Protein-coding gene in the species Homo sapiens
GTF2F1 Доступные структуры PDB Поиск ортолога: PDBE RCSB show 1F3U , 1I27 , 1J2X , 1NHA , 1ONV , 2K7L , 5IY9 , 5IYA , 5IYC , 5IYB , 5IY7 , 5IY8 , 5IYD , 5IY6
Идентификаторы Псевдонимы GTF2F1 Внешние идентификаторы Омим : 189968 ; MGI : 1923848 ; Гомологен : 1585 ; GeneCards : GTF2F1 ; OMA : GTF2F1 - Ортологи show РНК -паттерн экспрессии Bgee Human Mouse (ortholog)Top expressed in cerebellum cerebellar cortex cerebellar hemisphere left testis right hemisphere of cerebellum right testis left ovary prefrontal cortex anterior pituitary superior frontal gyrus
Top expressed in saccule otic placode otic vesicle seminiferous tubule neural layer of retina tail of embryo primitive streak primary oocyte yolk sac genital tubercle
More reference expression data
BioGPS
Викидид
Общий фактор транскрипции IIF Субъединица 1 - это белок , который у людей кодируется GTF2F1 геном . [ 5 ] [ 6 ]
Было показано, что GTF2F1 взаимодействует :
^ Подпрыгнуть до: а беременный в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000125651 - ENSEMBL , май 2017 г. ^ Подпрыгнуть до: а беременный в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000002658 - Ensembl , май 2017 г. ^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США . ^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США . ^ Finkelstein A, Kostrub CF, Li J, Chavez DP, Wang BQ, Fang SM, Greenblatt J, Burton ZF (март 1992 г.). «КДНК, кодирующая Rap74, общий коэффициент инициации транскрипции с помощью РНК -полимеразы II». Природа . 355 (6359): 464–7. Bibcode : 1992natur.355..464f . doi : 10.1038/355464A0 . PMID 1734284 . S2CID 1241044 . ^ «Ген Entrez: GTF2F1 Общий транскрипционный фактор IIF, полипептид 1, 74 кДа» . ^ Archambault J, Pan G, Dahmus GK, Cartier M, Marshall N, Zhang S, Dahmus ME, Greenblatt J (октябрь 1998 г.). «FCP1, субъединица RAP74-взаимодействия человеческой белковой фосфатазы, которая дефосфорилирует карбоксил-концевой домен РНК-полимеразы IIO» . Дж. Биол. Химический 273 (42): 27593–601. doi : 10.1074/jbc.273.42.27593 PMID 9765293 . ^ Подпрыгнуть до: а беременный в дюймовый и фон Скалли Р., Андерсон С.Ф., Чао Д.М., Вей В., Йе Л., Янг Р.А., Ливингстон Д.М., Парвин Д.Д. (май 1997). «BRCA1 является компонентом голоефермента РНК -полимеразы II» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 94 (11): 5605–10. Bibcode : 1997pnas ... 94.5605s . doi : 10.1073/pnas.94.11.5605 PMC 20825 PMID 9159119 . ^ Ким М.К., Никодем В.М. (октябрь 1999). «HNRNP U ингибирует фосфорилирование карбокси-концевого домена с помощью TFIIH и подавляет удлинение РНК-полимеразы II» . Мол Клетка. Биол . 19 (10): 6833–44. doi : 10.1128/mcb.19.10.6833 . PMC 84680 PMID 10490622 . ^ Suñé C, Hayashi T, Liu Y, Lane WS, Young RA, Garcia-Blanco MA (октябрь 1997 г.). «CA150, ядерный белок, связанный с голоуферментом РНК-полимеразы II, участвует в транскрипции вируса иммунодефицита человека, активируемого TAT, транскрипции типа 1 типа» . Мол Клетка. Биол . 17 (10): 6029–39. doi : 10.1128/mcb.17.10.6029 . PMC 232452 PMID 9315662 . ^ Чо Х., Орфанид Г., Сун Х, Ян XJ, Огризко В., Лис Е., Накатани Ю., Рейнберг Д. (сентябрь 1998 г.). «Комплекс РНК -полимеразы человека II, содержащий факторы, которые модифицируют структуру хроматина» . Мол Клетка. Биол . 18 (9): 5355–63. doi : 10.1128/mcb.18.9.5355 . PMC 109120 PMID 9710619 . ^ Джолиот В., Демма М., Привс Р. (февраль 1995 г.). «Взаимодействие с субъединицей RAP74 TFIIF требуется для активации транскрипции с помощью фактора отклика сыворотки». Природа . 373 (6515): 632–5. Bibcode : 1995natur.373..632J . doi : 10.1038/373632A0 . PMID 7854423 . S2CID 47196160 . ^ Zhu H, Joliot V, Prywes R (февраль 1994 г.). «Роль транскрипционного фактора TFIIF в транскрипции, активируемом фактором сывороточного отклика» . Дж. Биол. Химический 269 (5): 3489–97. doi : 10.1016/s0021-9258 (17) 41889-8 PMID 8106390 . ^ Dikstein R, Ruppert S, Tjian R (март 1996 г.). «TAFII250 - это двухпартная протеинкиназа, которая фосфорилирует основной транскрипционный фактор Rap74» . Клетка . 84 (5): 781–90. doi : 10.1016/s0092-8674 (00) 81055-7 PMID 8625415 . S2CID 18490534 . ^ Подпрыгнуть до: а беременный Ruppert S, Tjian R (ноябрь 1995 г.). «Человеческий TAFII250 взаимодействует с RAP74: последствия для инициации РНК -полимеразы II» . Гены Дев . 9 (22): 2747–55. doi : 10.1101/gad.9.22.2747 PMID 7590250 . ^ Siegert JL, Robbins PD (январь 1999 г.). «RB ингибирует внутреннюю киназную активность тата-связывающего белка фактора Tafii250» . Мол Клетка. Биол . 19 (1): 846–54. doi : 10.1128/mcb.19.1.846 . PMC 83941 PMID 9858607 . ^ Подпрыгнуть до: а беременный Малик С., Герма М., Редер Р.Г. (март 1998 г.). «Динамическая модель для функции коактиватора PC4 в транскрипции РНК -полимеразы II» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 95 (5): 2192–7. Bibcode : 1998pnas ... 95.2192M . doi : 10.1073/pnas.95.5.2192 PMC 19292 PMID 9482861 . ^ Fang SM, Burton ZF (май 1996 г.). «РНК-полимераза II-ассоциированный белок (RAP) 74 связывает фактор транскрипции (TF) IIB и блокирует связывание TFIIB-RAP30» . Дж. Биол. Химический 271 (20): 11703–9. doi : 10.1074/jbc.271.20.11703 PMID 8662660 .
Kato H, Sumimoto H, Pognonec P, Chen CH, Rosen CA, Roeder RG (1992). «ТАТ ВИЧ-1 действует как фактор процессивности in vitro в сочетании с факторами клеточного удлинения» . Гены Дев . 6 (4): 655–66. doi : 10.1101/gad.6.4.655 PMID 1559613 . Aso T, Vasavada HA, Kawaguchi T, Germino FJ, Ganguly S, Kitajima S, Weissman SM, Yasukochi Y (1992). «Характеристика кДНК для большой субъединицы фактора инициации транскрипции TFIIF». Природа . 355 (6359): 461–4. Bibcode : 1992natur.355..461a . doi : 10.1038/355461A0 . PMID 1734283 . S2CID 4312708 . Adams MD, Kerlavage AR, Fleischmann RD, Fuldner RA, Bult CJ, Lee NH, Kirkness EF, Weinstock KG, Gocayne JD, White O (1995). «Первоначальная оценка разнообразия генов человека и паттернов экспрессии на основе 83 миллионов нуклеотидов последовательности кДНК». Природа . 377 (6547 Suppl): 3–174. PMID 7566098 . Ruppert S, Tjian R (1995). «Человеческий TAFII250 взаимодействует с RAP74: последствия для инициации РНК -полимеразы II» . Гены Дев . 9 (22): 2747–55. doi : 10.1101/gad.9.22.2747 PMID 7590250 . Hysatake K, Ohta T, Takada R, Guermah M, Horikoshi M, Nakatani Y, Roeder RG (1995). «Эволюционное сохранение тата-связывающих полипептид-факторов человека и TAFII80 и взаимодействия TAFII80 с другими TAF и с общими факторами транскрипции» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 92 (18): 8195–9. Bibcode : 1995pnas ... 92.8195h . doi : 10.1073/pnas.92.18.8195 PMC 41123 PMID 7667268 . Джолиот В., Демма М., Привс Р. (1995). «Взаимодействие с субъединицей RAP74 TFIIF требуется для активации транскрипции с помощью фактора отклика сыворотки». Природа . 373 (6515): 632–5. Bibcode : 1995natur.373..632J . doi : 10.1038/373632A0 . PMID 7854423 . S2CID 47196160 . Zhu H, Joliot V, Prywes R (1994). «Роль транскрипционного фактора TFIIF в транскрипции, активируемом фактором сывороточного отклика» . Дж. Биол. Химический 269 (5): 3489–97. doi : 10.1016/s0021-9258 (17) 41889-8 PMID 8106390 . Йонаха М., Асо Т., Кобаяши Ю., Васавада Х, Ясукочи Ю., Вайсман С.М., Китажима С. (1993). «Структура домена общего коэффициента инициации транскрипции человека, TFIIF» . Нуклеиновые кислоты Res . 21 (2): 273–9. doi : 10.1093/nar/21.2.273 . PMC 309103 PMID 8441635 . Aso T, Tsai P, Kawaguchi T, Menninger JC, Kitajima S, Yasukochi Y, Ward DC, Weissman SM (1993). «Назначение гена GTF2F1 человека к хромосоме 19P13.3» . Геномика . 16 (1): 252–3. doi : 10.1006/geno.1993.1168 PMID 8486367 . Dikstein R, Ruppert S, Tjian R (1996). «TAFII250 - это двухпартная протеинкиназа, которая фосфорилирует основной транскрипционный фактор Rap74» . Клетка . 84 (5): 781–90. doi : 10.1016/s0092-8674 (00) 81055-7 PMID 8625415 . S2CID 18490534 . Fang SM, Burton ZF (1996). «РНК-полимераза II-ассоциированный белок (RAP) 74 связывает фактор транскрипции (TF) IIB и блокирует связывание TFIIB-RAP30» . Дж. Биол. Химический 271 (20): 11703–9. doi : 10.1074/jbc.271.20.11703 PMID 8662660 . McEwan IJ, Dahlman-Wright K, Ford J, Wright AP (1996). «Функциональное взаимодействие трансактивационного домена c-myc с белком, связывающим TATA: свидетельство индуцированной модели соответствия складывания трансактивации домена». Биохимия . 35 (29): 9584–93. doi : 10.1021/bi960793v . PMID 8755740 . Zhou Q, Sharp PA (1996). «TAT-SF1: кофактор для стимуляции удлинения транскрипции с помощью ВИЧ-1 ТАТ». Наука . 274 (5287): 605–10. Bibcode : 1996sci ... 274..605Z . doi : 10.1126/science.274.5287.605 . PMID 8849451 . S2CID 13266489 . Parada CA, Roeder RG (1996). «Улучшенная процессивность РНК-полимеразы II, вызванной TAT-индуцированным фосфорилированием его карбокси-концевого домена». Природа . 384 (6607): 375–8. Bibcode : 1996natur.384..375p . doi : 10.1038/384375A0 . PMID 8934526 . S2CID 4278432 . Cujec TP, Cho H, Maldonado E, Meyer J, Reinberg D, Peterlin BM (1997). «Трансактиватор вируса иммунодефицита человека TAT взаимодействует с голоуферментом РНК -полимеразы II» . Мол Клетка. Биол . 17 (4): 1817–23. doi : 10.1128/mcb.17.4.1817 . PMC 232028 PMID 9121429 . Скалли Р., Андерсон С.Ф., Чао Д.М., Вей В., Йе Л., Янг Р.А., Ливингстон Д.М., Парвин Д.Д. (1997). «BRCA1 является компонентом голоефермента РНК -полимеразы II» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 94 (11): 5605–10. Bibcode : 1997pnas ... 94.5605s . doi : 10.1073/pnas.94.11.5605 PMC 20825 PMID 9159119 . McEwan IJ, Gustafsson J (1997). «Взаимодействие функции трансактивации рецептора андрогена человека с общим фактором транскрипции TFIIF» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 94 (16): 8485–90. Bibcode : 1997pnas ... 94.8485m . doi : 10.1073/pnas.94.16.8485 PMC 22967 PMID 9238003 . Newberry EP, Latifi T, Battaile JT, Towler DA (1997). «Структурно-функциональный анализ MSX2-опосредованного транскрипционного подавления». Биохимия . 36 (34): 10451–62. doi : 10.1021/bi971008x . PMID 9265625 . О'Брайен Т., Тьян Р. (1998). «Функциональный анализ человеческого N-концевого киназного домена TAFII250» . Мол Клетка . 1 (6): 905–11. doi : 10.1016/s1097-2765 (00) 80089-1 PMID 9660973 .
показывать PDB Галерея
1f3u : CRYSTAL STRUCTURE OF THE RAP30/74 INTERACTION DOMAINS OF HUMAN TFIIF
1i27 : CRYSTAL STRUCTURE OF THE C-TERMINAL DOMAIN OF THE RAP74 SUBUNIT OF HUMAN TRANSCRIPTION FACTOR IIF (TFIIF)
1j2x : Crystal structure of RAP74 C-terminal domain complexed with FCP1 C-terminal peptide
1nha : Solution Structure of the Carboxyl-Terminal Domain of RAP74 and NMR Characterization of the FCP-Binding Sites of RAP74 and CTD of RAP74, the subunit of Human TFIIF
1onv : NMR Structure of a Complex Containing the TFIIF Subunit RAP74 and the RNAP II CTD Phosphatase FCP1
показывать
show (1) Basic domains
(1.1) Basic leucine zipper (bZIP )(1.2) Basic helix-loop-helix (bHLH )
Group A Group B Group CPAS Group D Group E Group F
(1.3) bHLH-ZIP (1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Basic helix-span-helix (bHSH)
hide (2) Zinc finger DNA-binding domains
(2.1) Nuclear receptor (Cys4 )
subfamily 1 subfamily 2 subfamily 3 subfamily 4 subfamily 5 subfamily 6 subfamily 0
(2.2) Other Cys4 (2.3) Cys2 His2 (2.4) Cys6 (2.5) Alternating composition (2.6) WRKY
show (4) β-Scaffold factors with minor groove contacts
show (0) Other transcription factors
Эта статья включает в себя текст из Национальной медицины Соединенных Штатов , которая находится в общественном доступе .
