IRF7

IRF7
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	2O61
Идентификаторы
Псевдонимы	IRF7 , IRF-7H, IRF7A, IRF7B, IRF7C, IRF7H, IMD39, регуляторный фактор интерферона 7, IRF-7
Внешние идентификаторы	Опустить : 605047 ; МГИ : 1859212 ; Гомологен : 128624 ; Генные карты : IRF7 ; ОМА : IRF7 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 11 (human)
End	615,983 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	140,846,394 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	granulocyte; ; blood; ; right lobe of liver; ; spleen; ; monocyte; ; mucosa of transverse colon; ; apex of heart; ; lymph node; ; bone marrow; ; bone marrow cells;
	Top expressed in
	granulocyte; ; gastrula; ; blood; ; mucous cell of stomach; ; ileum; ; jejunum; ; duodenum; ; large intestine; ; colon; ; thymus;
	More reference expression data
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	DNA binding; DNA-binding transcription factor activity; protein binding; RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding; transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; cis-regulatory region sequence-specific DNA binding;
Cellular component	nucleoplasm; endosome membrane; nucleus; cytoplasm; cytosol;
Biological process	positive regulation of type I interferon-mediated signaling pathway; regulation of transcription, DNA-templated; positive regulation of interferon-alpha production; MDA-5 signaling pathway; interferon-gamma-mediated signaling pathway; immune system process; regulation of adaptive immune response; response to virus; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; transcription by RNA polymerase II; transcription, DNA-templated; regulation of type I interferon production; cellular response to DNA damage stimulus; TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway; positive regulation of transcription, DNA-templated; negative regulation of macrophage apoptotic process; type I interferon signaling pathway; immunoglobulin mediated immune response; establishment of viral latency; regulation of immune response; viral process; regulation of monocyte differentiation; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; positive regulation of interferon-beta production; interferon-beta production; regulation of MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway; positive regulation of type I interferon production; innate immune response; regulation of MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway; interferon-alpha production; defense response to virus; regulation of gene expression;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	3665
	54123
	ENSG00000276561 ; ENSG00000185507
	ENSMUSG00000025498
	Q92985
	P70434
	НМ_001572 ; НМ_004029 ; НМ_004030 ; НМ_004031
	НМ_001252600 ; НМ_001252601 ; НМ_016850
	НП_001563 ; НП_004020 ; НП_004022
	НП_001239529 ; НП_001239530 ; НП_058546
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Регуляторный фактор интерферона 7 , также известный как IRF7 , является членом семейства регулирующих интерферон транскрипционных факторов, .

Функция

IRF7 кодирует регуляторный фактор интерферона 7, член семейства регуляторных факторов транскрипции интерферона (IRF). Было показано, что IRF7 играет роль в активации транскрипции индуцируемых вирусом клеточных генов , включая гены интерферона I типа . В частности, IRF7 регулирует многие интерферона-альфа . гены ^{[ 5 ]} Конститутивная экспрессия IRF7 в значительной степени ограничена лимфоидной тканью , в основном плазмоцитоидными дендритными клетками, тогда как IRF7 индуцируется во многих тканях. Было идентифицировано множество вариантов транскрипта IRF7, хотя их функциональные последствия еще не установлены. ^{[ 6 ]}

Было показано, что путь IRF7 подавляется в некоторых клеточных линиях метастатического рака молочной железы, что может помочь клеткам избежать иммунного ответа хозяина. ^{[ 7 ]} Восстановление IRF7 в этих клеточных линиях уменьшило метастазы и увеличило время выживания хозяина на животных моделях.

Было показано, что ген и продукт IRF7 дефектны у пациента с тяжелой восприимчивостью к гриппу H1N1 , в то время как восприимчивость к другим вирусным заболеваниям, таким как ЦМВ, РСВ и парагрипп , не была затронута. ^{[ 8 ]}

Взаимодействия

Было показано, что IRF7 взаимодействует с IRF3 . ^{[ 9 ]} Кроме того, было показано, что IRF7 взаимодействует с белком, взаимодействующим с арилуглеводородными рецепторами (AIP) , который является негативным регулятором противовирусного пути. ^{[ 10 ]}

См. также

Факторы регуляции интерферона

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ENSG00000185507 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000276561, ENSG00000185507 — Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025498 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Мари I, Дурбин Дж. Э., Леви Д. Е. (ноябрь 1998 г.). «Дифференциальная вирусная индукция различных генов интерферона-альфа посредством положительной обратной связи через регуляторный фактор интерферона-7» . Журнал ЭМБО . 17 (22): 6660–9. дои : 10.1093/emboj/17.22.6660 . ПМК 1171011 . ПМИД 9822609 .
^ «Ген Энтрез: регуляторный фактор интерферона 7 IRF7» .
^ Бидуэлл (2012). «Замалчивание путей Irf7 в клетках рака молочной железы способствует метастазированию в кости за счет ускользания от иммунитета». Природная медицина . 18 (8): 1224–1231. дои : 10.1038/нм.2830 . ПМИД 22820642 . S2CID 6727932 .
^ Чианканелли М.Дж., Хуанг С.Х., Лутра П., Гарнер Х., Итан Ю., Вольпи С., Лафай Ф.Г., Труйе С., Шмолке М., Альбрехт Р.А., Исраэльссон Е., Лим Х.К., Касадио М., Хермеш Т., Лоренцо Л., Люнг Л.В., Педерньяна В. , Буассон Б, Окада С, Пикард С, Рингье Б, Труссье Ф, Шосабель Д, Абель Л, Пелье И, Нотаранджело ЛД, Гарсиа-Састре А, Баслер КФ, Гейссманн Ф, Чжан СЮ, Сноек Х.В., Казанова Дж.Л. (апрель 2015 г.) ). «Инфекционное заболевание. Опасный для жизни грипп и нарушение амплификации интерферона при дефиците IRF7 у человека» . Наука . 348 (6233): 448–53. дои : 10.1126/science.aaa1578 . ПМЦ 4431581 . ПМИД 25814066 .
^ Au WC, Yeow WS, Pitha PM (февраль 2001 г.). «Анализ функциональных доменов регуляторного фактора интерферона 7 и его связи с IRF-3» . Вирусология . 280 (2): 273–82. дои : 10.1006/виро.2000.0782 . ПМИД 11162841 .
^ Чжоу К., Лаворна А., Боуман М., Хискотт Дж., Хархадж Э.В. (июнь 2015 г.). «Белок, взаимодействующий с арильным углеводородным рецептором, нацелен на IRF7 для подавления противовирусной передачи сигналов и индукции интерферона I типа» . Журнал биологической химии . 290 (23): 14729–39. дои : 10.1074/jbc.M114.633065 . ПМЦ 4505538 . ПМИД 25911105 .

Дальнейшее чтение

Нин С., Пагано Дж.С., Барбер Г.Н. (сентябрь 2011 г.). «IRF7: активация, регулирование, модификация и функции» . Гены и иммунитет . 12 (6): 399–414. дои : 10.1038/gen.2011.21 . ПМЦ 4437765 . ПМИД 21490621 .
Пита П.М., Ау В.К., Лоутер В., Хуанг Ю.Т., Шафер С.Л., Бурысек Л., Хискотт Дж., Мур П.А. (1999). «Роль факторов регуляции интерферона (IRF) в вирусопосредованной передаче сигналов и регуляции роста клеток» . Биохимия . 80 (8–9): 651–8. дои : 10.1016/S0300-9084(99)80018-2 . ПМИД 9865487 .
Чжан Л., Пагано Дж.С. (январь 2002 г.). «Структура и функции ИРФ-7». Журнал исследований интерферона и цитокинов . 22 (1): 95–101. дои : 10.1089/107999002753452700 . ПМИД 11846980 .
Чжан Л., Пагано Дж.С. (октябрь 1997 г.). «IRF-7, новый регуляторный фактор интерферона, связанный с латентным периодом вируса Эпштейна-Барр» . Молекулярная и клеточная биология . 17 (10): 5748–57. дои : 10.1128/MCB.17.10.5748 . ПМК 232423 . ПМИД 9315633 .
Уотелет М.Г., Лин Ч.Х., Парех Б.С., Ронко Л.В., Хоули П.М., Маниатис Т. (март 1998 г.). «Вирусная инфекция индуцирует сборку координально активированных факторов транскрипции на энхансере IFN-бета in vivo» . Молекулярная клетка . 1 (4): 507–18. дои : 10.1016/S1097-2765(00)80051-9 . ПМИД 9660935 .
Au WC, Мур П.А., ЛаФлер Д.В., Томбал Б., Пита П.М. (октябрь 1998 г.). «Характеристика регуляторного фактора интерферона-7 и его потенциальная роль в активации транскрипции генов интерферона А» . Журнал биологической химии . 273 (44): 29210–7. дои : 10.1074/jbc.273.44.29210 . ПМИД 9786932 .
Лу Р., Ау В.К., Йеоу В.С., Хагеман Н., Пита П.М. (октябрь 2000 г.). «Регуляция промоторной активности гена регуляторного фактора интерферона-7. Активация интерфероном и подавление гиперметилированием» . Журнал биологической химии . 275 (41): 31805–12. дои : 10.1074/jbc.M005288200 . ПМИД 10924517 .
Пэрис М.Дж., Уильямс Б.Р. (октябрь 2000 г.). «Характеристика контига размером 500 КБ, охватывающего область между c-Ha-Ras и MUC2 на хромосоме 11p15.5». Геномика . 69 (2): 196–202. дои : 10.1006/geno.2000.6339 . ПМИД 11031102 .
Мари И, Смит Э., Пракаш А., Леви Д.Е. (декабрь 2000 г.). «Индуцированная фосфорилированием димеризация регуляторного фактора интерферона 7 демаскирует связывание ДНК и двудольный домен трансактивации» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (23): 8803–14. дои : 10.1128/MCB.20.23.8803-8814.2000 . ПМК 86519 . ПМИД 11073981 .
Смит Э.Дж., Мари И., Пракаш А., Гарсиа-Састре А., Леви Д.Е. (март 2001 г.). «Фосфорилирование IRF3 и IRF7 в инфицированных вирусом клетках не требует двухцепочечной РНК-зависимой протеинкиназы R или киназы Ikappa B, но блокируется белком E3L вируса коровьей оспы» . Журнал биологической химии . 276 (12): 8951–7. дои : 10.1074/jbc.M008717200 . ПМИД 11124948 .
Au WC, Yeow WS, Pitha PM (февраль 2001 г.). «Анализ функциональных доменов регуляторного фактора интерферона 7 и его связи с IRF-3» . Вирусология . 280 (2): 273–82. дои : 10.1006/виро.2000.0782 . ПМИД 11162841 .
Лу Р., Мур П.А., Пита П.М. (май 2002 г.). «Стимуляция экспрессии гена IRF-7 фактором некроза опухоли альфа: потребность в факторе транскрипции NFkappa B и доступность гена» . Журнал биологической химии . 277 (19): 16592–8. дои : 10.1074/jbc.M111440200 . ПМИД 11877397 .
Морин П., Браганса Дж., Банду М.Т., Лин Р., Хискотт Дж., Доли Дж., Сивас А. (март 2002 г.). «Преимущественные сайты связывания регуляторных факторов интерферона 3 и 7, участвующих в транскрипции гена интерферона-А». Журнал молекулярной биологии . 316 (5): 1009–22. дои : 10.1006/jmbi.2001.5401 . ПМИД 11884139 .
Кайо А., Пракаш А., Смит Э., Масуми А., Ованесян А.Г., Леви Д.Е., Мари I (декабрь 2002 г.). «Ацетилирование регуляторного фактора интерферона-7 фактором, связанным с p300/CREB-связывающим белком (CBP) (PCAF), ухудшает его связывание с ДНК» . Журнал биологической химии . 277 (51): 49417–21. дои : 10.1074/jbc.M207484200 . ПМИД 12374802 .
Измайлова Э., Бертли Ф.М., Хуанг К., Макори Н., Миллер С.Дж., Янг Р.А., Альдовини А. (февраль 2003 г.). «Тат ВИЧ-1 перепрограммирует незрелые дендритные клетки для экспрессии хемоаттрактантов для активированных Т-клеток и макрофагов». Природная медицина . 9 (2): 191–7. дои : 10.1038/nm822 . ПМИД 12539042 . S2CID 26145639 .
Ян Х., Линь Ч., Ма Г., Баффи М.О., Уотелет М.Г. (май 2003 г.). «Регуляторный фактор интерферона-7 синергизирует с другими факторами транскрипции посредством множественных взаимодействий с коактиваторами p300/CBP» . Журнал биологической химии . 278 (18): 15495–504. дои : 10.1074/jbc.M212940200 . ПМИД 12604599 .
Нин С., Хан А.М., Хьюе Л.Е., Пагано Дж.С. (сентябрь 2003 г.). «Регуляторный фактор интерферона 7 регулирует экспрессию латентного мембранного белка 1 вируса Эпштейна-Барра: регуляторный контур» . Журнал вирусологии . 77 (17): 9359–68. doi : 10.1128/JVI.77.17.9359-9368.2003 . ЧВК 187426 . ПМИД 12915551 .
Фицджеральд К.А., Роу Д.С., Барнс Б.Дж., Кэффри Д.Р., Висинтин А., Латц Е., Монкс Б., Пита П.М., Голенбок Д.Т. (октябрь 2003 г.). «Передача сигналов LPS-TLR4 на IRF-3/7 и NF-kappaB включает платные адаптеры TRAM и TRIF» . Журнал экспериментальной медицины . 198 (7): 1043–55. дои : 10.1084/jem.20031023 . ПМК 2194210 . ПМИД 14517278 .
Лин Р., Нойс Р.С., Коллинз С.Е., Эверетт Р.Д., Моссман К.Л. (февраль 2004 г.). «Домен пальца RING ICP0 вируса простого герпеса ингибирует IRF3- и IRF7-опосредованную активацию стимулируемых интерфероном генов» . Журнал вирусологии . 78 (4): 1675–84. doi : 10.1128/JVI.78.4.1675-1684.2004 . ПМК 369457 . ПМИД 14747533 .

Внешние ссылки

СМИ, связанные с регуляторным фактором интерферона-7, на Викискладе?
IRF7 + белок, + человек Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 11 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с ENSG00000185507 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000276561, ENSG00000185507 — Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025498 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9822609-5] Мари I, Дурбин Дж. Э., Леви Д. Е. (ноябрь 1998 г.). «Дифференциальная вирусная индукция различных генов интерферона-альфа посредством положительной обратной связи через регуляторный фактор интерферона-7» . Журнал ЭМБО . 17 (22): 6660–9. дои : 10.1093/emboj/17.22.6660 . ПМК 1171011 . ПМИД 9822609 .

[entrez-6] «Ген Энтрез: регуляторный фактор интерферона 7 IRF7» .

[7] Бидуэлл (2012). «Замалчивание путей Irf7 в клетках рака молочной железы способствует метастазированию в кости за счет ускользания от иммунитета». Природная медицина . 18 (8): 1224–1231. дои : 10.1038/нм.2830 . ПМИД 22820642 . S2CID 6727932 .

[8] Чианканелли М.Дж., Хуанг С.Х., Лутра П., Гарнер Х., Итан Ю., Вольпи С., Лафай Ф.Г., Труйе С., Шмолке М., Альбрехт Р.А., Исраэльссон Е., Лим Х.К., Касадио М., Хермеш Т., Лоренцо Л., Люнг Л.В., Педерньяна В. , Буассон Б, Окада С, Пикард С, Рингье Б, Труссье Ф, Шосабель Д, Абель Л, Пелье И, Нотаранджело ЛД, Гарсиа-Састре А, Баслер КФ, Гейссманн Ф, Чжан СЮ, Сноек Х.В., Казанова Дж.Л. (апрель 2015 г.) ). «Инфекционное заболевание. Опасный для жизни грипп и нарушение амплификации интерферона при дефиците IRF7 у человека» . Наука . 348 (6233): 448–53. дои : 10.1126/science.aaa1578 . ПМЦ 4431581 . ПМИД 25814066 .

[pmid11162841-9] Au WC, Yeow WS, Pitha PM (февраль 2001 г.). «Анализ функциональных доменов регуляторного фактора интерферона 7 и его связи с IRF-3» . Вирусология . 280 (2): 273–82. дои : 10.1006/виро.2000.0782 . ПМИД 11162841 .

[10] Чжоу К., Лаворна А., Боуман М., Хискотт Дж., Хархадж Э.В. (июнь 2015 г.). «Белок, взаимодействующий с арильным углеводородным рецептором, нацелен на IRF7 для подавления противовирусной передачи сигналов и индукции интерферона I типа» . Журнал биологической химии . 290 (23): 14729–39. дои : 10.1074/jbc.M114.633065 . ПМЦ 4505538 . ПМИД 25911105 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]