IRF4
IRF4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | IRF4 , LSIRF, MUM1, NF-EM5, SHEP8, Регуляторный фактор интерферона 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | Омим : 601900 ; MGI : 1096873 ; Гомологен : 1842 ; GeneCards : IRF4 ; OMA : IRF4 - ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Викидид | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Регуляторный фактор интерферона 4 (IRF4), также известный как MUM1, является белком , который у людей кодируется IRF4 геном . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] IRF4 функционирует как ключевой регуляторный транскрипционный фактор в развитии иммунных клеток человека. [ 8 ] [ 9 ] Экспрессия IRF4 необходима для дифференцировки Т -лимфоцитов и В -лимфоцитов, а также для определенных миелоидных клеток . [ 8 ] Дисрегуляция гена IRF4 может привести к тому, что IRF4 функционирует либо в виде онкогена , либо усугубления опухоли , в зависимости от контекста модификации. [ 8 ]
Символ MUM1 также является нынешним официальным символом HGNC для меланомы, связанного с антигеном (MUTETED) 1 (HGNC: 29641).
Развитие иммунных клеток
[ редактировать ]IRF4 является транскрипционным фактором, принадлежащим к с регуляторами интерферона (IRF) . семейству транскрипционных факторов [ 8 ] [ 9 ] В отличие от некоторых других членов семьи IRF, экспрессия IRF4 не инициируется интерферонами; Скорее, экспрессия IRF4 способствует различным биологически активным стимулам, включая взаимодействие с рецептором антигена, липополисахарид (LPS) , IL-4 и CD40 . [ 8 ] [ 9 ] IRF4 может функционировать либо как активирующий, либо ингибирующий транскрипционный фактор в зависимости от его кофакторов транскрипции . [ 8 ] [ 9 ] IRF4 часто сотрудничает с кофактором B-клеточной лимфомы 6 белка (BCL6) и ядерным фактором активированных Т-клеток (NFAT) . [ 8 ] Экспрессия IRF4 ограничена клетками иммунной системы, в частности Т -клеток, В -клеток, макрофагов и дендритных клеток . [ 8 ] [ 9 ]
Дифференциация Т -клеток
[ редактировать ]IRF4 играет важную роль в регуляции дифференцировки Т -клеток. В частности, IRF4 обеспечивает дифференциацию CD4 + T Helper Cells в отдельные подмножества. [ 8 ] IRF4 необходим для развития клеток T H 2 и T H клеток 17 . IRF4 регулирует эту дифференцировку посредством апоптоза и продукции цитокинов , что может измениться в зависимости от стадии развития Т -клеток. [ 9 ] Например, IRF4 ограничивает выработку Th2-ассоциированных цитокинов в наивных Т-клетках , а также активирует производство цитокинов Th2 в эффекторах и Т-клетках памяти . [ 8 ] Хотя это и не является обязательным, IRF4 также считается ролью в CD8 + Цитотоксическая дифференцировка Т-клеток посредством его регуляции факторов, непосредственно связанных с этим процессом, включая BLIMP-1 , BATF , T-BET и RORγT . [ 8 ] IRF4 необходим для эффекторной функции T-регуляторных клеток из-за его роли в качестве регуляторного фактора для BIMP-1. [ 8 ]
Дифференциация В -клеток
[ редактировать ]IRF4 является важным регуляторным компонентом на различных стадиях развития В -клеток. При раннем развитии В-клеток функционирует IRF4 наряду с IRF8 , чтобы индуцировать экспрессию факторов транскрипции IKAROS и Aiolos , которые снижают экспрессию до-B-клеточного рецептора. [ 9 ] Затем IRF4 регулирует вторичную перестройку цепей κ и λ , что делает IRF4 необходимым для дальнейшего развития BCR . [ 8 ]
IRF4 также занимает важную позицию в адаптивном иммунном ответе зрелых В -клеток. Когда IRF4 отсутствует, зрелые В -клетки не образуют зародышевых центров (GC) и чрезмерно пролиферации как в селезенке , так и в лимфатических узлах . [ 9 ] Экспрессия IRF4 начинает образование GC за счет повышения транскрипционных факторов BCL6 и POU2AF1 , которые способствуют образованию зародышевого центра. [ 10 ] Экспрессия IRF4 уменьшается в B -клетках после формирования зародышевого центра, поскольку экспрессия IRF4 не требуется для устойчивой функции GC; Однако экспрессия IRF4 значительно увеличивается, когда В -клетки готовятся покинуть зародышевый центр для образования плазматических клеток. [ 9 ]
Долгоживущие плазматические клетки
[ редактировать ]Долгоживущие плазматические клетки -это В-клетки памяти, которые секретируют высокоаффинные антитела и помогают сохранить иммунологическую память в специфические антигены. [ 11 ] IRF4 играет значительную роль на нескольких этапах долгоживущей дифференцировки плазматических клеток. Эффекты экспрессии IRF4 сильно зависят от количества присутствующего IRF4. [ 10 ] Ограниченное присутствие IRF4 активирует BCL6, что необходимо для образования зародышевых центров, от которых дифференцируются плазматические клетки. [ 11 ] Напротив, повышенная экспрессия IRF4 подавляет экспрессию BCL6 и активирует экспрессию BLIMP-1 и ZBTB20 . [ 11 ] Этот ответ, зависящий от высокой дозы IRF4, помогает инициировать дифференцировку B -клеток зародышевого центра в плазматические клетки. [ 11 ]
Экспрессия IRF4 необходима для рекомбинации переключателя класса изотипа в B -клетках зародышевой центра, которые станут плазматическими клетками. В -клетки, которым не хватает IRF4, не могут подвергаться переключению класса иммуноглобулина. [ 9 ] Без IRF4 B -клетки не могут повысить регуляцию фермента AID , компонента, необходимого для индукции мутаций в областях переключения иммуноглобулина в B -клеточной ДНК во время соматической гипермутации . [ 9 ] В отсутствие IRF4 B-клетки не будут дифференцироваться в плазматические клетки Ig. [ 9 ]
Экспрессия IRF4 по-прежнему необходима для долгоживущих плазматических клеток после того, как произошла дифференцировка. В отсутствие IRF4 исчезают долгоживущие плазматические клетки, что позволяет предположить, что IRF4 играет роль в регуляции молекул, необходимых для продолжающегося выживания этих клеток. [ 11 ]
Дифференциация миелоидных клеток
[ редактировать ]Среди миелоидных клеток экспрессия IRF4 была идентифицирована в дендритных клетках (DC) и макрофагах. [ 8 ] [ 9 ]
Дендритные клетки (DCS)
[ редактировать ]Факторы транскрипции IRF4 и IRF8 работают согласованно для достижения дифференциации постоянного тока. [ 8 ] [ 9 ] Экспрессия IRF4 отвечает за индукцию развития DC CD4+ , в то время как экспрессия IRF8 необходима для разработки CD8+ DCS . [ 9 ] Экспрессия IRF4 или IRF8 может привести к CD4-/CD8- DCS. [ 9 ] Дифференциация подтипов DC также зависит от взаимодействия IRF4 с фактором роста GM-CSF . [ 8 ] Экспрессия IRF4 необходима для обеспечения того, чтобы дендритные клетки, полученные из моноцитов (MO-DC), могли перекрестно проходить антиген с CD8+ клетками. [ 8 ]
Макрофаги
[ редактировать ]IRF4 и IRF8 также являются значительными факторами транскрипции в дифференцировке общих миелоидных предшественников (CMP) в макрофаги. [ 8 ] IRF4 экспрессируется на более низком уровне, чем IRF8 в этих клетках -предшественниках; Тем не менее, экспрессия IRF4, по -видимому, особенно важна для развития макрофагов M2 . [ 8 ] JMJD3 , который регулирует IRF4, был идентифицирован как важный регулятор поляризации макрофагов M2 , что позволяет предположить, что IRF4 также может принять участие в этом процессе регулирования. [ 8 ]
Клиническое значение
[ редактировать ]В меланоцитарных клетках ген IRF4 может регулироваться MITF . [ 12 ] IRF4 является фактором транскрипции, который был вовлечен в острый лейкоз. [ 13 ] Этот ген тесно связан с пигментацией: чувствительность кожи к воздействию солнца, веснушки, голубые глаза и каштановые волосы. [ 14 ] Вариант был замешан в седлении волос. [ 15 ]
Всемирная организация здравоохранения (2016), предварительно определенная крупная В-клеточная лимфома с перестройкой IRF4 в качестве редкой индолентной большой B-клеточной лимфомы детей и подростков. Эта индолентная лимфома имитирует и должна отличаться от фолликулярной лимфомы педиатрического типа . [ 16 ] Отличительной чертой большой B-клеточной лимфомы с перестройкой IRF4 является сверхэкспрессия гена IRF4 злокачественными клетками болезни. Эта сверхэкспрессия вызвана приобретением в этих клетках транслокации IRF4 с его сайта на коротком (т. Е. P) руке хромосомы 6 в положении 25.3 [ 17 ] на участок возле тяжелого локуса иммуноглобулина на длинном (т.е. Q) руке хромосомы 14 в положении 32,33 [ 18 ] [ 19 ]
Взаимодействия
[ редактировать ]Было показано, что IRF4 взаимодействует :
- Айолос , [ 9 ]
- BATF3 , [ 8 ]
- Blimp-1 , [ 8 ] [ 11 ]
- Bcl6 , [ 20 ]
- CD40 , [ 8 ] [ 9 ]
- GM-CSF , [ 8 ]
- IL-4 , [ 8 ] [ 9 ]
- Икарос , [ 9 ]
- IRF8 , [ 8 ] [ 9 ]
- Jmjd3 , [ 8 ]
- MMP12 , [ 8 ]
- NFATC2 , [ 21 ]
- Spi1 , [ 22 ] [ 23 ] и
- STAT6 . [ 20 ]
Смотрите также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а беременный в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000137265 - ENSEMBL , май 2017 г.
- ^ Jump up to: а беременный в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000021356 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
- ^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
- ^ Гроссман А., Миттрюкер Х.В., Николл Дж., Сузуки А., Чунг С., Антонио Л. и др. (Октябрь 1996). «Клонирование лимфоцит-специфического интерферонного регуляторного фактора (HLSIRF/HIRF4) и картирование гена до 6P23-P25». Геномика . 37 (2): 229–233. doi : 10.1006/geno.1996.0547 . PMID 8921401 . S2CID 42646350 .
- ^ Xu D, Zhao L, Del Valle L, Miklossy J, Zhang L (июль 2008 г.). «Регуляторный фактор 4 интерферона участвует в трансформации вируса, опосредованной вирусом Эпштейна-Барра, человеческих лимфоцитов B» . Журнал вирусологии . 82 (13): 6251–6258. doi : 10.1128/jvi.00163-08 . PMC 2447047 . PMID 18417578 .
- ^ «Ген Entrez: IRF4 Интерферон регуляторный фактор 4» .
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон глин час я Дж k л м не а п Q. ведущий с Т в v В х и С аа Аб Nam S, Lim JS (2016). «Основная роль регуляторного фактора интерферона 4 (IRF4) в развитии иммунных клеток». Архи Фарм. Резерв 39 : 1548–1555. doi: 10.1007/s12272-016-0854-1 .
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон глин час я Дж k л м не а п Q. ведущий с Т в Shaffer AL, Tolga Emre NC, Romesser PB, Staudt LM (2009). "IRF4: иммунитет. Злокачественная опухоль! Терапия?" Клиническое исследование рака . 15 (9): 2954-2961. doi: 10.1158/1078-0432.ccr-08-1845
- ^ Jump up to: а беременный Laidlaw BJ, Cyster JG (2021). «Транскрипционная регуляция дифференцировки В -клеток памяти». НАТ Преподобный иммунол . 21 : 209–220. doi: 10.1038/s41577-020-004446-2 .
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон Ходадади Л., Ченг К., Радбрух А и Хипе Ф. (2019). «Поддержание плазменных ячеек памяти». Передний. Иммунол . 10 : 721. DOI: 10.3389/fimmu.2019.00721 .
- ^ Hoek KS, Schlegel NC, Eichhoff OM, Widmer DS, Praetorius C, Einarsson SO, et al. (Декабрь 2008 г.). «Новые мишени MITF, идентифицированные с использованием двухэтапной стратегии микрочипов ДНК» . Пигментные клеточные и меланому исследования . 21 (6): 665–676. doi : 10.1111/j.1755-148x.2008.00505.x . PMID 19067971 . S2CID 24698373 .
- ^ Адамаки М., Ламбру Джи, Атанасиаду А., Цанудаки М., Влахопулос С., Моски М. (2013). «Смысл экспрессии аберрантной гена IRF4 в острой лейкозе детства» . Plos один . 8 (8): E72326. Bibcode : 2013ploso ... 872326a . doi : 10.1371/journal.pone.0072326 . PMC 3744475 . PMID 23977280 .
- ^ Praetorius C, Grill C, Stacey SN, Metcalf AM, Gorkin Du, Robinson KC, et al. (Ноябрь 2013). «Полиморфизм в IRF4 влияет на пигментацию человека посредством пути тирозиназы MITF/TFAP2A» . Клетка . 155 (5): 1022–1033. doi : 10.1016/j.cell.2013.10.022 . PMC 3873608 . PMID 24267888 .
- ^ Adhikari K, Fontanil T, Cal S, Mendoza-Revilla J, Fuentes-Guajardo M, Chacón-Duque JC, et al. (Март 2016 г.). «Сканирование ассоциации по всему геному у смещенных латиноамериканцев идентифицирует локусы, влияющие на лицевые и кожи головы» . Природная связь . 7 : 10815. Bibcode : 2016natco ... 710815a . doi : 10.1038/ncomms10815 . PMC 4773514 . PMID 26926045 .
- «Седые волосы, обнаруженные учеными» . BBC News . 1 марта 2016 года.
- ^ Lynch RC, Gratzinger D, Advani RH (июль 2017 г.). «Клиническое влияние обновления 2016 года на классификацию лимфомы ВОЗ». Текущие варианты лечения в онкологии . 18 (7): 45. doi : 10.1007/s11864-017-0483-z . PMID 28670664 . S2CID 4415738 .
- ^ «Регуляторный фактор интерферона IRF4 4 [Homo Sapiens (Human)] - Gene - NCBI» .
- ^ «Иммуноглобулин тяжелый локус [Homo sapiens (человек)] - ген - ncbi» .
- ^ Woessmann W, Quintanilla-Martinez L (июнь 2019 г.). «Редкие зрелые В-клеточные лимфомы у детей и подростков» . Гематологическая онкология . 37 (Suppl 1): 53–61. doi : 10.1002/hon.2585 . PMID 31187530 .
- ^ Jump up to: а беременный Гупта С., Цзян М., Энтони А., Пернис А.Б. (декабрь 1999 г.). «Специфичная для линии модуляция передачи сигналов интерлейкина 4 с помощью регуляторного фактора интерферона 4» . Журнал экспериментальной медицины . 190 (12): 1837–1848. doi : 10.1084/jem.190.12.1837 . PMC 2195723 . PMID 10601358 .
- ^ Ренгараджан Дж., Моуэн К.А., Макбрайд К.Д., Смит Э.Д., Сингх Х., Глимчер Л.Х. (апрель 2002 г.). «Регуляторный фактор интерферона 4 (IRF4) взаимодействует с NFATC2 для модуляции экспрессии гена интерлейкина 4» . Журнал экспериментальной медицины . 195 (8): 1003–1012. doi : 10.1084/jem.20011128 . PMC 2193700 . PMID 11956291 .
- ^ Brass AL, Zhu AQ, Singh H (февраль 1999 г.). «Требования к сборке комплексов активатора PU.1-PIP (IRF-4): ингибирование функции in vivo с использованием слитых димеров» . Embo Journal . 18 (4): 977–991. doi : 10.1093/emboj/18.4.977 . PMC 1171190 . PMID 10022840 .
- ^ Escalante CR, Shen L, Escalante MC, Brass AL, Edwards TA, Singh H, Aggarwal AK (июль 2002 г.). «Кристаллизация и характеристика Pu.1/IRF-4/ДНК-тройного комплекса». Журнал структурной биологии . 139 (1): 55–59. doi : 10.1016/s1047-8477 (02) 00514-2 . PMID 12372320 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Маман Ю., Шарма С., Грандво Н., Эрнандес Е., Хискотт Дж. (Январь 2002 г.). «Активность IRF-4 в индуцированном HTLV-I-индуцированном лейкозелете Т-клеток». Журнал интерферонов и цитокиновых исследований . 22 (1): 135–143. doi : 10.1089/107999002753452746 . PMID 11846984 .
- Yamagata T, Nishida J, Tanaka S, Sakai R, Mitani K, Yoshida M, et al. (Апрель 1996 г.). «Новый фактор транскрипции семейства интерферонов, ICSAT/PIP/LSIRF, который негативно регулирует активность интерферонных генов» . Молекулярная и клеточная биология . 16 (4): 1283–1294. doi : 10.1128/mcb.16.4.1283 . PMC 231112 . PMID 8657101 .
- Эйд С., Рао П.Х., Батлер М., Коррадин П., Боккадоро М., Кляйн Б. и др. (Октябрь 1997). «Дерререгуляция MUM1/IRF4 путем хромосомной трансляции при множественной миломе» (PDF ) Природа генетика 17 (2): 226–2 Doi : 10.1038/ ng1097-2 9326949PMID 30327940S2CID
- Brass AL, Zhu AQ, Singh H (февраль 1999 г.). «Требования к сборке комплексов активатора PU.1-PIP (IRF-4): ингибирование функции in vivo с использованием слитых димеров» . Embo Journal . 18 (4): 977–991. doi : 10.1093/emboj/18.4.977 . PMC 1171190 . PMID 10022840 .
- Рао С., Мацумура А., Юн Дж., Саймон М.К. (апрель 1999 г.). «SPI-B активирует транскрипцию с помощью уникального пролина, серина и треонина и демонстрирует аффинные различия связывания ДНК от PU.1» . Журнал биологической химии . 274 (16): 11115–11124. doi : 10.1074/jbc.274.16.11115 . PMID 10196196 .
- Марецки С., Атчисон М.Л., Фентон М.Дж. (сентябрь 1999 г.). «Дифференциальная экспрессия и различные функции регуляторного фактора IFN 4 и связывающего белка последовательности IFN в макрофагах» . Журнал иммунологии . 163 (5): 2713–2722. doi : 10.4049/jimmunol.163.5.2713 . PMID 10453013 . S2CID 19537899 .
- Гупта С., Цзян М., Энтони А., Пернис А.Б. (декабрь 1999 г.). «Специфичная для линии модуляция передачи сигналов интерлейкина 4 с помощью регуляторного фактора интерферона 4» . Журнал экспериментальной медицины . 190 (12): 1837–1848. doi : 10.1084/jem.190.12.1837 . PMC 2195723 . PMID 10601358 .
- Mamane Y, Sharma S, Petropoulos L, Lin R, Hiscott J (февраль 2000 г.). «Посттрансляционная регуляция активности IRF-4 иммунофилином FKBP52» . Иммунитет . 12 (2): 129–140. doi : 10.1016/s1074-7613 (00) 80166-1 . PMID 10714679 .
- Гупта С., Энтони А., Пернис А.Б. (май 2001 г.). «Стадия специфической модуляции IFN-регуляторного фактора 4 функционирует белками цинкового пальца типа Krüppel» . Журнал иммунологии . 166 (10): 6104–6111. doi : 10.4049/jimmunol.166.10.6104 . PMID 11342629 .
- Imaizumi Y, Kohno T, Yamada Y, Ikeda S, Tanaka Y, Tomonaga M, Matsuyama T (декабрь 2001 г.). «Возможное участие регуляторного фактора 4 (IRF4) (IRF4) в клиническом подтипе взрослой лейкемии Т-клеток» . Японский журнал исследований рака . 92 (12): 1284–1292. doi : 10.1111/j.1349-7006.2001.tb02151.x . PMC 5926682 . PMID 11749693 .
- Ренгараджан Дж., Моуэн К.А., Макбрайд К.Д., Смит Э.Д., Сингх Х., Глимчер Л.Х. (апрель 2002 г.). «Регуляторный фактор интерферона 4 (IRF4) взаимодействует с NFATC2 для модуляции экспрессии гена интерлейкина 4» . Журнал экспериментальной медицины . 195 (8): 1003–1012. doi : 10.1084/jem.20011128 . PMC 2193700 . PMID 11956291 .
- Sharma S, Grandvaux N, Mamane Y, Genin P, Azimi N, Waldmann T, Hiscott J (сентябрь 2002 г.). «Регуляция экспрессии регуляторного фактора IFN 4 в Т-клетках, трансформированных вирусом Т-клеток человека-I-I-I-I» . Журнал иммунологии . 169 (6): 3120–3130. doi : 10.4049/jimmunol.169.6.3120 . PMID 12218129 .
- Escalante CR, Shen L, Escalante MC, Brass AL, Edwards TA, Singh H, Aggarwal AK (июль 2002 г.). «Кристаллизация и характеристика Pu.1/IRF-4/ДНК-тройного комплекса». Журнал структурной биологии . 139 (1): 55–59. doi : 10.1016/s1047-8477 (02) 00514-2 . PMID 12372320 .
- Hu CM, Jang Sy, Fanzo JC, Pernis AB (декабрь 2002 г.). «Модуляция продукции цитокинов Т-клеток с помощью интерферона регуляторного фактора-4» . Журнал биологической химии . 277 (51): 49238–49246. doi : 10.1074/jbc.m205895200 . PMID 12374808 .
- Fanzo JC, Hu CM, Jang Sy, Pernis AB (февраль 2003 г.). «Регуляция апоптоза лимфоцитов с помощью регуляторного фактора интерферона 4 (IRF-4)» . Журнал экспериментальной медицины . 197 (3): 303–314. doi : 10.1084/jem.20020717 . PMC 2193834 . PMID 12566414 .
- О'Рейли Д., Куинн С.М., Эль-Шанавани Т., Гордон С., Гривз Д.Р. (июнь 2003 г.). «Многочисленные факторы ETS и регуляторный фактор-интерферон-4 модулируют экспрессию CD68 специфичным для типа клеток» . Журнал биологической химии . 278 (24): 21909–21919. doi : 10.1074/jbc.m212150200 . PMID 12676954 .
- Sundram U, Harvell JD, Rouse RV, Natkunam Y (август 2003 г.). «Экспрессия маркера пролиферации B-клеток MAM1 с помощью меланоцитарных поражений и сравнение с S100, GP100 (HMB45) и Меланой» . Современная патология . 16 (8): 802–810. doi : 10.1097/01.mp.0000081726.49886.cf . PMID 12920225 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Факторбег IRF4
- IRF4+белок,+человек в Национальной медицинской библиотеке Медицинской библиотеки США (Mesh)
Эта статья включает в себя текст из Национальной медицины Соединенных Штатов , которая находится в общественном достоянии .