IRF3

IRF3
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	3QU6, 1J2F, 1QWT, 1T2K, 1ZOQ, 2O61, 2O6G, 2PI0, 3A77, 5JEO, 5JEK, 5JER, 5JEM, 5JEL, 5JEJ
Идентификаторы
Псевдонимы	IRF3 , энтрез:3661, IIAE7, регуляторный фактор интерферона 3
Внешние идентификаторы	Опустить : 603734 ; МГИ : 1859179 ; Гомологен : 1208 ; Генные карты : IRF3 ; ОМА : IRF3 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	49,665,875 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	44,652,272 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	granulocyte; ; right uterine tube; ; mucosa of transverse colon; ; spleen; ; right lobe of thyroid gland; ; canal of the cervix; ; left lobe of thyroid gland; ; anterior pituitary; ; lymph node; ; ectocervix;
	Top expressed in
	neural layer of retina; ; spermatocyte; ; lip; ; granulocyte; ; tibiofemoral joint; ; thymus; ; yolk sac; ; right kidney; ; crypt of lieberkuhn of small intestine; ; vestibular membrane of cochlear duct;
	More reference expression data
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	DNA binding; protein homodimerization activity; DNA-binding transcription factor activity; transcription coregulator activity; DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; protein binding; protein domain specific binding; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; sequence-specific DNA binding; identical protein binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Cellular component	cytoplasm; nucleoplasm; nucleus; cytosol;
Biological process	apoptotic process; positive regulation of type I interferon-mediated signaling pathway; macrophage apoptotic process; regulation of transcription, DNA-templated; response to bacterium; response to exogenous dsRNA; positive regulation of interferon-alpha production; MDA-5 signaling pathway; interferon-gamma-mediated signaling pathway; immune system process; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; transcription by RNA polymerase II; cellular response to dsRNA; transcription, DNA-templated; cellular response to DNA damage stimulus; TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway; response to lipopolysaccharide; defense response to virus; type I interferon signaling pathway; positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; negative regulation of type I interferon production; programmed necrotic cell death; viral process; cellular response to lipopolysaccharide; positive regulation of type I interferon production; lipopolysaccharide-mediated signaling pathway; positive regulation of interferon-beta production; innate immune response; regulation of type I interferon production; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; negative regulation of defense response to virus by host; regulation of gene expression; regulation of inflammatory response; cellular response to exogenous dsRNA; positive regulation of transcription, DNA-templated;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	3661
	54131
	ENSG00000126456
	ENSMUSG00000003184
	Q14653
	P70671
показывать НМ_001197122 ; НМ_001197123 ; НМ_001197124 ; НМ_001197125 ; НМ_001197126 ;
	NM_001197127; NM_001197128; NM_001571
	НМ_016849
показывать НП_001184051 ; НП_001184052 ; НП_001184053 ; НП_001184054 ; НП_001184055 ;
	NP_001184056; NP_001184057; NP_001562; NP_001184053.1; NP_001184056.1; NP_001184057.1
	НП_058545
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Регуляторный фактор интерферона 3 , также известный как IRF3 , является регуляторным фактором интерферона . ^{[ 5 ]}

Функция

IRF3 является членом семейства регуляторных транскрипционных факторов интерферона (IRF). ^{[ 5 ]} первоначально был обнаружен как гомолог IRF1 IRF3 и IRF2 . IRF3 был дополнительно охарактеризован и показано, что он содержит несколько функциональных доменов, включая сигнал ядерного экспорта, ДНК-связывающий домен , C-концевой ассоциативный домен IRF и несколько регуляторных сайтов фосфорилирования . ^{[ 6 ]} IRF3 находится в неактивной цитоплазматической форме, которая при фосфорилировании серина/треонина образует комплекс с CREBBP . ^{[ 7 ]} Комплекс транслоцируется в ядро для транскрипционной активации интерферонов альфа и бета, а также генов, индуцируемых интерфероном. ^{[ 8 ]}

IRF3 играет важную роль в врожденной иммунной системы реакции на вирусную инфекцию . ^{[ 9 ]} агрегированные MAVS активируют димеризацию IRF3. Было обнаружено, что ^{[ 10 ]} Исследование 2015 года показывает, что фосфорилирование врожденных иммунных адаптерных белков MAVS, STING и TRIF по консервативному мотиву pLxIS рекрутирует и определяет фосфорилирование и активацию IRF3 с помощью серин/треонин-протеинкиназы TBK1, тем самым активируя выработку интерферонов типа I. ^{[ 11 ]} Другое исследование показало, что нокаут IRF3-/- защищает от инфаркта миокарда. ^{[ 12 ]} В том же исследовании IRF3 и реакция IFN I типа были идентифицированы как потенциальная терапевтическая мишень для кардиопротекции после инфаркта миокарда . ^{[ 12 ]}

Взаимодействия

Было показано, что IRF3 взаимодействует с IRF7 . ^{[ 13 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000126456 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000003184 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Перейти обратно: ^а ^б Хискотт Дж., Пита П., Генин П., Нгуен Х., Хейлбрук С., Мамане Ю., Алгарте М., Лин Р. (1999). «Запуск интерфероновой реакции: роль фактора транскрипции IRF-3». J. Интерферон Цитокин Рез . 19 (1): 1–13. дои : 10.1089/107999099314360 . ПМИД 10048763 .
^ Лин Р., Хейлбрук С., Генин П., Пита П.М., Хискотт Дж. (февраль 1999 г.). «Основная роль регуляторного фактора интерферона 3 в прямой активации транскрипции хемокинов RANTES» . Мол Клеточная Биол . 19 (2): 959–66. дои : 10.1128/MCB.19.2.959 . ПМК 116027 . ПМИД 9891032 .
^ Ёнеяма М., Сухара В., Фудзита Т. (2002). «Контроль активации IRF-3 путем фосфорилирования». J. Интерферон Цитокин Рез . 22 (1): 73–6. дои : 10.1089/107999002753452674 . ПМИД 11846977 .
^ «Ген Энтрез: регуляторный фактор 3 интерферона IRF3» .
^ Коллинз С.Е., Нойс Р.С., Моссман К.Л. (февраль 2004 г.). «Врожденный клеточный ответ на проникновение вирусных частиц требует IRF3, но не репликации вируса» . Дж Вирол . 78 (4): 1706–17. doi : 10.1128/JVI.78.4.1706-1717.2004 . ПМК 369475 . ПМИД 14747536 .
^ Хоу Ф, Сунь Л, Чжэн Х, Скауг Б, Цзян QX, Чен ZJ (5 августа 2011 г.). «MAVS образует функциональные прионоподобные агрегаты для активации и распространения противовирусного врожденного иммунного ответа» . Клетка . 146 (3): 448–61. дои : 10.1016/j.cell.2011.06.041 . ПМК 3179916 . ПМИД 21782231 .
^ Лю С, Цай X, Ву Дж, Конг Q, Чен X, Ли Т, Ду Ф, Жэнь Дж, Ву Ю, Гришин Н и Чен ZJ (13 марта 2015 г.). «Фосфорилирование врожденных иммунных адаптерных белков MAVS, STING и TRIF индуцирует активацию IRF3» . Наука . 347 (6227): ааа2630. дои : 10.1126/science.aaa2630 . ПМИД 25636800 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Кинг КР, Агирре А.Д., Йе YX, Сан Ю, Ро Дж.Д., Нг младший Р.П., Колер Р.Х., Арлаукас С.П., Ивамото Ю., Савол А., Садреев Р.И., Келли М., Фитцгиббонс Т.П., Фицджеральд К.А., Митчисон Т., Либби П., Нарендорф М., Вайсследер Р. (6 ноября 2017 г.). «Интерфероны IRF3 и I типа способствуют фатальной реакции на инфаркт миокарда» . Природная медицина . 23 (12): 1481–1487. дои : 10.1038/нм.4428 . ПМК 6477926 . ПМИД 29106401 .
^ Au WC, Yeow WS, Pitha PM (февраль 2001 г.). «Анализ функциональных доменов регуляторного фактора интерферона 7 и его связи с IRF-3» . Вирусология . 280 (2): 273–82. дои : 10.1006/виро.2000.0782 . ПМИД 11162841 .

Дальнейшее чтение

Пита П.М., Ау В.К., Лоутер В., Хуанг Ю.Т., Шафер С.Л., Бурысек Л., Хискотт Дж., Мур П.А. (1999). «Роль факторов регуляции интерферона (IRF) в вирусопосредованной передаче сигналов и регуляции роста клеток» . Биохимия . 80 (8–9): 651–8. дои : 10.1016/S0300-9084(99)80018-2 . ПМИД 9865487 .
Ёнеяма М., Сухара В., Фудзита Т. (2002). «Контроль активации IRF-3 путем фосфорилирования». J. Интерферон Цитокин Рез . 22 (1): 73–6. дои : 10.1089/107999002753452674 . ПМИД 11846977 .
Ау В.К., Мур П.А., Лоутер В., Хуанг Ю.Т., Пита П.М. (1996). «Идентификация члена семейства регуляторных факторов интерферона, который связывается с элементом стимулируемого интерфероном ответа и активирует экспрессию генов, индуцированных интерфероном» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 92 (25): 11657–61. дои : 10.1073/pnas.92.25.11657 . ПМК 40461 . ПМИД 8524823 .
Йонеяма М., Сухара В., Фукухара Ю., Фукуда М., Нисида Э., Фудзита Т. (1998). «Прямой запуск системы интерферона I типа вирусной инфекцией: активация комплекса транскрипционных факторов, содержащего IRF-3 и CBP/p300» . ЭМБО Дж . 17 (4): 1087–95. дои : 10.1093/emboj/17.4.1087 . ПМК 1170457 . ПМИД 9463386 .
Уивер Б.К., Кумар К.П., Райх, Северная Каролина (1998). «Регуляторный фактор интерферона 3 и CREB-связывающий белок / p300 являются субъединицами двухцепочечного РНК-активируемого фактора транскрипции DRAF1» . Мол. Клетка. Биол . 18 (3): 1359–68. дои : 10.1128/MCB.18.3.1359 . ПМЦ 108849 . ПМИД 9488451 .
Лин Р., Хейлбрук С., Пита П.М., Хискотт Дж. (1998). «Вирус-зависимое фосфорилирование транскрипционного фактора IRF-3 регулирует ядерную транслокацию, потенциал трансактивации и деградацию, опосредованную протеасомами» . Мол. Клетка. Биол . 18 (5): 2986–96. дои : 10.1128/MCB.18.5.2986 . ПМЦ 110678 . ПМИД 9566918 .
Ронко Л.В., Карпова А.Ю., Видал М., Хоули П.М. (1998). «Онкобелок E6 вируса папилломы человека 16 связывается с регуляторным фактором интерферона-3 и ингибирует его транскрипционную активность» . Генс Дев . 12 (13): 2061–72. дои : 10.1101/гад.13.12.2061 . ПМК 316980 . ПМИД 9649509 .
Беллингем Дж., Грегори-Эванс К., Грегори-Эванс С.Ю. (1999). «Картирование регуляторного фактора 3 человеческого интерферона (IRF3) на хромосоме 19q13.3-13.4 с помощью внутригенного полиморфного маркера» . Анналы генетики человека . 62 (Часть 3): 231–4. дои : 10.1046/j.1469-1809.1998.6230231.x . ПМИД 9803267 . S2CID 46070705 .
Лоутер В.Дж., Мур П.А., Картер К.К., Пита П.М. (1999). «Клонирование и функциональный анализ человеческого промотора IRF-3». ДНК Клеточная Биол . 18 (9): 685–92. дои : 10.1089/104454999314962 . ПМИД 10492399 .
Ким Т, Ким ТАЙ, Сон ЮХ, Мин ИМ, Йим Дж, Ким ТК (1999). «Активация регуляторного фактора интерферона 3 в ответ на агенты, повреждающие ДНК» . Ж. Биол. Хим . 274 (43): 30686–9. дои : 10.1074/jbc.274.43.30686 . ПМИД 10521456 .
Кумар К.П., Макбрайд К.М., Уивер Б.К., Дингуолл С., Райх, Северная Каролина (2000). «Регулируемая ядерно-цитоплазматическая локализация регуляторного фактора 3 интерферона, субъединицы двухцепочечной РНК-активируемого фактора 1» . Мол. Клетка. Биол . 20 (11): 4159–68. дои : 10.1128/MCB.20.11.4159-4168.2000 . ПМЦ 85785 . ПМИД 10805757 .
Сухара В., Ёнеяма М., Ивамура Т., Ёсимура С., Тамура К., Намики Х., Аймото С., Фудзита Т. (2000). «Анализ вирус-индуцированных гомомерных и гетеромерных белковых ассоциаций между IRF-3 и коактиватором CBP/p300». Дж. Биохим . 128 (2): 301–7. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a022753 . ПМИД 10920266 .
Слуга MJ, тен Оевер Б, ЛеПейдж С, Конти Л, Гессани С, Юлкунен И, Лин Р, Хискотт Дж (2001). «Идентификация различных сигнальных путей, ведущих к фосфорилированию фактора регуляции интерферона 3» . Ж. Биол. Хим . 276 (1): 355–63. дои : 10.1074/jbc.M007790200 . ПМИД 11035028 .
Смит Э.Дж., Мари И., Пракаш А., Гарсиа-Састре А., Леви Д.Е. (2001). «Фосфорилирование IRF3 и IRF7 в инфицированных вирусом клетках не требует двухцепочечной РНК-зависимой протеинкиназы R или киназы Ikappa B, но блокируется белком E3L вируса коровьей оспы» . Ж. Биол. Хим . 276 (12): 8951–7. дои : 10.1074/jbc.M008717200 . ПМИД 11124948 .
Au WC, Yeow WS, Pitha PM (2001). «Анализ функциональных доменов регуляторного фактора интерферона 7 и его связи с IRF-3» . Вирусология . 280 (2): 273–82. дои : 10.1006/виро.2000.0782 . ПМИД 11162841 .
Барнс Б.Дж., Мур П.А., Пита П.М. (2001). «Вирусспецифическая активация нового регуляторного фактора интерферона, IRF-5, приводит к индукции отдельных генов интерферона альфа» . Ж. Биол. Хим . 276 (26): 23382–90. дои : 10.1074/jbc.M101216200 . ПМИД 11303025 .
Мах С.М., Харгроув Б.В., Кункель Г.Р. (2002). «Белок-активатор гена малой РНК, фактор, связывающий постоктамерную гомологию SphI / фактор, активирующий транскрипцию гена селеноцистеиновой тРНК, стимулирует транскрипцию гена регуляторного фактора-3 человеческого интерферона» . Ж. Биол. Хим . 277 (7): 4853–8. дои : 10.1074/jbc.M108308200 . ПМИД 11724783 .
Морин П., Браганса Дж., Банду М.Т., Лин Р., Хискотт Дж., Доли Дж., Сивас А. (2002). «Преимущественные сайты связывания регуляторных факторов интерферона 3 и 7, участвующих в транскрипции гена интерферона-А». Дж. Мол. Биол . 316 (5): 1009–22. дои : 10.1006/jmbi.2001.5401 . ПМИД 11884139 .
Данг О, Наварро Л., Андерсон К., Дэвид М. (2004). «Авангард: смертельный токсин сибирской язвы ингибирует активацию IFN-регуляторного фактора 3 липополисахаридом» . Журнал иммунологии . 172 (2): 747–51. дои : 10.4049/jimmunol.172.2.747 . ПМИД 14707042 .

Внешние ссылки

Интерферон + Регулятор + Фактор-3 в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
ФакторБук IRF3

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000126456 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000003184 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10048763-5] Перейти обратно: ^а ^б Хискотт Дж., Пита П., Генин П., Нгуен Х., Хейлбрук С., Мамане Ю., Алгарте М., Лин Р. (1999). «Запуск интерфероновой реакции: роль фактора транскрипции IRF-3». J. Интерферон Цитокин Рез . 19 (1): 1–13. дои : 10.1089/107999099314360 . ПМИД 10048763 .

[Lin-1999-6] Лин Р., Хейлбрук С., Генин П., Пита П.М., Хискотт Дж. (февраль 1999 г.). «Основная роль регуляторного фактора интерферона 3 в прямой активации транскрипции хемокинов RANTES» . Мол Клеточная Биол . 19 (2): 959–66. дои : 10.1128/MCB.19.2.959 . ПМК 116027 . ПМИД 9891032 .

[pmid11846977-7] Ёнеяма М., Сухара В., Фудзита Т. (2002). «Контроль активации IRF-3 путем фосфорилирования». J. Интерферон Цитокин Рез . 22 (1): 73–6. дои : 10.1089/107999002753452674 . ПМИД 11846977 .

[8] «Ген Энтрез: регуляторный фактор 3 интерферона IRF3» .

[Collins-2004-9] Коллинз С.Е., Нойс Р.С., Моссман К.Л. (февраль 2004 г.). «Врожденный клеточный ответ на проникновение вирусных частиц требует IRF3, но не репликации вируса» . Дж Вирол . 78 (4): 1706–17. doi : 10.1128/JVI.78.4.1706-1717.2004 . ПМК 369475 . ПМИД 14747536 .

[10] Хоу Ф, Сунь Л, Чжэн Х, Скауг Б, Цзян QX, Чен ZJ (5 августа 2011 г.). «MAVS образует функциональные прионоподобные агрегаты для активации и распространения противовирусного врожденного иммунного ответа» . Клетка . 146 (3): 448–61. дои : 10.1016/j.cell.2011.06.041 . ПМК 3179916 . ПМИД 21782231 .

[11] Лю С, Цай X, Ву Дж, Конг Q, Чен X, Ли Т, Ду Ф, Жэнь Дж, Ву Ю, Гришин Н и Чен ZJ (13 марта 2015 г.). «Фосфорилирование врожденных иммунных адаптерных белков MAVS, STING и TRIF индуцирует активацию IRF3» . Наука . 347 (6227): ааа2630. дои : 10.1126/science.aaa2630 . ПМИД 25636800 .

[pmid29106401-12] Перейти обратно: ^а ^б Кинг КР, Агирре А.Д., Йе YX, Сан Ю, Ро Дж.Д., Нг младший Р.П., Колер Р.Х., Арлаукас С.П., Ивамото Ю., Савол А., Садреев Р.И., Келли М., Фитцгиббонс Т.П., Фицджеральд К.А., Митчисон Т., Либби П., Нарендорф М., Вайсследер Р. (6 ноября 2017 г.). «Интерфероны IRF3 и I типа способствуют фатальной реакции на инфаркт миокарда» . Природная медицина . 23 (12): 1481–1487. дои : 10.1038/нм.4428 . ПМК 6477926 . ПМИД 29106401 .

[pmid11162841-13] Au WC, Yeow WS, Pitha PM (февраль 2001 г.). «Анализ функциональных доменов регуляторного фактора интерферона 7 и его связи с IRF-3» . Вирусология . 280 (2): 273–82. дои : 10.1006/виро.2000.0782 . ПМИД 11162841 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

v т и Сигнальный путь : TLR. сигнальный путь
TLRs	TLR1 TLR2 TLR3 TLR4 TLR5 TLR6 TLR7 TLR8 TLR9 TLR10 TLR11 TLR12 TLR13
Other receptors	CD14 LBP MD2
Downstream signalling	IRAK1 IRAK2 IRAK3 IRAK4 IRF3 MAP3K7 MYD88 TAB1 TICAM1 TIRAP TOLLIP TRAF6