Protein found in humans
Транскрипционный фактор 1 пре-В-клеточного лейкоза представляет собой белок , который у человека кодируется PBX1 геном . [ 5 ] Гомологичный белок у дрозофилы известен как экстрадентикул и вызывает изменения в эмбриональном развитии.
Исследования на мышах показывают, что PBX1 участвует в формировании костей и формировании скелета. [ 6 ]
Было показано, что PBX1 взаимодействует с:
Ген Drosophila melangoster , называемый extradenticle, кодирует гомеодоменовый белок, который на 71% похож на белок Pbx1 и считается гомологичным PBX1. [ 14 ] экстрадентикул - гомеодоменный транскрипционный фактор [ 15 ] экспрессируется во время эмбриогенеза и связан с морфологическими изменениями и развитием. [ 14 ]
Снижение уровня экстрадентикул вызывает сегментарные трансформации, не влияя на функциональность или расположение гомеозисных генов. Полное удаление экстрадентикулярных белков как материнских, так и зиготных, приводит к изменениям из-за нарушения экспрессии неэкстрадентикулярных белков. [ 16 ]
Исследование экспрессии белка экстрадентикул в эмбриональном развитии с помощью моноклональных антител показало, что он равномерно распределяется, а также исключается из ядер клеток до гаструляции . На стадии развития ретракции зародышевых полосок экстрадентикулярный белок начинает накапливаться в ядрах клеток по определенному образцу. крыльев и ног В проксимальных областях имагинальных дисков экстрадентикул присутствует в ядре, тогда как в дистальных областях он имеется только в цитоплазме. [ 17 ]
^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000185630 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000052534 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ген Энтреза: гомеобокс 1 пре-В-клеточного лейкоза PBX1» .
^ «PBX1 Гомеобокс PBX 1 [Homo sapiens (человек)] — Ген — NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 11 июня 2023 г.
^ Бертельсен Дж., Заппавинья В., Ферретти Э., Мавилио Ф., Блази Ф. (март 1998 г.). «Новый гомеопротеин Prep1 модулирует кооперативность белков Pbx-Hox» . Журнал ЭМБО . 17 (5): 1434–1445. дои : 10.1093/emboj/17.5.1434 . ПМЦ 1170491 . ПМИД 9482740 .
^ Пайпер Д.Е., Бэтчелор А.Х., Чанг С.П., Клири М.Л., Вольбергер С. (февраль 1999 г.). «Структура гетеродимера HoxB1-Pbx1, связанного с ДНК: роль гексапептида и четвертой гомеодоменовой спирали в образовании комплекса» . Клетка . 96 (4): 587–597. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80662-5 . ПМИД 10052460 . S2CID 16122785 .
^ Чанг С.П., Шен В.Ф., Розенфельд С., Лоуренс Х.Дж., Ларгман С., Клири М.Л. (март 1995 г.). «Белки Pbx демонстрируют гексапептид-зависимое кооперативное связывание ДНК с подмножеством белков Hox» . Гены и развитие . 9 (6): 663–674. дои : 10.1101/gad.9.6.663 . ПМИД 7729685 .
^ Шен В.Ф., Розенфельд С., Квонг А., Кёмвес Л.Г., Лоуренс Х.Дж., Ларгман С. (апрель 1999 г.). «HOXA9 образует тройные комплексы с PBX2 и MEIS1 в миелоидных клетках» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (4): 3051–3061. дои : 10.1128/MCB.19.4.3051 . ПМЦ 84099 . ПМИД 10082572 .
^ Шанмугам К., Грин Северная Каролина, Рамбальди И., Сарагови Х.У., Физерстоун М.С. (ноябрь 1999 г.). «PBX и MEIS как несвязывающиеся с ДНК партнеры в тримерных комплексах с белками HOX» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (11): 7577–7588. дои : 10.1128/MCB.19.11.7577 . ПМЦ 84774 . ПМИД 10523646 .
^ Джейкобс Ю., Шнабель К.А., Клири М.Л. (июль 1999 г.). «Тримерная ассоциация гомеодоменовых белков Hox и TALE опосредует активность энхансера заднего мозга Hoxb2» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (7): 5134–5142. дои : 10.1128/MCB.19.7.5134 . ПМЦ 84356 . ПМИД 10373562 .
^ Зубаир М., Исихара С., Ока С., Окумура К., Морохаши К. (июнь 2006 г.). «Двухэтапная регуляция транскрипции гена Ad4BP/SF-1 во время развития надпочечников плода: инициация комплексом Hox-Pbx1-Prep1 и поддержание посредством ауторегуляции Ad4BP/SF-1» . Молекулярная и клеточная биология . 26 (11): 4111–4121. дои : 10.1128/MCB.00222-06 . ПМК 1489093 . ПМИД 16705164 .
^ Jump up to: а б Рауколб С., Пайфер М., Вишаус Э. (сентябрь 1993 г.). «экстрадентикул, регулятор активности гомеотического гена, является гомологом гомеобокс-содержащего протоонкогена человека pbx1». Клетка . 74 (6): 1101–1112. дои : 10.1016/0092-8674(93)90731-5 . ПМИД 8104703 . S2CID 44721382 .
^ Аспланд SE, Уайт РА (февраль 1997 г.). «Нуклеоцитоплазматическая локализация экстрадентикулярного белка пространственно регулируется на протяжении всего развития у дрозофилы». Разработка . 124 (3): 741–747. дои : 10.1242/dev.124.3.741 . ПМИД 9043089 .
^ Пайфер М., Вишаус Э. (июль 1990 г.). «Мутации в экстрадентикулярном гене дрозофилы влияют на то, как специфические белки гомеодомена регулируют сегментную идентичность» . Гены и развитие . 4 (7): 1209–1223. дои : 10.1101/gad.4.7.1209 . ПМИД 1976570 .
^ «Нуклеоцитоплазматическая локализация экстрадентикулярного белка пространственно регулируется на протяжении всего развития дрозофилы» . Journals.biologies.com . Проверено 6 июня 2023 г.
Саньял М., Тунг Дж.В., Карсунки Х., Зенг Х., Селлери Л., Вайсман И.Л. и др. (май 2007 г.). «Развитие B-клеток прекращается в отсутствие протоонкогена Pbx1» . Кровь . 109 (10): 4191–4199. дои : 10.1182/кровь-2006-10-054213 . ПМЦ 1885499 . ПМИД 17244677 . {{cite journal }}
: CS1 maint: переопределенная настройка ( ссылка )
Хуэй Х, Перфетти Р. (февраль 2002 г.). «Гомеобокс-1 поджелудочной железы двенадцатиперстной кишки регулирует развитие поджелудочной железы во время эмбриогенеза и функцию островковых клеток во взрослом возрасте» . Европейский журнал эндокринологии . 146 (2): 129–141. дои : 10.1530/eje.0.1460129 . ПМИД 11834421 .
Хунгер С.П., Галили Н., Кэрролл А.Дж., Крист В.М., Линк М.П., Клири М.Л. (февраль 1991 г.). «t(1;19)(q23;p13) приводит к последовательному слиянию кодирующих последовательностей E2A и PBX1 при острых лимфобластных лейкозах» . Кровь . 77 (4): 687–693. дои : 10.1182/blood.V77.4.687.687 . ПМИД 1671560 .
Моника К., Галили Н., Нурс Дж., Солтман Д., Клири М.Л. (декабрь 1991 г.). «PBX2 и PBX3, новые гомеобоксные гены с обширной гомологией с человеческим протоонкогеном PBX1» . Молекулярная и клеточная биология . 11 (12): 6149–6157. дои : 10.1128/mcb.11.12.6149 . ПМЦ 361792 . ПМИД 1682799 .
Нурс Дж., Меллентин Дж.Д., Галили Н., Уилкинсон Дж., Стэнбридж Э., Смит С.Д. и др. (февраль 1990 г.). «Хромосомная транслокация t(1;19) приводит к синтезу слитой гомеобоксной мРНК, которая кодирует потенциальный химерный фактор транскрипции» . Клетка . 60 (4): 535–545. дои : 10.1016/0092-8674(90)90657-Z . ПМИД 1967982 . S2CID 7975269 .
Кампс MP, Мурре C, Сан XH, Балтимор D (февраль 1990 г.). «Новый ген гомеобокса вносит вклад в ДНК-связывающий домен транслокационного белка t(1;19) в pre-B ALL». Клетка . 60 (4): 547–555. дои : 10.1016/0092-8674(90)90658-2 . ПМИД 1967983 . S2CID 39661371 .
Лу Кью, Райт Д.Д., член парламента от Кампса (июнь 1994 г.). «Слияние с E2A превращает гомеодоменовый белок Pbx1 в конститутивный активатор транскрипции при лейкозах человека, несущий транслокацию t (1;19)» . Молекулярная и клеточная биология . 14 (6): 3938–3948. дои : 10.1128/mcb.14.6.3938 . ПМК 358760 . ПМИД 7910944 .
Ван Дейк М.А., Вурхув П.М., Мурре С. (июль 1993 г.). «Pbx1 превращается в активатор транскрипции при приобретении N-концевой области E2A при пре-B-клеточном остром лимфобластоидном лейкозе» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 90 (13): 6061–6065. Бибкод : 1993PNAS...90.6061D . дои : 10.1073/pnas.90.13.6061 . ПМК 46867 . ПМИД 8327485 .
Лу Ц, член парламента Кампса (апрель 1996 г.). «Структурные детерминанты внутри Pbx1, которые опосредуют кооперативное связывание ДНК с пентапептидсодержащими белками Hox: предложение модели комплекса Pbx1-Hox-ДНК» . Молекулярная и клеточная биология . 16 (4): 1632–1640. дои : 10.1128/mcb.16.4.1632 . ПМК 231149 . ПМИД 8657138 .
Бертельсен Дж., Заппавинья В., Мавилио Ф., Блази Ф. (март 1998 г.). «Prep1, новый функциональный партнер белков Pbx» . Журнал ЭМБО . 17 (5): 1423–1433. дои : 10.1093/emboj/17.5.1423 . ПМК 1170490 . ПМИД 9482739 .
Бертельсен Дж., Заппавинья В., Ферретти Э., Мавилио Ф., Блази Ф. (март 1998 г.). «Новый гомеопротеин Prep1 модулирует кооперативность белков Pbx-Hox» . Журнал ЭМБО . 17 (5): 1434–1445. дои : 10.1093/emboj/17.5.1434 . ПМЦ 1170491 . ПМИД 9482740 .
Пайпер Д.Е., Бэтчелор А.Х., Чанг С.П., Клири М.Л., Вольбергер С. (февраль 1999 г.). «Структура гетеродимера HoxB1-Pbx1, связанного с ДНК: роль гексапептида и четвертой гомеодоменовой спирали в образовании комплекса» . Клетка . 96 (4): 587–597. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80662-5 . ПМИД 10052460 . S2CID 16122785 .
Шен В.Ф., Розенфельд С., Квонг А., Кёмвес Л.Г., Лоуренс Х.Дж., Ларгман С. (апрель 1999 г.). «HOXA9 образует тройные комплексы с PBX2 и MEIS1 в миелоидных клетках» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (4): 3051–3061. дои : 10.1128/MCB.19.4.3051 . ПМЦ 84099 . ПМИД 10082572 .
Джейкобс Ю., Шнабель К.А., Клири М.Л. (июль 1999 г.). «Тримерная ассоциация гомеодоменовых белков Hox и TALE опосредует активность энхансера заднего мозга Hoxb2» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (7): 5134–5142. дои : 10.1128/MCB.19.7.5134 . ПМЦ 84356 . ПМИД 10373562 .
Кнопфлер П.С., Бергстром Д.А., Уэцуки Т., Дак-Корытко И., Сунь Ю.Х., Райт В.Е. и др. (сентябрь 1999 г.). «Консервативный мотив, N-концевой по отношению к ДНК-связывающим доменам миогенных факторов транскрипции bHLH, опосредует совместное связывание ДНК с pbx-Meis1/Prep1» . Исследования нуклеиновых кислот . 27 (18): 3752–3761. дои : 10.1093/нар/27.18.3752 . ПМК 148632 . ПМИД 10471746 . {{cite journal }}
: CS1 maint: переопределенная настройка ( ссылка )
МакВиртер-младший, Нойтбум С.Т., Ванцевич Е.В., Моня Б.П., Даунинг-младший, Мурре С. (сентябрь 1999 г.). «Онкогенный гомеодоменный транскрипционный фактор E2A-Pbx1 активирует новый ген WNT при остром лимфобластном лейкозе pre-B» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (20): 11464–11469. Бибкод : 1999PNAS...9611464M . дои : 10.1073/pnas.96.20.11464 . ЧВК 18056 . ПМИД 10500199 .
Шанмугам К., Грин Северная Каролина, Рамбальди И., Сарагови Х.У., Физерстоун М.С. (ноябрь 1999 г.). «PBX и MEIS как несвязывающиеся с ДНК партнеры в тримерных комплексах с белками HOX» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (11): 7577–7588. дои : 10.1128/MCB.19.11.7577 . ПМЦ 84774 . ПМИД 10523646 .
Миккола И., Бруун Дж.А., Холм Т., Йохансен Т. (февраль 2001 г.). «Суперактивация Pax6-опосредованной трансактивации из сайтов связывания парных доменов путем независимого от ДНК рекрутирования различных гомеодоменовых белков» . Журнал биологической химии . 276 (6): 4109–4118. дои : 10.1074/jbc.M008882200 . ПМИД 11069920 .
Тамим Ф., Вулфорд Дж. К., Богардус С., Прохазка М. (март 2001 г.). «Анализ PBX1 как гена-кандидата сахарного диабета 2 типа у индейцев пима». Биохимия и биофизика Acta (BBA) - Структура и экспрессия генов . 1518 (1–2): 215–220. дои : 10.1016/S0167-4781(01) 00189-0 ПМИД 11267683 .
Лю Ю, Макдональд Р.Дж., Свифт Г.Х. (май 2001 г.). «Связывание ДНК и активация транскрипции с помощью тримера PDX1.PBX1b.MEIS2b и сотрудничество со специфичным для поджелудочной железы базовым комплексом спираль-петля-спираль» . Журнал биологической химии . 276 (21): 17985–17993. дои : 10.1074/jbc.M100678200 . ПМИД 11279116 .
Мал А., Стурниоло М., Шильц Р.Л., Гош М.К., Хартер М.Л. (апрель 2001 г.). «Роль гистондеацетилазы HDAC1 в модуляции транскрипционной активности MyoD: ингибирование миогенной программы» . Журнал ЭМБО . 20 (7): 1739–1753. дои : 10.1093/emboj/20.7.1739 . ПМК 145490 . ПМИД 11285237 .
показывать галерея PDB
1b72 : PBX1, HOMEOBOX PROTEIN HOX-B1/DNA TERNARY COMPLEX
1b8i : STRUCTURE OF THE HOMEOTIC UBX/EXD/DNA TERNARY COMPLEX
1du6 : SOLUTION STRUCTURE OF THE TRUNCATED PBX HOMEODOMAIN
1lfu : NMR solution structure of the extended PBX homeodomain bound to DNA
1puf : Crystal structure of HoxA9 and Pbx1 homeodomains bound to DNA
показывать
show (1) Basic domains
(1.1) Basic leucine zipper (bZIP )(1.2) Basic helix-loop-helix (bHLH )
Group A Group B Group C bHLH-PAS Group D Group E Group F bHLH-COE
(1.3) bHLH-ZIP (1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Basic helix-span-helix (bHSH)
show (2) Zinc finger DNA-binding domains
(2.1) Nuclear receptor (Cys4 )
subfamily 1 subfamily 2 subfamily 3 subfamily 4 subfamily 5 subfamily 6 subfamily 0
(2.2) Other Cys4 (2.3) Cys2 His2 (2.4) Cys6 (2.5) Alternating composition (2.6) WRKY
show (4) β-Scaffold factors with minor groove contacts
show (0) Other transcription factors