✖


Jump to content

Варианты SARS-CoV-2

Страница полузащищена
(Перенаправлено из варианта Covid )
«Новый вариант коронавируса» перенаправляется сюда. Информацию о последних видах коронавируса см. в разделах «Новый коронавирус» и «Коронавирус» .

Часть серии о
COVID-19 пандемия
Научно точная атомная модель внешней структуры SARS-CoV-2. Каждый «шар» — это атом.
Scientifically accurate atomic model of the external structure of SARS-CoV-2. Each "ball" is an atom.
Хронология
Локации
Международный ответ
Медицинский ответ
Варианты
Варианты беспокойства
Другие варианты
Экономические последствия и рецессия
Воздействие
значок вируса Портал COVID-19
Положительные, отрицательные и нейтральные мутации в ходе эволюции коронавирусов, таких как SARS-CoV-2.

Варианты коронавируса 2 тяжелого острого респираторного синдрома ( SARS-CoV-2 ) — это вирусы, которые, хотя и похожи на оригинал, имеют генетические изменения, которые имеют достаточное значение, чтобы заставить вирусологов маркировать их отдельно. SARS-CoV-2 — это вирус, вызывающий коронавирусную болезнь 2019 года (COVID-19). Было заявлено, что некоторые из них имеют особое значение из-за их потенциала повышенной трансмиссивности. [1] повышенная вирулентность или снижение эффективности вакцин против них. [2] [3] Эти варианты способствуют продолжению пандемии COVID-19 .

По состоянию на август 2024 г. ни один вариант не обозначен Всемирной организацией здравоохранения как циркулирующий вызывающий озабоченность вариант , . [4]

Обзор

Происхождение SARS-CoV-2 не установлено. [5] Однако появление SARS-CoV-2 могло быть результатом событий рекомбинации между SARS-подобным коронавирусом летучих мышей и коронавирусом панголинов посредством межвидовой передачи. [6] [7] Самые ранние доступные геномы вируса SARS-CoV-2 были собраны у пациентов в декабре 2019 года, и китайские исследователи сравнили эти ранние геномы со штаммами коронавируса летучих мышей и панголинов, чтобы оценить предковый тип коронавируса человека; идентифицированный предковый тип генома был обозначен как «S», а его доминантный производный тип был обозначен как «L», чтобы отразить мутантные аминокислотные изменения. Независимо западные исследователи провели аналогичный анализ, но обозначили предковый тип «А» и производный тип «Б». Тип B мутировал в другие типы, включая B.1, который является предком основных глобальных вариантов, вызывающих обеспокоенность, обозначенных в 2021 году ВОЗ как варианты альфа , бета , гамма , дельта и омикрон . [8] [9] [10]

В начале пандемии относительно небольшое количество инфекций (по сравнению с более поздними стадиями пандемии) привело к меньшим возможностям для мутации вирусного генома и, следовательно, к меньшим возможностям для возникновения дифференцированных вариантов. [11] Поскольку встречаемость вариантов была более редкой, мутации S-белка в области рецептор-связывающего домена (RBD), взаимодействующей с ACE2, также не были частыми. [12]

Со временем эволюция генома SARS-CoV-2 (посредством случайных мутаций) привела к тому, что мутантные образцы вируса (т. е. генетические варианты), которые оказались более трансмиссивными, были отобраны естественным путем. Примечательно, что варианты Альфа и Дельта оказались более трансмиссивными, чем ранее идентифицированные вирусные штаммы. [13]

Некоторые варианты SARS-CoV-2 считаются вызывающими беспокойство, поскольку они сохраняют (или даже повышают) свою способность к репликации в условиях растущего популяционного иммунитета. [14] либо путем выздоровления от инфекции, либо посредством вакцинации. Некоторые из вызывающих беспокойство вариантов демонстрируют мутации в RBD S-белка. [15]

В следующей таблице представлена ​​информация и относительный риска . уровень [16] для ныне и ранее циркулирующих вызывающих беспокойство вариантов (ЛОС). [а] Интервалы предполагают уровень достоверности или достоверности 95 % , если не указано иное. В настоящее время все оценки являются приблизительными из-за ограниченной доступности данных для исследований. не изменяется Для Альфа, Бета, Гамма и Дельта точность теста . [20] [25] а активность нейтрализующих антител сохраняется у некоторых моноклональных антител. [18] [26] ПЦР-тесты продолжают выявлять вариант Омикрона. [27]

Идентификация [25] Появление Изменения относительно ранее циркулировавших вариантов во время и месте появления Активность нейтрализующих антител (или эффективность, если таковая имеется)
ВОЗ
этикетка 		ЧЕРНЫЙ
родословная 		Следующий штамм
клада 		Первый
вспышка 		Самый ранний
образец [28] 		Обозначенный ЛОС Текущий тираж Заметные мутации Трансмиссивность Госпитализация Смертность От естественного заражения [А] От вакцинации
Дельта Б.1.617.2 ​ 21А  Индия октябрь 2020 г. 6 мая 2021 г. [29] Нет Л452Р, Т478К, П681Р [30] +97% ( 76 – 117% ) [31] +85% ( 39 – 147% ) относительно Альфа [Д] +137% ( 50 – 230% ) [Б] Произошло повторное заражение с меньшей частотой, чем при вакцинированных инфекциях. [И] [34] Снижение эффективности при нетяжелых заболеваниях [25] [34] [Ф]
Омикрон Б.1.1.529 21 тыс.  ЮАР 9 ноября 2021 г. [36] 26 ноября 2021 г. [27] Да P681H, N440K, N501Y, S477N и многие другие. [37] Возможно увеличение [38] −57% ( 59 – 61% ) относительно Дельты [39] −63% ( 69 – 74% ) относительно Дельты [39] Повышенный уровень повторного заражения [38] Снижение эффективности против симптоматического заболевания, неизвестного при тяжелом течении заболевания [38]
Альфа Б.1.1.7 20И (В1)  Великобритания 20 сен 2020 г. [40] 18 декабря 2020 г. [41] Нет 69–70дел, N501Y, P681H [42] [43] +29% ( 24 – 33% ) [31] [Г] +52% ( 47 – 57% ) [ЧАС] [Г] +59% ( 44 – 74% ) [ЧАС] [Г] Минимальное сокращение [18] Минимальное сокращение [18]
Гамма П.1 (Б.1.1.28.1) 20Дж (В3)  Бразилия ноябрь 2020 г. 15 января 2021 г. [45] [46] Нет К417Т, Э484К, Н501Й [42] +38% ( 29 – 48% ) [31] Возможно увеличение [25] +50% (50% CR , 20 – 90% ) [Я] [Дж] Уменьшенный [18] Сохранено многими [К]
Бета Б.1.351 20Ч(В2)  ЮАР май 2020 г. 14 января 2021 г. [47] Нет К417Н, Э484К, Н501Й [42] +25% ( 20 – 30% ) [31] Под следствием [ когда? ] Возможно увеличение [20] [25] Сниженный ответ Т-клеток , вызванный вирусом D614G, остается эффективным. [18] [25] Снижение эффективности против симптоматического заболевания, [Л] сохраняется от тяжелого заболевания [25]

  Очень высокий риск   Высокий риск   Средний риск   Низкий риск   Неизвестный риск

  1. ^ Эффективность естественной инфекции против повторного заражения, если таковая имеется.
  2. ^ Перейти обратно: а б 7 февраля – 22 июня 2021 г., Онтарио. CFR 0,04% для непривитой возрастной группы <50 лет, 6,5% для непривитой возрастной группы >50 лет. [33]
  3. ^ Перейти обратно: а б Различия могут быть обусловлены различной политикой и вмешательствами, принятыми в каждой изучаемой области в разное время, возможностями местной системы здравоохранения или различными вариантами, циркулирующими во время и в месте проведения исследования.
  4. ↑ 1 апреля – 6 июня 2021 г., Шотландия. [32] Другое предварительное исследование, проведенное в Онтарио, показало, что количество госпитализаций по линии Дельта увеличилось на 120% по сравнению с линиями, не относящимися к ЛОС . [Б] [С]
  5. ^ В исследовании, проведенном в Израиле, отслеживалось 46 035 выздоровевших непривитых и 46 035 вакцинированных людей того же возраста, чтобы сравнить частоту заражения у них в период наблюдения. Зафиксировано 640 случаев заражения в группе привитых и 108 случаев заражения в группе выздоровевших.
  6. ^ Умеренно сниженная нейтрализация при использовании Коваксина. [35]
  7. ^ Перейти обратно: а б с Предполагается, что B.1.1.7 с E484K отличается от B.1.1.7 только активностью нейтрализующих антител. [21]
  8. ^ Перейти обратно: а б 23 ноября 2020 г. – 31 января 2021 г., Англия. [44] CFR 0,06% для возрастной группы <50 лет, 4,8% для возрастной группы>50 лет [33]
  9. ^ Заявленный доверительный или вероятный интервал имеет низкую вероятность, поэтому оценочное значение можно понимать только как возможное, а не как определенное или вероятное.
  10. ^ Март 2020 г. - февраль 2021 г., Манаус. [С]
  11. ^ За исключением Pfizer – BioNTech. [20]
  12. ^ Оксфорд-АстраЗенека, Новавакс.

Номенклатура

См. Также: Разговорные названия вариантов SARS-CoV-2.
Соответствующие номенклатуры SARS-CoV-2 [48]
Линии ПАНГО [49] Примечания к линиям ПАНГО [50] Клады следующего штамма, [51] 2021 [52] GISAID Клады Известные варианты
А.1–А.6 19Б С Содержит «эталонную последовательность» WIV04/2019. [53]
Б.3–Б.7 , Б.9 , Б.10 , Б.13–Б.16 19А л
ТО [б]
Б.2 V
Б.1 Б.1.5–Б.1.72 20А Г Lineage B.1 в номенклатурной системе PANGO Lineages; включает Дельту/ Б.1.617 [30] [54]
Б.1.9 , Б.1.13 , Б.1.22 , Б.1.26 , Б.1.37 ГХ
Б.1.3–Б.1.66 20С Включает Эпсилон/ Б.1.427/ Б.1.429/ CAL.20C и Эта/ Б.1.525 [18] [55]
20G Преобладает в США в целом, февраль 21 г. [55]
20 ч. Включает бета-версию/ B.1.351, также известная как линия 20H/501Y.V2 или 501.V2.
Б.1.1 20Б ГР Включает B.1.1.207 [ нужна ссылка ] и Лямбда (линия C.37) [56]
20Д
20Дж Включает Гамму/ П.1 и Зета/ П.2 [57] [58]
20F
20я Включает Альфу/ B.1.1.7, также известный как VOC-202012/01, VOC-20DEC-01 или 20I/501Y.V1
Б.1.177 20E (ЕС1) [52] ГВ [б] Получено из 20А [52]
Древовидная диаграмма линий SARS-CoV-2 согласно номенклатурной системе Панго.

Варианты SARS-CoV-2 сгруппированы в соответствии с их происхождением и компонентными мутациями. [14] Многие организации, в том числе правительства и новостные агентства, в разговорной речи упоминали о вызывающих беспокойство вариантах той страны, в которой они были впервые обнаружены. [60] [61] [62] После нескольких месяцев обсуждений Всемирная организация здравоохранения объявила названия важных штаммов, написанные греческими буквами . 31 мая 2021 года [63] чтобы на них можно было легко ссылаться простым, легким в произнесении и не стигматизирующим образом. [64] [65] Это решение могло быть частично принято из-за критики со стороны правительств по поводу использования названий стран для обозначения вариантов вируса; ВОЗ отметила, что упоминание названий стран может вызвать стигму. [66] После использования всех букв от Альфы до Му (см. ниже), в ноябре 2021 года ВОЗ пропустила следующие две буквы греческого алфавита, Ню и Си, и использовала Омикрон, что вызвало предположение, что Си был пропущен, чтобы не оскорбить китайского лидера Си Цзиньпина. . [67] В ВОЗ объяснили, что Ню слишком легко спутать с «новым», а Си — распространённая фамилия . [67] В случае, если ВОЗ будет использовать весь греческий алфавит, агентство рассмотрело возможность называть будущие варианты в честь созвездий . [68]

Различные варианты SARS-CoV-2, о которых официально сообщили CDC и NIH в мае 2021 года в связи с мутациями L452R и E484K.

Родословные и клады

Хотя существуют многие тысячи вариантов SARS-CoV-2, [69] подтипы вируса можно объединить в более крупные группы, такие как линии или клады . [с] Три основные, обычно используемые номенклатуры. [70] были предложены:

  • По состоянию на январь 2021 г. , GISAID — SARS-CoV-2 обозначается как hCoV-19. [50] — выделил восемь глобальных клад (S, O, L, V, G, GH, GR и GV). [71]
  • В 2017 году Хэдфилд и др. анонсировала Nextstrain , предназначенную «для отслеживания эволюции патогенов в режиме реального времени». [72] Позже штамм Nextstrain использовался для отслеживания SARS-CoV-2, идентифицировав 13 основных клад. [д] (19A–B, 20A–20J и 21A) по состоянию на июнь 2021 г. . [73]
  • В 2020 году Рамбо и др. Филогенетического присвоения названных линий глобальной вспышки (ПАНГОЛИН) [74] команда разработчиков программного обеспечения, предложенная в статье [49] «динамическая номенклатура линий SARS-CoV-2, ориентированная на активно циркулирующие линии вируса и те, которые распространяются в новые места»; [70] по состоянию на август 2021 г. было обозначено 1340 линий передачи. [75] [76]

Каждый национальный институт общественного здравоохранения может также создать свою собственную систему номенклатуры для целей отслеживания конкретных вариантов. Например, Служба общественного здравоохранения Англии обозначила каждый отслеживаемый вариант по году, месяцу и номеру в формате [ГГГГ] [ММ]/[NN] с префиксом «VUI» или «VOC» для варианта, находящегося в стадии расследования, или варианта, вызывающего беспокойство, соответственно. [19] Сейчас эта система была модифицирована и теперь использует формат [ГГ] [МММ]-[NN], где месяц записывается с помощью трехбуквенного кода. [19]

Классификация вариантов

Варианты, которые соответствуют одному или нескольким конкретным критериям, рассматриваемым во время пандемии COVID-19, могут быть помечены как «варианты, представляющие интерес» или «варианты, находящиеся на стадии исследования» («VUI») в ожидании проверки и подтверждения этих свойств. После проверки интересующие варианты /VUI могут быть переименованы в «варианты, вызывающие беспокойство» контролирующими организациями, такими как CDC в США. [77] [78] [79] Сопутствующей категорией является «вариант с высокими последствиями», который используется CDC, если есть явные доказательства того, что эффективность мер профилактики или вмешательства для конкретного варианта существенно снижается. [80]

Эталонная последовательность

Поскольку в настоящее время неизвестно, когда произошел индексный случай или «нулевой пациент», выбор эталонной последовательности для данного исследования является относительно произвольным, при этом выбор различных известных исследований варьируется следующим образом:

  • Самая ранняя последовательность, Ухань-1 , была получена 24 декабря 2019 года. [81]
  • Одна группа (Судхир Кумар и др.) [81] широко относится к NCBI эталонному геному (GenBankID:NC_045512; идентификатор GISAID: EPI_ISL_402125), [82] этот образец был собран 26 декабря 2019 г., [83] хотя они также использовали эталонный геном WIV04 GISAID (ID: EPI_ISL_402124), [84] в своих анализах. [85]
  • По данным другого источника (Жукова и др.), последовательность WIV04/2019 , принадлежащая кладе GISAID S/ линии PANGO A/ кладу Nextstrain 19B, считается наиболее точно отражающей последовательность исходного вируса, инфицирующего человека, известного как « нулевая последовательность». [53] Образец WIV04/2019 был взят у пациента с симптомами заболевания 30 декабря 2019 года и широко используется (особенно теми, кто сотрудничает с GISAID). [86] в качестве эталонной последовательности . [53]

Вариант, впервые отобранный и идентифицированный в Ухане, Китай, как полагают исследователи, отличается от генома-прародителя тремя мутациями. [81] [87] Впоследствии появилось множество различных линий SARS-CoV-2. [75]

Критерии известности

Вирусы обычно со временем мутируют, порождая новые варианты. Когда в популяции появляется новый вариант, его можно назвать «новым вариантом». В случае с SARS-CoV-2 новые линии часто отличаются друг от друга всего на несколько нуклеотидов. [14]

Некоторые из потенциальных последствий появления новых вариантов следующие: [42] [88]

  • Повышенная трансмиссивность
  • Повышенная заболеваемость
  • Повышенная смертность
  • Возможность уклониться от обнаружения с помощью диагностических тестов.
  • Снижение чувствительности к противовирусным препаратам (если и когда такие препараты доступны)
  • Снижение чувствительности к нейтрализующим антителам, как терапевтическим (например, плазма выздоравливающих или моноклональные антитела), так и в лабораторных экспериментах.
  • Способность уклоняться от естественного иммунитета (например, вызывая повторные инфекции)
  • Способность заразить вакцинированных лиц.
  • Повышенный риск определенных состояний, таких как мультисистемный воспалительный синдром или длительный COVID .
  • Повышенная близость к определенным демографическим или клиническим группам, таким как дети или люди с ослабленным иммунитетом.

Варианты, которые соответствуют одному или нескольким из этих критериев, могут быть помечены как «варианты, находящиеся на стадии исследования» или «варианты, представляющие интерес» в ожидании проверки и подтверждения этих свойств. Основная характеристика интересующего варианта заключается в том, что он демонстрирует доказательства, доказывающие, что он является причиной увеличения доли случаев или уникальных кластеров вспышек; однако она также должна иметь ограниченную распространенность или распространение на национальном уровне, иначе классификация будет повышена до « варианта, вызывающего обеспокоенность ». [19] [78] Если есть явные доказательства того, что эффективность мер профилактики или вмешательства для конкретного варианта существенно снижается, этот вариант называется «вариантом с высокими последствиями». [18]

Варианты, вызывающие обеспокоенность (ВОЗ)

По состоянию на 28 июня 2024 г. , Всемирная организация здравоохранения не перечислила никаких вызывающих беспокойство вариантов (ЛОС). [4] Другие организации, такие как CDC в США, обычно определяют свои варианты несколько иначе; например, CDC деэскалировал вариант Дельта 14 апреля 2022 года, [18] а ВОЗ сделала это 7 июня 2022 года.

в искусственных цветах Трансмиссионная электронная микрофотография варианта коронавируса B.1.1.7 . Считается, что повышенная трансмиссивность этого варианта связана с изменениями в структуре белков-шипов, показанных здесь зеленым цветом.

ВОЗ регулярно публикует обновления. [17]

Обзор исторических вариантов, вызывающих озабоченность или находящихся под наблюдением

Омикрон

Основная статья: Вариант SARS-CoV-2 Омикрон

Родословная B.1.1.529

Вариант Омикрона, известный как линия B.1.1.529, был объявлен Всемирной организацией здравоохранения вариантом, вызывающим обеспокоенность, 26 ноября 2021 года. [89]

Этот вариант имеет большое количество мутаций , некоторые из которых вызывают беспокойство. Некоторые данные показывают, что этот вариант имеет повышенный риск повторного заражения . В настоящее время проводятся исследования для оценки точного влияния на заразность, смертность и другие факторы. [90]

Назван Омикрон ВОЗ, [89] [91] он был идентифицирован в ноябре 2021 года в Ботсване и Южной Африке ; [92] один случай был доставлен в Гонконг , [93] [94] [95] один подтвержденный случай был выявлен в Израиле у путешественника, вернувшегося из Малави , [96] вместе с двумя, вернувшимися из Южной Африки, и одним с Мадагаскара. [97] Бельгия подтвердила первый выявленный случай заболевания в Европе 26 ноября 2021 года у человека, вернувшегося из Египта 11 ноября. [98] Индийский консорциум по геномике SARS-CoV-2 (INSACOG) в своем бюллетене за январь 2022 года отметил, что Омикрон находится в передаче среди населения в Индии, где количество новых случаев растет в геометрической прогрессии. [99]

БА. сублинии

По данным ВОЗ, по состоянию на февраль 2022 года наиболее распространенными сублиниями Omicron во всем мире были BA.1, BA.1.1 и BA.2. . [100] BA.2 содержит 28 уникальных генетических изменений, в том числе четыре в шиповатом белке, по сравнению с BA.1, который уже приобрел 60 мутаций со времен предкового штамма Ухань, в том числе 32 в шиповатом белке. [101] BA.2 более передается, чем BA.1. [102] К середине марта 2022 года он вызывал большинство случаев заболевания в Англии, а к концу марта BA.2 стал доминирующим в США. [103] [101] По состоянию на май 2022 г. подлинии от BA.1 до BA.5, включая всех их потомков, классифицируются ВОЗ как варианты, вызывающие обеспокоенность, [94] Центр по контролю и профилактике заболеваний, [18] и ECDC [104] (за исключением BA.3).

Дальнейшие сублинии появятся в 2022 году

В течение 2022 года в разных местах появился ряд новых штаммов, в том числе XBB.1.5, который произошел от штамма XBB компании Omicron. Первый случай XBB в Англии был обнаружен в образце, взятом 10 сентября 2022 года, и с тех пор новые случаи были выявлены в большинстве регионов Англии. К концу года на XBB.1.5 приходилось 40,5% новых случаев в США и он был доминирующим штаммом; вызывающий беспокойство вариант BQ.1 наблюдался на уровне 18,3%, а BQ.1.1 представлял собой 26,9% новых случаев, в то время как штамм BA.5 снижался - 3,7%. На этом этапе во многих других странах это было редкостью, например, в Великобритании на него приходилось около 7% новых случаев, согласно данным секвенирования UKHSA. [105]

22 декабря 2022 года Европейский центр по контролю заболеваний написал в сводке, что на штаммы XBB приходится около 6,5% новых случаев в пяти странах ЕС с достаточным объемом секвенирования или генотипирования для получения оценок. [105]

В 2023 году появятся дальнейшие подлинии: EG.5 «Эрис», BA.2.86 и JN.1 «Пирола».

В течение 2023 года SARS-CoV-2 продолжал циркулировать среди населения мира и развиваться, при этом в заголовки газет попал ряд новых штаммов. Снижены темпы тестирования, секвенирования и отчетности. [106]

EG.5 , подвариант XBB.1.9.2 (в некоторых СМИ прозванный «Эридой»). [107] ) появился в феврале 2023 года. [108] 6   августа 2023 года Агентство безопасности здравоохранения Великобритании сообщило, что штамм EG.5 стал причиной каждого седьмого нового случая заболевания в Великобритании в третью неделю июля. [109]

Основная статья: BA.2.86

BA.2.86 был впервые обнаружен в образце 24   июля 2023 года и 17 августа 2023 года был обозначен как вариант, находящийся под наблюдением Всемирной организации здравоохранения. [110]

«JN.1» перенаправляется сюда. Чтобы узнать о других значениях, см. JN1 (значения) .

JN.1 (иногда называемый «Пирола»), подвариант BA.2.86 Omicron, появился в августе 2023 года в Люксембурге. К декабрю 2023 года он был обнаружен в 12 странах, включая Великобританию и США. [111] [112] 19 декабря ВОЗ объявила JN.1 представляющим интерес вариантом, независимым от его родительского штамма BA.2.86, но общий риск для здоровья населения был определен как низкий. [113] Поскольку на JN.1 приходится около 60% случаев в Сингапуре, в декабре 2023 года Сингапур и Индонезия рекомендовали носить маски в аэропортах. [114] По оценкам CDC , на этот вариант приходилось 44% случаев в США 22 декабря 2023 года и 62% случаев 5 января 2024 года. [115]

По состоянию на 9 февраля 2024 г. По оценкам ВОЗ, JN.1 является наиболее распространенным вариантом SARS-CoV-2 (распространенность 70–90% в четырех из шести регионов мира; недостаточно данных в регионах Восточного Средиземноморья и Африки). Ожидалось, что общий уровень популяционного иммунитета и иммунитета от XBB.1.5 бустерных версий вакцины против COVID-19 обеспечит некоторую защиту (перекрестную реактивность) в отношении JN.1. [116]

В 2024 году появятся следующие подлинии: KP.1.1, KP.2 («FLiRT»), KP.3 («FLuQE»).

В конце апреля 2024 года данные CDC показали, что KP.2 является наиболее распространенным вариантом в США: в четверти всех случаев он опережает JN.1. KP1.1 составил 7 процентов случаев в США. [117] Эти два варианта известны как варианты FLiRT , поскольку они характеризуются мутацией фенилаланина (F) на лейцин (L) и мутацией аргинина (R) на треонин (Т) в белке-шипе вируса. [118] К июлю 2024 года потомок FLiRT с дополнительным аминокислотным изменением в белке-шипе Q493E получил названия KP.3 и FluQE и стал основным вариантом в Новом Южном Уэльсе во время австралийской зимы. Первоначальные исследования показали, что изменение Q493E может помочь FluQE более эффективно связываться с клетками человека, чем FLiRT. [119]

Варианты Омикрона под наблюдением (ВОЗ, 2022/2023 г.)

25 мая 2022 года Всемирная организация здравоохранения ввела новую категорию для потенциально опасных подлиний широко распространенных вызывающих озабоченность вариантов, первоначально называвшуюся линиями ЛОС, находящимися под наблюдением (VOC-LUM). Это решение было принято с учетом того, что в феврале 2022 года более 98% всех секвенированных GISAID образцов принадлежали к семейству Omicron, внутри которого происходила большая часть эволюции вариантов. [120] К 9 февраля 2023 года категория была переименована в «Варианты Omicron, находящиеся под наблюдением». [121]

По состоянию на 9 февраля 2023 г. [121]
Родословная Панго Клада GISAID Клада Nextstrain Связь с циркулирующими ЛОС Впервые задокументировано Примечательные особенности
БФ.7 ИГРА 22Б Подлиния BA.5 2022-01-24 ВА.5 + С:Р346Т
БК.1 ИГРА 22Е Подлиния BA.5 2022-02-07 BQ.1 и BQ.1.1: BA.5 + S:R346T, S:K444T, S:N460K
ВА.2.75 ИГРА 22Д Подлиния BA.2 2021-12-31 BA.2.75: BA.2 + S:K147E, S:W152R, S:F157L, S:I210V, S:G257S, S:D339H, S:G446S, S:N460K, S:Q493R реверсия
Гл.1.1 ИГРА 22Д Подлиния BA.2 2022-07-20 BA.2.75 + S:L452R, S:F486S
XBB ИГРА 22F Рекомбинант подлиний BA.2.10.1 и BA.2.75, т.е. BJ1 и BM.1.1.1, с точкой разрыва в S1. 2022-08-13 BA.2+ S:V83A, S:Y144-, S:H146Q, S:Q183E, S:V213E, S:G252V, S:G339H, S:R346T, S:L368I, S:V445P, S:G446S, S :N460K, S:F486S, S:F490S
ХВВ.1.5 ИГРА 23А Рекомбинант подлиний BA.2.10.1 и BA.2.75, т.е. BJ1 и BM.1.1.1, с точкой разрыва в S1. 2022-01-05 XBB+S:F486P
XBF ИГРА Рекомбинант BA.5.2.3 и CJ.1 (сублиния BA.2.75.3) 2022-07-20 BA.5 + S:K147E, S:W152R, S:F157L, S:I210V, S:G257S, S:G339H, S:R346T, S:G446S, S:N460K, S:F486P, S:F490S
ДЖН.1 ИГРА 24А BA.2.86 сублиния; генетические особенности включают S:L455S 2023-08-25 По состоянию на 28 июня 2024 г. , классифицированный как VOI; Категория «Омикрон ЛОС» больше не заявлена. [4]

Варианты интереса (ВОЗ)

Ниже перечислены представляющие интерес варианты (VOI), признанные Всемирной организацией здравоохранения . [17] Другие организации, такие как CDC в США, иногда могут использовать немного другой список. [18]

По состоянию на 15 марта 2023 г. , [122] ВОЗ определяет VOI как вариант «с генетическими изменениями, которые, как прогнозируется или известно, влияют на характеристики вируса, такие как трансмиссивность, вирулентность, уклонение от антител, чувствительность к терапевтическим препаратам и выявляемость», и что он циркулирует больше, чем другие варианты, в более чем одном регионе ВОЗ. до такой степени, что можно предположить глобальный риск для общественного здравоохранения. [123] Кроме того, в обновлении говорится, что «VOI будут называться с использованием установленных систем научной номенклатуры, таких как те, которые используются Nextstrain и Pango». [123]

18 декабря 2023 года ВОЗ включила XBB.1.5, XBB.1.16, EG.5, BA.2.86 и JN.1 в список циркулирующих представляющих интерес вариантов. [124] Шесть месяцев спустя, по состоянию на 28 июня 2024 г. , ВОЗ перечислила только BA.2.86 и JN.1 как циркулирующие представляющие интерес варианты. [4]

Варианты под наблюдением (ВОЗ)

Ниже перечислены варианты, находящиеся под наблюдением (VUM), признанные ВОЗ. ВУМ определяются как варианты с генетическими изменениями, предположительно влияющими на характеристики вируса, и некоторыми признаками потенциального риска в будущем, но с неясными доказательствами фенотипического или эпидемиологического воздействия, требующими усиленного мониторинга и повторной оценки после получения новых данных. [17]

21 ноября 2023 г. ВОЗ включила DV.7, XBB в целом, XBB.1.9.1, XBB.1.9.2 и XBB.2.3 в список вариантов, находящихся под наблюдением. [124] По состоянию на 28 июня 2024 г. ВОЗ рассматривала JN.1.7, KP.2, KP.3, JN.1.18 и LB.1 как варианты, находящиеся под наблюдением. [4]

Ранее циркулирующие и ранее отслеживавшиеся варианты (ВОЗ)

ВОЗ определяет ранее циркулирующий вариант как вариант, который «продемонстрировал, что больше не представляет серьезного дополнительного риска для глобального общественного здравоохранения по сравнению с другими циркулирующими вариантами SARS-CoV-2», но все равно требует мониторинга. [94]

15 марта 2023 года ВОЗ опубликовала обновленную информацию о системе отслеживания ЛОС, объявив, что греческие буквы будут присваиваться только ЛОС. [122]

Ранее циркулировавшие вызывающие беспокойство варианты (ЛОС)

Перечисленные ниже варианты ранее считались вызывающими беспокойство вариантами, но были заменены другими вариантами. По состоянию на май 2022 г. ВОЗ перечисляет следующее в разделе «ранее циркулировавшие варианты, вызывающие обеспокоенность»: [94]

Альфа (родословная B.1.1.7)

Основная статья: Альфа-вариант SARS-CoV-2

Впервые обнаружен в октябре 2020 года во время пандемии COVID-19 в Соединенном Королевстве из образца, взятого в предыдущем месяце в Кенте. [125] линия B.1.1.7, [126] обозначенный альфа-вариант , ранее был известен как первый вариант, находящийся на стадии исследования в декабре 2020 года (VUI – 202012/01) ВОЗ как [127] и позже обозначен как VOC-202012/01. [19] Он также известен как 20I (V1), [28] 20И/501Ю.В1 [128] (ранее 20Б/501Y.В1), [42] [129] [130] или 501Y.V1. [131] С октября по декабрь 2020 года его распространенность удваивалась каждые 6,5 дней — предполагаемый интервал поколений. [132] [133] Это коррелирует со значительным увеличением уровня заражения COVID-19 в Соединенном Королевстве , частично связанным с мутацией N501Y . [132] Были некоторые свидетельства того, что этот вариант имел повышенную трансмиссивность на 40–80% (при этом большинство оценок лежало примерно в середине и в верхнем конце этого диапазона). [134] [135] и ранние анализы показали увеличение смертности, [136] [137] хотя более поздние работы не обнаружили никаких доказательств повышенной вирулентности. [138] По состоянию на май 2021 года вариант Альфа был обнаружен примерно в 120 странах. [139]

16 марта 2022 года ВОЗ деэскалировала вариант Альфа и его подварианты до «ранее циркулировавших вызывающих озабоченность вариантов». [140] [141]

B.1.1.7 с E484K

Вариант 21FEB-02 (ранее обозначавшийся как VOC -202102/02), описанный Министерством здравоохранения Англии (PHE) как «B.1.1.7 с E484K». [19] принадлежит к той же линии в номенклатурной системе Панго, но имеет дополнительную мутацию E484K . было зарегистрировано 39 подтвержденных случаев ЛОС -21FEB-02. По состоянию на 17 марта 2021 года в Великобритании [19] 4 марта 2021 года ученые сообщили о B.1.1.7 с мутациями E484K в штате Орегон . В 13 проанализированных тестовых образцах была обнаружена эта комбинация, которая, по-видимому, возникла спонтанно и локально, а не была импортирована. [142] [143] [144] Другие названия этого варианта включают B.1.1.7+E484K. [145] и B.1.1.7 Происхождение с S:E484K. [146]

Бета (родословная B.1.351)

Основная статья: Бета-вариант SARS-CoV-2

18 декабря 2020 года вариант 501.V2 , также известный как 501.V2, 20H (V2), [28] 20H/501Y.V2 [128] (ранее 20C/501Y.V2), 501Y.V2, [147] VOC-20DEC-02 (ранее VOC -202012/02) или линия B.1.351, [42] Впервые был обнаружен в Южной Африке страны , о чем сообщил департамент здравоохранения . [148] ВОЗ назвала его бета-вариантом. Исследователи и официальные лица сообщили, что распространенность этого варианта выше среди молодых людей без каких-либо заболеваний, и по сравнению с другими вариантами в этих случаях он чаще приводит к серьезным заболеваниям. [149] [150] Департамент здравоохранения ЮАР также указал, что этот вариант может стать движущей силой второй волны эпидемии COVID-19 в стране из-за того, что этот вариант распространяется более быстрыми темпами, чем другие более ранние варианты вируса. [148] [149]

Ученые отметили, что этот вариант содержит несколько мутаций, которые позволяют ему легче прикрепляться к клеткам человека из-за следующих трех мутаций в рецептор-связывающем домене (RBD) шипового гликопротеина вируса: N501Y , [148] [151] К417Н и Е484К . [152] [153] Мутация N501Y также была обнаружена в Соединенном Королевстве. [148] [154]

16 марта 2022 года ВОЗ снизила уровень бета-варианта и его подвариантов до «ранее циркулировавших вызывающих озабоченность вариантов». [140] [141]

Гамма (родословная P.1)

Основная статья: Гамма-вариант SARS-CoV-2

Вариант Гаммы или линия P.1, названная Вариантом беспокойства 21 января 2002 г. [19] (ранее VOC-202101/02) Службы общественного здравоохранения Англии, [19] 20Дж (В3) [28] или 20J/501Y.V3 [128] от Nextstrain или просто 501Y.V3, [131] был обнаружен в Токио 6 января 2021 года Национальным институтом инфекционных заболеваний (НИИД). ВОЗ маркирует его как вариант Гамма. Новый вариант впервые был выявлен у четырех человек, прибывших в Токио из бразильского штата Амазонас 2 января 2021 года. [155] 12 января 2021 года Бразильско-британский CADDE-центр подтвердил 13 местных случаев нового варианта Гамма в тропических лесах Амазонки. [156] Этот вариант SARS-CoV-2 получил название линии P.1 (хотя он является потомком B.1.1.28, название B.1.1.28.1). [20] [157] не разрешен, и поэтому полученное название - P.1) и имеет 17 уникальных аминокислотных изменений, 10 из которых в его белке-шипе, включая три, связанные с мутациями: N501Y , E484K и K417T. [156] [157] [158] [159] : Рисунок 5

Мутации N501Y и E484K способствуют образованию стабильного комплекса RBD-hACE2, тем самым повышая аффинность связывания RBD с hACE2. Однако мутация K417T препятствует образованию комплекса между RBD и hACE2, что, как было показано, снижает аффинность связывания. [1]

Новый вариант отсутствовал в пробах, собранных с марта по ноябрь 2020 года в Манаусе , штат Амазонас, но в том же городе он был обнаружен в 42% проб с 15 по 23 декабря 2020 года, за ним следовали 52,2% в течение 15–31 декабря и 85,4% за 1–9 января 2021 г. [156] Исследование показало, что инфекции, вызванные Гаммой, могут вызывать почти в десять раз большую вирусную нагрузку по сравнению с людьми, инфицированными одной из других линий, выявленных в Бразилии (B.1.1.28 или B.1.195). Гамма также показала в 2,2 раза более высокую трансмиссивность при одинаковой способности заражать как взрослых, так и пожилых людей, что позволяет предположить, что линии P.1 и P.1-подобные более успешно заражают молодых людей независимо от пола. [160]

Исследование образцов, собранных в Манаусе в период с ноября 2020 года по январь 2021 года, показало, что вариант Гамма в 1,4–2,2 раза более заразен и способен уклоняться от 25–61% наследственного иммунитета от предыдущих коронавирусных заболеваний, что приводит к возможности повторного заражения после выздоровления от ранее перенесенной инфекции COVID-19. Что касается смертности, заражения Гаммой также оказались на 10–80% более смертоносными. [161] [162] [163]

Исследование показало, что у людей, полностью вакцинированных вакцинами Pfizer или Moderna, значительно снижается эффект нейтрализации Гаммы, хотя фактическое влияние на течение заболевания неясно.Предварительное исследование Фонда Освальдо Круза, опубликованное в начале апреля, показало, что в реальной жизни люди, получившие начальную дозу вакцины Sinovac от Коронавак , имели эффективность примерно 50%. Они ожидали, что эффективность будет выше после второй дозы. По состоянию на июль 2021 года исследование продолжается. [164]

Предварительные данные двух исследований показывают, что вакцина Oxford-AstraZeneca эффективна против варианта Гамма, хотя точный уровень эффективности еще не установлен. [165] [166] Предварительные данные исследования, проведенного Instituto Butantan, показывают, что CoronaVac также эффективен против варианта Gamma, и по состоянию на июль 2021 года его еще предстоит расширить для получения окончательных данных. [167]

16 марта 2022 года ВОЗ деэскалировала вариант Гамма и его подварианты до «ранее циркулировавших вызывающих озабоченность вариантов». [140] [141]

Дельта (родословная B.1.617.2)

Основная статья: Вариант SARS-CoV-2 Delta

Вариант Дельта, также известный как B.1.617.2, G/452R.V3, 21A. [28] или 21А/С:478К, [128] был глобально доминирующим вариантом, который распространился как минимум на 185 стран. [168] Впервые он был обнаружен в Индии . Потомок линии B.1.617, которая также включает исследуемый вариант Каппа, он был впервые обнаружен в октябре 2020 года и с тех пор распространился по всему миру. [169] [170] [171] [172] [173] 6 мая 2021 года британские ученые объявили B.1.617.2 (у которого, в частности, отсутствует мутация E484Q) «вызывающим беспокойство вариантом», назвав его VOC-21APR-02, после того как они отметили доказательства того, что он распространяется быстрее, чем исходная версия. вируса и может распространяться быстрее или так же быстро, как Альфа. [174] [21] [175] [176] Он несет мутации L452R и P681R у Спайка; [30] в отличие от Каппы, он имеет T478K, но не E484Q.

3 июня 2021 года Управление общественного здравоохранения Англии сообщило, что двенадцать из 42 смертей от варианта Дельта в Англии были среди полностью вакцинированных, и что он распространялся почти в два раза быстрее, чем вариант Альфа. [177] Также 11 июня Медицинский центр Футхиллс в Калгари, Канада, сообщил, что половина из 22 случаев заболевания вариантом Дельта произошла среди полностью вакцинированных. [178]

В июне 2021 года начали появляться сообщения о варианте Дельты с мутацией K417N. [179] Мутация, также присутствующая в вариантах Бета и Гамма, вызвала обеспокоенность по поводу возможности снижения эффективности вакцин и лечения антителами и увеличения риска повторного заражения. [180] Вариант, названный Министерством здравоохранения Англии «Дельта с K417N», включает две клады, соответствующие линиям Панго AY.1 и AY.2. [181] Его прозвали «Дельта плюс». [182] от «Дельта плюс К417Н». [183] Название мутации K417N относится к обмену, при котором лизин (K) заменяется аспарагином (N) в положении 417. [184] 22 июня Министерство здравоохранения и благосостояния семьи Индии объявило вариант COVID-19 «Дельта плюс» вариантом, вызывающим обеспокоенность, после того как в Индии было зарегистрировано 22 случая этого варианта. [185] После объявления ведущие вирусологи заявили, что данных недостаточно, чтобы назвать этот вариант отдельным вызывающим беспокойство вариантом, указав на небольшое количество изученных пациентов. [186] В Великобритании в июле 2021 года был выявлен AY.4.2. Помимо упомянутых ранее, он также получил прозвище «Дельта Плюс» из-за дополнительных мутаций Y145H и A222V. Они не уникальны для него, но отличают его от оригинального варианта Delta. [187]

7 июня 2022 года ВОЗ снизила уровень эскалации варианта Дельта и его подвариантов до «ранее циркулировавших вызывающих озабоченность вариантов». [141] [188]

Ранее циркулирующие интересующие варианты (VOI)

Родословная Панго Клада GISAID Клада Nextstrain Самые ранние образцы Дата ВОИ Дата назначения Страна отбора проб Примечания
П.2 ГР/484К.В2 20Б/С.484К 2020-04 2021-07-06 2021-08-17 Зета вариант
стр.3 ГР/1092К.В1 21Е 2021-01 2021-07-06 2021-08-17 Тета вариант
Б.1.427
Б.1.429 		ГХ/452Р.В1 21С 2020-03 2021-07-06 2021-11-09 Эпсилон вариант
Б.1.617.1 Г/452Р.В3 21Б 2020-10 2021-09-20 Вариант пальто
Б.1.526 ГХ/253Г.В1 21F 2020-11 2021-09-20 Йота вариант
Б.1.525 Г/484К.В3 21Д 2020-12 2021-09-20 И вариант
С.37 GR/452Q.V1 21Г 2020-12 2021-06-14 2022-03-09 Лямбда-вариант
Б.1.621 ГХ 21 ч. 2021-01 2021-08-30 2022-03-09 В варианте

Эпсилон (линии B.1.429, B.1.427, CAL.20C)

Основная статья: Вариант Эпсилон SARS-CoV-2

Вариант Эпсилон или линия B.1.429, также известная как CAL.20C. [189] или CA   VUI1, [190] 21С [28] или 20К/С:452Р, [128] определяется пятью различными мутациями (I4205V и D1183Y в гене ORF1ab и S13I, W152C, L452R в S-гене шиповидного белка), из которых особую озабоченность вызывал L452R (ранее также обнаруженный в других неродственных линиях). [55] [191] С 17 марта по 29 июня 2021 года CDC внес B.1.429 и связанный с ним B.1.427 в список «вариантов, вызывающих озабоченность». [30] [192] [193] [194] По состоянию на июль 2021 года Эпсилон больше не рассматривается ВОЗ как вариант, представляющий интерес. [17] как его обогнала Альфа. [195]

С сентября 2020 года по январь 2021 года его заразность была на 19–24% выше, чем у предыдущих вариантов в Калифорнии. Нейтрализация против него антителами от естественных инфекций и прививок была умеренно снижена, [196] но его по-прежнему можно было обнаружить в большинстве диагностических тестов. [197]

Эпсилон (CAL.20C) впервые был обнаружен в июле 2020 года исследователями Медицинского центра Сидарс-Синай , Калифорния , в одном из 1230 образцов вируса, собранных в округе Лос-Анджелес с начала эпидемии COVID-19 . [198] Он не был обнаружен снова до сентября, когда он снова появился в образцах в Калифорнии, но до ноября его численность оставалась очень низкой. [199] [200] В ноябре 2020 года на вариант Эпсилон приходилось 36 процентов образцов, собранных в Медицинском центре Сидарс-Синай, а к январю 2021 года на вариант Эпсилон приходилось 50 процентов образцов. [191] В совместном пресс-релизе Калифорнийского университета в Сан-Франциско , Департамента общественного здравоохранения Калифорнии и Департамента общественного здравоохранения округа Санта-Клара , [201] вариант также был обнаружен во многих округах Северной Калифорнии. С ноября по декабрь 2020 года частота этого варианта в секвенированных случаях из Северной Калифорнии выросла с 3% до 25%. [202] В препринте CAL.20C описывается как принадлежащий к кладе 20C и дающий примерно 36% образцов, в то время как новый вариант из клады 20G составляет около 24% образцов в исследовании, сосредоточенном на Южной Калифорнии. Однако обратите внимание, что в США в целом по состоянию на январь 2021 года преобладает клада 20G. [55] После увеличения количества Эпсилона в Калифорнии этот вариант обнаруживался с различной частотой в большинстве штатов США. Небольшое количество было обнаружено в других странах Северной Америки, а также в Европе, Азии и Австралии. [199] [200] После первоначального увеличения его частота с февраля 2021 года быстро упала, поскольку его уступила более передающаяся Альфа . В апреле Эпсилон оставался относительно частым в некоторых частях северной Калифорнии, но он практически исчез с юга штата и так и не смог закрепиться где-либо еще; только 3,2% всех случаев в США были Эпсилон, тогда как более двух третей были Альфа. [195]

Зета (линия P.2)

Основная статья: Зета-вариант SARS-CoV-2

Зета-вариант или линия P.2, сублиния B.1.1.28, подобная Gamma (P.1), была впервые обнаружена в обращении в штате Рио-де-Жанейро ; он содержит мутацию E484K, но не мутации N501Y и K417T. [159] Он развился независимо в Рио-де-Жанейро, не имея прямого отношения к варианту Гамма из Манауса. [156] Хотя ранее Зета считалась представляющим интерес вариантом, по состоянию на июль 2021 года ВОЗ больше не считает ее таковой. [17]

И (линия B.1.525)

Основная статья: Эта вариант SARS-CoV-2

Вариант Eta или линия B.1.525, также называемая VUI -21FEB-03. [19] (ранее VUI-202102/03) Службы общественного здравоохранения Англии (PHE) и ранее известный как UK1188, [19] 21Д [28] или 20А/С: 484К, [128] не несет той же мутации N501Y, что и у Alpha , Beta и Gamma , но несет ту же мутацию E484K, что и у вариантов Gamma, Zeta и Beta, а также несет ту же самую делецию ΔH69/ΔV70 (делецию аминокислот гистидин и валин в положениях 69 и 70), как обнаружено в Alpha, варианте N439K (B.1.141 и B.1.258) и варианте Y453F ( кластер 5 ). [203] Эта отличается от всех других вариантов наличием как мутации E484K, так и новой мутации F888L (замена фенилаланина (F) на лейцин (L) в домене S2 белка-шипа). По состоянию на 5 марта 2021 года он был обнаружен в 23 странах. [204] [205] [206] Об этом также сообщили в Майотте , заморском департаменте/регионе Франции. [204] Первые случаи были выявлены в декабре 2020 года в Великобритании и Нигерии, а по состоянию на 15 февраля 2021 года они встречались с наибольшей частотой среди образцов в последней стране. [206] По состоянию на 24 февраля в Великобритании было выявлено 56 случаев. [19] Дания, которая секвенирует все свои случаи COVID-19, обнаружила 113 случаев этого варианта с 14 января по 21 февраля 2021 года, семь из которых были напрямую связаны с зарубежными поездками в Нигерию. [205]

По состоянию на июль 2021 года британские эксперты изучают это, чтобы определить, насколько это может быть риском. В настоящее время он рассматривается как «вариант, находящийся на стадии расследования», но в ожидании дальнейшего изучения он может стать « вариантом, вызывающим озабоченность ». Рави Гупта из Кембриджского университета заявил в интервью BBC , что линия B.1.525, похоже, имеет «значительные мутации», уже наблюдаемые в некоторых других новых вариантах, а это означает, что их вероятный эффект в некоторой степени более предсказуем. [207]

Тета (линия P.3)

Основная статья: Тета-вариант SARS-CoV-2

18 февраля 2021 года Министерство здравоохранения Филиппин подтвердило обнаружение двух мутаций COVID-19 на Центральных Висайских островах после того, как образцы от пациентов были отправлены на секвенирование генома. Позже мутации были названы E484K и N501Y, которые были обнаружены в 37 из 50 образцов, причем обе мутации одновременно встречались в 29 из них. [208]

13 марта Министерство здравоохранения подтвердило, что мутации представляют собой вариант, обозначенный как линия P.3. [209] В тот же день был также подтвержден первый случай заболевания COVID-19, вызванный вариантом Гамма в стране . 13 марта на Филиппинах было зарегистрировано 98 случаев варианта Тета. [210] 12 марта было объявлено, что Тета также была обнаружена в Японии. [211] [212] 17 марта Великобритания подтвердила свои первые два случая: [213] где PHE назвал его VUI-21MAR-02. [19] 30 апреля 2021 года Малайзия выявила 8 случаев варианта Тета в Сараваке. [214]

По состоянию на июль 2021 года Тета больше не рассматривается ВОЗ как вариант, представляющий интерес. [17]

Йота (родословная B.1.526)

Основная статья: Вариант SARS-CoV-2 Йота

В ноябре 2020 года в Нью-Йорке был обнаружен мутантный вариант, получивший название линия B.1.526. [215] По состоянию на 11 апреля 2021 года этот вариант был обнаружен как минимум в 48 штатах США и 18 странах. В модели, отражающей Эпсилон, Йота изначально смогла достичь относительно высоких уровней в некоторых штатах, но к маю 2021 года ее вытеснили более передающиеся Дельта и Альфа. [195]

Каппа (родословная B.1.617.1)

Основная статья: Каппа-вариант SARS-CoV-2

Вариант Каппа [17] является одной из трех подлиний линии B.1.617 . Он также известен как линия B.1.617.1, 21B. [28] или 21А/С:154К, [128] и впервые был обнаружен в Индии в декабре 2020 года. [216] К концу марта 2021 года на долю Каппы приходилось более половины последовательностей, отправленных из Индии. [217] 1 апреля 2021 года Служба общественного здравоохранения Англии обозначила его как вариант, находящийся на стадии расследования (VUI-21APR-01). [29] Он имеет заметные мутации L452R, E484Q, P681R. [218]

Лямбда (линия C.37)

Основная статья: Лямбда-вариант SARS-CoV-2

Вариант Lambda, также известный как линия C.37, был впервые обнаружен в Перу в августе 2020 года и был определен ВОЗ как представляющий интерес вариант 14 июня 2021 года. [17] Он распространился как минимум на 30 стран. [219] по всему миру и по состоянию на июль 2021 г. , неизвестно, является ли он более заразным и устойчивым к вакцинам, чем другие штаммы. [220] [221] 16 марта 2022 года ВОЗ снизила уровень эскалации варианта Lambda до «ранее циркулировавших вызывающих озабоченность вариантов». [140] [141]

Му (родословная B.1.621)

Основная статья: Вариант SARS-CoV-2 Mu

Вариант Mu, также известный как линия B.1.621, был впервые обнаружен в Колумбии в январе 2021 года и 30 августа 2021 года был определен ВОЗ как представляющий интерес вариант. [17] Вспышки были в Южной Америке и Европе. [222] [223] 16 марта 2022 года ВОЗ деэскалировала вариант Му и его подварианты до «ранее циркулировавших вызывающих озабоченность вариантов». [140] [141]

Ранее отслеживаемые варианты (ВОЗ)

Перечисленные ниже варианты когда-то входили в список вариантов, находящихся под наблюдением, но были реклассифицированы либо из-за того, что они больше не циркулируют на значительном уровне, либо не оказали существенного влияния на ситуацию, либо из-за научных доказательств того, что вариант не имеет свойств, вызывающих беспокойство. [94]

По состоянию на 26 мая 2022 г. [94]
Родословная Панго Клада GISAID Клада Nextstrain Самые ранние образцы Дата ВУМ Дата назначения Страна отбора проб
ВЫКЛ.1 ГР 2021-03 2021-05-26 2021-07-21  Великобритания
АТ.1 ГР 2021-01 2021-06-09 2021-07-21  Россия
Р.1 ГР 2021-01 2021-04-07 2021-11-09  Япония
Б.1.466.2 ГХ 2020-11 2021-04-28 2021-11-09  Индонезия
Б.1.1.519 ГР 20Б/С.732А 2020-11 2021-06-02 2021-11-09 Несколько стран
С.36.3 ГР 2021-01 2021-06-16 2021-11-09 Несколько стран
B.1.214.2G2020-112021-06-302021-11-09Multiple countries
B.1.1.523GR2020-052021-07-142021-11-09Multiple countries
B.1.619G2020-052021-07-142021-11-09Multiple countries
B.1.620G20A/S.126A2020-112021-07-142021-11-09 Lithuania
B.1.1.318

AZ.5

GR2021-012021-06-02 England
C.1.2GR2021-052021-09-01 South Africa
B.1.630GH2021-032021-10-12 Dominican Republic
B.1.640GH/490R2021-092021-11-22 Republic of Congo
XD2022-012022-03-09 France

Other notable variants

Lineage B.1.1.207 was first sequenced in August 2020 in Nigeria;[224] the implications for transmission and virulence are unclear but it has been listed as an emerging variant by the US Centers for Disease Control.[42] Sequenced by the African Centre of Excellence for Genomics of Infectious Diseases in Nigeria, this variant has a P681H mutation, shared in common with the Alpha variant. It shares no other mutations with the Alpha variant and as of late December 2020 this variant accounts for around 1% of viral genomes sequenced in Nigeria, though this may rise.[224] As of May 2021, lineage B.1.1.207 has been detected in 10 countries.[225]

Lineage B.1.1.317, while not considered a variant of concern, is noteworthy in that Queensland Health forced 2 people undertaking hotel quarantine in Brisbane, Australia to undergo an additional 5 days' quarantine on top of the mandatory 14 days after it was confirmed they were infected with this variant.[226]

Lineage B.1.616, being identified in Brittany, Western France in early January 2021 and designated by WHO as "Variant under investigation" in March 2021, was reported to be difficult to detect from nasopharyngeal swab sampling method of coronavirus detection, and detection of the virus needs to rely on samples from lower respiratory tract.[citation needed]

Lineage B.1.618 was first isolated in October 2020. It has the E484K mutation in common with several other variants, and showed significant spread in April 2021 in West Bengal, India.[227][228] As of 23 April 2021, the PANGOLIN database showed 135 sequences detected in India, with single-figure numbers in each of eight other countries worldwide.[229]

In July 2021, scientists reported in a preprint which was published in a journal in February 2022, the detection of anomalous unnamed unknown-host SARS-CoV-2 lineages via wastewater surveillance in New York City. They hypothesized that "these lineages are derived from unsampled human COVID-19 infections or that they indicate the presence of a non-human animal reservoir".[230][231]

Lineage B.1.640.2 (also known as the IHU variant[232]) was detected in October 2021 by researchers at the Institut Hospitalo-Universitaire (IHU) in Marseille.[233] They found the variant in a traveler who returned to France from Cameroon and reportedly infected 12 people.[234][235] The B.1.640 lineage, which includes B.1.640.2, was designated a variant under monitoring (VUM) by the World Health Organization (WHO) on 22 November 2021.[236] However, the WHO has reported that lineage B.1.640.2 has spread much slower than the Omicron variant, and so is of relatively little concern.[235][237] According to a preprint study, lineage B.1.640.2 has two already known spike protein mutations – E484K and N501Y – among a total of 46 nucleotide substitutions and 37 deletions.[234][238][239]

In March 2022, researchers reported SARS-CoV-2 variant recombinant viruses that contain elements of Delta and Omicron – Deltacron (also called "Deltamicron").[240][241][242][243][244] Recombination occurs when a virus combines parts from a related virus with its genetic sequence as it assembles copies of itself. It is unclear whether Deltacron – which is not to be confused with "Deltacron" reported in January albeit the first detection was also in January[244][245] – will be able to compete with Omicron and whether that would be detrimental to health.[246]

In July 2023, Professor Lawrence Young, a virologist at Warwick University announced a super mutated Delta variant from a swab of an Indonesian case with 113 unique mutations, with 37 affecting the spike protein.[247]

Notable missense mutations

There have been a number of missense mutations observed of SARS-CoV-2.

del 69-70

The name of the mutation, del 69-70, or 69-70 del, or other similar notations, refers to the deletion of amino acid at position 69 to 70. The mutation is found in the Alpha variant, and could lead to "spike gene target failure" and result in false negative result in PCR virus test.[248]

RSYLTPGD246-253N

Otherwise referred to as del 246-252, or other various similar expression, refer to the deletion of amino acid from the position of 246 to 252, in the N-terminal domain of spike protein, accompanied with a replacement of the aspartic acid (D) at the position 253 for asparagine (N).[249][250]

The 7 amino acid deletion mutation is currently described as unique in the Lambda variant, and have been attributed to as one of the cause of the strain's increased capability to escape from neutralizing antibodies according to preprint paper.[251]

N440K

The name of the mutation, N440K, refers to an exchange whereby the asparagine (N) is replaced by lysine (K) at position 440.[252]

This mutation has been observed in cell cultures to be 10 times more infective compared to the previously widespread A2a strain (A97V substitution in RdRP sequence) and 1000 times more in the lesser widespread A3i strain (D614G substitution in Spike and a and P323L substitution in RdRP).[253] It was involved in rapid surges of COVID-19 cases in India in May 2021.[254] India has the largest proportion of N440K mutated variants followed by the US and Germany.[255]

G446V

The name of the mutation, G446V, refers to an exchange whereby the glycine (G) is replaced by valine (V) at position 446.[252]

The mutation, identified in Japan among inbound travelers starting from May, and among 33 samples from individuals related to 2020 Tokyo Olympic Games and 2020 Tokyo Paralympic Games, are said to be possible to impact affinity of multiple monoclonal antibody, although its clinical impact against the use of antibody medicine is still yet to be known.[256]

L452R

The name of the mutation, L452R, refers to an exchange whereby the leucine (L) is replaced by arginine (R) at position 452.[252]

L452R is found in both the Delta and Kappa variants which first circulated in India, but have since spread around the world. L452R is a relevant mutation in this strain that enhances ACE2 receptor binding ability and can reduce vaccine-stimulated antibodies from attaching to this altered spike protein.

L452R, some studies show, could even make the coronavirus resistant to T cells, that are necessary to target and destroy virus-infected cells. They are different from antibodies that are useful in blocking coronavirus particles and preventing it from proliferating.[170]

Y453F

The name of the mutation, Y453F, refers to an exchange whereby the tyrosine (Y) is replaced by phenylalanine (F) at position 453. The mutation have been found potentially linked to the spread of SARS-CoV-2 among minks in the Netherlands in 2020.[257]

S477G/N

A highly flexible region in the receptor binding domain (RBD) of SARS-CoV-2, starting from residue 475 and continuing up to residue 485, was identified using bioinformatics and statistical methods in several studies. The University of Graz[258] and the Biotech Company Innophore[259] have shown in a recent publication that structurally, the position S477 shows the highest flexibility among them.[260]

At the same time, S477 is hitherto the most frequently exchanged amino acid residue in the RBDs of SARS-CoV-2 mutants. By using molecular dynamics simulations of RBD during the binding process to hACE2, it has been shown that both S477G and S477N strengthen the binding of the SARS-COV-2 spike with the hACE2 receptor. The vaccine developer BioNTech[261] referenced this amino acid exchange as relevant regarding future vaccine design in a preprint published in February 2021.[262]

E484Q

The name of the mutation, E484Q, refers to an exchange whereby the glutamic acid (E) is replaced by glutamine (Q) at position 484.[252]

The Kappa variant circulating in India has E484Q. These variants were initially (but misleadingly) referred to as a "double mutant".[263] E484Q may enhance ACE2 receptor binding ability, and may reduce vaccine-stimulated antibodies' ability to attach to this altered spike protein.[170]

E484K

The name of the mutation, E484K, refers to an exchange whereby the glutamic acid (E) is replaced by lysine (K) at position 484.[252] It is nicknamed "Eeek".[264]

E484K has been reported to be an escape mutation (i.e., a mutation that improves a virus's ability to evade the host's immune system[265][266]) from at least one form of monoclonal antibody against SARS-CoV-2, indicating there may be a "possible change in antigenicity".[267] The Gamma variant (lineage P.1),[156] the Zeta variant (lineage P.2, also known as lineage B.1.1.28.2)[159] and the Beta variant (501.V2) exhibit this mutation.[267] A limited number of lineage B.1.1.7 genomes with E484K mutation have also been detected.[268] Monoclonal and serum-derived antibodies are reported to be from 10 to 60 times less effective in neutralising virus bearing the E484K mutation.[269][270] On 2 February 2021, medical scientists in the United Kingdom reported the detection of E484K in 11 samples (out of 214,000 samples), a mutation that may compromise current vaccine effectiveness.[271][272]

F490S

F490S denotes a change from phenylalanine (F) to serine (S) in amino-acid position 490.[273]

It is one of the mutation found in Lambda, and have been associated with reduced susceptibility to antibody generated by those who were infected with other strains, meaning antibody treatment against people infected with strains carrying such mutation would be less effective.[274]

N501Y

N501Y denotes a change from asparagine (N) to tyrosine (Y) in amino-acid position 501.[275] N501Y has been nicknamed "Nelly".[264]

This change is believed by PHE to increase binding affinity because of its position inside the spike glycoprotein's receptor-binding domain, which binds ACE2 in human cells; data also support the hypothesis of increased binding affinity from this change.[43] Molecular interaction modelling and the free energy of binding calculations has demonstrated that the mutation N501Y has the highest binding affinity in variants of concern RBD to hACE2.[1] Variants with N501Y include Gamma,[267][156] Alpha (VOC 20DEC-01), Beta, and COH.20G/501Y (identified in Columbus, Ohio).[1] This last became the dominant form of the virus in Columbus in late December 2020 and January and appears to have evolved independently of other variants.[276][277]

N501S

N501S denotes a change from asparagine (N) to serine (S) in amino-acid position 501.[278]

As of September 2021, there are 8 cases of patients around the world infected with Delta variant which feature this N501S mutation. As it is considered a mutation similar to N501Y, it is suspected to have similar characteristics as N501Y mutation, which is believed to increase the infectivity of the virus, however the exact effect is unknown yet.[279]

D614G

Prevalence of mutation D614G across all reported GISAID strains during the course of 2020. Convergence with unity closely matches the upper limb of the logistics curve.[280]

D614G is a missense mutation that affects the spike protein of SARS-CoV-2. From early appearances in Eastern China early in 2020, the frequency of this mutation in the global viral population increased early on during the pandemic.[281] G (glycine) quickly replaced D (aspartic acid) at position 614 in Europe, though more slowly in China and the rest of East Asia, supporting the hypothesis that G increased the transmission rate, which is consistent with higher viral titres and infectivity in vitro.[53] Researchers with the PANGOLIN tool nicknamed this mutation "Doug".[264]

In July 2020, it was reported that the more infectious D614G SARS-CoV-2 variant had become the dominant form in the pandemic.[282][283][284][285] PHE confirmed that the D614G mutation had a "moderate effect on transmissibility" and was being tracked internationally.[275][286]

The global prevalence of D614G correlates with the prevalence of loss of smell (anosmia) as a symptom of COVID-19, possibly mediated by higher binding of the RBD to the ACE2 receptor or higher protein stability and hence higher infectivity of the olfactory epithelium.[287]

Variants containing the D614G mutation are found in the G clade by GISAID[53] and the B.1 clade by the PANGOLIN tool.[53]

Q677P/H

The name of the mutation, Q677P/H, refers to an exchange whereby the glutamine (Q) is replaced by proline (P) or histidine (H) at position 677.[252] There are several sub-lineages containing the Q677P mutation; six of these, which also contain various different combinations of other mutations, are referred to by names of birds. One of the earlier ones noticed for example is known as "Pelican," while the most common of these as of early 2021 was provisionally named "Robin 1."[288]

The mutation has been reported in multiple lineages circulating inside the United States as of late 2020 and also some lineages outside the country. 'Pelican' was first detected in Oregon, and as of early 2021 'Robin 1' was found often in the Midwestern United States, while another Q667H sub-lineage, 'Robin 2', was found mostly in the southeastern United States.[288] The frequency of such mutation being recorded has increased from late 2020 to early 2021.[289]

P681H

Logarithmic Prevalence of P681H in 2020 according to sequences in the GISAID database[280]

The name of the mutation, P681H, refers to an exchange whereby the proline (P) is replaced by histidine (H) at position 681.[280]

In January 2021, scientists reported in a preprint that the mutation P681H, a characteristic feature of the Alpha variant and lineage B.1.1.207 (identified in Nigeria), is showing a significant exponential increase in worldwide frequency, thus following a trend to be expected in the lower limb of the logistics curve. This may be compared with the trend of the now globally prevalent D614G.[280][290]

P681R

The name of the mutation, P681R, refers to an exchange whereby the proline (P) is replaced by arginine (R) at position 681.[252]

Indian SARS-CoV-2 Genomics Consortium (INSACOG) found that other than the two mutations E484Q and L452R, there is also a third significant mutation, P681R in lineage B.1.617. All three concerning mutations are on the spike protein, the operative part of the coronavirus that binds to receptor cells of the body.[170]

A701V

According to initial media reports, the Malaysian Ministry of Health announced on 23 December 2020 that it had discovered a mutation in the SARS-CoV-2 genome which they designated as A701B(sic), among 60 samples collected from the Benteng Lahad Datu cluster in Sabah. The mutation was characterised as being similar to the one found recently at that time in South Africa, Australia, and the Netherlands, although it was uncertain if this mutation was more infectious or aggressive[clarification needed] than before.[291] The provincial government of Sulu in neighbouring Philippines temporarily suspended travel to Sabah in response to the discovery of 'A701B' due to uncertainty over the nature of the mutation.[292]

On 25 December 2020, the Malaysian Ministry of Health described a mutation A701V as circulating and present in 85% of cases (D614G was present in 100% of cases) in Malaysia.[293][294] These reports also referred to samples collected from the Benteng Lahad Datu cluster.[293][294] The text of the announcement was mirrored verbatim on the Facebook page of Noor Hisham Abdullah, Malay Director-General of Health, who was quoted in some of the news articles.[294]

The A701V mutation has the amino acid alanine (A) substituted by valine (V) at position 701 in the spike protein. Globally, South Africa, Australia, Netherlands and England also reported A701V at about the same time as Malaysia.[293] In GISAID, the prevalence of this mutation is found to be about 0.18%. of cases.[293]

On 14 April 2021, the Malaysian Ministry of Health reported that the third wave, which had started in Sabah, has involved the introduction of variants with D614G and A701V mutations.[295]

Recombinant variants

The British government has reported a number of recombinant variants of SARS-CoV-2.[296] These recombinant lineages have been given the Pango lineage identifiers XD, XE, and XF.[297]

XE is a recombinant lineage of Pango lineages BA.1 and BA.2.[298] As of March 2022 XE was believed to have a growth rate 9.8% greater than BA.2.[296]

Differential vaccine effectiveness

See also: Oxford–AstraZeneca COVID-19 vaccine § Effectiveness, Pfizer–BioNTech COVID-19 vaccine § Effectiveness, Moderna COVID-19 vaccine § Effectiveness, Janssen COVID-19 vaccine § Efficacy, Novavax COVID-19 vaccine § Efficacy, Sinopharm BIBP COVID-19 vaccine § Effectiveness, Sputnik V COVID-19 vaccine § Effectiveness, CoronaVac § Effectiveness, Covaxin § Efficacy, ZF2001 § Efficacy, Abdala (vaccine) § Efficacy, SCB-2019 § Efficacy, and COVID-19 vaccine clinical research § Variants

The interplay between the SARS-CoV-2 virus and its human hosts was initially natural but then started being altered by the rising availability of vaccines seen in 2021.[299] The potential emergence of a SARS-CoV-2 variant that is moderately or fully resistant to the antibody response elicited by the COVID-19 vaccines may necessitate modification of the vaccines.[300] The emergence of vaccine-resistant variants is more likely in a highly vaccinated population with uncontrolled transmission.[301]

As of February 2021, the US Food and Drug Administration believed that all FDA authorized vaccines remained effective in protecting against circulating strains of SARS-CoV-2.[300]

Immune evasion by variants

This section is an excerpt from COVID-19 vaccine § Immune evasion by variants.[edit]
In contrast to other investigated prior variants, the SARS-CoV-2 Omicron variant[302][303][304][305][306] and its BA.4/5 subvariants[307] have evaded immunity induced by vaccines, which may lead to breakthrough infections despite recent vaccination. Nevertheless, vaccines are thought to provide protection against severe illness, hospitalizations, and deaths due to Omicron.[308]

Vaccine adjustments

This section is an excerpt from SARS-CoV-2 Omicron variant § Vaccine adjustments.[edit]

In June 2022, Pfizer and Moderna developed bivalent vaccines to protect against the SARS-CoV-2 wild-type and the Omicron variant. The bivalent vaccines are well-tolerated and offer immunity to Omicron superior to previous mRNA vaccines.[309] In September 2022, the United States Food and Drug Administration (FDA) authorized the bivalent vaccines for use in the US.[310][311][312]

In June 2023, the FDA advised manufacturers that the 2023–2024 formulation of the COVID‑19 vaccines for use in the US be updated to be a monovalent COVID‑19 vaccine using the XBB.1.5 lineage of the Omicron variant.[313][314] In June 2024, the FDA advised manufacturers that the 2024–2025 formulation of the COVID‑19 vaccines for use in the US be updated to be a monovalent COVID‑19 vaccine using the JN.1 lineage.[315]

Data and methods

Modern DNA sequencing, where available, may permit rapid detection (sometimes known as 'real-time detection') of genetic variants that appear in pathogens during disease outbreaks.[316] Through use of phylogenetic tree visualisation software, records of genome sequences can be clustered into groups of identical genomes all containing the same set of mutations. Each group represents a 'variant', 'clade', or 'lineage', and comparison of the sequences allows the evolutionary path of a virus to be deduced. For SARS-CoV-2, until March 2021, over 330,000 viral genomic sequences had been generated by molecular epidemiology studies across the world.[317]

New variant detection and assessment

On 26 January 2021, the British government said it would share its genomic sequencing capabilities with other countries in order to increase the genomic sequencing rate and trace new variants, and announced a "New Variant Assessment Platform".[318] As of January 2021, more than half of all genomic sequencing of COVID-19 was carried out in the UK.[319]

Wastewater surveillance was demonstrated to be one technique to detect SARS-CoV-2 variants[231] and to track their rise for studying related ongoing infection dynamics.[320][321][322]

Testing

Whether one or more mutations visible in RT-PCR tests can be used reliably to identify a variant depends on the prevalence of other variants currently circulating in the same population.[323][324]

Mutations used to identify variants of concern in commercial test assays[325]
MutationAlphaBetaGammaDeltaOmicron
Δ69–70[e]YesNoNoNoYes
ins214EPE[f]NoNoNoNoYes
S371L/S373P[f]NoNoNoNoYes
N501YYesYesYesNoYes
E484KNoYesYesNoNo
E484A[f]NoNoNoNoYes
L452RNoNoNoYesNo
nsp6:Δ106–108YesYesYesNoNo

Incubation theory for multiple mutated variants

See also: Antigenic escape and Escape mutation

Researchers have suggested that multiple mutations can arise in the course of the persistent infection of an immunocompromised patient, particularly when the virus develops escape mutations under the selection pressure of antibody or convalescent plasma treatment,[326][327] with the same deletions in surface antigens repeatedly recurring in different patients.[328]

Cross-species transmission

Further information: Impact of the COVID-19 pandemic on animals and List of animals that can get SARS-CoV-2

There is a risk that COVID-19 could transfer from humans to other animal populations and could combine with other animal viruses to create yet more variants that are dangerous to humans.[329] Reverse zoonosis spillovers may cause reservoirs for mutating variants that spill back to humans – another possible source for variants of concern, in addition to immunocompromised people.[330]

Cluster 5

Main article: Cluster 5

In early November 2020, Cluster 5, also referred to as ΔFVI-spike by the Danish State Serum Institute (SSI),[331] was discovered in Northern Jutland, Denmark. It is believed to have been spread from minks to humans via mink farms. On 4 November 2020, it was announced that the mink population in Denmark would be culled to prevent the possible spread of this mutation and reduce the risk of new mutations happening. A lockdown and travel restrictions were introduced in seven municipalities of Northern Jutland to prevent the mutation from spreading, which could compromise national or international responses to the COVID-19 pandemic. By 5 November 2020, some 214 mink-related human cases had been detected.[332]

The WHO stated that cluster 5 had a "moderately decreased sensitivity to neutralising antibodies".[333] SSI warned that the mutation could reduce the effect of COVID-19 vaccines under development, although it was unlikely to render them useless. Following the lockdown and mass-testing, SSI announced on 19 November 2020 that cluster 5 in all probability had become extinct.[334] As of 1 February 2021, authors to a peer-reviewed paper, all of whom were from the SSI, assessed that cluster 5 was not in circulation in the human population.[335]

See also

Notes

  1. ^ Based on various trackers[17][18][19][20][21] and periodic reports.[22][23][24]
  2. ^ Jump up to: a b In another source, GISAID name a set of 7 clades without the O clade but including a GV clade.[59]
  3. ^ According to the WHO, "Lineages or clades can be defined based on viruses that share a phylogenetically determined common ancestor".[70]
  4. ^ As of January 2021, at least one of the following criteria must be met in order to count as a clade in the Nextstrain system (quote from source):[52]
    1. A clade reaches >20% global frequency for 2 or more months
    2. A clade reaches >30% regional frequency for 2 or more months
    3. A VOC ('variant of concern') is recognized (applies currently [6 January 2021] to 501Y.V1 and 501Y.V2)
  5. ^ Produces S gene target failure (SGTF) in TaqPath.
  6. ^ Jump up to: a b c Detectable by the TIB MolBiol assay using the melting curve method.

References

  1. ^ Jump up to: a b c d Shahhosseini N, Babuadze GG, Wong G, Kobinger GP (April 2021). "Mutation Signatures and In Silico Docking of Novel SARS-CoV-2 Variants of Concern". Microorganisms. 9 (5): 926. doi:10.3390/microorganisms9050926. PMC 8146828. PMID 33925854. S2CID 233460887.
  2. ^ "Coronavirus variants and mutations: The science explained". BBC News. 6 January 2021. Archived from the original on 22 February 2021. Retrieved 2 February 2021.
  3. ^ Kupferschmidt K (15 January 2021). "New coronavirus variants could cause more reinfections, require updated vaccines". Science. doi:10.1126/science.abg6028. S2CID 234141081. Archived from the original on 22 February 2021. Retrieved 2 February 2021.
  4. ^ Jump up to: a b c d e Tracking SARS-CoV-2 variants, World Health Organization, 28 June 2024, Wikidata Q127328784, archived from the original on 10 July 2024
  5. ^ "Origins of Coronaviruses". NIH.gov. National Institutes of Health in the United States. 16 March 2022. Archived from the original on 21 January 2023. Retrieved 3 February 2023. To date, the origin of SARS-CoV-2 which caused the COVID-19 pandemic has not been identified.
  6. ^ Shahhosseini N, Wong G, Kobinger GP, Chinikar S (June 2021). "SARS-CoV-2 spillover transmission due to recombination event". Gene Reports. 23: 101045. doi:10.1016/j.genrep.2021.101045. PMC 7884226. PMID 33615041.
  7. ^ "The rise and fall of the lab leak hypothesis for the origin of SARS-CoV-2 | Science-Based Medicine". sciencebasedmedicine.org. 1 August 2022. Retrieved 4 November 2022.
  8. ^ Tang X, Wu C, Li X, Song Y (3 March 2020). "On the origin and continuing evolution of SARS-CoV-2". National Science Review. 7 (6): 1012–1023. doi:10.1093/nsr/nwaa036. PMC 7107875. PMID 34676127. (Erratum: doi:10.1093/nsr/nwaa036,  Retraction Watch. If the erratum has been checked and does not affect the cited material, please replace {{erratum|...}} with {{erratum|...|checked=yes}}.)
  9. ^ Forster P, Forster L, Renfrew C, Forster M (8 April 2020). "Phylogenetic network analysis of SARS-CoV-2 genomes". Proceedings of the National Academy of Sciences. 117 (17): 9241–9243. Bibcode:2020PNAS..117.9241F. doi:10.1073/pnas.2004999117. ISSN 0027-8424. PMC 7196762. PMID 32269081.
  10. ^ Rambaut A, Holmes EC, OToole A, Hill V, McCrone JT, Ruis C, et al. (15 July 2020). "A dynamic nomenclature proposal for SARS-CoV-2 lineages to assist genomic epidemiology". Nature Microbiology. 5 (11): 1403–1407. doi:10.1038/s41564-020-0770-5. PMC 7610519. PMID 32669681.
  11. ^ Tregoning JS, Flight KE, Higham SL, Wang Z, Pierce BF (9 August 2021). "Progress of the COVID-19 vaccine effort: viruses, vaccines and variants versus efficacy, effectiveness and escape". Nature Reviews Immunology. 21 (10): 626–636. doi:10.1038/s41577-021-00592-1. PMC 8351583. PMID 34373623.
  12. ^ Piplani S, Singh PK, Winkler DA, Petrovsky N (December 2021). "In silico comparison of SARS-CoV-2 spike protein-ACE2 binding affinities across species and implications for virus origin". Scientific Reports. 11 (1): 13063. Bibcode:2021NatSR..1113063P. doi:10.1038/s41598-021-92388-5. PMC 8225877. PMID 34168168.
  13. ^ Gallagher J (12 June 2021). "Covid: Is there a limit to how much worse variants can get?". BBC. Archived from the original on 15 June 2021. Retrieved 12 June 2021.
  14. ^ Jump up to: a b c Tao K, Tzou PL, Nouhin J, Gupta RK, de Oliveira T, Kosakovsky Pond SL, et al. (17 September 2021). "The biological and clinical significance of emerging SARS-CoV-2 variants". Nature Reviews Genetics. 22 (12): 757–773. doi:10.1038/s41576-021-00408-x. PMC 8447121. PMID 34535792.
  15. ^ Hendy M, Kaufman S, Ponga M (December 2021). "Molecular strategies for antibody binding and escape of SARS-CoV-2 and its mutations". Scientific Reports. 11 (1): 21735. Bibcode:2021NatSR..1121735H. doi:10.1038/s41598-021-01081-0. PMC 8571385. PMID 34741079.
  16. ^ "SARS-CoV-2 variants: risk assessment framework" (PDF). GOV.UK. Government Digital Service. Public Health England. 22 May 2021. GOV-8426. Archived (PDF) from the original on 27 May 2021. Retrieved 22 June 2021.
  17. ^ Jump up to: a b c d e f g h i j "Tracking SARS-CoV-2 variants". who.int. World Health Organization. Archived from the original on 18 June 2021. Retrieved 22 June 2021. Updated frequently.
  18. ^ Jump up to: a b c d e f g h i j k "SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions". CDC.gov. Centers for Disease Control and Prevention. 11 February 2020. Archived from the original on 29 June 2021. Retrieved 18 June 2021. Updated frequently.
  19. ^ Jump up to: a b c d e f g h i j k l m "Variants: distribution of cases data". Public Health England. Government Digital Service. Archived from the original on 7 June 2021. Retrieved 16 February 2021. Updated frequently. Data up to 19 May 2021 included in the 2 July 2021 update.
  20. ^ Jump up to: a b c d e "Living Evidence – SARS-CoV-2 variants". Agency for Clinical Innovation. nsw.gov.au. Ministry of Health (New South Wales). 23 July 2021. Archived from the original on 16 April 2021. Retrieved 22 March 2021. Updated frequently.
  21. ^ Jump up to: a b c "SARS-CoV-2 variants of concern". ECDC.eu. European Centre for Disease Prevention and Control. 30 April 2021. Archived from the original on 16 June 2021. Retrieved 12 May 2021. Updated frequently.
  22. ^ "Coronavirus Disease (COVID-19) Situation Reports". who.int. World Health Organization. Archived from the original on 26 January 2020. Retrieved 14 June 2021. Updated frequently.
  23. ^ "Investigation of SARS-CoV-2 variants: technical briefings". GOV.UK. Government Digital Service. Public Health England. Retrieved 18 November 2021. Updated frequently.
  24. ^ "Investigation of SARS-CoV-2 variants of concern: variant risk assessments". GOV.UK. Government Digital Service. Public Health England. Archived from the original on 19 June 2021. Retrieved 19 June 2021. Updated frequently.
  25. ^ Jump up to: a b c d e f g Weekly epidemiological update on COVID-19 – 20 July 2021 (Situation report). World Health Organization. 20 July 2021. Archived from the original on 23 July 2021. Retrieved 24 July 2021.
  26. ^ Planas D, Veyer D, Baidaliuk A, Staropoli I, Guivel-Benhassine F, Rajah MM, et al. (27 May 2021). "Reduced sensitivity of infectious SARS-CoV-2 variant B.1.617.2 to monoclonal antibodies and sera from convalescent and vaccinated individuals". bioRxiv 10.1101/2021.05.26.445838.
  27. ^ Jump up to: a b "Classification of Omicron (B.1.1.529): SARS-CoV-2 Variant of Concern". World Health Organization. 26 November 2021. Retrieved 26 November 2021.
  28. ^ Jump up to: a b c d e f g h Weekly epidemiological update on COVID-19 – 22 June 2021 (Situation report). World Health Organization. 22 June 2021. Archived from the original on 29 June 2021. Retrieved 26 June 2021.
  29. ^ Jump up to: a b SARS-CoV-2 variants of concern and variants under investigation in England, technical briefing 10 (PDF) (Briefing). Public Health England. 7 May 2021. GOV-8226. Archived (PDF) from the original on 8 May 2021. Retrieved 6 June 2021.
  30. ^ Jump up to: a b c d "SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions". CDC.gov. Centers for Disease Control and Prevention. 29 June 2021. Archived from the original on 16 June 2021. Retrieved 19 February 2021. Frequently updated.
  31. ^ Jump up to: a b c d Campbell F, Archer B, Laurenson-Schafer H, Jinnai Y, Konings F, Batra N, et al. (June 2021). "Increased transmissibility and global spread of SARS-CoV-2 variants of concern as at June 2021". Euro Surveillance. 26 (24): 2100509. doi:10.2807/1560-7917.ES.2021.26.24.2100509. PMC 8212592. PMID 34142653.
  32. ^ Sheikh A, McMenamin J, Taylor B, Robertson C (June 2021). "SARS-CoV-2 Delta VOC in Scotland: demographics, risk of hospital admission, and vaccine effectiveness". Lancet. 397 (10293): 2461–2462. doi:10.1016/S0140-6736(21)01358-1. PMC 8201647. PMID 34139198.
  33. ^ Jump up to: a b "SARS-CoV-2 variants of concern and variants under investigation in England Technical Briefing 21" (PDF). Public Health England. 20 August 2021. p. 16 and 22. Archived (PDF) from the original on 29 August 2021. Retrieved 29 August 2021.
  34. ^ Jump up to: a b Risk assessment for SARS-CoV-2 variant Delta (PDF) (Assessment). Public Health England. 23 July 2021. Archived (PDF) from the original on 25 July 2021. Retrieved 24 July 2021.
  35. ^ Yadav PD, Sapkal GN, Abraham P, Ella R, Deshpande G, Patil DY, et al. (May 2021). "Neutralization of variant under investigation B.1.617 with sera of BBV152 vaccinees". Clinical Infectious Diseases. 74 (ciab411). Oxford University Press: 366–368. bioRxiv 10.1101/2021.04.23.441101. doi:10.1093/cid/ciab411. PMID 33961693.
  36. ^ Callaway E (25 November 2021). "Heavily mutated coronavirus variant puts scientists on alert". Nature. 600 (7887): 21. Bibcode:2021Natur.600...21C. doi:10.1038/d41586-021-03552-w. PMID 34824381. S2CID 244660616.
  37. ^ SARS-CoV-2 variants of concern and variants under investigation in England, technical briefing 29 (PDF) (Briefing). Public Health England. 26 November 2021. GOV-10481. Archived (PDF) from the original on 27 November 2021. Retrieved 26 November 2021.
  38. ^ Jump up to: a b c Risk assessment for SARS-CoV-2 variant Omicron (PDF) (Assessment). Public Health England. 22 December 2021. GOV-10869. Retrieved 23 December 2021.
  39. ^ Jump up to: a b Nyberg T, Ferguson NM, Nash SG, Webster HH, Flaxman S, Andrews N, et al. (16 March 2022). "Comparative analysis of the risks of hospitalisation and death associated with SARS-CoV-2 omicron (B.1.1.529) and delta (B.1.617.2) variants in England: a cohort study". The Lancet. 399 (10332): 1303–1312. doi:10.1016/S0140-6736(22)00462-7. ISSN 0140-6736. PMC 8926413. PMID 35305296.
  40. ^ Rambaut A, Loman N, Pybus O, Barclay W, Barrett J, Carabelli A, et al. (18 December 2020). "Preliminary genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in the UK defined by a novel set of spike mutations". Virological. Archived from the original on 21 December 2020. Retrieved 14 June 2021.
  41. ^ Investigation of novel SARS-COV-2 variant, technical briefing 1 (PDF) (Briefing). Public Health England. 21 December 2020. Archived (PDF) from the original on 15 June 2021. Retrieved 6 June 2021.
  42. ^ Jump up to: a b c d e f g "Emerging SARS-CoV-2 Variants". CDC.gov (Science brief). Centers for Disease Control and Prevention. 28 January 2021. Archived from the original on 15 May 2021. Retrieved 4 January 2021. Public Domain This article incorporates text from this source, which is in the public domain.
  43. ^ Jump up to: a b Chand et al. (2020), p. 6, Potential impact of spike variant N501Y.
  44. ^ Nyberg T, Twohig KA, Harris RJ, Seaman SR, Flannagan J, Allen H, et al. (June 2021). "Risk of hospital admission for patients with SARS-CoV-2 variant B.1.1.7: cohort analysis". BMJ. 373: n1412. arXiv:2104.05560. doi:10.1136/bmj.n1412. PMC 8204098. PMID 34130987. S2CID 235187479.
  45. ^ "Confirmed cases of COVID-19 variants identified in UK". GOV.UK. Public Health England. 15 January 2021. Archived from the original on 7 May 2021. Retrieved 5 March 2021.
  46. ^ Horby P, Barclay W, Gupta R, Huntley C (27 January 2021). NERVTAG paper: note on variant P.1 (Note). Public Health England. Archived from the original on 6 June 2021. Retrieved 6 June 2021.
  47. ^ Horby P, Barclay W, Huntley C (13 January 2021). NERVTAG paper: brief note on SARS-CoV-2 variants (Note). Public Health England. Archived from the original on 6 June 2021. Retrieved 6 June 2021.
  48. ^ This table is an adaptation and expansion of Alm et al., figure 1.
  49. ^ Jump up to: a b Rambaut A, Holmes EC, O'Toole Á, Hill V, McCrone JT, Ruis C, et al. (November 2020). "A dynamic nomenclature proposal for SARS-CoV-2 lineages to assist genomic epidemiology". Nature Microbiology. 5 (11): 1403–1407. doi:10.1038/s41564-020-0770-5. PMC 7610519. PMID 32669681. S2CID 220544096. Cited in Alm et al.
  50. ^ Jump up to: a b Alm E, Broberg EK, Connor T, Hodcroft EB, Komissarov AB, Maurer-Stroh S, et al. (The WHO European Region sequencing laboratories and GISAID EpiCoV group) (August 2020). "Geographical and temporal distribution of SARS-CoV-2 clades in the WHO European Region, January to June 2020". Euro Surveillance. 25 (32). doi:10.2807/1560-7917.ES.2020.25.32.2001410. PMC 7427299. PMID 32794443.
  51. ^ "Nextclade" (What are the clades?). nextstrain.org. Archived from the original on 19 January 2021. Retrieved 19 January 2021.
  52. ^ Jump up to: a b c d Bedford T, Hodcroft B, Neher RA (6 January 2021). "Updated Nextstrain SARS-CoV-2 clade naming strategy". nextstrain.org. Archived from the original on 18 January 2021. Retrieved 19 January 2021.
  53. ^ Jump up to: a b c d e f Zhukova A, Blassel L, Lemoine F, Morel M, Voznica J, Gascuel O (November 2020). "Origin, evolution and global spread of SARS-CoV-2". Comptes Rendus Biologies. 344: 57–75. doi:10.5802/crbiol.29. PMID 33274614.
  54. ^ "Genomic epidemiology of novel coronavirus – Global subsampling (Filtered to B.1.617)". nextstrain.org. Archived from the original on 13 July 2021. Retrieved 5 May 2021.
  55. ^ Jump up to: a b c d Zhang W, Davis B, Chen SS, Martinez JS, Plummer JT, Vail E (2021). "Emergence of a Novel SARS-CoV-2 Variant in Southern California". JAMA. 325 (13): 1324–1326. doi:10.1001/jama.2021.1612. ISSN 0098-7484. PMC 7879386. PMID 33571356. Retrieved 2 October 2021.
  56. ^ What are the clades? clades.nextstrain.org, accessed 29 November 2021
  57. ^ "PANGO lineages-Lineage B.1.1.28". cov-lineages.org. Archived from the original on 24 February 2021. Retrieved 4 February 2021.[failed verification]
  58. ^ "Variant: 20J/501Y.V3". covariants.org. 1 April 2021. Archived from the original on 23 March 2021. Retrieved 6 April 2021.
  59. ^ "clade tree (from 'Clade and lineage nomenclature')". GISAID. 4 July 2020. Archived from the original on 9 January 2021. Retrieved 7 January 2021.
  60. ^ "Don't call it the 'British variant.' Use the correct name: B.1.1.7". STAT. 9 February 2021. Archived from the original on 4 June 2021. Retrieved 12 February 2021.
  61. ^ Фланаган Р. (2 февраля 2021 г.). «Почему ВОЗ не называет это «британским вариантом», и вам тоже не следует этого делать» . Новости КТВ . Архивировано из оригинала 1 мая 2021 года . Проверено 12 февраля 2021 г.
  62. ^ Список источников, в которых используются имена, относящиеся к стране, в которой варианты были впервые идентифицированы, см., например, в Talk:South African Covid-вариант и Talk:UK Coronavirusvariant .
  63. ^ «Сегодня @ВОЗ объявляет о новых, простых в произнесении ярлыках для #SARSCoV2: варианты, вызывающие озабоченность (VOC) и интерес (VOI)» . Архивировано из оригинала 7 июля 2021 года . Проверено 7 июля 2021 г.
  64. ^ Брансвелл Х. (31 мая 2021 г.). «Игра в названия вариантов коронавируса стала немного проще» . Стат Новости . Архивировано из оригинала 17 июня 2021 года . Проверено 28 июня 2021 г.
  65. ^ Всемирная организация здравоохранения (15 января 2021 г.). «Заявление о шестом заседании Комитета по чрезвычайной ситуации Международных медико-санитарных правил (2005 г.) в связи с пандемией коронавирусной болезни (COVID-19)» . Архивировано из оригинала 7 февраля 2021 года . Проверено 18 января 2021 г.
  66. ^ «Covid: ВОЗ переименовывает Великобританию и другие варианты греческими буквами» . Новости Би-би-си . 31 мая 2021 года. Архивировано из оригинала 31 мая 2021 года . Проверено 7 июля 2021 г.
  67. ^ Перейти обратно: а б «ВОЗ пропустила две буквы греческого алфавита при названии варианта коронавируса» . Ассошиэйтед Пресс . 27 ноября 2021 г.
  68. ^ «Новые варианты COVID могут быть названы в честь созвездий, как только греческий алфавит будет израсходован» . Небесные новости. 8 августа 2021 г. Проверено 30 ноября 2021 г.
  69. ^ Кояма Т., Платт Д., Парида Л. (июль 2020 г.). «Вариантный анализ геномов SARS-CoV-2» . Бюллетень Всемирной организации здравоохранения . 98 (7): 495–504. дои : 10.2471/BLT.20.253591 . ПМЦ   7375210 . ПМИД   32742035 . Всего мы обнаружили 65776 вариантов, из них 5775 различных.
  70. ^ Перейти обратно: а б с Штаб-квартира ВОЗ (8 января 2021 г.). «3.6 Соображения по наименованию и номенклатуре вирусов». Геномное секвенирование SARS-CoV-2 в целях общественного здравоохранения: временное руководство, 8 января 2021 г. Всемирная организация здравоохранения. п. 6. Архивировано из оригинала 23 января 2021 года . Проверено 2 февраля 2021 г.
  71. ^ «Глобальная филогения, обновленная Nextstrain» . ГИСАИД. 18 января 2021 года. Архивировано из оригинала 20 января 2021 года . Проверено 19 января 2021 г.
  72. ^ Хэдфилд Дж., Мегилл С., Белл С.М., Хаддлстон Дж., Поттер Б., Каллендер С. и др. (декабрь 2018 г.). Келсо Дж. (ред.). «Nextstrain: отслеживание эволюции патогенов в реальном времени» . Биоинформатика . 34 (23): 4121–4123. doi : 10.1093/биоинформатика/bty407 . ПМК   6247931 . ПМИД   29790939 .
  73. ^ «Nextstrain COVID-19» . Следующий штамм . Архивировано из оригинала 21 января 2021 года . Проверено 1 июня 2021 г.
  74. ^ «cov-lineages/pangolin: пакет программного обеспечения для отнесения последовательностей генома SARS-CoV-2 к глобальным линиям» . Гитхаб. Архивировано из оригинала 15 февраля 2021 года . Проверено 2 января 2021 г.
  75. ^ Перейти обратно: а б «Описания родословных» . cov-lineages.org . Команда Панго . Архивировано из оригинала 4 июня 2021 года . Проверено 24 декабря 2020 г.
  76. ^ Рамбо А., Холмс Э.К., О'Тул А., Хилл В., Маккроун Дж.Т., Руис С. и др. (март 2021 г.). «Приложение: Предложение по динамической номенклатуре линий SARS-CoV-2 в помощь геномной эпидемиологии» . Природная микробиология . 6 (3): 415. дои : 10.1038/s41564-021-00872-5 . ПМЦ   7845574 . ПМИД   33514928 .
  77. ^ «Варианты: распределение данных случаев» . GOV.UK. ​28 января 2021 г. На конференции «Различия между вызывающим беспокойство вариантом и исследуемым вариантом» . Проверено 19 февраля 2021 г. Варианты SARS-CoV-2, если считается, что они обладают эпидемиологическими, иммунологическими или патогенными свойствами, подлежат официальному расследованию. На этом этапе им присваивается обозначение «Вариант на стадии расследования» (VUI) с указанием года, месяца и номера. После оценки риска соответствующим экспертным комитетом им может быть присвоен статус «Вариант, вызывающий беспокойство» (VOC).
  78. ^ Перейти обратно: а б Гриффитс Э., Таннер Дж., Нокс Н., Сяо В., Ван Домселар Дж. (15 января 2021 г.). Временные рекомендации CanCOGeN по наименованию, идентификации и сообщению о вызывающих беспокойство вариантах SARS-CoV-2 (PDF) . CanCOGeN (nccid.ca) (Отчет). 1.0. Архивировано (PDF) из оригинала 17 апреля 2021 года.
  79. ^ Исследование вызывающих озабоченность вариантов SARS-CoV-2 в Англии. Технический брифинг 6, 13 февраля 2021 г. (см. раздел: Номенклатура вариантов в Великобритании, стр. 3) assets.publishing.service.gov.uk , по состоянию на 27 февраля 2021 г.
  80. ^ CDC (11 февраля 2020 г.). «Случаи, данные и наблюдение» . Центры по контролю и профилактике заболеваний . Проверено 16 марта 2021 г.
  81. ^ Перейти обратно: а б с Кумар С., Тао К., Уивер С., Сандерфорд М., Карабалло-Ортис М.А., Шарма С. и др. (май 2021 г.). «Эволюционный портрет прародителя SARS-CoV-2 и его доминирующих ответвлений в пандемии COVID-19» . Молекулярная биология и эволюция . 38 (8): 3046–3059. дои : 10.1093/molbev/msab118 . ПМЦ   8135569 . ПМИД   33942847 .
  82. ^ Ву Ф, Чжао С, Ю Б, Чен ЮМ, Ван В, Сун ЗГ и др. (март 2020 г.). «Новый коронавирус связан с респираторным заболеванием человека в Китае» . Природа . 579 (7798): 265–269. Бибкод : 2020Natur.579..265W . дои : 10.1038/s41586-020-2008-3 . ПМК   7094943 . ПМИД   32015508 .
  83. ^ Кьяра М., Хорнер Д.С., Гисси К., Песоле Дж. (май 2021 г.). «Сравнительная геномика показывает раннее появление и неравномерное пространственно-временное распространение SARS-CoV-2» . Молекулярная биология и эволюция . 38 (6): 2547–2565. дои : 10.1093/molbev/msab049 . ПМЦ   7928790 . ПМИД   33605421 .
  84. ^ Чжоу П. , Ян С.Л., Ван С.Г., Ху Б., Чжан Л., Чжан В. и др. (март 2020 г.). «Вспышка пневмонии, связанная с новым коронавирусом вероятного происхождения от летучих мышей» . Природа . 579 (7798): 270–273. Бибкод : 2020Natur.579..270Z . дои : 10.1038/s41586-020-2012-7 . ПМК   7095418 . ПМИД   32015507 .
  85. ^ Окада П., Буатхонг Р., Фуйгун С., Танадачакул Т., Парнмен С., Вонгбут В. и др. (февраль 2020 г.). «Ранние модели передачи коронавирусной болезни 2019 года (COVID-19) среди путешественников из Уханя в Таиланд, январь 2020 года» . Евронаблюдение . 25 (8). дои : 10.2807/1560-7917.ES.2020.25.8.2000097 . ПМК   7055038 . ПМИД   32127124 .
  86. ^ «Официальная эталонная последовательность hCoV-19» . www.gisaid.org . Архивировано из оригинала 6 мая 2021 года . Проверено 14 мая 2021 г.
  87. ^ «Предок уханьского штамма SARS-CoV-2 циркулировал в конце октября 2019 года» . Новости Медицинские . Архивировано из оригинала 24 июля 2021 года . Проверено 10 мая 2020 г. Ссылка в журнале: Кумар, С. и др. (2021). Эволюционный портрет...
  88. ^ Участник IDSA «COVID «Мегавариант» и восемь критериев шаблона для оценки всех вариантов» . Наука говорит: Global ID News . 2 февраля 2021 г. Архивировано из оригинала 21 апреля 2021 г. Проверено 20 февраля 2021 г.
  89. ^ Перейти обратно: а б «Классификация Омикрона (B.1.1.529): вызывающий беспокойство вариант SARS-CoV-2» . www.who.int . Проверено 26 ноября 2021 г.
  90. ^ Каллауэй Э (25 ноября 2021 г.). «Сильно мутировавший вариант коронавируса заставляет ученых насторожиться» . Природа . 600 (7887): 21. Бибкод : 2021Natur.600...21C . дои : 10.1038/d41586-021-03552-w . ПМИД   34824381 . S2CID   244660616 .
  91. ^ Фернандо М.Дж. «Мировые эксперты проводят специальное совещание по тревожному новому варианту COVID-19 в Южной Африке: последние новости» . США сегодня .
  92. ^ «outbreak.info» . вспышка.информация . Проверено 26 ноября 2021 г.
  93. ^ Covid: новый сильно мутировавший вариант B.1.1.529 в Южной Африке вызывает обеспокоенность , 25 ноября 2021 г., BBC News, по состоянию на 25 ноября 2021 г.
  94. ^ Перейти обратно: а б с д и ж Отслеживание вариантов SARS-CoV-2 . www.who.int , по состоянию на 26 мая 2022 г. Часто обновляется.
  95. ^ Уайтсайд П. (30 ноября 2021 г.). «COVID-19: Как распространение Омикрона от нулевого пациента распространилось по всему миру» . Небесные новости . Проверено 3 января 2022 г.
  96. ^ @BNODesk (26 ноября 2021 г.). «Заявление министерства здравоохранения Израиля, сообщающее об 1 подтвержденном случае нового варианта коронавируса B.1.1.529» ( твит ) . Проверено 26 ноября 2021 г. - через Twitter .
  97. ^ 14:30 4 проверенных на новый вариант были обнаружены в Израиле, премьер-министр проведет пресс-конференцию с переводом: "...В стране подтверждено 4 проверенных на новый вариант..." , m.ynet.co , по состоянию на 26 ноября 2021 г.
  98. ^ «Бельгия выявила первый случай нового варианта COVID-19 в Европе» . Рейтер . 26 ноября 2021 г. Проверено 26 ноября 2021 г.
  99. ^ «ЕЖЕНЕДЕЛЬНЫЙ БЮЛЛЕТЕНЬ ИНСАКОГ» (PDF) . dbtindia.gov.in . 10 января 2022 г. Проверено 24 января 2022 г.
  100. ^ «Заявление о сублинии Омикрона ВА.2» . www.who.int . Проверено 4 апреля 2022 г.
  101. ^ Перейти обратно: а б Шмидт К. «Что мы знаем о варианте BA.2 компании Omicron на данный момент» . Научный американец . Проверено 4 апреля 2022 г.
  102. ^ «Инфекция Covid снова растет по всей Великобритании – ONS» . Новости Би-би-си . 11 марта 2022 г.
  103. ^ Джессика Рендалл (29 марта 2022 г.). «BA.2 теперь является доминирующим вариантом COVID в США, как показывают данные CDC» .
  104. ^ ECDC (12 мая 2022 г.). «Изменения в списке вызывающих беспокойство вариантов SARS-CoV-2, вариантов, представляющих интерес, и вариантов, находящихся под наблюдением» (PDF) .
  105. ^ Перейти обратно: а б Питер Рассел (6 января 2023 г.). «Омикрон XBB.1.5: что мы знаем на данный момент?» . Проверено 8 января 2023 г.
  106. ^ «Обновление распространенности последовательности генома SARS-CoV-2 и темпов роста: 8 ноября 2023 г.» . GOV.UK. ​6 декабря 2023 г. Проверено 21 декабря 2023 г.
  107. ^ Джонсон А. «Что мы знаем о варианте Covid «Эрис» EG.5: доминирующий штамм, вызывающий рост заболеваемости» . Форбс . Проверено 11 августа 2023 г.
  108. ^ «cov-lineages.org» . Проверено 11 августа 2023 г.
  109. ^ Мундасад С. (10 августа 2023 г.). «Что мы знаем о варианте Covid EG.5, получившем название «Эрис» » . Новости Би-би-си . Би-би-си . Проверено 10 августа 2023 г.
  110. ^ «Еженедельный эпидемиологический обзор COVID-19 (выпуск 156, опубликовано 17 августа 2023 г.)» (PDF) . Всемирная организация здравоохранения. 17 августа 2023 г. Проверено 30 августа 2023 г.
  111. ^ «Covid: все, что мы знаем о новом потомке Омикрона на фоне роста зимнего гриппа» . Независимый . 8 декабря 2023 г. Проверено 16 декабря 2023 г.
  112. ^ Бартель А., Грау Дж. Х., Битцегейо Дж., Вербер Д., Линцнер Н., Шумахер В. и др. (10 января 2024 г.). «Своевременный мониторинг фрагментов РНК SARS-CoV-2 в сточных водах показывает появление JN.1 (BA.2.86.1.1, клада 23I) в Берлине, Германия» . Вирусы . 16 (1): 102. дои : 10.3390/v16010102 . ISSN   1999-4915 . ПМЦ   10818819 . ПМИД   38257802 .
  113. ^ «Первоначальная оценка рисков JN.1, 19 декабря 2023 г.» (PDF) . Всемирная организация здравоохранения. 19 декабря 2023 г. Проверено 11 января 2024 г.
  114. ^ «Возвращение маски? Сингапур и Индонезия возвращают ограничения на фоне резкого роста случаев Covid» . мята . 14 декабря 2023 г. Проверено 16 декабря 2023 г.
  115. ^ «Активность COVID-19 возрастает, поскольку распространенность варианта JN.1 продолжает расти» . Центры по контролю и профилактике заболеваний. 5 января 2024 г. Проверено 11 января 2024 г.
  116. ^ Обновленная оценка риска JN.1, 9 января 2023 г. [неверно указана дата] (PDF) , Всемирная организация здравоохранения , 9 февраля 2024 г., Викиданные   Q124477897 , заархивировано (PDF) из оригинала 10 февраля 2024 г.
  117. ^ Левентис Лургос А (9 мая 2024 г.). «Новые варианты COVID 'FLiRT' распространяются по всей стране. Эксперты здравоохранения Чикаго призывают к своевременной вакцинации» . Yahoo Новости . Проверено 14 мая 2024 г. - через Chicago Tribune .
  118. ^ Ки С. (20 мая 2024 г.). «Новые варианты COVID, распространяющиеся в США, называются FLiRT. Но почему?" . СЕГОДНЯ.com . Проверено 29 мая 2024 г.
  119. ^ Натан Бартлетт (9 июля 2024 г.). «От FLiRT до FluQE: что нужно знать о последних растущих вариантах COVID» . Разговор . Викиданные   Q127329080 . Архивировано из оригинала 10 июля 2024 года.
  120. ^ Отслеживание вариантов SARS-CoV-2 , Всемирная организация здравоохранения , 29 мая 2022 г., Викиданные   Q127329189 , заархивировано из оригинала 29 мая 2022 г.
  121. ^ Перейти обратно: а б Отслеживание вариантов SARS-CoV-2 , Всемирная организация здравоохранения , 11 февраля 2023 г., Викиданные   Q127329489 , заархивировано из оригинала 11 февраля 2023 г.
  122. ^ Перейти обратно: а б «Заявление об обновлении рабочих определений ВОЗ и системы отслеживания вызывающих озабоченность и представляющих интерес вариантов SARS-CoV-2» . www.who.int . Проверено 29 декабря 2023 г.
  123. ^ Перейти обратно: а б «Обновленные рабочие определения и основные действия для вариантов SARSCoV2» . www.who.int . Проверено 29 декабря 2023 г.
  124. ^ Перейти обратно: а б Отслеживание вариантов SARS-CoV-2 , Всемирная организация здравоохранения , 20 декабря 2023 г., Викиданные   Q127328911 , заархивировано из оригинала 20 декабря 2023 г.
  125. ^ «Covid: Ирландия, Италия, Бельгия и Нидерланды запрещают полеты из Великобритании» . Новости Би-би-си . 20 декабря 2020 года. Архивировано из оригинала 21 декабря 2020 года . Проверено 23 декабря 2020 г.
  126. ^ Чанд М., Хопкинс С., Дабрера Г., Ачисон С., Барклай В., Фергюсон Н. и др. (21 декабря 2020 г.). Исследование нового варианта SARS-COV-2: вызывающий беспокойство вариант 202012/01 (PDF) (отчет). Общественное здравоохранение Англии. Архивировано (PDF) оригинала 22 февраля 2021 года . Проверено 23 декабря 2020 г.
  127. ^ «PHE исследует новый штамм COVID-19» . Общественное здравоохранение Англии (PHE). 14 декабря 2020 г.
  128. ^ Перейти обратно: а б с д и ж г Еженедельный эпидемиологический обзор по COVID-19 за 8 июня 2021 г. (Ситуационный отчет). Всемирная организация здравоохранения. 8 июня 2021 года. Архивировано из оригинала 15 июня 2021 года . Проверено 14 июня 2021 г.
  129. ^ Рамбо А., Ломан Н., Пибус О., Барклай В., Барретт Дж., Карабелли А. и др. (2020). Предварительная геномная характеристика новой линии SARS-CoV-2 в Великобритании, определяемой новым набором шиповых мутаций (отчет). Написано от имени Консорциума геномики COVID-19 Великобритании. Архивировано из оригинала 22 февраля 2021 года . Проверено 20 декабря 2020 г.
  130. ^ Купфершмидт К. (20 декабря 2020 г.). «Мутантный коронавирус в Соединенном Королевстве вызывает тревогу, но его важность остается неясной» . Научный журнал . Архивировано из оригинала 21 декабря 2020 года . Проверено 21 декабря 2020 г. .
  131. ^ Перейти обратно: а б Коллиер Д.А., Де Марко А., Феррейра И.А., Мэн Б., Датир Р.П., Уоллс А.С. и др. (май 2021 г.). «Чувствительность SARS-CoV-2 B.1.1.7 к мРНК антител, индуцированных вакциной» . Природа (Опубликовано). 593 (7857): 136–141. дои : 10.1038/s41586-021-03412-7 . ПМЦ   7899479 . ПМИД   33706364 . Поэтому мы создали псевдовирусы, несущие шиповые мутации B.1.1.7 с дополнительной заменой E484K или без нее, и протестировали их против сывороток, полученных после первой и второй дозы мРНК-вакцины BNT162b2, а также против сывороток выздоравливающих. После второй дозы вакцины мы наблюдали значительную потерю нейтрализующей активности псевдовируса со спайковыми мутациями B.1.1.7 и E484K (рис. 3г, д). Среднее кратное изменение для варианта B.1.1.7 с шипами, содержащего E484K, составило 6,7 по сравнению с 1,9 для варианта B.1.1.7 по сравнению с белком с шипами дикого типа (рис. 3a–c и расширенные данные, рис. 5). ). Аналогичным образом, когда мы протестировали панель сывороток выздоравливающих с диапазоном титров нейтрализации (рис. 1f, g и расширенные данные, рис. 5), мы наблюдали дополнительную потерю активности против мутантного спайка B.1.1.7 с E484K, с кратностью изменение на 11,4 по сравнению с шиповидным белком дикого типа (рис. 3f, g и расширенные данные, рис. 5).
  132. ^ Перейти обратно: а б «Новые данные о ВУИ-202012/01 и обзор оценки риска для здоровья населения» . Центр знаний . 15 декабря 2020 года. Архивировано из оригинала 21 декабря 2020 года . Проверено 25 декабря 2020 г.
  133. ^ «Витрина COG-UK» . 18 декабря 2020 года. Архивировано из оригинала 14 июня 2021 года . Проверено 25 декабря 2020 г. - через YouTube.
  134. ^ Дэвис Н.Г., Эбботт С., Барнард Р.К., Джарвис С.И., Кучарски А.Дж., Мандей Дж.Д. и др. (апрель 2021 г.). «Оценочная трансмиссивность и влияние SARS-CoV-2 линии B.1.1.7 в Англии» . Наука . 372 (6538): eabg3055. дои : 10.1126/science.abg3055 . ПМЦ   8128288 . ПМИД   33658326 .
  135. ^ Волц Э., Мишра С., Чанд М., Барретт Дж.К., Джонсон Р., Гейдельберг Л. и др. (май 2021 г.). «Оценка трансмиссивности SARS-CoV-2 линии B.1.1.7 в Англии» . Природа . 593 (7858): 266–269. Бибкод : 2021Природа.593..266В . дои : 10.1038/s41586-021-03470-x . hdl : 10044/1/87474 . ПМИД   33767447 .
  136. ^ Хорби П., Хантли С., Дэвис Н., Эдмундс Дж., Фергюсон Н., Медли Г. и др. (11 февраля 2021 г.). «Документ NERVTAG о вызывающем обеспокоенность варианте COVID-19 B.1.1.7: Обновленная примечание NERVTAG о серьезности B.1.1.7 (11 февраля 2021 г.)» (PDF) . GOV.UK. ​ Архивировано (PDF) из оригинала 13 апреля 2021 года . Проверено 26 февраля 2021 г.
  137. ^ Галлахер Дж. (22 января 2021 г.). «Коронавирус: британский вариант «может быть более смертоносным» » . Новости Би-би-си . Архивировано из оригинала 23 мая 2021 года . Проверено 22 января 2021 г.
  138. ^ Фрэмптон Д., Рэмплинг Т., Кросс А., Бейли Х., Хини Дж., Байотт М. и др. (апрель 2021 г.). «Геномные характеристики и клинический эффект новой линии SARS-CoV-2 B.1.1.7 в Лондоне, Великобритания: полногеномное секвенирование и когортное исследование на базе больницы» . «Ланцет». Инфекционные болезни . 21 (9): 1246–1256. дои : 10.1016/S1473-3099(21)00170-5 . ПМК   8041359 . ПМИД   33857406 .
  139. ^ «Линия ПАНГО Lineage B.1.1.7» . cov-lineages.org . 15 мая 2021 года. Архивировано из оригинала 16 июня 2021 года . Проверено 15 мая 2021 г.
  140. ^ Перейти обратно: а б с д и «Отслеживание вариантов SARS-CoV-2 (обновлено 16 марта 2022 г.)» . www.who.int . 16 марта 2022 года. Архивировано из оригинала 17 марта 2022 года . Проверено 17 марта 2022 г.
  141. ^ Перейти обратно: а б с д и ж «Отслеживание вариантов SARS-CoV-2 (обновлено 7 марта 2022 г.)» . www.who.int . 7 марта 2022 года. Архивировано из оригинала 15 марта 2022 года . Проверено 21 мая 2022 г.
  142. ^ Мандавилли А (5 марта 2021 г.). «В Орегоне ученые обнаружили вариант вируса с тревожной мутацией. В единственном образце генетики обнаружили версию коронавируса, впервые выявленную в Великобритании, с мутацией, первоначально зарегистрированной в Южной Африке» . Нью-Йорк Таймс . Архивировано из оригинала 6 марта 2021 года . Проверено 6 марта 2021 г.
  143. ^ Чен Р.Э., Чжан Х., Кейс Дж.Б., Винклер Э.С., Лю Ю., ВанБларган Л.А. и др. (апрель 2021 г.). «Устойчивость вариантов SARS-CoV-2 к нейтрализации моноклональными и поликлональными антителами, полученными из сыворотки» . Природная медицина . 27 (4): 717–726. дои : 10.1038/s41591-021-01294-w . ПМЦ   8058618 . PMID   33664494 .
  144. ^ «B.1.1.7 Происхождение с отчетом S:E484K» . вспышка.информация . 5 марта 2021 года. Архивировано из оригинала 7 марта 2021 года . Проверено 7 марта 2021 г.
  145. ^ Мустафа А.М., Бьянко С., Дену Л., Ахмед А., Нейде Б., Эверетт Дж. и др. (21 апреля 2021 г.). «Сравнительный анализ новых изолятов B.1.1.7+E484K SARS-CoV-2 из Пенсильвании». bioRxiv   10.1101/2021.04.21.440801 .
  146. ^ «B.1.1.7 Происхождение с отчетом S:E484K» . вспышка.информация . Архивировано из оригинала 3 июля 2021 года . Проверено 28 мая 2021 г.
  147. ^ Риск, связанный с распространением новых вызывающих озабоченность вариантов SARS-CoV-2 в ЕС/ЕЭЗ – первое обновление (оценка риска). Европейский центр профилактики и контроля заболеваний. 2 февраля 2021 года. Архивировано из оригинала 25 марта 2021 года . Проверено 22 марта 2021 г.
  148. ^ Перейти обратно: а б с д «Южная Африка объявляет о новом варианте коронавируса» . Нью-Йорк Таймс . 18 декабря 2020 года. Архивировано из оригинала 21 декабря 2020 года . Проверено 20 декабря 2020 г.
  149. ^ Перейти обратно: а б Роутон Л., Беарак М. (18 декабря 2020 г.). «Коронавирус в Южной Африке: вторая волна, вызванная новым штаммом, подростковыми «фестивалями ярости» » . Вашингтон Пост . Архивировано из оригинала 27 декабря 2020 года . Проверено 20 декабря 2020 г.
  150. ^ Мхизе З. (18 декабря 2020 г.). «Обновленная информация о Covid-19 (18 декабря 2020 г.)» (пресс-релиз). ЮАР. Южноафриканский онлайн-портал о COVID-19. Архивировано из оригинала 4 мая 2021 года . Проверено 23 декабря 2020 г. Наши врачи также предупредили нас, что ситуация изменилась и что молодые, ранее здоровые люди теперь серьезно заболевают.
  151. ^ Абдул Карим СС (19 декабря 2020 г.). «Вторая волна Covid-19 в Южной Африке: трансмиссивность и вариант 501.V2, 11-й слайд» . www.scribd.com. Архивировано из оригинала 6 января 2021 года . Проверено 23 декабря 2020 г.
  152. ^ Лоу Д. (22 декабря 2020 г.). «Новые мутации» . В Трубопроводе . Американская ассоциация содействия развитию науки . Архивировано из оригинала 29 января 2021 года . Проверено 23 декабря 2020 г. Здесь я должен отметить, что в Южной Африке существует еще один штамм, вызывающий аналогичные опасения. У этого человека есть восемь мутаций в белке Spike, три из которых (K417N, E484K и N501Y) могут иметь некоторую функциональную роль.
  153. ^ «Заявление Рабочей группы ВОЗ по моделям животных COVID-19 (WHO-COM) о новых вариантах SARS-CoV-2 в Великобритании и Южной Африке» (PDF) . Всемирная организация здравоохранения. 22 декабря 2020 г. Архивировано (PDF) из оригинала 4 мая 2021 г. . Проверено 23 декабря 2020 г.
  154. ^ «Новая комбинация мутаций в сайте связывания спайковых рецепторов» (пресс-релиз). ГИСАИД . 21 декабря 2020 года. Архивировано из оригинала 22 февраля 2021 года . Проверено 23 декабря 2020 г.
  155. ^ «Япония обнаружила новый вариант коронавируса у путешественников из Бразилии» . Япония сегодня . Япония. 11 января 2021 года. Архивировано из оригинала 11 января 2021 года . Проверено 14 января 2021 г.
  156. ^ Перейти обратно: а б с д и ж Фариа Н.Р., Кларо И.М., Кандидо Д., Мойзес Франко Л.А., Андраде П.С., Колетти Т.М. и др. (12 января 2021 г.). «Геномная характеристика новой линии SARS-CoV-2 в Манаусе: предварительные результаты» . Геномная сеть CADDE. вирусологический сайт . Архивировано из оригинала 20 мая 2021 года . Проверено 23 января 2021 г.
  157. ^ Перейти обратно: а б «П.1» . cov-lineages.org . Команда Панго . 1 июля 2021 года. Архивировано из оригинала 9 июня 2021 года . Проверено 7 марта 2021 г.
  158. ^ «Отчет COG-UK о мутациях SARS-CoV-2 Spike, представляющих интерес в Великобритании» (PDF) . www.cogconsortium.uk . Британский консорциум по геномике Covid-19. 15 января 2021 г. Архивировано (PDF) из оригинала 16 апреля 2021 г. . Проверено 25 января 2021 г.
  159. ^ Перейти обратно: а б с Волох CM, да Силва Франсиско Р., де Алмейда Л.Г., Кардосо CC, Брустолини О.Дж., Гербер А.Л. и др. (март 2021 г.). «Геномная характеристика новой линии SARS-CoV-2 из Рио-де-Жанейро, Бразилия» . Журнал вирусологии . 95 (10). дои : 10.1128/jvi.00119-21 . ПМЦ   8139668 . ПМИД   33649194 .
  160. ^ Насименто V, Соуза V (25 февраля 2021 г.). «Эпидемия COVID-19 в бразильском штате Амазонас была вызвана длительным существованием эндемичных линий SARS-CoV-2 и недавним появлением нового вызывающего обеспокоенность варианта P.1» . Исследовательская площадь . дои : 10.21203/rs.3.rs-275494/v1 . Архивировано из оригинала 1 марта 2021 года . Проверено 2 марта 2021 г.
  161. ^ Фариа Н.Р., Меллан Т.А., Уиттакер С., Кларо И.М., Кандидо Д.Д., Мишра С. и др. (май 2021 г.). «Геномика и эпидемиология линии P.1 SARS-CoV-2 в Манаусе, Бразилия» . Наука . 372 (6544): 815–821. Бибкод : 2021Sci...372..815F . дои : 10.1126/science.abh2644 . ISSN   0036-8075 . ПМЦ   8139423 . ПМИД   33853970 . В этой вероятной области пространства параметров P.1 может быть в 1,7–2,4 раза более передающимся (50% BCI, 2,0 медиана, с 99% апостериорной вероятностью >1), чем местные линии, не относящиеся к P1, и может уклоняться от 21 до 2,0. 46% (50% BCI, 32% медиана, с апостериорной вероятностью 95% возможности избежать по крайней мере 10%) защитного иммунитета, вызванного предыдущим инфицированием линиями, отличными от P.1, что соответствует 54–79% (50 % BCI, 68% медиана) перекрестный иммунитет... По нашим оценкам, инфекции в 1,2–1,9 раза чаще (50% BCI, медиана 1,5, 90% апостериорная вероятность >1) приводят к смертности в период после появление P.1 по сравнению с предыдущим, хотя апостериорные оценки этого относительного риска также коррелируют с предполагаемым перекрестным иммунитетом. В более широком смысле, недавняя эпидемия в Манаусе создала нагрузку на городскую систему здравоохранения, что привело к недостаточному доступу к медицинской помощи. Поэтому мы не можем определить, связано ли предполагаемое увеличение относительного риска смертности с инфекцией P.1, стрессом в системе здравоохранения Манауса или с тем и другим. Необходимы детальные клинические исследования инфекций P.1.
  162. ^ Андреони М., Лондоньо Э., Касадо Л. (3 марта 2021 г.). «Кризис Covid в Бразилии является предупреждением для всего мира, говорят ученые: в Бразилии наблюдается рекордное количество смертей и распространение более заразного варианта коронавируса, который может вызвать повторное заражение» . Нью-Йорк Таймс . Архивировано из оригинала 3 марта 2021 года . Проверено 3 марта 2021 г.
  163. ^ Циммер С (1 марта 2021 г.). «Вариант вируса в Бразилии заразил многих, кто уже выздоровел от Covid-19. Первые подробные исследования так называемого варианта P.1 показывают, как он опустошил бразильский город. Теперь ученые хотят знать, что он будет делать в других местах» . Нью-Йорк Таймс . Архивировано из оригинала 3 марта 2021 года . Проверено 3 марта 2021 г.
  164. ^ София Моутинью (4 мая 2021 г.). «Китайская вакцина против COVID-19 обеспечивает защиту в пораженной вирусом инфекции Бразилии» . Наука . дои : 10.1126/science.abi9414 . S2CID   234804602 . Архивировано из оригинала 16 июня 2021 года . Проверено 4 мая 2021 г.
  165. ^ Гайер Р. (5 марта 2021 г.). «Эксклюзив: Оксфордское исследование показывает, что AstraZeneca эффективна против бразильского варианта, - сообщает источник» . Рейтер . Рио-де-Жанейро. Архивировано из оригинала 9 марта 2021 года . Проверено 9 марта 2021 г.
  166. ^ «Эксклюзив: Оксфордское исследование показывает, что AstraZeneca эффективна против бразильского варианта, - сообщает источник» . Рейтер . Рио-де-Жанейро. 8 марта 2021 года. Архивировано из оригинала 9 марта 2021 года . Проверено 9 марта 2021 г.
  167. ^ Симойнс Э., Гайер Р. (8 марта 2021 г.). «CoronaVac и Oxford эффективны против варианта Манауса, говорят лаборатории» [CoronaVac и Oxford эффективны против варианта Манауса, говорят лаборатории]. UOL Notícias (на португальском языке). Рейтер Бразилия. Архивировано из оригинала 8 марта 2021 года . Проверено 9 марта 2021 г.
  168. ^ «Глобально доминирующий штамм Covid Delta теперь распространился в 185 странах: ВОЗ» . 22 сентября 2021 г.
  169. ^ «Линии ПАНГО» . cov-lineages.org . Архивировано из оригинала 3 июня 2021 года . Проверено 18 апреля 2021 г.
  170. ^ Перейти обратно: а б с д Коши Дж. (8 апреля 2021 г.). «Коронавирус | Индийский штамм «двойного мутанта» под названием B.1.617» . Индус . Архивировано из оригинала 26 мая 2021 года . Проверено 10 апреля 2021 г.
  171. ^ «Вторая волна, вызванная вариантами вируса в Индии, совпала с резким увеличением числа зараженных самолетов, приземлившихся в Канаде» . Торонто Сан . 10 апреля 2021 года. Архивировано из оригинала 2 июня 2021 года . Проверено 10 апреля 2021 г.
  172. ^ «Еженедельная эпидемиологическая информация о COVID-19» . Всемирная организация здравоохранения . 11 мая 2021 года. Архивировано из оригинала 11 мая 2021 года . Проверено 12 мая 2021 г.
  173. ^ «Штамм COVID, впервые обнаруженный в Индии, обнаружен на 53 территориях: ВОЗ» . www.aljazeera.com . Архивировано из оригинала 19 июня 2021 года . Проверено 27 мая 2021 г.
  174. ^ Мишра С., Миндерманн С., Шарма М., Уиттакер С., Меллан Т.А., Уилтон Т. и др. (1 сентября 2021 г.). «Изменение состава линий SARS-CoV-2 и появление варианта Дельта в Англии» . Электронная клиническая медицина . 39 : 101064. doi : 10.1016/j.eclinm.2021.101064 . ISSN   2589-5370 . ПМЦ   8349999 . ПМИД   34401689 .
  175. ^ «Британские учёные предупреждают об индийском варианте коронавируса» . Рейтер . 7 мая 2021 г. Архивировано из оригинала 22 мая 2021 г. Проверено 7 мая 2021 г.
  176. ^ "реакция эксперта на то, что ВУИ-21АПР-02/Б.1.617.2 классифицируется PHE как вызывающий беспокойство вариант" . Научный медиацентр . 7 мая 2021 года. Архивировано из оригинала 13 июля 2021 года . Проверено 15 мая 2021 г.
  177. ^ Варианты SARS-CoV-2, вызывающие обеспокоенность, и варианты, находящиеся на стадии расследования в Англии, технический брифинг 14 (PDF) (Брифинг). Общественное здравоохранение Англии. 3 июня 2021 г. GOV-8530. Архивировано (PDF) из оригинала 4 июля 2021 года . Проверено 26 июня 2021 г.
  178. ^ Пирсон Х., Пуллен Л., Дао С. (11 июня 2021 г.). «AHS раскрывает данные о вакцинации при вспышке варианта COVID-19 Дельта в больнице Калгари» . Глобальные новости . Архивировано из оригинала 12 июня 2021 года . Проверено 12 июня 2021 г.
  179. ^ Шраер Р. (4 июня 2021 г.). « Непальский вариант»: какая мутация мешает поездкам в Португалию из зеленого списка?» . Новости Би-би-си . Архивировано из оригинала 19 июня 2021 года . Проверено 18 июня 2021 г.
  180. ^ Ачарья Б., Джамкхандикар С. (23 июня 2021 г.). «Объяснитель: что такое дельта-вариант коронавируса с мутацией K417N?» . Рейтер . Архивировано из оригинала 23 июня 2021 года . Проверено 23 июня 2021 г.
  181. ^ Варианты SARS-CoV-2, вызывающие обеспокоенность, и варианты, находящиеся на стадии расследования в Англии, технический брифинг 17 (PDF) (Брифинг). Общественное здравоохранение Англии. 25 июня 2021 г. GOV-8576. Архивировано (PDF) оригинала 25 июня 2021 года . Проверено 26 июня 2021 г.
  182. ^ Шарма М. (14 июня 2021 г.). «Идентифицирован новый вариант SARS-CoV-2 «Дельта Плюс»; вот что нам известно на данный момент» . Индия сегодня . Архивировано из оригинала 17 июня 2021 года . Проверено 16 июня 2021 г.
  183. ^ Катлер С. (18 июня 2021 г.). « Непальский вариант: что мы узнали на данный момент» . Разговор . Архивировано из оригинала 18 июня 2021 года . Проверено 18 июня 2021 г.
  184. ^ Тан Дж.В., Оливер Т. (2021). «Внедрение южноафриканского варианта SARS-CoV-2 501Y.V2 в Великобританию» . Журнал инфекции . 82 (4): e8–e10. дои : 10.1016/j.jinf.2021.01.007 . ПМЦ   7813514 . ПМИД   33472093 .
  185. ^ «Индия заявляет, что новый вариант COVID вызывает беспокойство» . Рейтер . Бангалор. 22 июня 2021 года. Архивировано из оригинала 23 июня 2021 года . Проверено 23 июня 2021 г.
  186. ^ Бисвас С. (23 июня 2021 г.). «Дельта плюс: ученые говорят, что слишком рано говорить о риске варианта Covid-19» . Новости Би-би-си . Архивировано из оригинала 23 июня 2021 года . Проверено 23 июня 2021 г.
  187. ^ Робертс М. (19 октября 2021 г.). «Covid-19: новая мутация варианта Дельта находится под пристальным наблюдением в Великобритании» . www.bbc.co.uk. ​Проверено 19 октября 2021 г.
  188. ^ «Отслеживание вариантов SARS-CoV-2» . www.who.int . 7 июня 2022 года. Архивировано из оригинала 22 июня 2022 года . Проверено 23 июня 2022 г.
  189. ^ «Штамм COVID-19 из Южной Калифорнии быстро расширяет глобальный охват» . Cedars-Sinai Отдел новостей . Лос-Анджелес . 11 февраля 2021 года. Архивировано из оригинала 16 апреля 2021 года . Проверено 17 марта 2021 г.
  190. ^ Латиф А.А., Маллен Дж.Л., Алкузвени М., Цуенг Г., Кано М., Хааг Э. и др. (Центр биологии вирусных систем). «Отчет о происхождении B.1.429» . вспышка.информация . Архивировано из оригинала 3 июля 2021 года . Проверено 28 мая 2021 г.
  191. ^ Перейти обратно: а б «Новый калифорнийский вариант может вызвать там всплеск вируса, как предполагает исследование» . Нью-Йорк Таймс . 19 января 2021 года. Архивировано из оригинала 9 июня 2021 года . Проверено 20 января 2021 г.
  192. ^ Азад А (17 марта 2021 г.). «Штаммы коронавируса, впервые обнаруженные в Калифорнии, официально являются «вариантами, вызывающими беспокойство», — заявили в CDC» . CNN . Архивировано из оригинала 6 июня 2021 года . Проверено 6 июня 2021 г.
  193. ^ Шен X, Тан Х, Паджон Р, Смит Дж, Гленн ГМ, Ши В и др. (июнь 2021 г.). «Нейтрализация SARS-CoV-2 вариантов B.1.429 и B.1.351» . Медицинский журнал Новой Англии . 384 (24): 2352–2354. дои : 10.1056/NEJMc2103740 . ПМЦ   8063884 . ПМИД   33826819 .
  194. ^ «Классификации и определения вариантов SARS-CoV-2: обновлено 23 июня 2021 г.» . CDC.gov . Центры по контролю и профилактике заболеваний. 23 июня 2021 года. Архивировано из оригинала 29 июня 2021 года.
  195. ^ Перейти обратно: а б с Циммер С, Мандавилли А (14 мая 2021 г.). «Как Соединённые Штаты на данный момент победили варианты» . Нью-Йорк Таймс . Архивировано из оригинала 16 мая 2021 года . Проверено 17 мая 2021 г.
  196. ^ Вадман М. (23 февраля 2021 г.). «Штамм калифорнийского коронавируса может быть более заразным и смертельным» . науки Новости . дои : 10.1126/science.abh2101 . Архивировано из оригинала 1 мая 2021 года . Проверено 17 марта 2021 г.
  197. ^ Хо С (28 февраля 2021 г.). «Работают ли тесты на коронавирус на вариантах?» . Хроники Сан-Франциско . Архивировано из оригинала 24 июня 2021 года . Проверено 24 июня 2021 г.
  198. ^ «Местный штамм COVID-19 обнаружен более чем у трети пациентов Лос-Анджелеса» . новости мудрые (пресс-релиз). Калифорния: Медицинский центр Сидарс-Синай. 19 января 2021 года. Архивировано из оригинала 13 июня 2021 года . Проверено 3 марта 2021 г.
  199. ^ Перейти обратно: а б «Б.1.429» . Группа Рамбо, Эдинбургский университет . Родословная ПАНГО. 15 февраля 2021 года. Архивировано из оригинала 28 апреля 2021 года . Проверено 16 февраля 2021 г.
  200. ^ Перейти обратно: а б «Отчет о происхождении B.1.429» . Исследование Скриппса . Вспышка.info. 15 февраля 2021 года. Архивировано из оригинала 9 июня 2021 года . Проверено 16 февраля 2021 г.
  201. ^ «Вариант COVID-19, впервые обнаруженный в других странах и штатах, теперь чаще встречается в Калифорнии» . Департамент общественного здравоохранения Калифорнии . Архивировано из оригинала 16 июня 2021 года . Проверено 30 января 2021 г.
  202. ^ Вайзе Э., Вайнтрауб К. «Новые штаммы COVID, быстро распространяющиеся по США, требуют тщательного наблюдения, говорят ученые» . США сегодня . Архивировано из оригинала 4 марта 2021 года . Проверено 30 января 2021 г.
  203. ^ «Дельта-ПЦР-тест» [Дельта-ПЦР-тест] (на датском языке). Статенский институт сывороток. 25 февраля 2021 года. Архивировано из оригинала 7 февраля 2021 года . Проверено 27 февраля 2021 г.
  204. ^ Перейти обратно: а б «Варианты GISAID hCOV19 (см. пункт меню «G/484K.V3 (B.1.525)»)» . ГИСАИД . Архивировано из оригинала 23 июня 2021 года . Проверено 4 марта 2021 г.
  205. ^ Перейти обратно: а б «Статус рассмотрения вызывающих беспокойство вариантов SARS-CoV-2 (VOC) в Дании» [Статус разработки вызывающих беспокойство вариантов SARS-CoV-2 (VOC) в Дании] (на датском языке). Статенский институт сывороток. 27 февраля 2021 года. Архивировано из оригинала 27 августа 2021 года . Проверено 27 февраля 2021 г.
  206. ^ Перейти обратно: а б «Отчет о международном происхождении B.1.525» . cov-lineages.org . Команда Панго . 19 мая 2021 года. Архивировано из оригинала 9 июня 2021 года . Проверено 16 февраля 2021 г.
  207. ^ Робертс М. (16 февраля 2021 г.). «Еще один новый вариант коронавируса замечен в Великобритании» . Новости Би-би-си . Архивировано из оригинала 20 июня 2021 года . Проверено 16 февраля 2021 г.
  208. ^ «Министерство здравоохранения подтверждает обнаружение двух мутаций SARS-CoV-2 в регионе 7» . Новости АБС-ЦБН . 18 февраля 2021 года. Архивировано из оригинала 3 мая 2021 года . Проверено 13 марта 2021 г.
  209. ^ Сантос Э (13 марта 2021 г.). «Министерство здравоохранения сообщает о «уникальном» варианте COVID-19 для PH, это первый случай бразильского варианта» . CNN Филиппины . Архивировано из оригинала 16 марта 2021 года . Проверено 17 марта 2021 г.
  210. ^ «Министерство здравоохранения подтверждает новый вариант COVID-19, впервые обнаруженный при ЛГ, первый случай бразильского варианта» . Новости АБС-ЦБН . 13 марта 2021 г. Архивировано из оригинала 2 мая 2021 г. Проверено 13 марта 2021 г.
  211. ^ "РН обнаружила новый вариант COVID-19 раньше, чем Япония, - уточняет эксперт" . CNN Филиппины . 13 марта 2021 года. Архивировано из оригинала 17 марта 2021 года . Проверено 17 марта 2021 г.
  212. ^ «Япония обнаружила новый вариант коронавируса у путешественника, прибывшего из PH» . CNN Филиппины . 13 марта 2021 года. Архивировано из оригинала 16 марта 2021 года . Проверено 21 марта 2021 г.
  213. ^ «Великобритания сообщает о двух случаях варианта COVID-19, впервые обнаруженного на Филиппинах» . АБС-КБН . 17 марта 2021 года. Архивировано из оригинала 18 марта 2021 года . Проверено 21 марта 2021 г.
  214. ^ «Covid-19: Саравак обнаруживает вариант, зарегистрированный на Филиппинах» . 30 апреля 2021 года. Архивировано из оригинала 1 мая 2021 года . Проверено 30 апреля 2021 г.
  215. ^ Мандавилли А (24 февраля 2021 г.). «Новый вариант коронавируса распространяется в Нью-Йорке, сообщают исследователи» . Нью-Йорк Таймс . Архивировано из оригинала 26 апреля 2021 года . Проверено 22 апреля 2021 г.
  216. ^ Еженедельный эпидемиологический обзор COVID-19 – 27 апреля 2021 г. (отчет о ситуации). Всемирная организация здравоохранения. 27 апреля 2021 года. Архивировано из оригинала 14 июня 2021 года . Проверено 14 июня 2021 г.
  217. ^ Ле Пейдж М (4 июня 2021 г.). «Индийский вариант Covid-19 (B.1.617)» . Новый учёный . Архивировано из оригинала 23 июня 2021 года . Проверено 8 июня 2021 г.
  218. ^ Нуки П., Ньюи С. (16 апреля 2021 г.). «Прибытие в Индию «двойной мутации» усугубляет различные проблемы, но угроза остается неясной» . Телеграф . ISSN   0307-1235 . Архивировано из оригинала 21 июня 2021 года . Проверено 17 апреля 2021 г.
  219. ^ «Коронавирус Covid 19: в Австралии обнаружен ультраконтагиозный вариант лямбда» . Вестник Новой Зеландии . Архивировано из оригинала 6 июля 2021 года . Проверено 6 июля 2021 г.
  220. ^ «COVID-19: вариант Лямбда может быть более устойчивым к вакцинам, чем другие штаммы» . Вион . 6 июля 2021 года. Архивировано из оригинала 6 июля 2021 года . Проверено 6 июля 2021 г.
  221. ^ «Лямбда-вариант: какой новый штамм Covid обнаружен в Великобритании?» . Независимый . 6 июля 2021 года. Архивировано из оригинала 6 июля 2021 года . Проверено 6 июля 2021 г.
  222. ^ «Что такое Му-вариант COVID-19?» . www.abc.net.au. ​1 сентября 2021 года. Архивировано из оригинала 1 сентября 2021 года . Проверено 1 сентября 2021 г.
  223. ^ О'Нил Л. (3 сентября 2021 г.). «Му: все, что вам нужно знать о новом интересующем варианте коронавируса» . Разговор . Архивировано из оригинала 3 сентября 2021 года . Проверено 3 сентября 2021 г.
  224. ^ Перейти обратно: а б «Обнаружение варианта шиповидного белка P681H SARS-CoV-2 в Нигерии» . Вирусологический . 23 декабря 2020 года. Архивировано из оригинала 13 июня 2021 года . Проверено 1 января 2021 г.
  225. ^ «Линия Б.1.1.207» . cov-lineages.org . Команда Панго . Архивировано из оригинала 27 января 2021 года . Проверено 11 марта 2021 г.
  226. ^ «Путешественникам из Квинсленда продлили карантин в отеле после обнаружения российского варианта коронавируса» . www.abc.net.au. ​3 марта 2021 года. Архивировано из оригинала 3 марта 2021 года . Проверено 3 марта 2021 г.
  227. ^ Коши Дж. (21 апреля 2021 г.). «Новый вариант коронавируса обнаружен в Западной Бенгалии» . www.thehindu.com . Архивировано из оригинала 26 мая 2021 года . Проверено 23 апреля 2021 г.
  228. ^ «Что представляет собой новый «тройной мутантный вариант» вируса Covid-19, обнаруженный в Бенгалии? Насколько он плох?» . www.indiatoday.in . 22 апреля 2021 года. Архивировано из оригинала 28 апреля 2021 года . Проверено 23 апреля 2021 г.
  229. ^ «Линии ПАНГО Lineage B.1.618» . cov-lineages.org . Архивировано из оригинала 14 мая 2021 года . Проверено 23 апреля 2021 г.
  230. ^ «Обнаружение новых вариантов SARS-CoV-2 в сточных водах Нью-Йорка» . Университет Миссури . Проверено 10 марта 2022 г.
  231. ^ Перейти обратно: а б Смит Д.С., Трухильо М., Грегори Д.А., Чунг К., Гао А., Грэм М. и др. (3 февраля 2022 г.). «Отслеживание загадочных линий SARS-CoV-2, обнаруженных в сточных водах Нью-Йорка» . Природные коммуникации . 13 (1): 635. Бибкод : 2022NatCo..13..635S . дои : 10.1038/s41467-022-28246-3 . ISSN   2041-1723 . ПМЦ   8813986 . ПМИД   35115523 .
  232. ^ Браун Э (4 января 2022 г.). «Что мы знаем о варианте COVID B.1.640.2 IHU с 46 мутациями» . Newsweek . Архивировано из оригинала 5 января 2022 года . Проверено 5 января 2022 г.
  233. ^ Фрейнд А (7 января 2022 г.). «Коронавирус: эксперты в области здравоохранения не встревожены вариантом, выявленным во Франции» . Немецкая волна . Архивировано из оригинала 7 января 2022 года . Проверено 8 января 2022 г.
  234. ^ Перейти обратно: а б Фрейнд А (4 января 2022 г.). «Новый вариант коронавируса выявлен во Франции» . Немецкая волна . Архивировано из оригинала 5 января 2022 года . Проверено 5 января 2022 г.
  235. ^ Перейти обратно: а б Бенгальский S (5 января 2022 г.). «Вариант, обнаруженный во Франции, не вызывает беспокойства, — говорят в ВОЗ» . Нью-Йорк Таймс . ISSN   0362-4331 . Архивировано из оригинала 6 января 2022 года . Проверено 5 января 2022 г.
  236. ^ «Отслеживание вариантов SARS-CoV-2» . Всемирная организация здравоохранения . Архивировано из оригинала 25 ноября 2021 года . Проверено 5 января 2022 г.
  237. ^ Кобб Э (6 января 2022 г.). « Вариант коронавируса IHU «на нашем радаре», но не является угрозой, заявляет Всемирная организация здравоохранения» . Новости CBS . Архивировано из оригинала 7 января 2022 года . Проверено 8 января 2022 г.
  238. ^ Чатурведи А (4 января 2022 г.). «Новый вариант Covid-19 IHU, обнаруженный во Франции, имеет больше мутаций, чем Omicron» . Индостан Таймс . Архивировано из оригинала 5 января 2022 года . Проверено 5 января 2022 г.
  239. ^ «COVID-19: новый вариант B.1.640.2 обнаружен во Франции – исследование» . «Джерузалем Пост» . Архивировано из оригинала 4 января 2022 года . Проверено 4 января 2022 г.
  240. ^ «Что такое вариант Covid Дельтакрон и где он был обнаружен?» . Хранитель . 11 марта 2022 г. Проверено 18 апреля 2022 г.
  241. ^ Лапид Н. (9 марта 2022 г.). «Идентифицирован вариант, сочетающий в себе Дельту и Омикрон; собаки чуют вирус с высокой точностью» . Рейтер . Проверено 18 апреля 2022 г.
  242. ^ «COVID-19, Украина и другие глобальные чрезвычайные ситуации в области здравоохранения, стенограмма виртуальной пресс-конференции — 16 марта 2022 г.» . www.who.int . Проверено 24 апреля 2022 г.
  243. ^ Снайдер М. «Возможно, существует новый вариант COVID, Дельтакрон. Вот что мы о нем знаем» . США СЕГОДНЯ . Проверено 24 апреля 2022 г.
  244. ^ Перейти обратно: а б Колсон П., Фурнье П.Е., Делерс Дж., Миллион М., Бедотто М., Хухамди Л. и др. (16 марта 2022 г.). «Культивирование и идентификация SARS-CoV-2 «Дельтамикрон» в кластере из трех случаев на юге Франции». стр. 3739–3749. medRxiv   10.1101/2022.03.03.22271812v2 .
  245. ^ «Дельта (AY.4) и BA.1 рекомбинантные во Франции/Дании [~30 сек, изолированы/пассированы в Веро] · Проблема № 444 · cov-lineages/pango-обозначение» . Гитхаб . Проверено 24 апреля 2022 г.
  246. ^ О'Нил Л. (21 марта 2022 г.). «Дельтакрон: что на данный момент ученые знают об этом новом гибридном коронавирусе» . Разговор . Проверено 18 апреля 2022 г.
  247. ^ Сундаравелу А (28 июля 2023 г.). «Ученые обнаружили у пациентов «самый мутировавший» и «самый крайний» вариант Covid» . Метро Новости . Проверено 28 июля 2023 г.
  248. ^ «Что такое новая мутация коронавируса | Японская медицинская лабораторная лаборатория» [Что такое новая мутация коронавируса | Японская медицинская лаборатория]. Архивировано из оригинала 3 сентября 2021 года . Проверено 3 сентября 2021 года .
  249. ^ «Вариант: 21G (Лямбда)» . Коварианты . Архивировано из оригинала 21 июля 2021 года . Проверено 3 сентября 2021 г.
  250. ^ Фрэнк Даймонд (7 августа 2021 г.). «Больше данных указывают на потенциальную летальность лямбда-варианта» . Инфекционный контроль сегодня . Архивировано из оригинала 3 сентября 2021 года . Проверено 3 сентября 2021 г.
  251. ^ Кимура И., Косуги Ю., Ву Дж., Ямасоба Д., Бутлертанака Э.П., Танака Ю.Л. и др. (2021). «Вариант SARS-CoV-2 Lambda демонстрирует более высокую инфекционность и иммунную устойчивость» . Отчеты по ячейкам . 38 (2): 110218. bioRxiv   10.1101/2021.07.28.454085 . дои : 10.1016/j.celrep.2021.110218 . hdl : 2433/267436 . ПМЦ   8683271 . ПМИД   34968415 . S2CID   236520241 . Архивировано из оригинала 16 сентября 2021 года . Проверено 3 сентября 2021 г.
  252. ^ Перейти обратно: а б с д и ж г Гринвуд М. (15 января 2021 г.). «Какие мутации SARS-CoV-2 вызывают беспокойство?» . Новости Медицинские науки о жизни . Архивировано из оригинала 16 января 2021 года . Проверено 16 января 2021 г.
  253. ^ Тандель Д., Гупта Д., Сах В., Харшан К.Х. (30 апреля 2021 г.). «Вариант SARS-CoV-2 N440K обладает более высокой инфекционной пригодностью». bioRxiv   10.1101/2021.04.30.441434 .
  254. ^ Бхаттачарджи С. (3 мая 2021 г.). «COVID-19 | Штамм AP как минимум в 15 раз более вирулентный» . Индус . Архивировано из оригинала 10 мая 2021 года . Проверено 4 мая 2021 г.
  255. ^ «Вариант N440k Covid: мутант N440K в 10 раз более заразен, чем родительский штамм | Хайдарабадские новости» . Таймс оф Индия . 2 мая 2021 года. Архивировано из оригинала 30 августа 2021 года . Проверено 3 сентября 2021 г.
  256. ^ 2 «Новые мутантные штаммы нового коронавируса (SARS-CoV-2). Обеспокоенность по поводу увеличения инфекции и трансмиссивности, а также изменений антигенности (Отчет 13)» . ) Обеспокоенность по поводу повышенной инфекционности и трансмиссивности, а также изменений антигенности (13-й отчет)] . оригинал 3 сентября 2021 г. Проверено 3 сентября 2021 г.
  257. ^ «Мутации шипа предположительно связаны со вспышкой заболевания на датских норковых фермах» . ГИСАИД . Архивировано из оригинала 3 сентября 2021 года . Проверено 3 сентября 2021 г.
  258. ^ «Университет Граца» . www.uni-graz.at . Архивировано из оригинала 6 мая 2021 года . Проверено 22 февраля 2021 г.
  259. ^ «Коронавирус SARS-CoV-2 (ранее известный как уханьский коронавирус и 2019-nCoV) – что мы можем выяснить на структурном уровне биоинформатики» . Иннофор . 23 января 2020 г. Проверено 22 февраля 2021 г.
  260. ^ Сингх А., Стейнкельнер Г., Кёхл К., Грубер К., Грубер CC (февраль 2021 г.). «Серин 477 играет решающую роль во взаимодействии белка-шипа SARS-CoV-2 с человеческим рецептором ACE2» . Научные отчеты . 11 (1): 4320. Бибкод : 2021NatSR..11.4320S . дои : 10.1038/s41598-021-83761-5 . ПМК   7900180 . ПМИД   33619331 .
  261. ^ «BioNTech: Мы стремимся индивидуализировать лекарство от рака» . БиоНТек . Архивировано из оригинала 18 июня 2021 года . Проверено 22 февраля 2021 г.
  262. ^ Шроерс Б., Гудимелла Р., Букур Т., Рослер Т., Лоуэр М., Шахин У. (4 февраля 2021 г.). «Крупномасштабный анализ мутантов спайк-гликопротеина SARS-CoV-2 демонстрирует необходимость постоянного скрининга вирусных изолятов». bioRxiv   10.1101/2021.02.04.429765 .
  263. ^ «Люди говорят о варианте «двойного мутанта» в Индии. Что это значит?» . ЭНЕРГЕТИЧЕСКИЙ ЯДЕРНЫЙ РЕАКТОР . Архивировано из оригинала 27 апреля 2021 года . Проверено 27 апреля 2021 г. ...с научной точки зрения термин «двойной мутант» не имеет смысла, говорит Андерсен. «SARS-CoV-2 постоянно мутирует. Поэтому повсюду много двойных мутантов. Индийский вариант действительно не следует так называть».
  264. ^ Перейти обратно: а б с Мандавилли А., Мюллер Б. (2 марта 2021 г.). «Почему варианты вирусов имеют такие странные названия» . Нью-Йорк Таймс . ISSN   0362-4331 . Архивировано из оригинала 20 июня 2021 года . Проверено 2 марта 2021 г.
  265. ^ «ускользающая мутация» . ВИЧ i-Base . 11 октября 2012 года. Архивировано из оригинала 9 мая 2021 года . Проверено 19 февраля 2021 г.
  266. ^ Wise J (февраль 2021 г.). «Covid-19: мутация E484K и риски, которые она представляет» . БМЖ . 372 : n359. дои : 10.1136/bmj.n359 . ПМИД   33547053 . S2CID   231821685 .
  267. ^ Перейти обратно: а б с «Краткий отчет: Новый вариант штамма SARS-CoV-2 выявлен у путешественников из Бразилии» (PDF) (пресс-релиз). Япония: НИИД (Национальный институт инфекционных заболеваний). 12 января 2021 г. Архивировано (PDF) из оригинала 15 января 2021 г. . Проверено 14 января 2021 г.
  268. ^ Исследование нового варианта SARS-CoV-2 202012/01, технический брифинг 5 (PDF) (Брифинг). Общественное здравоохранение Англии. 2 февраля 2021 г. GW-1905. Архивировано (PDF) из оригинала 29 июня 2021 года . Проверено 14 июня 2021 г.
  269. ^ Грини А.Дж., Лоес А.Н., Кроуфорд К.Х., Старр Т.Н., Мэлоун К.Д., Чу Х.И. и др. (март 2021 г.). «Комплексное картирование мутаций в домене, связывающем рецептор SARS-CoV-2, которые влияют на распознавание поликлональными антителами плазмы человека» . Клетка-хозяин и микроб . 29 (3): 463–476.e6. дои : 10.1016/j.chom.2021.02.003 . ПМЦ   7869748 . ПМИД   33592168 .
  270. ^ Купфершмидт К. (январь 2021 г.). «Новые мутации вызывают призрак «убегания иммунитета» » . Наука . 371 (6527): 329–330. Бибкод : 2021Sci...371..329K . дои : 10.1126/science.371.6527.329 . ПМИД   33479129 .
  271. ^ Реттнер Р. (2 февраля 2021 г.). «Вариант британского коронавируса развивает мутацию, уклоняющуюся от вакцинации. В нескольких случаях вариант британского коронавируса развивал мутацию под названием E484K, которая может повлиять на эффективность вакцины» . Живая наука . Архивировано из оригинала 2 февраля 2021 года . Проверено 2 февраля 2021 г.
  272. ^ Ахенбах Дж., Бут В. (2 февраля 2021 г.). «Тревожная мутация коронавируса обнаружена в британском варианте и в некоторых образцах из США» . Вашингтон Пост . Архивировано из оригинала 2 февраля 2021 года . Проверено 2 февраля 2021 г.
  273. ^ составляет одну пятую?] « Лямбда-штамм» приземлился на Олимпийских играх в Токио, и эффект вакцины Goo News . Архивировано из оригинала 3 сентября 2021 года . Проверено 3 сентября 2021 года .
  274. ^ «Вариант Лямбда: более заразен и может ли избежать вакцинации? Объясняет вирусолог» . Разговор . 21 июля 2021 года. Архивировано из оригинала 3 сентября 2021 года . Проверено 3 сентября 2021 г.
  275. ^ Перейти обратно: а б Обновленная информация COG-UK о мутациях SARS-CoV-2 Spike, представляющих особый интерес: отчет 1 (PDF) (отчет). Британский консорциум по геномике COVID-19 (COG-UK). 20 декабря 2020 г. с. 7. Архивировано из оригинала (PDF) 25 декабря 2020 года . Проверено 31 декабря 2020 г.
  276. ^ «Исследователи обнаружили новый вариант вируса COVID-19 в Колумбусе, штат Огайо» . wexnermedical.osu.edu . 13 января 2021 года. Архивировано из оригинала 15 января 2021 года . Проверено 16 января 2021 г.
  277. ^ Ту Х, Авенариус М.Р., Кубатко Л., Хант М., Пан Х, Ру П и др. (26 января 2021 г.). «Отличные закономерности появления вариантов пиков SARS-CoV-2, включая N501Y, в клинических образцах в Колумбусе, штат Огайо». bioRxiv   10.1101/2021.01.12.426407 .
  278. ^ «Обнаружение нового мутанта «штамм Дельта». Влияние на инфекционность неизвестно» . NHK News . 31 августа 2021 г. Архивировано из оригинала 1 сентября 2021 г. Проверено 2 сентября 2021 г.
  279. ^ «Подтвержденный случай заражения среди населения (первый случай в Японии) новым штаммом Delta (штамм B.1.617.2) с мутацией N501S» - 8-й отчет Проекта анализа полного генома нового коронавируса Университета медицины и стоматологии - «Подтвержден случай заражения среди населения» приобретенная инфекция (первый случай в Японии) нового дельта-штамма (штамм B.1.617.2) с мутацией N501S» - 8-й отчет Проекта полного анализа генома нового коронавируса Медико-стоматологического университета -] (PDF) . Архивировано (PDF) из оригинал 30 августа 2021 г. Проверено 2 сентября 2021 г.
  280. ^ Перейти обратно: а б с д Maison DP, Ching LL, Shikuma CM, Nerurkar VR (январь 2021 г.). «Генетические характеристики и филогения последовательности гена S длиной 969 п.н. SARS-CoV-2 с Гавайских островов раскрывают возникшую во всем мире мутацию P681H». bioRxiv   10.1101/2021.01.06.425497 . Доступно под лицензией CC BY 4.0. Архивировано 16 октября 2017 г. на Wayback Machine .
  281. ^ Корум Дж., Циммер С. (9 февраля 2021 г.). «Отслеживание вариантов коронавируса» . Нью-Йорк Таймс . Архивировано из оригинала 30 ноября 2021 года . Проверено 1 декабря 2021 г. Постоянно обновляется
  282. ^ Шраер Р. (18 июля 2020 г.). «Коронавирус: мутации делают его более заразным?» . Новости Би-би-си . Архивировано из оригинала 30 декабря 2020 года . Проверено 3 января 2021 г.
  283. ^ «Новый, более заразный штамм COVID-19 теперь доминирует в глобальных случаях заражения вирусом: исследование» . www.medicalxpress.com . Архивировано из оригинала 17 ноября 2020 года . Проверено 16 августа 2020 г. .
  284. ^ Корбер Б., Фишер В.М., Гнанакаран С., Юн Х., Тейлер Дж., Абфальтерер В. и др. (август 2020 г.). «Отслеживание изменений в пике SARS-CoV-2: доказательства того, что D614G увеличивает инфекционность вируса COVID-19» . Клетка . 182 (4): 812–827.e19. doi : 10.1016/j.cell.2020.06.043 . ПМЦ   7332439 . ПМИД   32697968 .
  285. ^ Хоу Ю.Дж., Чиба С., Халфманн П., Эре С., Курода М., Диннон К.Х. и др. (декабрь 2020 г.). «Вариант SARS-CoV-2 D614G демонстрирует эффективную репликацию ex vivo и передачу in vivo» . Наука . 370 (6523): 1464–1468. Бибкод : 2020Sci...370.1464H . дои : 10.1126/science.abe8499 . ПМЦ   7775736 . ПМИД   33184236 . возникшая замена Asp614→Gly (D614G) в шиповом гликопротеине штаммов SARS-CoV-2, которая в настоящее время является наиболее распространенной формой во всем мире.
  286. ^ Волц Э.М., Хилл В., Маккроун Дж.Т., Прайс А., Йоргенсен Д., О'Тул А. и др. (4 августа 2020 г.). «Оценка влияния мутации D614G SARS-CoV-2 Spike на трансмиссивность и патогенность» . Клетка . 184 (1): 64–75.e11. дои : 10.1016/j.cell.2020.11.020 . hdl : 10044/1/84079 . ПМК   7674007 . PMID   33275900 .
  287. ^ Бутовт Р., Билинска К., Фон Бартельд К.С. (октябрь 2020 г.). «Хемосенсорная дисфункция при COVID-19: интеграция генетических и эпидемиологических данных в вариант шипового белка D614G как способствующий фактор» . ACS Химическая нейронаука . 11 (20): 3180–3184. дои : 10.1021/acschemneuro.0c00596 . ПМЦ   7581292 . ПМИД   32997488 .
  288. ^ Перейти обратно: а б Ходкрофт Э.Б., Домман Д.Б., Снайдер Д.Д., Огунтуйо К.Ю., Ван Дист М., Денсмор К.Х. и др. (21 февраля 2021 г.). «Появление в конце 2020 года нескольких линий белков Spike SARS-CoV-2, затрагивающих положение аминокислоты 677». medRxiv   10.1101/2021.02.12.21251658 .
  289. ^ «Исследование выявило 7 новых выявленных вариантов COVID-19, циркулирующих в Соединенных Штатах» . ABC11 Роли-Дарем . 15 февраля 2021 года. Архивировано из оригинала 3 сентября 2021 года . Проверено 3 сентября 2021 г.
  290. ^ «Исследование показывает, что мутация P681H становится глобально распространенной среди последовательностей SARS-CoV-2» . Новости-Medical.net . 10 января 2021 года. Архивировано из оригинала 14 февраля 2021 года . Проверено 11 февраля 2021 г.
  291. ^ «Малайзия выявила новый штамм Covid-19, аналогичный штамму, обнаруженному в трех других странах» . «Стрейтс Таймс» . 23 декабря 2020 года. Архивировано из оригинала 23 декабря 2020 года . Проверено 10 января 2021 г. Тан Шри, доктор Нур Хишам Абдулла, сказал, что до сих пор неизвестно, является ли штамм, получивший название мутация «A701B», более заразным, чем обычно.
  292. ^ «Дутерте говорит, что Сулу обращается за помощью после того, как в соседнем Сабахе, Малайзия, обнаружен новый вариант COVID-19» . Новости ГМА . 27 декабря 2020 года. Архивировано из оригинала 3 января 2021 года . Проверено 10 января 2021 г.
  293. ^ Перейти обратно: а б с д «Текущая ситуация и информация о мутации белка Spike Covid-19 в Малайзии» . Кементериан Кесихатан Малайзия – Covid-19 Малайзия . 25 декабря 2020 года. Архивировано из оригинала 2 июля 2021 года . Проверено 15 января 2021 г.
  294. ^ Перейти обратно: а б с «Мутация A701V COVID-19 распространяется на кластеры третьей волны» . focusmalaysia.my . 25 декабря 2020 года. Архивировано из оригинала 14 мая 2021 года . Проверено 13 мая 2021 г.
  295. ^ «Варианты проблем (VOC), B.1.524, B.1.525, южноафриканский B.1.351, STRAIN D614G, A701V, B1.1.7» . covid-19.moh.gov.my . 14 апреля 2021 года. Архивировано из оригинала 2 июля 2021 года . Проверено 15 мая 2021 г.
  296. ^ Перейти обратно: а б «Варианты SARS-CoV-2, вызывающие беспокойство, и варианты, находящиеся на стадии расследования в Англии: Технический брифинг 39» (PDF) . gov.uk. ​Агентство безопасности здравоохранения Великобритании. 25 марта 2022 г. Архивировано (PDF) из оригинала 4 апреля 2022 г. . Проверено 6 апреля 2022 г.
  297. ^ «Еженедельный эпидемиологический обзор COVID-19: выпуск 84, опубликовано 22 марта 2022 г.» (PDF) . кто.инт . Всемирная организация здравоохранения. 2 марта 2022 г. Проверено 6 апреля 2022 г.
  298. ^ «Cov-Lineages» . cov-lineages.org . Проверено 6 апреля 2022 г.
  299. ^ Буриони Р., Тополь Е.Ю. (июнь 2021 г.). «Достиг ли SARS-CoV-2 пика физической формы?» . Природная медицина . 27 (8): 1323–24. дои : 10.1038/s41591-021-01421-7 . ПМИД   34155413 .
  300. ^ Перейти обратно: а б Офис комиссара (23 февраля 2021 г.). «Обновление о коронавирусе (COVID-19): FDA выпускает правила, помогающие разработчикам медицинской продукции работать с вариантами вируса» . США Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов (FDA) . Проверено 7 марта 2021 г.
  301. ^ Релла С.А., Куликова Ю.А., Дермицакис Э.Т., Кондрашов Ф.А. (30 июля 2021 г.). «Степень передачи SARS-CoV-2 и вакцинация влияют на судьбу штаммов, устойчивых к вакцинам» . Научные отчеты . 11 (1): 15729. doi : 10.1038/s41598-021-95025-3 . ISSN   2045-2322 . ПМЦ   8324827 . ПМИД   34330988 .
  302. ^ Ван Р., Чен Дж., Вэй Г.В. (декабрь 2021 г.). «Механизмы эволюции SARS-CoV-2, выявляющие мутации, устойчивые к вакцинам, в Европе и Америке» (PDF) . Журнал физической химии . 12 (49): 11850–11857. doi : 10.1021/acs.jpclett.1c03380 . ПМЦ   8672435 . ПМИД   34873910 . Архивировано (PDF) из оригинала 18 декабря 2021 года . Проверено 27 января 2022 г.
  303. ^ «Результаты исследования показывают, что распространение Омикрона можно объяснить уклончивостью иммунитета, а не увеличением заразности» . Новости-Medical.net . 5 января 2022 года. Архивировано из оригинала 21 января 2022 года . Проверено 17 января 2022 г.
  304. ^ Цао Ю, Ван Дж, Цзянь Ф, Сяо Т, Сун В, Исимайи А и др. (февраль 2022 г.). «Омикрон ускользает от большинства существующих антител, нейтрализующих SARS-CoV-2» . Природа . 602 (7898): 657–663. дои : 10.1038/d41586-021-03796-6 . ПМЦ   8866119 . ПМИД   35016194 . S2CID   245455422 .
  305. ^ Лю Л., Икетани С., Го Й., Чан Дж.Ф., Ван М., Лю Л. и др. (февраль 2022 г.). «Поразительное уклонение от антител, проявленное вариантом Омикрон SARS-CoV-2» . Природа . 602 (7898): 676–681. дои : 10.1038/d41586-021-03826-3 . ПМИД   35016198 . S2CID   245462866 .
  306. ^ Мохсин М., Махмуд С. (май 2022 г.). «Вызывающий обеспокоенность вариант Omicron SARS-CoV-2: обзор его заразности, уклонения от иммунитета, повторного заражения и тяжести» . Лекарство . 101 (19): e29165. дои : 10.1097/MD.0000000000029165 . ПМЦ   9276130 . ПМИД   35583528 . S2CID   248858919 .
  307. ^ «Как скоро после заражения COVID-19 вы сможете заразиться снова?» . Новости АВС . 2 мая 2022 года. Архивировано из оригинала 9 июля 2022 года . Проверено 24 июня 2022 г.
  308. ^ «Вариант Омикрон: что нужно знать» . Центры по контролю и профилактике заболеваний . 20 декабря 2021 года. Архивировано из оригинала 27 января 2022 года . Проверено 27 января 2022 г.
  309. ^ Шин Д.Х., Смит Д.М., Чой Дж.Ю. (2022). «Вариант Омикрон SARS-CoV-2, вызывающий беспокойство: все, что вы хотели знать об Омикроне, но боялись спросить» . Медицинский журнал Йонсей . 63 (11): 977–983. дои : 10.3349/ymj.2022.0383 . ПМЦ   9629902 . ПМИД   36303305 .
  310. ^ «Бустерная вакцина против COVID-19» . США Управление по контролю за продуктами и лекарствами (FDA). 27 сентября 2022 года. Архивировано из оригинала 8 октября 2022 года . Проверено 8 октября 2022 г.
  311. ^ «Современные вакцины против COVID-19» . Управление по контролю за продуктами и лекарствами США . 7 октября 2022 года. Архивировано из оригинала 7 октября 2022 года . Проверено 8 октября 2022 г.
  312. ^ «Вакцины Pfizer-BioNTech против COVID-19» . Управление по контролю за продуктами и лекарствами США . 3 октября 2022 года. Архивировано из оригинала 8 октября 2022 года . Проверено 8 октября 2022 г.
  313. ^ «Обновленные вакцины против COVID-19 для использования в США, начиная с осени 2023 года» . США Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов (FDA) . 15 июня 2023 года. Архивировано из оригинала 17 июня 2023 года . Проверено 16 июня 2023 г. Общественное достояние В данную статью включен текст из этого источника, находящегося в свободном доступе .
  314. ^ Рекомендации по формуле вакцин против COVID-19 в США на 2023–2024 гг. (PDF) (Отчет). США Управление по контролю за продуктами и лекарствами (FDA). 16 июня 2023 года. Архивировано из оригинала 16 июня 2023 года . Проверено 16 июня 2023 г.
  315. ^ «Обновленные вакцины против COVID-19 для использования в США, начиная с осени 2024 года» . США Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов (FDA) . 5 июня 2024 года. Архивировано из оригинала 18 июня 2024 года . Проверено 19 июня 2024 г. Общественное достояние В данную статью включен текст из этого источника, находящегося в свободном доступе .
  316. ^ Юрковецкий Л., Ван Х, Паскаль К.Е., Томкинс-Тинч С., Ньялиле Т.П., Ван Ю. и др. (октябрь 2020 г.). «Структурный и функциональный анализ варианта шипованного белка D614G SARS-CoV-2» . Клетка . 183 (3): 739–751.e8. дои : 10.1016/j.cell.2020.09.032 . ПМК   7492024 . ПМИД   32991842 .
  317. ^ Томсон ЕС, Розен Л.Е., Шепард Дж.Г., Спрэафико Р., да Силва Филипе А., Войцеховский Дж.А. и др. (март 2021 г.). «Циркулирующие варианты N439K с шипами SARS-CoV-2 сохраняют физическую форму, уклоняясь при этом от иммунитета, опосредованного антителами» . Клетка . 184 (5): 1171–1187.e20. дои : 10.1016/j.cell.2021.01.037 . ПМЦ   7843029 . ПМИД   33621484 .
  318. ^ Смаут А (26 января 2021 г.). «Британия поможет другим странам отслеживать варианты коронавируса» . Рейтер . Архивировано из оригинала 26 января 2021 года . Проверено 27 января 2021 г.
  319. ^ Доннелли Л. (26 января 2021 г.). «Великобритания поможет секвенировать мутации Covid по всему миру, чтобы найти новые опасные варианты» . Телеграф . Архивировано из оригинала 27 января 2021 года . Проверено 28 января 2021 г.
  320. ^ Галани А., Аализаде Р., Костакис М., Марку А., Алигизакис Н., Литрас Т. и др. (январь 2022 г.). «Данные наблюдения за сточными водами SARS-CoV-2 могут предсказать количество госпитализаций и госпитализаций в отделения интенсивной терапии» . Наука об общей окружающей среде . 804 : 150151. Бибкод : 2022ScTEn.80450151G . doi : 10.1016/j.scitotenv.2021.150151 . ПМК   8421077 . ПМИД   34623953 .
  321. ^ Баайенс Дж.А., Зулли А., Отт И.М., Петроне М.Е., Альперт Т., Фовер Дж.Р. и др. (2 сентября 2021 г.). «Вариантная оценка распространенности SARS-CoV-2 в сточных водах с использованием количественного определения RNA-Seq». medRxiv   10.1101/2021.08.31.21262938 .
  322. ^ Хейнен Л., Эльсинга Г., Грааф М.Д., Моленкамп Р., Купманс М.П., ​​Медема Г. (26 марта 2021 г.). «Капельная цифровая RT-PCR для обнаружения вызывающих беспокойство вариантов SARS-CoV-2 в сточных водах». medRxiv   10.1101/2021.03.25.21254324v1 .
  323. ^ Методы обнаружения и идентификации вариантов SARS-CoV-2 . Европейский центр профилактики и контроля заболеваний, Всемирная организация здравоохранения (технический отчет). Стокгольм: Европейский центр профилактики и контроля заболеваний. 3 марта 2021 г. Диагностический скрининг известных ЛОС.
  324. ^ Варианты SARS-CoV-2, вызывающие обеспокоенность, и варианты, находящиеся на стадии расследования в Англии, технический брифинг 15 (PDF) (Брифинг). Общественное здравоохранение Англии. 11 июня 2021 г. GOV-8576. Архивировано (PDF) из оригинала 4 июля 2021 года . Проверено 15 июня 2021 г.
  325. ^ Оценка дальнейшего появления и потенциального воздействия вызывающего озабоченность варианта SARS-CoV-2 Omicron в контексте продолжающейся передачи вызывающего беспокойство варианта Delta в ЕС/ЕЭЗ, 18-е обновление (Технический отчет). Стокгольм: Европейский центр профилактики и контроля заболеваний. 15 декабря 2021 г. Приложения 1 и 2.
  326. ^ Купфершмидт К. (23 декабря 2020 г.). «Вариант для Великобритании привлекает внимание к роли пациентов с ослабленным иммунитетом в пандемии COVID-19» . Наука . дои : 10.1126/science.abg2911 . S2CID   234378594 . Архивировано из оригинала 24 июня 2021 года . Проверено 25 февраля 2021 г.
  327. ^ Сазерленд С. (23 февраля 2021 г.). «Варианты COVID могут возникнуть у людей с нарушенной иммунной системой» . Научный американец . Архивировано из оригинала 6 июня 2021 года . Проверено 25 февраля 2021 г.
  328. ^ Маккарти К.Р., Ренник Л.Дж., Намбулли С., Робинсон-Маккарти Л.Р., Бейн В.Г., Хайдар Г. и др. (март 2021 г.). «Периодические делеции в спайковом гликопротеине SARS-CoV-2 приводят к высвобождению антител» . Наука . 371 (6534): 1139–1142. Бибкод : 2021Sci...371.1139M . дои : 10.1126/science.abf6950 . ПМЦ   7971772 . ПМИД   33536258 .
  329. ^ Грин СТ, Клади Л (26 января 2021 г.). «Covid-19 и эволюционное давление – можем ли мы предсказать, какие генетические опасности скрываются за горизонтом?» . БМЖ : n230. Архивировано из оригинала 8 июня 2021 года . Проверено 8 июня 2021 г.
  330. ^ Джейкобс А. (2 ноября 2021 г.). «Широко распространенная коронавирусная инфекция обнаружена у оленей в Айове, говорится в новом исследовании» . Нью-Йорк Таймс . Архивировано из оригинала 28 декабря 2021 года . Проверено 12 декабря 2021 г. Исследователи и сторонние эксперты охарактеризовали результаты исследования как тревожное событие в ходе пандемии. Широкое распространение инфекции среди наиболее распространенных видов диких животных Северной Америки может еще больше затруднить искоренение возбудителя, особенно если они станут резервуаром мутаций, которые в конечном итоге перекинутся обратно на человека. [...] они предупреждают охотников на оленей и других лиц, занимающихся оленями, о необходимости принятия мер предосторожности во избежание передачи инфекции. [...] Если бы вирус стал эндемичным для диких животных, таких как олени, он мог бы со временем развиться и стать более вирулентным, а затем заразить людей новым штаммом, способным уклониться от нынешнего набора вакцин.
  331. ^ Лассауньер Р., Фонагер Дж., Расмуссен М., Фрише А., Странд С., Расмуссен Т. и др. (10 ноября 2020 г.). Шиповые мутации SARS-CoV-2, возникающие у датской норки, их распространение на человека и данные нейтрализации ( Препринт ). Статенский институт сывороток . Архивировано из оригинала 10 ноября 2020 года . Проверено 11 ноября 2020 г.
  332. ^ «Обнаружение новых вариантов SARS-CoV-2, связанных с норками» (PDF) . ECDC.eu. ​Европейский центр профилактики и контроля заболеваний. 12 ноября 2020 г. Архивировано (PDF) из оригинала 8 января 2021 г. . Проверено 12 ноября 2020 г.
  333. ^ «Вариантный штамм SARS-CoV-2, связанный с норками – Дания» . ВОЗ Новости о вспышках болезней . 6 ноября 2020 г. Архивировано из оригинала 12 ноября 2020 г. Проверено 19 марта 2021 г.
  334. ^ Кевани С., Карстенсен Т. (19 ноября 2020 г.). «Датский вариант норки Covid, скорее всего, вымер», но спорная выбраковка продолжается» . Хранитель . Архивировано из оригинала 24 апреля 2021 года . Проверено 19 апреля 2021 г.
  335. ^ Ларсен Х.Д., Фонагер Дж., Ломхолт Ф.К., Далби Т., Бенедетти Г., Кристенсен Б. и др. (февраль 2021 г.). «Предварительный отчет о вспышке SARS-CoV-2 у норки и норковых фермеров, связанной с распространением среди населения, Дания, июнь-ноябрь 2020 года» . Евронаблюдение . 26 (5). дои : 10.2807/1560-7917.ES.2021.26.5.210009 . ПМЦ   7863232 . ПМИД   33541485 .

Дальнейшее чтение

У Схолии есть профиль варианта SARS-CoV-2 (Q104450895) .
Найдите COVID в Викисловаре, бесплатном словаре.
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Variants_of_SARS-CoV-2&oldid=1238214296"
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: d76c53e48125d533fe18a8bc37695cae__1722611940
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/d7/ae/d76c53e48125d533fe18a8bc37695cae.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Variants of SARS-CoV-2 - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)