ПРОКС1

ПРОКС1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2LMD
Идентификаторы
Псевдонимы	PROX1 , гомеобокс Просперо 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 601546 ; МГИ : 97772 ; Гомологен : 2069 ; Генные карты : PROX1 ; OMA : PROX1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	214,041,510 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 1 (mouse)
End	189,902,911 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	sural nerve; ; liver; ; right lobe of liver; ; right ventricle; ; buccal mucosa cell; ; corpus callosum; ; biceps brachii; ; islet of Langerhans; ; Skeletal muscle tissue of biceps brachii; ; body of pancreas;
	Top expressed in
	lens; ; neural layer of retina; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; subthalamus; ; atrioventricular valve; ; nucleus reuniens; ; lumbar subsegment of spinal cord; ; Rostral migratory stream; ; white matter; ; aortic valve;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; sequence-specific DNA binding; transcription corepressor activity; DNA binding domain binding; DNA-binding transcription factor activity; LBD domain binding; DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; core promoter sequence-specific DNA binding; protein binding; nuclear receptor binding; transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding;
Cellular component	cytoplasm; nucleus;
Biological process	dorsal spinal cord development; olfactory placode formation; regulation of transcription, DNA-templated; positive regulation of endothelial cell proliferation; venous blood vessel morphogenesis; kidney development; lymphangiogenesis; lung development; dentate gyrus development; rhythmic process; ventricular septum morphogenesis; cardiac muscle cell differentiation; lymphatic endothelial cell differentiation; positive regulation of sarcomere organization; positive regulation of forebrain neuron differentiation; endocardium formation; hepatocyte differentiation; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; negative regulation of DNA-binding transcription factor activity; lymph vessel development; hepatocyte cell migration; transcription, DNA-templated; lens placode formation involved in camera-type eye formation; skeletal muscle thin filament assembly; neuronal stem cell population maintenance; positive regulation of endothelial cell migration; positive regulation of transcription, DNA-templated; positive regulation of heart growth; ventricular cardiac muscle tissue morphogenesis; positive regulation of neural precursor cell proliferation; retina morphogenesis in camera-type eye; multicellular organism development; negative regulation of viral genome replication; brain development; branching involved in pancreas morphogenesis; positive regulation of cell cycle; lens development in camera-type eye; response to nutrient levels; hepatocyte proliferation; positive regulation of cell cycle checkpoint; regulation of circadian rhythm; circadian rhythm; acinar cell differentiation; neural tube development; neuron differentiation; positive regulation of cell population proliferation; lens morphogenesis in camera-type eye; positive regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity; negative regulation of bile acid biosynthetic process; embryonic retina morphogenesis in camera-type eye; regulation of gene expression; cell fate determination; pancreas development; liver development; atrial cardiac muscle tissue morphogenesis; endothelial cell differentiation; inner ear development; negative regulation of transcription, DNA-templated; ventricular cardiac myofibril assembly; otic placode formation; aorta smooth muscle tissue morphogenesis; cerebellar granule cell differentiation; negative regulation of cell population proliferation; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; lens fiber cell morphogenesis;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	5629
	19130
	ENSG00000117707
	ENSMUSG00000010175
	Q92786
	P48437
	НМ_001270616 ; НМ_002763
	НМ_008937 ; НМ_001360827
	НП_001257545 ; НП_002754
	НП_032963 ; НП_001347756
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок 1 гомеобокса Prospero — это белок , который у человека кодируется PROX1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} Ген Prox1 имеет решающее значение для развития множественных ткани. Активность Prox1 необходима и достаточна для определения судьбы лимфатических эндотелиальных клеток в эндотелиальных предшественниках, расположенных в эмбриональных венах. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что PROX1 взаимодействует с EP300 . ^{[ 8 ]}

Производство

PROX1 вырабатывается преимущественно в зубчатой извилине у мышей, а также в зубчатой извилине и белом веществе человека. Данные по экспрессии генов у мышей, человека и макак из Атласов мозга Аллена можно найти здесь .

Клиническое значение

PROX1 используется в качестве маркера лимфатического эндотелия в образцах биопсии.

Гомологичный ген

ПРОКС2

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000117707 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000010175 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Зиновьева Р.Д., Дункан М.К., Джонсон Т.Р., Торрес Р., Полимеропулос М.Х., Томарев С.И. (декабрь 1996 г.). «Структура и хромосомная локализация гомеобоксного гена человека Prox 1» . Геномика . 35 (3): 517–22. дои : 10.1006/geno.1996.0392 . ПМИД 8812486 .
^ «Ген Энтреза: гомеобокс 1, связанный с PROX1 просперо» .
^ Харви, Наташа Л. (октябрь 2005 г.). «Дефекты лимфатических сосудов, вызванные гаплонедостаточностью Prox1, вызывают ожирение у взрослых» . Природная генетика . 37 (10): 1072–1081. дои : 10.1038/ng1642 . ПМИД 16170315 . S2CID 25103068 .
^ Чен, Цинь; Доухан Деннис Х; Лян Дунцай; Мур Дэвид Д.; Овербик Пол А. (июль 2002 г.). «CREB-связывающий белок/коактивация p300 экспрессии гена кристаллина» . Ж. Биол. Хим . 277 (27). США: 24081–9. дои : 10.1074/jbc.M201821200 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 11943779 .

Дальнейшее чтение

Вигл Дж.Т., Чоудхури К., Грусс П., Оливер Г. (1999). «Функция Prox1 имеет решающее значение для удлинения волокон линзы мыши». Нат. Жене . 21 (3): 318–22. дои : 10.1038/6844 . ПМИД 10080188 . S2CID 23791417 .
Моута Каррейра С., Насер С.М., ди Томазо Э. и др. (2001). «LYVE-1 не ограничивается лимфатическими сосудами: экспрессия в нормальных синусоидах крови печени и снижение регуляции при раке печени и циррозе печени человека». Рак Рез . 61 (22): 8079–84. ПМИД 11719431 .
Родригес-Ниденфюр М., Папуци М., Крист Б. и др. (2002). «Prox1 является маркером эктодермальных плакод, энтодермальных компартментов, лимфатического эндотелия и лимфангиобластов». Анат. Эмбриол . 204 (5): 399–406. дои : 10.1007/s00429-001-0214-9 . ПМИД 11789987 . S2CID 21608393 .
Дункан М.К., Кюи В., Ох DJ, Томарев С.И. (2002). «Prox1 по-разному локализуется во время развития хрусталика» . Мех. Дев . 112 (1–2): 195–8. дои : 10.1016/S0925-4773(01)00645-1 . ПМИД 11850194 . S2CID 10074353 .
Чен Ц., Доухан Д.Х., Лян Д. и др. (2002). «CREB-связывающий белок/коактивация p300 экспрессии гена кристаллина» . Ж. Биол. Хим . 277 (27): 24081–9. дои : 10.1074/jbc.M201821200 . ПМИД 11943779 .
Уилтинг Дж., Папуци М., Крист Б. и др. (2002). «Фактор транскрипции Prox1 является маркером лимфатических эндотелиальных клеток в нормальных и больных тканях человека» . ФАСЕБ Дж . 16 (10): 1271–3. doi : 10.1096/fj.01-1010fje . ПМИД 12060670 . S2CID 13013505 .
Петрова Т.В., Мякинен Т., Мякеля Т.П. и др. (2002). «Лимфатическое эндотелиальное перепрограммирование сосудистых эндотелиальных клеток с помощью транскрипционного фактора гомеобокса Prox-1» . ЭМБО Дж . 21 (17): 4593–9. дои : 10.1093/emboj/cdf470 . ПМК 125413 . ПМИД 12198161 .
Хонг Ю.К., Харви Н., Но Ю.Х. и др. (2003). «Prox1 является главным контрольным геном в программе, определяющей судьбу лимфатических эндотелиальных клеток» . Дев. Дин . 225 (3): 351–7. дои : 10.1002/dvdy.10163 . ПМИД 12412020 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Дайер М.А., Ливси Ф.Дж., Чепко К.Л., Оливер Дж. (2003). «Функция Prox1 контролирует пролиферацию клеток-предшественников и генезис горизонтальных клеток в сетчатке млекопитающих». Нат. Жене . 34 (1): 53–8. дои : 10.1038/ng1144 . ПМИД 12692551 . S2CID 6134008 .
Нагай Х., Ли Ю., Хатано С. и др. (2003). «Мутации и аберрантное метилирование ДНК гена PROX1 при гематологических злокачественных новообразованиях». Гены Хромосомы Рак . 38 (1): 13–21. дои : 10.1002/gcc.10248 . ПМИД 12874782 . S2CID 35135526 .
Стеффенсен К.Р., Холтер Э., Бовнер А. и др. (2005). «Функциональная консервация взаимодействий между кофактором гомеодомена и гомологом FTZ-F1 млекопитающих» . Представитель ЭМБО . 5 (6): 613–9. дои : 10.1038/sj.embor.7400147 . ПМК 1299067 . ПМИД 15143342 .
Цинь Дж., Гао Д.М., Цзян Ц.Ф. и др. (2005). «Гомеобокс, родственный Просперо (Prox1), является корепрессором гомолога-1 рецептора печени человека и подавляет транскрипцию гена холестерин-7-альфа-гидроксилазы» . Мол. Эндокринол . 18 (10): 2424–39. дои : 10.1210/me.2004-0009 . ПМИД 15205472 .
Дудас Дж., Папуци М., Хехт М. и др. (2005). «Гомеобоксный транскрипционный фактор Prox1 высококонсервативен в эмбриональных гепатобластах, а также во взрослых и трансформированных гепатоцитах, но отсутствует в эпителии желчных протоков». Анат. Эмбриол . 208 (5): 359–66. дои : 10.1007/s00429-004-0403-4 . ПМИД 15232737 . S2CID 117581 .
Рейс Р.М., Рейс-Фильо Дж.С., Лонгатто Филью А. и др. (2006). «Дифференциальная экспрессия Prox-1 и CD 31 в слизистых оболочках, кожных и мягких тканях, сосудистых поражениях и опухолях». Патол. Рез. Практика . 201 (12): 771–6. дои : 10.1016/j.prp.2005.08.010 . hdl : 1822/5789 . ПМИД 16308102 .
Сун К.Х., Ли Т., Чан Цзюй (2006). «Гомеодомен, родственный просперобелку, является новым корегулятором ядерного фактора 4α гепатоцитов, который регулирует ген холестерин-7α-гидроксилазы» . Ж. Биол. Хим . 281 (15): 10081–8. дои : 10.1074/jbc.M513420200 . ПМЦ 1785292 . PMID 16488887 .
Шнайдер М., Бюхлер П., Гизе Н. и др. (2006). «Роль лимфангиогенеза и лимфангиогенных факторов в прогрессировании рака поджелудочной железы и лимфатическом распространении» . Межд. Дж. Онкол . 28 (4): 883–90. дои : 10.3892/ijo.28.4.883 . ПМИД 16525637 .
Симода М., Такахаши М., Ёсимото Т. и др. (2006). «Гомеобоксный белок prox1 участвует в дифференцировке, пролиферации и прогнозе гепатоцеллюлярной карциномы» . Клин. Рак Рез . 12 (20, часть 1): 6005–11. дои : 10.1158/1078-0432.CCR-06-0712 . HDL : 2433/135812 . ПМИД 17062673 .
Лаерм А., Хелмбольд П., Голдберг М. и др. (2007). «Гомеобокс 1, связанный с Просперо (PROX1), часто инактивируется геномными делециями и эпигенетическим молчанием при карциномах желчевыводящей системы». Дж. Гепатол . 46 (1): 89–97. дои : 10.1016/j.jhep.2006.07.033 . ПМИД 17069925 .

Внешние ссылки

PROX1 + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q92786 (гомеобоксный белок 1 Prospero) в PDBe-KB .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000117707 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000010175 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8812486-5] Зиновьева Р.Д., Дункан М.К., Джонсон Т.Р., Торрес Р., Полимеропулос М.Х., Томарев С.И. (декабрь 1996 г.). «Структура и хромосомная локализация гомеобоксного гена человека Prox 1» . Геномика . 35 (3): 517–22. дои : 10.1006/geno.1996.0392 . ПМИД 8812486 .

[entrez-6] «Ген Энтреза: гомеобокс 1, связанный с PROX1 просперо» .

[7] Харви, Наташа Л. (октябрь 2005 г.). «Дефекты лимфатических сосудов, вызванные гаплонедостаточностью Prox1, вызывают ожирение у взрослых» . Природная генетика . 37 (10): 1072–1081. дои : 10.1038/ng1642 . ПМИД 16170315 . S2CID 25103068 .

[pmid11943779-8] Чен, Цинь; Доухан Деннис Х; Лян Дунцай; Мур Дэвид Д.; Овербик Пол А. (июль 2002 г.). «CREB-связывающий белок/коактивация p300 экспрессии гена кристаллина» . Ж. Биол. Хим . 277 (27). США: 24081–9. дои : 10.1074/jbc.M201821200 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 11943779 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]