НФХ1

НФХ1
Идентификаторы
Псевдонимы	NFX1 , NFX2, TEG-42, Tex42, фактор ядерной транскрипции, связывание X-box 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 603255 ; МГИ : 1921414 ; Гомологен : 1875 ; Генные карты : NFX1 ; OMA : NFX1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 9 (human)
End	33,371,157 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 4 (mouse)
End	41,025,993 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	buccal mucosa cell; ; skin of hip; ; tail of epididymis; ; caput epididymis; ; corpus epididymis; ; endothelial cell; ; right ventricle; ; oral cavity; ; skin of thigh; ; biceps brachii;
	Top expressed in
	cumulus cell; ; primitive streak; ; epiblast; ; gastrula; ; seminal vesicula; ; dermis; ; neural layer of retina; ; hair follicle; ; superior frontal gyrus; ; aortic valve;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	DNA-binding transcription factor activity; DNA binding; DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; zinc ion binding; ligase activity; RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; metal ion binding; nucleic acid binding; RNA binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; transferase activity; ubiquitin protein ligase activity;
Cellular component	plasma membrane; nucleolus; nucleus; cytosol;
Biological process	inflammatory response; viral process; regulation of transcription, DNA-templated; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; transcription by RNA polymerase II; negative regulation of MHC class II biosynthetic process; transcription, DNA-templated; protein ubiquitination;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	4799
	74164
	ENSG00000086102
	ENSMUSG00000028423
	Q12986
	B1AY10
	НМ_002504 ; НМ_147133 ; НМ_147134 ; НМ_001318758
	НМ_001290448 ; НМ_001290449 ; НМ_023739
	НП_001305687 ; НП_002495 ; НП_667345
	НП_001277377 ; НП_001277378 ; НП_076228
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Репрессор транскрипции NF-X1 представляет собой белок , который у человека кодируется NFX1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Экспрессия генов MHC класса II контролируется преимущественно на уровне транскрипции с помощью транскрипционных факторов , которые связываются с X- и Y-боксами, двумя высококонсервативными элементами в проксимальном промоторе генов MHC класса II. Белок, кодируемый этим геном, представляет собой репрессор транскрипции , способный связываться с консервативным мотивом X-бокса HLA-DRA и других генов MHC класса II in vitro. Белок может играть роль в регулировании продолжительности воспалительной реакции, ограничивая период, в течение которого молекулы MHC класса II индуцируются IFN-γ . три альтернативных варианта сплайсинга , каждый из которых кодирует другую изоформу . Были идентифицированы ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000086102 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028423 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Сонг З., Кришна С., Танос Д., Строминджер Дж.Л., Оно С.Дж. (декабрь 1994 г.). «Новый богатый цистеином ДНК-связывающий белок, специфичный для последовательности, взаимодействует с консервативным мотивом X-box генов класса II главного комплекса гистосовместимости человека через повторяющийся домен Cys-His и действует как репрессор транскрипции» . Джей Эксп Мед . 180 (5): 1763–74. дои : 10.1084/jem.180.5.1763 . ПМК 2191754 . ПМИД 7964459 .
^ Хьюм CR, Ли Дж.С. (январь 1990 г.). «Врожденные иммунодефициты, связанные с отсутствием антигенов HLA класса II на лимфоцитах, возникают в результате различных мутаций транс-действующих факторов». Хум Иммунол . 26 (4): 288–309. дои : 10.1016/0198-8859(89)90007-4 . ПМИД 2511169 .
^ Арлотта П., Миядзаки Д., Коупленд Н.Г., Гилберт Д.Д., Дженкинс Н.А., Оно С.Дж. (июнь 2002 г.). «Мышиный NFX.1: выделение и характеристика его информационной РНК, картирование ее хромосомного расположения и оценка ее экспрессии в процессе развития» . Иммунология . 106 (2): 173–81. дои : 10.1046/j.1365-2567.2002.01416.x . ПМК 1782705 . ПМИД 12047746 .
^ «Ген Энтрез: ядерный фактор транскрипции NFX1, связывание X-box 1» .

Дальнейшее чтение

Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Сузуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Лорик К.Л., Дженсен Дж.П., Фанг С. и др. (1999). «КОЛЬЦЕВЫЕ пальцы опосредуют убиквитинирование, зависимое от убиквитин-конъюгирующего фермента (E2)» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 96 (20): 11364–9. Бибкод : 1999PNAS...9611364L . дои : 10.1073/pnas.96.20.11364 . ЧВК 18039 . ПМИД 10500182 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Сайто К., Фудзивара Т., Катахира Дж. и др. (2004). «TAP/NXF1, первичный рецептор экспорта мРНК, специфически взаимодействует с нейрональным РНК-связывающим белком HuD». Биохим. Биофиз. Рез. Общий . 321 (2): 291–7. дои : 10.1016/j.bbrc.2004.06.140 . ПМИД 15358174 .
Гевин Л., Майерс Х., Кийоно Т., Галлоуэй Д.А. (2004). «Идентификация нового репрессора теломеразы, который взаимодействует с комплексом E6/E6-AP вируса папилломы человека типа 16» . Генс Дев . 18 (18): 2269–82. дои : 10.1101/gad.1214704 . ПМК 517520 . ПМИД 15371341 .
Каценелленбоген Р.А., Эгелькроут Э.М., Влит-Грегг П. и др. (2007). «NFX1-123 и поли(А)-связывающие белки синергически усиливают активацию теломеразы в клетках, экспрессирующих E6 вируса папилломы человека типа 16» . Дж. Вирол . 81 (8): 3786–96. дои : 10.1128/JVI.02007-06 . ПМК 1866132 . ПМИД 17267499 .

Внешние ссылки

NFX1 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 9 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000086102 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028423 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7964459-5] Сонг З., Кришна С., Танос Д., Строминджер Дж.Л., Оно С.Дж. (декабрь 1994 г.). «Новый богатый цистеином ДНК-связывающий белок, специфичный для последовательности, взаимодействует с консервативным мотивом X-box генов класса II главного комплекса гистосовместимости человека через повторяющийся домен Cys-His и действует как репрессор транскрипции» . Джей Эксп Мед . 180 (5): 1763–74. дои : 10.1084/jem.180.5.1763 . ПМК 2191754 . ПМИД 7964459 .

[pmid2511169-6] Хьюм CR, Ли Дж.С. (январь 1990 г.). «Врожденные иммунодефициты, связанные с отсутствием антигенов HLA класса II на лимфоцитах, возникают в результате различных мутаций транс-действующих факторов». Хум Иммунол . 26 (4): 288–309. дои : 10.1016/0198-8859(89)90007-4 . ПМИД 2511169 .

[pmid12047746-7] Арлотта П., Миядзаки Д., Коупленд Н.Г., Гилберт Д.Д., Дженкинс Н.А., Оно С.Дж. (июнь 2002 г.). «Мышиный NFX.1: выделение и характеристика его информационной РНК, картирование ее хромосомного расположения и оценка ее экспрессии в процессе развития» . Иммунология . 106 (2): 173–81. дои : 10.1046/j.1365-2567.2002.01416.x . ПМК 1782705 . ПМИД 12047746 .

[entrez-8] «Ген Энтрез: ядерный фактор транскрипции NFX1, связывание X-box 1» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]