ПРДМ2

ПРДМ2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск Human UniProt: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2JV0, 2QPW
Идентификаторы
Псевдонимы	PRDM2 , HUMHOXY1, KMT8, MTB-ZF, RIZ, RIZ1, RIZ2, домен PR 2, домен PR/SET 2, KMT8A
Внешние идентификаторы	Опустить : 601196 ; МГИ : 107628 ; Гомологен : 40822 ; Генные карты : PRDM2 ; ОМА : PRDM2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	13,825,079 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 4 (mouse)
End	143,212,995 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	sural nerve; ; secondary oocyte; ; buccal mucosa cell; ; middle temporal gyrus; ; epithelium of colon; ; Brodmann area 46; ; Brodmann area 10; ; frontal pole; ; bone marrow cells; ; Brodmann area 23;
	Top expressed in
	interventricular septum; ; spermatocyte; ; spermatid; ; granulocyte; ; zygote; ; tail of embryo; ; genital tubercle; ; otic vesicle; ; muscle of thigh; ; visual cortex;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA-binding transcription factor activity; methyltransferase activity; transferase activity; DNA binding; zinc ion binding; histone-lysine N-methyltransferase activity; metal ion binding; nucleic acid binding; RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; chromatin DNA binding; sequence-specific DNA binding;
Cellular component	nucleus; Golgi apparatus;
Biological process	histone lysine methylation; methylation; regulation of transcription, DNA-templated; determination of adult lifespan; transcription, DNA-templated; transcription by RNA polymerase II; positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	7799
	110593
	ENSG00000116731
	ENSMUSG00000057637
	Q13029
	н/д
showНМ_001007257 ; НМ_001135610 ; НМ_012231 ; НМ_015866 ; НМ_001393986 ;
	NM_001393987; NM_001393988
	НМ_001081355 ; НМ_001256380
	НП_001007258 ; НП_001129082 ; НП_036363 ; НП_056950
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок 2 цинкового пальца домена PR представляет собой белок , который у человека кодируется PRDM2 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Этот ген-супрессор опухоли является членом суперсемейства ядерных гистонов/протеин-метилтрансфераз. Он кодирует белок «цинковые пальцы», который может связываться с белком ретинобластомы, рецептором эстрогена и TPA-чувствительным элементом (MTE) гена гем-оксигеназы-1. Хотя функции этого белка полностью не охарактеризованы, он может (1) играть роль в регуляции транскрипции во время нейрональной дифференцировки и патогенеза ретинобластомы, (2) действовать как активатор транскрипции гена гем-оксигеназы-1 и (( 3) быть специфическим эффектором эстрогенного действия. Для этого гена обнаружено три варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что PRDM2 взаимодействует с альфа-рецептором эстрогена. ^{[ 7 ]} и белок ретинобластомы . ^{[ 5 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000116731 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000057637 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б Буйсе И.М., Шао Г., Хуан С. (май 1995 г.). «Белок ретинобластомы связывается с RIZ, белком цинковых пальцев, который имеет общий эпитоп с белком E1A аденовируса» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (10): 4467–71. Бибкод : 1995PNAS...92.4467B . дои : 10.1073/pnas.92.10.4467 . ПМК 41965 . ПМИД 7538672 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: PR-домен PRDM2, содержащий 2, с доменом ZNF» .
^ Аббонданса С, Медичи Н, Нигро В, Росси В, Галло Л, Пилузо Г, Белсито А, Росчиньо А, Бонтемпо П, Пука А.А., Молинари А.М., Мончармон Б, Пука Г.А. (март 2000 г.). «Взаимодействующий с ретинобластомой белок цинковых пальцев RIZ является нижестоящим эффектором действия эстрогена» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (7): 3130–5. дои : 10.1073/pnas.050015697 . ПМК 16204 . ПМИД 10706618 .

Дальнейшее чтение

Шапиро В.С., Ли П., Виното А. (октябрь 1995 г.). «Идентификация и клонирование кДНК G3B, кодирующей 3'-сегмент белка, связывающегося с GATA-3». Джин . 163 (2): 329–30. дои : 10.1016/0378-1119(95)00420-Б . ПМИД 7590293 .
Мураоса И., Такахаси К., Ёсидзава М., Сибахара С. (февраль 1996 г.). «Клонирование кДНК нового белка, содержащего два домена цинковых пальцев, которые могут функционировать как фактор транскрипции гена гем-оксигеназы-1 человека». Европейский журнал биохимии . 235 (3): 471–9. дои : 10.1111/j.1432-1033.1996.00471.x . ПМИД 8654390 .
Буйсе И.М., Такахаши Э.И., Хуан С. (май 1996 г.). «Физическое картирование ретинобластомы, взаимодействующей гена цинкового пальца RIZ с D1S228 на хромосоме 1p36». Геномика . 34 (1): 119–21. дои : 10.1006/geno.1996.0249 . ПМИД 8661032 .
Лю Л., Шао Г., Стил-Перкинс Г., Хуан С. (январь 1997 г.). «Взаимодействующий с ретинобластомой ген цинкового пальца RIZ продуцирует продукт без PR-домена через внутренний промотор» . Журнал биологической химии . 272 (5): 2984–91. дои : 10.1074/jbc.272.5.2984 . ПМИД 9006946 .
Се М., Шао Г., Буйсе И.М., Хуан С. (октябрь 1997 г.). «Транкрипционная репрессия, опосредованная геном цинкового пальца RIZ домена PR» . Журнал биологической химии . 272 (42): 26360–6. дои : 10.1074/jbc.272.42.26360 . ПМИД 9334209 .
Хэ Л., Юй Дж.С., Лю Л., Буйсе И.М., Ван М.С., Ян К.К., Накагавара А., Бродер Г.М., Ши Й.Е., Хуан С. (октябрь 1998 г.). «RIZ1, но не альтернативный продукт того же гена RIZ2, недостаточно экспрессируется при раке молочной железы, а вынужденная экспрессия RIZ1 вызывает остановку клеточного цикла G2-M и/или апоптоз». Исследования рака . 58 (19): 4238–44. ПМИД 9766644 .
Аббонданса С, Медичи Н, Нигро В, Росси В, Галло Л, Пилузо Г, Белсито А, Росчиньо А, Бонтемпо П, Пука А.А., Молинари А.М., Мончармон Б, Пука Г.А. (март 2000 г.). «Взаимодействующий с ретинобластомой белок цинковых пальцев RIZ является нижестоящим эффектором действия эстрогена» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (7): 3130–5. дои : 10.1073/pnas.050015697 . ПМК 16204 . ПМИД 10706618 .
Диас Нето Э, Корреа Р.Г., Верёвски-Алмейда С., Брионес М.Р., Нагаи М.А., да Силва В., Заго М.А., Бордин С., Коста ФФ, Гольдман Г.Х., Карвальо А.Ф., Мацукума А., Бая Г.С., Симпсон Д.Х., Брунштейн А., де Оливейра П.С., Бучер П., Джонджинил К.В., О'Хара М.Дж., Соареш Ф., Брентани Р.Р., Рейс Л.Ф., де Соуза С.Дж., Симпсон А.Дж. (март 2000 г.). «Секвенирование транскрипции человека с помощью меток последовательности, экспрессируемых ORF» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (7): 3491–6. Бибкод : 2000PNAS...97.3491D . дои : 10.1073/pnas.97.7.3491 . ПМК 16267 . ПМИД 10737800 .
Ду Ю, Карлинг Т., Фанг В., Пяо З., Шу Дж. К., Хуан С. (ноябрь 2001 г.). «Гиперметилирование при раке человека гена-супрессора опухоли RIZ1, члена суперсемейства гистонов/протеин-метилтрансфераз». Исследования рака . 61 (22): 8094–9. ПМИД 11719434 .
Сасаки О, Мегуро К, Томия Ю, Фунато Т, Шибахара С, Сасаки Т (март 2002 г.). «Нуклеотидное изменение гена цинкового пальца, взаимодействующего с белком ретинобластомы, RIZ, при лейкемии человека» . Журнал экспериментальной медицины Тохоку . 196 (3): 193–201. дои : 10.1620/tjem.196.193 . ПМИД 12002276 .
Поетч М., Диттбернер Т., Военкхаус С. (май 2002 г.). «Мутации со сдвигом рамки RIZ, но отсутствие точечных мутаций в экзонах RIZ1 при злокачественных меланомах с делецией 1p36». Онкоген . 21 (19): 3038–42. дои : 10.1038/sj.onc.1205457 . ПМИД 12082534 . S2CID 37956595 .
Сасаки О, Мегуро К, Томия Ю, Фунато Т, Шибахара С, Сасаки Т (декабрь 2002 г.). «Измененная экспрессия гена цинкового пальца, взаимодействующего с белком ретинобластомы, RIZ, при лейкемии человека» . Британский журнал гематологии . 119 (4): 940–8. дои : 10.1046/j.1365-2141.2002.03972.x . ПМИД 12472571 . S2CID 21560813 .
Токумару Ю, Номото С, Херонимо С, Энрике Р, Харден С, Тринк Б, Сидрански Д (октябрь 2003 г.). «Биаллельная инактивация гена RIZ1 при раке желудка человека». Онкоген . 22 (44): 6954–8. дои : 10.1038/sj.onc.1206403 . ПМИД 14534544 . S2CID 20152972 .
Ким К.С., Гэн Л., Хуан С. (ноябрь 2003 г.). «Инактивация гистон-метилтрансферазы мутациями при раке человека». Исследования рака . 63 (22): 7619–23. ПМИД 14633678 .
Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж.Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М.А., Кэнтли Л.К., Гиги С.П. (август 2004 г.). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (33): 12130–5. Бибкод : 2004PNAS..10112130B . дои : 10.1073/pnas.0404720101 . ПМК 514446 . ПМИД 15302935 .
Пан К.Ф., Лу ЙЮ, Лю В.Г., Чжан Л., Ю В.К. (сентябрь 2004 г.). «Обнаружение мутаций сдвига рамки RIZ при раке желудка с микросателлитной нестабильностью» . Всемирный журнал гастроэнтерологии . 10 (18): 2719–22. дои : 10.3748/wjg.v10.i18.2719 . ПМК 4572200 . ПМИД 15309726 .
Росси М., Аббонданса С., Д'Арканджело А., Газзерро П., Медичи Н., Мончармон Б., Пука Г.А. (ноябрь 2004 г.). «Домен Zn-finger белка RIZ способствует пролиферации клеток MCF-7». Письма о раке . 215 (2): 229–37. дои : 10.1016/j.canlet.2004.05.014 . ПМИД 15488642 .
Грундберг Э., Карлинг Т., Брэндстрем Х., Хуанг С., Рибом Э.Л., Юнггрен О., Маллмин Х., Киндмарк А. (декабрь 2004 г.). «Делеционный полиморфизм в гене RIZ, коактиваторе рецептора женских половых стероидных гормонов, демонстрирует сниженную реакцию на эстроген in vitro и связан с низкой минеральной плотностью костей у молодых шведских женщин» . Журнал клинической эндокринологии и метаболизма . 89 (12): 6173–8. дои : 10.1210/jc.2004-0403 . ПМИД 15579774 .

Внешние ссылки

PRDM2 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

статья о гене на хромосоме 1 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000116731 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000057637 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7538672-5] Jump up to: ^а ^б Буйсе И.М., Шао Г., Хуан С. (май 1995 г.). «Белок ретинобластомы связывается с RIZ, белком цинковых пальцев, который имеет общий эпитоп с белком E1A аденовируса» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (10): 4467–71. Бибкод : 1995PNAS...92.4467B . дои : 10.1073/pnas.92.10.4467 . ПМК 41965 . ПМИД 7538672 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: PR-домен PRDM2, содержащий 2, с доменом ZNF» .

[pmid10706618-7] Аббонданса С, Медичи Н, Нигро В, Росси В, Галло Л, Пилузо Г, Белсито А, Росчиньо А, Бонтемпо П, Пука А.А., Молинари А.М., Мончармон Б, Пука Г.А. (март 2000 г.). «Взаимодействующий с ретинобластомой белок цинковых пальцев RIZ является нижестоящим эффектором действия эстрогена» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (7): 3130–5. дои : 10.1073/pnas.050015697 . ПМК 16204 . ПМИД 10706618 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]