✖


Jump to content

Убикитин

(Перенаправлено с Ubiquitinated )
Не путать с убихинолом .
Семейство убиквитинов
Схема убиквитина . Семь боковых цепей лизина показаны желтым/оранжевым цветом.
Идентификаторы
Символ убиквитин
Пфам PF00240
ИнтерПро ИПР000626
PROSITE PDOC00271
ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 1aar / SCOPe / СУПФАМ
Доступные белковые структуры:
Pfam  structures / ECOD  
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumstructure summary

Убиквитин — небольшой (8,6 кДа ) регуляторный белок, обнаруженный в большинстве тканей эукариотических организмов, т. е. он встречается повсеместно . Он был обнаружен в 1975 году. [1] Гидеоном Гольдштейном и далее охарактеризованный на протяжении конца 1970-х и 1980-х годов. [2] Четыре гена в геноме человека кодируют убиквитин: UBB , UBC , UBA52 и RPS27A . [3]

Добавление убиквитина к белку-субстрату называется убиквитилированием (или убиквитинированием или убиквитинилированием ). Убиквитилирование влияет на белки разными способами: оно может отмечать их деградацию через протеасому , изменять их клеточное расположение , влиять на их активность и стимулировать или предотвращать белковые взаимодействия . [4] [5] [6] Убиквитилирование включает три основных этапа: активацию, конъюгацию и лигирование, выполняемые ферментами, активирующими убиквитин (E1s), ферментами, конъюгирующими убиквитин (E2s), и убиквитинлигазами (E3) соответственно. Результатом этого последовательного каскада является связывание убиквитина с остатками лизина на белковом субстрате через изопептидную связь , с остатками цистеина через тиоэфирную связь , с остатками серина и треонина через сложноэфирную связь или с аминогруппой N-конца белка через пептидная связь . [7] [8] [9]

Модификации белка могут представлять собой либо одиночный белок убиквитина (моноубиквитилирование), либо цепь убиквитина (полиубиквитилирование). Вторичные молекулы убиквитина всегда связаны с одним из семи остатков лизина или N-концевым метионином предыдущей молекулы убиквитина. Эти «связывающие» остатки представлены буквами «K» или «M» ( однобуквенное обозначение аминокислот лизина и метионина соответственно) и числом, относящимся к его положению в молекуле убиквитина, как в K48, K29 или M1. . Первая молекула убиквитина ковалентно связана через свою С-концевую карбоксилатную группу с определенным лизином, цистеином, серином, треонином или N-концом целевого белка. Полиубиквитилирование происходит, когда С-конец другого убиквитина соединяется с одним из семи остатков лизина или первым метионином на ранее добавленной молекуле убиквитина, образуя цепь. Этот процесс повторяется несколько раз, что приводит к добавлению нескольких убиквитинов. Только полиубиквитилирование определенных лизинов, в основном K48 и K29, связано с деградацией протеасома (называемая «молекулярным поцелуем смерти»), в то время как другие полиубиквитилирования (например, K63, K11, K6 и M1) и моноубиквитилирования могут регулировать такие процессы, как эндоцитарный транспорт , воспаление , трансляция и репарация ДНК . [10]

Открытие того, что цепи убиквитина направляют белки в протеасому, которая разлагает и перерабатывает белки, было удостоено Нобелевской премии по химии в 2004 году. [8] [11] [12]

Идентификация

[ редактировать ]
Поверхностное изображение убиквитина.

Убиквитин (первоначально вездесущий иммунопоэтический полипептид ) был впервые идентифицирован в 1975 году. [1] как белок массой 8,6 кДа , экспрессируемый во всех эукариотических клетках. Основные функции убиквитина и компоненты пути убиквитилирования были выяснены в начале 1980-х годов в Технионе Аароном Чехановером , Аврамом Гершко и Ирвином Роузом , за что в 2004 году была присуждена Нобелевская премия по химии . [11]

Система убиквитилирования первоначально была охарактеризована как АТФ -зависимая протеолитическая система, присутствующая в клеточных экстрактах. термостабильный полипептид Было обнаружено, что , присутствующий в этих экстрактах, АТФ-зависимый фактор протеолиза 1 (APF-1), ковалентно присоединяется к модельному белку-субстрату лизоциму в АТФ- и Mg. 2+ -зависимый процесс. [13] Несколько молекул APF-1 были связаны с одной субстрата молекулой изопептидной связью, и было обнаружено, что конъюгаты быстро разлагаются с высвобождением свободного APF-1. Вскоре после того, как была охарактеризована конъюгация белка APF-1, APF-1 был идентифицирован как убиквитин. Карбоксильная группа С-концевого остатка глицина убиквитина (Gly76) была идентифицирована как фрагмент, конъюгированный с остатками лизина субстрата .

Белок

[ редактировать ]
Свойства убиквитина (человека) [ который? ]
Количество остатков 76
Молекулярная масса 8564.8448 Да
Изоэлектрическая точка (pI) 6.79
Имена генов РПС27А (UBA80, UBCEP1), UBA52 (UBCEP2), UBB , UBC
Последовательность ( однобуквенная )

MQIFV K TLTG K TITLEVEPSDTIENV K A K IQD K EGIPPD

QQRLIFAG K QLEDGRTLSDYNIQ K ESTLHLVLRLRGG

Убиквитин — небольшой белок , который существует во всех эукариотических клетках . Он выполняет множество функций посредством конъюгации с широким спектром белков-мишеней. Могут встречаться самые разные модификации . Сам белок убиквитин состоит из 76 аминокислот и имеет молекулярную массу около 8,6 кДа. Ключевые особенности включают С-концевой хвост и 7 остатков лизина . Он высоко консервативен на протяжении всей эволюции эукариот; Убикитин человека и дрожжей имеет 96% идентичности последовательностей . [14]

Гены

[ редактировать ]

Убиквитин кодируется у млекопитающих четырьмя разными генами. Гены UBA52 и RPS27A кодируют одну копию убиквитина, слитую с рибосомальными белками L40 и S27a соответственно. Гены UBB и UBC кодируют белки-предшественники полиубиквитина. [3]

Убиквитилирование

[ редактировать ]
Система убиквитилирования (показана лигаза RING E3).

Убиквитилирование (также известное как убиквитинирование или убиквитинилирование) представляет собой ферментативную посттрансляционную модификацию , при которой белок убиквитин присоединяется к белку-субстрату . Этот процесс чаще всего связывает последнюю аминокислоту убиквитина ( глицин 76) с остатком лизина на субстрате. изопептидная связь образуется Между карбоксильной группой (COO) − ) глицина убиквитина и эпсилон- аминогруппы (ε- NH +
3 ) лизина субстрата. [15] Расщепление трипсином субстрата, конъюгированного с убиквитином, оставляет «остаток» диглицина, который используется для идентификации места убиквитинирования. [16] [17] Убиквитин также может быть связан с другими участками белка, которые представляют собой богатые электронами нуклеофилы , что называется «неканоническим убиквитилированием». [9] Впервые это было обнаружено, когда аминогруппа белка на N-конце для убиквитилирования использовалась , а не остаток лизина, в белке MyoD. [18] и с тех пор наблюдался в 22 других белках у многих видов, [19] [20] [21] [22] [23] [24] [25] [26] [27] [28] [29] [30] [31] [32] [33] [34] [35] [36] [37] включая сам убиквитин. [38] [39] Также появляется все больше свидетельств того, что нелизиновые остатки являются мишенями убиквитилирования с использованием неаминных групп, таких как сульфгидрильная группа цистеина. [34] [35] [40] [41] [42] [43] [44] [45] [46] [47] и гидроксильная группа треонина и серина. [34] [35] [40] [46] [47] [48] [49] [50] [51] Конечным результатом этого процесса является добавление одной молекулы убиквитина (моноубиквитилирование) или цепи молекул убиквитина (полиубиквитинирование) к белку-субстрату. [52]

Для убиквитинирования необходимы три типа ферментов: ферменты, активирующие убиквитин , ферменты, конъюгирующие убиквитин , и убиквитинлигазы , известные как E1s, E2s и E3s соответственно. Процесс состоит из трех основных этапов:

  1. Активация : убиквитин активируется в двухэтапной реакции с помощью фермента, активирующего убиквитин E1 , который зависит от АТФ . Начальный этап включает производство промежуточного продукта убиквитин-аденилата. E1 связывает как АТФ, так и убиквитин и катализирует ациладенилирование С-конца молекулы убиквитина. На втором этапе убиквитин переносится к в активном центре остатку цистеина с высвобождением АМФ . Этот этап приводит к образованию тиоэфирной связи между С-концевой карбоксильной группой убиквитина и сульфгидрильной группой цистеина E1 . [15] [53] Геном человека содержит два гена, вырабатывающих ферменты, способные активировать убиквитин: UBA1 и UBA6 . [54]
  2. Конъюгация : ферменты, конъюгирующие убиквитин Е2 , катализируют перенос убиквитина от Е1 к цистеину активного центра Е2 посредством реакции транс(тио)этерификации. Для осуществления этой реакции E2 связывается как с активированным убиквитином, так и с ферментом E1. У человека имеется 35 различных ферментов E2, тогда как у других эукариотических организмов их от 16 до 35. Они характеризуются высококонсервативной структурой, известной как каталитическая складка, конъюгирующая убиквитин (UBC). [55]
    Глицин и лизин связаны изопептидной связью. Изопептидная связь выделена желтым цветом.
  3. Лигирование : убиквитинлигазы E3 катализируют заключительную стадию каскада убиквитилирования. Чаще всего они создают изопептидную связь между лизином белка-мишени и С-концевым глицином убиквитина. В общем, этот шаг требует активности одного из сотен E3. Ферменты Е3 функционируют как модули распознавания субстрата системы и способны взаимодействовать как с Е2, так и с субстратом. Некоторые ферменты E3 также активируют ферменты E2. Ферменты E3 обладают одним из двух доменов : гомологичным домену карбоксильного конца E6-AP ( HECT ) и домену действительно интересного нового гена ( RING ) (или близкородственному домену U-box). Домен E3 HECT временно связывает убиквитин в этом процессе (облигатный тиоэфирный промежуточный продукт образуется с цистеином активного центра E3), тогда как домен E3 RING катализирует прямой перенос от фермента E2 к субстрату. [56] Комплекс , способствующий анафазе (APC) и комплекс SCF (для белкового комплекса Skp1-Cullin-F-box) являются двумя примерами мультисубъединичных E3 , участвующих в распознавании и убиквитилировании специфических белков-мишеней для деградации протеасомой . [57]

В каскаде убиквитилирования E1 может связываться со многими E2, которые могут связываться с сотнями E3 иерархическим образом. Наличие уровней внутри каскада позволяет жестко регулировать механизм убиквитилирования. [7] Другие убиквитиноподобные белки (UBL) также модифицируются посредством каскада E1-E2-E3, хотя вариации в этих системах действительно существуют. [58]

Ферменты E4, или факторы удлинения цепи убиквитина, способны добавлять предварительно сформированные цепи полиубиквитина к белкам-субстратам. [59] Например, множественное моноубиквитилирование опухолевого супрессора р53 с помощью Mdm2. [60] за этим может последовать добавление полиубиквитиновой цепи с использованием p300 и CBP . [61] [62]

Типы

[ редактировать ]
Смотрите также: Убиквитинлигаза § Моно- и полиубиквитилирование

Убиквитилирование влияет на клеточные процессы, регулируя деградацию белков (через протеасому и лизосому ), координируя клеточную локализацию белков, активируя и инактивируя белки и модулируя белок-белковые взаимодействия . [4] [5] [6] Эти эффекты опосредуются различными типами убиквитилирования субстрата, например, добавлением одной молекулы убиквитина (моноубиквитилирование) или разных типов цепей убиквитина (полиубиквитилирование). [63]

Моноубиквитилирование

[ редактировать ]

Моноубиквитилирование – это присоединение одной молекулы убиквитина к одному остатку белка-субстрата. Мультимоноубиквитилирование — это присоединение одной молекулы убиквитина к нескольким остаткам субстрата. Моноубиквитилирование белка может иметь эффекты, отличные от полиубиквитилирования того же белка. Считается, что добавление одной молекулы убиквитина необходимо до образования цепей полиубиквитина. [63] Моноубиквитилирование влияет на клеточные процессы, такие как мембранный транспорт , эндоцитоз и почкование вируса . [10] [64]

Полиубиквитиновые цепи

[ редактировать ]
Схема лизин-48-связанного диубиквитина . Связь между двумя цепями убиквитина показана оранжевым цветом.
Схема лизин-63-связанного диубиквитина . Связь между двумя цепями убиквитина показана оранжевым цветом.

Полиубиквитилирование – это образование убиквитиновой цепи на одном остатке лизина на белке-субстрате. После добавления одной молекулы убиквитина к белковому субстрату к первой можно добавить дополнительные молекулы убиквитина, образуя полиубиквитиновую цепь. [63] Эти цепи образуются путем связывания остатка глицина молекулы убиквитина с лизином убиквитина, связанным с субстратом. Убиквитин имеет семь остатков лизина и N-конец , который служит точками убиквитинирования; это К6, К11, К27, К29, К33, К48, К63 и М1 соответственно. [8] Лизиновые 48-связанные цепи были впервые идентифицированы и представляют собой наиболее охарактеризованный тип убиквитиновых цепей. Цепи K63 также хорошо охарактеризованы, тогда как функция других лизиновых цепей, смешанных цепей, разветвленных цепей, линейных цепей, связанных с M1, и гетерологичных цепей (смесей убиквитина и других убиквитиноподобных белков) остается более неясной. [17] [39] [63] [64] [65]

Лизин-48-связанные полиубиквитиновые цепи нацелены на разрушение белков с помощью процесса, известного как протеолиз . Мультиубиквитиновые цепи длиной не менее четырех молекул убиквитина должны быть присоединены к остатку лизина на поврежденном белке, чтобы он мог быть распознан 26S протеасомой . [66] Это структура бочкообразной формы, состоящая из центрального протеолитического ядра, состоящего из четырех кольцевых структур, окруженных двумя цилиндрами, которые избирательно обеспечивают проникновение убиквитилированных белков. Попав внутрь, белки быстро разлагаются на небольшие пептиды (обычно длиной 3–25 аминокислотных остатков). Молекулы убиквитина отщепляются от белка непосредственно перед разрушением и перерабатываются для дальнейшего использования. [67] Хотя большинство белковых субстратов убиквитилированы, существуют примеры неубиквитилированных белков, нацеленных на протеасому. [68] Цепи полиубиквитина распознаются субъединицей протеасомы: S5a/Rpn10. Это достигается за счет мотива, взаимодействующего с убиквитином (UIM), обнаруженного в гидрофобном участке в С-концевой области единицы S5a/Rpn10. [4]

Цепи, связанные с лизином 63, не связаны с протеасомной деградацией белка-субстрата. Вместо этого они позволяют координировать другие процессы, такие как транспорт эндоцитов , воспаление , трансляция и восстановление ДНК . [10] В клетках цепи 63 лизина связаны комплексом ESCRT-0 , что предотвращает их связывание с протеасомой. Этот комплекс содержит два белка, Hrs и STAM1, которые содержат UIM, который позволяет ему связываться с 63-связанными цепями лизина. [69] [70]

Метиониновые 1-связанные (или линейные) полиубиквитиновые цепи представляют собой еще один тип недеградирующих убиквитиновых цепей. В этом случае убиквитин связан по принципу «голова к хвосту», что означает, что С-конец последней молекулы убиквитина напрямую связывается с N-концом следующей молекулы. Хотя первоначально считалось, что они нацелены на белки для протеасомной деградации, [71] позже оказалось, что линейный убиквитин незаменим для передачи сигналов NF-kB. [72] В настоящее время известна только одна убиквитинлигаза Е3, генерирующая М1-связанные полиубиквитиновые цепи, — линейный комплекс сборки убиквитиновых цепей (LUBAC). [39] [73]

Меньше известно об атипичных (не связанных с лизином 48) цепях убиквитина, но исследования начинают предполагать роль этих цепей. [64] Имеются данные о том, что атипичные цепи, связанные лизином 6, 11, 27, 29 и метионином 1, могут вызывать протеасомную деградацию. [68] [74]

Могут быть образованы разветвленные цепи убиквитина, содержащие несколько типов связей. [75] Функция этих цепочек неизвестна. [8]

Структура

[ редактировать ]

По-разному связанные цепи оказывают специфическое воздействие на белок, к которому они прикреплены, что вызвано различиями в конформации белковых цепей. К29-, К33-, [76] K63- и M1-связанные цепи имеют достаточно линейную конформацию; они известны как цепи открытой конформации. К6-, К11- и К48-связанные цепи образуют замкнутые конформации. Молекулы убиквитина в цепях открытой конформации не взаимодействуют друг с другом, за исключением ковалентных изопептидных связей связывающих их . Напротив, замкнутые конформационные цепи имеют границы раздела с взаимодействующими остатками. Изменение конформации цепи обнажает и скрывает различные части белка убиквитина, а различные связи распознаются белками, специфичными для уникальных топологий , присущих этой связи. Белки могут специфически связываться с убиквитином через убиквитин-связывающие домены (UBD). Расстояния между отдельными единицами убиквитина в цепях различаются между 63- и 48-связанными лизиновыми цепями. UBD используют это, имея небольшие спейсеры между взаимодействующими с убиквитином мотивами , которые связывают 48-связанные лизином цепи (компактные убиквитиновые цепи), и более крупные спейсеры для 63-связанных лизиновых цепей. Механизм, участвующий в распознавании полиубиквитиновых цепей, также может различать цепи, связанные с K63, и цепи, связанные с M1, о чем свидетельствует тот факт, что последние могут индуцировать протеасомную деградацию субстрата. [8] [10] [74]

Функция

[ редактировать ]

Система убиквитилирования участвует в самых разных клеточных процессах, включая: [77]

  • Обработка антигена
  • Апоптоз
  • Биогенез органелл
  • Клеточный цикл и деление
  • ДНК Транскрипция и репарация
  • Дифференциация и развитие
  • Иммунный ответ и воспаление
  • Нервная и мышечная дегенерация
  • Поддержание плюрипотентности [78]
  • Морфогенез нейронных сетей
  • Модуляция рецепторов клеточной поверхности, ионных каналов и секреторного пути
  • Реакция на стресс и внеклеточные модуляторы
  • Биогенез рибосом
  • Вирусная инфекция

Мембранные белки

[ редактировать ]

Мультимоноубиквитилирование может маркировать трансмембранные белки (например, рецепторы ) для удаления из мембран (интернализация) и выполнять несколько сигнальных ролей внутри клетки. Когда трансмембранные молекулы клеточной поверхности метятся убиквитином, субклеточная локализация белка изменяется, часто нацеливаясь на белок для разрушения в лизосомах. Это служит механизмом отрицательной обратной связи, поскольку часто стимуляция рецепторов лигандами увеличивает скорость их убиквитилирования и интернализации. Подобно моноубиквитилированию, лизин-63-связанные полиубиквитиновые цепи также играют роль в транспортировке некоторых мембранных белков. [10] [63] [66] [79]

Геномное обслуживание

[ редактировать ]

Ядерный антиген пролиферирующих клеток (PCNA) представляет собой белок, участвующий в синтезе ДНК . В нормальных физиологических условиях PCNA сумойлируется (посттрансляционная модификация, аналогичная убиквитилированию). Когда ДНК повреждается ультрафиолетовым излучением или химическими веществами, молекула SUMO , прикрепленная к остатку лизина, заменяется убиквитином. Моноубиквитилированный PCNA рекрутирует полимеразы , которые могут осуществлять синтез ДНК с поврежденной ДНК; но это очень подвержено ошибкам, которые могут привести к синтезу мутированной ДНК. Полиубиквитилирование PCNA, связанное с лизином 63, позволяет ему выполнять менее подверженный ошибкам обход мутаций, известный как путь переключения матрицы. [6] [80] [81]

Убиквитилирование гистона H2AX участвует в распознавании повреждений ДНК в результате двухцепочечных разрывов ДНК. Лизин-63-связанные полиубиквитиновые цепи образуются на гистоне H2AX с помощью пары лигаз E2/E3 , Ubc13-Mms2/RNF168. [82] [83] Эта цепочка K63, по-видимому, задействует RAP80, который содержит UIM, а затем RAP80 помогает локализовать BRCA1 . Этот путь в конечном итоге рекрутирует необходимые белки для репарации гомологичной рекомбинации . [84]

Транскрипционная регуляция

[ редактировать ]

Гистоны могут быть убиквитинированы, обычно в форме моноубиквитилирования, хотя встречаются и полиубиквитилированные формы. Убиквитилирование гистонов изменяет структуру хроматина и обеспечивает доступ ферментов, участвующих в транскрипции. Убиквитин на гистонах также действует как сайт связывания для белков, которые либо активируют, либо ингибируют транскрипцию, а также могут вызывать дальнейшие посттрансляционные модификации белка. Все эти эффекты могут модулировать транскрипцию генов. [85] [86]

Деубиквитинирование

[ редактировать ]

Деубиквитинирующие ферменты (деубиквитиназы; DUB) противодействуют убиквитинированию, удаляя убиквитин из белков-субстратов. Это цистеиновые протеазы , которые расщепляют амидную связь между двумя белками. Они очень специфичны, как и лигазы Е3, которые присоединяют убиквитин, и содержат всего несколько субстратов на фермент. Они способны расщеплять как изопептидные (между убиквитином и лизином), так и пептидные связи (между убиквитином и N-концом ). Помимо удаления убиквитина из белков-субстратов, DUB выполняют множество других функций внутри клетки. Убикитин либо экспрессируется в виде нескольких копий, соединенных в цепь (полиубиквитин), либо прикрепленных к субъединицам рибосомы. DUB расщепляют эти белки с образованием активного убиквитина. Они также перерабатывают убиквитин, который был связан с небольшими нуклеофильными молекулами в процессе убиквитилирования. Моноубиквитин образуется из DUB, которые отщепляют убиквитин от свободных цепей полиубиквитина, ранее удаленных из белков. [87] [88]

Убиквитин-связывающие домены

[ редактировать ]
Таблица охарактеризованных убиквитин-связывающих доменов [89]
Домен Количество белков

в протеоме

Длина

(аминокислоты)

Связывание убиквитина

Близость

КИЙ С. cerevisiae : 7

Х. сапиенс : 21

42–43 ~2–160 мкм
ЦЕННОСТЬ С. cerevisiae : 2

Х. сапиенс : 14

135 ~180 мкм
КЛЕЙ С. cerevisiae : ?

Х. мудрый : ?

~135 ~460 мкм
НЗФ С. cerevisiae : 1

Х. сапиенс : 25

~35 ~100–400 мкм
МИР С. cerevisiae : 5

Х. сапиенс : 16

~58 Не известно
ОТЕЦ С. cerevisiae : 10

Х. сапиенс : 98

45–55 ~0,03–500 мкм
УЭВ С. cerevisiae : 2

Х. мудрый : ?

~145 ~100–500 мкм
УИМ С. cerevisiae : 8

Х. сапиенс : 71

~20 ~100–400 мкм
VHS С. cerevisiae : 4

Х. сапиенс : 28

150 Не известно

Убиквитин-связывающие домены (UBD) представляют собой модульные белковые домены, которые нековалентно связываются с убиквитином. Эти мотивы контролируют различные клеточные события. Детальные молекулярные структуры известны для ряда UBD, специфичность связывания определяет их механизм действия и регуляции, а также то, как она регулирует клеточные белки и процессы. [89] [90]

Ассоциации заболеваний

[ редактировать ]

Патогенез

[ редактировать ]

Убиквитиновый путь участвует в патогенезе широкого спектра заболеваний и расстройств, в том числе: [91]

нейродегенерация

[ редактировать ]

Убиквитин участвует в нейродегенеративных заболеваниях, связанных с дисфункцией протеостаза, включая болезнь Альцгеймера , болезнь двигательных нейронов , [92] Болезнь Хантингтона и болезнь Паркинсона . [91] Варианты транскрипта, кодирующие различные изоформы убикилина-1, обнаруживаются при поражениях, связанных с Альцгеймера и Паркинсона . болезнью [93] Было показано, что более высокие уровни убикилина в мозге уменьшают пороки развития белка-предшественника амилоида (APP) , который играет ключевую роль в запуске болезни Альцгеймера. [94] И наоборот, более низкие уровни убикилина-1 в головном мозге были связаны с увеличением пороков развития АРР . [94] Мутация сдвига рамки убиквитина B может привести к тому, что в укороченном пептиде будет отсутствовать С-концевой глицин . этот аномальный пептид, известный как UBB+1 Было показано, что , избирательно накапливается при болезни Альцгеймера и других таупатиях .

Инфекция и иммунитет

[ редактировать ]

Убиквитин и убиквитиноподобные молекулы широко регулируют пути передачи иммунных сигналов практически на всех стадиях, включая устойчивую репрессию, активацию во время инфекции и ослабление после клиренса. Без этой регуляции иммунная активация против патогенов может быть нарушена, что приведет к хроническому заболеванию или смерти. Альтернативно, иммунная система может стать гиперактивированной, а органы и ткани могут подвергнуться аутоиммунному повреждению .

С другой стороны, вирусы должны блокировать или перенаправлять процессы клетки-хозяина, включая иммунитет для эффективной репликации , однако многие вирусы, имеющие отношение к болезням, имеют информационно ограниченные геномы . Из-за очень большого количества ролей в клетке манипулирование системой убиквитина представляет собой эффективный способ для таких вирусов блокировать, подрывать или перенаправлять критические процессы клетки-хозяина для поддержки их собственной репликации. [95]

Белок гена I, индуцируемого ретиноевой кислотой ( RIG-I ), является первичным сенсором иммунной системы для вирусных и других инвазивных РНК в клетках человека. [96] Иммунный сигнальный путь RIG-I-подобного рецептора ( RLR ) является одним из наиболее широко изученных с точки зрения роли убиквитина в иммунной регуляции. [97]

Генетические нарушения

[ редактировать ]
  • Синдром Ангельмана вызван нарушением функции UBE3A , которая кодирует фермент убиквитинлигазы (E3), называемый E6-AP.
  • Синдром фон Хиппеля-Линдау включает разрушение убиквитин-лигазы E3, называемой опухолевым супрессором VHL, или гена VHL .
  • Анемия Фанкони : восемь из тринадцати идентифицированных генов, нарушение которых может вызвать это заболевание, кодируют белки, образующие большой комплекс убиквитинлигазы (Е3).
  • Синдром 3-М — аутосомно-рецессивное заболевание с задержкой роста, связанное с мутациями Cullin7 E3. убиквитинлигазы [98]

Диагностическое использование

[ редактировать ]

Иммуногистохимия с использованием антител к убиквитину позволяет выявить аномальные скопления этого белка внутри клеток, что указывает на болезненный процесс. Эти скопления белка называются тельцами включения (это общий термин для любого микроскопически видимого скопления аномального материала в клетке). Примеры включают в себя:

[ редактировать ]

Посттрансляционная модификация белков является широко используемым механизмом передачи сигналов эукариотических клеток. [99] Убиквитилирование, конъюгация убиквитина с белками , является важнейшим процессом для клеточного цикла развития , а также пролиферации и развития клеток . Хотя убиквитилирование обычно служит сигналом к ​​деградации белка через 26S протеасому , оно также может служить для других фундаментальных клеточных процессов, [99] при эндоцитозе , [100] ферментативная активация [101] и репарация ДНК. [102] Более того, поскольку функция убиквитилирования жестко регулирует клеточный уровень циклинов , ожидается, что его неправильная регуляция будет иметь серьезные последствия. Первые доказательства важности убиквитин/протеасомного пути в онкогенных процессах были получены благодаря высокой противоопухолевой активности ингибиторов протеасом. [103] [104] [105] Различные исследования показали, что дефекты или изменения процессов убиквитилирования обычно связаны с карциномой человека или присутствуют при ней. [106] [107] [108] [109] [110] [111] [112] [113] Злокачественные новообразования могут развиваться в результате потери функции мутации непосредственно в гене-супрессоре опухоли , повышенной активности убиквитилирования и/или косвенного ослабления убиквитилирования из-за мутации в родственных белках. [114]

Мутация с прямой потерей функции убиквитинлигазы E3

[ редактировать ]

Почечно-клеточный рак

[ редактировать ]

Ген VHL ( фон Хиппель-Линдау ) кодирует компонент убиквитинлигазы Е3 . Комплекс VHL нацеливается на члена семейства факторов транскрипции, индуцируемых гипоксией (HIF), для деградации путем взаимодействия с доменом кислородзависимого разрушения в нормоксических условиях. HIF активирует нижестоящие мишени, такие как фактор роста эндотелия сосудов (VEGF), способствуя ангиогенезу . Мутации в VHL предотвращают деградацию HIF и, таким образом, приводят к образованию гиперваскулярных поражений и опухолей почек. [106] [114]

Рак молочной железы

[ редактировать ]

Ген BRCA1 — это еще один ген-супрессор опухоли у людей, который кодирует белок BRCA1, который участвует в ответе на повреждение ДНК. Белок содержит мотив RING с активностью убиквитинлигазы Е3. BRCA1 может образовывать димер с другими молекулами, такими как BARD1 и BAP1 , благодаря своей активности убиквитилирования. Мутации, влияющие на функцию лигазы, часто обнаруживаются и связаны с различными видами рака. [110] [114]

Циклин Е

[ редактировать ]

Поскольку процессы развития клеточного цикла являются наиболее фундаментальными процессами клеточного роста и дифференцировки и чаще всего изменяются при карциномах человека, ожидается, что белки, регулирующие клеточный цикл, будут находиться под жесткой регуляцией. Уровень циклинов, как следует из названия, высок только в определенный момент клеточного цикла. Это достигается путем постоянного контроля уровней циклинов или CDK посредством убиквитилирования и деградации. Когда циклин E соединяется с CDK2 и фосфорилируется, связанный с SCF белок F-бокса Fbw7 распознает комплекс и, таким образом, нацеливает его на деградацию. Мутации Fbw7 были обнаружены более чем в 30% опухолей человека, что характеризует его как белок-супрессор опухолей. [113]

Повышенная убиквитинирующая активность

[ редактировать ]

Рак шейки матки

[ редактировать ]

Известно, что онкогенные типы вируса папилломы человека (ВПЧ) захватывают клеточный путь убиквитин- протеасомы для вирусной инфекции и репликации. Белки E6 ВПЧ связываются с N-концом клеточной убиквитинлигазы E6-AP E3, перенаправляя комплекс на связывание p53 , хорошо известного гена-супрессора опухолей, инактивация которого обнаруживается при многих типах рака. [108] Таким образом, р53 подвергается убиквитилированию и деградации, опосредованной протеасомами. Между тем, E7, еще один из рано экспрессируемых генов ВПЧ, будет связываться с Rb , также геном-супрессором опухоли, опосредуя его деградацию. [114] Потеря p53 и Rb в клетках обеспечивает безграничную пролиферацию клеток.

регуляция р53

[ редактировать ]

Амплификация гена часто происходит при различных опухолях, в том числе при MDM2 , гене, кодирующем убиквитинлигазу RING E3, ответственную за подавление активности р53. MDM2 нацелен на p53 для убиквитилирования и протеасомной деградации, тем самым поддерживая его уровень, соответствующий нормальному состоянию клеток. Сверхэкспрессия MDM2 вызывает потерю активности р53 и, следовательно, позволяет клеткам иметь безграничный репликационный потенциал. [109] [114]

стр.27

[ редактировать ]

Другим геном, являющимся мишенью амплификации генов, является SKP2 . SKP2 представляет собой белок F-box , играющий роль в распознавании субстрата для убиквитилирования и деградации. SKP2 нацелен на p27 Кип-1 , ингибитор циклинзависимых киназ ( CDK ). CDK2/4 взаимодействуют с циклинами E/D соответственно, образуя семейство регуляторов клеточного цикла, которые контролируют прохождение клеточного цикла через фазу G1. Низкий уровень р27 Кип-1 Белок часто обнаруживается при различных видах рака и возникает из-за сверхактивации убиквитин-опосредованного протеолиза за счет сверхэкспрессии SKP2. [111] [114]

Эфп

[ редактировать ]

Efp , или эстроген-индуцируемый белок RING-finger, представляет собой убиквитинлигазу E3, чрезмерная экспрессия которой, как было показано, является основной причиной эстроген -независимого рака молочной железы . [105] [115] Субстратом Efp является белок 14-3-3 , который отрицательно регулирует клеточный цикл.

Уклонение от убиквитинирования

[ редактировать ]

Колоректальный рак

[ редактировать ]

Ген, связанный с колоректальным раком, — это аденоматозный полипоз кишечной палочки (APC), который является классическим геном-супрессором опухоли . Продукт гена APC нацелен бета-катенина на деградацию посредством убиквитилирования на N-конце , регулируя тем самым его клеточный уровень. Большинство случаев колоректального рака обнаруживаются при мутациях в гене APC. Однако в тех случаях, когда ген APC не мутирован, мутации обнаруживаются на N-конце бета-катенина, что делает его свободным от убиквитинирования и, следовательно, повышает активность. [107] [114]

Глиобластома

[ редактировать ]

Поскольку наиболее агрессивный рак возникает в головном мозге, мутации, обнаруженные у пациентов с глиобластомой , связаны с делецией части внеклеточного домена рецептора эпидермального фактора роста (EGFR). Эта делеция приводит к тому, что лигаза CBL E3 не может связываться с рецептором для его рециркуляции и деградации по убиквитин-лизосомальному пути. Таким образом, EGFR конститутивно активен в клеточной мембране и активирует ее нижестоящие эффекторы, которые участвуют в пролиферации и миграции клеток. [112]

Зависимое от фосфорилирования убиквитилирование

[ редактировать ]

Взаимодействие между убиквитилированием и фосфорилированием представляет собой постоянный исследовательский интерес, поскольку фосфорилирование часто служит маркером того, что убиквитилирование приводит к деградации. [99] Более того, убиквитилирование также может включать/выключать киназную активность белка. [116] Критическая роль фосфорилирования в значительной степени подчеркнута в активации и снятии аутоингибирования в белке Cbl . [117] Cbl представляет собой убиквитинлигазу E3 с доменом RING-пальца, который взаимодействует со своим тирозинкиназным связывающим доменом (TKB) , предотвращая взаимодействие домена RING с ферментом, конъюгирующим убиквитин E2 . Это внутримолекулярное взаимодействие представляет собой регуляцию аутоингибирования, которая предотвращает его роль негативного регулятора различных факторов роста, передачи сигналов тирозинкиназы и активации Т-клеток . [117] Фосфорилирование Y363 снимает аутоингибирование и усиливает связывание с E2. [117] Было показано, что мутации, которые приводят к дисфункции белка Cbl из-за потери его лигазной/опухолесупрессорной функции и сохранения его положительной сигнальной/онкогенной функции, вызывают развитие рака. [118] [119]

Как мишень для наркотиков

[ редактировать ]

Скрининг субстратов убиквитинлигазы

[ редактировать ]

Нарушение регуляции взаимодействий E3-субстрата является ключевой причиной многих заболеваний человека, поэтому идентификация субстратов лигазы E3 имеет решающее значение. В 2008 году было разработано «Профилирование глобальной стабильности белков (GPS)» для обнаружения субстратов убиквитинлигазы E3. [120] В этой высокопроизводительной системе использовались репортерные белки, независимо слитые с тысячами потенциальных субстратов. За счет ингибирования активности лигазы (посредством создания доминантно-негативного Cul1, таким образом, убиквитинирование не происходит), повышенная репортерная активность показывает, что идентифицированные субстраты накапливаются. Этот подход добавил большое количество новых субстратов к списку субстратов лигазы E3.

Возможное терапевтическое применение

[ редактировать ]

Блокирование распознавания специфических субстратов лигазами Е3, например бортезомибом . [115]

Испытание

[ редактировать ]

Поиск специфической молекулы, которая избирательно ингибирует активность определенной лигазы Е3 и/или белок-белковые взаимодействия, участвующие в заболевании, остается одной из важных и расширяющихся областей исследований. Более того, поскольку убиквитинирование представляет собой многоэтапный процесс с участием различных участников и промежуточных форм, при разработке низкомолекулярных ингибиторов необходимо учитывать очень сложные взаимодействия между компонентами. [105]

Похожие белки

[ редактировать ]

Основная статья: Убиквитиноподобный белок

Убиквитин является наиболее изученным модификатором посттрансляции, однако несколько семейств убиквитиноподобных белков (UBL) могут модифицировать клеточные мишени параллельным, но разными путями. Известные UBL включают: малый убиквитиноподобный модификатор ( SUMO ), перекрестно-реактивный белок убиквитина (UCRP, также известный как стимулируемый интерфероном ген-15 ISG15 ), связанный с убиквитином модификатор-1 ( URM1 ), экспрессируемый клетками-предшественниками нейронов. белок-8 с пониженной регуляцией развития ( NEDD8 , также называемый Rub1 у S. cerevisiae ), человеческий лейкоцитарный антиген F-ассоциированный ( FAT10 ), аутофагия-8 ( ATG8 ) и -12 ( ATG12 ), малое количество убиквитиноподобного белка ( FUB1 ), MUB (мембранно-заякоренный УБЛ), [121] модификатор складки убиквитина-1 ( UFM1 ) и убиквитиноподобный белок-5 ( UBL5 , который известен как гомологичный убиквитину-1 [Hub1] в S. pombe ). [122] [123] Хотя эти белки имеют лишь ограниченную идентичность первичной последовательности с убиквитином, они тесно связаны в трехмерном отношении. Например, SUMO имеет только 18% идентичности последовательностей, но они содержат одну и ту же структурную складку. Эта складка называется «убиквитиновая складка». FAT10 и UCRP содержат два. Эта компактная глобулярная складка бета-захвата обнаружена в убиквитине, UBL и белках, которые содержат убиквитин-подобный домен, например, в S. cerevisiae белке дупликации тела полюса веретена , Dsk2, и в белке NER, Rad23, оба содержат N-концевые убиквитиновые домены. .

Эти родственные молекулы имеют новые функции и влияют на разнообразные биологические процессы. Существует также перекрестная регуляция между различными путями конъюгации, поскольку некоторые белки могут модифицироваться более чем одним UBL, а иногда даже одним и тем же остатком лизина. Например, модификация SUMO часто действует антагонистически по отношению к модификации убиквитинирования и служит для стабилизации белковых субстратов. Белки, конъюгированные с UBL, обычно не подвергаются деградации протеасомой, а скорее выполняют различные регуляторные функции. Присоединение UBL может изменить конформацию субстрата, повлиять на сродство к лигандам или другим взаимодействующим молекулам, изменить локализацию субстрата и повлиять на стабильность белка.

UBL структурно аналогичны убиквитину и обрабатываются, активируются, конъюгируются и высвобождаются из конъюгатов с помощью ферментативных стадий, которые аналогичны соответствующим механизмам для убиквитина. UBL также транслируются с помощью C-концевых расширений, которые обрабатываются для раскрытия инвариантного C-концевого LRGG. Эти модификаторы имеют свои собственные специфические ферменты E1 (активирующий), E2 (конъюгирующий) и E3 (лигирующий), которые конъюгируют UBL с внутриклеточными мишенями. Эти конъюгаты могут быть обращены UBL-специфичными изопептидазами, механизмы которых аналогичны механизмам деубиквитинирующих ферментов. [77]

У некоторых видов за утилизацию митохондрий сперматозоидов после оплодотворения отвечает распознавание и разрушение митохондрий сперматозоидов с помощью механизма, включающего убиквитин. [124]

Прокариотическое происхождение

[ редактировать ]

Считается, что убиквитин произошел от бактериальных белков, подобных ThiS ( O32583 ). [125] или МоаД ( P30748 ). [126] Эти прокариотические белки, несмотря на небольшую идентичность последовательностей (ThiS имеет 14% идентичность с убиквитином), имеют одну и ту же белковую складку. Эти белки также имеют общий химический состав серы с убиквитином. MoaD, который участвует в биосинтезе молибдоптерина , взаимодействует с MoeB, который действует как фермент, активирующий убиквитин E1 для MoaD, укрепляя связь между этими прокариотическими белками и системой убиквитина. Аналогичная система существует для ThiS с его E1-подобным ферментом ThiF . Также считается, что Saccharomyces cerevisiae белок Urm1 , родственный убиквитину модификатор, представляет собой « молекулярное ископаемое », которое связывает эволюционное родство с прокариотическими убиквитиноподобными молекулами и убиквитином. [127]

У архей есть функционально более близкий гомолог системы модификации убиквитина, где осуществляется «сампилирование» с помощью SAMP (небольших белков-модификаторов архей). Система сампилирования использует только E1 для доставки белков к протеосомам . [128] Протеоархеоты , родственные предку эукариот, обладают всеми ферментами E1, E2 и E3, а также регулируемой системой Rpn11. В отличие от SAMP, которые больше похожи на ThiS или MoaD, убиквитин Proteoarchaeota наиболее похож на эукариотических гомологов. [129]

Прокариотический убиквитиноподобный белок (Pup) и бактериальный убиквитин (UBact)

[ редактировать ]
Основная статья: Прокариотический убиквитиноподобный белок

Прокариотический убиквитиноподобный белок (Pup) представляет собой функциональный аналог убиквитина, который был обнаружен у грамположительных бактерий типа Actinomycetota . Он выполняет одну и ту же функцию (нацеливая белки на деградацию), хотя ферментология убиквитилирования и окукливания различна, и эти два семейства не имеют гомологии. В отличие от трехстадийной реакции убиквитилирования, окукливание требует двух стадий, поэтому в окуклировании участвуют только два фермента.

В 2017 году гомологи Pup были обнаружены в пяти типах грамотрицательных бактерий, в семи типах бактерий-кандидатов и в одном архее. [130] Последовательности гомологов Pup сильно отличаются от последовательностей Pup у грамположительных бактерий и были названы убиквитиновыми бактериями (UBact), хотя еще не доказано, что это различие филогенетически подтверждено отдельным эволюционным происхождением и не имеет экспериментальных подтверждений. . [130]

Обнаружение системы протеасом Pup/UBact как у грамположительных, так и у грамотрицательных бактерий позволяет предположить, что либо система протеасом Pup/UBact развилась у бактерий до разделения на грамположительные и отрицательные клады более 3000 миллионов лет назад, либо, [131] что эти системы были приобретены различными бактериальными линиями посредством горизонтального переноса генов от третьего, пока неизвестного организма. В подтверждение второй возможности два UBact в геноме некультивируемого анаэробного метанотрофного архея были обнаружены локуса (ANME-1; локус CBH38808.1 и локус CBH39258.1 ).

Белки человека, содержащие домен убиквитина

[ редактировать ]

К ним относятся убиквитиноподобные белки.

АНУБЛ1 ; СУМКА1 ; БАТ3/БАГ6 ; C1orf131 ; ДДИ1 ; ДДИ2 ; ФАУ ; ГЕРПУД1 ; ГЕРПУД2 ; ХОПС ; ИКБКБ ; ИСГ15 ; ЛОК391257 ; МИДН ; НЭДД8 ; ОАСЛ ; ПАРК2 ; РАД23А ; РАД23Б ; РПС27А ; САКС ; 8У СФ3А1 ; СУМО1 ; СУМО2 ; СУМО3 ; СУМО4 ; ТМУБ1 ; ТМУБ2 ; УБА52 ; УББ ; ЮБК ; УБД ; УБФД1 ; УБЛ4А ; УБЛ4Б ; УБЛ7 ; УБЛКП1 ; УБКЛН1 ; УБКЛН2 ; УБКЛН3 ; УБКЛН4 ; УБКЛНЛ ; УБТД1 ; УБТД2 ; УХРФ1 ; УХРФ2 ;

[ редактировать ]

Прогнозирование убиквитинирования

[ редактировать ]

В настоящее время доступны следующие программы прогнозирования:

  • UbiPred — это сервер прогнозирования на основе SVM, использующий 31 физико-химический признак для прогнозирования сайтов убиквитилирования. [132]
  • UbPred — это случайного леса система прогнозирования потенциальных сайтов убиквитинирования в белках на основе . Он был обучен на объединенном наборе из 266 неизбыточных экспериментально подтвержденных сайтов убиквитинирования, доступных в результате наших экспериментов и двух крупномасштабных протеомных исследований. [133]
  • CKSAAP_UbSite — это прогнозирование на основе SVM, которое использует в качестве входных данных композицию пар аминокислот, расположенных через k, окружающих сайт запроса (т. е. любой лизин в последовательности запроса), и использует тот же набор данных, что и UbPred. [134]

Подкаст

[ редактировать ]

Исследование протеасомной системы убиквитина было в центре внимания подкаста Dementia Researcher. [135] Подкаст был опубликован 16 августа 2021 года, его вел профессор Селина Рэй из Университетского колледжа Лондона.

См. также

[ редактировать ]

Ссылки

[ редактировать ]
  1. ^ Jump up to: а б Гольдштейн Г., Шайд М., Хаммерлинг У., Шлезингер Д.Х., Найл Х.Д., Бойс Э.А. (январь 1975 г.). «Выделение полипептида, обладающего лимфоцит-дифференцирующими свойствами и, вероятно, универсально представленного в живых клетках» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 72 (1): 11–5. Бибкод : 1975ПНАС...72...11Г . дои : 10.1073/pnas.72.1.11 . ПМЦ   432229 . ПМИД   1078892 .
  2. ^ Уилкинсон К.Д. (октябрь 2005 г.). «Открытие убиквитинзависимого протеолиза» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (43): 15280–2. Бибкод : 2005PNAS..10215280W . дои : 10.1073/pnas.0504842102 . ПМК   1266097 . ПМИД   16230621 .
  3. ^ Jump up to: а б Кимура Ю, Танака К (июнь 2010 г.). «Регуляторные механизмы, участвующие в контроле гомеостаза убиквитина» . Журнал биохимии . 147 (6): 793–8. дои : 10.1093/jb/mvq044 . ПМИД   20418328 .
  4. ^ Jump up to: а б с Гликман М.Х., Чехановер А. (апрель 2002 г.). «Убиквитин-протеасомный протеолитический путь: разрушение ради строительства». Физиологические обзоры . 82 (2): 373–428. doi : 10.1152/physrev.00027.2001 . ПМИД   11917093 .
  5. ^ Jump up to: а б Мухопадхьяй Д., Ризман Х. (январь 2007 г.). «Независимые от протеасом функции убиквитина в эндоцитозе и передаче сигналов». Наука . 315 (5809): 201–5. Бибкод : 2007Sci...315..201M . дои : 10.1126/science.1127085 . ПМИД   17218518 . S2CID   35434448 .
  6. ^ Jump up to: а б с Шнелл Дж. Д., Хике Л. (сентябрь 2003 г.). «Нетрадиционные функции убиквитина и убиквитин-связывающих белков» . Журнал биологической химии . 278 (38): 35857–60. дои : 10.1074/jbc.R300018200 . ПМИД   12860974 .
  7. ^ Jump up to: а б Пиккарт CM, Эддинс MJ (ноябрь 2004 г.). «Убиквитин: структуры, функции, механизмы» . Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Исследования молекулярных клеток . 1695 (1–3): 55–72. дои : 10.1016/j.bbamcr.2004.09.019 . ПМИД   15571809 .
  8. ^ Jump up to: а б с д и Командер Д, Рап М (2012). «Код убиквитина». Ежегодный обзор биохимии . 81 : 203–29. doi : 10.1146/annurev-biochem-060310-170328 . ПМИД   22524316 . S2CID   30693177 .
  9. ^ Jump up to: а б Макдауэлл Г.С., Филпотт А. (август 2013 г.). «Неканоническое убиквитилирование: механизмы и последствия» . Международный журнал биохимии и клеточной биологии . 45 (8): 1833–42. doi : 10.1016/j.biocel.2013.05.026 . ПМИД   23732108 .
  10. ^ Jump up to: а б с д и Миранда М., Соркин А. (июнь 2007 г.). «Регуляция рецепторов и транспортеров путем убиквитинирования: новый взгляд на удивительно похожие механизмы». Молекулярные вмешательства . 7 (3): 157–67. дои : 10.1124/ми.7.3.7 . ПМИД   17609522 .
  11. ^ Jump up to: а б «Нобелевская премия по химии 2004 г.» . Нобелевская премия . Проверено 16 октября 2010 г.
  12. ^ «Нобелевская премия по химии 2004 г.: популярная информация» . Нобелевская премия . Проверено 14 декабря 2013 г.
  13. ^ Цехановер А., Ход Ю., Гершко А. (август 2012 г.). «Термостабильный полипептидный компонент АТФ-зависимой протеолитической системы ретикулоцитов. 1978». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 425 (3): 565–70. дои : 10.1016/j.bbrc.2012.08.025 . ПМИД   22925675 .
  14. ^ Шарп, премьер-министр; Ли, WH (ноябрь 1987 г.). «Молекулярная эволюция генов убиквитина». Тенденции в экологии и эволюции . 2 (11): 328–32. дои : 10.1016/0169-5347(87)90108-X . ПМИД   21227875 .
  15. ^ Jump up to: а б Пиккарт CM (2001). «Механизмы, лежащие в основе убиквитилирования». Ежегодный обзор биохимии . 70 : 503–33. doi : 10.1146/annurev.biochem.70.1.503 . ПМИД   11395416 .
  16. ^ Маротти Л.А., Ньюитт Р., Ван Й., Эберсольд Р., Долман Х.Г. (апрель 2002 г.). «Прямая идентификация сайта убиквитилирования G-белка методом масс-спектрометрии». Биохимия . 41 (16): 5067–74. дои : 10.1021/bi015940q . ПМИД   11955054 .
  17. ^ Jump up to: а б Пэн Дж., Шварц Д., Элиас Дж.Э., Торин CC, Ченг Д., Марсишки Дж., Рулофс Дж., Финли Д., Гиги С.П. (август 2003 г.). «Протеомный подход к пониманию убиквитилирования белков». Природная биотехнология . 21 (8): 921–6. дои : 10.1038/nbt849 . ПМИД   12872131 . S2CID   11992443 .
  18. ^ Брайтшопф К., Бенгал Э., Зив Т., Адмон А., Чехановер А. (октябрь 1998 г.). «Новый сайт убиквитилирования: N-концевой остаток, а не внутренние лизины MyoD, важен для конъюгации и деградации белка» . Журнал ЭМБО . 17 (20): 5964–73. дои : 10.1093/emboj/17.20.5964 . ПМК   1170923 . ПМИД   9774340 .
  19. ^ Блум Дж., Амадор В., Бартолини Ф., ДеМартино Дж., Пагано М. (октябрь 2003 г.). «Протеасомная деградация р21 посредством N-концевого убиквитинилирования» . Клетка . 115 (1): 71–82. дои : 10.1016/S0092-8674(03)00755-4 . ПМИД   14532004 . S2CID   15114828 .
  20. ^ Скальоне К.М., Басрур В., Ашраф Н.С., Конен Дж.Р., Эленитоба-Джонсон К.С., Тоди С.В., Полсон Х.Л. (июнь 2013 г.). «Убиквитин-конъюгирующий фермент (E2) Ube2w убиквитинирует N-конец субстратов» . Журнал биологической химии . 288 (26): 18784–8. дои : 10.1074/jbc.C113.477596 . ПМЦ   3696654 . ПМИД   23696636 .
  21. ^ Саде Р, Брайтшопф К, Беркович Б, Зоаби М, Кравцова-Иванцив Ю, Корницер Д, Шварц А, Чехановер А (октябрь 2008 г.). «N-концевой домен MyoD необходим и достаточен для его зависимой от ядерной локализации деградации с помощью убиквитиновой системы» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (41): 15690–5. Бибкод : 2008PNAS..10515690S . дои : 10.1073/pnas.0808373105 . ПМК   2560994 . ПМИД   18836078 .
  22. ^ Куломб П., Родье Г., Боннейл Э., Тибо П., Мелош С. (июль 2004 г.). «N-концевое убиквитилирование киназы 3, регулируемой внеклеточными сигналами, и р21 направляет их деградацию с помощью протеасомы» . Молекулярная и клеточная биология . 24 (14): 6140–50. дои : 10.1128/MCB.24.14.6140-6150.2004 . ПМК   434260 . ПМИД   15226418 .
  23. ^ Куо М.Л., ден Бестен В., Бертвистл Д., Руссель М.Ф., Шерр С.Дж. (август 2004 г.). «N-концевое полиубиквитилирование и деградация супрессора опухоли Arf» . Гены и развитие . 18 (15): 1862–74. дои : 10.1101/gad.1213904 . ПМК   517406 . ПМИД   15289458 .
  24. ^ Бен-Саадон Р., Фаджерман И., Зив Т., Хеллман У., Шварц А.Л., Чехановер А. (октябрь 2004 г.). «Белок-супрессор опухоли p16 (INK4a) и онкопротеин-58 E7 вируса папилломы человека представляют собой природные белки, не содержащие лизина, которые расщепляются убиквитиновой системой. Прямые доказательства убиквитилирования по N-концевому остатку» . Журнал биологической химии . 279 (40): 41414–21. дои : 10.1074/jbc.M407201200 . ПМИД   15254040 .
  25. ^ Ли Х., Окамото К., Пирт М.Дж., Привес К. (февраль 2009 г.). «Лизин-независимый оборот циклина G1 может быть стабилизирован субъединицами B'альфа протеинфосфатазы 2А» . Молекулярная и клеточная биология . 29 (3): 919–28. дои : 10.1128/MCB.00907-08 . ПМК   2630686 . ПМИД   18981217 .
  26. ^ Райнштейн Э., Шеффнер М., Орен М., Чехановер А., Шварц А. (ноябрь 2000 г.). «Деградация онкобелка вируса папилломы человека E7 системой убиквитин-протеасома: нацеливание посредством убиквитилирования N-концевого остатка» . Онкоген . 19 (51): 5944–50. дои : 10.1038/sj.onc.1203989 . ПМИД   11127826 .
  27. ^ Авиэль С., Винберг Г., Массуччи М., Чехановер А. (август 2000 г.). «Деградация латентного мембранного белка 1 вируса Эпштейна-Барра (LMP1) по пути убиквитин-протеасома. Нацеливание посредством убиквитилирования N-концевого остатка» . Журнал биологической химии . 275 (31): 23491–9. дои : 10.1074/jbc.M002052200 . ПМИД   10807912 .
  28. ^ Икеда М., Икеда А., Лонгнекер Р. (август 2002 г.). «Лизин-независимое убиквитилирование вируса Эпштейна-Барра LMP2A» . Вирусология . 300 (1): 153–9. дои : 10.1006/виро.2002.1562 . ПМИД   12202215 .
  29. ^ Ян Дж, Хун Й, Ван В, Ву В, Чи Й, Цзун Х, Конг Х, Вэй Й, Юн Х, Ченг С, Чен К, Гу Дж (май 2009 г.). «HSP70 защищает BCL2L12 и BCL2L12A от N-концевой протеасомной деградации, опосредованной убиквитилированием» . Письма ФЭБС . 583 (9): 1409–14. дои : 10.1016/j.febslet.2009.04.011 . ПМИД   19376117 . S2CID   32330510 .
  30. ^ Ван Ю, Шао Q, Юй X, Конг В, Хилдрет Дж. Э., Лю Б (май 2011 г.). «N-концевая гемагглютининовая метка делает APOBEC3G с дефицитом лизина устойчивым к деградации, индуцированной ВИЧ-1 Vif, за счет снижения полиубиквитилирования» . Журнал вирусологии . 85 (9): 4510–9. дои : 10.1128/JVI.01925-10 . ПМК   3126286 . ПМИД   21345952 .
  31. ^ Трауш-Азар Дж. С., Лингбек Дж., Чехановер А., Шварц А. Л. (июль 2004 г.). «Убиквитин-протеасомная деградация Id1 модулируется MyoD» . Журнал биологической химии . 279 (31): 32614–9. дои : 10.1074/jbc.M403794200 . ПМИД   15163661 .
  32. ^ Трауш-Азар Дж., Леоне Т.К., Келли Д.П., Шварц А.Л. (декабрь 2010 г.). «Убиквитин-протеасомо-зависимая деградация коактиватора транскрипции PGC-1 {альфа} по N-концевому пути» . Журнал биологической химии . 285 (51): 40192–200. дои : 10.1074/jbc.M110.131615 . ПМК   3001001 . ПМИД   20713359 .
  33. ^ Фаджерман И., Шварц А.Л., Чехановер А. (февраль 2004 г.). «Деградация регулятора развития Id2: нацеливание через N-концевое убиквитилирование». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 314 (2): 505–12. дои : 10.1016/j.bbrc.2003.12.116 . ПМИД   14733935 .
  34. ^ Jump up to: а б с Воспер Дж.М., Макдауэлл Г.С., Хиндли С.Дж., Фиоре-Хериш К.С., Кучерова Р., Хоран И., Филпотт А. (июнь 2009 г.). «Убиквитилирование на канонических и неканонических сайтах нацелено на транскрипционный фактор нейрогенин для убиквитин-опосредованного протеолиза» . Журнал биологической химии . 284 (23): 15458–68. дои : 10.1074/jbc.M809366200 . ПМЦ   2708843 . ПМИД   19336407 .
  35. ^ Jump up to: а б с Макдауэлл Г.С., Куцерова Р., Филпотт А. (октябрь 2010 г.). «Неканоническое убиквитилирование пронейрального белка Ngn2 происходит как в эмбрионах Xenopus, так и в клетках млекопитающих». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 400 (4): 655–60. дои : 10.1016/j.bbrc.2010.08.122 . ПМИД   20807509 .
  36. ^ Тэтхэм М.Х., Плеханова А., Джафрей Э.Г., Салмен Х., Хэй RT (июль 2013 г.). «Ube2W конъюгирует убиквитин с α-аминогруппами N-конца белка» . Биохимический журнал . 453 (1): 137–45. дои : 10.1042/BJ20130244 . ПМЦ   3778709 . ПМИД   23560854 .
  37. ^ Виттал В., Ши Л., Венцель Д.М., Скальоне К.М., Дункан Э.Д., Басрур В., Эленитоба-Джонсон К.С., Бейкер Д., Полсон Х.Л., Бржович П.С., Клевит Р.Э. (январь 2015 г.). «Внутреннее расстройство приводит к убиквитилированию N-конца с помощью Ube2w» . Химическая биология природы . 11 (1): 83–9. дои : 10.1038/nchembio.1700 . ПМК   4270946 . ПМИД   25436519 .
  38. ^ Джонсон Е.С., Ма ПК, Ота И.М., Варшавский А. (июль 1995 г.). «Протеолитический путь, который распознает убиквитин как сигнал деградации» . Журнал биологической химии . 270 (29): 17442–56. дои : 10.1074/jbc.270.29.17442 . ПМИД   7615550 .
  39. ^ Jump up to: а б с Кирисако Т., Камей К., Мурата С., Като М., Фукумото Х., Кани М., Сано С., Токунага Ф., Танака К., Иваи К. (октябрь 2006 г.). «Комплекс убиквитинлигазы собирает линейные полиубиквитиновые цепи» . Журнал ЭМБО . 25 (20): 4877–87. дои : 10.1038/sj.emboj.7601360 . ПМК   1618115 . ПМИД   17006537 .
  40. ^ Jump up to: а б Ван X, господин Р.А., Чуа В.Дж., Либаргер Л., Вирц Э.Дж., Хансен Т.Х. (май 2007 г.). «Убиквитинирование остатков серина, треонина или лизина на цитоплазматическом хвосте может индуцировать ERAD MHC-I с помощью вирусной лигазы E3 mK3» . Журнал клеточной биологии . 177 (4): 613–24. дои : 10.1083/jcb.200611063 . ПМК   2064207 . ПМИД   17502423 .
  41. ^ Кэдвелл К., Коской Л. (июль 2005 г.). «Убиквитинирование нелизиновых остатков вирусной убиквитинлигазой E3» . Наука . 309 (5731): 127–30. Бибкод : 2005Sci...309..127C . дои : 10.1126/science.1110340 . ПМИД   15994556 .
  42. ^ Кэдвелл К., Коской Л. (апрель 2008 г.). «Специфичность убиквитинлигаз Е3, кодируемых саркомой Капоши и кодируемой герпесвирусом, определяется положением остатков лизина или цистеина внутри внутрицитоплазматических доменов их мишеней» . Журнал вирусологии . 82 (8): 4184–9. дои : 10.1128/JVI.02264-07 . ПМК   2293015 . ПМИД   18272573 .
  43. ^ Уильямс С., ван ден Берг М., Шпренгер Р.Р., Дистел Б. (август 2007 г.). «Консервативный цистеин необходим для Pex4p-зависимого убиквитинирования пероксисомального рецептора импорта Pex5p» . Журнал биологической химии . 282 (31): 22534–43. дои : 10.1074/jbc.M702038200 . ПМИД   17550898 .
  44. ^ Карвалью А.Ф., Пинту М.П., ​​Гру К.П., Аленкастр И.С., Франсен М., Са-Миранда К., Азеведо Х.Е. (октябрь 2007 г.). «Убиквитинирование Pex5p млекопитающих, пероксисомального рецептора импорта» . Журнал биологической химии . 282 (43): 31267–72. дои : 10.1074/jbc.M706325200 . ПМИД   17726030 .
  45. ^ Леон С., Субрамани С. (март 2007 г.). «Консервативный остаток цистеина Pichia Pastoris Pex20p необходим для его рециркуляции из пероксисомы в цитозоль» . Журнал биологической химии . 282 (10): 7424–30. дои : 10.1074/jbc.M611627200 . ПМЦ   3682499 . ПМИД   17209040 .
  46. ^ Jump up to: а б Тейт С.В., де Врис Э., Маас С., Келлер А.М., Д'Сантос К.С., Борст Дж. (декабрь 2007 г.). «Индукция апоптоза с помощью Bid требует нетрадиционного убиквитинирования и деградации его N-концевого фрагмента» . Журнал клеточной биологии . 179 (7): 1453–66. дои : 10.1083/jcb.200707063 . ПМК   2373500 . ПМИД   18166654 .
  47. ^ Jump up to: а б Роарк Р., Ицхаки Л., Филпотт А. (декабрь 2012 г.). «Комплексная регуляция контролирует протеолиз нейрогенина3» . Биология Открытая . 1 (12): 1264–72. дои : 10.1242/bio.20121750 . ПМЦ   3522888 . ПМИД   23259061 .
  48. ^ Магадан Х.Г., Перес-Виктория Ф.Дж., Сугра Р., Йе Ю, Штребель К., Бонифачино Х.С. (апрель 2010 г.). «Многоуровневый механизм подавления CD4 с помощью Vpu ВИЧ-1, включающий отдельные этапы удержания ER и этапы нацеливания на ERAD» . ПЛОС Патогены . 6 (4): e1000869. дои : 10.1371/journal.ppat.1000869 . ПМК   2861688 . ПМИД   20442859 .
  49. ^ Токарев А.А., Мунгия Дж., Гуателли Дж.К. (январь 2011 г.). «Убиквитинирование серин-треонина опосредует подавление BST-2/тетерина и облегчение ограниченного высвобождения вирионов с помощью Vpu ВИЧ-1» . Журнал вирусологии . 85 (1): 51–63. дои : 10.1128/JVI.01795-10 . ПМК   3014196 . ПМИД   20980512 .
  50. ^ Исикура С., Вайсман А.М., Бонифачино Дж.С. (июль 2010 г.). «Остатки серина в цитозольном хвосте альфа-цепи рецептора Т-клеточного антигена опосредуют убиквитинирование и деградацию несобранного белка, связанную с эндоплазматическим ретикулумом» . Журнал биологической химии . 285 (31): 23916–24. дои : 10.1074/jbc.M110.127936 . ПМЦ   2911338 . ПМИД   20519503 .
  51. ^ Симидзу Ю., Окуда-Симидзу Ю., Хендершот Л.М. (декабрь 2010 г.). «Убиквитилирование субстрата ERAD происходит по нескольким типам аминокислот» . Молекулярная клетка . 40 (6): 917–26. doi : 10.1016/j.molcel.2010.11.033 . ПМК   3031134 . ПМИД   21172657 .
  52. ^ Дикич И., Робертсон М. (март 2012 г.). «Убиквитинлигазы и не только» . БМК Биология . 10:22 . дои : 10.1186/1741-7007-10-22 . ПМК   3305657 . ПМИД   22420755 .
  53. ^ Шульман Б.А., Харпер Дж.В. (май 2009 г.). «Активация убиквитиноподобного белка ферментами E1: вершина последующих сигнальных путей» . Nature Reviews Молекулярно-клеточная биология . 10 (5): 319–31. дои : 10.1038/nrm2673 . ПМЦ   2712597 . ПМИД   19352404 .
  54. ^ Гроетруп М., Пельцер С., Шмидтке Г., Хофманн К. (май 2008 г.). «Активация семейства убиквитинов: UBA6 бросает вызов этой области» . Тенденции биохимических наук . 33 (5): 230–7. дои : 10.1016/j.tibs.2008.01.005 . ПМИД   18353650 .
  55. ^ ван Вейк С.Дж., Тиммерс Х.Т. (апрель 2010 г.). «Семейство убиквитин-конъюгирующих ферментов (E2): решение между жизнью и смертью белков» . Журнал ФАСЭБ . 24 (4): 981–93. дои : 10.1096/fj.09-136259 . ПМИД   19940261 . S2CID   21280193 .
  56. ^ Мецгер М.Б., Христова В.А., Вайсман А.М. (февраль 2012 г.). «Краткий обзор семейств убиквитинлигаз E3 HECT и RING Finger» . Журнал клеточной науки . 125 (Часть 3): 531–7. дои : 10.1242/jcs.091777 . ПМЦ   3381717 . ПМИД   22389392 .
  57. ^ Скаар-младший, Пагано М (декабрь 2009 г.). «Контроль роста клеток с помощью убиквитинлигаз SCF и APC/C» . Современное мнение в области клеточной биологии . 21 (6): 816–24. дои : 10.1016/j.ceb.2009.08.004 . ПМК   2805079 . ПМИД   19775879 .
  58. ^ Кершер О., Фельбербаум Р., Хохштрассер М. (2006). «Модификация белков убиквитином и убиквитиноподобными белками». Ежегодный обзор клеточной биологии и биологии развития . 22 : 159–80. doi : 10.1146/annurev.cellbio.22.010605.093503 . ПМИД   16753028 .
  59. ^ Коегль М., Хоппе Т., Шленкер С., Ульрих Х.Д., Майер Т.У., Йентш С. (март 1999 г.). «Новый фактор убиквитинирования, Е4, участвует в сборке мультиубиквитиновой цепи» . Клетка . 96 (5): 635–44. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80574-7 . ПМИД   10089879 .
  60. ^ Лай З., Ферри К.В., Даймонд М.А., Ви К.Е., Ким Ю.Б., Ма Дж., Ян Т., Бенфилд П.А., Коупленд Р.А., Огер К.Р. (август 2001 г.). «Человеческий mdm2 опосредует множественное моноубиквитинирование р53 по механизму, требующему изомеризации фермента» . Журнал биологической химии . 276 (33): 31357–67. дои : 10.1074/jbc.M011517200 . ПМИД   11397792 .
  61. ^ Гроссман С.Р., Деато М.Э., Бриньон С., Чан Х.М., Кунг А.Л., Тагами Х., Накатани Ю., Ливингстон Д.М. (апрель 2003 г.). «Полюбиквитинирование р53 за счет активности убиквитинлигазы р300». Наука 300 (5617): 342–4. Бибкод : 2003Sci...300..342G . дои : 10.1126/science.1080386 . ПМИД   12690203 . S2CID   11526100 .
  62. ^ Ши Д., Поп М.С., Куликов Р., Лав И.М., Кунг А.Л., Кунг А., Гроссман С.Р. (сентябрь 2009 г.). «CBP и p300 представляют собой цитоплазматические полиубиквитинлигазы E4 для p53» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 106 (38): 16275–80. Бибкод : 2009PNAS..10616275S . дои : 10.1073/pnas.0904305106 . ПМЦ   2752525 . ПМИД   19805293 .
  63. ^ Jump up to: а б с д и Командер Д (октябрь 2009 г.). «Новая сложность убиквитинирования белков». Труды Биохимического общества . 37 (Часть 5): 937–53. дои : 10.1042/BST0370937 . ПМИД   19754430 .
  64. ^ Jump up to: а б с Икеда Ф, Дикич I (июнь 2008 г.). «Атипичные цепи убиквитина: новые молекулярные сигналы. Серия обзоров «Модификации белков: за пределами обычных подозреваемых»» . Отчеты ЭМБО . 9 (6): 536–42. дои : 10.1038/embor.2008.93 . ПМЦ   2427391 . ПМИД   18516089 .
  65. ^ Сюй П, Пэн Дж (май 2008 г.). «Характеристика структуры полиубиквитиновой цепи методом средней масс-спектрометрии» . Аналитическая химия . 80 (9): 3438–44. дои : 10.1021/ac800016w . ПМЦ   2663523 . ПМИД   18351785 .
  66. ^ Jump up to: а б Хик Л. (март 2001 г.). «Регуляция белка моноубиквитином». Nature Reviews Молекулярно-клеточная биология . 2 (3): 195–201. дои : 10.1038/35056583 . ПМИД   11265249 . S2CID   205013847 .
  67. ^ Лекер С.Х., Голдберг А.Л., Митч В.Е. (июль 2006 г.). «Деградация белка по пути убиквитин-протеасома в норме и при заболеваниях» . Журнал Американского общества нефрологов . 17 (7): 1807–19. дои : 10.1681/ASN.2006010083 . ПМИД   16738015 .
  68. ^ Jump up to: а б Кравцова-Иванцив Ю., Цехановер А (февраль 2012 г.). «Неканонические сигналы на основе убиквитина для протеасомной деградации» . Журнал клеточной науки . 125 (Часть 3): 539–48. дои : 10.1242/jcs.093567 . ПМИД   22389393 .
  69. ^ Натан Дж.А., Ким Х.Т., Тинг Л., Гиги С.П., Голдберг А.Л. (февраль 2013 г.). «Почему клеточные белки, связанные с цепями K63-полиубиквитина, не связываются с протеасомами?» . Журнал ЭМБО . 32 (4): 552–65. дои : 10.1038/emboj.2012.354 . ПМЦ   3579138 . ПМИД   23314748 .
  70. ^ Баче К.Г., Райборг С., Мехлум А., Стенмарк Х. (апрель 2003 г.). «STAM и Hrs представляют собой субъединицы мультивалентного убиквитин-связывающего комплекса на ранних эндосомах» . Журнал биологической химии . 278 (14): 12513–21. дои : 10.1074/jbc.M210843200 . ПМИД   12551915 .
  71. ^ Накамура, Мунехиро; Токунага, Фуминори; Саката, Синъити; Иваи, Казухиро (декабрь 2006 г.). «Взаимная регуляция обычной протеинкиназы С и комплекса убиквитинлигазы» . Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 351 (2): 340–347. дои : 10.1016/j.bbrc.2006.09.163 . ПМИД   17069764 .
  72. ^ Токунага, Саэки, Сатоми, Ёсинори; Камей, Киёко; Като, Митико; Мурата, Ямаока, Сёдзи; Иваи, Казухиро (февраль 2009 г.). «Участие линейного полиубиквитилирования NEMO в активации NF-κB» . Nature Cell Biology 11 ( ): Такао, Тошифуми ; 2 123–132 . .   1465-7392 . ПМИД   19136968 . ​  ​ ​
  73. ^ Герлах, Бьёрн; Кордье, Стефани М.; Шмукле, Анна С.; Эммерих, Кристоф Х.; Ризер, Ева; Хаас, Тобиас Л.; Уэбб, Эндрю И.; Рикард, Джеймс А.; Андертон, Холли; Вонг, Венди В.-Л.; Нахбур, Ули; Гангода, Лахиру; Варнкен, Уве; Перселл, Энтони В.; Силке, Джон (март 2011 г.). «Линейное убиквитинирование предотвращает воспаление и регулирует передачу иммунных сигналов» . Природа . 471 (7340): 591–596. Бибкод : 2011Natur.471..591G . дои : 10.1038/nature09816 . ISSN   0028-0836 . ПМИД   21455173 . S2CID   4384869 .
  74. ^ Jump up to: а б Чжао С., Ульрих Х.Д. (апрель 2010 г.). «Отличные последствия посттрансляционной модификации линейными и K63-связанными полиубиквитиновыми цепями» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 107 (17): 7704–9. Бибкод : 2010PNAS..107.7704Z . дои : 10.1073/pnas.0908764107 . ПМЦ   2867854 . ПМИД   20385835 .
  75. ^ Ким Х.Т., Ким КП, Лледиас Ф., Киселев А.Ф., Скальоне К.М., Сковира Д., Гиги С.П., Гольдберг А.Л. (июнь 2007 г.). «Определенные пары убиквитин-конъюгирующих ферментов (Е2) и убиквитин-белковых лигаз (Е3) синтезируют неразлагаемые раздвоенные убиквитиновые цепи, содержащие все возможные изопептидные связи» . Журнал биологической химии . 282 (24): 17375–86. дои : 10.1074/jbc.M609659200 . ПМИД   17426036 .
  76. ^ Мишель М.А., Эллиотт П.Р., Сватек К.Н., Симичек М., Прунеда Дж.Н., Вагстафф Дж.Л., Фройнд С.М., Командер Д. (апрель 2015 г.). «Сборка и специфическое распознавание k29- и k33-связанного полиубиквитина» . Молекулярная клетка . 58 (1): 95–109. doi : 10.1016/j.molcel.2015.01.042 . ПМК   4386031 . ПМИД   25752577 .
  77. ^ Jump up to: а б «Обзор пути протеасом убиквитина» . Архивировано из оригинала 30 марта 2008 г. Проверено 30 апреля 2008 г.
  78. ^ Бакс, М. (июнь 2019 г.). «Убиквитиновая протеасомная система является ключевым регулятором выживания плюрипотентных стволовых клеток и дифференцировки двигательных нейронов» . Клетки . 8 (6): 581. doi : 10.3390/cells8060581 . ПМК   6627164 . ПМИД   31200561 .
  79. ^ Сони Д., Ван Д.М., Регми СК, Миттал М., Фогель С.М., Шлютер Д., Тируппати К. (май 2018 г.). «Дебиквитиназная функция А20 поддерживает и восстанавливает эндотелиальный барьер после повреждения сосудов легких» . Открытие клеточной смерти . 4 (60): 60. дои : 10.1038/s41420-018-0056-3 . ПМЦ   5955943 . ПМИД   29796309 .
  80. ^ Шахин М., Шанмугам И., Громас Р. (август 2010 г.). «Роль посттрансляционных модификаций PCNA в синтезе транслезий» . Журнал нуклеиновых кислот . 2010 : 1–8. дои : 10.4061/2010/761217 . ПМЦ   2935186 . ПМИД   20847899 .
  81. ^ Джексон С.П., Дюрошер Д. (март 2013 г.). «Регуляция реакций на повреждение ДНК с помощью убиквитина и СУМО» . Молекулярная клетка . 49 (5): 795–807. doi : 10.1016/j.molcel.2013.01.017 . ПМИД   23416108 .
  82. ^ Кэмпбелл С.Дж., Эдвардс Р.А., Люнг CC, Некулай Д., Ходж К.Д., Де-Паганон С., Гловер Дж.Н. (июль 2012 г.). «Молекулярное понимание функции белков, содержащих RING-палец (RNF) hRNF8 и hRNF168, в Ubc13/Mms2-зависимом убиквитилировании» . Журнал биологической химии . 287 (28): 23900–10. дои : 10.1074/jbc.M112.359653 . ПМК   3390666 . ПМИД   22589545 .
  83. ^ Икура Т, Таширо С, Какино А, Сима Х, Джейкоб Н, Амунугама Р, Йодер К, Изуми С, Кураока И, Танака К, Кимура Х, Икура М, Нисикубо С, Ито Т, Муто А, Миягава К, Такеда С , Фишел Р., Игараси К., Камия К. (октябрь 2007 г.). «Зависимое от повреждения ДНК ацетилирование и убиквитинирование H2AX усиливает динамику хроматина» . Молекулярная и клеточная биология . 27 (20): 7028–40. дои : 10.1128/MCB.00579-07 . ПМК   2168918 . ПМИД   17709392 .
  84. ^ Ким Х, Чен Дж, Юй Х (май 2007 г.). «Убиквитин-связывающий белок RAP80 опосредует BRCA1-зависимую реакцию на повреждение ДНК». Наука . 316 (5828): 1202–5. Бибкод : 2007Sci...316.1202K . дои : 10.1126/science.1139621 . ПМИД   17525342 . S2CID   31636419 .
  85. ^ Хофманн К. (апрель 2009 г.). «Убиквитин-связывающие домены и их роль в реакции на повреждение ДНК». Восстановление ДНК . 8 (4): 544–56. дои : 10.1016/j.dnarep.2009.01.003 . ПМИД   19213613 .
  86. ^ Хаммонд-Мартель I, Ю Х, Аффар эль Б (февраль 2012 г.). «Роль передачи сигналов убиквитина в регуляции транскрипции». Сотовая сигнализация . 24 (2): 410–21. дои : 10.1016/j.cellsig.2011.10.009 . ПМИД   22033037 .
  87. ^ Рейес-Турку Ф.Е., Вентий К.Х., Уилкинсон К.Д. (2009). «Регуляция и клеточная роль убиквитин-специфичных деубиквитинирующих ферментов» . Ежегодный обзор биохимии . 78 : 363–97. doi : 10.1146/annurev.biochem.78.082307.091526 . ПМК   2734102 . ПМИД   19489724 .
  88. ^ Нийман С.М., Луна-Варгас, член парламента, Вельдс А., Бруммелькамп Т.Р., Дирак А.М., Сиксма Т.К., Бернардс Р. (декабрь 2005 г.). «Геномный и функциональный перечень деубиквитинирующих ферментов». Клетка . 123 (5): 773–86. дои : 10.1016/j.cell.2005.11.007 . hdl : 1874/20959 . ПМИД   16325574 . S2CID   15575576 ​​.
  89. ^ Jump up to: а б Хике Л., Шуберт Х.Л., Хилл С.П. (август 2005 г.). «Убиквитин-связывающие домены». Nature Reviews Молекулярно-клеточная биология . 6 (8): 610–21. дои : 10.1038/nrm1701 . ПМИД   16064137 . S2CID   3056635 .
  90. ^ Хусняк К, Дикич И (1 января 2012 г.). «Убиквитин-связывающие белки: декодеры убиквитин-опосредованных клеточных функций». Ежегодный обзор биохимии . 81 : 291–322. doi : 10.1146/annurev-biochem-051810-094654 . ПМИД   22482907 .
  91. ^ Jump up to: а б Попович, Д. (ноябрь 2014 г.). «Убиквитинирование в патогенезе и лечении заболеваний» . Природная медицина . 20 (11): 1242–1253. дои : 10.1038/нм.3739 . ПМИД   25375928 . S2CID   205394130 .
  92. ^ Йербери, Джастин (май 2020 г.). «Дисфункция протеомного гомеостаза: объединяющий принцип патогенеза БАС» . Тенденции в нейронауках . 43 (5): 274–284. doi : 10.1016/j.tins.2020.03.002 . ПМИД   32353332 . S2CID   216095994 .
  93. ^ «UBQLN1 убиквилин 1 [Homo sapiens]» . Джин . Национальный центр биотехнологической информации . Проверено 9 мая 2012 г.
  94. ^ Jump up to: а б Стирен Э.С., Эль Аяди А., Сяо Ю., Силлер Э., Ландсверк М.Л., Оберхаузер А.Ф., Баррал Дж.М., Боенинг Д. (октябрь 2011 г.). «Убикилин-1 является молекулярным шапероном белка-предшественника амилоида» . Журнал биологической химии . 286 (41): 35689–98. дои : 10.1074/jbc.M111.243147 . ПМК   3195644 . ПМИД   21852239 .
  95. ^ Хитон С.М., Борг Н.А., Диксит В.М. (январь 2016 г.). «Убиквитин в активации и ослаблении врожденного противовирусного иммунитета» . Журнал экспериментальной медицины . 213 (1): 1–13. дои : 10.1084/jem.20151531 . ПМК   4710203 . ПМИД   26712804 .
  96. ^ Такеучи О, Акира С (март 2010 г.). «Рецепторы распознавания образов и воспаление» . Клетка . 140 (6): 805–20. дои : 10.1016/j.cell.2010.01.022 . ПМИД   20303872 . S2CID   223338 .
  97. ^ Окамото М., Коуваки Т., Фукусима Ю., Осиуми Х. (2018). «Регуляция активации RIG-I посредством K63-связанного полиубиквитинирования» . Границы в иммунологии . 8 : 1942. дои : 10.3389/fimmu.2017.01942 . ПМК   5760545 . ПМИД   29354136 .
  98. ^ Хубер С, Диас-Сантагата Д, Глейзер А, О'Салливан Дж, Браунер Р, Ву К, Сюй Х, Пирс К, Ван Р, Узиелли МЛ, Дагоно Н, Чемайтили Ж, Суперти-Фурга А, Дос Сантос Х, Мегарбане А, Морен Дж., Гиллессен-Кесбах Г., Хеннекам Р., Ван дер Бургт И., Блэк Г.К., Клейтон П.Е., Рид А., Ле Меррер М., Скамблер П.Дж., Мюнних А., Пан ZQ, Винтер Р., Кормье-Дэр В. (октябрь 2005 г.) ). «Идентификация мутаций CUL7 при синдроме 3-М». Природная генетика . 37 (10): 1119–24. дои : 10.1038/ng1628 . ПМИД   16142236 . S2CID   44003147 .
  99. ^ Jump up to: а б с Нгуен Л.К., Колх В., Холоденко Б.Н. (июль 2013 г.). «Когда убиквитинирование встречается с фосфорилированием: взгляд системной биологии на передачу сигналов EGFR/MAPK» . Сотовая связь и сигнализация . 11:52 . дои : 10.1186/1478-811X-11-52 . ПМЦ   3734146 . ПМИД   23902637 .
  100. ^ Соркин А., Го Л.К. (октябрь 2008 г.). «Эндоцитоз и внутриклеточный транспорт ErbB» . Экспериментальные исследования клеток . 314 (17): 3093–106. дои : 10.1016/j.yexcr.2008.07.029 . ПМК   2605728 . ПМИД   18793634 .
  101. ^ Нгуен Л.К., Муньос-Гарсия Х., Маккарио Х., Чехановер А., Колх В., Холоденко Б.Н. (декабрь 2011 г.). «Переключатели, возбудимые реакции и колебания в системе убиквитинирования Ring1B/Bmi1» . PLOS Вычислительная биология . 7 (12): e1002317. Бибкод : 2011PLSCB...7E2317N . дои : 10.1371/journal.pcbi.1002317 . ПМК   3240587 . ПМИД   22194680 .
  102. ^ Чжоу В, Ван X, Розенфельд М.Г. (январь 2009 г.). «Убиквитинирование гистонов H2A в регуляции транскрипции и восстановлении повреждений ДНК». Международный журнал биохимии и клеточной биологии . 41 (1): 12–5. doi : 10.1016/j.biocel.2008.09.016 . ПМИД   18929679 .
  103. ^ Доу QP, Ли Б (август 1999 г.). «Ингибиторы протеасом как потенциальные новые противораковые средства» . Обновления по лекарственной устойчивости . 2 (4): 215–223. дои : 10.1054/drup.1999.0095 . ПМИД   11504494 .
  104. ^ Фрис Э.Г., Вервей Дж. (2000). «Клинические исследования рака 2000: Новые агенты и методы лечения». Обновления по лекарственной устойчивости . 3 (4): 197–201. дои : 10.1054/drup.2000.0153 . ПМИД   11498385 .
  105. ^ Jump up to: а б с Молитесь Т.Р., Парлати Ф., Хуанг Дж., Вонг Б.Р., Паян Д.Г., Беннетт М.К., Иссакани С.Д., Молино С.Д., Демо С.Д. (декабрь 2002 г.). «Регуляторы клеточного цикла убиквитинлигазы E3 как противораковые мишени». Обновления по лекарственной устойчивости . 5 (6): 249–58. дои : 10.1016/s1368-7646(02)00121-8 . ПМИД   12531181 .
  106. ^ Jump up to: а б Клиффорд С.К., Кокман М.Э., Смоллвуд А.С., Моул Д.Р., Вудворд Э.Р., Максвелл П.Х., Рэтклифф П.Дж., Махер Э.Р. (2001). «Контрастные эффекты на регуляцию HIF-1-альфа болезнетворными мутациями pVHL коррелируют с паттернами онкогенеза при болезни фон Хиппеля-Линдау» . Молекулярная генетика человека . 10 (10): 1029–38. дои : 10.1093/hmg/10.10.1029 . ПМИД   11331613 .
  107. ^ Jump up to: а б Спаркс А.Б., Морин П.Дж., Фогельштейн Б., Кинцлер К.В. (март 1998 г.). «Мутационный анализ пути APC/бета-катенин/Tcf при колоректальном раке». Исследования рака . 58 (6): 1130–4. ПМИД   9515795 .
  108. ^ Jump up to: а б Шеффнер М., Хуибрегце Дж.М., Виерстра Р.Д., Хоули П.М. (ноябрь 1993 г.). «Комплекс E6 и E6-AP HPV-16 действует как убиквитин-белковая лигаза при убиквитинировании p53». Клетка . 75 (3): 495–505. дои : 10.1016/0092-8674(93)90384-3 . ПМИД   8221889 . S2CID   27437768 .
  109. ^ Jump up to: а б Моманд Дж., Юнг Д., Вильчински С., Ниланд Дж. (август 1998 г.). «База данных амплификации гена MDM2» . Исследования нуклеиновых кислот . 26 (15): 3453–9. дои : 10.1093/нар/26.15.3453 . ПМЦ   147746 . ПМИД   9671804 .
  110. ^ Jump up to: а б Хасидзуме Р., Фукуда М., Маэда И., Нисикава Х., Ояке Д., Ябуки Ю., Огата Х., Охта Т. (май 2001 г.). «Гетеродимер RING BRCA1-BARD1 представляет собой убиквитинлигазу, инактивированную мутацией, вызванной раком молочной железы» . Журнал биологической химии . 276 (18): 14537–40. дои : 10.1074/jbc.C000881200 . ПМИД   11278247 .
  111. ^ Jump up to: а б Чжу CQ, Блэкхолл Ф.Х., Пинтили М., Айенгар П., Лю Н., Хо Дж., Чомиак Т., Лау Д., Уинтон Т., Шепард Ф.А., Цао М.С. (2004). «Нарушения числа копий гена Skp2 часто встречаются при немелкоклеточной карциноме легкого, а его сверхэкспрессия в опухолях с мутацией ras является плохим прогностическим маркером» . Клинические исследования рака . 10 (6): 1984–91. дои : 10.1158/1078-0432.ccr-03-0470 . ПМИД   15041716 .
  112. ^ Jump up to: а б Шмидт М.Х., Фурнари Ф.Б., Кавени В.К., Бёглер О. (май 2003 г.). «Интенсивность передачи сигналов рецептора эпидермального фактора роста определяет внутриклеточные белковые взаимодействия, убиквитинирование и интернализацию» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 100 (11): 6505–10. Бибкод : 2003PNAS..100.6505S . дои : 10.1073/pnas.1031790100 . ПМК   164476 . ПМИД   12734385 .
  113. ^ Jump up to: а б Кнуутила С, Аалто Й, Аутио К, Бьёркквист АМ, Эль-Рифаи В, Хеммер С, Хухта Т, Кеттунен Е, Киуру-Кулефельт С, Ларраменди МЛ, Лушникова Т, Монни О, Пере Х, Таппер Дж, Таркканен М, Варис А, Васениус В.М., Вольф М., Чжу Ю. (сентябрь 1999 г.). «Потери числа копий ДНК при новообразованиях человека» . Американский журнал патологии . 155 (3): 683–94. дои : 10.1016/S0002-9440(10)65166-8 . ПМК   1866903 . ПМИД   10487825 .
  114. ^ Jump up to: а б с д и ж г Мани А., Гельманн Е.П. (июль 2005 г.). «Путь убиквитин-протеасома и его роль в развитии рака». Журнал клинической онкологии . 23 (21): 4776–89. дои : 10.1200/JCO.2005.05.081 . ПМИД   16034054 .
  115. ^ Jump up to: а б Налепа Дж., Уэйд Харпер Дж. (май 2003 г.). «Терапевтические противораковые мишени выше протеасомы». Обзоры лечения рака . 29 (Приложение 1): 49–57. дои : 10.1016/s0305-7372(03)00083-5 . ПМИД   12738243 .
  116. ^ Витовский Дж. А., Джонсон Г. Л. (январь 2003 г.). «Убиквитилирование MEKK1 ингибирует фосфорилирование MKK1 и MKK4 и активацию путей ERK1/2 и JNK» . Журнал биологической химии . 278 (3): 1403–6. дои : 10.1074/jbc.C200616200 . ПМИД   12456688 .
  117. ^ Jump up to: а б с Кобашигава Ю., Томитака А., Кумета Х., Нода Н.Н., Ямагути М., Инагаки Ф. (декабрь 2011 г.). «Механизмы активации, индуцированные аутоингибированием и фосфорилированием, белка E3 Cbl-b, связанного с раком человека и аутоиммунными заболеваниями» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 108 (51): 20579–84. Бибкод : 2011PNAS..10820579K . дои : 10.1073/pnas.1110712108 . ПМЦ   3251137 . ПМИД   22158902 .
  118. ^ Нимейер СМ, Канг М.В., Шин Д.Х., Фурлан И., Эрлахер М., Бунин Н.Дж., Бунда С., Финклештейн Дж.З., Сакамото К.М., Горр Т.А., Мехта П., Шмид И., Кропшофер Г., Корбачиоглу С., Ланг П.Дж., Кляйн С., Шлегель П.Г. , Хайнцманн А, Шнайдер М, Старый Дж, ван ден Хевел-Эйбринк ММ, Хасле Х, Локателли Ф, Сакаи Д, Аршамбо С, Чен Л, Рассел Р.С., Сибинко С.С., Ох М, Браун Б.С., Флото С, Ло МЛ ( сентябрь 2010 г.). «Зародышевые мутации CBL вызывают аномалии развития и предрасполагают к ювенильному миеломоноцитарному лейкозу» . Природная генетика . 42 (9): 794–800. дои : 10.1038/ng.641 . ПМЦ   4297285 . ПМИД   20694012 .
  119. ^ Калес С.К., Райан П.Е., Нау М.М., Липковиц С. (июнь 2010 г.). «Cbl и миелоидные новообразования человека: онкоген Cbl достигает совершеннолетия» . Исследования рака . 70 (12): 4789–94. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-10-0610 . ПМЦ   2888780 . ПМИД   20501843 .
  120. ^ Йен ХК, Элледж С.Дж. (2008). «Идентификация субстратов убиквитинлигазы SCF путем глобального профилирования стабильности белков». Наука . 322 (5903): 923–9. Бибкод : 2008Sci...322..923Y . дои : 10.1126/science.1160462 . ПМИД   18988848 . S2CID   23586705 .
  121. ^ Даунс Б.П., Саракко С.А., Ли С.С., Кроуэлл Д.Н., Виерстра Р.Д. (сентябрь 2006 г.). «MUB, семейство убиквитиновых белков, которые закрепляются на плазматической мембране посредством пренилирования» . Журнал биологической химии . 281 (37): 27145–57. дои : 10.1074/jbc.M602283200 . ПМИД   16831869 .
  122. ^ Уэлчман Р.Л., Гордон С., Майер Р.Дж. (август 2005 г.). «Убиквитин и убиквитиноподобные белки как многофункциональные сигналы». Nature Reviews Молекулярно-клеточная биология . 6 (8): 599–609. дои : 10.1038/nrm1700 . ПМИД   16064136 . S2CID   7373421 .
  123. ^ Граббе С., Дикич I (апрель 2009 г.). «Функциональные роли белков, содержащих убиквитин-подобный домен (ULD) и убиквитин-связывающий домен (UBD). Химические обзоры . 109 (4): 1481–94. дои : 10.1021/cr800413p . ПМИД   19253967 .
  124. ^ Сутовский П., Морено Р.Д., Рамальо-Сантос Дж., Доминко Т., Симерли С., Шаттен Г. (август 2000 г.). «Убиквитинированные митохондрии сперматозоидов, селективный протеолиз и регуляция митохондриальной наследственности у эмбрионов млекопитающих» . Биология размножения . 63 (2): 582–90. дои : 10.1095/biolreprod63.2.582 . ПМИД   10906068 .
  125. ^ Ван С., Си Дж., Бегли Т.П., Николсон Л.К. (январь 2001 г.). «Структура решения ThiS и последствия для эволюционных корней убиквитина». Структурная биология природы . 8 (1): 47–51. дои : 10.1038/83041 . ПМИД   11135670 . S2CID   29632248 .
  126. ^ Озеро М.В., Вюббенс М.М., Раджагопалан К.В., Шинделин Х. (ноябрь 2001 г.). «Механизм активации убиквитина, выявленный структурой бактериального комплекса MoeB-MoaD». Природа . 414 (6861): 325–9. Бибкод : 2001Natur.414..325L . дои : 10.1038/35104586 . ПМИД   11713534 . S2CID   3224437 .
  127. ^ Хохштрассер М (март 2009 г.). «Происхождение и функции убиквитиноподобных белков» . Природа . 458 (7237): 422–9. Бибкод : 2009Natur.458..422H . дои : 10.1038/nature07958 . ПМК   2819001 . ПМИД   19325621 .
  128. ^ Мопен-Ферлоу Дж. А. (2013). «Архейные протеасомы и сампилирование». Регулируемый протеолиз в микроорганизмах . Субклеточная биохимия. Том. 66. стр. 297–327. дои : 10.1007/978-94-007-5940-4_11 . ISBN  978-94-007-5939-8 . ПМЦ   3936409 . ПМИД   23479445 .
  129. ^ Фукс А.С., Мальдонер Л., Войтынек М., Хартманн М.Д., Мартин Дж. (июль 2018 г.). «Rpn11-опосредованный процессинг убиквитина в системе убиквитинирования предков архей» . Природные коммуникации . 9 (1): 2696. Бибкод : 2018NatCo...9.2696F . дои : 10.1038/s41467-018-05198-1 . ПМК   6043591 . ПМИД   30002364 .
  130. ^ Jump up to: а б Леманн Г., Удасин Р.Г., Ливне И., Чехановер А. (февраль 2017 г.). «Идентификация UBact, убиквитиноподобного белка, а также других гомологичных компонентов системы конъюгации и протеасомы у различных грамотрицательных бактерий». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 483 (3): 946–950. дои : 10.1016/j.bbrc.2017.01.037 . ПМИД   28087277 .
  131. ^ Марин Дж., Баттистуцци Ф.У., Браун AC, Хеджес С.Б. (февраль 2017 г.). «Древо времени прокариотов: новый взгляд на их эволюцию и видообразование» . Молекулярная биология и эволюция . 34 (2): 437–446. дои : 10.1093/molbev/msw245 . ПМИД   27965376 .
  132. ^ Тунг CW, Хо SY (июль 2008 г.). «Компьютерная идентификация сайтов убиквитилирования по белковым последовательностям» . БМК Биоинформатика . 9 : 310. дои : 10.1186/1471-2105-9-310 . ПМЦ   2488362 . ПМИД   18625080 .
  133. ^ Радивояк П., Вачич В., Хейнс С., Коклин Р.Р., Мохан А., Хейен Дж.В., Гебл М.Г., Якучева Л.М. (февраль 2010 г.). «Идентификация, анализ и прогнозирование сайтов убиквитинирования белков» . Белки . 78 (2): 365–80. дои : 10.1002/прот.22555 . ПМК   3006176 . ПМИД   19722269 .
  134. ^ Чен Z, Чен YZ, Ван XF, Ван C, Ян RX, Чжан Z (2011). Братья Ф (ред.). «Прогнозирование сайтов убиквитинирования с использованием состава пар аминокислот, разделенных k-разнесениями» . ПЛОС ОДИН . 6 (7): e22930. Бибкод : 2011PLoSO...622930C . дои : 10.1371/journal.pone.0022930 . ПМК   3146527 . ПМИД   21829559 .
  135. ^ «Эпизод трансляции подкаста Dementia Researcher «Исследование протеасомной системы убиквитина» | Слушайте онлайн бесплатно на SoundCloud» .
[ редактировать ]
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Ubiquitin&oldid=1234899211"
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: b762b4d681dc35589bdfdbad94195c33__1721143500
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/b7/33/b762b4d681dc35589bdfdbad94195c33.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Ubiquitin - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)