Y -бокс -связывающий белок 1

YBX1
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	1H95
Идентификаторы
Псевдонимы	YBX1 , BP-8, CSDA2, CSDB, DBPB, MDR-NF1, NSEP-1, NSEP1, YB-1, YB1, CBF-A, EFI-A, Y-BOX-связывающий белок 1
Внешние идентификаторы	Омим : 154030 ; MGI : 99146 ; Гомологен : 88707 ; GeneCards : YBX1 ; OMA : YBX1 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	42,703,805 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 4 (mouse)
End	119,151,801 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	left testis; ; right testis; ; ganglionic eminence; ; ventricular zone; ; Achilles tendon; ; gastrocnemius muscle; ; muscle of thigh; ; skeletal muscle tissue; ; left ventricle; ; stromal cell of endometrium;
	Top expressed in
	Ileal epithelium; ; primitive streak; ; tail of embryo; ; abdominal wall; ; medial ganglionic eminence; ; endothelial cell of lymphatic vessel; ; seminiferous tubule; ; choroid plexus of fourth ventricle; ; migratory enteric neural crest cell; ; maxillary prominence;
	More reference expression data
	n/a
showДжин Онтология
Molecular function	DNA binding; DNA-binding transcription factor activity; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; protein binding; RNA binding; nucleic acid binding; GTPase binding; double-stranded DNA binding; single-stranded DNA binding; chromatin binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	cytoplasm; CRD-mediated mRNA stability complex; nuclear membrane; intracellular membrane-bounded organelle; U12-type spliceosomal complex; nucleoplasm; extracellular region; cytoplasmic stress granule; extracellular exosome; nucleus; histone pre-mRNA 3'end processing complex; cytosol; ribonucleoprotein complex;
Biological process	CRD-mediated mRNA stabilization; mRNA splicing, via spliceosome; regulation of transcription, DNA-templated; mRNA processing; transcription by RNA polymerase II; protein localization to cytoplasmic stress granule; transcription, DNA-templated; positive regulation of cell division; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; in utero embryonic development; RNA splicing; negative regulation of striated muscle cell differentiation; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; Notch signaling pathway; cellular response to interleukin-7;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	4904
	22608
	ENSG00000065978
	Ensmusg00000028639
	P67809
	P62960
	NM_004559
	NM_011732
	NP_004550
	NP_035862
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Y-бокс-связывающий белок 1, также известный как фактор транскрипции Y-бокса или чувствительный к нуклеазе белок 1, является белком , который у людей кодируется YBX1 геном . ^{[ 5 ]} YBX1 - это РНК -связывающий белок ^{[ 6 ]} Это стабилизирует РНКсенджер, модифицированные с помощью N6-метиладенозина. ^{[ 7 ]}

Клиническое значение

YBX1 является потенциальной мишенью для лекарств в терапии рака. ^{[ 8 ]} YB-1 помогает репликации аденовируса типа 5, обычно используемого вектора в генной терапии . ^{[ 8 ]} Таким образом, YB-1 может вызвать «онколитический» эффект в положительных раковых клетках YB-1, обработанных аденовирусами.

Взаимодействия

Y -бокс -связывание белок 1 1 взаимодействует с :

Ankrd2 , ^{[ 9 ]}
CTCF , ^{[ 10 ]}
P53 , ^{[ 9 ]}^{[ 11 ]}
Pcna , ^{[ 12 ]}
RBBP6 , ^{[ 13 ]} и
SFRS9 . ^{[ 14 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000065978 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000028639 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Entrezgene 4904 Ybx1 y-box-связывающий белок 1
^ Квон Э., Тодорова К., Ван Дж, Хорос Р., Ли К.К., Нил В.А. и др. (Апрель 2018). «РНК-связывающий белок YBX1 регулирует эпидермальные предшественники на посттранскрипционном уровне» . Природная связь . 9 (1): 1734. Bibcode : 2018natco ... 9.1734K . doi : 10.1038/s41467-018-04092-0 . PMC 5928080 . PMID 29712925 .
^ Feng M, Xie X, Han G, Zhang T, Li Y, Li Y, et al. (Июль 2021 г.). «YBX1 необходим для поддержания выживаемости клеток миелоидного лейкоза путем регулирования стабильности BCL2 в зависимости от M6A» . Кровь . 138 (1): 71–85. doi : 10.1182/blood.2020009676 . PMC 8667054 . PMID 33763698 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Lage H, Surowiak P, Holm PS (ноябрь 2008 г.). «[YB-1 как потенциальная мишень в терапии рака]» . DER Pathologe (на немецком языке). 29 (Suppl 2): 187–190. doi : 10.1007/s00292-008-1030-2 . PMID 18773210 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Kojic S, Medeot E, Guccione E, Krmac H, Zara I, Martinelli V, et al. (Май 2004 г.). «Белок ANKRD2, связь между саркором и ядром в скелетных мышцах». Журнал молекулярной биологии . 339 (2): 313–325. doi : 10.1016/j.jmb.2004.03.071 . PMID 15136035 .
^ Чернухин IV, Шамсуддин С., Робинсон А.Ф., Карн А.Ф., Пол А., Эль-Кади А.И. и др. (Сентябрь 2000). «Физическое и функциональное взаимодействие между двумя плюрипотентными белками, ДНК/РНК-связывающим фактором Y-Box, YB-1 и мультивалентным фактором цинкового пальца, CTCF» . Журнал биологической химии . 275 (38): 29915–29921. doi : 10.1074/jbc.m001538200 . PMID 10906122 .
^ Okamoto T, Izumi H, Imamura T, Takano H, Ise T, Uchiumi T, et al. (Декабрь 2000 г.). «Прямое взаимодействие p53 с белком, связывающим Y-бокса, YB-1: механизм регуляции экспрессии генов человека» . Онкоген . 19 (54): 6194–6202. doi : 10.1038/sj.onc.1204029 . PMID 11175333 .
^ Ise T, Nagatani G, Imamura T, Kato K, Takano H, Nomoto M, et al. (Январь 1999). «Фактор транскрипции Y-бокса, связывающий белок 1, преимущественно связывается с цисплатином-модифицированной ДНК и взаимодействует с пролиферирующим ядерным антигеном клеток». РАНКА . 59 (2): 342–346. PMID 9927044 .
^ Chibi M, Meyer M, Skepu A, G Rees DJ, Moolman-Smook JC, Pugh DJ (декабрь 2008 г.). «RBBP6 взаимодействует с многофункциональным белком YB-1 через его с доменом безымянного пальца, что приводит к убиквитинированию и протеосомной деградации YB-1». Журнал молекулярной биологии . 384 (4): 908–916. doi : 10.1016/j.jmb.2008.09.060 . PMID 18851979 .
^ Raffetseder U, Frye B, Rauen T, Jürchott K, Royer HD, Jansen PL, et al. (Май 2003 г.). «Взаимодействие фактора сплайсинга SRP30C с Y-BOX белком-1 дает ядерный шаттлин YB-1 и альтернативный выбор сайта сплайсинга» . Журнал биологической химии . 278 (20): 18241–18248. doi : 10.1074/jbc.m212518200 . PMID 12604611 .

Дальнейшее чтение

Коллури Р., Торри Т.А., Киннибург А.Дж. (январь 1992 г.). «Связывающий белок промотора CT: определение двойного цепочки и нового одноцепочечного ДНК-связывающего мотива» . Исследование нуклеиновых кислот . 20 (1): 111–116. doi : 10.1093/nar/20.1.111 . PMC 5356827 . PMID 1738588 .
Коллури Р., Киннибург А.Дж. (сентябрь 1991 г.). «Последовательность кДНК полной длины, кодирующая чувствительный к нуклеазе белок ДНК-связывающего белка» . Исследование нуклеиновых кислот . 19 (17): 4771. DOI : 10.1093/NAR/19.17.4771 . PMC 328725 . PMID 1891370 .
Сакура Х., Маекава Т., Имамото Ф., Ясуда К, она (декабрь 1988 г.). «Два человека человека, выделенные новым методом, кодируют белки ДНК-бинтод, содержащие общую область гомологии» Ген 73 (2): 499–5 Doi : 10.1016/0378-1119 (88) 90514-8 2977358PMID
Didier DK, Schiffenbauer J, Woulfe SL, Zacheis M, Schwartz BD (октябрь 1988 г.). «Характеристика кДНК, кодирующей связывание белка с основным комплексом гистосовместимости класса II Y -ящик» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 85 (19): 7322–7326. Bibcode : 1988pnas ... 85,7322d . doi : 10.1073/pnas.85.19.7322 . PMC 282178 . PMID 3174636 .
Kudo S, Mattei MG, Fukuda M (июль 1995 г.). «Характеристика гена для DBPA, члена семейства белков-связывающих нуклеиновых связывающих, содержащих домен холодного шока». Европейский журнал биохимии . 231 (1): 72–82. doi : 10.1111/j.1432-1033.1995.tb20672.x (неактивный 2024-06-08). PMID 7628487 . {{cite journal}}: CS1 Maint: doi неактивен по состоянию на июнь 2024 года ( ссылка )
Lloberas J, Maki RA, Celada A (сентябрь 1995 г.). «Репрессия основного комплекса гистосовместимости экспрессии бета-гена IA с помощью DBPA и DBPB (MYB-1) белков» . Молекулярная и клеточная биология . 15 (9): 5092–5099. doi : 10.1128/mcb.15.9.5092 . PMC 230756 . PMID 7651426 .
Чен Н.Н., Чанг С.Ф., Галлия Г.Л., Керр Д.А., Джонсон Э.М., Крачмаров С.П. и др. (Февраль 1995). «Совместное действие клеточных белков YB-1 и Pur Alpha с опухолевым антигеном человеческого полиомавируса JC определяет их взаимодействие с вирусным литическим контрольным элементом» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (4): 1087–1091. Bibcode : 1995pnas ... 92.1087c . doi : 10.1073/pnas.92.4.1087 . PMC 42642 . PMID 7862639 .
Horwitz EM, Maloney Ka, Ley TJ (май 1994). «Человеческий белок, содержащий домен« холодного шока », специфически связывается с H-ДНК вверх по течению от генов гамма-глобина человека» . Журнал биологической химии . 269 (19): 14130–14139. doi : 10.1016/s0021-9258 (17) 36764-9 . PMID 8188694 .
Kashanchi F, Duvalll JF, Dittmer J, Mireskandar A, Reid RL, Gitlin SD, et al. (Январь 1994). «Участие транскрипционного фактора YB-1 в Т-клеточном лимфотропном вирусе человека типа IB- 1 Журнал вирусологии 68 (1): 561–5 Doi : 10.1128/ jvi.68.1.561-5 236322PMC 8254772PMID
Makino Y, Ohga T, Toh S, Koike K, Okumura K, Wada M, et al. (Май 1996). «Структурный и функциональный анализ гена-промотора, связывающего Y-бокс человека (YB-1)» . Исследование нуклеиновых кислот . 24 (10): 1873–1878. doi : 10.1093/nar/24.10.1873 . PMC 145870 . PMID 8657568 .
Funke B, Zuleger B, Benavente R, Schuster T, Goller M, Stévenin J, et al. (Октябрь 1996). «Мышиный поли (C)-связывающий белок существует в нескольких изоформах и взаимодействует с несколькими РНК-связывающими белками» . Исследование нуклеиновых кислот . 24 (19): 3821–3828. doi : 10.1093/nar/24.19.3821 . PMC 146158 . PMID 8871564 .
Koike K, Uchiumi T, Ohga T, Toh S, Wada M, Kohno K, et al. (Ноябрь 1997). «Ядерная транслокация белка, связывающего Y-Box путем ультрафиолетового облучения» . Письма Febs . 417 (3): 390–394. Bibcode : 1997febsl.417..390k . doi : 10.1016/s0014-5793 (97) 01296-9 . PMID 9409758 . S2CID 24656107 .
Toh S, Nakamura T, Ohga T, Koike K, Uchiumi T, Wada M, et al. (Январь 1998). «Геномная организация гена белка Y-бокса человека (YB-1)». Ген . 206 (1): 93–97. doi : 10.1016/s0378-1119 (97) 00570-2 . PMID 9461420 .
Sawaya BE, Khalili K, Amini S (февраль 1998 г.). «Транскрипция промотора вируса иммунодефицита человека типа 1 (ВИЧ-1) в клетках центральной нервной системы: влияние YB-1 на экспрессию длительного повторения ВИЧ-1 терминала» . Журнал общей вирусологии . 79. 79 (Pt 2) (2): 239–246. doi : 10.1099/0022-1317-79-2-239 . PMID 9472608 .
Mertens PR, Alfonso-Jaume MA, Steinmann K, Lovett DH (декабрь 1998 г.). «Синергетическое взаимодействие транскрипционных факторов AP2 и YB-1 регулирует транскрипцию, зависящую от энхансеры,» . Журнал биологической химии . 273 (49): 32957–32965. doi : 10.1074/jbc.273.49.32957 . PMID 9830047 .
Ise T, Nagatani G, Imamura T, Kato K, Takano H, Nomoto M, et al. (Январь 1999). «Фактор транскрипции Y-бокса, связывающий белок 1, преимущественно связывается с цисплатином-модифицированной ДНК и взаимодействует с пролиферирующим ядерным антигеном клеток». РАНКА . 59 (2): 342–346. PMID 9927044 .
Safak M, Gallia GL, Khalili K (апрель 1999 г.). «Взаимное взаимодействие между двумя клеточными белками, Puralpha и YB-1 модулирует транскрипционную активность JCVCY в глиальных клетках» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (4): 2712–2723. doi : 10.1128/mcb.19.4.2712 . PMC 84064 . PMID 10082537 .
Келм Р.Дж., Коган Дж. Г., Старейшина П.К., Страух А.Р., Гетц М.Дж. (май 1999). «Молекулярные взаимодействия между одноцепочечными ДНК-связывающими белками, связанными с незаменимым элементом MCAT в промоторе альфа-актина гладких мышц» . Журнал биологической химии . 274 (20): 14238–14245. doi : 10.1074/jbc.274.20.14238 . PMID 10318844 .
Sapak M, GL, Simons In, Chalili K (декабрь 1999 г.). Jc virus . Журнал вирусологии 73 (12): 10146–10157. doi : 10.1128/jvi.73.12.12.146-1015.159 . 113067PMC PMID 10559300 .
Алисс В.Н., Сапак М., Г.Л., Г.Л., Саммер Б.Е., Советы С., Калили К (октябрь 1999). Полем Журнал . 80. 80 (Pt 10) (10: 2629–2 doi : 10.1099/ 0022-1317-80-10-2 PMID 10573156 .
Basaki Y, Hosoi F, Oda Y, Fotovati A, Maruyama Y, Oie S, et al. (Апрель 2007 г.). «AKT-зависимая ядерная локализация Y-BOX-связывающего белка 1 при приобретении злокачественных характеристик клетками рака яичников человека» . Онкоген . 26 (19): 2736–2746. doi : 10.1038/sj.onc.1210084 . PMID 17072343 .

Внешние ссылки

YBX1+белок,+человек в Национальной медицинской библиотеке Медицинской библиотеки США (Mesh)

Эта статья включает в себя текст из Национальной медицины Соединенных Штатов , которая находится в общественном доступе .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000065978 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000028639 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[5] Entrezgene 4904 Ybx1 y-box-связывающий белок 1

[Kwon_2018-6] Квон Э., Тодорова К., Ван Дж, Хорос Р., Ли К.К., Нил В.А. и др. (Апрель 2018). «РНК-связывающий белок YBX1 регулирует эпидермальные предшественники на посттранскрипционном уровне» . Природная связь . 9 (1): 1734. Bibcode : 2018natco ... 9.1734K . doi : 10.1038/s41467-018-04092-0 . PMC 5928080 . PMID 29712925 .

[7] Feng M, Xie X, Han G, Zhang T, Li Y, Li Y, et al. (Июль 2021 г.). «YBX1 необходим для поддержания выживаемости клеток миелоидного лейкоза путем регулирования стабильности BCL2 в зависимости от M6A» . Кровь . 138 (1): 71–85. doi : 10.1182/blood.2020009676 . PMC 8667054 . PMID 33763698 .

[Lage_2008-8] Jump up to: ^а ^{беременный} Lage H, Surowiak P, Holm PS (ноябрь 2008 г.). «[YB-1 как потенциальная мишень в терапии рака]» . DER Pathologe (на немецком языке). 29 (Suppl 2): 187–190. doi : 10.1007/s00292-008-1030-2 . PMID 18773210 .

[pmid15136035-9] Jump up to: ^а ^{беременный} Kojic S, Medeot E, Guccione E, Krmac H, Zara I, Martinelli V, et al. (Май 2004 г.). «Белок ANKRD2, связь между саркором и ядром в скелетных мышцах». Журнал молекулярной биологии . 339 (2): 313–325. doi : 10.1016/j.jmb.2004.03.071 . PMID 15136035 .

[pmid10906122-10] Чернухин IV, Шамсуддин С., Робинсон А.Ф., Карн А.Ф., Пол А., Эль-Кади А.И. и др. (Сентябрь 2000). «Физическое и функциональное взаимодействие между двумя плюрипотентными белками, ДНК/РНК-связывающим фактором Y-Box, YB-1 и мультивалентным фактором цинкового пальца, CTCF» . Журнал биологической химии . 275 (38): 29915–29921. doi : 10.1074/jbc.m001538200 . PMID 10906122 .

[pmid11175333-11] Okamoto T, Izumi H, Imamura T, Takano H, Ise T, Uchiumi T, et al. (Декабрь 2000 г.). «Прямое взаимодействие p53 с белком, связывающим Y-бокса, YB-1: механизм регуляции экспрессии генов человека» . Онкоген . 19 (54): 6194–6202. doi : 10.1038/sj.onc.1204029 . PMID 11175333 .

[pmid9927044-12] Ise T, Nagatani G, Imamura T, Kato K, Takano H, Nomoto M, et al. (Январь 1999). «Фактор транскрипции Y-бокса, связывающий белок 1, преимущественно связывается с цисплатином-модифицированной ДНК и взаимодействует с пролиферирующим ядерным антигеном клеток». РАНКА . 59 (2): 342–346. PMID 9927044 .

[pmid18851979-13] Chibi M, Meyer M, Skepu A, G Rees DJ, Moolman-Smook JC, Pugh DJ (декабрь 2008 г.). «RBBP6 взаимодействует с многофункциональным белком YB-1 через его с доменом безымянного пальца, что приводит к убиквитинированию и протеосомной деградации YB-1». Журнал молекулярной биологии . 384 (4): 908–916. doi : 10.1016/j.jmb.2008.09.060 . PMID 18851979 .

[pmid12604611-14] Raffetseder U, Frye B, Rauen T, Jürchott K, Royer HD, Jansen PL, et al. (Май 2003 г.). «Взаимодействие фактора сплайсинга SRP30C с Y-BOX белком-1 дает ядерный шаттлин YB-1 и альтернативный выбор сайта сплайсинга» . Журнал биологической химии . 278 (20): 18241–18248. doi : 10.1074/jbc.m212518200 . PMID 12604611 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]