Jump to content

ГЛИ1

(Перенаправлено с Gli1 )

ГЛИ1
Доступные структуры
ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы GLI1 , GLI, цинковый палец семейства GLI 1, PAPA8, PPD1
Внешние идентификаторы Опустить : 165220 ; МГИ : 95727 ; Гомологен : 3859 ; Генные карты : GLI1 ; ОМА : GLI1 — ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Вместе
ЮниПрот
RefSeq (мРНК)

НМ_001160045
НМ_001167609
НМ_005269

НМ_010296

RefSeq (белок)

НП_001153517
НП_001161081
НП_005260

НП_034426

Местоположение (UCSC) Чр 12: 57,46 – 57,47 Мб Чр 10: 127,17 – 127,18 Мб
в PubMed Поиск [ 3 ] [ 4 ]
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Белок цинковых пальцев GLI1, также известный как онкоген, связанный с глиомой, представляет собой белок , который у человека кодируется геном GLI1 . Первоначально он был выделен из глиобластомы человека. клеток [ 5 ]

Белки Gli являются эффекторами передачи сигналов Hedgehog (Hh) и, как было показано, участвуют в определении судьбы клеток , пролиферации и формировании паттерна во многих типах клеток и большинстве органов во время развития эмбриона . [ 6 ] В развивающемся спинном мозге гены-мишени белков Gli, которые сами являются факторами транскрипции, организованы в сложную генную регуляторную сеть, которая транслирует градиент внеклеточной концентрации Sonic hedgehog в различные клеточные судьбы вдоль дорсовентральной оси. [ 7 ]

Gli Факторы транскрипции активируют/ингибируют транскрипцию путем связывания с генами, чувствительными к Gli, и путем взаимодействия с транскрипционным комплексом. Факторы транскрипции Gli имеют ДНК- связывающие домены цинковых пальцев , которые связываются с консенсусными последовательностями своих генов-мишеней, инициируя или подавляя транскрипцию. [ 8 ] Юн [ 9 ] показали, что мутация домена цинкового пальца Gli ингибирует эффект белков, что доказывает его роль в качестве фактора транскрипции. Белки Gli имеют область из 18 аминокислот, очень похожую на домен активации α-спирального белка 16 вируса простого герпеса. Этот домен содержит элемент консенсусного распознавания человеческого TFIID TATA-бокс -связывающего белка, связанного с фактором TAFII31. [ 9 ] Было показано, что другие белки, такие как Missing in Metastasis (MIM/BEG4), усиливают влияние факторов транскрипции Gli на транскрипцию гена-мишени. Было показано, что Gli и MIM действуют синергически, индуцируя рост эпидермиса, а графты со сверхэкспрессией MIM + Gli1 демонстрируют сходные модели роста с трансплантатами Shh. [ 10 ]

В семье три члена; Gli1, Gli2 и Gli3, которые являются факторами транскрипции, опосредующими путь Hh. Гены GLI1, GLI2 и GLI3 кодируют факторы транскрипции, все из которых содержат консервативные тандемные домены C2-H2 «цинковых пальцев» и консенсусную последовательность гистидин / цистеинового линкера между цинковыми пальцами. Этот мотив Gli родственен мотиву Kruppel, который является геном сегментации дрозофилы класса разрыва. [ 11 ] У трансгенных мышей мутант Gli1, лишенный цинковых пальцев, не индуцирует мишени Sonic Hedgehog (Shh). [ 12 ] Консервативный участок из 9 аминокислот соединяет С-концевой гистидин одного пальца с N-концевым цистеином другого. Консенсусная аминокислотная последовательность пальцев GLI представляет собой [Y/F]JXCX3GCX3[F/Y]X5LX2HX4H[T/S]GEKP. [ 11 ] связывающий домен цинкового пальца белков Gli1 и Gli2 ДНК- Было показано, что связывается с консенсусным сайтом связывания GLI ДНК GACCACCCA. [ 13 ]

Регуляция транскрипции белков Gli является тканеспецифичной для многих мишеней. Например, Gli1 в первичных кератиноцитах активирует FOXM1. [ 14 ] тогда как в мезенхимальных клетках C3H10T1/2 было показано, что он активирует рецептор фактора роста тромбоцитов PDGFra. [ 15 ]

Человеческий Gli1 кодирует активатор транскрипции, участвующий в развитии, который является известным онкогеном . [ 9 ] [ 16 ] Было обнаружено, что N-концевые области Gli1 рекрутируют комплексы гистондеацетилазы через SuFu, которые участвуют в ДНК сворачивании в хромосомах . [ 17 ] Это может отрицательно регулировать транскрипцию, указывая на то, что Gli1 может действовать как ингибитор транскрипции, а также как активатор. [ 18 ] Область промотора GLI1 человека регулируется 5'-областью размером 1,4 т.п.н., включающей 5'-фланкирующую последовательность, нетранслируемый экзон и 425 пар оснований первого интрона. Многочисленные белки, такие как Sp1, USF1, USF2 и Twist, также участвуют в регуляции промотора Gli1. [ 19 ] [ 20 ] [ 21 ] Во время развития эмбриона мыши экспрессия Gli1 может быть обнаружена в мезодерме кишечника, вентральной части нервной трубки, эпендимальном слое спинного мозга, переднем мозге, среднем мозге, мозжечке и в местах формирования эндохондральной кости. [ 22 ] [ 23 ] [ 24 ] Некоторые из последующих генов-мишеней человеческого Gli1 включают регуляторы клеточного цикла и апоптоза, такие как циклин D2 и плакоглобин соответственно. [ 25 ] Gli1 также активирует FoxM1 в BCC. [ 14 ] Экспрессия Gli1 также может имитировать экспрессию Shh в определенных типах клеток. [ 26 ]

Изоляция

[ редактировать ]

глиомы GLI1 был первоначально выделен из опухоли , и было обнаружено, что его повышенная регуляция наблюдается во многих опухолях, включая опухоли мышц, головного мозга и кожи, такие как базальноклеточная карцинома (BCC). [ 27 ] Изменения числа копий ДНК, которые способствуют усилению превращения онкогенов Gli1–3 в активаторы транскрипции с помощью сигнального пути Hedgehog, включены в общегеномный паттерн, который, как было обнаружено, коррелирует с исходом у пациента с астроцитомой. [ 28 ] Гены Shh и Gli обычно экспрессируются в волосяных фолликулах , а опухоли кожи, экспрессирующие Gli1, могут возникать из волосяных фолликулов. Уровень экспрессии Gli1 коррелирует со степенью опухоли при саркомах костей и мягких тканей . [ 29 ] У трансгенных мышей и лягушек, сверхэкспрессирующих Gli1, развиваются опухоли, подобные BCC, а также другие неоплазии, происходящие из волосяных фолликулов, такие как трихоэпителиомы, цилиндромы и трихобластомы. [ 26 ] [ 30 ] Экспрессия Gli1 в эпидермисе эмбрионов лягушки приводит к развитию опухолей , экспрессирующих эндогенный Gli1. Это говорит о том, что одного сверхэкспрессированного Gli1, вероятно, достаточно для развития опухоли. [ 30 ] [ 31 ] мутации, приводящие к экспрессии Gli1 в базальных клетках, индуцируют образование BCC. Таким образом, прогнозируется, что [ 26 ]

Взаимодействия

[ редактировать ]

Было показано, что GLI1 взаимодействует с:

  1. ^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000111087 Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ Перейти обратно: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025407 Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Кинзлер К.В., Бигнер С.Х., Бигнер Д.Д., Трент Дж.М., Лоу М.Л., О'Брайен С.Дж., Вонг А.Дж., Фогельштейн Б. (апрель 1987 г.). «Идентификация амплифицированного, высоковыраженного гена в глиоме человека». Наука . 236 (4797): 70–3. Бибкод : 1987Sci...236...70K . дои : 10.1126/science.3563490 . ПМИД   3563490 .
  6. ^ Руис и Альтаба А (июнь 1999 г.). «Белки Gli кодируют контекстно-зависимые положительные и отрицательные функции: значение для развития и болезней». Разработка . 126 (14): 3205–16. дои : 10.1242/dev.126.14.3205 . ПМИД   10375510 .
  7. ^ Ловрич А., Гао И., Юхас Б., Бок И., Бирн Х.М., Диньес А., Ковач К.А. (ноябрь 2014 г.). «Булево моделирование выявляет новые регуляторные связи между факторами транскрипции, управляющими развитием вентральной части спинного мозга» . ПЛОС ОДИН . 9 (11): 11430. Бибкод : 2014PLoSO...9k1430L . дои : 10.1371/journal.pone.0111430 . ПМЦ   4232242 . ПМИД   25398016 .
  8. ^ Сасаки Х., Хуэй С., Накафуку М., Кондо Х. (апрель 1997 г.). «Сайт связывания белков Gli необходим для активности энхансера пластинки дна HNF-3beta у трансгенных животных и может реагировать на Shh in vitro». Разработка . 124 (7): 1313–22. дои : 10.1242/dev.124.7.1313 . ПМИД   9118802 .
  9. ^ Перейти обратно: а б с Лю Ч.З., Ян Дж.Т., Юн Дж.В., Вильявисенсио Э., Пфендлер К., Уолтерхаус Д., Ианнакконе П. (март 1998 г.). «Характеристика промоторной области и геномной организации GLI, члена сигнального пути Sonic hedgehog-Patched». Джин . 209 (1–2): 1–11. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00668-9 . ПМИД   9524201 .
  10. ^ Каллахан Калифорния, Офстад Т., Хорнг Л., Ван Дж.К., Чжэнь Х.Х., Куломб П.А., Оро А.Е. (ноябрь 2004 г.). «MIM/BEG4, ген, чувствительный к Sonic hedgehog, который усиливает Gli-зависимую транскрипцию» . Генс Дев . 18 (22): 2724–9. дои : 10.1101/gad.1221804 . ПМК   528890 . ПМИД   15545630 .
  11. ^ Перейти обратно: а б Руперт Дж.М., Кинцлер К.В., Вонг А.Дж., Бигнер Ш., Као Ф.Т., Лоу М.Л., Сеуанес Х.Н., О'Брайен С.Дж., Фогельштейн Б. (август 1988 г.). «Семейство генов человека GLI-Kruppel» . Мол Клеточная Биол . 8 (8): 3104–13. дои : 10.1128/mcb.8.8.3104 . ПМЦ   363537 . ПМИД   2850480 .
  12. ^ Пак Х.Л., Бай С., Платт К.А., Матис М.П., ​​Бигли А., Хуэй К.С., Накашима М., Джойнер А.Л. (апрель 2000 г.). «Мутанты Gli1 мыши жизнеспособны, но имеют дефекты передачи сигналов SHH в сочетании с мутацией Gli2». Разработка . 127 (8): 1593–605. дои : 10.1242/dev.127.8.1593 . ПМИД   10725236 .
  13. ^ Кинцлер К.В., Фогельштейн Б. (февраль 1990 г.). «Ген GLI кодирует ядерный белок, который связывает определенные последовательности в геноме человека» . Мол Клеточная Биол . 10 (2): 634–42. дои : 10.1128/mcb.10.2.634 . ПМК   360861 . ПМИД   2105456 .
  14. ^ Перейти обратно: а б Тех М.Т., Вонг С.Т., Нил Г.В., Гали Л.Р., Филпотт, член парламента, Куинн А.Г. (август 2002 г.). «FOXM1 является нижестоящей мишенью Gli1 при базальноклеточном раке». Рак Рез . 62 (16): 4773–80. ПМИД   12183437 .
  15. ^ Се Дж., Астербаум М., Чжан Х., Бонифас Дж. М., Закари С., Эпштейн Э., МакКормик Ф. (июль 2001 г.). «Роль PDGFRalpha в пролиферации базальноклеточной карциномы» . Proc Natl Acad Sci США . 98 (16): 9255–9. Бибкод : 2001PNAS...98.9255X . дои : 10.1073/pnas.151173398 . ПМК   55407 . ПМИД   11481486 .
  16. ^ Кинзлер К.В., Бигнер С.Х., Бигнер Д.Д., Трент Дж.М., Лоу М.Л., О'Брайен С.Дж., Вонг А.Дж., Фогельштейн Б. (апрель 1987 г.). «Идентификация амплифицированного, высоковыраженного гена в глиоме человека». Наука . 236 (4797): 70–3. Бибкод : 1987Sci...236...70K . дои : 10.1126/science.3563490 . ПМИД   3563490 .
  17. ^ Ченг С.Ю., епископ Дж.М. (апрель 2002 г.). «Супрессор Fused подавляет Gli-опосредованную транскрипцию, задействуя корепрессорный комплекс SAP18-mSin3» . Proc Natl Acad Sci США . 99 (8): 5442–7. Бибкод : 2002PNAS...99.5442C . дои : 10.1073/pnas.082096999 . ПМК   122788 . ПМИД   11960000 .
  18. ^ Джейкоб Дж., Бриско Дж. (август 2003 г.). «Белки Gli и контроль формирования паттерна спинного мозга» . Представитель ЭМБО . 4 (8): 761–5. дои : 10.1038/sj.embor.embor896 . ПМЦ   1326336 . ПМИД   12897799 .
  19. ^ Вильявисенсио Э.Х., Юн Дж.В., Фрэнк DJ, Фюхтбауэр Э.М., Уолтерхаус Д.О., Ианнакконе П.М. (апрель 2002 г.). «Совместная регуляция E-box человеческого GLI1 с помощью TWIST и USF». Бытие . 32 (4): 247–58. дои : 10.1002/gen.10078 . ПМИД   11948912 . S2CID   12132097 .
  20. ^ Гительман I (сентябрь 1997 г.). «Твист-белок в эмбриогенезе мышей» . Дев. Биол . 189 (2): 205–14. дои : 10.1006/dbio.1997.8614 . ПМИД   9299114 .
  21. ^ Хеброк М., Фюхтбауэр А, Фюхтбауэр Э.М. (май 1997 г.). «Подавление активации специфического для мышц гена мышиным белком Twist». Эксп. Сотовый Res . 232 (2): 295–303. doi : 10.1006/excr.1997.3541 . ПМИД   9168805 .
  22. ^ Хуэй CC, Слюсарски Д., Платт К.А., Холмгрен Р., Джойнер А.Л. (1994). «Экспрессия трех мышиных гомологов гена полярности сегмента дрозофилы cubitus прерывания, Gli, Gli-2 и Gli-3, в тканях, происходящих из эктодермы и мезодермы, предполагает множественную роль во время постимплантационного развития». Дев. Биол . 162 (2): 402–13. дои : 10.1006/dbio.1994.1097 . ПМИД   8150204 .
  23. ^ Уолтерхаус Д., Ахмед М., Слюсарски Д., Каламарас Дж., Баучер Д., Холмгрен Р., Яннакконе П. (1993). «gli, фактор транскрипции и онкоген цинковых пальцев, экспрессируется во время нормального развития мышей» . Дев. Дин . 196 (2): 91–102. дои : 10.1002/aja.1001960203 . ПМИД   8364225 . S2CID   8951322 .
  24. ^ Уоллес В.А. (1999). «Полученный из клеток Пуркинье Sonic hedgehog регулирует пролиферацию клеток-предшественников гранулярных нейронов в развивающемся мозжечке мыши» . Курс. Биол . 9 (8): 445–8. Бибкод : 1999CBio....9..445W . дои : 10.1016/s0960-9822(99)80195-x . ПМИД   10226030 . S2CID   12373898 .
  25. ^ Юн Дж.В., Кита Ю., Фрэнк Д.Д., Маевски Р.Р., Коничек Б.А., Нобрега М.А., Джейкоб Х., Уолтерхаус Д., Ианнакконе П. (февраль 2002 г.). «Профилирование экспрессии генов приводит к идентификации GLI1-связывающих элементов в генах-мишенях и к роли нескольких последующих путей в трансформации клеток, индуцированной GLI1» . Ж. Биол. Хим . 277 (7): 5548–55. дои : 10.1074/jbc.M105708200 . ПМИД   11719506 .
  26. ^ Перейти обратно: а б с Дамане Н., Ли Дж., Робинс П., Хеллер П., Руис и Альтаба А. (1997). «Активация фактора транскрипции Gli1 и сигнального пути Sonic hedgehog в опухолях кожи». Природа . 389 (6653): 876–81. Бибкод : 1997Natur.389..876D . дои : 10.1038/39918 . ПМИД   9349822 . S2CID   4424572 .
  27. ^ Руис и Альтаба А (2011). «Передача сигналов Hedgehog и код Gli в стволовых клетках, раке и метастазах». Научный сигнал . 4 (200): пт9. дои : 10.1126/scisignal.2002540 . ПМИД   22114144 .
  28. ^ Айелло К.А., Альтер О (октябрь 2016 г.). «Независимая от платформы общегеномная картина изменений числа копий ДНК, прогнозирующая выживаемость астроцитомы и ответ на лечение, выявленная с помощью GSVD, сформулированного как сравнительное спектральное разложение» . ПЛОС ОДИН . 11 (10): e0164546. Бибкод : 2016PLoSO..1164546A . дои : 10.1371/journal.pone.0164546 . ПМК   5087864 . ПМИД   27798635 .
  29. ^ Дахман Н., Ли Дж., Робинс П., Хеллер П., Руис и Альтаба А. (октябрь 1997 г.). «Активация фактора транскрипции Gli1 и сигнального пути Sonic hedgehog в опухолях кожи». Природа . 389 (6653): 876–81. Бибкод : 1997Natur.389..876D . дои : 10.1038/39918 . ПМИД   9349822 . S2CID   4424572 . Опечатка в: Nature, 1997, декабрь 4;390(6659):536.
  30. ^ Перейти обратно: а б Нильссон М, Унден А.Б., Краузе Д., Мальмквист У., Раза К., Зафиропулос П.Г., Тофтгард Р. (2000). «Индукция базальноклеточного рака и трихоэпителиомы у мышей, сверхэкспрессирующих GLI-1» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 97 (7): 3438–43. дои : 10.1073/pnas.050467397 . ПМК   16258 . ПМИД   10725363 .
  31. ^ Трипати К., Мани С., Барнетт Р., Наллури С., Бачабойна Л., Роккони Р.П., Атар М., Оуэн Л.Б., Палле К. (2014). «Gli1 регулирует контрольную точку S-фазы в опухолевых клетках посредством Bid, и его ингибирование повышает чувствительность к ингибиторам ДНК-топоизомеразы 1» . Журнал биологической химии . 289 (45): 31513–25. дои : 10.1074/jbc.M114.606483 . ПМЦ   4223349 . ПМИД   25253693 .
  32. ^ Ченг С.Ю., епископ Дж.М. (апрель 2002 г.). «Супрессор Fused подавляет Gli-опосредованную транскрипцию, задействуя корепрессорный комплекс SAP18-mSin3» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (8): 5442–7. Бибкод : 2002PNAS...99.5442C . дои : 10.1073/pnas.082096999 . ПМЦ   122788 . ПМИД   11960000 .
  33. ^ Муроне М., Луо С.М., Стоун Д., Ли В., Герни А., Арманини М., Грей С., Розенталь А., де Соваж Ф.Дж. (май 2000 г.). «Регуляция Гли путем противодействия деятельности слитых и подавления слитых». Нат. Клеточная Биол . 2 (5): 310–2. дои : 10.1038/35010610 . ПМИД   10806483 . S2CID   31424234 .
  34. ^ Стоун Д.М., Муроне М., Луох С., Й.В., Арманини М.П., ​​Герни А., Филлипс Х., Браш Дж., Годдард А., де Соваж Ф.Дж., Розенталь А. (декабрь 1999 г.). «Характеристика человеческого супрессора слитого, отрицательного регулятора транскрипционного фактора Gli с цинковыми пальцами». Дж. Клеточная наука . 112 (23): 4437–48. дои : 10.1242/jcs.112.23.4437 . ПМИД   10564661 .
  35. ^ Когерман П., Гримм Т., Когерман Л., Краузе Д., Унден А.Б., Сандстедт Б., Тофтгорд Р., Зафиропулос П.Г. (сентябрь 1999 г.). «Супрессор слияния млекопитающих модулирует ядерно-цитоплазматическое перемещение Gli-1» . Нат. Клеточная Биол . 1 (5): 312–9. дои : 10.1038/13031 . ПМИД   10559945 . S2CID   6907964 .
  36. ^ Дунаева М., Майкельсон П., Когерман П., Тофтгард Р. (февраль 2003 г.). «Характеристика физического взаимодействия белков Gli с белками SUFU» . Ж. Биол. Хим . 278 (7): 5116–22. дои : 10.1074/jbc.M209492200 . ПМИД   12426310 .
  37. ^ Коябу Ю., Наката К., Мизугиши К., Аруга Дж., Микосиба К. (март 2001 г.). «Физические и функциональные взаимодействия между белками Zic и Gli» . Ж. Биол. Хим . 276 (10): 6889–92. дои : 10.1074/jbc.C000773200 . ПМИД   11238441 .
[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 140983854fc33e8ee330e7148a3e21bb__1711860540
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/14/bb/140983854fc33e8ee330e7148a3e21bb.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
GLI1 - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)