Jump to content

Связанный с RAR рецептор-сирот альфа

(Перенаправлено из Рор-Альфа )

Рора
Доступные структуры
PDB Поиск ортолога: PDBE RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы RORA , NR1F1, ROR1, ROR2, ROR3, RZR-ALPHA, RZRA, RAR, связанный с сиротой рецептор A, Iddeca
Внешние идентификаторы Омим : 600825 ; MGI : 104661 ; Гомологен : 56594 ; Genecards : Rora ; OMA : RORA - Ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Набор
Uniprot
Refseq (мРНК)

NM_002943
NM_134260
NM_134261
NM_134262

NM_013646
NM_001289916
NM_001289917

Refseq (белок)

NP_002934
NP_599022
NP_599023
NP_599024

NP_001276845
NP_001276846
NP_038674

Расположение (UCSC) Chr 15: 60,49 - 61,23 МБ Chr 9: 68,56 - 69,3 МБ
PubMed Search [ 3 ] [ 4 ]
Викидид
Посмотреть/редактировать человека Посмотреть/редактировать мышь

Связанный с RAR альфа-рецептор-сирот ( RORα ), также известный как NR1F1 (подсемейство 1-я ядерного рецептора 1, группа F, член 1), является ядерным рецептором , который у людей кодируется RORA геном . [ 5 ] RORα участвует в регуляции транскрипции некоторых генов, участвующих в циркадном ритме . [ 6 ] У мышей RORα необходим для развития мозжечка [ 7 ] [ 8 ] посредством прямой регуляции генов, экспрессируемых в клетках Пуркинье. [ 9 ] Он также играет важную роль в развитии врожденных лимфоидных клеток типа 2 (ILC2), а мутантные животные дефицит ILC2. [ 10 ] [ 11 ] Кроме того, хотя клетки ILC3 и Th17 от мышей с дефицитом RORα у мышей, дефицитных, дефектны для цитокинов . выработки [ 12 ]

Открытие

[ редактировать ]

Первые трехместные изоформы RORα были первоначально клонированы и охарактеризованы как ядерные рецепторы в 1994 году Giguère и коллегами, когда их структура и функция были впервые изучены. [ 13 ]

В начале 2000 -х годов различные исследования показали, что RORα демонстрирует ритмические паттерны экспрессии в циркадном цикле в печени , почках , сетчатке и легких . [ 14 ] Интересно, что примерно в это же время было обнаружено, что численность RORα является циркадным в супрахиазматическом ядре млекопитающих . [ 15 ] RORα необходим для нормальных циркадных ритмов у мышей , [ 16 ] демонстрируя его важность в хронобиологии .

Структура

[ редактировать ]

Белок, кодируемый этим геном, является членом подсемейства NR1 рецепторов ядерных гормонов. [ 16 ] У людей было идентифицировано 4 изоформы RORα, которые генерируются посредством альтернативного сплайсинга и использования промотора и демонстрируют дифференциальную ткань-специфическую экспрессию. Структура белка RORα состоит из четырех канонических функциональных групп: N -концевого (A/B) домена, ДНК -связывающего домена , содержащего два цинковых пальца , домен шарнира и C -концевой лиганд -связывающий домен. В семье ROR ДНК-связывающий домен высоко консервативен, а лиганд-связывающий домен только умеренно консервативный. [ 14 ] Различные изоформы RORα имеют различную специфичность связывания и сильные стороны транскрипционной активности. [ 5 ]

Регуляция циркадного ритма

[ редактировать ]

Основные млекопитающих циркадные часы - это отрицательная петля обратной связи , которая состоит из PER1/PER2 , CRY1/CRY2 , BMAL1 и часов . [ 15 ] Эта обратная связь стабилизируется через другую петлю, включающую транскрипционную регуляцию BMAL1 . [ 17 ] Трансактивация BMAL1 промоторе регулируется через восходящий элемент ответа ROR/Rev-ERB (RRE) в BMAL1 , с которым связывают RORα и Rev-ERBα . [ 17 ] Эта стабилизирующая регуляторная петля индуцируется гетеродимером BMAL1/часов , который индуцирует транскрипцию RORα и Rev-ERBα . [ 15 ] RORα, который активирует транскрипцию BMAL1 , и Rev-ERBα, который подавляет транскрипцию BMAL1 , конкурирует, чтобы связываться с RRE. [ 17 ] эта петля обратной связи, регулирующая экспрессию BMAL1 Считается, что , стабилизирует механизм основных часов, помогая сформировать его от изменений в окружающей среде . [ 17 ]

Механизм

[ редактировать ]

Конкретная связь с элементами ROR (RORE) в регуляторных областях необходима для функции RORα в качестве активатора транскрипции. [ 18 ] RORα достигает этого путем специфического связывания с консенсусным мотивом Core в RORE, RGGTCA. Это взаимодействие возможно благодаря ассоциации первого цинкового пальца RORα с основным мотивом в основной канавке, P-боксе и ассоциации его C-концевого расширения с AT-богатой областью в 5-футовой области RORE. [ 16 ]

Гомология

[ редактировать ]

RORα, RORβ и RORγ являются транскрипционными активаторами, распознавающими элементы ROR-ответа. [ 19 ] ROR-альфа экспрессируется в различных типах клеток и участвует в регуляции нескольких аспектов развития, воспалительных реакций и развития лимфоцитов . [ 20 ] Изоформы RORα (RORα1 через RORα3) возникают посредством альтернативной обработки РНК, причем RORα2 и RORα3 разделяют аминоконцевую область, отличную от RORα1. [ 5 ] В отличие от RORα, RORβ экспрессируется в тканях центральной нервной системы (CNS), участвующих в обработке сенсорной информации и в генерировании циркадных ритмов, в то время как RORγ является критическим в лимфатических узлов организме и тимопоэизисе . [ 20 ]

ДНК-связывающие домены рецептора сирот DHR3 у дрозофилы показывают особенно тесную гомологию в амино и карбокси , прилегающих к второй области цинкового пальца в RORα, что позволяет предположить, что эта группа остатков важна для функциональности белков. [ 5 ]

PDP1 и VRI в Drosophila регулируют циркадный ритм, конкурируя за тот же сайт связывания, VP-короб, аналогично тому, как ROR и Rev-Erb конкурентно связываются с RRE. [ 17 ] PDP1 и VRI представляют собой петлю обратной связи и являются функциональными гомологами ROR и Rev-ERB у млекопитающих. [ 17 ]

Прямые ортологи этого гена были идентифицированы у мышей и людей.

Цитохром C -псевдоген HC2 и RORα разделяют перекрывающуюся геномную организацию с псевдогеном HC2, расположенным в пределах транскрипции RORα2. Нуклеотидные и выведенные аминокислотные последовательности псевдогена цитохрома-С-обработки находятся на цепи смысла , в то время как последователи амино-концевого экзона RORα2 находятся на антисмысловой цепи. [ 5 ]

Взаимодействия

[ редактировать ]

Как цель наркотиков

[ редактировать ]

Поскольку RORα и Rev-ERBα являются ядерными рецепторами, которые имеют одни и те же гены-мишени и участвуют в процессах, которые регулируют метаболизм , развитие , иммунитет и циркадный ритм, они демонстрируют потенциал в качестве лекарственных целей . Синтетические лиганды имеют различные потенциальные терапевтические применения и могут использоваться для лечения таких заболеваний, как диабет , атеросклероз , аутоиммунитет и рак . Было обнаружено, что T0901317 и SR1001, два синтетических лиганда, являются RORα и RORγ обратными агонистами , которые подавляют репортерную активность и, как было показано, задерживают начало и клиническую тяжесть рассеянного склероза и других Th17 клеточных клеточных, опосредованных клетками . SR1078 был обнаружен в качестве агониста RORα и RORγ, который увеличивает экспрессию G6PC и FGF21, что дает терапевтический потенциал для лечения ожирения и диабета, а также рака молочной железы , яичников и простаты . SR3335 также был обнаружен в качестве обратного агониста RORα. [ 13 ]

CGP 52608

Смотрите также

[ редактировать ]
  1. ^ Jump up to: а беременный в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000069667 - ENSEMBL , май 2017 г.
  2. ^ Jump up to: а беременный в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000032238 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
  4. ^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
  5. ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и Giguère V, Tini M, Flock G, Ong E, Evans RM, Otulakowski G (март 1994 г.). «Изоформные аминоконцевые домены диктуют ДНК-связывающие свойства ROR Alpha, нового семейства ядерных рецепторов-сирот» . Гены и развитие . 8 (5): 538–53. doi : 10.1101/gad.8.5.538 . PMID   7926749 .
  6. ^ Jump up to: а беременный в «Ген Entrez: Rora RAR-рецептор-сирот» А » .
  7. ^ Сидман Р.Л., Лейн П.В., Дики М.М. (август 1962 г.). «Шофляер, новая мутация в мыши, затрагивающая мозжечок». Наука . 137 (3530): 610–2. Bibcode : 1962sci ... 137..610S . doi : 10.1126/science.137.3530.610 . PMID   13912552 . S2CID   30733570 .
  8. ^ Гамильтон Б.А., Франкель В.Н., Керреброк А.В., Хокинс Т.Л., Фицхью В., Кусуми К. и др. (Февраль 1996 г.). «Разрушение рецептора ядерного гормона roralpha ускоростных мышей». Природа . 379 (6567): 736–9. Bibcode : 1996natur.379..736h . doi : 10.1038/379736A0 . PMID   8602221 . S2CID   4318427 .
  9. ^ Gold DA, Baek SH, Schork NJ, Rose DW, Larsen DD, Sachs BD, et al. (Декабрь 2003 г.). «Roralpha координирует взаимную передачу сигналов в развитии мозжечка с помощью звукового ежи и кальций-зависимых путей» . Нейрон . 40 (6): 1119–31. doi : 10.1016/s0896-6273 (03) 00769-4 . PMC   2717708 . PMID   14687547 .
  10. ^ Халим Тай, Макларен А., Романиш М.Т., Голд М.Дж., Макнагни К.М., Такеи Ф. (сентябрь 2012 г.). «Альфа-рецептор-рецептор-рецептор, связанный с рецептором-рецептором, требуется для развития природных вспомогательных клеток и аллергического воспаления» . Иммунитет . 37 (3): 463–74. doi : 10.1016/j.immuni.2012.06.012 . PMID   22981535 .
  11. ^ Gold MJ, Antignano F, Halim Ty, Hirota JA, Blanchet MR, Zaph C, et al. (Апрель 2014). «Группа 2 врожденные лимфоидные клетки облегчают сенсибилизацию к локальному, но не системному, индуцирующему Th2-индикационному воздействию аллергенов». Журнал аллергии и клинической иммунологии . 133 (4): 1142–8. doi : 10.1016/j.jaci.2014.02.033 . PMID   24679471 .
  12. ^ LO BC, Gold MJ, Hughes MR, Antignano F, Valdez Y, Zaph C, et al. (Сентябрь 2016 г.). «Ядерный рецептор -сирот ROR Alpha и группа 3 врожденные лимфоидные клетки приводят к фиброзу в мышиной модели болезни Крона» . Научная иммунология . 1 (3): EAAF8864. doi : 10.1126/sciimmunol.aaf8864 . PMC   5489332 . PMID   28670633 .
  13. ^ Jump up to: а беременный Kojetin DJ, Burris TP (март 2014 г.). «Ядерные рецепторы Rev-Erb и ROR в качестве лекарственных целей» . Природные обзоры. Открытие наркотиков . 13 (3): 197–216. doi : 10.1038/nrd4100 . PMC   4865262 . PMID   24577401 .
  14. ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и Jetten AM, Kurebayashi S, Ueda E (2001). «Подсемейство ядерного рецептора ядерного сироты: критические регуляторы множественных биологических процессов» . Прогресс в исследованиях нуклеиновых кислот и молекулярной биологии . 69 : 205–47 . doi : 10.1016/s0079-6603 (01) 69048-2 . ISBN  978-0-12-540069-5 Анкет PMID   11550795 .
  15. ^ Jump up to: а беременный в KO CH, Takahashi JS (октябрь 2006 г.). «Молекулярные компоненты циркадных часов млекопитающих» . Молекулярная генетика человека . 15 Спецификация № 2 (2): R271-7. doi : 10.1093/hmg/ddl207 . PMC   3762864 . PMID   16987893 .
  16. ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон Emery P, Reppert SM (август 2004 г.). «Ритмичный рор» . Нейрон . 43 (4): 443–6. doi : 10.1016/j.neuron.2004.08.009 . PMID   15312644 .
  17. ^ Laitinen S, Staels B (2003). «Потенциальная роль Рор-Альфа в сердечно-сосудистой эндокринологии» . Передача сигналов ядерного рецептора . 1 : E011. doi : 10.1621/nrs.01011 . PMC   1402228 . PMID   16604183 .
  18. ^ Zhao X, Cho H, Yu RT, Atkins AR, Downes M, Evans RM (май 2014). «Ядерные рецепторы качаются вокруг часов» . Embo сообщает . 15 (5): 518–28. doi : 10.1002/emb.201338271 . PMC   4210094 . PMID   24737872 .
  19. ^ Jump up to: а беременный Du J, Huang C, Zhou B, Ziegler SF (апрель 2008 г.). «Изоформа-специфическое ингибирование альфа-опосредованной транскрипционной активации ROR FOXP3» . Журнал иммунологии . 180 (7): 4785–92. doi : 10.4049/jimmunol.180.7.4785 . PMID   18354202 .
  20. ^ Xiong G, Wang C, Evers BM, Zhou BP, Xu R (апрель 2012 г.). «RORα подавляет инвазию опухоли молочной железы, индуцируя экспрессию SEMA3F» . РАНКА . 72 (7): 1728–39. doi : 10.1158/0008-5472.can-11-2762 . PMC   3319846 . PMID   22350413 .
  21. ^ Paravicini G, Steinmayr M, André E, Becker-André M (октябрь 1996 г.). «Кандидат -кандидат супрессора метастазирования нуклеотидфосфаткиназа NM23 специфически взаимодействует с членами подсемейства ядерного рецептора -сироты ROR/RZR». Биохимическая и биофизическая исследовательская коммуникация . 227 (1): 82–7. doi : 10.1006/bbrc.1996.1471 . PMID   8858107 .

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: b0624ff0c6fc3152f509120015a6bf9c__1724334120
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/b0/9c/b0624ff0c6fc3152f509120015a6bf9c.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
RAR-related orphan receptor alpha - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)