Транскрипционный фактор II D

Фактор транскрипции II D ( TF _II D ) является одним из нескольких общих факторов транскрипции , которые составляют РНК-полимеразы II преинициаторный комплекс . Голофермент РНК-полимеразы II представляет собой форму эукариотической РНК-полимеразы II , которая рекрутируется в промоторы белок -кодирующих генов в живых клетках. Он состоит из РНК-полимеразы II , подмножества общих факторов транскрипции , и регуляторных белков, известных как белки SRB. Перед началом транскрипции комплекс транскрипционного фактора II D (TF _II D) связывается с основной ДНК промотора гена посредством специфического распознавания мотивов последовательности промотора, включая ТАТА-бокс , инициатор , нижестоящий промотор , мотив десять или нижестоящий регуляторный элемент. элементы. ^{[ 1 ]}

Функции

Координирует активность более 70 полипептидов, необходимых для инициации транскрипции РНК-полимеразой II.
Связывается с основным промотором для правильного позиционирования полимеразы.
Служит каркасом для сборки оставшейся части транскрипционного комплекса.
Действует как канал для регуляторных сигналов.

Структура

TF _II D сам по себе состоит из ТБФ и нескольких субъединиц, называемых факторами, связанными с ТАТА-связывающим белком ( ТБФ-ассоциированные факторы или TAF ). В пробирке для транскрипции на промоторах , содержащих ТАТА-бокс , необходим только ТБФ . ^{[ 2 ]} TAF, однако, добавляют селективности к промотору, особенно если нет последовательности TATA-бокса, с которой мог бы связываться TBP. ^{[ 1 ]} TAF включены в два отдельных комплекса: TF _II D ^{[ 3 ]} и Б-ТФ _II Д. ^{[ 4 ]} Комплекс TF _II D состоит из ТБФ и более восьми TAF. Но большая часть ТБФ присутствует в комплексе B-TF _II D, который состоит из ТБФ и TAFII170 ( BTAF1 ) в соотношении 1:1. ^{[ 5 ]} TF _II D и B-TF _II D не эквивалентны, поскольку реакции транскрипции с использованием TF _II D чувствительны к ген-специфичным факторам транскрипции, таким как SP1, тогда как реакции, восстановленные с помощью B-TF _II D, не являются. ^{[ 5 ]}

Субъединицы комплекса TF _II D включают: ^{[ 2 ]}

TBP (ТАТА-связывающий белок) или:
- Факторы, связанные с ТБП у животных ( TBPL1 ; TBPL2 ) ^{[ 6 ]}
ТАФ1 (ТАФИИ250)
ТАФ2 (КИФ150)
ТАФ3 (ТАФИИ140)
ТАФ4 (ТАФИИ130/135)
ТАФ4Б (ТАФИИ105)
ТАФ5 (ТАФИИ100)
ТАФ6 (ТАФИИ70/80)
ТАФ7 (ТАФИИ55)
ТАФ8 (ТАФИИ43)
ТАФ9 (ТАФИИ31/32)
ТАФ9Б (ТАФИИ31Л)
ТАФ10 (ТАФИИ30)
ТАФ11 (ТАФИИ28)
ТАФ12 (ТАФИИ20/15)
ТАФ13 (ТАФИИ18)
ТАФ15 (ТАФИИ68)

См. также

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б Громче, РК; Привет; Лопес-Бланко-младший; Фанг, Дж; Чакон, П; Ногалес, Э (2016). «Структура TFIID, связанного с промотором, и модель сборки прединициаторного комплекса человека» . Природа . 531 (7596): 604–609. Бибкод : 2016Natur.531..604L . дои : 10.1038/nature17394 . ПМЦ 4856295 . ПМИД 27007846 .
^ Jump up to: ^а ^б Ли, Тонг Ин; Янг, Ричард А. (2000). «Транскрипция генов, кодирующих эукариотические белки». Анну. Преподобный Жене . 34 : 77–137. дои : 10.1146/annurev.genet.34.1.77 . ПМИД 11092823 .
^ Динлахт, Брайан Дэвид; Хоуи, Тимоти; Тиан, Роберт (август 1991 г.). «Выделение коактиваторов, связанных с ТАТА-связывающим белком, которые опосредуют активацию транскрипции». Клетка . 66 (3): 563–576. дои : 10.1016/0092-8674(81)90019-2 . ПМИД 1907890 . S2CID 5000858 .
^ «NCBI Entrez GeneID: 9044 BTAF1 BTAF1 РНК-полимераза II, связанная с транскрипционным фактором B-TFIID, 170 кДа (гомолог Mot1, S. cerevisiae )» .
^ Jump up to: ^а ^б Тиммерс, Х.; Мейерс, Р.Э.; Шарп, Пенсильвания (сентябрь 1992 г.). «Состав фактора транскрипции B-TFIID» . Proc Natl Acad Sci США . 89 (17): 8140–4. Бибкод : 1992PNAS...89.8140T . дои : 10.1073/pnas.89.17.8140 . ПМК 49872 . ПМИД 1387711 .
^ Даттке, С.Х. (март 2015 г.). «Эволюция и диверсификация базального транскрипционного аппарата» . Тенденции биохимических наук . 40 (3): 127–9. дои : 10.1016/j.tibs.2015.01.005 . ПМК 4410091 . ПМИД 25661246 .

Внешние ссылки

Транскрипция + Фактор + TFIID в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
3D-структуры электронной микроскопии TFIID из Банка данных EM (EMDB)

Эта о генетике статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[:0-1] Jump up to: ^а ^б Громче, РК; Привет; Лопес-Бланко-младший; Фанг, Дж; Чакон, П; Ногалес, Э (2016). «Структура TFIID, связанного с промотором, и модель сборки прединициаторного комплекса человека» . Природа . 531 (7596): 604–609. Бибкод : 2016Natur.531..604L . дои : 10.1038/nature17394 . ПМЦ 4856295 . ПМИД 27007846 .

[Lee-2] Jump up to: ^а ^б Ли, Тонг Ин; Янг, Ричард А. (2000). «Транскрипция генов, кодирующих эукариотические белки». Анну. Преподобный Жене . 34 : 77–137. дои : 10.1146/annurev.genet.34.1.77 . ПМИД 11092823 .

[Dynlacht-3] Динлахт, Брайан Дэвид; Хоуи, Тимоти; Тиан, Роберт (август 1991 г.). «Выделение коактиваторов, связанных с ТАТА-связывающим белком, которые опосредуют активацию транскрипции». Клетка . 66 (3): 563–576. дои : 10.1016/0092-8674(81)90019-2 . ПМИД 1907890 . S2CID 5000858 .

[BTAF-4] «NCBI Entrez GeneID: 9044 BTAF1 BTAF1 РНК-полимераза II, связанная с транскрипционным фактором B-TFIID, 170 кДа (гомолог Mot1, S. cerevisiae )» .

[Timmers-5] Jump up to: ^а ^б Тиммерс, Х.; Мейерс, Р.Э.; Шарп, Пенсильвания (сентябрь 1992 г.). «Состав фактора транскрипции B-TFIID» . Proc Natl Acad Sci США . 89 (17): 8140–4. Бибкод : 1992PNAS...89.8140T . дои : 10.1073/pnas.89.17.8140 . ПМК 49872 . ПМИД 1387711 .

[pmid25661246-6] Даттке, С.Х. (март 2015 г.). «Эволюция и диверсификация базального транскрипционного аппарата» . Тенденции биохимических наук . 40 (3): 127–9. дои : 10.1016/j.tibs.2015.01.005 . ПМК 4410091 . ПМИД 25661246 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]