Jump to content

Альфа-вариант SARS-CoV-2

(Перенаправлено из альфа-варианта )

SARS-CoV-2 Вариант
Альфа
Научно точная атомная модель внешней структуры SARS-CoV-2. Каждый «шар» — это атом.
Scientifically accurate atomic model of the external structure of SARS-CoV-2. Each "ball" is an atom.
Общие сведения
Обозначение ВОЗ Альфа
Родословная Б1.1.1.7
Впервые обнаружено Кент , Англия
Дата сообщения ноябрь 2020 г .; 3 года назад ( 2020-11 )
Статус Вариант беспокойства
Симптомы
  • None
  • Chills
  • Loss of appetite
  • Headaches
  • Muscle aches
Cases map
Total number of B.1.1.7 sequences by country as of 25 March 2021[1]
Legend:
  10,000+ confirmed sequences
  5,000–9,999 confirmed sequences
  1,000–4,999 confirmed sequences
  500–999 confirmed sequences
  100–499 confirmed sequences
  2–99 confirmed sequences
  1 confirmed sequence
  None or no data available
Major variants

Вариант Альфа (Б.1.1.7) был [ 2 ] [ 3 ] вызывающий беспокойство вариант SARS -CoV-2 . По оценкам, он на 40–80% более заразен, чем SARS-CoV-2 дикого типа (при этом большинство оценок занимают средний и верхний конец этого диапазона). Ученые более широко обратили внимание на этот вариант в начале декабря 2020 года, когда филогенетическое дерево, показывающее вирусные последовательности из Кента , Великобритания, выглядело необычно. [ 4 ]

Вариант начал быстро распространяться к середине декабря, примерно в то же время, когда количество заражений резко возросло. вируса Считается, что это увеличение, по крайней мере частично, связано с одной или несколькими мутациями в белке-шипе . Этот вариант также отличался большим количеством мутаций, чем обычно. [ 5 ] К январю 2021 года более половины всего геномного секвенирования SARS-CoV-2 было проведено в Великобритании. [ 6 ] Это вызвало вопросы относительно того, сколько других важных вариантов циркулировало по миру незамеченными. [ 7 ] [ 8 ]

On 2 February 2021, Public Health England reported that they had detected "[a] limited number of B.1.1.7 VOC-202012/01 genomes with E484K mutations",[9] which they dubbed Variant of Concern 202102/02 (VOC-202102/02).[10] One of the mutations (N501Y) was also present in Beta variant and Gamma variant. On 31 May 2021, the World Health Organization announced that the Variant of Concern would be labelled "Alpha" for use in public communications.[11][12]

The Alpha variant disappeared in late 2021 as a result of competition from even more infectious variants. In March 2022, the World Health Organization changed its designation to "previously circulating variant of concern".

Classification

[edit]

Names

[edit]

The variant is known by several names. Outside the UK it is sometimes referred to as the UK variant or British variant or English variant,[13] despite the existence of other, less common, variants first identified in UK, such as Eta variant (lineage B.1.525). Within the UK, it is commonly referred to as the Kent variant after Kent, where the variant was found.[14][15][16]

In scientific use, the variant had originally been named the first Variant Under Investigation in December 2020 (VUI – 202012/01) by Public Health England (PHE),[17][a] but was reclassified to a Variant of Concern (Variant of Concern 202012/01, abbreviated VOC-202012/01) by Meera Chand and her colleagues in a report published by PHE on 21 December 2020.[b] In a report written on behalf of COVID-19 Genomics UK (COG-UK) Consortium, Andrew Rambaut and his co-authors, using the Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages (pangolin) tool, dubbed it lineage B.1.1.7,[19] while Nextstrain dubbed the variant 20I/501Y.V1.[20]

The name VOC-202102/02 refers to the variant with the E484K mutation (see below).[10]

Genetic profile

[edit]
Defining mutations in VOC-202012/01
(change of amino acid only)
Gene Nucleotide Amino acid
ORF1ab C3267T T1001I
C5388A A1708D
T6954C I2230T
11288–11296 deletion SGF 3675–3677 deletion
Spike 21765–21770 deletion HV 69–70 deletion
21991–21993 deletion Y144 deletion
A23063T N501Y
C23271A A570D
C23604A P681H
C23709T T716I
T24506G S982A
G24914C D1118H
ORF8 C27972T Q27stop
G28048T R52I
A28111G Y73C
N 28280 GAT→CTA D3L
C28977T S235F

Mutations in SARS-CoV-2 are common: over 4,000 mutations have been detected in its spike protein alone, according to the COVID-19 Genomics UK (COG-UK) Consortium.[22]

VOC-202012/01 is defined by 23 mutations: 14 non-synonymous mutations, 3 deletions, and 6 synonymous mutations[23] (i.e., there are 17 mutations that change proteins and six that do not[5]).

Symptoms and signs

[edit]

Imperial College London investigated over a million people in England while the Alpha variant was dominant and discovered a wide range of further symptoms linked to Covid. "Chills, loss of appetite, headache and muscle aches" were most common in infected people, as well as classic symptoms.[24]

Diagnosis

[edit]

Several rapid antigen tests for SARS-CoV-2 are in widespread use globally for COVID-19 diagnostics. They are believed to be useful in stopping the chain of transmission of the virus by providing the means to rapidly identify large numbers of cases as part of a mass-testing program. Following the emergence of VOC-202012/01, there was initially concern that rapid tests might not detect it, but Public Health England determined that rapid tests evaluated and used in the United Kingdom detected the variant.[25]

Prevention

[edit]

By late 2020, several COVID-19 vaccines were being deployed or under development.

However, as further mutations occurred, concerns were raised as to whether vaccine development would need to be altered. SARS-CoV-2 does not mutate as quickly as, for example, influenza viruses, and the new vaccines that had proved effective by the end of 2020 are types that can be adjusted if necessary.[26] As of the end of 2020, German, British, and American health authorities and experts believe that existing vaccines will be as effective against VOC-202012/01 as against previous variants.[27][28]

On 18 December, NERVTAG determined "that there are currently insufficient data to draw any conclusion on... [a]ntigenic escape".[29]

As of 20 December 2020, Public Health England confirmed there is "no evidence" to suggest that the new variant would be resistant to the Pfizer–BioNTech vaccine currently being used in the UK's vaccination programme, and that people should still be protected.[30]

E484K mutation

[edit]

On 2 February 2021, Public Health England reported that they had detected "[a] limited number of B.1.1.7 VOC-202012/01 genomes with E484K mutations",[9] which is also present in the Beta and Gamma variants;[14] a mutation which may reduce vaccine effectiveness.[14] On 9 February 2021, it became known that some 76 cases with the E484K mutation had been detected, principally in Bristol, but with a genomically distinct group in Liverpool also carrying the mutation.[31] A week later a Research and analysis report from PHE gave a total of 77 confirmed and probable cases involving the E484K mutation across the UK, in two variants, VUI-202102/01 and VOC-202102/02, the latter described as 'B.1.1.7 with E484K'.[10]

On 5 March 2021, it was reported that a B.1.1.7 lineage with the E484K mutation has been detected in two US patients (in Oregon and New York states). Researchers thought that the E484K mutation in the Oregon variant arose independently.[32][33]

Characteristics

[edit]

Transmissibility

[edit]

The transmissibility of the Alpha variant (lineage B.1.1.7) had generally been found to be substantially higher than that of pre-existing SARS-CoV-2 variants. The variant was discovered by a team of scientists at COG-UK whose initial results found transmissibility was 70% (50-100%) higher.[16][34] A study by the Centre for the Mathematical Modelling of Infectious Diseases at the London School of Hygiene & Tropical Medicine reported that the variant was 43 to 90% (range of 95% credible intervals, 38 to 130%) more transmissible than pre-existing variants in the United Kingdom, depending on the method used to assess increases in transmissibility. Similar increases in the transmissibility of lineage B.1.1.7 were measured in Denmark, Switzerland, and the United States.[35] Furthermore, a simple model to account for the rapid rise of lineage B.1.1.7 in several countries and the world found that the variant is 50% more transmissible than the local wild type in these three countries and across the world as whole.[36] Another study concluded that it was 75% (70%–80%) more transmissible in the UK between October and November 2020.[37] A later study suggested that these earlier estimates overestimated the transmissibility of the variant and that the transmissibility increase was on the lower ends of these ranges.[38][39]

The Dutch Ministry of Health, Welfare and Sport calculated, based on genome sequencing of positive cases, each week the transmissibility rate of the variant compared to the local wildtype, and found it to fluctuate between 28%-47% higher during the first six weeks of 2021.[40] The Danish Statens Serum Institut in comparison calculated it to be 55% (48%–62%) more transmissible in Denmark based upon the observed development of its relative frequency from 4 January to 12 February 2021.[41] The Institute of Social and Preventive Medicine (ISPM) under University of Bern, calculated the transmissibility of lineage B.1.1.7 based on the weekly development of its observed fraction of all Covid-19 positives during the entire pandemic, and found for 95% confidence intervals under the assumption of a wildtype reproduction number Rw≈1 and an exponentially generation time of 5.2 days, that transmissibility was: 52% (45%–60%) higher when compared to the wildtype in Denmark and 51% (42%-60%) higher when compared to the wildtype in Switzerland.[42]

On 18 December 2020—early on in the risk assessment of the variant—the UK scientific advisory body New and Emerging Respiratory Virus Threats Advisory Group (NERVTAG) concluded that they had moderate confidence that VOC-202012/01 was substantially more transmissible than other variants, but that there were insufficient data to reach any conclusion on underlying mechanism of increased transmissibility (e.g. increased viral load, tissue distribution of virus replication, serial interval etc.), the age distribution of cases, or disease severity.[29] Data seen by NERVTAG indicated that the relative reproduction number ("multiplicative advantage") was determined to be 1.74—i.e., the variant is 74% more transmissible—assuming a 6.5-day generational interval. It was demonstrated that the variant grew fast exponentially with respect to the other variants.[43][44][45] The variant out-competed the ancestral variant by a factor of every two weeks. Another group came to similar conclusions, generating a replicative advantage, independent of "protective measures", of 2.24 per generation of 6.73 days, out-competing the ancestral variant by every two weeks.[46] Similarly, in Ireland, the variant—as indicated by the missing S gene[c] detection (S-gene target failure [SGTF]), which historically was rare—went from 16.3% to 46.3% of cases in two weeks. This demonstrates, based on the statistics of 116 positive samples, that the variant had a relative higher growth by a factor of , when compared to the average growth for all other variants by the end of this two week period.[48] The variant became the dominant variant in London, East of England and the South East from low levels in one to two months. A surge of SARS-CoV-2 infections around the start of the new year is seen[by whom?] as being the result of the elevated transmissibility of the variant, while the other variants were in decline.[49][50][51]

One of the most important changes in lineage B.1.1.7 seems to be N501Y,[22] a change from asparagine (N) to tyrosine (Y) in amino-acid position 501.[52] This is because of its position inside the spike protein's receptor-binding domain (RBD)—more specifically inside the receptor-binding motif (RBM),[53] a part of the RBD[54]—which binds human ACE2.[55] Mutations in the RBD can change antibody recognition and ACE2 binding specificity[55] and lead to the virus becoming more infectious;.[22] Chand et al. concluded that "[i]t is highly likely that N501Y affects the receptor-binding affinity of the spike protein, and it is possible that this mutation alone or in combination with the deletion at 69/70 in the N-terminal domain (NTD) is enhancing the transmissibility of the virus".[56] In early 2021 a peer-reviewed paper found that the mentioned HV 69–70 deletion in vitro "appeared to have two-fold higher infectivity over a single round of infection compared to [wild-type SARS-CoV-2]" in lentiviral SARS-CoV-2 pseudoviruses.[57]

Using In Silico approach, Shahhosseini et al. demonstrated that the Y501 mutation in lineage B.1.1.7 forms a shorter H-bond (length of 2.94 Å) than its counterpart in the wild type (WT) variant residue N501, indicating that in lineage B.1.1.7 the RBD and hACE2 have a stable interaction. Furthermore, the Y501 mutation in lineage B.1.1.7 contributes more negatively to Binding Free Energy (BFE) (-7.18 kcal/mol) than its counterpart in the WT variant residue N501 (-2.92 kcal/mol). As a result of combining BFE and molecular interaction results, the N501Y mutation in RBD strengthens binding affinity of SARS-CoV-2 RBD to hACE2.[58]

In a detailed affinity and kinetic analysis of the interaction between the Spike RBD and ACE2, the N501Y mutation was found to significantly enhance the binding affinity between the RBD and ACE2 by approximately 10-fold, resulting from a 1.8-fold increase in the association rate constant (kon) and a 7-fold decrease in the dissociation rate constant (koff).[59]

Virulence

[edit]

Matched cohort studies of the Alpha variant (lineage B.1.1.7) found higher mortality rate than earlier circulating variants overall,[60][61] but not in hospitalised patients.[62] An ecological study found no difference in mortality overall.[63]

Initially, NERVTAG said on 18 December 2020 that there were insufficient data to reach a conclusion regarding disease severity. At prime minister Boris Johnson's briefing the following day, officials said that there was "no evidence" as of that date that the variant caused higher mortality or was affected differently by vaccines and treatments;[64] Vivek Murthy agreed with this.[65] Susan Hopkins, the joint medical adviser for the NHS Test and Trace and Public Health England (PHE), declared in mid-December 2020: "There is currently no evidence that this strain causes more severe illness, although it is being detected in a wide geography, especially where there are increased cases being detected."[22] Around a month later, however—on 22 January 2021—Johnson said that "there is some evidence that the new variant [VOC-202012/01]... may be associated with a higher degree of mortality", though Sir Patrick Vallance, the government's Chief Scientific Advisor, stressed that there is not yet enough evidence to be fully certain of this.[66]

In a paper analysing twelve different studies on lineage B.1.1.7 death rate relative to other lineages, it was found to have a higher death rate (71% according to LSHTM, 70% according to University of Exeter, 65% according to Public Health England, and 36% according to Imperial College London), and NERVTAG concluded: "Based on these analyses, it is likely that infection with VOC B.1.1.7 is associated with an increased risk of hospitalisation and death compared to infection with non-VOC viruses".[67] Results of the death studies were associated with some high uncertainty and confidence intervals, because of a limited sample size related to the fact that UK only analysed the VOC status for 8% of all COVID-19 deaths.[68]

A UK case-control study for 54,906 participants, testing positive for SARS-CoV-2 between 1 October 2020 and 29 January 2021 in the community setting (not including vulnerable persons from care centres and other public institutions), reported that patients infected with the Alpha variant (VOC 202012/1) had a hazard ratio for death within 28 days of testing of 1.64 (95% confidence interval 1.32-2.04), as compared with matched patients positive for other variants of SARS-CoV-2.[69] Also in the UK, a survival analysis of 1,146,534 participants testing positive for SARS-CoV-2 between 1 November 2020 and 14 February 2021, including individuals in the community and in care and nursing homes, found a hazard ratio of 1.61 (95% confidence interval 1.42–1.82) for death within 28 days of testing among individuals infected with lineage B.1.1.7; no significant differences in the increased hazard of death associated with lineage B.1.1.7 were found among individuals differing in age, sex, ethnicity, deprivation level, or place of residence.[61] Both studies adjusted for varying COVID-19 mortality by geographical region and over time, correcting for potential biases due to differences in testing rates or differences in the availability of hospital services over time and space.[citation needed]

A Danish study found people infected by lineage B.1.1.7 to be 64% (32%–104%) more likely to get admitted to hospitals compared with people infected by another lineage.[70]

Genetic sequencing of VOC-202012/01 has shown a Q27stop mutation which "truncates the ORF8 protein or renders it inactive".[19] An earlier study of SARS-CoV-2 variants which deleted the ORF8 gene noted that they "have been associated to milder symptoms and better disease outcome".[71] The study also noted that "SARS-CoV-2 ORF8 is an immunoglobulin (Ig)–like protein that modulates pathogenesis", that "SARS-CoV-2 ORF8 mediates major histocompatibility complex I (MHC-I) degradation", and that "SARS-CoV-2 ORF8 suppresses type I interferon (IFN)–mediated antiviral response".[71]

Referring to amino-acid position 501 inside the spike protein, Chand et al. concluded that "it is possible that variants at this position affect the efficacy of neutralisation of virus",[56] but noted that "[t]here is currently no neutralisation data on N501Y available from polyclonal sera from natural infection".[56] The HV 69–70 deletion has, however, been discovered "in viruses that eluded the immune response in some immunocompromised patients",[72] and has also been found "in association with other RBD changes".[56]

Epidemiology

[edit]
Test determined growth curves on a logarithmic scale, for development of the Alpha variant (lineage B.1.1.7) share among all coronavirus positive samples in Denmark, the Netherlands, the United Kingdom, Portugal, Switzerland, and Ireland.[78] The slopes noted in brackets, are the relative exponential growth rate per day (e.g. 7.6% per day for Denmark).
Test determined growth curves on a logarithmic scale, for development of the Alpha variant (lineage B.1.1.7) share among all coronavirus positive samples in the United Kingdom, countries in the UK, and regions of England.[81] The slopes noted in brackets, are the relative exponential growth rate per day (e.g. 8.6% per day for the UK).

Cases of the Alpha variant (lineage B.1.1.7) were estimated to be under-reported by most countries as the most commonly used tests do not distinguish between this variant and other SARS-CoV-2 variants, and as many SARS-CoV-2 infections are not detected at all. RNA sequencing is required for detection of this variant,[82] although RT-PCR test for specific variants[d] can be used as a proxy test for Alpha — or as a supplementing first-screening test before conducting the whole-genome sequencing.[83][75]

As of 23 March, the Alpha variant had been detected in 125 out of 241 sovereign states and dependencies (or 104 out of 194 WHO member countries),[e] of which some had reported existence of community transmission while others so far only found travel related cases.[87] As of 16 March, it had become the dominant COVID-19 variant for 21 countries: United Kingdom (week 52), Ireland (week 2), Bulgaria (week 4), Slovakia (week 5), Israel (week 5), Luxembourg (week 5), Portugal (week 6), Denmark (week 7), Netherlands (week 7), Norway (week 7), Italy (week 7), Belgium (week 7), France (week 8), Austria (week 8), Switzerland (week 8), Liechtenstein (week 9), Germany (week 9), Sweden (week 9), Spain (week 9), Malta (week 10) and Poland (week 11). The emergence and the fast spreading of the new variant has been detected in Lebanon and a relationship noted between SARS-CoV-2 transmission intensity and the frequency of the new variant during the first twelve days of January.[88] By February, Alpha became the dominant variant in Lebanon.[89]

Spread in UK

[edit]

The first case was likely in mid-September 2020 in London or Kent, United Kingdom.[90] The variant was sequenced in September.[91] As of 13 December 2020, 1,108 cases with this variant had been identified in the UK in nearly 60 different local authorities. These cases were predominantly in the south east of England. The variant has also been identified in Wales and Scotland.[92] By November, around a quarter of cases in the COVID-19 pandemic in London were being caused by the new variant, and by December, that was a third.[93] In mid-December, it was estimated that almost 60 percent of cases in London involved Alpha.[94] By 25 January 2021, the number of confirmed and probable UK cases had grown to 28,122.[95]

Spread in Europe

[edit]

The variant became dominant for:

In Bulgaria, genome sequencing found the variant to be dominant with 52.1% in week 4, followed by 73.4% in week 9.[97]

Distribution of the SARS-CoV-2 virus variants after entering Germany

Also in Slovakia, a RT-PCR Multiplex DX test capable of detecting the 2 deletions specific for lineage B.1.1.7 (ΔH69/ΔV70 and ΔY144),[98] first found the variant nationwide in 74% of cases on 3 February (week 5), followed by 72% of cases on 15 February (week 7), and it then grew to 90% of cases on 3 March (week 9).[99] The same test found earlier on 8 January prevalence of the variant at a rate of 36% in the Michalovce District and 29% in Nitra.[100]

In Israel, the variant was first time detected by genome sequencing 23 December 2020.[101] Leumit Health Care Services however analysed with the proxy test RT-PCR (SGTF) and found the variant at a rate of 3‑4% on 15 December.[102] The national Ministry of Health estimated based on genome sequencing, that the prevalence of the variant became dominant (70%) on 6 February[103] followed by 90% on 16 February.[104]

In Luxembourg, a weekly genome sequencing revealed that the variant grew from 0.3% (week 51) to be dominant with a share of 53.0% in week 5, although results might not be fully representative due to the fact that no correction occurred from potential targeting bias from contact tracing, airport travellers and local outbreaks. Genome sequencing of a population representative randomized test pool - with no target bias - was conducted since week 6, and it confirmed the dominant status of the variant at a rate of 54.1% (week 6) growing to 62.8% (week 9), while the competing Beta variant (lineage B.1.351) was found to be at 18.5% in week 9.[105]

In Denmark the variant grew from 0.3% (week 46 of 2020) to become dominant with 65.9% (week 7 of 2021), and it grew further to 92.7% (week 10); with the regional prevalence ranging from 87.3% in the North Jutland Region to 96.1% in the Central Denmark Region.[106] The observed growth of the relative variant share, was in full accordance with the earlier modelled forecast,[41] that had predicted dominance (over 50%) around mid-February and a prevalence of around 80% of the total circulating variants by early March.[107] In comparison, the genome sequencing only found the competing Beta variant in 0.4% of the positive cases (9 times out of 2315 tests) in week 10.[108][109]

In the Netherlands, a randomly conducted genome sequencing found that the variant grew from 1.3% of cases in week 49 to a dominant share of 61.3% in week 7, followed by 82.0% in week 9; while the competing Beta variant in comparison was found to be at 3.0% in week 9.[74] In Amsterdam, the Alpha variant (lineage B.1.1.7) grew from 5.2% (week 52) to 54.5% (week 6).[110]

In Norway, the variant was found by genome sequencing to grow from 5.7% (week 1) into dominance by a 58.4% (week 7), followed by 65.0% (week 8).[111] Another large survey comprising results of both genome sequencing and PCR proxy tests, with a sample seize of more than 1000 tests per week (since week 4), at the same time found that the variant grew from 2.0% (week 48) into dominance by 60.0% (week 7), followed by 72.7% in week 10 - while only 2.2% of cases in comparison were found to be of the Beta variant.[112] The variant regionally had its highest share in the county of Oslo and Viken,[113] growing from 18% to 90% of analysed samples in Oslo from 20 January to 23 February (although with the data-corrected estimate a bit lower at 50-70% on 23 February); while growing from 21% to 80% of analysed samples in Viken from 25 January to 23 February (although with the data-corrected estimate a bit lower at 50% on 23 February).[114] For the period 15 February to 14 March, the combined survey of genome sequencing and PCR proxy tests, also found the Alpha variant was at a dominant rate over 50% for 8 out of 11 regions, with its highest rate (82%) found for Oslo; while the region Nordland was different from all other regions by having only 6% cases of Alpha along with a dominant 88% of cases represented by the Beta variant.[112]

In Portugal, the variant represented according to a national genome sequencing survey: 16.0% of the Covid-19 infections during 10–19 January (week 2),[115] followed by a dominant 58.2% in week 6.[116] A national RT-PCR proxy test based on SGTF and SGTL observations, found the variant at a rate of 33.5% in week 4, but observed afterwards a decelerating pace for the weekly rise of the variant share (reason unknown), and according to this study it only became dominant by 50.5% (91.8% of 55.0% SGTFL) in week 8, followed by 64.3% (91.8% of 70% SGTFL) in week 10.[75]

In Italy, the Alpha variant accounted for 17.8% of cases nationwide on 4–5 February (week 5),[117] followed by 54.0% on 18 February (week 7). The regional prevalence for week 7 ranged from 0% in Aosta Valley (although only one sample was tested) to 93.3% in Molise. In week 7, the competing Gamma variant had a prevalence of 4.3% (ranging between 0%-36.2% regionally) and the South African variant a prevalence of 0.4% (ranging between 0%-2.9% regionally).[118]

In Switzerland, a nationwide weekly genome sequencing survey found that the Alpha variant grew from 0.05% (week 51) to a dominant 58.2% of cases in week 8, followed by 71.1% in week 9.[76] This was in full accordance with a model from 9 February that had forecast dominance around mid-February.[119] In comparison, the competing Beta variant was only found nationwide in 1.0% of the positive cases in week 9.[76]

In Belgium, genome sequencing of samples selected randomly after excluding all samples from active targeted testing related to local outbreaks or travels (creating a statistical representative national sample with a seize equal to 4.4% of all COVID-19 positive tests), found that the Alpha variant share grew from 7.1% in week 1 to a dominant 51.5% in week 7, followed by 79.3% in week 10.[120] The variant was first time detected by targeted genome sequencing in week 49, but due to a small sample seize (not being random, and less than 100 tests per week) then no reliable variant share data could be determined before week 1.[121] The proxy test for the variant (RT-PCR SGTF) was also conducted for a sample seize equal to 25.8% of all COVID-19 positive tests, and found a dominant 54.8% SGTF rate for week 10. In comparison, the competing Beta variant was found to be at 3.6% and the Gamma variant had a prevalence of 1.8% in week 10.[120]

In France, scientists accurately forecast the Alpha variant (VOC-202012/01) would likely become dominant nationwide around week 8–11 of 2021.[122] A nationwide survey of randomly selected positive COVID-19 samples first analysed by a RT-PCR screening test and subsequently confirmed by genome sequencing, revealed that the variant grew from a share of 3.3% (388/11916) on 7–8 January (week 1)[123] to 13.3% (475/3561) on 27 January (week 4),[85] followed by 44.3% (273/615) on 16 February (week 7).[85] In week 8, the variant was found to have a dominant share of 56.4% (758/1345) according to the interpretable results of a weekly genome sequencing survey comprising 0.9% of all COVID-19 positive tests, or 59.5% according to a variant-specific RT-PCR survey testing 54% of all the COVID-19 positive tests.[124] In week 10, the variant was found to have a share of 71.9% according to a variant-specific RT-PCR survey testing 56.9% of all the COVID-19 positive tests. The spread of the variant differed regionally for the 96 departments located in Metropolitan France for week 10, with 91 departments over 50% and 5 departments with 30%-50% (of which the Moselle department in particular was notable due to finding a high 38.3% rate of the competing Beta variant, that - despite having declined from a dominant 54.4% value in week 8 - still was significantly above the 5.0% national average for this specific variant).[125]

In Austria, Agentur für Gesundheit und Ernährungssicherheit (AGES) collected data from N501Y RT-PCR specific tests combined with subsequent genome sequencing analysis, and found that the variant grew from 7.2% (week 1) to a dominant 61.3% (week 8), followed by 61.2% in week 9 and 48.3% in week 10. If all N501Y positive tests had been analysed further by genome sequencing, then these listed shares could have been even higher, for example they could have been as mcuh as: 2.4% higher for week 1, 23.0% higher for week 7, 4.0% higher for week 8, 6.8% higher for week 9 and 25.4% higher for week 10. The competing Beta variant was only found nationwide in 0.3% of the positive cases in week 10, and for the region Tyrol - where it had been most prevalent - its share declined from 24.5% in week 4 to just 1.9% in week 10. Regionally Alpha was found to be dominant with over 50% for 7 out of 9 regions, with the only two exceptions being Tyrol and Vorarlberg.[126]

In Germany, the largest and probably most representative national survey published by the Robert Koch Institute (entitled RKI-Testzahlerfassung), determined the share of circulating COVID-19 variants for the latest week by analysing 53,272 COVID-19 positive samples either by genome sequencing or RT-PCR proxy tests, with data collected on a voluntary basis from 84 laboratories from the university / research / clinical / outpatient sector - spread evenly across the nation. The survey did not utilize data weights or data selection criteria to ensure existence of geographical representativity, but might still be regarded as somewhat representative for the national average due to its big sample seize. According to the RKI-Testzahlerfassung survey, the variant grew from a share of 2.0% (week 2) to a dominant share of 54.5% (week 9), followed by 63.5% in week 10. In comparison, the competing Beta variant was only found nationwide in 0.9% of the positive cases in week 10.[127]

In Malta, the variant was first time detected by genome sequencing on 30 December 2020,[128] and represented 8% of the positive cases in week 7.[129] A new RT-PCR variant specific test was introduced for the surveillance,[130] where the first results reported on 10 March revealed the variant now represented 61% of cases nationwide.[131]

In Sweden, the national authorities initially expected the variant would become dominant around week 12–14 under the assumption of 50% increased transmissibility compared to the original virus.[132] In average, the variant share was found growing from 10.8% (week 4) to 36.9% (week 7) across five of its southern regions (Skåne, Västra Götaland, Västmanland, Gävleborg and Örebro).[133] For week 7, the share of the variant was for the first time also calculated to 30.4% as the overall average for 19 out of 21 Swedish regions (ranging from 3.3% in Blekinge to 45% in Gävleborg). For week 9, the share of the variant was calculated to a dominant 56.4% as the overall average for the 19 regions (ranging from 16% in Kronoberg to 72% in Gävleborg). For week 10, the share of the variant was calculated to have increased further to 71.3% as the overall average for the 19 regions (ranging from 40% in Kronoberg to 84% in Jönköping). Although no geographical weights were applied to ensure geographical representativity for the calculated average for the 19 regions, the overall sample seize of 12,417 variant tests represented 43.1% of all COVID-19 positive PCR-tests for week 10, inferring that the result of the survey might be close to represent the actual true average for the nation as a whole.[86]

In the microstate Liechtenstein, the first case of Alpha was detected on 19 December 2020. During the entire pandemic, 67 VOC-N501Y PCR-positive cases were detected comprising 58 cases of Alpha, 1 of Beta (detected 1 February) and 8 un-identified N501Y cases (from 10 Dec. to 22 Feb.), as of 18 March 2021. The weekly average of each days calculated 7-day rolling average for the share of all detected VOC-N501Y cases (which is a good proxy for Alpha in Liechtenstein), was found to be 10.9% in week 5, followed by a dominant 52.2% in week 9 (where 8 out of 15 tests were found to be Alpha); and grew further to 73.4% in week 10 (where 6 out of 9 tests were found to be Alpha).[134]

In Spain, the variant share was estimated nationwide to be 5%-10% of cases on 29 January,[135] followed by 20%-25% of cases on 18 February[136][137] and 25%-30% of cases on 22 February,[138] and estimated to be dominant with over 50% as of 3 March (week 9).[139] As of week 10, the prevalence of the variant ranged from 18.3% to 97.0% for the 17 regions, with all but two regions having a dominant rate above 50%:[140]

In Poland, a national survey among infected teachers led to experts estimating that the variant share was between 5% and 10% nationwide as of 11 February,[141] while ECDC reported it to be 9% as of 15 February.[142] According to Health minister Adam Niedzielski, the variant was found at a rate of 5% in the first studies from the second half of January, and then it increased by ten percentage points every ten days, until it became dominant nationwide by a 52% rate on 16 March (week 11).[143][144] Regionally, the variant had already exceeded 70% for Warmian-Masurian and Pomeranian on 22–23 February (week 8),[145] and even reached 90% for the Greater Poland Voivodeship on 17 March (week 11).[146]

In Finland, no statistical representative national survey had been conducted as of February 2021, as the national genome sequencing mainly targeted further analysis of COVID-19 positive samples from travellers and local outbreak clusters.[147] Helsinky University Hospital (HUS), operating in the Helsinki and Uusimaa Hospital District, found the variant in 10% of all samples collected randomly during a few days ahead of 14 February in the capitol region (also known as the Helsinky constituency and Uusimaa constituency). For the capitol region, the variant was modelled to become dominant (over 50%) in the second half of March (week 11-13).[148]

In Iceland, the national authorities implemented a strict 3 test and quarantine regime for all persons entering the country from abroad, that so far successfully managed to prevent new infectious VOCs from gaining a foothold in the country. As of 4 March, a total of 90 travellers had tested positive for the Alpha variant at Iceland's borders and the 20 additional domestic cases were all closely connected to the border cases, with no cases related to community transmission.[149]

Spread in North America

[edit]

In the United States, the variant first appeared late November 2020,[150] grew from 1.2% in late January and became predominant around the end of March.[151][152]The spread of the variant was primarily concentrated in the upper Midwest of the country, especially the states of Michigan and Minnesota, but it failed to spread in high concentrations to other parts of the country.[153]

In Canada, the variant first appeared in Ontario late December 2020.[154] By 13 February, it had spread to all ten provinces.[155] Testing and confirmation of the Alpha variant (lineage B.1.1.7) in COVID-19-positive samples has been inconsistent across the country.[156] On 3 February, the province of Alberta was the first to screen all COVID-19 positive samples for variants of concern.[156][157] As of 23 March, the Alpha variant had been detected in 5812 cases, and was most prevalent in the province of Alberta.[158] In Ontario, a combined RT-PCR (N501Y) and genome sequencing study found that all VOCs represented 4.4% of all COVID-19 positives on 20 January (week 3), and that Alpha comprised 99% of all those VOCs.[159] Public Health Ontario laboratories found the variant in close to 7% of all COVID-19 positives in week 5, representing 97% (309/319) of all detected VOCs.[160] Alpha became the dominant variant on or around 16 March; 53% of all positive cases were VOCs, and it was presumed 97% of VOCs were Alpha.[161] In Quebec, where the variant was also widespread, it was expected to become dominant by late March or in April.[162]

Development

[edit]
Development of the Alpha variant (lineage B.1.1.7)
(share of analysed SARS-CoV-2–positive tests in a given week)
Country Test 2020 Week 42 Week 43 Week 44 Week 45 Week 46 Week 47 Week 48 Week 49 Week 50 Week 51 Week 52 Week 53 2021 Week 1 Week 2 Week 3 Week 4 Week 5 Week 6 Week 7 Week 8 Week 9 Week 10
United Kingdom Seq.[77] 0.05% 0.35% 1.0% 2.7% 6.3% 10.2% 10.2% 13.9% 32.9% 45.7% 51.3% 70.6% 74.1% 78.6% 86.0% 89.1%
England SGTF[163]*Seq.%[164]

Seq.[96]
SGTF rawdata[f]
SGTF model[f]

0.07%

(0.02%)
(N/A)
(N/A)

0.4%

(0.5%)
(N/A)
(N/A)

0.9%

(1.2%)
(N/A)
(N/A)

2.9%

(1.5%)
(N/A)
(N/A)

5.5%

(5.3%)
(N/A)
(N/A)

9.1%

(7.8%)
(15.2%)
(m:13.3%)

18.0%

(11.4%)
(24.3%)
(m:15.9%)

32.2%

(22.1%)
(36.8%)
(m:22.0%)

51.8%

(38.1%)
(49.3%)
(m:32.1%)

63.7%

(61.8%)
(60.7%)
(m:57.2%)

72.4%

(62.1%)
(72.1%)
(m:68.9%)

77.9%

(78.4%)
(75.0%)
(m:74.0%)

82.1%

(76.7%)
(80.7%)
(m:78.3%)

87.5%

(79.7%)
(83.3%)
(m:82.1%)

90.6%

(–)
(88.2%)
(m:86.0%)

93.8%

(–)
(87.7%)
(m:89.3%)

95.7%

(–)
(93.4%)
(m:92.5%)

97.4%

(–)
(95.3%)
(m:94.5%)

98.1%

(–)
(97.0%)
(m:95.4%)

98.6%

(–)
(95.6%)
(m:95.5%)

98.7%

(–)
(94.2%)
(m:95.2%)


(–)
(96.1%)
(m:94.1%)

Northern Ireland SGTF rawdata[f]
SGTF model[f]
N/A N/A N/A N/A N/A 17.9%
(m:14.0%)
7.4%
(m:14.9%)
37.5%
(m:16.3%)
23.0%
(m:18.5%)
50.0%
(m:36.1%)
25.0%
(m:42.1%)
58.8%
(m:44.7%)
45.2%
(m:52.7%)
71.4%
(m:67.0%)
78.2%
(m:74.0%)
72.4%
(m:81.4%)
95.7%
(m:86.5%)
88.9%
(m:90.5%)
92.2%
(m:92.4%)
100.0%
(m:93.0%)
86.2%
(m:92.6%)
100.0%
(m:91.1%)
Scotland SGTF rawdata[f]
SGTF model[f]
N/A N/A N/A N/A N/A 9.5%
(m:5.8%)
9.7%
(m:6.7%)
10.4%
(m:7.7%)
11.7%
(m:10.2%)
51.4%
(m:26.2%)
40.0%
(m:39.5%)
35.8%
(m:43.9%)
64.1%
(m:49.8%)
67.2%
(m:64.2%)
63.3%
(m:65.0%)
69.2%
(m:70.0%)
70.6%
(m:77.3%)
93.9%
(m:84.7%)
82.0%
(m:90.0%)
100.0%
(m:93.7%)
93.0%
(m:95.8%)
100.0%
(m:96.9%)
Wales SGTF rawdata[f]
SGTF model[f]
N/A N/A N/A N/A N/A 27.9%
(m:18.1%)
8.3%
(m:16.0%)
10.7%
(m:13.3%)
26.3%
(m:12.1%)
13.4%
(m:15.0%)
15.9%
(m:14.7%)
19.8%
(m:20.4%)
54.4%
(m:34.8%)
61.5%
(m:59.6%)
69.0%
(m:65.0%)
68.1%
(m:68.7%)
77.0%
(m:73.4%)
71.8%
(m:76.6%)
75.8%
(m:78.5%)
87.9%
(m:78.9%)
80.0%
(m:77.2%)
69.9%
(m:73.3%)
Ireland SGTF rawdata[48] 1.9%
(few data)
0.0%
(few data)
0.0%
(few data)
6.1%
(few data)
2.2%
(few data)
1.6%
(few data)
7.5% 16.3% 26.2% 46.3% 57.7% 69.5% 75.0% 90.1% 88.6% 90.8%
Bulgaria Seq.[97] 52.1% 70.8% 73.4%
Israel SGTF w.51+1
Seq. after w.1
3–4%
(Dec.15)[102]
10–20%
(Jan.5)[102]
10–20%
(Jan.11)[167]
30–40%
(Jan.19)[168]
40–50%
(Jan.25)[169]
~70%
(Feb.2)[103]
~80%
(Feb.9)[170]
~90%
(Feb.16)[104]
Slovakia PCR (SGTF+ΔY144) [99] ~74%
(Feb.3)
~72%
(Feb.15)
~90%
(Mar.3)
Luxembourg Seq.[105] 0.3% 0.9% 4.2% 8.7% 15.5% 16.9% 36.2% 53.0% 54.1% 53.8% 63.7% 62.8%
Denmark Seq.[106] 0.3% 0.2% 0.4% 0.4% 0.4% 0.8% 1.8% 1.9% 3.5% 7.0% 13.1% 19.6% 29.6% 47.0% 65.9% 75.3% 85.1% 92.7%
Netherlands Seq.[74] 1.3% 0.8% 0.5% 2.1% 4.4% 9.6% 15.9% 22.7% 24.7% 31.0.% 40.3% 61.3% 75.2% 82.0%
Norway PCR proxy and Seq.[112]
Seq.[171][111]

(–)

(–)

(–)

(–)

(–)
0.0%
(–)
2.0%
(–)
0.0%
(0.0%)
4.9%
(0.0%)
8.9%
(7.2%)
6.0%
(2.9%)
14.9%
(1.3%)
18.9%
(5.7%)
19.5%
(11.6%)
15.2%
(9.3%)
19.8%
(20.1%)
34.1%
(30.3%)
43.6%
(40.8%)
60.0%
(58.4%)
71.8%
(65.0%)
76.7%
(–)
72.7%
(–)
Italy Seq.%[117][118] 17.8% 54.0%
France PCR proxy
Seq.
SGTF*Seq.%

(–)
(–)

(–)
(–)

(–)
(–)

(–)
(–)

(–)
(–)

(–)
(–)

(–)
(–)

(–)
(–)

(–)
(–)

(–)
(–)

(–)
(–)

(–)
(–)

(–)
(3.3%)[123]

(–)
(–)

(–)
(–)

(–)
(13.3%)[85]

(–)
(–)
36.1%[172]
(–)
(–)
49.3%[173]
(45.8%)[173]
(44.3%)[85]
59.5%[124]
(56.4%)[124]
(–)
65.8%[85]
(69.0%)[125]
(–)
71.9%[125]
(–)
(–)
Switzerland Seq.[76] 0.05% 0.4% 0.8% 2.6% 4.9% 9.2% 16.5% 26.0% 32.4% 47.0% 58.2% 71.1%
Austria PCR(N501Y)*Seq.%[126]
Seq.B117+unseq.N501Y[126]
7.2%[g]
(9.6%)
17.4%[g]
(23.8%)
14.7%[g]
(19.6%)
22.5%[g]
(28.6%)
28.7%[g]
(37.2%)
24.0%[g]
(45.4%)
35.1%[g]
(58.1%)
61.3%[g]
(65.3%)
61.2%[g]
(68.0%)
48.3%[g]
(73.7%)
Belgium Seq.[121][120]
SGTF[121][120]

(–)

(–)

(–)

(–)

(–)

(–)

(–)
0.0%
(<5%)
0.0%
(<5%)
0.0%
(<5%)
13.6%
(<5%)
0.0%
(<5%)
7.1%
(7.2%)
7.7%
(6.9%)
13.4%
(16.6%)
23.3%
(19.5%)
39.4%
(22.4%)
43.2%
(27.9%)
51.5%
(34.4%)
57.6%
(45.8%)
66.5%
(46.3%)
79.3%
(54.8%)
Portugal SGTFL*Seq.%[75] 1.7% 0.8% 1.2% 1.7% 2.9% 6.8% 12.3% 22.7% 33.5% 39.2% 40.9% 45.7% 50.5% 56.0% 64.3%
Sweden Seq. all N501Y+A570D pos. tests[86] 10.8%
(av. for 5 out of 21 regions)[h]
15.1%
(av. for 5 out of 21 regions)[i]
27.3%
(av. for 5 out of 21 regions)[j]
30.4%
(av. for 19 out of 21 regions)[k]
41.5%
(av. for 19 out of 21 regions)[l]
56.4%
(av. for 17 out of 21 regions)[m]
71.3%
(av. for 18 out of 21 regions)[n]
Germany PCR proxy and Seq.[127]
Seq.[127]

(–)

(–)

(–)

(–)

(–)

(–)

(–)

(–)

(–)

(–)

(–)

(–)

(2.6%)
2.0%
(8.8%)
3.6%
(4.9%)
4.7%
(10.7%)
7.2%
(17.7%)
17.6%
(20.8%)
25.9%
(33.2%)
40.0%
(42.9%)
54.5%
(48.3%)
63.5%
(–)
Liechtenstein PCR proxy: N501Y[134] 10.9% 28.5% 32.8% 47.0% 52.2% 73.4%
Spain Estimated based on PCR proxy[140] 5-10%
(Jan.29)[135]
20-25%
(Feb.18)[137]
25-30%
(Feb.22)[138]
>50%
(Mar.3)[139]
United States SGTF*Seq.%[175] 0.05% 0.2% 0.4% 0.5% 1.0% 1.9% 3.0% 4.7% 7.6% 12.4% 19.3% 28.8% 37.4%
California SGTF*Seq.%[175] 0.3% 0.3% 0.7% 1.1% 1.3% 2.0% 1.9% 4.2% 5.9% 13.1% 16.6% 18.8% 28.0%
Florida SGTF*Seq.%[175] 0.2% 0.5% 0.9% 1.0% 2.3% 4.6% 8.1% 10.7% 14.5% 21.0% 28.3% 39.8% 47.0%
Other countries without weekly/periodic data, but with a variant share above 5%: 00 Malta (61%),[131] and Poland (52%).[144]

The following additional countries did not report variant shares, but are likely to have a significant share present due to their finding of more than 50 cases confirmed by whole genome sequencing per 13 March 2021:[176]

The GISAID database of all sequenced COVID-19 genomes, calculates for each country for the past four weeks an average "Relative Variant Genome Frequency" for submitted samples. Those observed frequencies are however subject to sampling and reporting biases, and do not represent exact variant share prevalence due to absence of statistical representativity.[176]

Countries reporting a first case

[edit]

December 2020

[edit]

Cases of the variant began to be reported globally during December, being reported in Denmark,[64][177] Belgium,[178] the Netherlands, Australia[64][177] and Italy.[179] Shortly after, several other countries confirmed their first cases, the first of whom were found in Iceland and Gibraltar,[180][181] then Singapore, Israel and Northern Ireland on 23 December,[182][183][184] Germany and Switzerland on 24 December,[185][186] and the Republic of Ireland and Japan confirmed on 25 December.[187][188]

The first cases in Canada, France, Lebanon, Spain and Sweden were reported on 26 December.[189][190][191][192] Jordan, Norway, and Portugal reported their first case on 27 December,[193][194] Finland and South Korea reported their first cases on 28 December,[195][196] and Chile, India, Pakistan and the United Arab Emirates reported their first cases on 29 December.[197][198][199][200] The first case of new variant in Malta and Taiwan are reported on 30 December.[128][201] China and Brazil reported their first cases of the new variant on 31 December.[202][203] The United Kingdom and Denmark are sequencing their SARS-CoV-2 cases at considerably higher rates than most others,[204] and it was considered likely that additional countries would detect the variant later.[205]

The United States reported a case in Colorado with no travel history on 29 December, the sample was taken on 24 December.[206] On 6 January 2021, the US Centers for Disease Control and Prevention announced that it had found at least 52 confirmed cases in California, Florida, Colorado, Georgia, and New York.[207] In the following days, more cases of the variant were reported in other states, leading former CDC director Tom Frieden to express his concerns that the U.S. will soon face "close to a worst-case scenario".[208]

January 2021

[edit]

Turkey detected its first cases in 15 people from England on 1 January 2021.[209] It was reported on 1 January that Denmark had found a total of 86 cases of the variant, equalling an overall frequency of less than 1% of the sequenced cases in the period from its first detection in the country in mid-November to the end of December;[210][211] this had increased to 1.6% of sequenced tests in the period from mid-November to week two of 2021, with 7% of sequenced tests in this week alone being of Alpha variant (lineage B.1.1.7).[212] Luxembourg and Vietnam reported their first case of this variant on 2 January 2021.[213][214]

On 3 January 2021, Greece and Jamaica detected their first four cases of this variant[215][216] and Cyprus announced that it had detected Alpha (VOC 202012/01) in 12 samples.[217] At the same time, New Zealand and Thailand reported their first cases of this variant, where the former reported six cases made up of five from the United Kingdom and one from South Africa,[218] and the latter reported the cases from a family of four who had arrived from Kent.[219] Georgia reported its first case[220] and Austria reported their first four cases of this variant, along with one case of Beta variant, on 4 January.[221]

On 5 January, Iran,[222] Oman,[223] and Slovakia reported their first cases of VOC-202012/01.[224] On 8 January, Romania reported its first case of the variant, an adult woman from Giurgiu County who declared not having left the country recently.[225] On 9 January, Peru confirmed its first case of the variant.[226] Mexico and Russia reported their first case of this variant on 10 January,[227] then Malaysia and Latvia on 11 January.[228][229]

On 12 January, Ecuador confirmed its first case of this variant.[230] The Philippines and Hungary both detected the presence of the variant on 13 January.[231][232] The Gambia recorded first cases of the variant on 14 January with it being the first confirmation of the variant's presence in Africa.[233] On 15 January, the Dominican Republic confirmed its first case of the new variant[234] and Argentina confirmed its first case of the variant on 16 January.[235] Czech Republic and Morocco reported their first cases on 18 January[236][237] while Ghana and Kuwait confirmed their first cases on 19 January.[238][239] Nigeria confirmed its first case on 25 January.[240] On 28 January, Senegal detected its first case of the variant.[241]

In early January, an outbreak linked to a primary school led to the detection of at least 30 cases of the new variant in the Bergschenhoek area of the Netherlands, signifying local transmission.[242]

On 24 January, a person travelling from Africa to Faroe Islands tested positive upon arrival to the islands, and went directly into quarantine.[243]

On 28 January, North Macedonia confirmed the variant was detected in a 46-year-old man, who had already recovered.[244]

February 2021

[edit]

On 1 February, Lithuania confirmed the first cases of the new lineage.[citation needed] On 4 February, health authorities in Uruguay announced the first case of the variant in the country. The case was detected in a person who entered the country on 20 December 2020 and has been in quarantine ever since.[245] On 10 February, the Health Ministry of Croatia confirmed that out of 61 sequenced samples since 20 January, the variant was detected in 3 samples: a male 50 year old and 3.5 year old from Zagreb, and a male 34-year-old from Brod-Posavina County.[246] On 12 February, the variant was detected from four areas in Sri Lanka,[247] and the Canadian province of Newfoundland and Labrador confirmed an outbreak of the variant.[248]

March 2021

[edit]

On 2 March, Indonesia reports its first cases of the variant in two migrant workers returning from Saudi Arabia.[249] On the same day, Tunisia[250] reported their first cases of the variant. The presence of the variant in Ivory Coast was confirmed on 25 March.[251]

N501Y mutation elsewhere

[edit]

The N501Y mutation arose independently multiple times in different locations:

  • In April 2020, it was seen for the first time in a few isolated sequences in Brazil.[252]
  • In June 2020, the mutation appeared in an Australian lineage.[252]
  • In July 2020, (according to Dr Julian Tang, University of Leicester) N501Y appeared in a lineage circulating in United States.[252][citation needed]
  • In September 2020, it was found in a lineage in Wales, that evolved independently and was different from lineage B.1.1.7.[52]
  • In September 2020,[1] the much more transmissible and widespread lineage B.1.1.7 (501Y.V1) was detected for the first time in Kent (England).[19]
  • In October 2020, another highly transmissible variant of concern termed lineage B.1.351 (501Y.V2, Beta variant) was first time detected by genome sequencing in Nelson Mendela Bay (South Africa).[253] Phylogeographic analysis suggests this lineage emerged already in July or August 2020.[254]
  • In December 2020,[255] another highly transmissible variant termed lineage P.1 (501Y.V3, Gamma variant) was detected in Manaus (Brazil).[256]

Statistics

[edit]

Table

[edit]

Graphics

[edit]

Confirmed cases by countries

[edit]
  • Note: The graphs presented here are only viewable by computers and some phones. If you cannot view it on your cell phone, switch to desktop mode from your browser.
  • Data provided by various sources, such as; governmental, press or officials are updated every week since their last publication.

History

[edit]

Detection

[edit]
False-colour transmission electron micrograph of the Alpha variant. The variant's increased transmissibility is believed to be due to changes in structure of the spike proteins, shown here in green.

The Alpha variant (lineage B.1.1.7) was first detected in early December 2020 by analysing genome data with knowledge that the rates of infection in Kent were not falling despite national restrictions.[5][260]

The two earliest genomes that belong to lineage B.1.1.7 were collected on 20 September 2020 in Kent and another on 21 September 2020 in Greater London.[19] These sequences were submitted to the GISAID sequence database (sequence accessions EPI_ISL_601443 and EPI_ISL_581117, respectively).[261]

Backwards tracing using genetic evidence suggests lineage B.1.1.7 emerged in September 2020 and then circulated at very low levels in the population until mid-November. The increase in cases linked to the variant first became apparent in late November when Public Health England (PHE) was investigating why infection rates in Kent were not falling despite national restrictions. PHE then discovered a cluster linked to this variant spreading rapidly into London and Essex.[30]

Also important was the nature of the RT-PCR test used predominantly in the UK, Thermo Fisher Scientific's TaqPath COVID-19. The test matches RNA in three locations, and stopped working for the spike gene due to the HV 69–70 deletion—a deletion of the amino acids histidine and valine in positions 69 and 70, respectively[262]—in the spike protein of lineage B.1.1.7. This made preliminary identification easier because it could be better suspected which cases were with lineage B.1.1.7 through genome sequencing.[263]

It has been suggested that the variant may have originated in a chronically infected immunocompromised person, giving the virus a long time to replicate and evolve.[264][5][265][266]

Control

[edit]

In the presence of a more transmissible variant, stronger physical distancing and lockdown measures were opted for to avoid overwhelming the population due to its tendency to grow exponentially.[267]

All countries of the United Kingdom were affected by domestic travel restrictions in reaction to the increased spread of the virus—at least partly attributed to Alpha—effective from 20 December 2020.[268][269] During December 2020, an increasing number of countries around the world either announced temporary bans on, or were considering banning, passenger travel from the UK, and in several cases from other countries such as the Netherlands and Denmark. Some countries banned flights; others allowed only their nationals to enter, subject to a negative SARS-CoV-2 test.[270] A WHO spokesperson said that, "[a]cross Europe, where transmission is intense and widespread, countries need to redouble their control and prevention approaches". Most bans by EU countries were for 48 hours, pending an integrated political crisis response meeting of EU representatives on 21 December to evaluate the threat from the new variant and coordinate a joint response.[271][272]

Many countries around the world imposed restrictions on passenger travel from the United Kingdom; neighbouring France also restricted manned goods vehicles (imposing a total ban before devising a testing protocol and permitting their passage once more).[273] Some also applied restrictions on travel from other countries.[274][275][276][277] As of 21 December 2020, at least 42 countries had restricted flights from the UK,[270] and Japan was restricting entry of all foreign nationals after cases of the new variant were detected in the country.[278]

The usefulness of travel bans has been contested as limited in cases where the variant has likely already arrived, especially if the estimated growth rate per week of the virus is higher locally.[279][280]

Extinction

[edit]

In October 2021, Dr Jenny Harries, chief executive of the UK Health and Security Agency stated that previous circulating variants such as Alpha had 'disappeared' and replaced by the Delta variant.[281] In March 2022, the World Health Organization listed the Alpha, Beta and Gamma variants as previously circulating citing lack of any detected cases in the prior weeks and months.[282]

See also

[edit]

Notes

[edit]
  1. ^ Written as VUI 202012/01 (Variant Under Investigation, year 2020, month 12, variant 01) by GISAID[283] and the ECDC.[284]
  2. ^ The difference between the two is explained by PHE:

    SARS-CoV-2 variants, if considered to have concerning epidemiological, immunological, or pathogenic properties, are raised for formal investigation. At this point they are designated Variant Under Investigation (VUI) with a year, month, and number. Following a risk assessment with the relevant expert committee, they may be designated Variant of Concern (VOC).[18]

  3. ^ Jump up to: a b SARS-CoV-2's S gene encodes its spike protein.[47]
  4. ^ An example of this is the delta (Δ)–PCR test, which in connection to SARS-CoV-2, has been used to detect the HV 69–70 deletion in variants with this mutation[83] through what has been named "spike-gene target failure" (SGTF) or "spike-gene drop out"[75] for the spike (S) gene[c] in a subset of RT-PCR assays (e.g., TaqPath COVID-19 RT-PCR assay, ThermoFisher).[84] Though existing in a few other variants of SARS-CoV-2,[75] the HV 69–70 deletion in the spike protein is present in the vast majority of B.1.1.7 genomes, which enables the delta-PCR test to be used as a proxy test for the lineage—or as a supplementing first-screening test before conducting the whole-genome sequencing.[83][75]
    Another example of a RT-PCR test intended to detect specific variants is the one detecting all genomes with the N501Y mutation (e.g., Alpha, Gamma variant, and Beta variant), which is now also being used as a first-step screening tool ahead of genome sequencing by several laboratories/countries (e.g. by some parts of France).[85]
    A third and fourth RT-PCR test intended for detecting specific variants pre-screen the samples for variants respectively with the N501Y+A570D mutations (Alpha) and N501Y without the A570D mutation (Beta, Gamma, and other N501Y variants).[86]
  5. ^ 104 WHO members had reported a detection of the Alpha variant (lineage B.1.1.7), as of 23 March 2021: Albania, Angola, Argentina, Australia, Austria, Azerbaijan, Bahrain, Bangladesh, Barbados, Belarus, Belgium, Belize, Bosnia and Herzegovina, Brazil, Brunei Darussalam, Bulgaria, Cabo Verde, Cambodia, Canada, Chile, China, Costa Rica, Croatia, Cyprus, Czech Republic, Democratic Republic of the Congo, Denmark, Dominican Republic, Ecuador, Estonia, Finland, France, Gambia, Georgia, Germany, Ghana, Greece, Hungary, Iceland, India, Indonesia, Iran, Iraq, Ireland, Israel, Italy, Jamaica, Japan, Jordan, Kenya, Kuwait, Latvia, Lebanon, Libya, Lithuania, Luxembourg, Malaysia, Malta, Mauritania, Mauritius, Mexico, Monaco, Montenegro, Morocco, Nepal, Netherlands, New Zealand, Nigeria, North Macedonia, Norway, Oman, Pakistan, Peru, Philippines, Poland, Portugal, Republic of Korea (South Korea), Republic of Moldova, Romania, Russia, Rwanda, Saint Lucia, Saudi Arabia, Senegal, Serbia, Singapore, Slovakia, Slovenia, South Africa, Spain, Sri Lanka, Sweden, Switzerland, Thailand, Trinidad and Tobago, Tunisia, Turkey, Ukraine, United Arab Emirates, United Kingdom, United States, Uruguay, Uzbekistan, Vietnam.[87]

    90 WHO members had not reported any detection of the Alpha variant (lineage B.1.1.7), as of 23 March 2021: Afghanistan, Algeria, Andorra, Antigua and Barbuda, Armenia, Bahamas, Benin, Bhutan, Bolivia, Botswana, Burkina Faso, Burundi, Cameroon, Central African Republic, Chad, Colombia, Comoros, Congo, Cook Islands, Côte d'Ivoire, Cuba, Democratic People's Republic of Korea (North Korea), Djibouti, Dominica, Egypt, El Salvador, Equatorial Guinea, Eritrea, Ethiopia, Fiji, Gabon, Grenada, Guatemala, Guinea-Bissau, Guyana, Haiti, Honduras, Guinea, Kazakhstan, Kiribati, Kyrgyzstan, Lao People's Democratic Republic, Lesotho, Liberia, Madagascar, Malawi, Maldives, Mali, Marshall Islands, Micronesia, Mongolia, Mozambique, Myanmar, Namibia, Nauru, Nicaragua, Niger, Niue, Palau, Panama, Papua New Guinea, Paraguay, Qatar, Saint Kitts and Nevis, Saint Vincent and the Grenadines, Samoa, San Marino, Sao Tome and Principe, Seychelles, Sierra Leone, Solomon Islands, Somalia, South Sudan, Sudan, Suriname, Swaziland, Syrian Arab Republic, Tajikistan, Timor-Leste, Togo, Tonga, Turkmenistan, Tuvalu, Uganda, United Republic of Tanzania, Vanuatu, Venezuela, Yemen, Zambia, Zimbabwe.[87]
  6. ^ Jump up to: a b c d e f g h В еженедельном опросе по инфекциям в Великобритании для каждой страны Великобритании приводится набор необработанных данных и сглаженных по среднему значению смоделированных данных, полученных SGTF, проанализированных ПЦР-тестами, собранными в частных домохозяйствах (исключая тесты из больниц, центров ухода и государственных учреждений). К необработанным данным, а также к модельным данным для Уэльса, Северной Ирландии и Шотландии следует относиться с осторожностью из-за небольшого количества собранных образцов, что приводит к большой неопределенности данных. [165][166]
    • All PCR tests were analysed for 3 genes present in the coronavirus: N protein, S protein and ORF1ab (see Table 6A in the Infection Survey). Each PCR test can have any one, any two or all three genes detected. Coronavirus positives are those where one or more of these genes is detected in the swab (other than tests that are only positive on the S-gene which is not considered a reliable indicator of the virus if found on its own). The new B.1.1.7 variant of COVID-19 has genetic changes in the S gene, that results in the S-gene no longer being detected in the current test, meaning that it will only be positive on the ORF1ab and the N gene. The survey uses the terms "New UK variant compatible" for ORF1ab + N protein gene positives, "not compatible with new UK variant" for ORF1ab + N protein + S protein gene positive, and "virus too low to be identifiable" for all other gene patterns (a reasonable definition given that all samples taken from the first phase of the COVID-19 disease where virus exist by identifiable quantity, either will be positive by "ORF1ab+N" or "ORF1ab+N+S"). However, further uncertainty exists given that not all "New UK variant compatible" SGTF cases (positive on ORF1ab and N-genes, but not the S-gene) will be the new UK variant - due to some other competing variants also delivering this same test pattern; and prior to mid-November 2020 the data should not be read as being an indicator of the variant at all.[165][166]
    • Необработанные данные о доле еженедельного варианта B.1.1.7 рассчитываются на основе таблицы 6A путем деления процентного содержания «ORF1ab+N» на процентную сумму «ORF1ab+N» и «ORF1ab+N+S». В таблице 6C использовались необработанные данные из таблицы 6A в качестве входных данных для расчета некоторых смоделированных (средне-сглаженных и взвешенных) ежедневных расчетных показателей для соответствующего процента населения, инфицированного коронавирусом либо «вирусом, совместимым с новым британским вариантом «вирусом, совместимым с новым британским вариантом» , либо ». Не совместим с новым вирусом в Великобритании» или «вирусом, слишком слабым, чтобы его можно было идентифицировать» , при этом данные за более ранние даты 2020 года также доступны при загрузке опубликованных более ранних выпусков «Обзора инфекций». Смоделированное среднее недельное значение для варианта Alpha, отмеченное в этой таблице как значение (m: %), рассчитывается как среднее значение для перечисленных семи дней в каждой неделе «Процента совместимости нового варианта для Великобритании», деленного на сумму « Процент совместимости с новым вариантом для Великобритании» и «Процент несовместимости с новым вариантом для Великобритании» . [ 165 ] [ 166 ]
  7. ^ Jump up to: а б с д и ж г час я дж В Австрии указанные доли вариантов B.1.1.7 представляют собой процент всех положительных тестов на COVID-19, подтвержденных секвенированием генома как B.1.1.7. Однако многие N501Y-положительные тесты RT-PCR не были вариантом, определяемым в дальнейшем путем секвенирования генома, и, вероятно, дали бы положительный результат B.1.1.7 для подавляющего большинства таких тестов, если бы анализ секвенирования генома был проведен. Если бы все положительные тесты N501Y были дополнительно проанализированы с помощью секвенирования генома, то котируемые еженедельные доли B.1.1.7 могли бы вырасти до: 9,6% для недели 1 (выше на 2,4%) , 23,8% для недели 2 (выше на 6,4%) , 19,6% для 3-й недели (выше на 4,9%) , 28,6% для 4-й недели (выше на 6,1%) , 37,2% для 5-й недели (выше на 8,5%) , 45,4% для 6-й недели (выше на 21,4%) , 58,1% для 7-й недели ( на 23,0% выше) , 65,3% на 8-й неделе (на 4,0% выше) , 68,0% на 9-й неделе (на 6,8% выше) и 73,7% на 10-й неделе (на 25,4% выше) . [ 126 ]
  8. ^ В Швеции исследование, включающее 11% всех ПЦР-положительных образцов SARS-CoV-2 по всей стране за четвертую неделю, показало, что доля B.1.1.7 составила 10,8% (243/2244). Однако образцы были собраны только из пяти южных регионов ( Сконе , Вестра-Гёталанд , Вестманланд , Евлеборг и Эребру ), которые не считались статистически репрезентативными для демографии и географии Швеции в целом. Национальные власти планируют расширить еженедельное исследование, чтобы охватить больше регионов, в течение следующих недель в феврале 2021 года. [ 174 ] [ 133 ]
  9. ^ В Швеции исследование, включающее 16% всех ПЦР-положительных образцов SARS-CoV-2 по всей стране за пятую неделю, показало, что доля B.1.1.7 составила 15,1% (488/3224). Однако образцы были собраны только из пяти южных регионов ( Сконе , Вестра-Гёталанд , Вестманланд , Евлеборг и Эребру ), которые не считались статистически репрезентативными для демографии и географии Швеции в целом. Национальные власти также рассчитали среднее значение за две недели (недели 5+6) для 19 из 21 региона и планируют расширить еженедельное исследование, чтобы охватить больше регионов в течение следующих недель в феврале 2021 года. [ 133 ]
  10. ^ В Швеции исследование, включающее 18% всех ПЦР-положительных образцов SARS-CoV-2 по всей стране за 6 неделю, показало, что доля B.1.1.7 составила 27,3% (1021/3742). Однако образцы были собраны только из пяти южных регионов ( Сконе , Вестра-Гёталанд , Вестманланд , Евлеборг и Эребру ), которые не считались статистически репрезентативными для демографии и географии Швеции в целом. Национальные власти также рассчитали среднее значение за две недели (недели 5+6) для 19 из 21 региона и планируют расширить еженедельное исследование, чтобы охватить больше регионов в течение следующих недель в феврале 2021 года. [ 133 ]
  11. ^ В Швеции исследование, включающее 47,8% всех ПЦР-положительных образцов SARS-CoV-2 по всей стране за 7 неделю, собрало образцы из 19 из 21 региона (все, кроме Готланда и Вестерботтена ), и выявило долю B.1.1.7. составит 30,4% (3316/10910) как простое общее среднее значение (с возможным географическим искажением в расчетах, поскольку данные отсутствуют веса использовались для нормализации/корректировки доли каждого региона в общей выборке). [ 86 ]
  12. ^ В Швеции исследование, включающее 42,2% всех ПЦР-положительных образцов SARS-CoV-2 по всей стране за 8-ю неделю, собрало образцы из 19 из 21 региона (все, кроме Готланда и Вестерботтена ), и выявило долю B.1.1.7. составит 41,5% (4643/11191) как простое общее среднее значение (с потенциальным географическим искажением в расчетах, поскольку для нормализации/корректировки доли каждого региона в общей выборке не использовались веса данных). [ 86 ]
  13. ^ В Швеции исследование, охватывающее 37,8% всех ПЦР-положительных образцов SARS-CoV-2 по всей стране за 9 неделю, собрало образцы из 17 из 21 региона (все, кроме Готланда , Вестерботтена , Норрботтена и Эстергётланда ) и выявило вирус B. 1.1.7 доля составит 56,4% (5939/10528) как простое общее среднее значение (с потенциальным географическим искажением в расчетах, поскольку для нормализации/корректировки доли каждого региона в общей выборке не использовались веса данных). [ 86 ]
  14. ^ В Швеции исследование, охватывающее 43,1% всех ПЦР-положительных образцов SARS-CoV-2 по всей стране за 10 неделю, собрало образцы из 18 из 21 региона (все, кроме Готланда , Вестерботтена и Эстергётланда ) и обнаружило B.1.1. 7 доля составит 71,3% (8850/12417) как простой общий средний показатель (с потенциальным географическим искаженное искажение данных в расчетах, поскольку не использовались веса данных для нормализации/коррекции доли каждого региона в общей выборке). [ 86 ]
  1. ^ Jump up to: а б «Отчет Б.1.1.7» . cov-lineages.org . Проверено 29 января 2021 г.
  2. ^ «Отслеживание вариантов SARS-CoV-2» . www.who.int . Проверено 17 августа 2022 г.
  3. ^ «Варианты беспокойства» . CDGN . Проверено 17 августа 2022 г.
  4. ^ Купфершмидт, Кай. «Мутантный коронавирус в Соединенном Королевстве вызывает тревогу, но его важность остается неясной» . www.science.org . Наука . Проверено 24 февраля 2023 г.
  5. ^ Jump up to: а б с д Пикок, Шэрон (22 декабря 2020 г.). «Вот что мы знаем о новом варианте коронавируса» . Хранитель .
  6. ^ Доннелли, Лаура (26 января 2021 г.). «Великобритания поможет секвенировать мутации Covid по всему миру, чтобы найти новые опасные варианты» . Телеграф . Архивировано из оригинала 11 января 2022 года . Проверено 28 января 2021 г.
  7. Рэйчел Шраер (22 декабря 2020 г.). «Covid: новый вариант обнаружен «благодаря упорной работе британских ученых» . Би-би-си. Проверено 30 января 2021 г.
  8. ^ Сагден, Джоанна (30 января 2021 г.). «Как Великобритания стала мировым лидером в секвенировании генома коронавируса» . Уолл Стрит Джорнал .
  9. ^ Jump up to: а б Исследование нового варианта SARS-CoV-2, вызывающего опасения 202012/01: Технический брифинг 5 (PDF) (Отчет). Общественное здравоохранение Англии. 2 февраля 2021 г. Проверено 2 февраля 2021 г.
  10. ^ Jump up to: а б с Общественное здравоохранение Англии (16 февраля 2021 г.). «Варианты: распределение данных случаев» . Правительство Великобритании . Проверено 17 февраля 2021 г.
  11. ^ «Объяснение: почему ВОЗ назвала варианты Covid-19, впервые обнаруженные в Индии, как «Каппа» и «Дельта» | Новости Индии – Times of India» . Таймс оф Индия . 1 июня 2021 г. Проверено 2 июня 2021 г.
  12. ^ «ВОЗ объявляет о простых и понятных этикетках для вариантов SARS-CoV-2, представляющих интерес и вызывающих беспокойство» . www.who.int . Проверено 6 июня 2021 г.
  13. ^ Подробный список источников новостей, использующих эти термины, см. в разделе « Вариант Covid-19 для Великобритании» , вариант коронавируса для Великобритании и вариант для Великобритании.
  14. ^ Jump up to: а б с Робертс, Мишель (2 февраля 2021 г.). «Британский вариант снова мутировал, говорят ученые» . Новости Би-би-си . Проверено 2 февраля 2021 г.
  15. ^ Бозли, Сара (10 февраля 2021 г.). «Мутировавший вариант Kent Covid следует воспринимать серьезно, - предупреждает британский ученый» . Хранитель . Проверено 10 февраля 2021 г.
  16. ^ Jump up to: а б « Все в Кенте пошли на нелегальный рейв?»: по вариантному следу с детективами по Covid» . Хранитель . 3 апреля 2021 г. Проверено 23 сентября 2022 г.
  17. ^ «PHE исследует новый штамм COVID-19» . Общественное здравоохранение Англии. 14 декабря 2020 г. Эта статья содержит текст, лицензированный OGL. Эта статья включает текст, опубликованный в соответствии с Британской лицензией открытого правительства v3.0:
  18. ^ «Варианты: распределение данных случаев» . GOV.UK. ​28 января 2021 г. На конференции «Различия между вызывающим беспокойство вариантом и исследуемым вариантом» . Проверено 19 февраля 2021 г. Эта статья содержит текст, лицензированный OGL. Эта статья включает текст, опубликованный в соответствии с Британской лицензией открытого правительства v3.0:
  19. ^ Jump up to: а б с д Рамбо, Эндрю; Ломан, Ник; Пайбус, Оливер; Барклай, Венди; Барретт, Джефф; Карабелли, Алесандро; и др. (19 декабря 2020 г.). Предварительная геномная характеристика новой линии SARS-CoV-2 в Великобритании, определяемой новым набором шиповых мутаций (Отчет). Написано от имени Консорциума геномики COVID-19 Великобритании . Проверено 20 декабря 2020 г.
  20. ^ Каллауэй, Юэн (15 января 2021 г.). « 'Кровавый беспорядок': царит путаница по поводу названий новых вариантов COVID» . Новости природы и комментарии . 589 (7842): 339. Бибкод : 2021Natur.589..339C . дои : 10.1038/d41586-021-00097-w . ПМИД   33452513 . [...] Эмма Ходкрофт , молекулярный эпидемиолог из Бернского университета, Швейцария, которая является частью Nextstrain, усилия по присвоению имени SARS-CoV-2, которое назвало «британский вариант» 20I/501Y.V1.
  21. ^ Варианты шипов: альфа-вариант, также известный как B.1.1.7, 501Y.V1, 20I/501Y.V1 и вариант COVID для Великобритании , 24 июня 2021 г., covdb.stanford.edu , по состоянию на 1 июля 2021 г.
  22. ^ Jump up to: а б с д Уайз, Жаки (16 декабря 2020 г.). «Covid-19: В Великобритании выявлен новый вариант коронавируса» . БМЖ . 371 : м4857. дои : 10.1136/bmj.m4857 . ПМИД   33328153 . S2CID   229291003 .
  23. ^ Чанд и др. , с. 5.
  24. ^ «Головная боль и насморк связаны с вариантом Дельта» . Новости Би-би-си . 14 июня 2021 г.
  25. ^ «Быстрая оценка подтверждает, что устройства с латеральным потоком эффективны в обнаружении нового варианта COVID-19» . Правительство Великобритании . Проверено 27 декабря 2020 г. Эта статья содержит текст, лицензированный OGL. Эта статья включает текст, опубликованный в соответствии с Британской лицензией открытого правительства v3.0:
  26. ^ Патель-Карстерс, Сунита (19 декабря 2020 г.). «COVID-19: Лондон и Юго-Восток перешли на правила Уровня 4 – как новый вариант COVID, «настоящая причина для беспокойства» » . Небесные новости .
  27. ^ «Вакцины от Covid все еще эффективны против быстро распространяющегося варианта» . Метро . 20 декабря 2020 г.
  28. ^ «Вакцины эффективны против нового штамма вируса – министр здравоохранения Германии» . Спрашивающий . АФП. 21 декабря 2020 г.
  29. ^ Jump up to: а б «Совещание NERVTAG по расследуемому варианту SARS-CoV-2: VUI-202012/01» . Консультативная группа по новым и возникающим угрозам респираторных вирусов. 18 декабря 2020 г.
  30. ^ Jump up to: а б «COVID-19 (SARS-CoV-2): информация о новом варианте вируса» . Gov.uk. ​Общественное здравоохранение Англии. 20 декабря 2020 г. Проверено 21 декабря 2020 г. . Эта статья содержит текст, лицензированный OGL. Эта статья включает текст, опубликованный в соответствии с Британской лицензией открытого правительства v3.0:
  31. ^ Браун, Фэй (9 февраля 2021 г.). «Мутантный штамм Covid, обнаруженный в Бристоле, обозначен как «вариант, вызывающий беспокойство » . Метро Великобритании . Проверено 10 февраля 2021 г.
  32. ^ Мандавилли, Апурва (5 марта 2021 г.). «В Орегоне ученые нашли вариант вируса с тревожной мутацией» . Нью-Йорк Таймс . ISSN   0362-4331 . Архивировано из оригинала 28 декабря 2021 года . Проверено 6 марта 2021 г.
  33. ^ «B.1.1.7 Происхождение с отчетом S:E484K» . Вспышка . Проверено 6 марта 2021 г.
  34. ^ Волц Э., Мишра С. и др. (май 2021 г.). «Оценка трансмиссивности SARS-CoV-2 линии B.1.1.7 в Англии» . Природа . 593 (7858): 266–269. Бибкод : 2021Природа.593..266В . дои : 10.1038/s41586-021-03470-x . hdl : 10044/1/87474 . ISSN   1476-4687 . ПМИД   33767447 . S2CID   232365193 .
  35. ^ Дэвис Н.Г., Эбботт С. и др. (9 апреля 2021 г.). «Оценочная трансмиссивность и влияние SARS-CoV-2 линии B.1.1.7 в Англии» . Наука . 372 (6538): eabg3055. дои : 10.1126/science.abg3055 . ПМЦ   8128288 . ПМИД   33658326 .
  36. ^ Форт, Хьюго (август 2021 г.). «Очень простая модель для объяснения быстрого роста альфа-варианта SARS-CoV-2 в ряде стран и мира» . Вирусные исследования . 304 : 198531. doi : 10.1016/j.virusres.2021.198531 . ПМЦ   8339456 . ПМИД   34363849 .
  37. ^ Люнг, Кэти; Шум, Маркус Х.Х.; Люнг, Габриэль М; Лам, Томми Тай; Ву, Джозеф Т. (7 января 2021 г.). «Ранняя оценка трансмиссивности мутантных штаммов N501Y SARS-CoV-2 в Соединенном Королевстве, октябрь-ноябрь 2020 г.» . Евронадзор . 26 (1). дои : 10.2807/1560-7917.ES.2020.26.1.2002106 . ПМЦ   7791602 . ПМИД   33413740 .
  38. ^ Кремер М.Ю., Хилл В. и др. (22 июля 2021 г.). «Пространственно-временная динамика инвазии появления SARS-CoV-2 линии B.1.1.7» . Наука . 373 (6557): 889–895. Бибкод : 2021Sci...373..889K . дои : 10.1126/science.abj0113 . hdl : 10044/1/90624 . ISSN   0036-8075 . ПМК   9269003 . ПМИД   34301854 . S2CID   236209853 .
  39. ^ Пинкстоун, Джо (23 июля 2021 г.). «Ученые переоценили заразность альфа-варианта» . Телеграф . ISSN   0307-1235 . Архивировано из оригинала 11 января 2022 года . Проверено 10 августа 2021 г.
  40. ^ ван Диссель, Яап (24 февраля 2021 г.). «COVID-19 2e Kamer-брифинг, 24 февраля 2021 г.» [Технический брифинг 2-й палаты по развитию коронавируса, 24 февраля 2021 г.] (PDF) (на голландском языке) . Проверено 28 февраля 2021 г.
  41. ^ Jump up to: а б Экспертный отчет от 21 февраля 2021 г.: Прогнозы уровня заражения и количества госпитализаций при сценариях повторного открытия 1 марта [Экспертный отчет от 21 февраля 2021 г.: Прогнозы уровня заражения и госпитализаций при сценариях повторного открытия 1 марта] (PDF) (Отчет) (на датском языке) . Государственный сывороточный институт . 22 февраля 2021 г. Проверено 22 февраля 2021 г.
  42. ^ «Передача вариантов SARS-CoV-2 в Швейцарии» . Институт социальной и профилактической медицины (ISPM), Бернский университет. 5 марта 2021 г. Проверено 5 марта 2021 г.
  43. ^ Jump up to: а б с Волц Э., Мишра С. и др. (4 января 2021 г.). «Передача SARS-CoV-2 линии B.1.1.7 в Англии: результаты объединения эпидемиологических и генетических данных». medRxiv   10.1101/2020.30.12.20249034 .
  44. ^ «Новые данные о ВУИ-202012/01 и обзор оценки риска для здоровья населения» . Проверено 4 января 2021 г.
  45. ^ «Витрина COG-UK» . Ютуб . Проверено 25 декабря 2020 г.
  46. ^ Грабовски, Фредерик; Прейбиш, Гжегож; Гизинский, Станислав; Кочанчик, Марек; Липняцкий, Томаш (1 марта 2021 г.). «Вызывающий интерес вариант SARS-CoV-2 202012/01 обладает примерно двукратным репликативным преимуществом и приобретает мутации» . Вирусы . 13 (3): 392. дои : 10.3390/v13030392 . ПМЦ   8000749 . ПМИД   33804556 .
  47. ^ «UniProtKB — P0DTC2 (SPIKE_SARS2)» . ЮниПрот . Проверено 4 февраля 2021 г.
  48. ^ Jump up to: а б с д Национальная группа по чрезвычайным ситуациям в области общественного здравоохранения , Министерство здравоохранения (25 февраля 2021 г.). «Обновление NPHET о COVID-19 – 25 февраля 2021 г.» (PDF) . Новый (B.1.1.7) вариант - неспособность достичь цели гена S (p   31) . Проверено 4 марта 2021 г. {{cite web}}: CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка )
  49. ^ Пилас, Пан (2 января 2021 г.). «Великобритания бьет рекорд с 57 725 случаями, ей настоятельно рекомендуется держать школы закрытыми» . Корона вирус . Проверено 3 января 2021 г.
  50. ^ Махасе, Элизабет (23 декабря 2020 г.). «Covid-19: что мы узнали о новом варианте в Великобритании?» . БМЖ . 371 : м4944. дои : 10.1136/bmj.m4944 . ПМИД   33361120 . S2CID   229366003 .
  51. ^ Кирби, Тони (февраль 2021 г.). «Новый вариант SARS-CoV-2 в Великобритании вызывает всплеск заболеваемости COVID-19» . Ланцет респираторной медицины . 9 (2): е20–е21. дои : 10.1016/S2213-2600(21)00005-9 . ПМЦ   7784534 . ПМИД   33417829 .
  52. ^ Jump up to: а б Обновленная информация COG-UK о мутациях SARS-CoV-2 Spike, представляющих особый интерес: отчет 1 (PDF) (отчет). Британский консорциум по геномике COVID-19 (COG-UK). 20 декабря 2020 г. с. 7. Архивировано из оригинала (PDF) 22 декабря 2020 года.
  53. ^ COG-UK (20 декабря 2020 г.) , с. 4.
  54. ^ Йи, К.; Солнце, Х.; Йе, Дж.; и др. (2020). «Ключевые остатки рецепторсвязывающего мотива в белке-шипе SARS-CoV-2, которые взаимодействуют с ACE2 и нейтрализующими антителами» . Клеточная и молекулярная иммунология . 17 (6): 621–630. дои : 10.1038/s41423-020-0458-z . ПМЦ   7227451 . ПМИД   32415260 .
  55. ^ Jump up to: а б COG-UK (20 декабря 2020 г.) , с. 1.
  56. ^ Jump up to: а б с д Чанд и др. , с. 6.
  57. ^ Кемп, ЮАР; Коллиер, Д.А.; Датир, РП; Феррейра, IATM; Гайед, С.; Джахун, А.; и др. (2021). «Эволюция SARS-CoV-2 при лечении хронической инфекции» . Природа (Ускоренный просмотр статьи). 592 (7853): 277–282. дои : 10.1038/s41586-021-03291-y . ПМК   7610568 . ПМИД   33545711 . S2CID   232113127 .
  58. ^ Шаххоссейни, Нариман; Бабуадзе, Георгий (Георгий); Вонг, Гэри; Кобингер, Гэри П. (май 2021 г.). «Сигнатуры мутаций и стыковка in silico новых вызывающих беспокойство вариантов SARS-CoV-2» . Микроорганизмы . 9 (5): 926. doi : 10.3390/microorganisms9050926 . ПМЦ   8146828 . ПМИД   33925854 .
  59. ^ Бартон, Майкл I; Макгоуэн, Стюарт А; Кутузов Михаил А; Душек, Омер; Бартон, Джеффри Джон; ван дер Мерве, П. Антон (26 августа 2021 г.). Фушье, Рон AM; Ван дер Меер, Йос В.; Фушье, Рон А.М. (ред.). «Влияние общих мутаций в SARS-CoV-2 Spike RBD и его лиганде, рецепторе ACE2 человека, на аффинность связывания и кинетику» . электронная жизнь . 10 : е70658. дои : 10.7554/eLife.70658 . ISSN   2050-084X . ПМЦ   8480977 . ПМИД   34435953 .
  60. ^ Челлен Р., Брукс-Поллок Э. и др. (9 марта 2021 г.). «Риск смертности у пациентов, инфицированных вызывающим беспокойство вариантом SARS-CoV-2 202012/1: сопоставленное когортное исследование» . БМЖ . 372 : n579. дои : 10.1136/bmj.n579 . ПМЦ   7941603 . ПМИД   33687922 .
  61. ^ Jump up to: а б Дэвис Н.Г., Джарвис С.И. и др. (13 мая 2021 г.). «Повышение смертности в протестированных на местном уровне случаях SARS-CoV-2 линии B.1.1.7» . Природа . 593 (7858): 270–274. Бибкод : 2021Natur.593..270D . дои : 10.1038/s41586-021-03426-1 . ISSN   0028-0836 . ПМК   9170116 . ПМИД   33723411 . S2CID   232245304 .
  62. ^ Фрэмптон Д., Рэмплинг Т. и др. (апрель 2021 г.). «Геномные характеристики и клинический эффект новой линии SARS-CoV-2 B.1.1.7 в Лондоне, Великобритания: полногеномное секвенирование и когортное исследование на базе больницы» . Ланцет инфекционных заболеваний . 21 (9): 1246–1256. дои : 10.1016/S1473-3099(21)00170-5 . ПМК   8041359 . ПМИД   33857406 .
  63. ^ Грэм М.С., Судре CH и др. (май 2021 г.). «Изменения симптоматики, реинфекции и трансмиссивности, связанные с вариантом B.1.1.7 SARS-CoV-2: экологическое исследование» . Ланцет общественного здравоохранения . 6 (5): е335–е345. дои : 10.1016/S2468-2667(21)00055-4 . ПМК   8041365 . ПМИД   33857453 .
  64. ^ Jump up to: а б с «Covid: ВОЗ находится в «тесном контакте» с Великобританией по поводу нового варианта вируса» . Новости Би-би-си . 20 декабря 2020 г.
  65. ^ Бергер, Мириам (20 декабря 2020 г.). «Страны по всей Европе прекращают полеты из Великобритании из-за опасений по поводу мутации коронавируса» . Вашингтон Пост . ISSN   0190-8286 . Архивировано из оригинала 20 декабря 2020 года . Проверено 20 декабря 2020 г.
  66. ^ «Новый британский вариант «может быть более смертоносным» » . Новости Би-би-си . 22 января 2021 г.
  67. ^ Питер Хорби; Кэтрин Хантли; Ник Дэвис; Джон Эдмундс; Нил Фергюсон; Грэм Медли; Эндрю Хейворд; Муге Джевик; Калум Семпл (11 февраля 2021 г.). «Документ NERVTAG о вызывающем обеспокоенность варианте COVID-19 B.1.1.7: Обновленная примечание NERVTAG о серьезности B.1.1.7 (11 февраля 2021 г.)» (PDF) . www.gov.uk.
  68. ^ Пестон, Роберт (22 января 2021 г.). «Новый штамм Covid-19 может быть более смертоносным, - узнает Роберт Пестон» . Новости ИТВ . Проверено 24 января 2021 г.
  69. ^ Челлен, Роберт; Брукс-Поллок, Эллен; Прочтите, Джонатан М; Дайсон, Луиза; Цанева-Атанасова, Красимира; Данон, Леон (9 марта 2021 г.). «Риск смертности у пациентов, инфицированных вызывающим беспокойство вариантом SARS-CoV-2 202012/1: сопоставленное когортное исследование» . БМЖ . 372 : n579. дои : 10.1136/bmj.n579 . ПМЦ   7941603 . ПМИД   33687922 .
  70. ^ Статенский институт сыворотки (24 февраля 2021 г.). «B.1.1.7 может привести к увеличению количества госпитализаций» (на датском языке) . Проверено 25 февраля 2021 г.
  71. ^ Jump up to: а б Зинзула, Лука (2020). «Потерян при удалении: загадочный белок ORF8 SARS-CoV-2» . Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 538 : 116–24. дои : 10.1016/j.bbrc.2020.10.045 . ПМЦ   7577707 . ПМИД   33685621 .
  72. ^ Купфершмидт, Кай (20 декабря 2020 г.). «Мутантный коронавирус в Соединенном Королевстве вызывает тревогу, но его важность остается неясной». Наука . дои : 10.1126/science.abg2626 . S2CID   234564870 .
    См. также COG-UK (20 декабря 2020 г.) , стр. 4: «69–70del выявлен в вариантах, связанных с ускользанием иммунитета у пациентов с ослабленным иммунитетом…»
  73. ^ «Геномный обзор SARS-CoV-2 в Дании» . 30 января 2021 г. Проверено 1 февраля 2021 г.
  74. ^ Jump up to: а б с Национальный институт общественного здравоохранения и окружающей среды (RIVM) – Министерство здравоохранения, благосостояния и спорта (23 марта 2021 г.). «Варианты коронавируса SARS-CoV-2» . www.rivm.nl. ​Проверено 23 марта 2021 г.
  75. ^ Jump up to: а б с д и ж г Борхес, Витор; и др. (19 января 2021 г.). «Отслеживание распространения SARS-CoV-2 VOC 202012/01 (линия B.1.1.7) в Португалии: данные общенациональных данных о выпадении генов Spike с помощью RT-PCR» . Обновленная информация, включая данные за 3–10 недели 2021 г.: опубликовано после статьи 16 марта 2021 г. В сноске к предыдущим обновлениям поясняется, что 91,8% общего количества SGTF+SGTL (~90% SGTF и 100% SGTL) было подтверждено последовательность генома должна быть вариантом B.1.1.7. Доли B.1.1.7 были рассчитаны как 91,8% от общей доли SGTF+SGTL за каждую неделю . Проверено 16 марта 2021 г.
  76. ^ Jump up to: а б с д Швейцарская национальная научная целевая группа по COVID-19. «Геномная характеристика» . Проверено 15 марта 2021 г. {{cite web}}: CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка )
  77. ^ Jump up to: а б с д «Варианты SARS-CoV-2, вызывающие беспокойство в Швейцарии» . ИБЗ Блестящий . Январь 2021 г. Архивировано из оригинала 17 февраля 2021 г. Проверено 18 февраля 2021 г.
  78. ^ Источники данных:
  79. ^ Jump up to: а б с «Обследование инфекции коронавируса (COVID-19), Великобритания: 29 января 2021 г.: 10. Положительные тесты, совместимые с новым британским вариантом» . www.ons.gov.uk. ​29 января 2021 г. Проверено 1 февраля 2021 г. Эта статья содержит текст, лицензированный OGL. Эта статья включает текст, опубликованный в соответствии с Британской лицензией открытого правительства v3.0:
  80. ^ Уокер, А. Сара; Вихта, Карина-Дорис; Гетингс, Оуэн; Причард, Эмма; Джонс, Джоэл; Хаус, Томас; Белл, Иэн; Белл, Джон I; Ньютон, Джон Н.; Фаррар, Джереми; Даймонд, Ян; Стадли, Рут; Рурк, Эмма; Привет, Джоди; Хопкинс, Сьюзен; Крук, Деррик; Пето, Тим; Мэтьюз, Филиппа К.; Эйр, Дэвид В.; Штессер, Николь; Пауэлс, Коэн Б. (15 января 2021 г.). «Рост инфекций, но не вирусной нагрузки, с новым вариантом SARS-CoV-2». medRxiv   10.1101/2021.01.13.21249721 .
  81. ^ Источники данных:
    • Гражданин Великобритании (21 января 2021 г.): [ 77 ]
    • Юго-Восточная Англия (31 декабря 2020 г.): [ 43 ]
    • Страны Великобритании (29 января 2021 г.): [ 79 ]
    • Регионы Англии (15 января 2021 г.): [ 80 ]
  82. ^ «Риск, связанный с распространением новых вызывающих озабоченность вариантов SARSCoV-2 в ЕС/ЕЭЗ» (PDF) . www.ecdc.europa.eu . 29 декабря 2020 г. Проверено 1 февраля 2021 г.
  83. ^ Jump up to: а б с Statens Serum Institut (4 февраля 2021 г.). «Дельта-ПЦР-тест» [Дельта-ПЦР-тест] (на датском языке) . Проверено 11 февраля 2021 г.
  84. ^ Антонин Баль; Грегори Дестрас; Александр Гаймар; Карл Штефик; Жюльен Марле; и др. (Исследовательская группа HCL по диагностике COVID) (21 января 2021 г.). «Двухэтапная стратегия идентификации вызывающего озабоченность варианта SARS-CoV-2 202012/01 и других вариантов с делецией пика H69–V70; Франция; август-декабрь 2020 г.» . Евронадзор . 26 (3). дои : 10.2807/1560-7917.ES.2021.26.3.2100008 . ПМЦ   7848679 . ПМИД   33478625 .
  85. ^ Jump up to: а б с д и ж Общественное здравоохранение Франции (11 марта 2021 г.). «COVID-19: Еженедельное эпидемиологическое обновление от 11 марта 2021 года» [COVID-19: Еженедельное эпидемиологическое обновление от 11 марта 2021 года] (на французском языке) . Проверено 12 марта 2021 г.
  86. ^ Jump up to: а б с д и ж г «Статистика по вызывающим обеспокоенность вариантам SARS-CoV-2» [Статистика по вызывающим обеспокоенность вариантам SARS-CoV-2] (на шведском языке). Управление общественного здравоохранения. 18 марта 2021 г. Проверено 18 марта 2021 г.
  87. ^ Jump up to: а б с «Еженедельный эпидемиологический обзор COVID-19, 23 марта 2021 г.» (PDF) . ВОЗ. 23 марта 2021 г. Проверено 23 марта 2021 г.
  88. ^ Юнес М., Хамзе К. и др. (26 января 2021 г.). «Появление и быстрое распространение линии B.1.1.7 в Ливане». medRxiv   10.1101/2021.01.25.21249974 .
  89. ^ Юнес М., Хамзе К. и др. (17 марта 2021 г.). «B.1.1.7 стал доминирующим вариантом в Ливане». medRxiv   10.1101/2021.03.17.21253782 .
  90. ^ Хиггинс-Данн, Н. (19 декабря 2020 г.). «В Великобритании выявили новый штамм Covid-19, который распространяется быстрее. Вот что им известно» . MSNBC.
  91. ^ Команда, Файлы блокировки (9 марта 2023 г.). «Вариант Covid, испортивший Рождество, месяцами скрывался учеными от министров» . Телеграф . ISSN   0307-1235 . Проверено 13 марта 2023 г.
  92. ^ «Консорциум по геномике COVID-19 Великобритании (COG-UK) - Институт Велкома Сэнгера» . www.sanger.ac.uk . Проверено 23 декабря 2020 г.
  93. ^ Галлахер, Джеймс (20 декабря 2020 г.). «Новый вариант коронавируса: что мы знаем?» . Новости Би-би-си . Проверено 21 декабря 2020 г. .
  94. ^ Росс, Т.; Спенс, Э. (19 декабря 2020 г.). «Лондон начинает чрезвычайную изоляцию, поскольку Великобритания борется с новым штаммом вируса» . Новости Блумберга.
  95. ^ «Варианты – распределение данных о случаях: данные до 25 января 2021 года» . Gov.uk. ​Общественное здравоохранение Англии. 26 января 2021 г. Проверено 27 января 2021 г. Эта статья содержит текст, лицензированный OGL. Эта статья включает текст, опубликованный в соответствии с Британской лицензией открытого правительства v3.0:
  96. ^ Jump up to: а б Общественное здравоохранение Англии (1 февраля 2021 г.). «Исследование нового варианта SARS-CoV-2: 202012/01. Технический брифинг 5 данных» . Отчет о данных - «Рисунок 1» показывает еженедельный процент всех секвенированных геномов VOC202012/01 путем добавления доли SGTF+Kent к доле Not SGTF+Kent. В отчете в качестве сокращенного псевдонима VOC202012/01 используется слово «Кент» . Проверено 5 февраля 2021 г. Эта статья содержит текст, лицензированный OGL. Эта статья включает текст, опубликованный в соответствии с Британской лицензией открытого правительства v3.0:
  97. ^ Jump up to: а б «(09.03.2021) Эпидемия острого респираторного синдрома, связанная с новым коронавирусом SARS-COV-2, УХАНЬ, КИТАЙ: ОБНОВЛЕНИЕ» [(09.03.2021) Эпидемия острого респираторного синдрома, связанная с новым коронавирусом SARS-COV-2, Ухань, Китай: актуальная информация] (на болгарском языке). 3 марта 2021 г. Проверено 10 марта 2021 г.
  98. ^ Ковацова, В.; и др. (5 февраля 2021 г.). «Новый, стабильный при комнатной температуре, мультиплексный RT-qPCR анализ, позволяющий отличить линию B.1.1.7 от остальных линий SARS-CoV-2» . вирусологический сайт . Проверено 21 февраля 2021 г.
  99. ^ Jump up to: а б Ян Микас, главный гигиенист Словацкой Республики (9 марта 2021 г.). «Британский вариант подтвержден в Словакии в 90% исследованных образцов» [Британский вариант подтвержден в Словакии в 90% исследованных образцов] (на словацком языке). Управление общественного здравоохранения Словацкой Республики. Архивировано из оригинала 13 мая 2021 года . Проверено 17 марта 2021 г.
  100. ^ «Текущая эпидемиологическая ситуация в Словакии (презентация, 8 января 2021 г.)» [Текущая эпидемиологическая ситуация в Словакии (презентация, 8 января 2021 г.)] (PDF) (на словацком языке). Управление общественного здравоохранения Словацкой Республики. 9 января 2021 г. Архивировано из оригинала (PDF) 14 июля 2021 г. . Проверено 21 февраля 2021 г.
  101. ^ «Пресс-релизы: Четыре случая варианта COVID-19, обнаруженные в Соединенном Королевстве, были обнаружены в Израиле» . Министерство здравоохранения. 23 декабря 2020 г. Проверено 26 февраля 2021 г.
  102. ^ Jump up to: а б с Адриан Пилот (5 января 2021 г.). «Британская мутация составляет от 10% до 20% случаев короны» [Британская мутация составляет от 10% до 20% случаев короны по всей стране] (на иврите). Калькалист . Проверено 26 февраля 2021 г.
  103. ^ Jump up to: а б Той Стафф (2 февраля 2021 г.). «Нам придется жить с COVID-19 еще долго, — говорит израильский эксперт» . Времена Израиля . Проверено 26 февраля 2021 г.
  104. ^ Jump up to: а б Ynet (16 февраля 2021 г.). «Высокопоставленный чиновник здравоохранения: 90% случаев COVID-19 вызваны британским вариантом» . Проверено 25 февраля 2021 г.
  105. ^ Jump up to: а б Национальная лаборатория здоровья (LNS) (18 марта 2021 г.). «Наблюдение за респираторными вирусами – REVILUX: Информационный бюллетень Sentinel о респираторных вирусах, бюллетень REVILUX hebdomadaire» [Наблюдение за респираторными вирусами – REVILUX: Информационный бюллетень Sentinel о респираторных вирусах, еженедельное обновление REVILUX]. Архивировано из оригинала 17 декабря 2021 года . Проверено 18 марта 2021 г.
  106. ^ Jump up to: а б «Статус рассмотрения вызывающих беспокойство вариантов SARS-CoV-2 (VOC) в Дании» [Статус разработки вызывающих беспокойство вариантов SARS-CoV-2 (VOC) в Дании] (на датском языке). Статенский институт сывороток. 20 марта 2021 г. Проверено 20 марта 2021 г.
  107. ^ Обратите внимание на прогнозы уровня заражения и госпитализации в сценариях открытия 0,-4. класс в начальной школе [ Меморандум о прогнозах уровня заражения и госпитализации в сценариях открытия 0–4 классов начальной школы] (PDF) (Отчет) (на датском языке). Государственный сывороточный институт . 31 января 2021 г. Проверено 2 февраля 2021 г.
  108. ^ «Статус рассмотрения вызывающих беспокойство вариантов SARS-CoV-2 (VOC) в Дании» [Статус разработки вызывающих беспокойство вариантов SARS-CoV-2 (VOC) в Дании] (на датском языке). Статенский институт сывороток. 12 марта 2021 г. Проверено 20 марта 2021 г.
  109. ^ «Статус рассмотрения вызывающих беспокойство вариантов SARS-CoV-2 (VOC) в Дании» [Статус разработки вызывающих беспокойство вариантов SARS-CoV-2 (VOC) в Дании] (на датском языке). Статенский институт сывороток. 19 марта 2021 г. Проверено 20 марта 2021 г.
  110. ^ Министерство здравоохранения, благосостояния и спорта (23 февраля 2021 г.). «Совет VWS по OMT 101» [Совет VWS после 101-го OMT по COVID-19] (PDF) . Government.nl (на голландском языке) . Проверено 13 апреля 2022 г.
  111. ^ Jump up to: а б Folkehelseinstituttet (3 марта 2021 г.). «COVID-19 Ukerapport – uke 8, onsdag 3. Марс 2021» [еженедельный отчет о COVID-19 за 8 неделю (среда, 3 марта 2021 г.)] (PDF) (на норвежском языке). Архивировано из оригинала (PDF) 19 ноября 2021 года . Проверено 4 марта 2021 г.
  112. ^ Jump up to: а б с Folkehelseinstituttet (17 марта 2021 г.). «COVID-19 Ukerapport – uke 10, onsdag 17. Марс 2021» [еженедельный отчет о COVID-19 за 10 неделю (среда, 17 марта 2021 г.)] (PDF) (на норвежском языке). Архивировано из оригинала (PDF) 17 марта 2021 года . Проверено 17 марта 2021 г.
  113. ^ Норвежский институт общественного здравоохранения (26 февраля 2021 г.). «Статистика зарегистрированных случаев английского и южноафриканского вариантов коронавируса» [Статистика зарегистрированных случаев английского и южноафриканского вариантов коронавируса] (на норвежском языке) . Проверено 28 февраля 2021 г.
  114. ^ Норвежский институт общественного здравоохранения (27 февраля 2021 г.). «Английский вариант вируса доминирует в Осло и Викене» [английский вариант вируса доминирует в Осло и Викене] (на норвежском языке). Архивировано из оригинала 17 апреля 2021 года . Проверено 28 февраля 2021 г.
  115. ^ Национальный институт здравоохранения (INSA), доктор Рикардо Хорхе (5 февраля 2021 г.). « Генетическое разнообразие нового коронавируса SARS-CoV-2 (COVID-19) в Португалии» (PDF) (на португальском языке) . Проверено 7 февраля 2021 г.
  116. ^ Национальный институт здравоохранения (INSA), доктор Рикардо Хорхе (3 марта 2021 г.). «Генетическое разнообразие нового коронавируса SARS-CoV-2 (COVID-19) в Португалии (3 марта 2021 г.)» ] (PDF) (на португальском языке) . Проверено 4 марта 2021 г.
  117. ^ Jump up to: а б Высший институт здравоохранения (15 февраля 2021 г.). «Распространенность варианта ЛОС 202012/01, линия B.1.1.7 в Италии ( исследование распространенности, 4–5 февраля 2021 г.)] (на итальянском языке) . Проверено 17 февраля 2021 г.
  118. ^ Jump up to: а б Высший институт здравоохранения (2 марта 2021 г.). «CS № 14/2021 - В Италии 54% инфекций вызваны «английским вариантом», 4,3% - «бразильским» и 0,4% - «южноафриканским» вариантом » [CS № 14/2021 - В Италии 54% случаев заражения вызваны «английским вариантом», 4,3% — «бразильским» и 0,4% — «южноафриканским»] (на итальянском языке) . Проверено 5 марта 2021 г.
  119. ^ «Wissenschaftliches update 09 февраля 2021 г.» [Научное обновление от 9 февраля 2021 г.] (на немецком языке). Швейцарская национальная целевая группа по борьбе с COVID-19. 9 февраля 2021 г. Проверено 17 февраля 2021 г.
  120. ^ Jump up to: а б с д Ученый (19 марта 2021 г.). «Еженедельный эпидемиологический бюллетень Covid-19 (19 марта 2021 г.)» [Еженедельный эпидемиологический бюллетень Covid-19 (19 марта 2021 г.)] (PDF) . Молекулярный надзор за SARS-CoV-2 (стр. 20-22) (на голландском языке) . Проверено 19 марта 2021 г.
  121. ^ Jump up to: а б с Сьенсано (19 февраля 2021 г.). «Еженедельный эпидемиологический бюллетень Covid-19 (19 февраля 2021 г.)» [Еженедельный эпидемиологический бюллетень Covid-19 (19 февраля 2021 г.)] (PDF) . Молекулярный надзор за SARS-CoV-2 (стр. 21–24) (на голландском языке) . Проверено 25 февраля 2021 г.
  122. ^ «Предполагаемая дата доминирования штамма VOC-202012/01 во Франции и прогнозируемые сценарии» (PDF) . 16 января 2021 г.
  123. ^ Jump up to: а б Общественное здравоохранение Франции (28 января 2021 г.). «COVID-19: Еженедельное эпидемиологическое обновление от 28 января 2021 года» [COVID-19: Еженедельное эпидемиологическое обновление от 28 января 2021 года] (на французском языке) . Проверено 1 февраля 2021 г.
  124. ^ Jump up to: а б с Общественное здравоохранение Франции (4 марта 2021 г.). «COVID-19: Еженедельное эпидемиологическое обновление от 4 марта 2021 г.» [COVID-19: Еженедельное эпидемиологическое обновление от 4 марта 2021 г.] (на французском языке) . Проверено 5 марта 2021 г.
  125. ^ Jump up to: а б с Общественное здравоохранение Франции (18 марта 2021 г.). «COVID-19: Еженедельное эпидемиологическое обновление от 18 марта 2021 года» [COVID-19: Еженедельное эпидемиологическое обновление от 18 марта 2021 года] (на французском языке) . Проверено 21 марта 2021 г.
  126. ^ Jump up to: а б с д «Варианты SARS-CoV-2 в Австрии» (на немецком языке). Австрийское агентство по здравоохранению и безопасности пищевых продуктов GmbH (AGES). 19 марта 2021 г. . Проверено 19 марта 2021 г.
  127. ^ Jump up to: а б с «Обновленный отчет о вариантах вируса SARS-CoV-2 в Германии, в частности о вызывающем беспокойство варианте (VOC) B.1.1.7: по состоянию на 17 марта 2021 г.» [Обновленный отчет о вариантах вируса SARS-CoV-2 в Германии Германия, в частности по варианту, вызывающему озабоченность (VOC) B.1.1.7: по состоянию на 17 марта 2021 г.] (PDF) . www.rki.de/DE/Content/InfAZ/N/Neuhaftes_Coronavirus/DESH/berichte-VOC-tab.html (на немецком языке). Институт Роберта Коха (федеральный институт в сфере Федерального министерства здравоохранения). 17 марта 2021 г. Проверено 20 марта 2021 г.
  128. ^ Jump up to: а б «На Мальте выявлено три случая нового варианта COVID» . Времена Мальты . 30 декабря 2020 г.
  129. ^ Лаура Каллеха (24 февраля 2021 г.). «COVID-19: Бары и музыкальные клубы в марте останутся закрытыми, — говорит Крис Ферн» . Мальта сегодня . Проверено 13 марта 2021 г.
  130. ^ «Мальта получит новые мазки, которые смогут идентифицировать варианты Covid-19» . Мальта Независимая. 4 марта 2021 г. Проверено 13 марта 2021 г.
  131. ^ Jump up to: а б Клэр Фарруджа (10 марта 2021 г.). «Вариант британского вируса обнаружен в 60 процентах новых случаев COVID» . Времена Мальты . Проверено 10 марта 2021 г.
  132. ^ Управление общественного здравоохранения (4 февраля 2021 г.). «Сценарии дальнейшего распространения – промежуточный отчет» [Сценарии дальнейшего распространения – промежуточный отчет] (на шведском языке) . Проверено 8 февраля 2021 г.
  133. ^ Jump up to: а б с д «Опубликованная статистика по вариантам вируса SARS-CoV-2, вызывающим особую озабоченность, в течение 8-й недели 2021 г.» [Статистика по вариантам вируса SARS-CoV-2, вызывающим особую озабоченность, за 8-ю неделю 2021 г.] (на шведском языке). Управление общественного здравоохранения. 15 марта 2021 года. Архивировано из оригинала 11 октября 2021 года . Проверено 15 марта 2021 г.
  134. ^ Jump up to: а б «COVID-⁠19 Швейцария Информация о текущей ситуации по состоянию на 18 марта 2021 г.: Ключевые цифры, Лихтенштейн» . Загрузить данные: Данные в виде файла .csv . Федеральное управление общественного здравоохранения . 18 марта 2021 г. Проверено 18 марта 2021 г.
  135. ^ Jump up to: а б «По оценкам Министерства здравоохранения Испании, на британский вариант приходится до 10% положительных результатов в Испании» . murciatoday.com . 30 января 2021 г. Проверено 3 февраля 2021 г.
  136. ^ Альваро Сото (18 февраля 2021 г.). «Британский вариант уже составляет 20% случаев в Испании » . msn.com (на испанском языке) . Получено 22 февраля.
  137. ^ Jump up to: а б «Органы здравоохранения подтвердили, что британский штамм «широко» циркулирует в Испании» (на испанском языке). Глубокий. 18 февраля 2021 г. Проверено 17 марта 2021 г.
  138. ^ Jump up to: а б Мануэль Виласеро (22 февраля 2021 г.). «Detectadas en España las nuevas varias nigeriana y de Río de Janeiro del Coronavirus» [Новые варианты коронавируса в Нигерии и Рио-де-Жанейро, обнаруженные в Испании] (на испанском языке) . Проверено 1 марта 2021 г.
  139. ^ Jump up to: а б Мигель Идальго Перес (3 марта 2021 г.). «Дариас: «Британский вариант уже является доминирующим в Испании» [ Дариас: «Британский вариант уже является доминирующим в Испании»] (на испанском языке) . Проверено 17 марта 2021 г.
  140. ^ Jump up to: а б Испании (18 марта 2021 г.)» «Обновленная эпидемиологическая ситуация по важным вариантам общественного здравоохранения в (PDF) (на испанском языке). Министерство здравоохранения, потребления и социального обеспечения. 18 марта 2021 г. Проверено 18 марта 2021 г.
  141. ^ Адриан Дабек (11 февраля 2021 г.). «Бритыйский вариант коронавирусы – каков масштаб знаний в Польше?» [Британский вариант коронавируса – каковы масштабы его присутствия в Польше?] (на польском языке). Медонет . Получено 17 февраля.
  142. ^ Европейский центр профилактики и контроля заболеваний (15 февраля 2021 г.). «Быстрая оценка риска: увеличение распространения вызывающих озабоченность вариантов SARS-CoV-2 и распространение вакцины в ЕС/ЕЭЗ, 14-е обновление, 15 февраля 2021 г.» (PDF) . www.ecdc.europa.eu . Проверено 18 февраля 2021 г.
  143. ^ «С 20 марта на всей территории Польши действуют расширенные правила безопасности». gov.pl (на польском языке). Правительство Польши. 17 марта 2021 г. Проверено 17 марта 2021 г.
  144. ^ Jump up to: а б Сильвия Дабковска-Пожичка; Эдита Рос; Виктория Никалек; Кароль Костшева; Александра Ребелинская (17 марта 2021 г.). «Новые ограничения по всей стране с 20 марта по 9 апреля» . pap.pl (на польском языке). Польское агентство печати . Проверено 17 марта 2021 г.
  145. ^ Петр Каллалас (2 марта 2021 г.). « Британский вариант коронавируса может доминировать в Померании». trojmiasto.pl (на польском языке) . Проверено 17 марта 2021 г.
  146. ^ «Коронавирус. Британский вариант в Великой Польше. Последние данные» [Коронавирус. Британский вариант в Великой Польше. Последняя дата]. Onet.pl (на польском языке). 17 марта 2021 г. Проверено 17 марта 2021 г.
  147. ^ Финский институт здравоохранения и социального обеспечения, TLH (17 февраля 2021 г.). «Продолжение гибридной стратегии в связи с эпидемией COVID-19: отдельный обзор, другая тема ( Продолжение гибридной стратегии в отношении эпидемии COVID-19: отдельный обзор, другая тема (Наблюдение за мутировавшим коронавирусом 17.02.2021) )] (на шведском языке). Архивировано из оригинала 14 июля 2021 года . Проверено 2 марта 2021 г.
  148. ^ «Британский вариант Covid распространяется в Финляндии» . Юле. 14 февраля 2021 г. Проверено 2 марта 2021 г.
  149. ^ Елена Чирич (4 марта 2021 г.). «COVID-19 в Исландии: южноафриканский вариант обнаружен на границе» . Обзор Исландии . Проверено 13 марта 2021 г.
  150. ^ Вашингтон, Н.Л., Гангварапу К. и др. (7 февраля 2021 г.). «Геномная эпидемиология определяет появление и быструю передачу SARS-CoV-2 B.1.1.7 в Соединенных Штатах». medRxiv   10.1101/2021.02.06.21251159v1 .
  151. ^ CDC (28 марта 2020 г.). «Отслеживание данных о COVID» . Центры по контролю и профилактике заболеваний . Проверено 30 апреля 2021 г.
  152. ^ Галлоуэй С.Е., Пол П. и др. (22 января 2021 г.). «Появление SARS-CoV-2 B.1.1.7 Lineage — США, 29 декабря 2020 г. – 12 января 2021 г.» . Еженедельный отчет о заболеваемости и смертности . 70 (3): 95–99. doi : 10.15585/mmwr.mm7003e2 . ПМЦ   7821772 . ПМИД   33476315 .
  153. ^ «Еще больше загадок Ковида» . Нью-Йорк Таймс . 30 июля 2021 г.
  154. ^ Азиз, Саба (27 декабря 2020 г.). «Канада сообщает о первых случаях британского варианта коронавируса. Вот что вам нужно знать» . Глобальные новости . Проверено 14 февраля 2021 г.
  155. ^ Томпсон, Николь (13 февраля 2021 г.). «Заразный вариант COVID-19 сейчас выявлен во всех 10 провинциях» . Звездный Феникс . Канадская пресса . Проверено 14 февраля 2021 г.
  156. ^ Jump up to: а б «Почему в Альберте выявлено больше вариантов случаев, но считается, что они более распространены в Онтарио | CBC News» . ЦБК . Проверено 1 апреля 2021 г.
  157. ^ «Вызывающие опасения варианты SARS-CoV-2» (PDF) . Службы здравоохранения Альберты .
  158. ^ «Варианты, вызывающие обеспокоенность (VOC) в Канаде» . Правительство Канады. 19 апреля 2020 г. Проверено 24 марта 2021 г.
  159. ^ «Вызывающие опасения варианты SARS-CoV-2: результаты точечного исследования распространенности» (PDF) . Общественное здравоохранение Онтарио. 12 февраля 2021 г. Проверено 13 марта 2021 г.
  160. ^ Барбара Яффе (16 февраля 2021 г.). «Коронавирус: представитель здравоохранения Онтарио говорит, что примерно 7% проверенных случаев связаны с вариантами заболевания в провинции» . Глобальные новости . Проверено 13 марта 2021 г.
  161. ^ «Информационная панель Онтарио: разоблачение новых вариантов проблем» . Научная консультативная таблица Онтарио по COVID-19. 16 марта 2021 года. Архивировано из оригинала 17 марта 2021 года . Проверено 16 марта 2021 г.
  162. ^ Калина Лафрамбуаз (17 февраля 2021 г.). «Более заразный вариант COVID-19 может стать доминирующим штаммом в Монреале к марту: INSPQ» . Глобальные новости . Проверено 13 марта 2021 г.
  163. ^ Общественное здравоохранение Англии (11 марта 2021 г.). «Исследование вызывающих беспокойство вариантов SARS-CoV-2 в Англии: Технический брифинг 7» (PDF) . Еженедельное количество и доля случаев COVID-19 в Англии по компоненту 2 с SGTF (рис. 10) . Проверено 12 марта 2021 г.
  164. ^ Общественное здравоохранение Англии (13 февраля 2021 г.). «Исследование вызывающих беспокойство вариантов SARS-CoV-2 в Англии: Технический брифинг 6» (PDF) . Процент последовательностей Δ69-70 компонента 2, которые являются VOC 202012/01 (таблица 7), со значением 100% с 4-й недели 2021 года . Проверено 14 февраля 2021 г.
  165. ^ Jump up to: а б с Общественное здравоохранение Англии (19 марта 2021 г.). «Набор данных: Исследование инфекции, вызванной коронавирусом (COVID-19)» . Таблица 6А: Значения процента и порога цикла (Ct) случаев COVID-19, Великобритания. Таблица 6C: Новый вариант для Великобритании, совместимый, несовместимый с новым вариантом для Великобритании, и уровень вируса слишком низкий, чтобы вариант мог быть идентифицируемым положительным, смоделированные ежедневные оценки, Великобритания . Проверено 19 марта 2021 г. Эта статья содержит текст, лицензированный OGL. Эта статья включает текст, опубликованный в соответствии с Британской лицензией открытого правительства v3.0:
  166. ^ Jump up to: а б с Общественное здравоохранение Англии (19 марта 2021 г.). «Обследование инфекции коронавируса (COVID-19), Великобритания: 19 марта 2021 г.» . Проверено 19 марта 2021 г. Эта статья содержит текст, лицензированный OGL. Эта статья включает текст, опубликованный в соответствии с Британской лицензией открытого правительства v3.0:
  167. ^ Идо Эфрети (12 января 2021 г.). «Коронавирус в прямом эфире: в Израиле наблюдается снижение числа инфекций через 14 дней после первой дозы вакцины (16:50 Мутация составляет до 20% недавних случаев заражения COVID-19 в Израиле)» . Гаарец . Проверено 26 февраля 2021 г.
  168. ^ «Высокопоставленный чиновник здравоохранения: Вариант вируса в Великобритании подвергает беременных женщин большему риску» . www.timesofisrael.com . 21 января 2021 г. Проверено 23 января 2021 г.
  169. ^ Стюарт Винер (25 января 2021 г.). «Руководители здравоохранения: британский вариант разрастается, поражая детей с тревожной скоростью» . Времена Израиля . Проверено 25 февраля 2021 г.
  170. ^ Мааян Любель; Ари Рабинович (9 февраля 2021 г.). «Вакцина против варианта: многообещающие данные в гонке Израиля за победу над пандемией» . Рейтер . Проверено 26 февраля 2021 г.
  171. ^ Folkehelseinstituttet (24 февраля 2021 г.). «COVID-19 Ukerapport – uke 7, onsdag 24 февраля 2021 г.» [еженедельный отчет о COVID-19 за 7 неделю (среда, 24 февраля 2021 г.)] (PDF) (на норвежском языке). Архивировано из оригинала (PDF) 6 мая 2021 года . Проверено 28 февраля 2021 г.
  172. ^ Общественное здравоохранение Франции (18 февраля 2021 г.). «COVID-19: Еженедельное эпидемиологическое обновление от 18 февраля 2021 г.» [COVID-19: Еженедельное эпидемиологическое обновление от 18 февраля 2021 г.] (на французском языке) . Проверено 20 февраля 2021 г.
  173. ^ Jump up to: а б Общественное здравоохранение Франции (25 февраля 2021 г.). «COVID-19: Еженедельное эпидемиологическое обновление от 25 февраля 2021 г.» [COVID-19: Еженедельное эпидемиологическое обновление от 25 февраля 2021 г.] (на французском языке) . Проверено 26 февраля 2021 г.
  174. ^ «Случайные образцы указывают на увеличение распространения британского варианта вируса в Швеции» [Случайные образцы указывают на увеличение распространения британского варианта вируса в Швеции] (на шведском языке). Управление общественного здравоохранения . 2 февраля 2021 г. Архивировано из оригинала 12 мая 2021 г. Проверено 2 февраля 2021 г.
  175. ^ Jump up to: а б с Хеликс. «Панель мониторинга Helix® COVID-19» . Тенденции нарушения целевых показателей S-гена (SGTF), интерактивная карта данных: B.1.1.7 еженедельная доля, рассчитанная как среднее значение дневных B.1.1.7 долей за неделю. Ежедневные доли B.1.1.7 определяются путем умножения «Ежедневного процента SGTF положительных образцов» и «B.1.1.7 как % секвенированных положительных SGTF» . Проверено 17 марта 2021 г.
  176. ^ Jump up to: а б «Отслеживание вариантов: ВУИ202012/01 GR/501Y.V1 (Б.1.1.7)» . ГИСАИД . Проверено 19 февраля 2021 г.
  177. ^ Jump up to: а б Хенли, Джон; Джонс, Сэм; Джуффрида, Анджела; Холмс, Оливер (20 декабря 2020 г.). «ЕС проведет кризисные переговоры, поскольку страны блокируют поездки из Великобритании из-за нового штамма Covid» . Хранитель .
  178. ^ Хоуп, Алан (20 декабря 2020 г.). «Нидерланды запрещают полеты из Великобритании из-за новой мутации Covid» . Брюссель Таймс .
  179. ^ «Коронавирус, у одного человека в Италии положительный результат на английский вариант». la Repubblica (на итальянском языке). 20 декабря 2020 г.
  180. ^ Келланд, Кейт (21 декабря 2020 г.). «Объяснитель: новый вариант коронавируса в Британии: насколько он тревожен?» . Рейтер .
  181. ^ Сквайрс, Ник; Оранж, Ричард (21 декабря 2020 г.). «Новый штамм коронавируса обнаружен по всему миру, от Гибралтара до Австралии» . Телеграф . Архивировано из оригинала 11 января 2022 года.
  182. ^ «Сингапур подтверждает первый случай заражения новым штаммом Covid-19 из Великобритании, у 17-летнего студента, недавно вернувшегося из Британии» . «Стрейтс Таймс» . 23 декабря 2020 г. Проверено 24 декабря 2020 г.
  183. ^ «Израиль подтверждает четыре случая нового варианта Covid» . Хранитель . 23 декабря 2020 г.
  184. ^ Мориарти, Джерри (23 декабря 2020 г.). «Первый случай британского варианта штамма Covid-19 подтвержден в Северной Ирландии» . Ирландские Таймс . Проверено 24 декабря 2020 г.
  185. ^ Бургер, Людвиг (24 декабря 2020 г.). «Германия сообщает о первом случае распространения варианта коронавируса в Британии» . Рейтер .
  186. ^ «COVID-19: Новый вариант коронавируса обнаружен в двух образцах в Швейцарии» (на французском языке). Федеральное управление общественного здравоохранения (Швейцария). 24 декабря 2020 г.
  187. ^ Молони, Эоган (25 декабря 2020 г.). «Новый британский вариант Covid-19 подтвержден в Ирландии, подтверждено 1025 новых случаев и еще две смерти» . Ирландская независимая газета . Проверено 25 декабря 2020 г.
  188. ^ Грэм-Харрисон, Эмма (25 декабря 2020 г.). «Япония сообщает о пяти случаях варианта коронавируса, обнаруженного в Великобритании» . Хранитель .
  189. ^ «Онтарио выявил первые случаи британского варианта COVID-19 в провинции» . Канадская радиовещательная корпорация ( CBC News ) . 26 декабря 2020 г.
  190. ^ «Коронавирус: в Европе обнаружено больше случаев нового варианта Covid» . Би-би-си. 26 декабря 2020 г. Проверено 26 декабря 2020 г.
  191. ^ «Франция и Ливан подтверждают первые случаи нового варианта коронавируса» . Альджазира. 26 декабря 2020 г. Проверено 26 декабря 2020 г.
  192. ^ «Случаи британского варианта вируса обнаружены в Швеции» (на шведском языке). СВТ. 26 декабря 2020 г.
  193. ^ «Норвегия и Португалия подтверждают первые случаи варианта коронавируса у путешественников из Великобритании» . Ньюшуб. 27 декабря 2020 года. Архивировано из оригинала 30 декабря 2020 года . Проверено 28 декабря 2020 г.
  194. ^ «В Иордании выявлено два варианта заболевания коронавирусом: министр» . Новости Персидского залива . 27 декабря 2020 г. Проверено 28 декабря 2020 г.
  195. ^ «Новый британский вариант штамма Covid обнаружен в Финляндии» . Юле Новости. 28 декабря 2020 г.
  196. ^ «Южная Корея сообщает о случаях варианта COVID и говорит, что они прибыли из Великобритании» . Небесные новости. 28 декабря 2020 г.
  197. ^ "В Чили зафиксирован первый случай британского варианта коронавируса - минздрав" . Рейтер . 29 декабря 2020 г.
  198. ^ «Коронавирус: Индия подтверждает шесть случаев нового варианта Covid» . Новости Би-би-си. 29 декабря 2020 г.
  199. ^ «Первый подтвержденный случай нового штамма Covid-19 обнаружен в Пакистане» . Индостан Таймс. 29 декабря 2020 г.
  200. ^ «Новый штамм Covid в ОАЭ: все, что мы знаем на данный момент» . Халидж Таймс. 30 декабря 2020 г.
  201. ^ «Тайвань сообщает о первом случае мутантного штамма Covid-19, обнаруженного в Великобритании» . Южно-Китайская Морнинг Пост. 30 декабря 2020 г.
  202. ^ «Китай подтверждает первый случай британского варианта коронавируса» . Франция24. 31 декабря 2020 г.
  203. ^ «В Бразилии выявлено два случая нового варианта коронавируса, обнаруженного в Великобритании» . Рейтер . 31 декабря 2020 г.
  204. ^ Кнудсен, TH (20 декабря 2020 г.). «Датский профессор Оксфорда: Дания должна сделать все, чтобы гарантировать, что новый вариант вируса не распространится» [Датский профессор Оксфорда: Дания должна сделать все, чтобы гарантировать, что новый вариант вируса не распространится] (на датском языке). ДР .
    См. также: «Глобальный охват секвенирования» . covidcg.org . Проверено 23 декабря 2020 г.
  205. ^ Мандавилли, Апурва; Ландлер, Марк; Касл, Стивен (20 декабря 2020 г.). «Ученые призывают сохранять спокойствие в отношении мутаций коронавируса, которые не являются неожиданными» . Нью-Йорк Таймс .
  206. ^ Казиано, Луи (29 декабря 2020 г.). «Руководители здравоохранения Колорадо подтверждают новый вариант COVID-19 в штате» . Фокс Ньюс . Проверено 29 декабря 2020 г. .
  207. ^ Недельман, Майкл (6 января 2021 г.). «CDC обнаружил в США более 50 случаев варианта коронавируса, впервые выявленного в Великобритании» . CNN . Проверено 7 января 2021 г.
  208. ^ Рейманн, Николас (8 января 2021 г.). « Близко к наихудшему сценарию» — бывший директор Центра по контролю и профилактике заболеваний (CDC) высказывает «ужасающие» прогнозы по поводу нового штамма Covid» . Форбс . Проверено 15 января 2021 г.
  209. ^ «Последние новости... Министр Коджа объявил: мутировавший вирус у 15 человек! Въезд из Англии полностью прекращен» [Последние новости... Министр Коджа объявил, мутировавший вирус у 15 человек! Заявки из Великобритании полностью приостановлены] (Видео) . CNN Турк . Проверено 4 января 2021 г.
  210. ^ «SSI: Очень заразная коронная мутация [ так в оригинале ] из Англии распространяется в Дании] ДР (на датском языке). января 2 Получено 3 января.
  211. ^ «Udvikling i smitte med engelskvirusvariant of SARS-COV-2 (кластер B.1.1.7)» [Развитие при заражении английским вирусным вариантом SARS-COV-2 (кластер B.1.1.7)] (PDF) (в датский). Статенский институт сывороток. 1 января 2021 года . Проверено 2 января 2021 г.
  212. ^ «Статус развития B.1.1.7 в Дании от 17 января 2021 г.» [Статус развития B.1.1.7 в Дании на 17 января 2021 г.]. Статенский институт сывороток. Архивировано из оригинала 18 января 2021 года . Проверено 19 января 2021 г.
  213. ^ «Вьетнам сообщает о первом случае нового варианта коронавируса у женщины, вернувшейся из Великобритании» . Телеграф . 2 января 2021 года. Архивировано из оригинала 11 января 2022 года . Проверено 2 января 2021 г.
  214. ^ «Новый штамм Covid-19 обнаружен в Люксембурге» . luxtimes.lu . Архивировано из оригинала 22 февраля 2021 года . Проверено 4 января 2021 г.
  215. ^ «В Греции выявлено четыре случая нового варианта коронавируса» . Рейтер . 3 января 2021 г.
  216. ^ «На Ямайке подтверждено четыре случая варианта COVID-19» . 3 января 2021 года. Архивировано из оригинала 3 января 2021 года . Проверено 22 января 2021 г.
  217. ^ Тернер, Кэти. «Коронавирус: новый, быстро распространяющийся британский вариант обнаружен на Кипре | Почта Кипра» . Проверено 4 января 2021 г.
  218. ^ «В шести случаях на границе Новой Зеландии был выявлен новый вариант Covid-19, всего 19 случаев за последние три дня» . ТВНЗ . Проверено 4 января 2021 г.
  219. ^ Тайгер (3 января 2021 г.). «Британцы, прибывающие в Таиланд, дали положительный результат на британский вариант Covid» . Тайгер . Проверено 4 января 2021 г.
  220. ^ «В Грузии подтвержден первый случай заражения штаммом коронавируса, связанного с Великобританией» . 4 января 2021 г.
  221. ^ «Мутации британского и южноафриканского корорнавирусов [ sic ] обнаружены в Австрии» . Рейтер . Берлин. 4 января 2021 г. Проверено 6 января 2021 г.
  222. ^ «Иран подтверждает первый случай нового варианта Covid-19» . Франция 24 . Тегеран . 5 января 2021 г. Проверено 6 января 2021 г.
  223. ^ «Оман зарегистрировал первый случай нового варианта вируса у путешественника из Великобритании» . Рейтер . Дубай. 5 января 2021 г. Проверено 6 января 2021 г.
  224. ^ «Случаи нового британского варианта коронавируса подтверждены в Словакии» . Expats.cz. 5 января 2021 г.
  225. ^ «В Румынии выявлен первый случай британского варианта коронавируса» . Рейтер . 8 января 2021 г.
  226. ^ «Перу подтверждает первый случай варианта штамма COVID-19» . 9 января 2021 г.
  227. ^ Мексика обнаруживает первый случай нового штамма коронавируса, впервые обнаруженного в Великобритании , 11 января 2021 г. www.business-standard.com , по состоянию на 15 января 2021 г.
  228. ^ «Британский вариант Covid-19 достиг Малайзии, - подтверждает доктор Нур Хишам» . Малайская почта . 11 января 2021 г.
  229. ^ «В Латвии обнаружен новый вариант Covid-19» . Балтийская новостная сеть. 4 января 2021 г.
  230. ^ «В Эквадоре зафиксирован первый случай нового варианта коронавируса» . 12 января 2021 г.
  231. ^ «ЖИВЫЕ ОБНОВЛЕНИЯ: пандемия COVID-19» . CNN Филиппины . 13 января 2021 года. Архивировано из оригинала 21 ноября 2021 года . Проверено 15 января 2021 г.
  232. ^ «В Венгрии обнаружен британский вариант коронавируса, - сообщил главный хирург» . Рейтер . 13 января 2021 г.
  233. ^ «В Гамбии зафиксированы первые два случая британского варианта COVID-19» . Рейтер . 14 января 2021 г.
  234. ^ «Подтверждено, что новый штамм COVID-19 прибыл в Доминиканскую Республику из Лондона» . 15 января 2021 г.
  235. ^ «В Аргентине обнаружен первый случай британского варианта вируса» . МедикалЭкспресс. 16 января 2021 г.
  236. ^ «ОБНОВЛЕНИЕ 1. В Чехии обнаружен вариант коронавируса в Великобритании, поэтому необходимо сохранить меры по локализации» . Рейтер . 18 января 2021 г.
  237. ^ «Кувейт и Марокко сообщают о первых случаях британского варианта коронавируса» . Арабский еженедельник. 19 января 2021 г.
  238. ^ «COVID-19: варианты Великобритании и Южной Африки обнаружены в Гане - старший научный сотрудник» . СтаррФМ . 19 января 2021 г. Проверено 12 февраля 2021 г.
  239. ^ «Кувейт зарегистрировал первые случаи нового варианта вируса» . Рейтер . 19 января 2021 г.
  240. ^ Адебовале, Nike (25 января 2021 г.). «Обновлено: вариант COVID-19, вызывающий беспокойство в Великобритании, обнаружен в Нигерии – официально» . Премиум Таймс . Проверено 29 января 2021 г.
  241. ^ «ОБНОВЛЕНИЕ 1 – Сенегал подтверждает наличие британского варианта коронавируса» . Рейтер . 28 января 2021 г.
  242. ^ «Муниципалитет проверит 60 000 жителей на наличие британского штамма коронавируса» . Голландские новости . 11 января 2021 г. Проверено 12 января 2021 г.
  243. ^ Трондур Олсен (24 января 2021 г.). «Штамм британского Covid подтвержден на Фарерских островах» . Радио Фарерских островов . Проверено 25 марта 2021 г.
  244. ^ «Северная Македония сообщает о первом случае британского варианта коронавируса» . Рейтер . 28 января 2021 г.
  245. ^ «Обнаружен британский вариант вируса SARS-CoV-2 в Уругвае» (на испанском языке). 4 февраля 2021 г.
  246. ^ Telegram.hr. "Первые три случая британского штамма коронавируса подтверждены в Хорватии" . Telegram.hr (на хорватском языке) . Проверено 10 февраля 2021 г.
  247. ^ «Великобританский штамм COVID обнаружен в Шри-Ланке - доктор Чандима Джевандара» . Новости Шри-Ланки — Newsfirst . 12 февраля 2021 г. Проверено 12 февраля 2021 г.
  248. ^ «Вариант коронавируса снова помещает NL в карантин; личное голосование приостановлено» . Новости ЦБК . Проверено 13 февраля 2021 г.
  249. ^ «Министр здравоохранения заявил, что два случая мутации британской короны произошли из Саудовской Аравии» . CNN Индонезия (на индонезийском языке). 2 марта 2021 г. Проверено 8 марта 2021 г.
  250. ^ В Тунисе зарегистрированы первые случаи британского варианта - как это произошло 2 марта 2021 г. www.theguardian.com , по состоянию на 3 марта 2021 г.
  251. ^ «Covid-19: английский вариант обнаружен в Кот-д'Ивуаре (Министерство здравоохранения)» . Educarriere.ci . 25 марта 2021 г. . Проверено 9 апреля 2021 г.
  252. ^ Jump up to: а б с «Экспертная реакция на новые ограничения и новый вариант SARS-CoV-2» . Научный медиацентр . 21 декабря 2020 г. Проверено 21 декабря 2020 г. . Доктор Джулиан Тан, почетный доцент/клинический вирусолог Университета Лестера, сказал: «Изучение глобальной базы данных последовательностей GISAID SARS-COV-2 показывает, что эта мутация N501Y на самом деле спорадически циркулировала гораздо раньше в этом году за пределами Великобритании. : в Австралии в июне–июле, в США в июле и в Бразилии в апреле 2020 года».
  253. ^ Глобальный отчет B.1.351 (Отчет). cov-lineages.org. 10 марта 2021 г. Проверено 10 марта 2021 г.
  254. ^ Тегалли Х., Уилкинсон Э. и др. (22 декабря 2020 г.). «Появление и быстрое распространение новой линии коронавируса 2, связанного с тяжелым острым респираторным синдромом (SARS-CoV-2), с множественными шиповыми мутациями в Южной Африке». medRxiv   10.1101/2020.21.12.20248640 .
  255. ^ Глобальный отчет P.1 (Отчет). cov-lineages.org. 11 марта 2021 г. Проверено 11 марта 2021 г.
  256. ^ Нуно Р. Фариа; и др. (12 января 2021 г.). «Геномная характеристика новой линии SARS-CoV-2 в Манаусе: предварительные результаты» . Вирусологический.org . Проверено 11 марта 2021 г.
  257. ^ «GISAID – варианты hCov19» . www.gisaid.org . Проверено 13 августа 2021 г.
  258. ^ «Отслеживание вариантов нового коронавируса в Канаде» . Новости КТВ . 4 февраля 2021 г. Проверено 13 августа 2021 г.
  259. ^ «Обновление ситуации с коронавирусом - Варианты коронавируса» . Финский институт здравоохранения и социального обеспечения . 11 августа 2021 г. Проверено 11 августа 2021 г. Альфа-вариант: 7953
  260. ^ Чанд, Мира; Хопкинс, Сьюзен; Дабрера, Гэвин; Ачисон, Кристина; Барклай, Венди; Фергюсон, Нил; и др. (21 декабря 2020 г.). Исследование нового варианта SARS-COV-2: вызывающий беспокойство вариант 202012/01 (PDF) (отчет). Общественное здравоохранение Англии . п. 2 . Получено 22 декабря. Эта статья содержит текст, лицензированный OGL. Эта статья включает текст, опубликованный в соответствии с Британской лицензией открытого правительства v3.0:
  261. ^ Грабовски, Фредерик; Прейбиш, Гжегож; Гизинский, Станислав; Кочанчик, Марек; Липняцкий, Томаш (март 2021 г.). «Вызывающий интерес вариант SARS-CoV-2 202012/01 обладает примерно двукратным репликативным преимуществом и приобретает мутации» . Вирусы . 13 (3): 392. дои : 10.3390/v13030392 . ПМЦ   8000749 . ПМИД   33804556 .
  262. ^ «Влияние мутации 69-70del в белке-шипе SARS-CoV-2 на комбинированный набор TaqPath COVID-19» (PDF) . Термо Фишер Сайентифик . Проверено 13 февраля 2021 г.
  263. ^ Доктор Андреа Торн: Новая мутация SARS-CoV-2 Insidecorona.net , по состоянию на 7 февраля 2021 г.
  264. ^ «Отчет 42 — Передача SARS-CoV-2 линии B.1.1.7 в Англии: выводы из связи эпидемиологических и генетических данных» . Имперский колледж Лондона . Проверено 26 марта 2021 г.
  265. ^ «Новый вариант коронавируса: что мы знаем?» . Новости Би-би-си . 20 декабря 2020 г. Проверено 22 декабря 2020 г.
  266. ^ Эллиатт, Холли (11 февраля 2021 г.). «Вариант британского коронавируса на пути к тому, чтобы «охватить весь мир», — говорит ведущий учёный» . CNBC . Проверено 26 марта 2021 г.
  267. ^ «Возвращение к полной изоляции может оказаться недостаточным для контроля над новым вариантом Covid, — предупреждает Сейдж» . Независимый . 31 декабря 2020 г. Проверено 31 декабря 2020 г.
  268. ^ «Covid-19: рождественские правила ужесточаются для Англии, Шотландии и Уэльса» . Новости Би-би-си . 20 декабря 2020 г. Проверено 20 декабря 2020 г.
  269. ^ Фэрни, Роберт (19 декабря 2020 г.). «Путешествие между Шотландией и остальной частью Великобритании запрещено на Рождество, поскольку граница закрыта» . Эдинбурглайв . Проверено 20 декабря 2020 г.
  270. ^ Jump up to: а б Холлидей, Джош (21 декабря 2020 г.). «Призывы к общенациональному карантину в Англии, чтобы сдержать распространение нового штамма Covid» . Хранитель .
  271. ^ Хенли, Джон; Джонс, Сэм; Джуффрида, Анджела; Холмс, Оливер (20 декабря 2020 г.). «ЕС проведет кризисные переговоры, поскольку страны блокируют поездки из Великобритании из-за нового штамма Covid» . Хранитель .
  272. ^ Майклс, Дэниел (20 декабря 2020 г.). «Страны запрещают поездки из Великобритании в гонке за блокировку нового штамма Covid-19» . ВСЖ .
  273. ^ «После закрытия границы очередь грузовиков в Кенте сократилась до 60 машин» . www.bbc.co.uk. ​29 декабря 2020 г. Проверено 30 декабря 2020 г.
  274. ^ ГРИШАБЕР, КИРСТЕН; ХУЙ, СИЛЬВИЯ (21 декабря 2020 г.). «Больше стран ЕС запрещают поездки из Великобритании, опасаясь вирусного варианта» . АП НОВОСТИ .
  275. ^ Бергер, Мириам (20 декабря 2020 г.). «Страны по всей Европе прекращают полеты из Великобритании из-за опасений по поводу мутации коронавируса» . Вашингтон Пост . ISSN   0190-8286 . Архивировано из оригинала 20 декабря 2020 года . Проверено 20 декабря 2020 г.
  276. ^ Куинн, Эдна Мохамед (сейчас) Бен; Дэвис (ранее), Кэролайн; Дэвидсон, Хелен; Уолквист (ранее), Калла; Уокер, Шон (20 декабря 2020 г.). «Случаи заражения новым штаммом зарегистрированы за пределами Великобритании – как это произошло» . Хранитель . ISSN   0261-3077 . Проверено 21 декабря 2020 г. .
  277. ^ «Covid-19: Изоляция Великобритании растет по мере того, как все больше стран запрещают поездки» . Новости Би-би-си . 21 декабря 2020 г.
  278. ^ Огура, Джунко. «Япония запретит въезд иностранным гражданам после обнаружения в стране варианта Covid-19» . CNN . Проверено 27 декабря 2020 г.
  279. ^ «В Калифорнии зарегистрирован второй подтвержденный случай варианта вируса в стране» . АП НОВОСТИ . 30 декабря 2020 г. Проверено 3 января 2021 г.
  280. ^ Маллапати, Смрити (22 декабря 2020 г.). «Что говорят данные о закрытии границ и распространении COVID» . Природа . 589 (7841): 185. дои : 10.1038/d41586-020-03605-6 . ПМИД   33361805 . S2CID   229692296 .
  281. ^ «COVID-19: «Дельта приводит к исчезновению других вариантов коронавируса» — но что это значит для Великобритании?» . Небесные новости . Проверено 17 августа 2022 г.
  282. ^ Рэйчел Реттнер (23 марта 2022 г.). «Варианты коронавируса: факты об омикроне, дельте и других мутантах COVID-19» . www.livscience.com . Проверено 17 августа 2022 г.
  283. ^ «Великобритания сообщает о новом варианте под названием VUI 202012/01» . ГИСАИД. Архивировано из оригинала 20 декабря 2020 года . Проверено 20 декабря 2020 г.
  284. ^ Краткий обзор угрозы: Быстрое увеличение количества варианта SARS-CoV-2 с множественными мутациями белка-шипа наблюдалось в Соединенном Королевстве (PDF) (Отчет). Европейский центр профилактики и контроля заболеваний (ECDC). 20 декабря 2020 г.
[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: f8414a49ac1d3739a45770f4b4219666__1711917960
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/f8/66/f8414a49ac1d3739a45770f4b4219666.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
SARS-CoV-2 Alpha variant - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)