домен Bzip
| Фактор транскрипции BZIP | |||
|---|---|---|---|
 CREB (вверху) является фактором транскрипции , способным связывать ДНК через домен BZIP (внизу) и регулируя экспрессию генов . | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | bzip_1 | ||
| Pfam | PF00170 | ||
| InterPro | IPR011616 | ||
| PROSITE | PDOC00036 | ||
| Краткое содержание | 1ysa / scope / supfam | ||
| CDD | CD14686 | ||
| Мембраном | 235 | ||
| |||
Основной домен лейциновой молнии ( домен BZIP ) обнаружен во многих эукариотических белках, связывающих ДНК . Одна часть домена содержит область, которая опосредует последовательность специфических свойств связывания ДНК и лейциновую молнию , которая необходима для удержания (димеризации) двух областей связывания ДНК. Область связывания ДНК содержит ряд основных аминокислот, таких как аргинин и лизин . Белки, содержащие этот домен, являются факторами транскрипции . [ 1 ] [ 2 ]
Факторы транскрипции BZIP
[ редактировать ]Факторы транскрипции BZIP обнаруживаются во всех эукариотах и образуют одно из крупнейших семейств димеризации TF. [ 3 ] Эволюционное исследование 2008 года показало, что 4 гена BZIP были закодированы геномом самого последнего общего предка всех растений. [ 4 ] Взаимодействие между факторами транскрипции BZIP многочисленны и сложны [ 5 ] [ 6 ] [ 3 ] и играть важную роль в развитии рака [ 7 ] В эпителиальных тканях синтез стероидных гормонов клетками эндокринных тканей, [ 8 ] факторы, влияющие на репродуктивные функции, [ 9 ] и несколько других явлений, которые влияют на здоровье человека.
домен BZIP, содержащие белки
[ редактировать ]- AP-1 FOS / Jun Heterodimer, который образует фактор транскрипции
- Джун-B Транскрипционный фактор
- CREB Camp Фактор транскрипции отклика
- Opaque2 (O2) транскрипционный фактор гена Zein 22 кД, который кодирует класс белков хранения в эндосперме ( ядра кукурузы Zea mays )
- NFE2L2 или NRF2
- BZIP MAF Факторы транскрипции
Человеческие белки, содержащие этот домен
[ редактировать ]ATF1 ; ATF2 ; ATF4 ; ATF5 ; ATF6 ; ATF7 ; Bach1 ; Bach2 ; BATF ; BATF2 ; CEBPA ; CEBPB ; CEBPD ; CEBPE ; CEBPG ; CEBPZ ; Creb1 ; Creb3 ; Creb3l1 ; CREB3L2 ; Creb3l3 ; CREB3L4 ; Creb5 ; Crebl1 ; Крем ; E4bp4 ; Гулять ; Гулять ; Jun ; Junb ; Jund ; Мафа ; Мафб ; Мафф ; Мафг ; NRL; C-MAF ; Мафк ; NFE2 ; NFE2L2 ; NFE2L3 ; SNFT ; XBP1
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Элленбергер Т. (1994). «Получение сцепления в распознавании ДНК: структуры базовой области лейциновой молнии и базовые домены связывания спиральной спирали-спирали-спирали» ». Карт Мнение Структура Биол . 4 (1): 12–21. doi : 10.1016/s0959-440x (94) 90054-x .
- ^ Херст ХК (1995). «Факторы транскрипции 1: белки BZIP». Профиль протеина . 2 (2): 101–68. PMID 7780801 .
- ^ Jump up to: а беременный Amoutzias, Grigoris D.; Робертсон, Дэвид Л.; Ван де Пир, Ив; Оливер, Стивен Г. (2008-05-01). «Выберите своих партнеров: димеризация в эукариотических факторах транскрипции». Тенденции в биохимических науках . 33 (5): 220–229. doi : 10.1016/j.tibs.2008.02.002 . ISSN 0968-0004 . PMID 18406148 .
- ^ Corrêa LG, Riaño-Pachón DM, Schrago CG, Dos Santos RV, Mueller-Roeber B, Vincentz M (2008). Шиу Ш (ред.). «Роль факторов транскрипции BZIP в эволюции зеленого растения: адаптивные особенности, возникающие из четырех генов основателей» . Plos один . 3 (8): E2944. Bibcode : 2008ploso ... 3.2944c . doi : 10.1371/journal.pone.0002944 . PMC 2492810 . PMID 18698409 .
- ^ Винсон, Чарльз; Ачарья, Аша; Taparowsky, Elizabeth J. (2006-01-01). «Расшифровка взаимодействия транскрипционных факторов B-zip in vitro и in vivo» . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - структура и экспрессия гена . 1759 (1–2): 4–12. doi : 10.1016/j.bbaexp.2005.12.005 . ISSN 0006-3002 . PMID 16580748 .
- ^ Ньюман, Джон Р.С.; Китинг, Эми Э. (2003-06-27). «Комплексная идентификация взаимодействия BZIP человека с массивами с спиральной катушкой» . Наука . 300 (5628): 2097–2101. Bibcode : 2003sci ... 300.2097n . doi : 10.1126/science.1084648 . ISSN 1095-9203 . PMID 12805554 . S2CID 36715183 .
- ^ Vlahopolos SA, Logotheti S, Mikas D, Girika A, Gorgoulis V, Zoumpourlis V (апрель 2008 г.). «Роль ATF-2 в онкогенезе» Биссайс 30 (4): 314–2 Doi : 10.1002/Бис . PMID 18348191 678541S2CID
- ^ Манна П.Р., Дайсон М.Т., Юбанк Д.В., Кларк Б.Дж., Лалли Э., Сассоне-Корси П., Зелесник А.Дж., Стокко Д.М. (январь 2002 г.). «Регуляция стероидогенеза и стероидогенный острый регуляторный белок членом семейства связывающих белков с элементом ответа цАМФ» . Мол Эндокринол . 16 (1): 184–99. doi : 10.1210/mend.16.1.0759 . PMID 11773448 .
- ^ Hoare S, Copland JA, Wood TG, Jeng YJ, Izban MG, Soloff MS (май 1999). «Идентификация сайта связывания альфа/бета GABP/бета, участвующего в индукции экспрессии гена рецептора окситоцина в клетках молочной железы человека, потенцирование с помощью C-FOS/C-Jun» . Эндокринология . 140 (5): 2268–79. doi : 10.1210/endo.140.5.6710 . PMID 10218980 .