким содержанием GC, из-за молекулярных взаимодействий, которые происходят во время укладки оснований. ^[23]
гуанозин ( G , Го): Один из четырех стандартных нуклеозидов, используемых в молекулах РНК , состоящий из гуанинового основания которого _{N 9} , азот связан C ₁ с углеродом сахара рибозы . Гуанин, связанный с дезоксирибозой , известен как дезоксигуанозин , версия, используемая в ДНК .
направляющая РНК (гРНК)

ЧАС

шпилька: См. стебель-петля .
гаплоидный: (клетки или организма) Наличие одной копии каждой хромосомы , причем каждая копия не является частью пары. Сравните диплоид и полиплоид .
Предел Хейфлика
геликаза: Любой представитель класса АТФ -зависимых моторных белков , которые направленно движутся вдоль ДНК основной цепи и катализируют разделение двух комплементарных цепей двухцепочечных . молекул, обеспечивая выполнение широкого спектра жизненно важных процессов, например, транскрипции , репликации и репарации . ^[14]
гемизиготный: В диплоидном организме имеется только один аллель в данном генетическом локусе (обычно их два). Гемизиготность может наблюдаться, когда в обычно диплоидной клетке или организме присутствует только одна копия хромосомы , или когда сегмент хромосомы, содержащий одну копию аллеля, удален , или когда ген расположен на половой хромосоме в гетерогаметном организме. пол (при котором половые хромосомы не существуют в совпадающих парах); например, у мужчин с нормальными хромосомами почти все Х-сцепленные гены называются гемизиготными, поскольку имеется только одна Х-хромосома существует лишь несколько таких же генов , а на Y-хромосоме .
наследственность: Хранение, передача и выражение молекулярной информации в биологических организмах. ^[14] проявляется в передаче фенотипических признаков от родителей к потомству как путем полового , так и бесполого размножения . Говорят, что потомственные клетки или организмы наследуют генетическую информацию своих родителей.
гетерохроматин
гетерохромосома: См . аллосома .
гетеродимер: Белок состоящий или белковый домен, из двух разных полипептидов , спаренных друг с другом в четвертичной структуре мультимерного комплекса. ^[4] Контрастный гомодимер .
гетерогенная ядерная РНК (hnRNA)
гетерокарион: Многоядерная клетка , содержащая ядра с разными генотипами, образующаяся в результате слияния двух или более генетически различных клеток либо естественным путем (например, при определенных типах полового размножения ), либо искусственно (например, при генной инженерии ). ^[11]
гетерологическое выражение: Экспрессия или любой другой чужеродной последовательности ДНК в организме-хозяине , чужеродного гена который в природе не содержит тот же ген. Вставка чужеродных трансгенов в гетерологичных хозяев с использованием рекомбинантных векторов является распространенным биотехнологическим методом изучения структуры и функции генов.
гетерозиготный: В диплоидном организме имеется два разных аллеля в одном генетическом локусе . В сокращении генетики гетерозиготные генотипы представлены парой несовпадающих букв или символов, часто прописной буквой (обозначающей доминантный аллель) и строчной буквой (обозначающей рецессивный аллель), например «Aa» или «Bb». Контраст гомозиготный .
высокая пропускная способность
гистология: Изучение или анализ микроскопической анатомии биологических тканей или клеток внутри тканей, в частности, с использованием специализированных методов для различения структур и функций на основе визуальной морфологии и дифференциального окрашивания. На практике этот термин иногда используется в более широком смысле и включает в себя цитологию .
гистон: Любой представитель класса высокощелочных белков , отвечающих за упаковку ядерной ДНК в структурные единицы, называемые нуклеосомами в эукариотических клетках. Гистоны являются основными белковыми компонентами хроматина , где они объединяются в восьмичленные комплексы , которые действуют как «катушки», вокруг которых наматывается линейная молекула ДНК. Они играют важную роль в генов регуляции и экспрессии .
гистоновое ядро: Комплекс из восьми белков- гистонов , вокруг которых двухцепочечная ДНК обертывается внутри нуклеосомы . Канонический октамер гистонов состоит из двух гистонов H2A , H2B , H3 и H4 , которые соединяются друг с другом симметрично, образуя шарообразный кластер, вокруг которого ДНК обвивается посредством взаимодействия с поверхностными доменами гистонов , хотя варианты гистонов могут заменять их. их аналоги в определенных контекстах.
модификация гистонов
вариант гистонов
гнРНК: См. гетерогенная ядерная РНК .
голоцентрический: (линейной хромосомы или фрагмента хромосомы) Не имеет единой центромеры , а имеет несколько мест сборки кинетохор, рассредоточенных по всей длине хромосомы. При делении клеток хроматиды голоцентрических хромосом расходятся параллельно и не образуют классических V-образных структур, типичных для моноцентрических хромосом.
гомеобокс: Любой класс последовательностей ДНК длиной около 180 пар оснований, встречающийся вблизи 3'-конца определенных эукариотических генов и кодирующий домен из 60 аминокислот , который способен связываться с ДНК или РНК посредством характерного мотива спираль-поворот-спираль. в белках, содержащих его. Гены, содержащие гомеобокс, транслируются в белки, содержащие гомеодомен, которые обычно регулируют транскрипцию или трансляцию путем связывания с другими генами или информационными РНК, содержащими специфические элементы, чувствительные к гомеобоксу . Продукты многих гомеозисных генов, примером которых являются Hox-гены , имеют решающее значение в путях развития. ^[4]
Адаптивный элемент гомеобокса (HRE): ДНК или РНК Любая последовательность , которая специфически распознается и связывается гомеодоменом белка , содержащего гомеодомен.
гомеодомен: Тип домена, связывающего нуклеиновую кислоту , обычно 60 аминокислот длиной , обнаруженный в некоторых эукариотических белках , характеризующийся высококонсервативным мотивом -поворот-спираль спираль , который с сильным сродством связывается с основной цепью специфических последовательностей распознавания в молекулах ДНК или РНК. . Белок может иметь один или несколько гомеодоменов, обычно расположенных ближе к С-концу содержащего его полипептида. Многие гомеодомен-содержащие белки действуют как факторы транскрипции, связываясь с последовательностями внутри промоторов и блокируя или привлекая другие белки, такие как РНК-полимераза , в комплекс инициации транскрипции . Гомеодомены — это переведенные версии гомеобоксов , хотя эти термины часто используются как синонимы.
гомодимер: Белок состоящий или белковый домен, из двух идентичных полипептидов , спаренных друг с другом в четвертичной структуре мультимерного комплекса. ^[4] Контрастный гетеродимер .
гомологичные хромосомы: Набор из двух совпадающих хромосом , одной материнской и одной отцовской, которые соединяются друг с другом внутри ядра во время мейоза . Они имеют одинаковые гены в одних и тех же локусах , но могут иметь разные аллели .
гомологичная рекомбинация: Тип генетической рекомбинации , при которой происходит обмен нуклеотидными последовательностями между двумя сходными или идентичными («гомологичными») молекулами ДНК , особенно той, которая происходит между гомологичными хромосомами . Этот термин может относиться к рекомбинации, которая происходит как часть любого из ряда различных клеточных процессов, чаще всего восстановления ДНК или хромосомного кроссовера во время мейоза у эукариот и горизонтального переноса генов у прокариот. Контрастная негомологичная рекомбинация .
гомозиготный: В диплоидном организме имеется два идентичных аллеля в данном генетическом локусе . В генетике гомозиготные генотипы обозначаются парой совпадающих букв или символов, таких как «АА» или «аа». Контраст гетерозиготный .
горизонтальный перенос генов (HGT): Любой процесс, посредством которого генетический материал передается между одноклеточными и/или многоклеточными организмами, кроме вертикальной передачи от родителя к потомству, например бактериальная конъюгация .
ген домашнего хозяйства: Любой конститутивный ген , который транскрибируется на относительно постоянном уровне во многих или всех известных состояниях и типах клеток. Продукты генов домашнего хозяйства обычно играют решающую роль в поддержании целостности клеток и основных метаболических функций. Обычно предполагается, что на их экспрессию не влияют экспериментальные или патологические условия.
Hox-гены: Подмножество высококонсервативных гомеобокс - содержащих генов , которые необходимы для правильной организации строения тела у развивающихся эмбрионов животных, гарантируя формирование правильных структур в правильных местах. Hox-гены обычно располагаются на хромосоме в виде тандемных массивов и экспрессируются последовательно во время развития, причем последовательность активации генов соответствует их физическому расположению внутри генома и/или физическому расположению тканей, в которых они экспрессируются, вдоль передней части организма. – задняя ось. ^[4]
Проект генома человека (HGP): Совместный международный научно-исследовательский проект с целью секвенирования всей хромосомной ДНК , идентификации и картирования всех генов в клетках человека и, в конечном итоге, создания полного эталонного генома человеческого вида. Проект был запущен в 1990 году консорциумом федеральных агентств, университетов и исследовательских институтов и был объявлен завершенным в 2003 году. Поскольку каждый отдельный человек имеет уникальный геном, готовый эталонный геном представляет собой мозаику последовательностей , полученных путем отбора образцов ДНК из тысяч людей по всему миру и не представляет какого-либо отдельного человека.
гиалоплазма: См . цитозоль .
гибридный: Потомство , возникающее в результате объединения качеств двух организмов разных родов , видов , пород или разновидностей путем полового размножения . Гибриды могут возникать естественным или искусственным путем, например, при селекции домашних животных и растений. Репродуктивные барьеры обычно предотвращают гибридизацию между отдаленно родственными организмами или, по крайней мере, гарантируют, что гибридное потомство будет стерильным, но плодовитые гибриды могут привести к видообразованию .
гибридизация: 1. Процесс получения гибридного организма из двух организмов разных родов, видов, пород или разновидностей.; 2. Процесс, при котором две или более одноцепочечные молекулы нуклеиновой кислоты с комплементарными нуклеотидными последовательностями спариваются друг с другом в растворе, образуя двухцепочечные или трехцепочечные молекулы посредством образования водородных связей между комплементарными нуклеиновыми основаниями каждой цепи. В некоторых лабораторных условиях, особенно в тех, в которых длинные цепи гибридизуются с короткими олигонуклеотидными праймерами , гибридизацию часто называют отжигом .; 3. Этап некоторых экспериментальных анализов, на котором препарат одноцепочечной ДНК или РНК добавляется к поверхности массива и отжигается с комплементарным зондом гибридизации .
гибридизационный зонд
гидрофильный: Растворимы или имеют сродство к ней в воде или других полярных соединениях ; описание полярной молекулы или фрагмента или функциональной группы внутри молекулы, которая участвует в межмолекулярных взаимодействиях, таких как образование водородных связей с другими полярными молекулами, и поэтому легко растворяется в полярных растворителях, таких как вода или водные растворы . ^[6] В отличие от гидрофобных соединений, гидрофильные соединения могут образовывать энергетически выгодные контакты с водной фазой биологических жидкостей и поэтому часто могут быть суспендированы непосредственно в цитозоле или находиться во внеклеточном пространстве. ^[12] Вместе контрастирующие свойства гидрофильности и гидрофобности играют важную роль в определении структурных конформаций и функций большинства биомолекул .
гидрофобный: Иметь низкую растворимость или сродство к воде или другим полярным растворителям; описывающее неполярную молекулу, фрагмент или функциональную группу внутри молекулы, которая не может образовывать энергетически выгодные взаимодействия с полярными соединениями и, следовательно, имеет тенденцию «избегать» или отталкиваться от таких соединений, вместо этого группируясь вместе с другими гидрофобными молекулами или организуя себя таким образом, чтобы свести к минимуму воздействие на полярное окружение. Это явление обусловлено не столько сродством гидрофобных молекул друг к другу, сколько следствием сильных межмолекулярных сил, которые позволяют полярным соединениям, таким как молекулы воды, связываться друг с другом; гидрофобные виды не способны образовывать альтернативные связи эквивалентной прочности с полярными соединениями, поэтому они имеют тенденцию исключаться из водных растворов из-за тенденции полярного растворителя максимизировать взаимодействие с самим собой. Гидрофобность является основным фактором, определяющим бесчисленные химические взаимодействия в биологических системах, включая пространственные взаимодействия. конформации, принимаемые макромолекулами, такими как белки и липиды , связывание лигандов и субстратов с белками, а также структура и свойства липидных мембран . ^[11]^[6] Контраст гидрофильный .
гипертонический
гипоморф: Мутантный аллель , который обеспечивает субнормальную экспрессию нормального фенотипа гена, например, путем кодирования нестабильного фермента, который слишком быстро деградирует, чтобы полностью выполнять свою функцию, но который, тем не менее, функционален в некоторых ограниченных возможностях, образуясь в количествах, достаточных для медленного протекания его реакции. или на низком уровне. ^[4]
гипотонический
гипоксантин ( я ): Встречающееся в природе неканоническое пуриновое нуклеиновое основание , которое используется в некоторых молекулах РНК и образует пары со стандартными нуклеиновыми основаниями в явлении, известном как спаривание оснований качания . Его нуклеозидная форма известна как инозин , поэтому его обычно сокращают буквой I в последовательности.

я

идиохромосома: См . аллосома .
идиограмма: Схематический или схематический кариотип всего набора хромосом внутри клетки или генома, в котором аннотированные иллюстрации изображают каждую хромосому в ее наиболее идеализированной форме (например, с прямыми линиями и явными центромерами ), чтобы облегчить идентификацию последовательностей и структурных особенностей. и физические расстояния, которые могут быть менее заметны на микрофотографиях реальных хромосом.
идиомера: См . хромомера .
увековечение
иммуногенный: Способен провоцировать или индуцировать иммунный ответ, как в случае с антигеном или вакциной .
иммуногистохимия (ИГХ)
иммуноокрашивание
в кремнеземе: (научного эксперимента или исследования) Проводится, производится или анализируется посредством компьютерного моделирования или симуляции, в отличие от реальных испытаний.
на месте: (научного эксперимента или биологического процесса) Происходящий или созданный в естественной, неконтролируемой обстановке или в естественном или исходном положении или месте, в отличие от чужеродной клетки или типа ткани или в искусственной среде .
in situ гибридизация
in vitro: (научного эксперимента или биологического процесса) Происходящий или возникший в лабораторном сосуде или другой контролируемой искусственной среде, например, в пробирке или чашке Петри, а не внутри живого организма или в естественной среде .
живой: (научного эксперимента или биологического процесса) Происходящий или возникающий внутри клеток или тканей живого организма; или, в самом широком смысле, в любой естественной, неконтролируемой обстановке. Сравните ex vivo и in vitro .
удалить: Термин, обозначающий вставку одного или или нескольких удаление оснований в последовательности нуклеиновой кислоты.
индуктор: Белок, который связывается с репрессором (чтобы отключить его) или с активатором (чтобы включить его).
индуцируемый ген: Ген , которого экспрессия либо реагирует на изменения окружающей среды, либо зависит от положения клетки-хозяина в клеточном цикле .
в кадре: 1. (гена или последовательности) Читается или транскрибируется в той же рамке считывания , что и другой ген или последовательность; не требуется сдвиг рамки считывания для обеспечения разборчивости или получения функционального пептида .; 2. (о мутации) Не вызывает сдвига рамки . ^[4]
наследование: См. наследственность .
инициирующий кодон: См. стартовый кодон .
инозин
вставка: Тип мутации , при котором одно или несколько оснований добавляются к последовательности нуклеиновой кислоты . контраста Удаление .
последовательность вставки (IS): Любая нуклеотидная последовательность, которая естественным или искусственным образом вставлена в другую последовательность. Этот термин используется, в частности, для обозначения части мобильного элемента , которая кодирует белки, непосредственно участвующие в процессе транспозиции, например фермент транспозазу . Кодирующая область в мобильной инсерционной последовательности обычно фланкирована короткими инвертированными повторами , а структура более крупных мобильных элементов может включать пару фланкирующих инсерционных последовательностей, которые сами по себе являются инвертированными.
инсерционный мутагенез: Изменение последовательности ДНК путем вставки в последовательность одного или нескольких нуклеотидов природного или искусственного происхождения. В зависимости от точного местоположения вставки в целевой последовательности, вставки могут частично или полностью инактивировать или даже активировать генный продукт или биохимический путь или же они могут быть нейтральными , что вообще не приводит к существенным изменениям. Многие методы генной инженерии основаны на вставке экзогенного генетического материала в клетки-хозяева с целью изучения функции и экспрессии генов. ^[4]
изолятор: Специфическая последовательность ДНК, которая предотвращает влияние на ген активации или репрессии близлежащих генов.
интегральный мембранный белок (IMP): Любой из класса мембранных белков , которые постоянно встроены в клеточную мембрану или прикреплены к ней (в отличие от тех, которые прикреплены только временно ). Интегральные мембранные белки можно подразделить на интегральные политопные белки , которые охватывают всю мембрану, и интегральные монотопные белки , которые прикрепляются только к одной стороне.
интегральный монотопный белок: Любой представитель класса интегральных мембранных белков , которые каким-либо образом постоянно прикреплены к одной стороне клеточной мембраны , но не полностью покрывают мембрану. Контрастный интегральный политопный белок .
интегральный политопный белок: Любой представитель класса интегральных мембранных белков , которые охватывают всю клеточную мембрану , простираясь от внутренней или цитозольной стороны мембраны до внешней или внеклеточной стороны. Трансмембранные белки обычно имеют гидрофильные домены, открытые с каждой стороны, а также один или несколько гидрофобных доменов, пересекающих неполярное пространство внутри липидного бислоя , на основании чего их далее классифицируют как однопроходные или многопроходные мембранные белки. По существу, многие трансмембранные белки функционируют как закрытые каналы или транспортеры, разрешая или запрещая движение определенных молекул или ионов через мембрану, часто претерпевая при этом конформационные изменения, или как рецепторы в сигнальных путях клетки. Контрастный интегральный монотопный белок .
интеграция
интегрирует: Мобильный генетический элемент, состоящий из генной кассеты, содержащей ген сайт -специфической рекомбиназы , сайты специфического узнавания интегразы и промотор , который управляет экспрессией одного или нескольких генов, придающих клетке-хозяину адаптивные признаки. Интегроны обычно существуют в форме кольцевых эписомальных фрагментов ДНК, посредством которых они способствуют быстрой адаптации бактерий, обеспечивая горизонтальный перенос генов устойчивости к антибиотикам между различными видами бактерий. ^[4]
интеин: Любая последовательность одной или нескольких аминокислот предшественнике в полипептиде- , которая вырезается в результате сплайсинга белка во время посттрансляционной модификации и, следовательно, отсутствует в зрелом белке, аналогично интронам, сплайсированным из транскриптов РНК. ^[4] Контрастный экстеин .
интеркалирующий агент: Любое химическое соединение (например, бромид этидия ), которое нарушает выравнивание и спаривание оснований в комплементарных цепях молекулы ДНК , встраиваясь между основаниями . ^[2]
вставка: Вставка, естественная или искусственная, химических соединений между плоскими основаниями молекулы ДНК , которая обычно разрушает водородные связи, необходимые для спаривания оснований .
межклеточный: Между двумя и более ячейками . Контраст внутриклеточный ; см. также внеклеточный .
межцистронная область: Любая последовательность ДНК, расположенная между стоп-кодоном одного гена и старт-кодоном следующего гена в полицистронной единице транскрипции. ^[4] См. также межгенная область .
пересекать: Скрещивание , при котором родители мужского и женского пола гетерозиготны по определенному локусу . ^[4]
межгенная область (IGR): Любая последовательность некодирующей ДНК , расположенная между функциональными генами .
межгенный спейсер (IGS): См . разделитель .
интеркинез: Сокращенная пауза в активности, связанной с делением клеток, которая возникает во время мейоза у некоторых видов между первым и вторым делениями мейоза (т. е. мейозом I и мейозом II). не Во время интеркинеза репликация ДНК происходит, в отличие от нормальной интерфазы , которая предшествует мейозу I и митозу . ^[4]
внутренний сайт входа в рибосому (IRES): Последовательность, присутствующая в некоторых информационных РНК , которая позволяет распознавать рибосому и , таким образом, инициировать трансляцию даже при отсутствии 5'-кэпа , который у эукариот в противном случае необходим для сборки инициирующего комплекса. Элементы IRES часто располагаются в 5'-нетранслируемой области , но могут быть обнаружены и в других положениях.
интерфаза: Все стадии клеточного цикла, за исключением деления клеток . Типичная клетка проводит большую часть своей жизни в интерфазе, во время которой она осуществляет повседневную метаболическую деятельность , а также полную репликацию своего генома при подготовке к митозу или мейозу .
внутриклеточный: Внутри клетки или ячеек; т.е. внутри плазматической мембраны . Контраст межклеточного и внеклеточного .
внутригенная область: См . интрон .
внутригенное подавление
внутригеномный конфликт
внутренний мембранный белок: См. интегральный мембранный белок .
внутренне неупорядоченный белок (IDP)
интрон: Любая нуклеотидная последовательность внутри функционального гена , которая удаляется в результате сплайсинга РНК во время посттранскрипционной модификации первичного мРНК транскрипта и, следовательно, отсутствует в окончательной зрелой мРНК. Этот термин относится как к последовательности, существующей внутри молекулы ДНК, так и к соответствующей последовательности в транскриптах РНК. Контрастный экзон .
интронное вторжение
интрон-опосредованная рекомбинация: См. перетасовку экзонов .
инвагинация: Складывание мембраны внутрь клетки или органеллы или листа клеток внутрь развивающегося эмбриона , ткани или органа, образующее отчетливый карман, выстланный мембраной. В случае отдельных клеток инвагинированный карман может полностью отделиться от исходной мембраны, создавая мембраносвязанный везикулы внутри клетки, как при эндоцитозе . ^[11]
перевернутый повтор: , Нуклеотидная последовательность следующая за той же цепью , имеет собственный обратный комплемент . Исходная последовательность и обратный комплемент могут быть разделены любым количеством нуклеотидов или могут находиться непосредственно рядом друг с другом; в последнем случае составная последовательность также называется палиндромной последовательностью . Инвертированные повторы по определению самодополнительны , и это свойство включает их во многие биологические функции и дисфункции. Контрастный прямой повтор .
ионный канал: Тип трансмембранного белкового комплекса, который образует водную пору или канал, охватывающий липидный бислой мембраны, через который определенные неорганические электрически заряженные ионы могут диффундировать вниз по своим электрохимическим градиентам. ^[6]
ионофор: Любое химическое соединение или макромолекула, которая облегчает перемещение ионов через биологические мембраны, или, более конкретно, любые химические соединения, которые обратимо связывают электрически заряженные атомы или молекулы. Многие ионофоры представляют собой жирорастворимые белки , которые катализируют транспорт одновалентных и двухвалентных катионов через гидрофобные липидные бислои , окружающие клетки и везикулы. ^[11]
изохора: Большой участок геномной ДНК с относительно однородным составом пар оснований , отличающийся от других участков долей пар G - C или A - T . Геномы большинства растений и позвоночных животных состоят из разных классов изохор, богатых GC и AT. ^[4]
изохромосома: Тип аномальной хромосомы , при которой плечи хромосомы являются зеркальным отражением друг друга. Формирование изохромосомы эквивалентно одновременным событиям дупликации и делеции , так что две копии либо длинного , либо короткого плеча составляют результирующую хромосому.
изомераза: из класса Любой фермент , который катализирует превращение молекулы из одного изомера в другой, так что продукт реакции имеет ту же молекулярную формулу, что и исходный субстрат, но отличается связностью или пространственным расположением его атомов.
изомерные гены: Два или более гена, которые эквивалентны и избыточны в том смысле, что, несмотря на кодирование различных генных продуктов , каждый из них приводит к одному и тому же фенотипу, если установлен в одном и том же генетическом фоне . присутствует несколько изомерных генов, Если в одном генотипе они могут иметь как кумулятивный, так и некумулятивный вклад в фенотип. ^[14]
изотонический

Дж

прыгающий ген: См. переносной элемент .
многообразие соединений
мусорная ДНК: Любая последовательность ДНК, которая, по-видимому, не имеет известной биологической функции или действует таким образом, что не оказывает ни положительного, ни отрицательного влияния на приспособленность генома , в котором она расположена. Этот термин когда-то использовался более широко для обозначения всей некодирующей ДНК , хотя позже было обнаружено, что большая часть ее имеет определенную функцию; в современном использовании это слово обычно относится к поврежденным или рудиментарным последовательностям и эгоистичным генетическим элементам , включая интроны , псевдогены , межгенную ДНК и фрагменты транспозонов и ретровирусов , которые вместе составляют значительную часть геномов большинства эукариот. Несмотря на то, что эти последовательности не вносят продуктивного вклада в организм хозяина, они способны бесконечно сохраняться внутри геномов, поскольку недостатки продолжения их копирования слишком малы, чтобы на них мог воздействовать естественный отбор .
мусорная РНК: Любая последовательность, кодируемая РНК, особенно транскрипт , которая, по-видимому, не имеет известной биологической функции или функция которой не оказывает положительного или суммарного отрицательного влияния на приспособленность генома, из которого она транскрибируется. остаются нетранслируемыми Несмотря на то, что многие некодирующие РНК , они по-прежнему выполняют важные функции, тогда как мусорные РНК действительно бесполезны: часто они являются продуктом случайной транскрипции мусорной последовательности ДНК или могут возникнуть в результате посттранскрипционной обработки , первичных транскриптов как в случае с сплайсированные интроны . Мусорная РНК обычно быстро разрушается рибонуклеазами и другими цитоплазматическими ферментами.

К

кариограмма: Кариотип , который изображает весь набор хромосом в клетке или организме с помощью микрофотографий реальных хромосом, как они появляются in vivo (обычно во время метафазы , в их наиболее конденсированных формах), в отличие от идеализированных иллюстраций хромосом, используемых в идиограммах . Микрофотографии часто по-прежнему располагаются парами и по размеру для облегчения идентификации конкретных хромосом, тогда как в реальном ядре редко наблюдается какая-либо видимая организация.
кариокинез: См . митоз .
кариолимфа: См. нуклеозол .
Карион: См . ядро .
кариоплазма: См. нуклеоплазма .
кариопикноз: См . пикноз .
кариорексис: Фрагментация и перерождение ядра умирающей клетки, при которых ядерная оболочка разрушается и содержимое ядра, в том числе хроматин , рассеивается по цитоплазме и расщепляется ферментами. Кариорексису обычно предшествует пикноз , он может возникнуть в результате апоптоза , клеточного старения или некроза .
кариосома
кариотип: Число и внешний вид хромосом в ядре эукариотической клетки, особенно как это показано на организованной кариограмме или идиограмме (парами и упорядоченными по размеру и положению центромеры ) . Этот термин также используется для обозначения полного набора хромосом у вида или отдельного организма или для любого теста, который обнаруживает этот комплемент или измеряет число хромосом.
кетогенез
кетогенная аминокислота: Любая аминокислота , которую можно преобразовать непосредственно в ацетил-КоА , который затем можно окислить для получения энергии или использовать в качестве предшественника для многих соединений, содержащих кетоновые группы . В этом отличие от глюкогенных аминокислот , которые могут превращаться в глюкозу . У человека семь из 20 аминокислот являются кетогенными, хотя только лейцин и лизин являются исключительно кетогенными; остальные пять ( фенилаланин , изолейцин , треонин , триптофан и тирозин ) являются как кетогенными, так и глюкогенными.
кетолиз
килобаза (КБ): Единица длины нуклеиновой кислоты , равная тысяче (1 × 10 ³) оснований в одноцепочечных молекулах или тысячу пар оснований в дуплексных молекулах, таких как двухцепочечная ДНК .
киназа: из класса Любой фермент , который катализирует перенос фосфатных групп от высокоэнергетических молекул, доноров фосфатов, таких как АТФ, к одному или нескольким специфическим субстратам , процесс, известный как фосфорилирование . Противоположный процесс, известный как дефосфорилирование , катализируется ферментами фосфатазами .
кинезис: Любое движение или изменение активности клетки или популяции клеток в ответ на стимул, при котором скорость движения или активности зависит от интенсивности стимула, но не от направления, с которого он возникает. Кинезис часто определяют как любую неспецифическую, ненаправленную реакцию, в отличие от таксиса и тропизма .
кинетохор: Белковый комплекс в форме диска, который собирается вокруг и мейоза , где он действует центромеры хромосомы во время прометафазы митоза как точка прикрепления микротрубочек веретенообразного аппарата .
ручка: В цитогенетике — увеличенная, сильно окрашивающаяся хромомера , которую можно использовать в качестве визуального маркера, позволяющего легко идентифицировать определенные хромосомы в ядре. ^[4]
сбить: Метод генной инженерии, с помощью которого нормальная скорость экспрессии организма одного или нескольких генов снижается либо путем прямой модификации последовательности ДНК, либо путем обработки реагентом, таким как короткий олигонуклеотид ДНК или РНК с последовательностью, комплементарной либо или транскрипт мРНК ген.
стучать
нокаутировать: Метод генной инженерии , при котором организм модифицируется так, чтобы он нес в себе гены , которые были выведены из строя («выбиты»), так что их экспрессия нарушается в какой-то момент пути производства генных продуктов , и организм лишается своей нормальной функции. эффекты. Контраст стучит .
Консенсусная последовательность Козака: Высококонсервативный , обычно это последовательность из 10 оснований , последовательности нуклеиновой кислоты мотив , который действует как сайт узнавания для инициации трансляции в большинстве эукариотических информационных РНК непосредственно окружающая и включающая стартовый кодон : GCC R CCAUGG . Поскольку преинициативный комплекс сканирует транскрипт, узнавание этой последовательности (или близкого варианта) заставляет комплекс приступить к полной сборке рибосомы и началу трансляции. Последовательность Козака отличается от других последовательностей распознавания, имеющих отношение к трансляции, таких как сайты связывания рибосом и внутренние сайты входа в рибосомы . ^[24]
Цикл Кребса: См. цикл лимонной кислоты .

л

маркировка: Химическое прикрепление высокоселективного вещества, известного как метка , метка или зонд , к конкретной клетке, белку, аминокислоте или другой интересующей молекуле, естественно или искусственно, in vivo или in vitro . Естественная маркировка — это основной механизм, с помощью которого биомолекулы специфически идентифицируют другие биомолекулы и взаимодействуют с ними; важные примеры включают метилирование , ацетилирование и убиквитинирование . Маркировка также является распространенным лабораторным методом, при котором метка обычно представляет собой реакционноспособное производное природного флуоресцентного соединения (например, зеленого флуоресцентного белка ), красителя, фермента, антитела, радиоактивной молекулы или любого другого вещества, которое каким-либо образом делает мишень различимой. Таким образом, помеченные цели отделяются от немаркированного окружения, что позволяет легко их обнаружить, идентифицировать, количественно оценить или изолировать для дальнейшего изучения.
отстающая прядь: При репликации ДНК зарождающаяся цепь , для которой ДНК-полимеразы направление синтеза направлено в сторону от репликационной вилки , что требует сложного и прерывистого процесса в отличие от упорядоченного, непрерывного синтеза другой зарождающейся цепи, известной как ведущая цепь . что происходит одновременно. Поскольку ДНК-полимераза работает только в направлении от 5' к 3' , но общее направление удлинения цепи отстающей цепи в конечном итоге должно быть противоположным (т.е. от 3' к 5', в сторону репликационной вилки), элонгация должна происходить по непрямому механизму. При этом фермент примаза синтезирует короткие РНК, праймеры комплементарные матричной ДНК, а ДНК-полимераза затем удлиняет загрунтованные сегменты в короткие цепочки нуклеотидов, известные как фрагменты Оказаки . Затем праймеры РНК удаляются и заменяются ДНК, а фрагменты Оказаки соединяются ДНК-лигазой .
хромосома ламповой щетки
латеральный перенос генов (LGT): См. горизонтальный перенос генов .
последовательность лидеров: См. 5' нетранслируемую область .
ведущая нить: При репликации ДНК возникающая цепь , для которой как направление синтеза ДНК-полимеразой, так и направление общего удлинения цепи направлены к репликационной вилке ; т.е. оба происходят в направлении от 5' к 3' , что приводит к единому непрерывному процессу удлинения с небольшими перерывами или без них. Напротив, другая возникающая цепь, известная как отстающая цепь , собирается в ходе прерывистого процесса, включающего лигирование коротких фрагментов ДНК, синтезируемых в противоположном направлении, вдали от репликационной вилки. ^[4]
левый соединительный узел: Граница между левым концом (условно 5'-концом ) интрона транскрипте пре и правым ( 3' -концом) соседнего экзона в -мРНК .
лептонема: В мейозе — первая из пяти подстадий профазы I , следующая за интерфазой и предшествующей зигонеме . При лептонеме реплицированные хромосомы конденсируются из диффузного хроматина в длинные тонкие нити, которые гораздо более заметны внутри ядра .
летальная мутация: Любая мутация , приводящая к преждевременной гибели организма, ее несущего. Рецессивные летальные мутации фатальны только для гомозигот , тогда как доминантные летальные мутации фатальны даже для гетерозигот . ^[4]
Лейциновая молния (ZIP): Общий структурный мотив ДНК -связывающих транскрипционных факторов и некоторых других типов белков, длиной около 35 аминокислот, характеризующийся главным образом повторением аминокислоты лейцина через каждые семь остатков. При моделировании в идеализированной альфа-спиральной конформации остатки лейцина располагаются таким образом, что они могут перекрещиваться с одинаковыми или подобными мотивами в альфа-спирали, принадлежащей другому аналогичному полипептиду, способствуя димеризации и образованию комплекса, напоминающего застежку-молнию. . ^[12]
лиганд: которая связывается или взаимодействует с определенным участком белка В биохимии — любая молекула , или другой биомолекулы , обычно обратимо посредством межмолекулярных сил; ^[6] или любое вещество, которое образует комплекс с биомолекулой в рамках биологического процесса. Связывание специфических лигандов с ДНК или белками важно во многих биохимических путях ; например, связывание белок-лиганд может привести к тому, что белок претерпит конформационные изменения , которые изменят его функцию или сродство к другим молекулам.
лигаза: Класс ферментов, которые катализируют соединение больших молекул, таких как нуклеиновые кислоты , путем образования между ними одной или нескольких химических связей, обычно C–C , C–O , C–S или C–N связей посредством реакций конденсации . Примером является ДНК-лигаза , которая катализирует образование фосфодиэфирных связей между соседними нуклеотидами на одной или обеих цепях молекулы ДНК, реакция, известная как лигирование .
перевязка
связь: Тенденция последовательностей ДНК, физически расположенных рядом друг с другом на одной хромосоме, наследоваться вместе во время мейоза . Поскольку физическое расстояние между ними относительно невелико, вероятность того, что любые две близлежащие части последовательности ДНК (часто локусы или генетические маркеры ) будут разделены на разные хроматиды во время хромосомного кроссовера , статистически очень мала; тогда говорят, что такие локусы более связаны , чем локусы, которые находятся дальше друг от друга. Локусы, находящиеся в совершенно разных хромосомах, называются совершенно несвязанными . Стандартной единицей измерения генетического сцепления является сантиморган (см).
неравновесие связей
линкерная ДНК: 1. Короткий синтетический дуплекс ДНК, содержащий последовательность узнавания определенного фермента рестрикции . ^[4] При молекулярном клонировании линкеры часто намеренно включают в рекомбинантные молекулы, чтобы сделать их легко модифицируемыми, позволяя расщеплять и вставлять чужеродные последовательности в точных местах. Сегмент сконструированной плазмиды , содержащий множество таких сайтов рестрикции, иногда называют полилинкером .; 2. Участок хромосомной ДНК, соединяющий соседние нуклеосомы путем связывания с гистоном Н1 . ^[4]
связующий номер: Число раз, когда две нити кольцевой двойной спиральной молекулы ДНК пересекают друг друга, эквивалентно числу скручивания (которое измеряет кручение двойной спирали) плюс числу извиваний (которое измеряет степень сверхспирали). Связующее число замкнутой молекулы невозможно изменить без разрыва и повторного соединения нитей. Молекулы ДНК, которые идентичны, за исключением числа связей, известны как топологические изомеры . ^[4]
липид: Любое из разнородного класса органических соединений, включая глицериды (жиры), воски , стерины и некоторые витамины, объединенные только своей амфипатической или гидрофобной природой и, следовательно, очень низкой растворимостью в воде. ^[12] Некоторые липиды, такие как фосфолипиды, имеют тенденцию образовывать пластинчатые структуры или мицеллы в водной среде, где они служат основными компонентами биологических мембран . Другие, такие как жирные кислоты, могут метаболизироваться с получением энергии, выполнять важные функции по хранению энергии или служить сигнальными молекулами. В разговорной речи термин «липиды» иногда используется как синоним жиров, хотя жиры правильнее считать подклассом липидов.
липидный бислой: Ламеллярная структура, состоящая из многочисленных молекул амфипатических липидов , упакованных вместе в два листа или слоя, расположенных спина к спине, причем их гидрофобные жирных кислот «хвосты» направлены внутрь, а их гидрофильные «головки» обнажены на внешней поверхности. Это основной структурный мотив всех биологических мембран , включая плазматическую мембрану, окружающую все клетки, а также мембраны, окружающие органеллы и пузырьки . Хотя бислои иногда в просторечии называют бислоями фосфолипидов , фосфолипиды являются лишь одним из нескольких классов мембранных липидов , которые образуют бислои; Большинство мембран на самом деле представляют собой жидкую гетерогенную смесь фосфолипидов, гликолипидов и холестерина , вкрапленную и усеянную различными другими молекулами, такими как интегральные белки . ^[12]
липофильный: См . гидрофобный .
днРНК: См. длинную некодирующую РНК .
локус: Конкретное, фиксированное положение на хромосоме , где находится определенный ген или генетический маркер .
Уровень детализации
длинная рука: В конденсированных хромосомах , где расположение центромеры создает два сегмента или «плеча» неравной длины, более длинное из двух плеч хроматиды . Контрастная короткая рука .
длинный вкрапленный ядерный элемент (LINE): Любой представитель большого семейства не относящихся к LTR ретротранспозонов, , которые вместе составляют один из наиболее распространенных мобильных генетических элементов в геномах эукариот. Каждая вставка LINE имеет длину в среднем около 7000 пар оснований.
длинная некодирующая РНК (днРНК): Класс некодирующих РНК, состоящий из всех транскриптов длиной более 200 нуклеотидов , которые не транслируются . Этот предел отличает днРНК от многочисленных более мелких некодирующих РНК, таких как микроРНК . См. также длинную промежуточную некодирующую РНК .
лионизация: См. X-инактивация .
лизис: Разрушение и разложение плазматической мембраны, окружающей клетку, или, в более общем плане, любой связанной с мембраной органеллы или пузырька , особенно под действием осмотических , ферментативных или других химических или механических процессов, которые нарушают целостность мембраны и тем самым вызывают беспрепятственный обмен содержимого. внутриклеточного внеклеточного и пространства . Лизис обычно подразумевает полную и необратимую утрату внутриклеточной организации в результате высвобождения внутренних компонентов клетки и разбавления цитозоля и , следовательно, гибель клетки. О такой клетке говорят, что она лизирована , а жидкость, содержащая содержимое лизированных клеток (обычно включая нуклеиновые кислоты , белки и многие другие органические молекулы), называется лизатом . Лизис может происходить как естественным, так и искусственным путем и является нормальной частью жизненного цикла клетки.
лизосома

См. также

Ссылки

^ «Говорящий словарь геномных и генетических терминов» . genome.gov. 8 октября 2017 года . Проверено 8 октября 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Клюг, Уильям С.; Каммингс, Майкл Р. (1986). Концепции генетики (2-е изд.). Гленвью, Иллинойс: Скотт, Форесман и компания. ISBN 0-673-18680-6 .
^ Jump up to: ^а ^б Ассери, Дэвид В. «Структура ДНК: семейства спиралей A-, B- и Z-ДНК». Люнгбю, Дания: Датский технический университет.
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н ^тот ^п ^д ^р ^с ^т ^в ^v ^В ^х ^и ^С ^аа ^аб ^и ^{объявление} ^но ^из ^в ^ах ^есть ^также ^и ^аль ^{являюсь} Кинг, Роберт С.; Стэнсфилд, Уильям Д.; Маллиган, Памела К. (2006). Генетический словарь (7-е изд.). Оксфорд: Издательство Оксфордского университета. ISBN 978-0-19-530762-7 .
^ «Словарь генетических терминов NCI» . Национальный институт рака . Редакционная коллегия PDQ® по генетике рака.
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н Альбертс, Брюс; Джонсон, Александр; Льюис, Джулиан; Рафф, Мартин; Робертс, Кейт; Уолтер, Питер (2002). «Глоссарий». Молекулярная биология клетки (доступно в Национальном центре биотехнологической информации) (4-е изд.). Нью-Йорк: Garland Science.
^ Jump up to: ^а ^б Левин, Бенджамин (2003). Гены VIII . Река Аппер-Сэддл, Нью-Джерси: Пирсон Прентис Холл. ISBN 0-13-143981-2 .
^ Лопес Д., Вламакис Х., Колтер Р. (июль 2010 г.). «Биопленки» . Перспективы Колд-Спринг-Харбор в биологии . 2 (7): а000398. doi : 10.1101/cshperspect.a000398 . ПМК 2890205 . ПМИД 20519345 .
^ Момени Б (июнь 2018 г.). «Разделение труда: как микробы разделяют свою ответственность» . Современная биология . 28 (12): 697–699 рэндов. дои : 10.1016/j.cub.2018.05.024 . ПМИД 29920261 . S2CID 49315067 .
^ «Словарь терминов, посвященных раку, NCI» . www.cancer.gov . Национальный институт рака. 2 февраля 2011 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н ^тот ^п ^д ^р ^с ^т ^в Маклин, Норман (1987). Словарь генетики и клеточной биологии . Нью-Йорк: Издательство Нью-Йоркского университета. ISBN 0-8147-5438-4 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н Лэки, Дж. М. (2013). Словарь клеточной и молекулярной биологии (5-е изд.). Амстердам: Академическая пресса/Эльзевир. ISBN 978-0-12-384931-1 .
^ SwissBioPics. «Животная клетка» . www.swissbiopics.org . Швейцарский институт биоинформатики (SIB).
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к Ригер, Ригомар (1991). Глоссарий генетики: классический и молекулярный (5-е изд.). Берлин: Springer-Verlag. ISBN 3540520546 .
^ Нисикава, С. (2007). «Перепрограммирование в цифрах». Природная биотехнология . 25 (8): 877–878. дои : 10.1038/nbt0807-877 . ПМИД 17687365 . S2CID 39773318 .
^ Коннерли, Польша (2010). «Как белки перемещаются через аппарат Гольджи?» . Природное образование . 3 (9): 60.
^ Валет, Гюнтер (2005). «Цитомика: вход в биологию биомедицинских клеточных систем» . Цитометрия Часть А. 63А (2): 67–68. doi : 10.1002/cyto.a.20110 . ISSN 1552-4922 . ПМИД 15657925 .
^ Принс, И.; Маймон, О.; Бен-Гал, И. (2007). «Оценка кластеризации экспрессии генов с помощью меры взаимного информационного расстояния» . БМК Биоинформатика . 8 : 111. дои : 10.1186/1471-2105-8-111 . ПМЦ 1858704 . ПМИД 17397530 .
^ Альбертс Б., Брэй Д., Хопин К., Джонсон А., Льюис Дж., Рафф М., Робертс К., Уолтер П. (2004). «Ткани и рак» . Основная клеточная биология . Нью-Йорк и Лондон: Garland Science . ISBN 978-0-8153-3481-1 .
^ «Общество данных функциональной геномики – Общество FGED» .
^ Эдгар, Р; Домрачев М; Лэш, А.Е. (1 января 2002 г.). «Омнибус экспрессии генов: хранилище данных массива экспрессии генов NCBI и гибридизации» . Исследования нуклеиновых кислот . 30 (1): 207–10. дои : 10.1093/нар/30.1.207 . ПМК 99122 . ПМИД 11752295 .
^ Барретт, Т; Уилхайт, SE; Леду, П; Евангелиста, К; Ким, ИФ; Томашевский М; Маршалл, Калифорния; Филиппи, КХ; Шерман, премьер-министр; Холко, М; Ефанов А; Ли, Х; Чжан, Н; Робертсон, CL; Серова, Н; Дэвис, С; Соболева, А (январь 2013 г.). «NCBI GEO: архив наборов данных функциональной геномики — обновление» . Исследования нуклеиновых кислот . 41 (Проблема с базой данных): D991-5. дои : 10.1093/nar/gks1193 . ПМК 3531084 . ПМИД 23193258 .
^ Яковчук П., Протозанова Е., Франк-Каменецкий М.Д. (2006). «Вклад укладки оснований и спаривания оснований в термическую стабильность двойной спирали ДНК» . Нуклеиновые кислоты Рез . 34 (2): 564–74. дои : 10.1093/nar/gkj454 . ПМЦ 1360284 . ПМИД 16449200 .
^ Козак, М. (февраль 1989 г.). «Модель сканирования для перевода: обновление» . Журнал клеточной биологии . 108 (2): 229–241. дои : 10.1083/jcb.108.2.229 . ISSN 0021-9525 . ПМК 2115416 . ПМИД 2645293 .

Дальнейшее чтение

Бадд, А. (2012). «Введение в биологию генома: особенности, процессы и структуры». Эволюционная геномика . Методы молекулярной биологии. Том. 855. стр. 3–4. дои : 10.1007/978-1-61779-582-4_1 . ISBN 978-1-61779-581-7 . ПМИД 22407704 .

Внешние ссылки

[1] «Говорящий словарь геномных и генетических терминов» . genome.gov. 8 октября 2017 года . Проверено 8 октября 2017 г.

[CoG-2] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Клюг, Уильям С.; Каммингс, Майкл Р. (1986). Концепции генетики (2-е изд.). Гленвью, Иллинойс: Скотт, Форесман и компания. ISBN 0-673-18680-6 .

[Ussery-3] Jump up to: ^а ^б Ассери, Дэвид В. «Структура ДНК: семейства спиралей A-, B- и Z-ДНК». Люнгбю, Дания: Датский технический университет.

[DoG7-4] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н ^тот ^п ^д ^р ^с ^т ^в ^v ^В ^х ^и ^С ^аа ^аб ^и ^{объявление} ^но ^из ^в ^ах ^есть ^также ^и ^аль ^{являюсь} Кинг, Роберт С.; Стэнсфилд, Уильям Д.; Маллиган, Памела К. (2006). Генетический словарь (7-е изд.). Оксфорд: Издательство Оксфордского университета. ISBN 978-0-19-530762-7 .

[NCI-G-5] «Словарь генетических терминов NCI» . Национальный институт рака . Редакционная коллегия PDQ® по генетике рака.

[Alberts_et_al.-6] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н Альбертс, Брюс; Джонсон, Александр; Льюис, Джулиан; Рафф, Мартин; Робертс, Кейт; Уолтер, Питер (2002). «Глоссарий». Молекулярная биология клетки (доступно в Национальном центре биотехнологической информации) (4-е изд.). Нью-Йорк: Garland Science.

[Lewin-7] Jump up to: ^а ^б Левин, Бенджамин (2003). Гены VIII . Река Аппер-Сэддл, Нью-Джерси: Пирсон Прентис Холл. ISBN 0-13-143981-2 .

[8] Лопес Д., Вламакис Х., Колтер Р. (июль 2010 г.). «Биопленки» . Перспективы Колд-Спринг-Харбор в биологии . 2 (7): а000398. doi : 10.1101/cshperspect.a000398 . ПМК 2890205 . ПМИД 20519345 .

[9] Момени Б (июнь 2018 г.). «Разделение труда: как микробы разделяют свою ответственность» . Современная биология . 28 (12): 697–699 рэндов. дои : 10.1016/j.cub.2018.05.024 . ПМИД 29920261 . S2CID 49315067 .

[NCI-C-10] «Словарь терминов, посвященных раку, NCI» . www.cancer.gov . Национальный институт рака. 2 февраля 2011 г.

[MacLean-11] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н ^тот ^п ^д ^р ^с ^т ^в Маклин, Норман (1987). Словарь генетики и клеточной биологии . Нью-Йорк: Издательство Нью-Йоркского университета. ISBN 0-8147-5438-4 .

[Lackie-12] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н Лэки, Дж. М. (2013). Словарь клеточной и молекулярной биологии (5-е изд.). Амстердам: Академическая пресса/Эльзевир. ISBN 978-0-12-384931-1 .

[SwissBioPics-13] SwissBioPics. «Животная клетка» . www.swissbiopics.org . Швейцарский институт биоинформатики (SIB).

[Rieger-14] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к Ригер, Ригомар (1991). Глоссарий генетики: классический и молекулярный (5-е изд.). Берлин: Springer-Verlag. ISBN 3540520546 .

[15] Нисикава, С. (2007). «Перепрограммирование в цифрах». Природная биотехнология . 25 (8): 877–878. дои : 10.1038/nbt0807-877 . ПМИД 17687365 . S2CID 39773318 .

[16] Коннерли, Польша (2010). «Как белки перемещаются через аппарат Гольджи?» . Природное образование . 3 (9): 60.

[17] Валет, Гюнтер (2005). «Цитомика: вход в биологию биомедицинских клеточных систем» . Цитометрия Часть А. 63А (2): 67–68. doi : 10.1002/cyto.a.20110 . ISSN 1552-4922 . ПМИД 15657925 .

[Priness-18] Принс, И.; Маймон, О.; Бен-Гал, И. (2007). «Оценка кластеризации экспрессии генов с помощью меры взаимного информационного расстояния» . БМК Биоинформатика . 8 : 111. дои : 10.1186/1471-2105-8-111 . ПМЦ 1858704 . ПМИД 17397530 .

[ECB-19] Альбертс Б., Брэй Д., Хопин К., Джонсон А., Льюис Дж., Рафф М., Робертс К., Уолтер П. (2004). «Ткани и рак» . Основная клеточная биология . Нью-Йорк и Лондон: Garland Science . ISBN 978-0-8153-3481-1 .

[urlFGED_Homepage-20] «Общество данных функциональной геномики – Общество FGED» .

[21] Эдгар, Р; Домрачев М; Лэш, А.Е. (1 января 2002 г.). «Омнибус экспрессии генов: хранилище данных массива экспрессии генов NCBI и гибридизации» . Исследования нуклеиновых кислот . 30 (1): 207–10. дои : 10.1093/нар/30.1.207 . ПМК 99122 . ПМИД 11752295 .

[22] Барретт, Т; Уилхайт, SE; Леду, П; Евангелиста, К; Ким, ИФ; Томашевский М; Маршалл, Калифорния; Филиппи, КХ; Шерман, премьер-министр; Холко, М; Ефанов А; Ли, Х; Чжан, Н; Робертсон, CL; Серова, Н; Дэвис, С; Соболева, А (январь 2013 г.). «NCBI GEO: архив наборов данных функциональной геномики — обновление» . Исследования нуклеиновых кислот . 41 (Проблема с базой данных): D991-5. дои : 10.1093/nar/gks1193 . ПМК 3531084 . ПМИД 23193258 .

[Yakovchuk2006-23] Яковчук П., Протозанова Е., Франк-Каменецкий М.Д. (2006). «Вклад укладки оснований и спаривания оснований в термическую стабильность двойной спирали ДНК» . Нуклеиновые кислоты Рез . 34 (2): 564–74. дои : 10.1093/nar/gkj454 . ПМЦ 1360284 . ПМИД 16449200 .

[Kozak-24] Козак, М. (февраль 1989 г.). «Модель сканирования для перевода: обновление» . Журнал клеточной биологии . 108 (2): 229–241. дои : 10.1083/jcb.108.2.229 . ISSN 0021-9525 . ПМК 2115416 . ПМИД 2645293 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]

[19]

[20]

[21]

[22]

[23]

[24]