АТФ1

АТФ1
Идентификаторы
Псевдонимы	ATF1 , EWS-FUS/ATF-1, TREB36, активирующий фактор транскрипции 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 123803 ; МГИ : 3037720 ; Гомологен : 3790 ; Генные карты : ATF1 ; ОМА : ATF1 – ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 12 (human) Band 12q13.12 Start 50,763,710 bp End 50,821,162 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. X chromosome (mouse) Band X|X A5 Start 52,885,578 bp End 52,886,387 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in germinal epithelium Skeletal muscle tissue of rectus abdominis parietal pleura amniotic fluid biceps brachii Skeletal muscle tissue of biceps brachii visceral pleura trabecular bone palpebral conjunctiva Achilles tendon Top expressed in embryo lens testicle striatum of neuraxis liver heart cerebellum More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function DNA binding sequence-specific DNA binding RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding DNA-binding transcription factor activity DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific protein binding protein heterodimerization activity transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding identical protein binding DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific protein-containing complex binding Cellular component ATF1-ATF4 transcription factor complex transcription regulator complex nucleoplasm nucleus Biological process regulation of transcription, DNA-templated response to organic cyclic compound transcription, DNA-templated positive regulation of DNA replication positive regulation of neuron projection development response to cobalt ion positive regulation of transcription by RNA polymerase II transcription by RNA polymerase II regulation of transcription by RNA polymerase II Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 466 100040260 Вместе ENSG00000123268 ENSMUSG00000080968 ЮниПрот P18846 н/д RefSeq (мРНК) НМ_005171 XM_036162179 RefSeq (белок) НП_005162 н/д Местоположение (UCSC) Чр 12: 50,76 – 50,82 Мб Chr X: 52,89 – 52,89 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Циклический АМФ-зависимый фактор транскрипции ATF-1 представляет собой белок , который у человека кодируется ATF1 геном .

Этот ген кодирует активирующий фактор транскрипции , который принадлежит к подсемейству ATF и семейству bZIP (лейциновая застежка-молния основной области). Он влияет на клеточные физиологические процессы, регулируя экспрессию нижестоящих генов-мишеней, которые связаны с ростом, выживанием и другой клеточной активностью. Этот белок фосфорилируется по серину 63 в его киназо-индуцируемом домене с помощью серин/треониновых киназ, цАМФ-зависимой протеинкиназы А, кальмодулин-зависимой протеинкиназы I/II, митоген- и стресс-активируемой протеинкиназы и циклин-зависимой киназы 3 ( CDK-3). Его фосфорилирование усиливает его трансактивационную и транскрипционную активность, а также усиливает трансформацию клеток.

Клиническое значение

Слияние этого гена и FUS на хромосоме 16 или EWSR1 на хромосоме 22, индуцированное транслокацией, приводит к образованию химерных белков при ангиоматоидной фиброзной гистиоцитоме и светлоклеточной саркоме . Этот ген имеет псевдоген на 6-й хромосоме.

См. также

• Активирующий фактор транскрипции

Взаимодействия

Было показано, что ATF1 взаимодействует с:

• БРЦА1 ,
• ЦСНК2А2 ,
• ЦСНК2А1 , и
• EWS.

Дальнейшее чтение

• Фудзимура И., Оно Т., Сиддик Х., Ли Л., Рао В.Н., Редди Э.С. (январь 1996 г.). «Ген EWS-ATF-1, участвующий в злокачественной меланоме мягких частей с транслокацией хромосомы t (12; 22), кодирует конститутивный активатор транскрипции». Онкоген . 12 (1): 159–67. ПМИД   8552387 .
• Фуджимура Ю., Сиддик Х., Ли Л., Рао В.Н., Редди Э.С. (октябрь 2001 г.). «Химерный белок EWS-ATF-1 при светлоклеточной саркоме мягких тканей связывается с CREB-связывающим белком и препятствует p53-опосредованной функции трансактивации» . Онкоген . 20 (46): 6653–9. дои : 10.1038/sj.onc.1204684 . ПМИД   11709699 .
• Рефусс Р.П., Уолтон К.М., Лорио М.М., Гудман Р.Х. (1991). «Связывающий энхансер-связывающий белок ATF-1, регулируемый цАМФ, активирует транскрипцию в ответ на цАМФ-зависимую протеинкиназу А». Ж. Биол. Хим . 266 (28): 18431–4. дои : 10.1016/S0021-9258(18)55078-X . ПМИД   1655749 .
• Ёсимура Т., Фудзисава Дж., Ёсида М. (1990). «Множественные клоны кДНК, кодирующие ядерные белки, которые связываются с зависимым от налога энхансером HTLV-1: все они содержат структуру лейциновой молнии и домен основной аминокислоты» . ЭМБО Дж . 9 (8): 2537–42. дои : 10.1002/j.1460-2075.1990.tb07434.x . ПМК   552284 . ПМИД   2196176 .
• Хай Т.В., Лю Ф., Кукос В.Дж., Грин М.Р. (1990). «Клоны кДНК транскрипционного фактора ATF: обширное семейство белков лейциновой молнии, способных избирательно образовывать ДНК-связывающие гетеродимеры» . Генс Дев . 3 (12Б): 2083–90. дои : 10.1101/gad.3.12b.2083 . ПМИД   2516827 .
• Понгубала Дж. М., Атчисон М. Л. (1995). «Активация фактора транскрипции 1 и модулятора элемента ответа циклического АМФ может модулировать активность энхансера каппа-3' иммуноглобулина» . Ж. Биол. Хим . 270 (17): 10304–13. дои : 10.1074/jbc.270.17.10304 . ПМИД   7730336 .
• Лю Ф., Томпсон М.А., Вагнер С. и др. (1993). «Активация транскрипционного фактора-1 может опосредовать активацию транскрипции, индуцируемую Ca(2+) и цАМФ» . Ж. Биол. Хим . 268 (9): 6714–20. дои : 10.1016/S0021-9258(18)53308-1 . ПМИД   8384217 .
• Дорси М.Дж., Тэ Х.Дж., Солленбергер К.Г. и др. (1996). «B-ATF: новый человеческий белок bZIP, который связывается с членами семейства транскрипционных факторов AP-1». Онкоген . 11 (11): 2255–65. ПМИД   8570175 .
• Сан П., Лу Л., Маурер Р.А. (1996). «Регуляция активации транскрипционного фактора-1 и белка, связывающего элемент ответа цАМФ, с помощью Ca2+/кальмодулин-зависимых протеинкиназ типа I, II и IV» . Ж. Биол. Хим . 271 (6): 3066–73. дои : 10.1074/jbc.271.6.3066 . ПМИД   8621702 .
• Шимомура А., Огава Ю., Китани Т. и др. (1996). «Кальмодулин-зависимая протеинкиназа II усиливает активацию транскрипции посредством активации фактора транскрипции 1, но не белка, связывающего элемент ответа цАМФ» . Ж. Биол. Хим . 271 (30): 17957–60. дои : 10.1074/jbc.271.30.17957 . ПМИД   8663317 .
• Бональдо М.Ф., Леннон Дж., Соарес М.Б. (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода к открытию генов» . Геном Рез . 6 (9): 791–806. дои : 10.1101/гр.6.9.791 . ПМИД   8889548 .
• Кобаяши М., Симомура А., Хагивара М., Каваками К. (1997). «Фосфорилирование ATF-1 усиливает его связывание с ДНК и транскрипцию промотора гена субъединицы альфа-1 Na,K-АТФазы» . Нуклеиновые кислоты Рез . 25 (4): 877–82. дои : 10.1093/нар/25.4.877 . ПМК   146500 . ПМИД   9016641 .
• Субт М.К., Маркситцер Р., Менуд П.А., Нагамин Ю. (1998). «Роль тканеспецифического транскрипционного фактора LFB3 в циклическом AMP-зависимом энхансере гена активатора плазминогена урокиназного типа в клетках LLC-PK1» . Мол. Клетка. Биол . 18 (8): 4698–706. дои : 10.1128/mcb.18.8.4698 . ПМК   109056 . ПМИД   9671480 .
• Ямагучи Ю., Вада Т., Сузуки Ф. и др. (1998). «Казеинкиназа II взаимодействует с доменами bZIP нескольких факторов транскрипции» . Нуклеиновые кислоты Рез . 26 (16): 3854–61. дои : 10.1093/нар/26.16.3854 . ПМЦ   147779 . ПМИД   9685505 .
• Пеллин А., Монтеагудо С., Лопес-Хинес С. и др. (1999). «Новый тип химерного продукта слияния генов EWS и ATFI при светлоклеточной саркоме (злокачественная меланома мягких частей)». Гены Хромосомы Рак . 23 (4): 358–60. doi : 10.1002/(SICI)1098-2264(199812)23:4<358::AID-GCC11>3.0.CO;2-3 . ПМИД   9824209 . S2CID   22927124 .
• Кабе Ю., Гото М., Шима Д. и др. (1999). «Роль человеческого MBF1 как коактиватора транскрипции» . Ж. Биол. Хим . 274 (48): 34196–202. дои : 10.1074/jbc.274.48.34196 . ПМИД   10567391 .
• Савада Дж., Симизу Н., Сузуки Ф. и др. (2000). «Синергическая активация транскрипции с помощью hGABP и избранных членов семейства белков, связывающих фактор активации транскрипции / цАМФ» . Ж. Биол. Хим . 274 (50): 35475–82. дои : 10.1074/jbc.274.50.35475 . ПМИД   10585419 .
• Уврас Ю., Бенезра М., Чжан Х. и др. (2000). «BRCA1 физически и функционально взаимодействует с ATF1» . Ж. Биол. Хим . 275 (46): 36230–7. дои : 10.1074/jbc.M002539200 . ПМИД   10945975 .
• Кнофлер М., Салех Л., Бауэр С. и др. (2000). «Промоторные элементы и факторы транскрипции, участвующие в зависимой от дифференцировки экспрессии рибонуклеиновой кислоты хорионического гонадотропина-альфа человека в терминальных ворсинчатых трофобластах» . Эндокринология . 141 (10): 3737–48. дои : 10.1210/en.141.10.3737 . ПМИД   11014230 .
• Артур Дж.С., Коэн П. (2000). «MSK1 необходим для фосфорилирования CREB в ответ на митогены в эмбриональных стволовых клетках мыши» . ФЭБС Летт . 482 (1–2): 44–8. Бибкод : 2000FEBSL.482...44A . дои : 10.1016/S0014-5793(00)02031-7 . ПМИД   11018520 . S2CID   30094202 .
• Андреуччи Дж.Дж., Грант Д., Кокс Д.М. и др. (2002). «Состав и функция транскрипционных комплексов AP-1 во время дифференцировки мышечных клеток» . Ж. Биол. Хим . 277 (19): 16426–32. дои : 10.1074/jbc.M110891200 . ПМИД   11877423 .

Внешние ссылки

• ATF1 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
• человека ATF1 Расположение генома и страница сведений о гене ATF1 в браузере генома UCSC .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .