КооА
CooA представляет собой фактор гемсодержащий транскрипции , который реагирует на присутствие монооксида углерода . Этот белок образует гомодимеры и является гомологом белка рецептора цАМФ . [ 1 ] CooA регулирует экспрессию дегидрогеназы монооксида углерода , фермента, который катализирует окисление CO до CO 2 . Наиболее хорошо изученный гомолог CooA происходит от Rhodospirillum rubrum ( RrCooA), гомолог CooA от Carboxydothermus Hydrogenoformans ( Ch CooA). но также был изучен [ 2 ] Основное различие между этими двумя гомологами CooA заключается в координации гема железа. Для Rr CooA трехвалентное гемовое железо связано с цистеином и амином N-концевого пролина, тогда как в двухвалентном состоянии происходит переключение лиганда, когда близлежащий гистидин замещает тиолат. [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] В случае Ch CooA железо гема лигируется гистидином и N-концевым амином как в трехвалентном, так и в двухвалентном состояниях. [ 6 ] Для обоих гомологов CO замещает аминный лиганд и активирует связывание белка с целевой последовательностью ДНК. [ 7 ] [ 8 ] Существует несколько структур CooA: RrCooA в двухвалентном состоянии (1FT9), [ 9 ] ChCooA в двухвалентном имидазол-связанном состоянии (2FMY), [ 10 ] и ChCooA в двухвалентном состоянии, связанном с CO (2HKX). [ 11 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Х. Кёрнер; HJ София; РГ Цумфт (2003). «Филогения бактериального суперсемейства регуляторов транскрипции Crp-Fnr: использование метаболического спектра путем контроля альтернативных генных программ» . Обзоры микробиологии FEMS . 27 (5): 559–592. дои : 10.1016/S0168-6445(03)00066-4 . ПМИД 14638413 .
- ^ Т. Симидзу; Д. Хуан; Ф. Ян; М. Странава; М. Бартосова; В. Фойтикова; М. Мартинкова (2015). «Газообразные O2, NO и CO в передаче сигнала: структурные и функциональные взаимосвязи датчиков газа на основе гема и датчиков гем-окислительно-восстановительного потенциала». хим. Преподобный . 115 (13): 6491–6533. doi : 10.1021/acs.chemrev.5b00018 . ПМИД 26021768 .
- ^ Шелвер, Дэниел; Торстейнссон, Марк В.; Керби, Роберт Л.; Чунг, Су Ёль; Робертс, Гэри П.; Рейнольдс, Марк Ф.; Паркс, Райан Б.; Берстин, Джудит Н. (1 марта 1999 г.). «Идентификация двух важных остатков гема (цистеин 75 и гистидин 77) в CooA, CO-сенсорном транскрипционном факторе Rhodospirillum rubrum» . Биохимия . 38 (9): 2669–2678. дои : 10.1021/bi982658j . ISSN 0006-2960 . ПМИД 10052937 .
- ^ Дхаван, Иш К.; Шелвер, Дэниел; Торстейнссон, Марк В.; Робертс, Гэри П.; Джонсон, Майкл К. (1 сентября 1999 г.). «Исследование аксиального лигирования гема в CO-сенсорном белке CooA с помощью спектроскопии магнитного кругового дихроизма» . Биохимия . 38 (39): 12805–12813. дои : 10.1021/bi991303c . ISSN 0006-2960 . ПМИД 10504250 .
- ^ Кларк, Роберт В.; Юн, Хван; Паркс, Райан Б.; Черный, Мелиса М.; Робертс, Гэри П.; Берстин, Джудит Н. (1 ноября 2004 г.). «Исследование роли N-концевого пролина, дистального лиганда гема в сенсоре CO CooA» . Биохимия . 43 (44): 14149–14160. дои : 10.1021/bi0487948 . ISSN 0006-2960 . ПМИД 15518565 .
- ^ Инагаки, Саяка; Масуда, Чиаки; Акаиси, Тецухиро; Накадзима, Хироши; Ёсиока, Сиро; Охта, Такехиро; Пал, Бисваджит; Китагава, Тейдзо; Аоно, Сигетоши (февраль 2005 г.). «Спектроскопические и окислительно-восстановительные свойства гомолога CooA Carboxydothermus Hydrogenoformans» . Журнал биологической химии . 280 (5): 3269–3274. дои : 10.1074/jbc.m409884200 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 15537640 .
- ^ ГП Робертс; Р. Л. Керби; Х. Юн; М. Конрад (2005). «CooA, парадигма регуляторных белков, чувствительных к газу». Дж. Неорг. Биохим . 99 (1): 280–92. дои : 10.1016/j.jinorgbio.2004.10.032 . ПМИД 15598507 .
- ^ Сигетоши Аоно (2003). «Биохимические и биофизические свойства CO-сенсорного активатора транскрипции CooA». Акк. хим. Рез . 36 (11): 825–31. дои : 10.1021/ar020097p . ПМИД 14622029 .
- ^ Ланзилотта, Уильям Н.; Шуллер, Дэвид Дж.; Торстейнссон, Марк В.; Керби, Роберт Л.; Робертс, Гэри П.; Пулос, Томас Л. (октябрь 2000 г.). «Структура COo-чувствительного активатора транскрипции CooA» . Структурная биология природы . 7 (10): 876–880. дои : 10.1038/82820 . ISSN 1545-9985 . ПМИД 11017196 . S2CID 26285016 .
- ^ Комори, Хирофуми; Инагаки, Саяка; Ёсиока, Сиро; Аоно, Сигетоши; Хигучи, Йошики (30 марта 2007 г.). «Кристаллическая структура CO-сенсорного активатора транскрипции CooA, связанного с экзогенным лигандом имидазолом» . Журнал молекулярной биологии . 367 (3): 864–871. дои : 10.1016/j.jmb.2007.01.043 . ISSN 0022-2836 . ПМИД 17292914 .
- ^ Борджигин, М.; Ли, Х.; Ланц, Северная Дакота; Керби, РЛ; Робертс, врач общей практики; Пулос, ТЛ (1 марта 2007 г.). «Структурная гипотеза активации CO-чувствительного транскрипционного фактора CooA» . Acta Crystallographica Раздел D: Биологическая кристаллография . 63 (3): 282–287. Бибкод : 2007AcCrD..63..282B . дои : 10.1107/S0907444906051638 . ISSN 0907-4449 . ПМИД 17327664 .